The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
88
|
structure length |
88
|
Chain Sequence |
GSSGSSGSEIQLNNKVARKVRALYDFEAVEDNELTFKHGEIIIVLDDSDANWWKGENHRGIGLFPSNFVTTNLNIETEAAAVSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of the Signal transducing adaptor molecule 2
rcsb |
| molecule keywords |
Signal transducing adapter molecule 2
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
88
|
| sequence length |
88
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SSH A; 3RBB B; 1RI9 A; 2LMJ A; 3C0C A; 1B07 A; 3ZL7 C; 4AFQ C; 1G2B A; 4J9H A; 3H0I A; 2PNI A; 1UE9 A; 2BZY A; 2O31 A; 3LH5 A; 2GQI A; 1PNJ A; 2JM8 A; 3FJ5 A; 4KRT A; 2CT3 A; 5IHN A; 1AWX A; 1AVZ C; 4J9C A; 4J9F A; 2EW3 A; 3EG1 A; 2C0I A; 4ESR A; 3IQL A; 1UHF A; 2BZX A; 2J6O A; 2ED1 A; 1QKW A; 1LCK A; 1UG1 A; 2HCK A; 1FMK A; 3TVT A; 1Y0M A; 3M0P A; 2JMC A; 1M3B A; 2KT8 A; 3EG3 A; 3SEM A; 1SRL A; 5IH2 A; 2RQW A; 2EVR A; 1UFF A; 4Z89 A; 1AZE A; 4AFZ C; 2X3X D; 1E6H A; 1MV0 B; 4EIK A; 1NLP C; 1TUD A; 2RMO A; 1V1C A; 5FWB A; 1JXM A; 1YN8 A; 3GBQ A; 2JT4 A; 1NYG A; 1GCQ C; 1W70 A; 2F2V A; 1NM7 A; 2ABL A; 2CH4 W; 2KRS A; 2GGR A; 1UJY A; 4JJD A; 2DBM A; 2KNB B; 3TSZ A; 2YSQ A; 4HXJ A; 1T3L A; 2CSQ A; 1ARK A; 3THK A; 3H0H A; 1ABO A; 5ECA A; 4RTT A; 2L3Q A; 1GBR A; 2MIO A; 1WIE A; 1WLP B; 1PHT A; 3JV3 A; 3UAT A; 1M27 C; 1UDL A; 4LUD A; 2F2W A; 2NWM A; 4HVV A; 1QWE A; 2YUN A; 4HVW A; 1BBZ A; 4RTU A; 1WDX A; 2DX1 A; 2V1Q A; 4OMP A; 2RQU A; 2MOX A; 2EYZ A; 3I35 A; 2L0A A; 1GBQ A; 5I22 A; 4D8D A; 2D1X A; 5FWC A; 5FW9 A; 1A0N B; 1WXU A; 1H92 A; 2YUO A; 1PRL C; 1UEC A; 4JJC A; 2BTT A; 4K11 A; 2JM9 A; 4Z88 A; 3TSW A; 2K2M A; 2C0T A; 2B86 A; 1M3C A; 4AG2 C; 4JJB A; 1K1Z A; 3EHR A; 1K0S A; 3VS1 A; 1KFZ A; 2DMO A; 1CSK A; 2LQW A; 1ZBJ A; 2EGA A; 3VS2 A; 2ESW