The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GIDPFTGEAIAKFNFNGDTQVEMSFRKGERITLLRQVDENWYEGRIPGTSRQGIFPITYVDVIKRPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein/cell adhesion
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Paxillin and ponsin interact in nascent costameres of muscle cells
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ponsin
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| total genus |
12
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-12-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UUE A; 2EGC A; 1BK2 A; 2HSP A; 1RLQ C; 1IO6 A; 1NLP C; 1WLP B; 4Z88 A; 1KJW A; 2EW3 A; 3TSZ A; 1SHF A; 1T3L A; 1QWE A; 4DEY A; 2FRW A; 3ZL7 C; 2LZ6 B; 3NGP A; 3M0T A; 5EC7 A; 2RNA A; 2OAW A; 2AK5 A; 2A36 A; 3UAT A; 4J9D A; 4F14 A; 3RNJ A; 2KXC A; 1EFN A; 3QWX X; 1M30 A; 1XOV A; 4F17 A; 2L2P A; 4HVV A; 1ZBJ A; 5L23 A; 2J05 A; 3M0R A; 2L3P A; 5IH2 A; 1ABQ A; 1CKA A; 4RTV A; 2L0A A; 4ZNX A; 2LCS A; 2EKH A; 1I1J A; 2PZ1 A; 1X27 A; 3CQT A; 3R6N A; 2KYM A; 2FPE A; 2X3X D; 4Z89 A; 1OEB A; 1Z9Z A; 2E5K A; 2EBP A; 2KNB B; 1X69 A; 3C0C A; 3UA6 A; 4RUG A; 2RQR A; 3NMZ C; 2LJ3 A; 2CH4 W; 2DX1 A; 2F2X A; 2ROT A; 2LMJ A; 2FPD A; 1YP5 A; 1ZSG A; 2B86 A; 2H8H A; 1ZUU A; 2VVK A; 2MCN A; 2RQW A; 2YT6 A; 1AVZ C; 3FJ5 A; 1E6H A; 1WFW A; 1M3B A; 4LUD A; 1JO8 A; 2A28 A; 2DJQ A; 1GFD A; 2DE0 X; 2BZ8 A; 2K3B A; 5ECA A; 2KR3 A; 1YWO A; 2GTO A; 2IIM A; 2LX7 A; 2EYW A; 4AFS C; 5IXF A; 2J06 A; 1SRL A; 2L3Q A; 1U3O A; 3VS0 A; 1E7O A; 4GBQ A; 4FSS A; 4JZ3 A; 1GFC A; 1NYG A; 4KRT A; 3RBB B; 2J6O A; 2JTE A; 2JM8 A; 4RTX A; 5IXB A; 2MIO A; 1U06 A; 3GBQ A; 2DYB A; 2GQI A; 1ARK A; 1UJY A; 4Z8A A; 1K4U S; 1ZUK A; 2BTT A; 4LN2 A; 3QWY A; 2O88 A; 1WXT A; 2XMF A; 2CT3 A; 1V1C A; 2HBW A; 2AZV A; 2K7A A; 2D8H A; 1UTI A; 3I9Q A; 1H92 A; 2M51 A; 1W6X A; 1YNZ A; 4HXJ A; 1S1N A; 2ED1 A; 2YSQ A; 1GRI A; 1KFZ A; 1W1F A; 1MV3 A; 2CRE A; 4F16 A; 1PNJ A; 1PKT A; 3UF4 A; 3VS2 A; 2KGT A; 1H8K A; 