The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
119
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structure length |
119
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Chain Sequence |
SKQPDKQRKSQRRAPLHERHKQVRATLSADLREEYGQRNVRVNAGDTVEVLRGDFAGEEGEVINVDLDKAVIHVEDVTLEKTDGEEVPRPLDTSNVRVTDLDLEDEKREARLESEDDSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Ribosome
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| total genus |
29
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| structure length |
119
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| sequence length |
119
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| T | PF00467 | KOW | KOW motif |
| T | PF16906 | Ribosomal_L26 | Ribosomal proteins L26 eukaryotic, L24P archaeal |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3LGL A; 1VQM T; 1EIF A; 1JJ2 S; 2OTL T; 1XTD A; 3PIO A; 1N8R C; 1VQ9 A; 1QVF S; 3CCE A; 2E70 A; 1NPR A; 2XHC A; 4YTL A; 1VQL T; 2G3R A; 4ZN3 A; 3DLL A; 3CC2 T; 1VQ8 A; 2L3R A; 1YI2 A; 2OTJ T; 3CCU T; 2JVV A; 3CPW S; 1VQ9 T; 4TVR A; 3G71 A; 3CCL T; 1BKB A; 1K8A U; 3CCV T; 1QVF A; 3CCQ A; 1YI2 T; 3KBG A; 3OW2 A; 4CRI A; 1VQN A; 1RL2 A; 4ZN1 A; 1S72 T; 1VQ4 T; 3J7A F; 1K9M C; 3CC4 A; 5DM7 R; 3CCR T; 5DLQ E; 1VQN T; 1YHQ T; 3ER0 A; 2QEX A; 1NJI U; 1K73 C; 2EIF A; 1YJW T; 5IAY A; 1Q81 C; 1VQ5 T; 1SSF A; 3CC4 T; 3LGF A; 1M90 C; 2MWP A; 1KQS A; 1M1K U; 1N8R U; 3OW2 S; 3DB3 A; 3CXC S; 1VQ7 T; 3CMA A; 3G4S A; 1KD1 U; 3P8B B; 1Q7Y U; 3CCE T; 1Q82 U; 1Q86 U; 1VQ8 T; 3HKS A; 3CCS A; 3CXC A; 3G4S T; 3G71 T; 1KQS S; 1VQK A; 5LL6 S; 1XNI A; 1K9M U; 3A5Z B; 3CCQ T; 2DO3 A; 4QQD A; 3CCS T; 3CD6 A; 2QA4 A; 1YIT A; 2JUF A; 1KC8 U; 1VQK T; 3CC7 A; 2KDS A; 3JAM E; 1NZ9 A; 2LCL A; 3CCJ A; 1M90 U; 2QEX T; 1IZ6 A; 3PIP A; 1YIT T; 3CD6 T; 1YIJ A; 2JNG A; 3DB4 A; 2MWO A; 1VQP A; 5J3B A; 3J80 E; 2LVM A; 2MI6 A; 1M1G A; 2LQ8 A; 1VQM A; 2JOY A; 3CMA T; 3I55 A; 1NJI C; 1W2B S; 1KC8 C; 1VQL A; 3CCM A; 5HY6 A; 3G6E A; 1YBY A; 3CC2 A; 1M1K C; 2OTJ A; 1NPP A; 1QVG A; 3CCU A; 3I55 T; 3OYY A; 5A2Q E; 3I56 A; 3CCL A; 2CKK A; 3CCV A; 5IT9 E; 1K73 U; 3CCM T; 3G6E T; 1Q81 U; 5FLX E; 1W2B A; 1KD1 C; 1Q7Y C; 3I56 T; 1K8A C; 1VQ6 A; 2IG0 A; 1Q82 C; 2QA4 T; 3LH0 A; 1VQ4 A; 1YJ9 A; 1S72 A; 1YJN A; 3CME A; 1Q86 C; 1JJ2 A; 3CC7 T; 3J81 E; 3CCR A; 1KHI A; 3CCJ T; 1X6O A; 1VQO A; 1YHQ A; 1QVG S; 1VQ6 T; 4RG2 A; 2KVQ G; 1YJ9 T; 1YIJ T; 1YJW A; 1YJN T; 3CME T; 1VQ5 A; 3TRE A; 3CPW A; 4X34 A; 3CPF A; 5J26 A; 2OTL A; 1VQP T; 1VQ7 A; 1VQO T; 2E6Z A; 1UEB A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2W10 A; 4FYY B; 2V26 A; 4NS5 A; 3UAT A; 3I5R A; 2DM1 A; 4ZN3 A; 2RD1 A; 4ESR A; 1BU1 A; 1K8A U; 2EJG A; 2RJC A; 4PFO A; 3M9Q A; 1QVP A; 2LQN A; 4A4H A; 4WF2 A; 4J9C A; 1YIJ Q; 5KCH A; 1LCK A; 2GGR A; 3QZ9 B; 2GBQ A; 1RAB B; 1VOM A; 1Q81 C; 3Q1J A; 2MWP A; 4E7J A; 2RQU A; 3OYF A; 4AFQ C; 2BZY A; 1Q95 G; 3MP8 A; 1VQ7 T; 1GFD A; 5AT1 B; 2O4X A; 3EG9 B; 1VYU A; 1M9S A; 1B3Q A; 1M2V B; 2A08 A; 3C12 A; 2EGA A; 4J9G A; 1I5O B; 2EYZ A; 1K0S A; 2FEI A; 2MYS A; 1K4U S; 3M56 A; 4OF1 A; 2VGM A; 1PC0 A; 6AT1 B; 1NM7 A; 1H92 A; 2X4W A; 2KR3 A; 4PK4 A; 4FCY A; 4BDY A; 3QJY A; 1WHL A; 4RG8 A; 1AWW A; 1YIJ A; 1VQL Q; 4N4G A; 5KYN A; 1I5L A; 2HQH A; 2SEM A; 2WSE E; 2MI6 A; 2K3X A; 2XU8 A; 2ENM A; 2LP5 A; 2DTI A; 1VQ8 Q; 1U06 A; 3TU4 K; 2DIL A; 1ZBJ A; 4XTY A; 1ZLM A; 1K9M R; 4ORZ A; 1N5Z A; 4JRI A; 3EFS A; 3QYG B; 1G3W A; 2QDY B; 4C8Q D; 2E5K A; 5CCA A; 1X27 A; 3HRT A; 1YCS B; 4M78 D; 1Q86 C; 2HSE B; 3EG9 A; 4CC4 B; 1X2Q A; 3MEA A; 1WHK A; 1YIJ T; 1M2V A; 2W0Z A; 3QII A; 2AK5 A; 1X75 C; 2DZC A; 1UGS B; 3KUF A; 2RQT A; 3V8L A; 4HXJ A; 3V7R A; 2D8J A; 3CCS Q; 4C8Q E; 3VS4 A; 4M78 E; 1GCQ A; 3DLL A; 4Y28 E; 1VQ8 A; 4XTX A; 4C8Q G; 1MV3 A; 4M78 G; 5FU7 C; 4BE2 A; 3VS2 A; 2DL3 A; 2QG9 B; 3CCQ A; 2LZ6 B; 1RL2 A; 2LQK A; 3BY7 A; 3FC3 A; 3LWI A; 3H0H A; 2DXU A; 2OJ2 A; 1JU5 C; 2F69 A; 5FW9 A; 3CMA Q; 4JUV A; 2LNV A; 2ZPI B; 1H64 1; 3QJ6 A; 5GMK i; 3EH2 A; 4C8Q B; 2M0O A; 4M78 B; 1OEB A; 4DOW A; 2LRQ A; 5I2M A; 3FEO A; 