The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GSEIVVAMYDFQATEAHDLRLERGQEYIILEKNDLHWWRARDKYGSEGYIPSNYVTGKKSNNLDQYD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The solution structure and intramolecular associations of the Tec kinase SRC homology 3 domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Mus musculus
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| molecule keywords |
TYROSINE-PROTEIN KINASE TEC
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| total genus |
11
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2001-08-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2P4R A; 2F2V A; 3UAT A; 2KXD A; 4CC3 A; 1WYX A; 4CC4 B; 2EGE A; 1M30 A; 1JXM A; 1WFW A; 3IQL A; 4J9I A; 2JW4 A; 3RBB B; 4ZNX A; 2NUZ A; 2KYB A; 2E5K A; 2AKK A; 2F2W A; 2KXC A; 2SEM A; 4J9C A; 1U06 A; 2L3Q A; 2KE9 A; 3EG2 A; 4JPB W; 2DL7 A; 1OPL A; 1KIK A; 4WCI A; 1TUC A; 2V1Q A; 2L0A A; 1I0C A; 1M3B A; 1VYV A; 1WLP B; 1SHG A; 2DE0 X; 1UTI A; 4HXJ A; 2CUB A; 4Z88 A; 1QKW A; 1UFF A; 1WXU A; 3M0S A; 4LN2 A; 1YN8 A; 3PE0 A; 3LH5 A; 2MOX A; 2KYM A; 2JS0 A; 3H0H A; 4J9E A; 4F14 A; 2DLP A; 2HCK A; 1QKX A; 2FPE A; 4AFU C; 3I9Q A; 2HBW A; 2CDT A; 1ZX6 A; 1I1J A; 2CH4 W; 2CRE A; 1M3A A; 1W6X A; 2FG0 A; 2EYY A; 2B86 A; 3EG3 A; 2D8H A; 2LQN A; 4OMO A; 4AG2 C; 2ENM A; 3REA B; 2YDL A; 2VKN A; 4RTW A; 1Z9Z A; 1BBZ A; 1GCP A; 4AFQ C; 3TSW A; 2EYW A; 2SRC A; 3GBQ A; 1RUW A; 1GRI A; 2H8H A; 3SHW A; 1BK2 A; 1OEB A; 2A36 A; 4RTY A; 1PKT A; 2L2P A; 2K2M A; 1I07 A; 2KRS A; 2VWF A; 2IIM A; 3M0P A; 1NEB A; 1TG0 A; 5IXF A; 2KGT A; 4RTX A; 1UDL A; 3VRY A; 3O5Z A; 1RI9 A; 1UG1 A; 2LX7 A; 1H92 A; 1IO6 A; 2MCN A; 3VS4 A; 3M0R A; 5I22 A; 1ABO A; 2JTE A; 1MV3 A; 4J9H A; 2LNH B; 2K3B A; 1JU5 C; 2GTO A; 2VVK A; 1UEC A; 1MV0 B; 2KEA A; 1B3Q A; 1K76 A; 4D8K A; 1T0H