4RTT A; 2FG0 A; 2AKL A; 1NEG A; 1JQQ A; 2OJ2 A; 4JJC A; 1GL5 A; 2LP5 A; 1G2B A; 3VS6 A; 1OPL A; 1HJD A; 4AFQ C; 4LE9 A; 4JJD A; 2J6K A; 2JMA A; 3EG1 A; 4K11 A; 1HSQ A; 1X2Q A; 2V1Q A; 4OMQ A; 2DL5 A; 4HVU A; 3M0P A; 2YUO A; 4OMO A; 4RTU A; 1AWX A; 4HCK A; 2NUZ A; 1J3T A; 2JW4 A; 2NWM A; 2FRY A; 2O2O A; 1M8M A; 2FEI A; 2KT8 A; 2DA9 A; 4CC4 B; 2D8J A; 1W70 A; 1NM7 A; 4RTZ A; 4ORZ A; 4AG2 C; 1SHG A; 2RQV A; 4AG1 C; 3KFV A; 2OI3 A; 4J9F A; 1BBZ A; 1ABO A; 1GBQ A; 1SSH A; 4OMP A; 3NHN A; 4JJB A; 1QCF A; 4Y92 A; 2LQW A; 4LUE A; 1T3S A; 2LNH B; 1AWO A; 2JMC A; 2RF0 A; 2AKK A; 1X2K A; 4R0K A; 1ZUY A; 2BZY A; 2ECZ A; 2EYZ A; 2KT1 A; 1K0X A; 1H3H A; 1TG0 A; 2KBT A; 1Y57 A; 3ULR B; 1A0N B; 2CSI A; 2DRM A; 5HCK A; 2ENM A; 2RMO A; 1AD5 A; 1NYF A; 2LJ0 A; 2KRM A; 1PKS A; 2EQI A; 3NPF A; 2O31 A; 3EG3 A; 2A08 A; 2DL7 A; 2VKN A; 2KRS A; 2EGE A; 2PNI A; 2EGA A; 2ROL A; 2FPF A; 2KRO A; 3EHQ A; 2JT4 A; 1YWP A; 2SEM A; 2K2M A; 4QT7 A; 1WYX A; 1OPK A; 1M27 C; 1I0C A; 2K9G A; 1GCQ A; 4JPB W; 4ESR A; 1SPK A; 1WI7 A; 1WA7 A; 4M4Z A; 2KEA A; 2V1R A; 1RI9 A; 1GCQ C; 4JZ4 A; 1AZG B; 1PHT A; 2F2V A; 1LCK A; 2F2W A; 2O9V A; 1QKW A; 1KSW A; 1UDL A; 5FWB A; 1AEY A; 1PRM C; 2GBQ A; 2K6D A; 1U5S A; 1MUZ A; 2KYB A; 3IQL A; 2DMO A; 1K9A A; 2DF6 A; 1UHC A; 2KRN A; 1AWJ A; 2DM1 A; 1K1Z A; 2ESW A; 3I5S A; 3REA B; 4IIO A; 2ABL A; 2DL4 A; 1K76 A; 3EG2 A; 1T0H A; 2CDT A; 1UG1 A; 3VS5 A; 2CUD A; 2PTK A; 5FW9 A; 3M0U A; 2C0T A; 1BU1 A; 2RPN A; 1TUC A; 1WDX A; 2BZX A; 2YUP A; 1GCP A; 1Z9Q A; 1JEG A; 4A63 B; 1QKX A; 4J9C A; 2C0O A; 1KIK A; 4GLM A; 1NLO C; 2VWF A; 1GBR A; 2C0I A; 1M3C A; 2LQN A; 3LH5 A; 3I35 A; 5I11 A; 2A37 A; 1T0J A; 2L3S A; 4D8K A; 2DNU A; 2CUB A; 4CC2 A; 1RLP C; 4RTY A; 2J7I A; 2GGR A; 1I07 A; 1JXO A; 1YN8 A; 2G6F X; 3VS3 A; 1FMK A; 1G83 A; 2D0N A; 2GTJ A; 1NG2 A; 1PWT A; 4CC3 A; 1Y0M A; 2EYY A; 2CT4 A; 4CC7 A; 1VYV A; 2DLP A; 1UHF A; 4DEX A; 4J9E A; 1CSK A; 2W10 A; 2DIL A; 1WXU A; 1QLY A; 3UA7 A; 1AOJ A; 3A98 A; 