A; 1X2Q A; 1HSQ A; 4OMO A; 1I0C A; 5IXB A; 3M0T A; 2RF0 A; 1YWO A; 2V1R A; 1RLQ C; 1KJW A; 2K79 A; 4E6R A; 1U06 A; 1WA7 A; 4LN2 A; 2LCS A; 2F2X A; 2EYY A; 1QWF A; 2DL5 A; 5HCK A; 4ZNX A; 1GCQ A; 1K9A A; 4RTY A; 1UUE A; 2DE0 X; 1WXT A; 3REA B; 1CKB A; 2HSP A; 2HDA A; 2DL4 A; 3VS4 A; 2J6K A; 4M4Z A; 1M3A A; 2DLP A; 3NGP A; 2CT4 A; 1QKX A; 4CC2 A; 2KR3 A; 2OI3 A; 1JU5 C; 2DL7 A; 1IO6 A; 2GTO A; 2KT1 A; 1MUZ A; 1PWT A; 1ZSG A; 2JW4 A; 2JS0 A; 4HCK A; 4JZ3 A; 3VS6 A; 2ENM A; 2NUZ A; 1ZLM A; 3I9Q A; 2I0N A; 1E7O A; 5IXF A; 1EFN A; 1SPK A; 1M30 A; 1NEG A; 2CRE A; 2C0O A; 1UGV A; 2RQT A; 2J05 A; 1W6X A; 1XOV A; 3M0S A; 4RTZ A; 1Z9Q A; 3UA7 A; 1TG0 A; 2L3P A; 1SEM A; 3VS7 A; 1CKA A; 3R6N A; 2JS2 A; 4ORZ A; 2KRM A; 3PVL A; 3RNJ A; 2KXC A; 4A63 B; 1HD3 A; 3EG0 A; 1S1N A; 3A98 A; 2RNA A; 4F17 A; 3UA6 A; 2KYB A; 1SRM A; 1X2K A; 2G6F X; 2KGT A; 2LJ0 A; 2A28 A; 1YWP A; 4D8K A; 4J9G A; 1H3H A; 4J9B A; 2K9G A; 4IIM A; 2LX7 A; 1HJD A; 3SHW A; 4IIO A; 2YUQ A; 1BK2 A; 4WCI A; 4AFU C; 2D0N A; 3VS5 A; 1PKS A; 2LQN A; 2DRK A; 3M0U A; 2K3B A; 1FYN A; 2O9V A; 1ZX6 A; 2E5K A; 2GNC A; 2HBW A; 2FPE A; 1X6B A; 3VS3 A; 4CC3 A; 1BB9 A; 4R0K A; 2DA9 A; 2FRY A; 4F16 A; 2JTE A; 2DBK A; 2QDL A; 2IIM A; 1T0J A; 4RTX A; 2ROT A; 1K76 A; 2CUB A; 4HVU A; 1NYF A; 2KRN A; 2X3W D; 1Z9Z A; 2J06 A; 3ULR B; 1SHG A; 3QWY A; 2AKK A; 1UHC A; 1AWW A; 3H41 A; 1ZUU A; 2L3S A; 4AFS C; 2EBP A; 2ED0 A; 2RN8 A; 1X6G A; 1OPL A; 1RLP C; 2W0Z A; 1WX6 A; 2HEQ A; 1VYU A; 1MV3 A; 2FG0 A; 1AWJ A; 1NG2 A; 1YCS B; 5L23 A; 2DVJ A; 2FO0 A; 2XMF A; 4FSS A; 1JO8 A; 1AEY A; 2H8H A; 3EG2 A; 4DEY A; 2EGC A; 1JQQ A; 2FPF A; 1NEB A; 2YDL A; 1SHF A; 2DJQ A; 4Y92 A; 4RTW A; 3VRY A; 3M0Q A; 4OMQ A; 1UTI A; 2KBT A; 3VRZ A; 2LP5 A; 2A36 A; 1WFW A; 2O2O A; 2FPD A; 1NLO C; 4DEX A; 2K7A A; 2KYM A; 