The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
68
|
structure length |
68
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Chain Sequence |
GSSGSSGRPARAKFDFKAQTLKELPLQKGDIVYIYKQIDQNWYEGEHHGRVGIFPRTYIELLSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Sorbin and SH3 domain-containing protein 1
|
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of human sorbin and Sh3 domain-containing protein 1
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Cell adhesion, signaling protein
|
| total genus |
8
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| structure length |
68
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| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JXM A; 1GCQ C; 2RN8 A; 3PE0 A; 4J9B A; 1W70 A; 1WI7 A; 1CSK A; 4OMP A; 4GBQ A; 3VS7 A; 1YNZ A; 2A08 A; 2BZ8 A; 2O88 A; 2RNA A; 5FWB A; 1AVZ C; 2O9V A; 2M51 A; 1SPK A; 1QWE A; 4OMN A; 4CC3 A; 2F2W A; 1B3Q A; 2LMJ A; 2FRY A; 5IH2 A; 1KIK A; 2EKH A; 1H3H A; 1XOV A; 2LJ3 A; 4J9I A; 4JPB W; 3TSZ A; 1RLQ C; 2RQW A; 2HEQ A; 2DIL A; 2RQR A; 2O2O A; 3A98 A; 2K79 A; 4JJC A; 2AKK A; 3UAT A; 1NM7 A; 2DLP A; 2DM1 A; 2JM8 A; 5FW9 A; 3VRZ A; 1WA7 A; 2KNB B; 1CKA A; 1WLP B; 2KT8 A; 1S1N A; 1UG1 A; 2DRM A; 1VYU A; 5IXB A; 2DL4 A; 4D8D A; 1M30 A; 1RUW A; 3H0I A; 1RI9 A; 3H0H A; 3SEM A; 1ZUU A; 2DL3 A; 4CC2 A; 3H0F A; 2DNU A; 1K0S A; 2SRC A; 1MUZ A; 1QWF A; 1JQQ A; 1NYF A; 2KRM A; 1PRL C; 1SRM A; 1YN8 A; 2K7A A; 2FPF A; 4KRT A; 1MV0 B; 2DE0 X; 4JJB A; 2ED0 A; 1UDL A; 5L23 A; 1M3A A; 2EGE A; 2O9S A; 1UGV A; 2VWF A; 4ORZ A; 4CC7 A; 2EQI A; 1K1Z A; 2KXD A; 4K11 A; 2DL8 A; 5GJW B; 1MV3 A; 2EYY A; 2F2X A; 4RTT A; 4JZ4 A; 2MOX A; 3VS3 A; 2C0I A; 4ZNX A; 2BZX A; 3I9Q A; 4Z89 A; 1UFF A; 1OPL A; 2KR3 A; 2A36 A; 1UHF A; 3O5Z A; 1T0J A; 2YSQ A; 1NLO C; 1BK2 A; 2DBK A; 3UA6 A; 2KBT A; 3M0R