A; 2EQI A; 1ZUU A; 1FYN A; 2O88 A; 2DM1 A; 1VYT A; 1JEG A; 2RQT A; 2CSQ A; 2K79 A; 2C0O A; 1PHT A; 2O2O A; 1NM7 A; 3SEM A; 2EGC A; 5IHK A; 2DBK A; 1AWO A; 1J3T A; 2AZS A; 1Z9Q A; 3RNJ A; 1ZBJ A; 2J6F A; 1UJY A; 2KBT A; 5EC7 A; 2CH4 A; 2KT8 A; 4M4Z A; 4LUD A; 2GNC A; 4JJD A; 4R0K A; 3UF4 A; 1MUZ A; 2EBP A; 2DRK A; 1SPK A; 2GGR A; 2J6K A; 2JM9 A; 1K9A A; 2V1R A; 2W10 A; 2RNA A; 3I5R A; 4CC2 A; 2DBM A; 2PZ1 A; 3EG0 A; 1B07 A; 2RQW A; 2FRW A; 2DVJ A; 3JV3 A; 1PRL C; 5FW9 A; 4JZ3 A; 4ESR A; 2C0T A; 1CKA A; 5FWB A; 1KFZ A; 2XMF A; 1PNJ A; 3VRZ A; 2HSP A; 2BTT A; 2JMC A; 2J7I A; 1NG2 A; 2RMO A; 1K1Z A; 1NYG A; 4J9D A; 2EPD A; 2BZY A; 1YWP A; 2J06 A; 1AWX A; 2ROL A; 4CC7 A; 1GBR A; 1KSW A; 1RLP C; 2DL3 A; 2G6F X; 4X1V A; 4RUG A; 5IHI A; 2YUQ A; 3PVL A; 2RPN A; 3NMZ C; 1JO8 A; 5GJW B; 1ZSG A; 2LJ3 A; 1ZLM A; 2KRM A; 4EIK A; 2EW3 A; 2K7A A; 2GQI A; 2YUN A; 2AKL A; 2CT3 A; 1SRL A; 2AZV A; 1YWO A; 2DF6 A; 4J9B A; 1K0S A; 4DEX A; 1WXT A; 2DYB A; 2FRY A; 4HVV A; 1LCK A; 1U5S A; 2KR3 A; 3VS1 A; 4DEY A; 2LMJ A; 1FMK A; 1V1C A; 2RF0 A; 2C0I A; 1G83 A; 2PTK A; 4RTT A; 2RN8 A; 4IIO A; 4IIM A; 1CSK A; 2J05 A; 2NWM A; 1KJW A; 3VS3 A; 2PNI A; 1NLO C; 1QWF A; 3THK A; 2JXB A; 2JS2 A; 1GL5 A; 2DMO A; 4OMP A; 3EG1 A; 2ESW A; 1UE9 A; 4RTZ A; 3UA6 A; 1E7O A; 1E6G A; 1GBQ A; 3EGU A; 1WDX A; 1T0J A; 1ABQ A; 1AWW A; 4HCK A; 2ED1 A; 3M0Q A; 4D8D A; 4Z8A A; 5HCK A; 1WIE A; 2BZX A; 3M0U A; 1NLP C; 2ROT A; 3VS2 A; 2LJ1 A; 1WX6 A; 1VYU A; 3EHR A; 1E6H A; 1SRM A; 2M0Y A; 3H41 A; 2F2X A; 2DA9 A; 1AZG B; 3VS0 A; 1AEY A; 1ZUK A; 2JT4 A; 4E6R A; 1SHF A; 1AVZ C; 2J6O A; 1U3O A; 1SEM A; 1PKS A; 2KRO A; 3UA7 A; 1AD5 A; 2K9G A; 2DRM A; 2GTJ A; 1UGV A; 4JJC A; 2RQU A; 3CQT A; 4QT7 A; 2BZ8 A; 2CUD A; 1X69 A; 1QLY A; 5L23 A; 3FJ5 A; 1CKB A; 1W1F A; 3R6N A; 2LJ0 A; 2OAW A; 1OOT A; 2YUO A; 