1OV3 A; 2KEA A; 2CUD A; 2YUP A; 1GRI A; 2CDT A; 1ABQ A; 3I5R A; 4LUE A; 2DRM A; 1JXO A; 3M0R A; 3REB B; 2LJ3 A; 3EGU A; 1I1J A; 2EKH A; 1QLY A; 4GBQ A; 2SRC A; 4OML A; 1T0H A; 2OJ2 A; 2O88 A; 1YNZ A; 1K4U S; 2DM1 A; 1ZUY A; 1X69 A; 2AKL A; 2KRO A; 1WXB A; 3UF4 A; 3NPF A; 1AWO A; 2DL8 A; 2O9S A; 2RQV A; 3H0F A; 2KXD A; 2L2P A; 3KFV A; 1M8M A; 3U23 A; 1T3S A; 2D8H A; 2EGE A; 2K6D A; 2EYW A; 2VVK A; 1H8K A; 2D8J A; 4LNP A; 1U3O A; 5EC7 A; 2M51 A; 4Z8A A; 2FRW A; 2P4R A; 1B3Q A; 3PVQ A; 1JEG A; 1PKT A; 2JMA A; 2M0Y A; 1KIK A; 1VA7 A; 1WI7 A; 2YT6 A; 1OOT A; 1BU1 A; 4J9I A; 1VYT A; 4JZ4 A; 3QWX X; 4GLM A; 2AK5 A; 4X1V A; 5IHI A; 2DF6 A; 5IHK A; 4OMM A; 1AOJ A; 1W1F A; 2FEI A; 1KSW A; 1AD5 A; 4CC7 A; 2DYB A; 4AG1 C; 2CSI A; 1AZG B; 1GFC A; 1GL5 A; 3I5S A; 1QCF A; 5GJW B; 2LJ1 A; 1OEB A; 2RPN A; 2DL3 A; 2JXB A; 1PRM C; 1VYV A; 4CC4 B; 2PTK A; 1UJ0 A; 1GCP A; 1N5Z A; 2AZV A; 2SEM A; 1K0X A; 2BZ8 A; 1TUC A; 2DNU A; 2A37 A; 2KE9 A; 2EYX A; 2J7I A; 1RUW A; 4J9E A; 2OAW A; 5GJV B; 4RTV A; 2ROL A; 1X43 A; 1WYX A; 2EPD A; 2J6F A; 3O5Z A; 2A08 A; 3CQT A; 4LE9 A; 2PZ1 A; 3NMZ C; 1I07 A; 2VWF A; 2AZS A; 2CH4 A; 2RQR A; 1X27 A; 1GFD A; 2VKN A; 2LNH B; 1YP5 A; 2GTJ A; 4RUG A; 2ECZ A; 3VS0 A; 5I11 A; 4F14 A; 2EQI A; 1G83 A; 2LZ6 B; 4OMN A; 1OPK A; 3EHQ A; 3PE0 A; 1E6G A; 4J9D A; 4JPB W; 4QT7 A; 1J3T A; 1U5S A; 1Y57 A; 1ZUK A; 2DIL A; 2GBQ A; 2MCN A; 2W10 A; 3NHN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQ7 A; 3RBB B; 1PCX A; 1RI9 A; 3C0C A; 1Q82 U; 1G2B A; 4M78 C; 3CCR A; 2PNI A; 5CCA A; 3BE3 A; 2EJG A; 4XU2 A; 3CCL T; 3OYD A; 2QQA A; 5KYU B; 2HZY A; 1JBM A; 3X28 B; 1O75 A; 2KQW A; 3EGD B; 1UB4 A; 1YJW A; 4J9C A; 4J9F A; 2R58 A; 3EG1 A; 4LD9 K; 3JB9 J; 3OBW A; 2F69 A; 5I2S A; 3OYM A; 2ED1 A; 1QKW A; 1UG1 A; 2HCK A; 3HTR A; 3TVT