A; 4JZ3 A; 3EHQ A; 4M4Z A; 1SRL A; 1GFC A; 2FPE A; 4GLM A; 1K76 A; 2CH4 A; 1PNJ A; 2CDT A; 5I11 A; 3I35 A; 2DL5 A; 3PVL A; 1EFN A; 2AZS A; 2KE9 A; 5IHN A; 1HD3 A; 1NEB A; 1VYT A; 2W10 A; 1HSQ A; 2ROT A; 2KYM A; 2HCK A; 1Y57 A; 2CT4 A; 2PNI A; 1VYV A; 2LX7 A; 1YCS B; 4LN2 A; 1M27 C; 3NPF A; 4RTY A; 2RPN A; 2AZV A; 2LNH B; 2L3Q A; 4LE9 A; 2IIM A; 3C0C A; 2GGR A; 3QWY A; 2EYZ A; 3I5S A; 1BB9 A; 2HBW A; 1YWO A; 1K0X A; 2DYB A; 1H92 A; 1OOT A; 2YDL A; 1PHT A; 1M8M A; 1UJ0 A; 1UE9 A; 2LCS A; 4Y92 A; 2K2M A; 2CUD A; 2MCN A; 2LJ0 A; 1W1F A; 1WXT A; 4RTZ A; 2O31 A; 4A63 B; 1YP5 A; 3M0S A; 3UF4 A; 4Z88 A; 1K9A A; 3EG3 A; 1A0N B; 1N5Z A; 2K6D A; 2OJ2 A; 1ZUY A; 2J06 A; 3EG2 A; 4FSS A; 1WYX A; 2L3S A; 1WX6 A; 2CT3 A; 2KYB A; 2GNC A; 4AFZ C; 1AWJ A; 3UA7 A; 2RMO A; 2OAW A; 2DA9 A; 2KGT A; 2NWM A; 4IIO A; 2AK5 A; 1SEM A; 1BBZ A; 5IHI A; 4E6R A; 1X69 A; 2PTK A; 2RQV A; 1UEC A; 2ENM A; 1GCQ A; 1E6H A; 2LJ1 A; 1KFZ A; 3FJ5 A; 1PKT A; 3ZL7 C; 4OMO A; 2LQW A; 2C0T A; 1GBR A; 1X43 A; 4LUD A; 1AZG B; 5I22 A; 2K9G A; 2W0Z A; 2YUQ A; 2MIO A; 1I1J A; 2G6F X; 2BTT A; 2CRE A; 3LH5 A; 2QDL A; 2X3W D; 1TUC A; 2J05 A; 1HJD A; 2EGA A; 2XMF A; 1GRI A; 1TUD A; 2V1Q A; 2CSQ A; 4RTV A; 3JV3 A; 2OI3 A; 2P4R A; 2CH4 W; 2FG0 A; 1LCK A; 2KXC A; 3ULR B; 1AZE A; 2JW4 A; 1J3T A; 3REA B; 1OPK A; 4DEX A; 1E7O A; 2ROL A; 4OML A; 3I5R A; 2V1R A; 4HXJ A; 4J9H A; 5FWC A; 1I0C A; 2JXB A; 1CKB A; 1T3S A; 4ESR A; 2FPD A; 1WXU A; 1UUE A; 2F2V A; 2RQU A; 2H8H A; 1AOJ A; 5IXF A; 1U5S A; 4HVW A; 2SEM A; 4D8K A; 3H41 A; 1PKS A; 2LQN A; 1JEG A; 2KRO A; 4OMM A; 4F14 A; 1RLP C; 2B86 A; 3PVQ A; 1T0H A; 4J9C A; 4LNP A; 3NGP A; 2JS2 A; 2D8J A; 4WCI A; 2DRK A; 2RQT A; 2DF6 A; 1ARK A; 4AFS C; 2YUO A; 3M0P A; 2DVJ A; 1ABO A; 1KSW A; 1SHF A; 1NEG A; 2L0A A; 1NYG A; 2GBQ A; 2NUZ A; 2DMO A; 2YUP A; 1FYN A; 1M3C A; 2JM9 A; 1U06 A; 4F17 A; 1W6X A; 2J7I A; 2EPD A; 1OEB A; 2JMC A; 1V1C A; 1KJW A; 1PWT A; 2PZ1 A; 2YT6 A; 1K4U S; 1IO6 A; 1AEY A; 1AD5 A; 2EW3 A; 3VS6 A; 5EC7 A; 1VA7 A; 2LP5 A; 3EGU A; 3M0U A; 4RTU A; 3THK A; 2GTO A; 4RTX A; 1X6B A; 1GL5 A; 2M0Y A; 1B07 A; 1AWW A; 1GBQ A; 3VS4 A; 2ESW A; 1WXB A; 1ZX6 A; 2AKL A; 1NLP C; 3M0Q A; 1Z9Q A; 2D1X A; 4EIK A; 1ABQ A; 1UHC A; 3VS0 A; 2CUB A; 2EBP A; 1X6G A; 4J9G A; 1QCF A; 2X3X D; 1ZSG A; 5ECA A; 4R0K A; 1PRM C; 1T3L A; 4HCK A; 2A28 A; 2ED1 A; 2HSP A; 4J9D A; 4J9E A; 1G2B A; 1M3B A; 2L3P A; 2HDA A; 1QKW A; 2KRN A; 3M0T A; 3VS5 A; 2D0N A; 1I07 A; 1SHG A; 1G83 A; 1ZUK A; 2FEI A; 1WIE A; 2VVK A; 3SHW A; 3R6N A; 2VKN A; 2DJQ A; 1FMK A; 2C0O A; 3EG0 A; 1UJY A; 2EYX A; 1E6G A; 1GFD A; 2A37 A; 1AWX A; 2KEA A; 1QLY A; 2K3B A; 4CC4 B; 4AFU C; 3RBB B; 3CQT A; 1WFW A; 2E5K A; 3QWX X; 1BU1 A; 2EGC A; 3VS2 A; 4LUE A; 3TVT A; 3EHR A; 2JT4 A; 3TSW A; 1Z9Z A; 2GTJ A; 1H8K A; 2DBM A; 2DL7 A; 3GBQ A; 1U3O A; 4Z8A A; 4AG2 C; 2J6F A; 1JXO A; 3VRY A; 4RTW A; 1OV3 A; 2CSI A; 2KT1 A; 1X27 A; 1NG2 A; 4J9F A; 2BZY A; 3IQL A; 1TG0 A; 1Y0M A; 2JS0 A; 4OMQ A; 1JO8 A; 1ZLM A; 2EYW A; 3REB B; 4QT7 A; 4DEY A; 2FO0 A; 4RUG A; 2ABL A; 3RNJ A; 2L2P A; 1UTI A; 2J6O A; 2JMA A; 2J6K A; 2I0N A; 3VS1 A; 1QKX A; 2FRW A; 4AFQ C; 4X1V A; 1SSH A; 4AG1 C; 1X2Q A; 5IHK A; 5GJV B; 1GCP A; 1ZBJ A; 1AWO A; 3EG1 A; 2D8H A; 3NMZ C; 2LZ6 B; 2DX1 A; 2EVR A; 5HCK A; 4HVV A; 3U23 A; 3NHN A; 1JU5 C; 4F16 A; 2GQI A; 3KFV A; 2RF0 A; 2ECZ A; 1YWP A; 2YUN A; 2KRS A; 1WDX A; 1X2K A; 4JJD A; 4IIM A; 4HVU A; 2JTE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4J9B A; 2CP2 A; 4F7U A; 1QVF S; 1CSK A; 1I8F A; 2HNI A; 4X9D A; 3PMI A; 5FWB A; 2O9V A; 3CCV A; 4DBF A; 1NE8 A; 4M7A F; 1QWE A; 3G1J A; 3QBY A; 5IN1 A; 2CP7 A; 4PJO A; 1IHW A; 4JPB W; 2DJZ A; 1QVF A; 2RA2 A; 1RLQ C; 1Q81 