4FSS A; 3NPF A; 1Y0M A; 4F16 A; 1JQQ A; 1M3C A; 2DIL A; 2O31 A; 2GBQ A; 3H0F A; 3NGP A; 4OMM A; 3H0I A; 4KRT A; 5IH2 A; 2X3W D; 2ECZ A; 2CSI A; 1WA7 A; 1YNZ A; 1YCS B; 1NEG A; 1H8K A; 4F17 A; 3NHN A; 1OV3 A; 1A0N B; 1HSQ A; 1W70 A; 2KRN A; 3EHQ A; 1X2Q A; 2LCS A; 1T3S A; 1BU1 A; 4GLM A; 1X6B A; 4Z89 A; 3QWY A; 3VS5 A; 2M51 A; 2LZ6 B; 1VA7 A; 1AWJ A; 2DJQ A; 4Y92 A; 2YUP A; 1XOV A; 1AZE A; 4OML A; 2KT1 A; 1OPK A; 2OJ2 A; 4K11 A; 4RTV A; 1QCF A; 1X2K A; 1S1N A; 3TVT A; 1GCQ C; 2RQV A; 1G2B A; 1ZUY A; 2AK5 A; 2D0N A; 2D1X A; 4AFS C; 1UHC A; 2EKH A; 2HDA A; 4JZ4 A; 2CT4 A; 4RTU A; 2EYX A; 3I5S A; 3ZL7 C; 2A08 A; 2RQR A; 5I11 A; 3PVQ A; 1RLQ C; 4A63 B; 1K0X A; 3TSZ A; 1NYF A; 1UUE A; 5IXB A; 4LE9 A; 1X6G A; 2L3P A; 3VS7 A; 2EVR A; 5GJV B; 2DL4 A; 1PWT A; 2DNU A; 2EYZ A; 2FEI A; 1T3L A; 4JJB A; 1PRM C; 1HJD A; 2DX1 A; 1N5Z A; 1EFN A; 2JM8 A; 2ABL A; 2A28 A; 1QWE A; 5FWC A; 4LUE A; 2LP5 A; 1GCQ A; 2A37 A; 3KFV A; 2L3S A; 1M27 C; 2HEQ A; 2YT6 A; 2FPF A; 1HD3 A; 1TUD A; 3U23 A; 2KNB B; 4J9F A; 1X43 A; 2FO0 A; 1X27 A; 4J9G A; 2FPD A; 2K6D A; 1AOJ A; 2DL8 A; 2O9V A; 2D8J A; 3M0T A; 1WXB A; 1YP5 A; 2W0Z A; 2O9S A; 2MIO A; 3ULR B; 1GFD A; 1H3H A; 1GFC A; 2YSQ A; 1BB9 A; 3C0C A; 2LQW A; 2DL5 A; 2ED0 A; 3QWX X; 1ARK A; 4OMQ A; 1UHF A; 2I0N A; 5IHN A; 4OMN A; 2JMA A; 4LNP A; 2X3X D; 4HVU A; 5ECA A; 4AFZ C; 1UJ0 A; 3VS6 A; 1WI7 A; 4GBQ A; 4AG1 C; 3I35 A; 2EGA A; 1JXO A; 1M8M A; 1Y57 A; 4HVW A; 2OI3 A; 1SSH A; 3REB B; 3A98 A; 2QDL A; 4ORZ A; 1K4U S; #chains in the Genus database with same CATH topology 1Y96 B; 4KH1 B; 3CD6 Q; 5KYY A; 1WYX A; 4CC4 B; 5GAM d; 1JXM A; 1WFW A; 3TU4 K; 5A0D A; 4PJO F; 4BAC A; 5LJ5 h; 1K8A C; 4J9I A; 3P8H A; 2B8A A; 4KGV B; 3A1P A; 1D3B B; 2RJF A; 3TEE A; 1X01 A; 2KXC A; 1YIT T; 1U06 A; 2NUP B; 3FIF A; 4UC4 A; 1QVF P; 2V1Q A; 2L0A