4D8D A; 3PVQ A; 1UFF A; 2HDA A; 1WIE A; 4WCI A; 3VRZ A; 2EYX A; 2RQU A; 2JS2 A; 1OV3 A; 2JM9 A; 3VS7 A; 2KXD A; 3M0S A; 3TSW A; 1BB9 A; 1M3A A; 4J9B A; 2AZS A; 2M0Y A; 5I22 A; 1NEB A; 1ZLM A; 2YUQ A; 3PE0 A; 1E6G A; 2JS0 A; 3SEM A; 5IHK A; 1OOT A; 1UE9 A; 1QWF A; 3EG0 A; 3O5Z A; 2YUN A; 4X1V A; 1VYU A; 4E6R A; 2W0Z A; 1AZE A; 3H0I A; 4IIM A; 1WX6 A; 2ED0 A; 2RN8 A; 2DVJ A; 2EVR A; 1X43 A; 2I0N A; 1CKB A; 4J9H A; 1HD3 A; 1X6B A; 2K79 A; 5GJV B; 2DBM A; 4OMN A; 4J9G A; 1SRM A; 3H0F A; 1N5Z A; 1B3Q A; 1JXM A; 1YCS B; 3SHW A; 3PVL A; 1WXB A; 2HEQ A; 3U23 A; 2LJ1 A; 3JV3 A; 3I5R A; 2FO0 A; 5GJW B; 3VRY A; 5IHI A; 4OMM A; 2JXB A; 2CSQ A; 2X3W D; 2SRC A; 2QDL A; 1VYT A; 1UEC A; 2CH4 A; 1TUD A; 4HVW A; 3TVT A; 2KE9 A; 3M0Q A; 5FWC A; 1SEM A; 3EGU A; 1JU5 C; 2HCK A; 4J9I A; 3H41 A; 2J6F A; 3VS1 A; 2O9S A; 5IHN A; 2RQT A; 2D1X A; 1MV0 B; 2DBK A; 3H0H A; 2DL3 A; 1ZX6 A; 1X6G A; 2YDL A; 3REB B; 1UGV A; 1B07 A; 1AWW A; 2GNC A; 4AFU C; 1VA7 A; 3EHR A; 1K0S A; 4EIK A; 4LNP A; 2P4R A; 1UJ0 A; 2EPD A; 1RUW A; 1PRL C; 4OML A; 3THK A; 2MOX A; 3VS4 A; 4AFZ C; 1FYN A; 2DL8 A; 4RTW A; 2DRK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1PM3 A; 1U8R A; 3QKJ A; 1UUE A; 2EGC A; 1BK2 A; 3JCM g; 4FW1 A; 1GXI E; 3CCE T; 5LJ3 h; 4FSX A; 2E6Z A; 5GAO m; 1VQ8 Q; 3JB9 F; 1KC8 U; 3CXC A; 3TCJ A; 3M0T A; 3G7Z A; 9ATC B; 2OAW A; 3QXE B; 2AK5 A; 2A36 A; 5D7U A; 3OBY A; 1K73 C; 2ZPF B; 1VQN A; 3GF5 A; 4F14 A; 1EFN A; 1VQ7 Q; 5KYU A; 1RAH B; 4F17 A; 2L2P A; 4HVV A; 1LVK A; 4PJM A; 1NZ9 A; 2FYK A; 1BYM A; 3M0R A; 3X26 B; 3OYF A; 1KHC A; 4HCC A; 2L3P A; 5IH2 A; 1ABQ A; 3FIF A; 1S72 A; 4ZNX A; 5LJ3 j; 1YIJ A; 3CC2 T; 4ELZ C; 1YJW A; 1I5L A; 2K57 A; 3GNF B; 3CD6 A; 2ZPH B; 2EYQ A; 5KYU B; 3R6N A; 2KYM A; 2FPE A; 2RO0 A; 1TS9 A; 5HY6 A; 1V76 A; 2LQK A; 3JB9 H; 2CH4 W; 5GAN 6; 4PJN A; 2ZGW A; 4BE1 A; 2ROT A; 2LT1 A; 3GLX A; 5CAI A; 3OYN A; 3JB9 J; 1ZUU A; 3DLM A; 2RQW A; 2YT6 A; 2RM4 A; 1E6H A; 5GAO p; 2A28 A; 1GFD A; 3I55 T; 