2BZX A; 1CKA A; 2E10 A; 1M3A A; 1R77 A; 2BUD A; 3V7S A; 5CKH A; 5HCK A; 4RTW A; 1K8A R; 1VQ8 T; 3OW2 P; 3CCS A; 2CZ0 B; 4IUQ A; 4ZGE B; 2K9G A; 3OYM A; 3CCQ T; 3HP9 A; 3OYI A; 2DJZ A; 3NFC A; 1J3T A; 1R0C B; 1H3Z A; 4BY6 B; 2V8K A; 1ZSG A; 1FMK A; 3PIP A; 5CKB A; 4IUU A; 2C0T A; 1AHJ B; 4FSX A; 3MHX A; 2A0F B; 2RHU A; 3QDR B; 1YI2 Q; 2ZPH B; 3X28 B; 2KRO A; 3CXC P; 2KT8 A; 5D6X A; 1BCM A; 1VQ4 Q; 1WHG A; 5HY6 A; 2J05 A; 4E7S A; 2EFI A; 2CSI A; 3MEV A; 2AKL A; 3OYJ A; 4C0F A; 4C8Q A; 3A8O B; 4M78 A; 3OYN A; 1GL5 A; 4ZGD B; 3NHN A; 2RA2 A; 2C0I A; 2EBP A; 1U3O A; 2K5F A; 3O5Z A; 4MZT A; 4XK8 E; 2DPP B; 3CEY A; 1KC8 U; 3M58 A; 2LMJ A; 3UPU A; 9ATC B; 2HDA A; 1UGP B; 3PIO A; 2P0K A; 4HT9 A; 3RMQ A; 4OMM A; 3ZFJ A; 2YRD A; 4F17 A; 1YI2 A; 1RAH B; 2YDL A; 3VU3 C; 2ROT A; 3OW2 A; 4HCK A; 3PFS A; 1FWZ A; 2OX7 A; 1ZBX A; 2CGH A; 3TVT A; 3G7Z A; 2QEX A; 2COY A; 1UUE A; 2EIF A; 3RES A; 2ZCF B; 3JCM J; 2AZS A; 2X3X D; 3AT1 B; 3X20 B; 2VV5 A; 2DXC A; 2Y4Y A; 2DER A; 3BFM A; 3I5S A; 1UGR B; 2DBK A; 2O2O A; 4XU2 A; 2GFU A; 4OB2 B; 3CCM Q; 3CQT A; 3VRY A; 1EFN A; 4J9B A; 5GAN 2; 1N9S A; 3OYH A; 8AT1 B; 5FU7 B; 3CXC A; 3M0S A; 3BDL A; 3C0C A; 3F70 A; 4B9X A; 5LJ3 j; 3V7C A; 2LTO A; 3S6W A; 2G6F X; 1D3B B; 4KH0 B; 3L2Z A; 1N9R A; 2QEX T; 3DB4 A; 5IHI A; 1JRI A; 2PZ1 A; 1VQM A; 5HKC A; 4WCI A; 4LD9 K; 2KE9 A; 3NMZ C; 4P5N A; 3M0R A; 1XOV A; 2RB6 A; 4BAC A; 1RAD B; 3C95 A; 4KGV B; 3CCM A; 2CSQ A; 3JB9 J; 1WJR A; 2XG8 D; 4OP0 A; 2QAS A; 3A98 A; 3I56 T; 2CYZ B; 2IG0 A; 3A8H B; 1PSE A; 5FU6 B; 5LJ5 g; 3M4Y A; 1FMV A; 5FRO A; 1Z9Q A; 4XU0 A; 1YJN T; 4IUT A; 4J9H A; 2JW4 A; 2LDM A; 1WDX A; 3OYE A; 2F5T X; 3G4S Q; 3WVD B; 3EG2 A; 1VQM T; 1TG0 A; 2H3J A; 1M2O A; 1QVG P; 1XTD A; 2M0Y A; 2LJ1 A; 1T3L A; 1DJ7 B; 4M7D D; 1PSF A; 2NUZ A; 2DVE A; 4J7I A; 1D3B A; 2JVV A; 3M54 A; 2FZC B; 4D8K A; 4A4F A; 1PG5 B; 4RTZ A; 3TQ7 P; 1VIF A; 1YWP A; 2M02 A; 1RAC B; 1JQQ A; 1BCO A; 1JXM A; 4R56 A; 3V8K A; 3VYH B; 5DM7 R; 2KGT A; 4QQ6 A; 5LJ5 j; 2M1H A; 1NJI U; 3OMC A; 5GAM h; 