A; 1I0C A; 1KD1 U; 3OYL A; 3CCL A; 3WXM B; 4ANJ A; 3GPL A; 2PUO B; 1UTI A; 4HXJ A; 2CUB A; 4Z88 A; 4PJO A; 3J81 E; 4JJN K; 1MGQ A; 1OX9 A; 4J9E A; 2E64 A; 3CC4 A; 2RK2 A; 4M7D D; 2DLP A; 3QG1 A; 2LTO A; 3PTA A; 2FPE A; 4DBQ A; 4E7J A; 1R8O B; 4C8Q F; 2CH4 W; 1UGS B; 2EYY A; 4PFO A; 4BI3 A; 2HMA A; 2D8H A; 4OMO A; 3CME Q; 2VKN A; 4ELY C; 1Z9Z A; 1BBZ A; 1GCP A; 3GNG A; 3SHW A; 4D6W A; 1Q81 U; 1N9S A; 3ZEH A; 4A4F A; 4M7D C; 1PKT A; 1I07 A; 4FYX B; 3CCJ Q; 2VWF A; 1C6V X; 1MMN A; 1XNI A; 1ZSZ A; 2FZC B; 4OVA A; 3ER0 A; 4RMO A; 3OYM A; 1IO6 A; 1H92 A; 3M0R A; 5I22 A; 1ABO A; 2K57 A; 2K3B A; 1MMG A; 1H3Z A; 2KEA A; 5GAN 5; 5IT9 E; 2VXE A; 1K76 A; 4XTZ A; 4EMK B; 5LL6 S; 1RL2 A; 5IN1 A; 1X75 C; 2K79 A; 4JLG A; 2C0O A; 1PHT A; 1NM7 A; 2EJ9 A; 4KGX B; 5KYW A; 1Z9Q A; 1VQ4 T; 3LYI A; 2E4H A; 2HKN A; 2J6F A; 2G3R A; 2E3I A; 4B9X A; 2CH4 A; 3QYH B; 3CME A; 2WSE E; 2GNC A; 4LUD A; 4R0K A; 5GAN 6; 1I5L A; 2HNI A; 2LX9 A; 2O4X A; 2HD0 A; 1GXI E; 2JTM A; 2I2L A; 3RKY A; 3CPW A; 1RAD B; 4F7U A; 3ZFJ A; 4F04 B; 2EFI A; 2DBM A; 4C8Q D; 6AT1 B; 2DTI A; 2LVM A; 2KSS A; 3HRU A; 3BY7 A; 3M55 A; 1YIT A; 1KFZ A; 2RM4 A; 2XMF A; 4M75 G; 5KYY B; 2J7I A; 1K1Z A; 5FU6 C; 2NUT B; 3TCJ A; 4OB2 B; 1QP3 A; 3OYK A; 3JB9 I; 2XK0 A; 1JBM A; 3OS5 A; 1WHM A; 1RLP C; 1ZBX A; 1VIE A; 4OB3 B; 2HQH A; 2COY A; 1TH7 A; 2DFU A; 4KUL A; 4RUG A; 2M02 A; 3RES A; 2V8J A; 3PVL A; 4PLL A; 3NMZ C; 5FU7 B; 1JO8 A; 5GJW B; 1BCO A; 3RDV A; 2EAY A; 2AKL A; 4LXC A; 4C0Z A; 4PJO B; 3JSC A; 1YJW T; 1VQ4 Q; 2CP7 A; 3QO3 A; 1RAE B; 2XHC A; 1Y07 A; 3MET A; 1LCK A; 1U5S A; 3VS1 A; 1N27 A; 3CC7 T; 1P92 A; 3RIR A; 1KQS S; 2QTX A; 5HK3 A; 4QKU A; 4IIM A; 4KUI A; 3L2W A; 1RAB B; 4IKF A; 1QWF A; 2P4T A; 2JXB A; 3A5Z B; 1GL5 A; 1OQK A; 3CCE T; 3HRS A; 3A8M B; 1OU9 A; 4JRK A; 2X9H A; 4B6M A; 4C92 E; 3OYN A; 