U; 4Y28 E; 5GAN h; 3D7S B; 3A98 A; 2K79 A; 4A4F A; 3OS1 A; 1M90 U; 3JB9 F; 2LQ8 A; 2AKK A; 2DXC A; 2M16 A; 4C8Q C; 4M75 E; 4R56 A; 2ZPE B; 1WA7 A; 4M75 B; 2KNB B; 1RL2 A; 5CQX A; 2Y4X A; 4IKF A; 2CP0 A; 1WHL A; 5IXB A; 3V8J A; 1VQL T; 1IGU A; 1M30 A; 1RUW A; 2WSE E; 2M1H A; 1V29 B; 2AHJ B; 3H0I A; 2CZ7 B; 3H0H A; 3CCE A; 2RHY A; 4CC2 A; 1X75 C; 2A7Y A; 4EMK C; 2SRC A; 3CCM T; 1PRL C; 2FPF A; 2DE0 X; 3C12 A; 3CCS A; 2COY A; 1TWB A; 2EQK A; 2VWF A; 2DL8 A; 1WQW A; 2EYY A; 1KC8 C; 4C92 E; 2EAY A; 2F2X A; 4C92 B; 3FC3 A; 2MOX A; 3VS3 A; 4C0Z A; 1H3Z A; 5AYF A; 1YJW T; 1VQO T; 2CYZ B; 2QA4 T; 1F1B B; 1T0J A; 1BK2 A; 3GNF B; 1VQK T; 1TXQ A; 3PIO A; 5CR2 A; 4XTU A; 5CKE A; 4A53 A; 2KBT A; 4M4Z A; 4M7D C; 3RKY A; 3CCQ Q; 1M1K R; 1SRL A; 1GFC A; 4A4E A; 2OAU A; 1XTD A; 2FPE A; 4GLM A; 1TH7 A; 3QZ9 B; 2CH4 A; 3PVL A; 5IHN A; 3SWN B; 2CP5 A; 5LJ5 f; 1NEB A; 2EQU A; 3A8O B; 2OTL A; 5KYY B; 1VQ6 Q; 3CME T; 2YHT A; 1SF9 A; 4HCB A; 1YCS B; 2OTJ T; 1QW1 A; 3OA6 A; 5FU7 C; 2LNH B; 4J5Y A; 2DER A; 1N8R U; 2HD0 A; 3CD6 Q; 1FMW A; 2GGR A; 3VYH B; 3S3O A; 3LH0 A; 1BB9 A; 1YWO A; 5IT9 E; 2DIQ A; 1FXX A; 1NZ9 A; 2LNV A; 1OOT A; 3V8K A; 3CCU T; 2LCS A; 2MCN A; 1K8A R; 4RTZ A; 4PLL A; 1JJ2 A; 4XTZ A; 1OU9 A; 2F69 A; 1RAB B; 3G7Z A; 4RMO A; 2K6D A; 2OJ2 A; 2J06 A; 4FSS A; 2PUK B; 4F04 B; 4JRK A; 5GAN 5; 3OYK A; 7AT1 B; 2EKO A; 3BFM A; 1QCO A; 2NWM A; 3FEO A; 1W2B P; 5IHI A; 4E6R A; 2PTK A; 2RQV A; 1UEC A; 3OYM A; 1GCQ A; 1PG5 B; 3INZ A; 1PKT A; 3A1P A; 3M58 A; 4AMC A; 2LQW A; 2R58 A; 3HFN A; 1GBR A; 2QAZ A; 1BI0 A; 1X43 A; 2X4X A; 2CZ0 B; 2M9U A; 5KYU A; 5I22 A; 2K9G A; 4M77 C; 3DB3 A; 1VQM Q; 2K3X A; 4EMG A; 2OX7 A; 2MIO A; 1BI3 A; 2BTT A; 2X3W D; 2RI2 A; 1QQJ A; 2VXE A; 1RAE B; 3ZEH A; 3CBO A; 3CBP A; 1G5V A; 3JV3 A; 1M90 R; 4XK8 E; 2JW4 A; 1J3T A; 3REA B; 5GMK l; 1ZSZ B; 3QDR