4M7D E; 4KGZ B; 1KC8 R; 1ZSZ B; 1M3C A; 4DBF A; 1K1Z A; 1M1K U; 5LJ3 h; 2IVW A; 3OW2 S; 4J8O A; 3JCM V; 4V2S A; 2DRK A; 2L5Q A; 3G6E Q; 3URG A; 3EFR A; 5KH6 A; 3G4S A; 1Q7Y U; 2DIG A; 3PTA A; 1K76 A; 2NUP B; 4QVD A; 1I1J A; 1TUD A; 2Z0W A; 4XU3 A; 4M7D B; 3EG1 A; 5CQX A; 4KGX B; 1M30 A; 1KG1 A; 1OU8 A; 1PD1 A; 2YUP A; 1KQS P; 3OYK A; 2XMF A; 2CZ1 B; 3VUB A; 4C8Q F; 4OMP A; 1YIT T; 3SD4 A; 2JNG A; 4M78 F; 4ELY C; 3FRN A; 3SWN B; 1GBQ A; 2LVM A; 1AEY A; 5L8R E; 3CCV Q; 4LE9 A; 2FHD A; 2QGG A; 2MCN A; 5CKD A; 1FYN A; 2FPF A; 2EQJ A; 1CKB A; 3G6E A; 1U5S A; 1QVG A; 3I55 T; 5KE3 A; 1WX6 A; 2KRN A; 3VS0 A; 3M53 A; 4M4Z A; 1ZSZ A; 2HL5 C; 3A1P A; 4OGE A; 2HQE A; 1KD1 C; 2EQI A; 4J9E A; 3AHU A; 3L2W A; 2RN8 A; 4N0A C; 2KVQ G; 2P4T A; 2NUP A; 3M59 A; 2E6Z A; 4LD6 A; 4M7D A; 1M27 C; 2O9V A; 3FB9 A; 1UGQ B; 2YHT A; 1ZUY A; 3H0F A; 4FW1 A; 3MP6 A; 3JCM f; 1NLO C; 3H0I A; 1WYX A; 4CRI A; 3SWN A; 2YUQ A; 3C4S A; 3J7A F; 5LJ3 f; 2F2X A; 1VYV A; 4F7U E; 1W70 A; 2FRW A; 3GNF B; 1KQS A; 2YWW A; 1BB9 A; 1JO8 A; 2V8J A; 3FIF A; 3QKJ A; 1QP3 A; 4NL2 A; 1GXI E; 1ABQ A; 2XK0 A; 4J5Y A; 1M1F A; 1QP2 A; 3T9N A; 3JCM X; 5LL6 S; 2JJ9 A; 5CIU A; 4F7U B; 1NJI R; 1O9S A; 1WJQ A; 4MML A; 4LUD A; 2KAF A; 1WIE A; 1M1K R; 2PUK B; 4M7A D; 2IPO B; 3GPL A; 4JZ4 A; 2LT4 A; 5KE2 A; 4QVZ A; 1K0X A; 1QWE A; 3EGU A; 3RKX A; 2RF0 A; 1QQJ A; 4MMK A; 1T0J A; 5A0L A; 1R0B G; 2E41 A; 1SF9 A; 4M7A E; 3L1A A; 1BIB A; 3I9Q A; 4BI4 A; 4JDS A; 1Q81 R; 4M75 E; 4OMO A; 3SEM A; 1VQ7 Q; 2A36 A; 1X6O A; 1Y71 A; 1QVG S; 3L42 A; 3RMS A; 5GAM e; 2E64 A; 4BD3 A; 3GBQ A; 2DMO A; 3M0P A; 1LJO A; 2OAU A; 2KY9 A; 3MEW A; 1FX7 A; 1EIF A; 3MP1 A; 2K2V A; 1YCY A; 4F7U A; 4M7A B; 2DTO A; 3OYG A; 2RK1 A; 4M75 B; 2YRC A; 2P0P A; 1RI9 A; 2JTE A; 4Z8A A; 1VQ9 T; 3FDR A; 3QHS A; 1IXD A; 2YSQ A; 5GAN 5; 3CBM A; 2DD5 A; 1Y96 B; 3NGP A; 1MMD A; 2F1L A; 1JEG A; 3ME9 A; 2XDD A; 5DLQ E; 2X3W D; 5L23 A; 5KYX B; 1WQ7 A; 2PU9 B; 4DA4 A; 3VJP A; 4IIM A; 2QQA A; 3FLG A; 1RAG B; 2ROL A; 4JJB A; 3DB3 A; 2DE0 X; 3U23 