2LT4 A; 4RTZ A; 2QK0 A; 4MZT A; 3JAM E; 1K73 C; 4X9D A; 3QKJ A; 4HCK A; 3VV0 A; 4FYW B; 4FSX A; 4XTV A; 2E3H A; 4RCB A; 1YIJ Q; 2MPX C; 3EGD A; 3LH0 A; 3VS2 A; 1ZSZ B; 3X25 B; 1BKB A; 1VYU A; 3EHR A; 2MAM A; 2M0Y A; 4ZN3 A; 4JS5 A; 3CCM A; 1M8V A; 1NJI U; 1AHJ B; 4E47 A; 2P84 A; 5LJ3 j; 1N6A A; 1VQ8 T; 4L59 A; 1ZUK A; 3JB9 J; 2KK4 A; 4RG8 A; 2J6O A; 1PKS A; 2PVD B; 1YJW Q; 5J39 A; 1QP2 A; 2L5Q A; 5KYW B; 4M7A E; 1TWB A; 2DRM A; 2GTJ A; 1OX8 A; 3EAE A; 1UGV A; 4JUV A; 4LDU A; 4PFP A; 3CC7 Q; 3CCU T; 4QT7 A; 1OZ3 A; 4R56 A; 2QAZ A; 2OX7 A; 3FJ5 A; 1XTD A; 2LJ0 A; 3L42 A; 3S3M A; 2GFA A; 3HKS A; 4FYY B; 5LJ5 g; 2O4X B; 1SF9 A; 4R55 A; 1M3C A; 4OMM A; 1C1A A; 3CCE Q; 5LJ5 d; 4F7U B; 1FX7 A; 1TSF A; 1Y71 A; 1KD1 C; 1WA7 A; 1UEB A; 3RKX A; 4M77 B; 3N5B B; 3NHN A; 1OV3 A; 3M59 A; 4NL3 A; 1YJ9 T; 4J7I A; 2P0K A; 1W70 A; 5D6X A; 5GAN 4; 3CCV T; 1X2Q A; 2LCS A; 4N0A C; 4KH0 B; 1WHJ A; 5DLQ E; 3PFS A; 4Z89 A; 5DM7 R; 2CZ7 B; 5CKB A; 4XU3 A; 4OP0 A; 3G4S T; 2M51 A; 1YJW A; 3URG A; 4DOV A; 4C92 D; 4BE2 A; 3BE3 A; 3UPU A; 1VQ8 Q; 1AZE A; 2KT1 A; 3MO8 A; 3CC7 A; 1S1N A; 3TVT A; 1GCQ C; 3JCM c; 5GAO p; 1VQM T; 3FEO A; 1UHC A; 2HDA A; 5GAN f; 2CT4 A; 2ZPE B; 1WHH A; 3I5S A; 1Q81 C; 5I11 A; 4PLI A; 3CCQ A; 1R0B G; 3CCU Q; 5HK0 A; 3CCE A; 3CC2 Q; 4A63 B; 1S72 Q; 3TSZ A; 1O9S A; 4M78 G; 4HCC A; 1UUE A; 4LE9 A; 2L3P A; 4FW2 A; 5GMK l; 4C92 C; 2DNU A; 5GAN h; 2FYK A; 2FEI A; 1N5Z A; 4ATO A; 5FRO A; 3OYC A; 2A28 A; 3JB9 F; 2QA4 Q; 1QVF A; 3JB9 H; 4M7A D; 2CP0 A; 3LLR A; 2FPF A; 1HD3 A; 2KNB B; 3CCV Q; 4J9F A; 4ZN1 A; 5KYN A; 3C4S A; 2H3E B; 4O6J A; 3SFM A; 3M54 A; 1VQ8 A; 3GIB A; 1IHV A; 3EGD B; 2K6D A; 3G4S Q; 2DEQ A; 2PUK B; 4E7K A; 4FT2 A; 4X9C A; 5GAN 2; 3UT1 A; 3AT1 B; 2JNG A; 2RHU A; 4HKE A; 2QAS A; 4DA4 A; 1BB9 A; 2QQR A; 4M7A C; 4OMQ A; 1VQM Q; 1M90 R; 