A; 2E41 A; 2GFA A; 1M3B A; 3A8L B; 3HRS A; 3AT1 B; 1SRL A; 2EVR A; 4OB3 B; 1AZE A; 5LJ3 g; 1KC8 C; 4BY6 C; 5FWB A; 2RMO A; 4EDU A; 4C0Z A; 1JXM A; 3GBQ A; 4C8Q G; 3JCM e; 3CC4 T; 1I8F A; 3LYI A; 4PK4 A; 4KT0 E; 1UJY A; 3JCM J; 1HYO A; 1G3T A; 5AYF A; 1R0B G; 2KNB B; 3QXE B; 2DVE A; 2MK5 A; 4OB1 B; 1ARK A; 3THK A; 5FRM A; 3NFC A; 3CXC A; 2QI2 A; 2KSS A; 2L3Q A; 2QEX Q; 3JV3 A; 3UAT A; 3MP8 A; 2HL3 A; 2F2W A; 4M7A A; 1H64 1; 2Z0W A; 4HVV A; 1VQ5 A; 4DBQ A; 2DO3 A; 4XU3 A; 1VUB A; 4X9D A; 2P4T A; 2XU8 A; 4EMH A; 4MMK A; 1OZ3 A; 1VQN T; 4M78 G; 2EYZ A; 2A7Y A; 1KHC A; 2RK1 A; 4D8D A; 3VYH B; 2D1X A; 2XD0 A; 2YUO A; 2V8K A; 1YFN A; 4JJC A; 5HY6 A; 3P8B B; 5CKH A; 3A8H B; 4JLG A; 5FLX E; 1YCY A; 1JRI A; 2COY A; 3TSW A; 5GAO l; 2K2M A; 1VQL A; 1M3C A; 4FYV B; 4JJB A; 1Q86 R; 3OW2 A; 1KFZ A; 2ZPE B; 1VQO A; 4BUG A; 1QVF P; 3JB9 H; 1X2Q A; 2IPO B; 4OMO A; 1QVG A; 4QVD A; 3M4G A; 2K79 A; 1TXQ A; 4JRI A; 1WA7 A; 3CBM A; 2G3R A; 2F2X A; 2EYY A; 3S3M A; 2DL5 A; 4FCY A; 5GAO m; 3JB9 G; 1XNI A; 1D3B A; 2OTJ T; 3REA B; 1RAG B; 1WXT A; 2DE0 X; 1CKB A; 4II1 A; 2HDA A; 2L5Q A; 4JJN K; 2CT4 A; 4HA8 A; 3UPU A; 3MKD A; 1VQM Q; 1YJ9 T; 3RKW A; 5CKF A; 1JU5 C; 1MHN A; 1ZA1 B; 2GTO A; 1PWT A; 4JZ3 A; 1ZSG A; 3JB9 D; 2ENM A; 2RI3 A; 3I9Q A; 5DM7 R; 3MEU A; 1E7O A; 2ATC B; 2DEQ A; 2E12 A; 2C0O A; 4N0A C; 1W6X A; 4M75 A; 3CCU A; 1VQ8 Q; 1Q95 G; 1TG0 A; 1QCO A; 2X35 A; 1VQ8 A; 4WF2 A; 4C92 D; 4ORZ A; 2KRM A; 3PVL A; 1MNE A; 4IUP A; 3RIR A; 1Q81 R; 1PG5 B; 4A63 B; 1HD3 A; 4M7A B; 1H3Z A; 2EWN A; 2A28 A; 1YWP A; 3SB2 A; 4D8K A; 1U1S A; 2RJC A; 3G4S T; 5LL6 S; 2E3I A; 1KQS P; 3CC2 Q; 3X20 B; 2LRQ A; 4R55 A; 2K9G A; 2VXE A; 1MMN A; 3SHW A; 2V8I A; 3VS5 A; 2QGG A; 1N27 A; 4OMF B; 1VQ6 T; 2GNC A; 2FPE A; 1X6B A; 2COZ A; 2OTL Q; 4M77 A; 1NJI R; 1K8A C; 