The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
96
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structure length |
96
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Chain Sequence |
EKKEQKEKEKKEQEIKKKFKLTGPIQVIHLAKACCDVKGGKNELSFKQGEQIEIIRITDNPEGKWLGRTARGSYGYIKTTAVEIDYDSLKLKKDLE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Redox-Regulated Conformational Changes in an SH3 Domain
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
FYN-binding protein
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
12
|
| structure length |
96
|
| sequence length |
96
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DL5 A; 1SRM A; 2JM9 A; 2LQW A; 1V1C A; 3EG3 A; 3UA6 A; 2FEI A; 4J9H A; 3JV3 A; 2ROT A; 4OMQ A; 3EGU A; 1TG0 A; 1X2Q A; 2GQI A; 2J06 A; 2KXD A; 5GJV B; 2OJ2 A; 3VRZ A; 2O9S A; 2DL7 A; 2B86 A; 1B3Q A; 5GJW B; 1WIE A; 4D8K A; 2YUN A; 5EC7 A; 2LJ3 A; 3R6N A; 1UGV A; 3EG1 A; 2RQU A; 1G83 A; 3SEM A; 4J9B A; 1S1N A; 2QDL A; 3U23 A; 2AKK A; 1K0X A; 1GFD A; 1YWO A; 4AFZ C; 3H0I A; 2KYM A; 3NGP A; 4CC3 A; 1WDX A; 4HCK A; 1GCQ A; 4HVU A; 4OMN A; 1UE9 A; 2DE0 X; 1AVZ C; 1M3B A; 2O9V A; 1H3H A; 3VS3 A; 5IXF A; 2DVJ A; 4RTV A; 5IH2 A; 1NLP C; 2L3S A; 2RF0 A; 2EYX A; 3I5R A; 2LP5 A; 4J9I A; 2FRW A; 3TVT A; 2AZS A; 2K3B A; 4IIM A; 3VS2 A; 1AWX A; 4GBQ A; 1H92 A; 2YUP A; 2LQN A; 1QWF A; 2CUD A; 4LUE A; 4IIO A; 1OEB A; 3M0S A; 2GTJ A; 3QWY A; 2EYZ A; 4J9G A; 1YP5 A; 1UFF A; 4CC4 B; 1T0H A; 1RUW A; 1A0N B; 1U3O A; 1SHG A; 4JZ4 A; 1TUD A; 5L23 A; 2DA9 A; 2JT4 A; 2J6K A; 2HDA A; 1SRL A; 3EG0 A; 2RPN A; 3PVQ A; 2RMO A; 3M0Q A; 4LE9 A; 2ENM A; 3TSZ A; 2KYB A; 4F16 A; 3H0H A; 2V1R A; 1WYX A; 4KRT A; 2SEM A; 2AZV A; 4AFU C; 1T3L A; 2EVR A; 2ABL A; 2FPE A; 3THK A; 1UHF A; 1NEB A; 1KSW A; 1BK2 A; 3KFV A; 1JEG A; 2C0T A; 3EHR A; 1OPL A; 2RQT A; 2DL8 A; 5IXB A; 2H8H A; 1W1F A; 1AWW A; 1IO6 A; 2C0I A; 1G2B A; 3ULR B; 2A36 A; 2M0Y A; 4LUD A; 4WCI A; 4AFS C; 3RBB B; 1K9A A; 1OV3 A; 4DEX A; 1RI9 A; 1BB9 A; 2FRY A; 1AZG B; 1BBZ A; 2KEA A; 3A98 A; 2K6D A; 1AWO A; 1NYF A; 1KJW A; 1PRM C; 4LN2 A; 1JU5 C; 2PZ1 A; 1YNZ A; 2HEQ A; 4J9E A; 4R0K A; 3VS4 A; 1Y0M A; 5FWC