1UHF A; 5IHN A; 2JMA A; 2OTJ T; 3QPH A; 2QXF A; 2X3X D; 1UJ0 A; 4J8O A; 4YTL A; 4ZGJ B; 4MZP A; 2COZ A; 5C0M A; 3SB2 A; 2IG0 A; 2KQW A; 2GQV A; 1TXQ A; 7AT1 B; 3OS2 A; 3C12 A; 1QCO A; 3DB3 A; 3MPU B; 4N4I A; 4EPC A; 2QDL A; 4PJL A; 4QVC A; 1YJ9 A; 3SWN C; 1OUL A; 2P4R A; 2E1H A; 2F2V A; 3HFO A; 2EGE A; 1M30 A; 4BDY A; 4JRI A; 2DVE A; 2HQX A; 2AKK A; 2R5A A; 3Q1J A; 4J6X A; 4J9C A; 2E6Z A; 3G4S A; 2KE9 A; 3EG2 A; 1TUC A; 5M9O A; 1WLP B; 2AIR B; 4FW1 A; 2AT1 B; 3S3O A; 1VQM A; 1ZHI A; 1YN8 A; 3PE0 A; 2LRQ A; 3CBO A; 1IGU A; 2JS0 A; 2WSF E; 3H0H A; 2DXB A; 2E70 A; 2HCK A; 1ZA2 B; 5CKF A; 5LJ3 e; 3I9Q A; 1Y7X A; 5KE3 A; 3EFR A; 2CRE A; 3LX7 A; 3EG3 A; 3QXE B; 3VKI A; 2FZG B; 1M4Z A; 5GAN j; 3REA B; 2YDL A; 3CMA A; 4BUG A; 4DBH A; 1WZO A; 3TSW A; 3MEA A; 2SRC A; 2QEX T; 1RUW A; 1TUG B; 2H8H A; 4CRI A; 1VOM A; 1OEB A; 2PVO B; 2A36 A; 2RHI A; 4RTY A; 2K2M A; 2GCX A; 1NJI C; 1TG0 A; 2BUD A; 5IXF A; 1VQK T; 2XG8 D; 1UDL A; 4RTX A; 1M1K R; 2YLC A; 3VS4 A; 4BY6 B; 4NS5 A; 2DET A; 4M7D F; 2PQW A; 2LNH B; 2RJD A; 2ZPH B; 2RJC A; 1JU5 C; 2GTO A; 4JRQ A; 1UEC A; 5AYF A; 1MV0 B; 1B7T A; 4D8K A; 1N8R U; 2K3Y A; 1VYT A; 3UDC A; 2VUB A; 2O2O A; 3A8O B; 3SEM A; 1AWO A; 2LNV A; 2OTJ A; 3J80 E; 3MP1 A; 1FXX A; 4M7D A; 2KBT A; 1UJY A; 3OYD A; 5EC7 A; 5CO7 A; 2KT8 A; 4OB1 B; 5D6W A; 3JRZ A; 3SDZ A; 2OTL T; 1MUZ A; 2EBP A; 2DRK A; 2J6K A; 2V1R A; 1W2B S; 1D0Z A; 3I5R A; 4WF2 A; 1N8R R; 3L2R A; 3NFC A; 2Y4Y A; 2QEX Q; 3M5A A; 3OBW A; 3PMT A; 2FRW A; 4KGZ B; 3CCJ T; 4N4G A; 1TOV A; 1CKA A; 2DER A; 1BIA A; 2VV5 A; 2JMC A; 2QDY B; 1NG2 A; 3ASK A; 1VQK Q; 2KI7 A; 2XDP A; 2EPD A; 2ZGW A; 3VYH B; 1VQO Q; 3PIO A; 3JCM V; 2J06 A; 1BYM A; 1MMD A; 5FLX E; 4CC7 A; 1PSE A; 1KSW A; 4XTU A; 4A4H A; 2EIF A; 2DL3 A; 1D1C A; 5IHI A; 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