5A0D A; 2DA9 A; 5GAM g; 1D0X A; 2FRY A; 2HBP A; 4F16 A; 1S72 Q; 2OTL A; 2QA4 A; 4M78 A; 1K76 A; 2KRN A; 4HCZ A; 4X34 A; 1SHG A; 2L89 A; 1UHC A; 1AWW A; 3GNF B; 1YIJ Q; 3CXC S; 1WHL A; 1PD1 A; 2RN8 A; 2COW A; 1YHQ A; 4PKC C; 3CCQ T; 1WX6 A; 4E7I A; 1D3B B; 5DY9 A; 1MV3 A; 1AWJ A; 1NG2 A; 1YCS B; 5C6S A; 1GXI E; 3RDV A; 1VQ9 Q; 1AEY A; 3M59 A; 3EG2 A; 4KH0 B; 4DEY A; 2EGC A; 3VRY A; 2DJQ A; 3OS5 A; 1UTI A; 1FXX A; 4JUV A; 1I5O B; 4M7A E; 4DEX A; 1NPR A; 2FZC B; 3CD6 A; 3GOX A; 2CUD A; 3I5R A; 2CDT A; 2GCX A; 2V8J A; 2DEU A; 4LUE A; 3CPW A; 2JNG A; 1JXO A; 4M75 B; 3REB B; 4BE1 A; 5KYY A; 5GAO q; 1I1J A; 5KE2 A; 1Y96 A; 1YJN Q; 1QLY A; 1Q7Y R; 3OW2 S; 2SRC A; 4FW1 A; 2VV5 A; 3X26 B; 2BE9 B; 2QG9 B; 3QYH B; 1ZA2 B; 4BE2 A; 5J26 A; 1WXB A; 3UF4 A; 2HKQ B; 4LDU A; 4E7Z A; 4M75 F; 3G71 A; 1QVG S; 2DIG A; 3TRE A; 2RQV A; 4MML A; 4C8Q B; 2KXD A; 3FC3 A; 2AIR B; 1UEB A; 4RG2 A; 3CME Q; 3OS2 A; 1RAC B; 4E7J A; 2EYW A; 2XID A; 2D8J A; 1NZ9 A; 1IGU A; 5EC7 A; 2RA2 A; 4C8Q F; 3PVQ A; 4PJL A; 3CMA T; 1PKT A; 3QDR B; 1WI7 A; 2YT6 A; 4X9C A; 1LNX A; 4M77 B; 1YI2 T; 3JCM b; 4JZ4 A; 4GLM A; 2DK3 A; 4M78 B; 2QYZ A; 3DLM A; 1QP3 A; 1Q81 U; 3MPU B; 3MCA B; 1BI0 A; 1W1F A; 2JVV A; 1KSW A; 5IAY A; 4EMG A; 4AG1 C; 1VQP A; 2EJ9 A; 3QSU A; 2F5K A; 4BD3 A; 1GL5 A; 1QMC A; 2KI7 A; 1M8V A; 5GJW B; 2AT1 B; 2K3Y A; 1PRM C; 2OX7 A; 4CC4 B; 4M78 F; 2PTK A; 3P8D A; 5LJ3 f; 1GCP A; 3T9N A; 2C06 A; 3G7Z A; 4M75 E; 5CR2 A; 1XTD A; 2AZV A; 2BE7 D; 2CGH A; 2QTV A; 5GAN 6; 2BZ8 A; 3MP6 A; 2P0P A; 1IRX A; 1BYM A; 3PMI A; 4J9E A; 1IXD A; 2PU9 B; 3M9Q A; 3CCE Q; 3HHT B; 2WSC E; 2KVQ G; 4LE9 A; 1VQK Q; 2VAS A; 2XG8 D; 3BFM A; 1VQ4 T; 5KYY B; 3QG1 A; 3JCM d; 3OB9 A; 1GFD A; 1N8R C; 1Y96 B; 4RUG A; 1AT1 B; 2ECZ A; 4F14 A; 1G83 A; 2LZ6 B; 1OPK A; 2A3L A; 3CCS T; 