A; 1TUC A; 1AZE A; 1ZUY A; 2EW3 A; 2DRK A; 2VWF A; 4HXJ A; 1X6G A; 2FPF A; 1WX6 A; 2KT8 A; 1ABQ A; 3M0T A; 1ZBJ A; 1EFN A; 2KGT A; 3GBQ A; 4JPB W; 2CH4 W; 3M0R A; 2F2X A; 1X43 A; 1ZUK A; 1AWJ A; 1WXU A; 1I1J A; 2CRE A; 2V1Q A; 2KRS A; 1NEG A; 2DJQ A; 4OMM A; 2J05 A; 2YT6 A; 4RTY A; 1M3A A; 1SEM A; 3C0C A; 2CSI A; 1SHF A; 2JMC A; 2JTE A; 3UAT A; 1PNJ A; 1WFW A; 5FWB A; 3NMZ C; 3VS5 A; 3VS1 A; 3NPF A; 3VS6 A; 2K9G A; 2LJ1 A; 1WA7 A; 2IIM A; 4J9F A; 2PTK A; 1GBQ A; 4M4Z A; 2K7A A; 1PKS A; 2I0N A; 1BU1 A; 2EYW A; 3O5Z A; 3VS7 A; 1ZX6 A; 2A08 A; 2AKL A; 1OPK A; 1PHT A; 2J6O A; 2VVK A; 4JJD A; 3VRY A; 4Z88 A; 1AD5 A; 1H8K A; 1M27 C; 1JXO A; 2KE9 A; 2KT1 A; 3TSW A; 1K4U S; 1ZLM A; 4A63 B; 2AK5 A; 2KR3 A; 2D1X A; 1GBR A; 2F2W A; 1JXM A; 1E7O A; 2FG0 A; 3EHQ A; 3H0F A; 1W6X A; 3PVL A; 1UJ0 A; 4ORZ A; 2DBM A; 1KIK A; 2K79 A; 2MCN A; 2FO0 A; 4JJB A; 2PNI A; 2SRC A; 2EYY A; 2LNH B; 3IQL A; 2CH4 A; 2XMF A; 1X27 A; 3M0P A; 2LCS A; 3UF4 A; 1MV3 A; 1K76 A; 4K11 A; 1K1Z A; 2O31 A; 2EGE A; 2L0A A; 5ECA A; 2CSQ A; 2JS2 A; 3FJ5 A; 1T3S A; 1NLO C; 1QKW A; 2KXC A; 1UG1 A; 2M51 A; 3RNJ A; 3I35 A; 1MUZ A; 2YUQ A; 4HVW A; 1E6H A; 1WI7 A; 4LNP A; 4RTW A; 1I0C A; 1QKX A; 2DBK A; 2KNB B; 2L3P A; 1M30 A; 1RLQ C; 4RTZ A; 2EKH A; 2EPD A; 2HBW A; 1W70 A; 2ECZ A; 1WLP B; 1GRI A; 3LH5 A; 3NHN A; 1ABO A; 2E5K A; 1FYN A; 1Z9Q A; 1GL5 A; 2A28 A; 4OMO A; 2DIL A; 2DLP A; 5FW9 A; 2W10 A; 2DNU A; 2ROL A; 1GCQ C; 4RTU A; 2ESW A; 2L3Q A; 1U5S A; 2DMO A; 2JW4 A; 3CQT A; 2BZ8 A; 1QLY A; 2DRM A; 4OMP A; 2LMJ A; 1UEC A; 2GBQ A; 4F14 A; 4RTX A; 1HJD A; 2KRO A; 4AG2 C; 4CC7 A; 2RNA A; 1CKB A; 1HD3 A; 5I22 A; 2JMA A; 2RQV A; 2GGR A; 5HCK A; 2O2O A; 3EG2 A; 4D8D A; 2KRM A; 1KFZ A; 2OAW A; 4RTT A; 2BZY A; 2K2M A; 2HSP A; 1YCS B; 1WXB A; 4ESR A; 2J6F A; 1SPK A; 2JS0 A; 2BTT A; 1FMK A; 2BZX A; 1UHC A; 1J3T A; 4Z89 A; 2RN8 A; 1ZUU A; 2EGA A; 1QCF A; 2LX7 A; 2RQR A; 2NWM A; 2KBT A; 2DF6 A; 1RLP C; 4RUG A; 1M3C A; 1CSK A; 4HVV A; 2DL4 A; 2X3W D; 5IHN A; 2HCK A; 2O88 A; 1CKA A; 2F2V A; 1NYG A; 1T0J A; 2CDT A; 1ARK A; 1GCP A; 1E6G A; 3I9Q A; 3H41 A; 4AG1 C; 2P4R A; 1JQQ A; 3PE0 A; 4EIK A; 1I07 A; 3REB B; 2LZ6 B; 1ZSG A; 