B; 1Y71 A; 4J6X A; 1YIJ Q; 2LQK A; 1E7O A; 2K3Y A; 1JJ2 P; 3H9N A; 3I5R A; 1D3B B; 5GMK h; 2LTO A; 2CP3 A; 2WSC E; 1Y96 A; 1VQ7 A; 3UT1 A; 4ESR A; 1PSF A; 5GAM f; 4JS5 A; 1IZ6 A; 2SEM A; 4D8K A; 3H41 A; 1PKS A; 5DM7 R; 2LQN A; 2KRO A; 4OMM A; 5LJ3 f; 4F14 A; 4VUB A; 2B86 A; 3PVQ A; 3NGP A; 2DEQ A; 1WHG A; 2ZAE A; 3JCM e; 1PC0 A; 1ARK A; 4D6W A; 4TVR A; 2DVJ A; 2FB7 A; 2EJF A; 1K9M C; 5I2M A; 4F7U F; 3OS0 A; 1KC8 R; 1QVG S; 3EG9 B; 1YIT A; 2YUP A; 1FYN A; 1U06 A; 3CMA A; 1W6X A; 2J7I A; 1OEB A; 1MMN A; 1KJW A; 2L8D A; 4M78 G; 2YT6 A; 3CC7 T; 1IO6 A; 4PJL A; 3VJP A; 1AEY A; 4PJO F; 1AD5 A; 4KUD K; 2LP5 A; 3EGU A; 3THK A; 4RTX A; 1UGQ B; 1X6B A; 5KCH A; 2QDY B; 1AWW A; 3QPH A; 1QVG A; 4L5G A; 5GAN f; 4C0G A; 4J83 A; 2XK0 A; 3M0Q A; 3CME A; 1YCY A; 5CK9 A; 2D1X A; 3HKS A; 4OVA A; 1VQ6 T; 2DZ9 A; 1ABQ A; 3VS0 A; 2VC8 A; 2RD1 A; 4C8Q E; 3EGD A; 4C8Q B; 3L2Q A; 2HSP A; 3V7C A; 4FYV B; 3RUX A; 4KH0 B; 1C6V X; 1VQ8 A; 2ZCF B; 2L3P A; 1QKW A; 3M0T A; 4E7K A; 2KY9 A; 3JCM g; 2D0N A; 2E6Z A; 5KH6 A; 2RI3 A; 1FMK A; 3EG0 A; 2PQW A; 1UJY A; 1DJ7 B; 3E19 A; 3WVE B; 2X35 A; 1YJ9 T; 1BCO A; 4FU6 A; 1UGP B; 4EMK B; 4CC4 B; 4J6Y A; 4MMK A; 4AFU C; 1WPY A; 2QQB A; 1JBM A; 2E3I A; 2EGC A; 2NUT A; 3TVT A; 1H64 1; 3TSW A; 4IUU A; 1UGS B; 2NLU A; 2YRV A; 3HRT A; 1RAC B; 4M75 A; 1TTH B; 1VOM A; 2VXF A; 1IRE B; 2KK4 A; 4FW1 A; 1JXO A; 4CRI A; 3CC2 Q; 1OV3 A; 2QTV A; 4XU2 A; 4QQD A; 3IQL A; 4M78 A; 4M7D E; 1MGQ A; 4M7D B; 2ZPB B; 1U1S A; 1UTI A; 5KYN A; 5GAN 6; 2JMA A; 2RHZ A; 3TU4 K; 2KVQ G; 2I0N A; 3VS1 A; 1SSH A; 5IHK A; 3HL8 A; 5FRO A; 1B7T A; 4IUP A; 3V7S A; 3OYF A; 2IPO B; 5KCO A; 4XAX B; 1R77 A; 3NTH A; 1AWO A; 4LDW A; 4HVV A; 5M9O A; 2V8J A; 1JU5 C; 3G6E T; 3KFV A; 4QKU A; 5FU7 B; 4BD3 A; 3GOX A; 1VQN A; 1C0M A; 2YUN A; 2KRS A; 1D09 B; 4BDZ A; 1YIJ T; 3SB2 A; 2LVM A; 3GIB