1Y7X A; 4M7A C; 4M77 E; 4B9W A; 5LJ3 e; 2FL7 A; 5A0L A; 1Y57 A; 1YIT Q; 2GBQ A; 5A2Q E; 4IUT A; 4MZM A; 4A4F A; 5CQX A; 4RMO A; 3CC7 Q; 3OYB A; 2LMJ A; 4CRI A; 3ZL7 C; 4JRK A; 2O4X B; 2Y4X A; 3TEE A; 4E7L A; 1EX4 A; 3LH5 A; 2GQI A; 4P5N A; 4BB7 A; 1MGQ A; 2JM8 A; 1TS9 A; 1DJ7 B; 2E3H A; 1KK7 A; 1Q7Y U; 2BKD N; 1AWX A; 3CCM A; 1AVZ C; 2EAY A; 2JN0 A; 3HPW A; 1UHF A; 1OZ2 A; 5GMK i; 1KQ2 A; 1Y0M A; 3CPW S; 2MWO A; 3VUZ A; 1OX8 A; 2RQW A; 4J6Y A; 1K73 C; 2PUK B; 1MV0 B; 4RG8 A; 4EIK A; 5FRN A; 3KBG A; 1G5V A; 3N5B B; 4QQG A; 2PVG B; 2FYK A; 2JT4 A; 3C95 A; 1NYG A; 1W70 A; 1NM7 A; 2RH2 A; 2KRS A; 2GGR A; 4C5H A; 4JJD A; 3CXC P; 2YSQ A; 2CKK A; 1T3L A; 4XU0 A; 3ASK A; 1WHK A; 4M7A G; 4RTT A; 1GBR A; 2KY9 A; 1RAF B; 1WIE A; 3M56 A; 3M54 A; 1UDL A; 2E5Q A; 4IUR A; 1EIF A; 1WDX A; 1IRE B; 1O9S A; 4Z02 A; 2HQE A; 4M75 C; 3I55 Q; 1GBQ A; 1M90 R; 3G1J A; 5I22 A; 3A1P A; 2JTM A; 2WSE E; 3OYK A; 4E7S A; 4C5E A; 4ANJ A; 1WXU A; 2QEX T; 2DXU A; 1H92 A; 1PRL C; 2X4X A; 2BTT A; 3MEA A; 3OW2 P; 2EJF A; 4Z88 A; 3G6E A; 1SKU B; 2C0T A; 3RMS A; 4ATO A; 1K1Z A; 3EHR A; 3L42 A; 1K0S A; 3JCM h; 4MDX A; 2DMO A; 2DIQ A; 1PD0 A; 4DQ2 A; 1QVG P; 5GAM f; 2X4Y A; 3VS2 A; 1I0C A; 3NTH A; 3M0T A; 4FT2 A; 3OSV A; 2DZC A; 4QVZ A; 3JCM X; 2LNV A; 1KJW A; 4R56 A; 4FYX B; 4JRP A; 4E6R A; 1VQ7 Q; 3GP8 A; 4M77 C; 4A53 A; 4JRQ A; 2M16 A; 3CCR Q; 5D6W A; 1QWF A; 2CZ0 B; 4IUV A; 4ZNX A; 1OQK A; 4ZTJ A; 4BDZ A; 2LDM A; 4NOY A; 2RB6 A; 3PTA A; 2HSP A; 1YJW Q; 3VS4 A; 2CP3 A; 3JCM c; 1OI1 A; 1QKX A; 1JB0 E; 2P0Q A; 5D6Y A; 3OYN A; 1IGQ A; 1TH7 A; 5CO7 A; 2JS0 A; 4M75 G; 2NUZ A; 1OU9 A; 1EFN A; 1SPK A; 4OB0 B; 2RQT A; 1ZSZ A; 3HFN A; 3PIP A; 1XOV A; 5C0M A; 1C1A A; 1HK9 A; 1MND A; 4RTZ A; 3ZFJ A; 2I2L A; 1Y71 A; 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