5I11 A; 2JXB A; 2J7I A; 2YDL A; 2A37 A; 1PWT A; 1LCK A; 1UTI A; 1SSH A; 2ED0 A; 2MIO A; 1MV0 B; 4OML A; 2CT4 A; 4JJC A; 2FPD A; 4GLM A; 1N5Z A; 2D8H A; 4CC2 A; 1X6B A; 2EBP A; 2MOX A; 2LJ0 A; 1VYT A; 1VA7 A; 3ZL7 C; 4J9C A; 1JO8 A; 1GFC A; 1HSQ A; 1PRL C; 5IHK A; 3UA7 A; 4F17 A; 1OOT A; 2L2P A; 1XOV A; 1PKT A; 2ED1 A; 2GNC A; 1Z9Z A; 2C0O A; 1UDL A; 2DM1 A; 2YSQ A; 3SHW A; 1UUE A; 2JM8 A; 1NG2 A; 3REA B; 1NM7 A; 1M8M A; 4J9D A; 2D0N A; 1YN8 A; 2OI3 A; 2EGC A; 4Z8A A; 1VYV A; 2DYB A; 4X1V A; 1U06 A; 1X69 A; 4JZ3 A; 4QT7 A; 3M0U A; 1Y57 A; 2EQI A; 1UJY A; 1K0S A; 4DEY A; 2NUZ A; 2CUB A; 2W0Z A; 1B07 A; 1AOJ A; 2X3X D; 2DL3 A; 2YUO A; 2D8J A; 1YWP A; 2RQW A; 2DX1 A; 2GTO A; 2G6F X; 4FSS A; 4Y92 A; 2KRN A; 3VS0 A; 4AFQ C; 4E6R A; 3QWX X; 2CT3 A; 5IHI A; 1QWE A; 2VKN A; 3I5S A; 4ZNX A; 1X2K A; 1VYU A; 1WXT A; 1AEY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQM Q; 5CCA A; 5L8R E; 2JM9 A; 1OUL A; 1RAI B; 5LJ3 d; 3FB9 A; 1VQK Q; 3OYL A; 4J9H A; 3JV3 A; 5A0L A; 2XD0 A; 1TG0 A; 3DKM A; 1QVG S; 2KXD A; 4C8Q G; 5GJV B; 4C5I A; 3VRZ A; 1BIB A; 2HQH A; 4HCZ A; 1M4Z A; 4J7F A; 4OB0 B; 2VC8 A; 3SEM A; 2CGH A; 3U23 A; 5A0G A; 1K9M C; 3MP1 A; 2AKK A; 5KYX B; 1GFD A; 1UGQ B; 2KYM A; 4BAC A; 2E5Q A; 1UE9 A; 2L3R A; 2DE0 X; 3A8G B; 4F7U A; 1QQJ A; 2A3L A; 2VAS A; 1AVZ C; 2XK0 A; 4QVC A; 2XID A; 3UWN A; 5IXF A; 3JCM J; 1BI0 A; 2L3S A; 4N0A C; 2EYX A; 4J9I A; 5CVI A; 2AZS A; 5GAM d; 3JCM c; 5GAN 5; 2CP3 A; 5CKE A; 2RJF A; 4IIO A; 3RKW A; 1XNI A; 1VQ5 A; 2IG0 A; 2HAX A; 1UB4 A; 3CCE A; 2GTJ A; 2EYZ A; 1I8F A; 4XU0 A; 2X4J A; 1KC8 R; 3ZBD A; 1UFF A; 2COY A; 4CC4 B; 2F1L A; 1VIF A; 2QEX A; 1SHG A; 4A53 A; 5L23 A; 3LH0 A; 3CCM Q; 2FVU A; 4D6W A; 3EG0 A; 2RPN A; 1Q7Y R; 5GMK m; 3M0Q A; 1VQ5 T; 4LE9 A; 3CCE T; 2BE9 B; 3TSZ A; 1KG1 A; 2DXC A; 4F16 A; 1BI3 A; 3MP6 A; 1H3Z A; 2V1R A; 4KRT A; 2AZV A; 3CD6 Q; 2WAC A; 4FYY B; 2QEX T; 5J3B A; 3M55 A; 1JJ2 A; 2EVR A; 2FPE A; 3OMG A; 3THK A; 3QDR B; 1R8O B; 4MDX A; 4QQD A; 2DXB A; 3EHR A; 2RB6 A; 4ZGD B; 2H8H A; 1AWW A; 3ULR B; 1Q86 C; 5C0M A; 1ZSZ B; 3OYH A; 2O01 E; 2X4W A; 1N9R A; 4ME7 A; 1RI9 A; 4M75 D; 4X9C A; 1Q82 R; 1KJW A; 4RMO A; 