A; 2F5T X; 1ZQ1 A; 3G71 A; 4ME7 A; 3RES A; 2JVV A; 2RB6 A; 4OMP A; 4GBQ A; 3E1S A; 4OMF B; 2X51 A; 1K73 C; 1SPK A; 1Q82 U; 2XDB A; 3RKX A; 3CPW S; 4OMN A; 4MDW A; 1K73 U; 2QI2 A; 1EIF A; 1LPL A; 2LMJ A; 1KHC A; 2RJC A; 3ZFJ A; 2EKH A; 4N4I A; 4J9I A; 2QQR A; 3TSZ A; 4M75 D; 3LGL A; 3X25 B; 3BW1 A; 4BE2 A; 1G3T A; 2HEQ A; 2RQR A; 4C0F A; 5GAN 2; 2E3H A; 4JJC A; 3QII A; 2GCX A; 2DLP A; 2JM8 A; 4RG8 A; 3CPW A; 4JRQ A; 3RKW A; 1K9M R; 1VQ9 A; 4F7U G; 4ANJ A; 1BKB A; 2L3R A; 2MI6 A; 2DXT A; 1S1N A; 2MMP A; 1VYU A; 1ACM B; 2DL4 A; 4Z02 A; 3DB4 A; 4M77 E; 4M77 B; 5D6W A; 1RI9 A; 2E1H A; 2DL3 A; 1EX4 A; 3M4G A; 1TUG B; 5GAO p; 1MUZ A; 4JUV A; 5HKC A; 1JQQ A; 4KH1 B; 1SRM A; 1RAH B; 5IAY A; 2Y90 A; 4C92 D; 8ATC B; 1VQ5 T; 3M4Y A; 4KUL A; 1ZSZ C; 5GJW B; 3PFS A; 1MV3 A; 3J80 E; 4FT4 A; 1OUL A; 1KD1 U; 2HZY A; 3DLL A; 2WSF E; 2BZX A; 2E5Q A; 3TRE A; 3NFC A; 3I9Q A; 3X26 B; 1OPL A; 3M53 A; 4C5E A; 3M0R A; 3CC4 A; 1YJ9 A; 5KYW A; 3CCJ Q; 3Q1J A; 2EQM A; 2VB6 A; 2CDT A; 2HL3 A; 2AZS A; 1I4K 1; 3M59 A; 5KYX A; 2K2V A; 4EPC A; 2PVG B; 2W10 A; 1JB0 E; 2ROT A; 1NBE B; 2KYM A; 1G3W A; 2HCK A; 2CT4 A; 1VYV A; 5I2S A; 4PJO C; 4LN2 A; 1M27 C; 3H6Z A; 1MND A; 1R0B G; 2DO3 A; 3NPF A; 1I5L A; 2H3E B; 2L3Q A; 4LE9 A; 2IIM A; 3C0C A; 4M7A B; 2E12 A; 2NUP B; 4BE0 A; 2EYZ A; 4YTL A; 4PJJ A; 3HRU A; 4ZTF A; 3CC2 T; 3I56 A; 3JCM c; 3TQ7 P; 2JJ9 A; 4DOV A; 1W1F A; 1LNX A; 2DK3 A; 1YP5 A; 3M0S A; 2HQH A; 3RR6 A; 2MPX C; 2XHC A; 3EGX B; 1ZUY A; 3EG2 A; 1WYX A; 3RDV A; 4HCC A; 3I55 Q; 1WX6 A; 1RAA B; 1AWJ A; 1S72 T; 3EFO B; 2HKQ B; 2KGT A; 3BDU A; 4IIO A; 5HY6 A; 2AK5 A; 5FRM A; 1VQ4 Q; 1KG1 A; 2DTH A; 2QEX T; 3JB9 J; 1X69 A; 2ENM A; 1E6H A; 3VUB A; 1N6A A; 1YHQ Q; 3PMT A; 4OMO A; 1TU0 B; 4OB0 B; 4LUD A; 1VQN Q; 3PIP A; 2W0Z A; 2PVD B; 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