2K3B A; 5LJ5 e; 2IIM A; 2GTO A; 2HMA A; 1U3O A; 1YBY A; 3BDU A; 1E7O A; 4JZ3 A; 1RAF B; 5J39 A; 1NYG A; 4X9D A; 2J6O A; 3HRU A; 1VQ5 T; 1N8R R; 2DAQ A; 1U06 A; 2VGM A; 2DEQ A; 2RA2 A; 4J8O A; 1UJY A; 1K4U S; 1K9M U; 4LN2 A; 2XMF A; 1MNE A; 2AZV A; 1H92 A; 2MAM A; 1YNZ A; 4J7I A; 5AYF A; 2YSQ A; 3OYE A; 3FC3 A; 1YIT A; 3LWH A; 1GRI A; 1QVF A; 1N27 A; 3HL8 A; 1YI2 Q; 1VQO A; 2CP2 A; 4RMO A; 1MV3 A; 4LDW A; 4EPC A; 2CRE A; 3P8H A; 3PT9 A; 1H8K A; 4XTX A; 2OJ2 A; 1VQK T; 1NPR A; 1G2B A; 3VS6 A; 4LE9 A; 4IUQ A; 3QJY A; 4GLK A; 1YJN Q; 2KMT A; 1SKU B; 4HVU A; 3SWN C; 4KBM B; 2EQM A; 2HKN A; 2X4J A; 1KD1 R; 1J3T A; 4DBQ A; 2ZPE B; 3HP9 A; 3ZFJ A; 2O2O A; 2FEI A; 2DA9 A; 4O5V A; 2VYT A; 4M77 E; 4A4G A; 1KK7 A; 2MYS A; 3L2U A; 1NM7 A; 1Y07 A; 3CCE A; 4Q5W A; 4PJL A; 1WHH A; 4L59 A; 1SHG A; 3R6O A; 3WVE B; 4EMK A; 1Q81 C; 1BBZ A; 4HKE A; 1GBQ A; 3NTI A; 3H8Z A; 4A4F A; 3NHN A; 1M90 U; 3SB2 A; 4MML A; 2PVD B; 4L6V 5; 1M1F A; 4M77 C; 2LNH B; 1AWO A; 3C95 A; 1FXX A; 3OYG A; 1YJN T; 4EMK B; 4M78 E; 2AKK A; 1ZUY A; 5GAO l; 1Q82 U; 3G4S Q; 3CCJ Q; 3CCL Q; 2EYZ A; 2KT1 A; 3OYA A; 3CC2 A; 2XK0 A; 2CSI A; 5HCK A; 1QCN A; 4PK4 A; 1NYF A; 4MMK A; 2X4W A; 2O31 A; 4C0Z A; 2DL7 A; 5LJ3 g; 2FPF A; 2KRO A; 2H3E B; 4M78 C; 2SEM A; 2K2M A; 3SFM A; 3NTK A; 1QW1 A; 3HSB A; 4JPB W; 3QDF A; 3S6W A; 2MPX C; 1K8A U; 4FIB A; 2V1R A; 4HT9 A; 1GCQ C; 1AZG B; 3I55 A; 1ZA1 B; 1QKW A; 3RKY A; 1G3W A; 2O01 E; 1VQ4 T; 5A0L A; 4E7H A; 2DMO A; 3AT1 B; 2KRN A; 4XU0 A; 3CCL T; 3C12 A; 1AWJ A; 4VUB A; 1K1Z A; 5M9O A; 3CME Q; 3I5S A; 3OYL A; 3G6E Q; 1VQ5 A; 2QA4 A; 2CUD A; 5GAN 4; 4QVD A; 1M1K C; 5KYY A; 4LXC A; 5FW9 A; 3G71 Q; 2RPN A; 5GAN e; 1TUC A; 4AT1 B; 1WDX A; 3G1J A; 1QKX A; 1IHV A; 2PVO B; 2JOY A; 2XHC A; 2LNV A; 1KIK A; 2VWF A; 2QGF B; 1NBE B; 2WSE E; 5EG2 A; 3KUF A; 5KYY B; 3CCM A; 2A37 A; 1T0J A; 2L3S A; 3M4G A; 2DNU A; 4M7D E; 3M57 A; 2CUB A; 2DZ9 A; 1RLP C; 1VQL T; 5CKB A; 2Y4Y A; 1VQK A; 3URG A; 2GGR A; 3EAE A; 4V2S A; 