A; 3HFN A; 5M9O A; 1SKU B; 4FT4 A; 1MGQ A; 4E7L A; 4C5E A; 2MMP A; 1NYG A; 1VYT A; 3VS5 A; 3CBO A; 3HKS A; 3SHW A; 1KQS S; 5KYW B; 5FRM A; 3LWH A; 1AOJ A; 3VS3 A; 2VXF A; 2DL4 A; 2EJ9 A; 2QYZ A; 5A0D A; 1G2B A; 4CI0 C; 2D1X A; 2QXF A; 4M7A A; 2AKK A; 2DKG A; 4C5G A; 5LJ5 d; 4M75 A; 1YP5 A; 2RHX A; 4XQ3 A; 2CH4 W; 2QTV A; 2R57 A; 2MPX C; 5D6W A; 3QG1 A; 4BE0 A; 1QLY A; 3A8G B; 3UWN A; 1Y96 A; 2RK2 A; 5GAN 6; 1QW1 A; 3LX7 A; 5D7U A; 2CP2 A; 1M8M A; 4M77 C; 3CCU A; 5CKE A; 5KYX A; 4RCC A; 3CCL A; 1PNJ A; 5IT9 E; 4A54 A; 4M7D F; 2OI3 A; 2LJ0 A; 1D09 B; 2O88 A; 2EQM A; 1MHN A; 1P92 A; 1B7T A; 1PD0 A; 4ELZ C; 2K5L A; 3FJP A; 4PLI A; 2PQW A; 5KYW A; 1G3S A; 2EAY A; 1UG1 A; 2F2W A; 4E47 A; 3LW5 E; 1RAE B; 3CCQ Q; 2RQW A; 2RHZ A; 2JM8 A; 4LDX A; 2E70 A; 2ATC B; 1IRE B; 2VYT A; 3CCU T; 1OPK A; 3CCL T; 1JJ2 P; 2DIQ A; 4BE1 A; 4PJO C; 5DY9 A; 2V1R A; 4IKF A; 3RIR A; 3OA6 A; 3QBY A; 4MDW A; 4E2F B; 2VVK A; 2JM9 A; 3JB9 H; 1Q82 U; 1T3S A; 1FXX A; 5CVI A; 2A3L A; 2KYM A; 2L8D A; 4IUV A; 3EAE A; 4EMK C; 2DO3 A; 3DLM A; 4DEY A; 4NL3 A; 5GAN g; 1H8K A; 1FMW A; 2CP5 A; 1YJW Q; 2E6N A; 1AZG B; 4AMC A; 4FW2 A; 1OYX A; 4HKE A; 4M77 D; 1SRL A; 3JCM W; 2HD0 A; 4J83 A; 3PMI A; 3SDZ A; 4JRQ A; 3P8H A; 3CC2 A; 1I8F A; 1YBY A; 2DL8 A; 5C6S A; 3RER A; 5HK0 A; 2L3P A; 1K73 U; 4F7U F; 4IUR A; 3HL8 A; 2X35 A; 2J6K A; 1AZE A; 5GAN j; 4KT0 E; 1JJ2 A; 5CO7 A; 4M77 G; 4II1 A; 4C0D C; 1VQ6 T; 1YJW A; 4OVA A; 5IHN A; 5IH2 A; 4PJL A; 1UHC A; 2E12 A; 5GMK j; 4XAX B; 3OBW A; 3CC2 T; 2A28 A; 3OYA A; 2MOX A; 2QEX Q; 3MET A; 1JBM A; 3KBG A; 4ZN1 A; 4Z88 A; 2AHJ B; 1EX4 A; 1AVZ C; 2M16 A; 1M8V A; 2YT6 A; 3JCM c; 1VQN T; 2L3S A; 1RUW A; 3VKI A; 4QVC A; 1YJW T; 1RLQ C; 4LDV A; 3CC4 T; 2VGN A; 1M90 C; 2YUO A; 3R6O A; 1YN8 A; 2DL5 A; 2HEQ A; 4KUL A; 2BKD N; 1GCP A; 4QT7 A; 4M7A F; 2EKH A; 2M9U A; 1WQW A; 2RH2 A; 4MZM A; 4M75 F; 3I56 Q; 5I21 A; 1I07 A; 3PVQ A; 1HD3 A; 2R5M A; 1YJN Q; 1W6X A; 3E9G A; 3A5Z B; 3QZ5 B; 2HQX A; 2BE9 B; 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