2G6F X; 3CC4 T; 2RHZ A; 2D0N A; 2PUK B; 2BE9 B; 4CC3 A; 1KC8 R; 2EYY A; 2O4X A; 3I56 Q; 2GFU A; 2EJG A; 3CME T; 1Y96 A; 4DEX A; 3G6E T; 1CSK A; 3QZ5 B; 4M7D C; 2OAU A; 4QVC A; 1WQ7 A; 3PVQ A; 3EFR A; 4A4H A; 3HTR A; 2HDA A; 1WIE A; 5LJ3 d; 1RAC B; 4ZGJ B; 3HHT B; 5GAM j; 2O4X B; 2JM9 A; 4IUR A; 1I81 A; 5FU7 C; 2KXD A; 1Y96 B; 2QG9 B; 2JTM A; 1BI2 A; 1G8X A; 1PD1 A; 4N0A A; 3JCM V; 3MP8 A; 4NS5 A; 2MWP A; 3PE0 A; 4M78 F; 1O9S A; 5GMK m; 2CP7 A; 1Q7Y U; 2A0F B; 4X1V A; 1VYU A; 4F7U F; 3JCM P; 1RAI B; 1ZQ1 A; 1PC0 A; 1WX6 A; 2ED0 A; 3CCV Q; 2MI6 A; 3CBM A; 1X43 A; 3OY9 A; 2DTO A; 1OU9 A; 3P8B B; 2RI5 A; 3A5Z B; 3JCM J; 1M5Q 1; 3SHW A; 1JXM A; 3U23 A; 2FO0 A; 2MWO A; 1N8R U; 4ELY C; 2PQW A; 4C92 D; 2EQK A; 2K2V A; 3CCS A; 2RJC A; 2QEX Q; 3CCR Q; 3P8D A; 1TUD A; 5J3B A; 4HVW A; 4Z02 A; 4BY6 B; 2KE9 A; 3M0Q A; 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1Q82 R; 3QDR B; 6AT1 B; 2P0K A; 1D3B B; 4M7A B; 2DET A; 2E10 A; 1YP5 A; 1ZSG A; 2B86 A; 1I4K 1; 2RI2 A; 1QP3 A; 2XI9 A; 5IN1 A; 3OQ5 A; 3MPU B; 5ECA A; 2AT1 B; 2K5I A; 1YWO A; 4FT2 A; 3CCQ T; 2J06 A; 3FEO A; 4KUL A; 1QVG A; 1K8A R; 1IZ6 A; 2YXY A; 1VQ9 Q; 1GFC A; 2ZCF B; 1M8V A; 2JM8 A; 2I2L A; 4Y91 A; 5IXB A; 3OS1 A; 1VOM A; 2MIO A; 3MEA A; 2DZC A; 2OTJ Q; 5GMK l; 1VQ6 T; 4WF2 A; 4C5I A; 1V1C A; 2HBW A; 2KI7 A; 2D8H A; 1UTI A; 4M7D G; 3L2W A; 2M51 A; 2VB6 A; 2KSS A; 1IB8 A; 4E7I A; 1QVG P; 1XTD A; 2M02 A; 3X20 B; 3CCU Q; 2FZC B; 3GOX A; 4JS4 A; 4JLI A; 4JUV A; 4MZT A; 1PNJ A; 1TTH B; 4CI0 C; 2K4Y A; 2KGT A; 3J80 E; 1NEG A; 3DKM A; 4EDU A; 3BE3 A; 2CP6 A; 3A8L B; 4JJC A; 2B8A A; 2DK3 A; 3A1P A; 4J6Y A; 2YLC A; 4AFQ C; 4WTO B; 1N9S A; 2X4Y A; 1VQM T; 2GFA A; 4OMQ A; 2DL5 A; 1RI0 A; 3M0P A; 4RCC A; 3CC7 A; 1OI1 A; 2Z0W A; 3E2U A; 1G3S A; 4HCK A; 2QTX A; 2NUZ A; 4O6J A; 1K9M C; 2NWM A; 1U1S A; 2IPO B; 1SF9 A; 2HAX A; 4GY5 A; 3X24 B; 1D1B A; 2D8J A; 5CQX A; 5LJ5 h; 1BI1 A; 4PFZ A; 2EJ9 A; 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