2KMT A; 2PUO B; 2HEQ A; 2E10 A; 4M7A B; 4J9E A; 3L1A A; 1Y96 B; 4OVA A; 1YJN Q; 3V8J A; 2FPF A; 3HRS A; 1OU8 A; 2KT8 A; 2HSE B; 3MPU B; 2QYZ A; 4M78 D; 1LVK A; 2KRS A; 1RAD B; 4HA8 A; 2RJC A; 2J05 A; 4CI0 C; 3J81 E; 4OGC A; 2RI3 A; 3X28 B; 1K73 U; 2WSE E; 4GY5 A; 2R5M A; 3V7R A; 1KQ1 A; 2JMC A; 4C8Q F; 1WFW A; 3SB2 A; 1MMD A; 3JB9 D; 3QHS A; 3VS1 A; 4ELZ C; 4DA4 A; 4EPC A; 1TH7 A; 3E19 A; 5LJ3 h; 5GAN d; 2DEU A; 1F1B B; 2QG9 B; 4KH1 B; 3D7S B; 2LTO A; 2WSF E; 3JCM h; 1VQL A; 2DFU A; 1BU1 A; 3Q1J A; 1ZX6 A; 2PUK B; 4A4E A; 3E1S A; 2J6O A; 2VVK A; 3MEA A; 3G6E A; 2LVM A; 1AD5 A; 2M0O A; 5GMK h; 1KHI A; 4FT4 A; 1LNX A; 2KE9 A; 1D1B A; 2VXE A; 1ZA2 B; 5A0D A; 3EGX B; 3DB3 A; 3ER0 A; 4C8Q C; 3GPL A; 1IHW A; 3PTA A; 2AK5 A; 1VQL T; 4JRQ A; 2D1X A; 3CXC S; 1V29 B; 2F2W A; 3G6E T; 2RK2 A; 3SWN A; 4JUV A; 1YIJ A; 3PGG A; 2FZG B; 3PVL A; 1N8R U; 3OYM A; 3I56 A; 2DBM A; 2RHY A; 3JCM V; 4JJB A; 2PNI A; 1BCM A; 4EDU A; 4KGX B; 1X27 A; 3M0P A; 3CCV Q; 1K76 A; 3UT1 A; 4XQ3 A; 3HKS A; 2EGE A; 2L0A A; 5ECA A; 2GQV A; 1T3S A; 4M75 A; 1VQN A; 3I56 T; 2XHC A; 2KXC A; 2I2L A; 1IB8 A; 1MUZ A; 2DIQ A; 3I35 A; 4HVW A; 3M4Y A; 1WI7 A; 4RTW A; 1I0C A; 1QKX A; 2KNB B; 4E7L A; 4RTZ A; 2HBW A; 3CCL Q; 3OYY A; 1W70 A; 3SD4 A; 1GRI A; 4WTO B; 3OYF A; 2CZ6 B; 3CCR T; 1Z9Q A; 1YI2 A; 4J6W A; 5KCO A; 2KI7 A; 1YIT A; 2W10 A; 2DNU A; 4R55 A; 1ZQ1 A; 2ROL A; 2Y4Y A; 3CME Q; 1Q95 G; 1QVF A; 2KVQ G; 1UEC A; 2GBQ A; 1XQH A; 5LJ3 g; 5LL6 S; 3LLR A; 2HL3 A; 3P8D A; 3BDL A; 4RTX A; 4Y91 A; 4C8Q A; 8ATC B; 3QG1 A; 4CC7 A; 1YI2 T; 4BE2 A; 5D6X A; 1HD3 A; 2LCL A; 4J8O A; 1YIT T; 2VGN A; 4HT9 A; 2JOY A; 2ZPF B; 1WQW A; 1MGQ A; 4OP0 A; 5LJ3 j; 2QA4 Q; 2DD4 A; 2CS7 A; 4LDW A; 2YLB A; 4JS4 A; 2CYZ B; 2LRQ A; 4C5E A; 3RDV A; 3MKD A; 4PJO E; 1FMK A; 2JN0 A; 1R0C B; 5KYW B; 1WJR A; 2RN8 A; 1ZUU A; 2EGA A; 2DD5 A; 2DET A; 1N9S A; 3GF5 A; 5GMK j; 1KD1 R; 2M1H A; 1RLP C; 5KE2 A; 2MWO A; 4QQG A; 2PU9 B; 1RAC B; 2OTJ T; 1U8R A; 2DIG A; 2CDT A; 3L42 A; 3V8K A; 1W4S A; 1GXI E; 5CQX A; 1TU0 B; 5GAM g; 2P4R A; 1B34 B; 3HL8 A; 2K5I A; 1IRE B; 2JXB A; 4ANJ A; 1OI1 A; 2J7I A; 4M7A F; 1LCK A; 4C92 E; 4M7D D; 1UTI A; 1SSH A; 1MV0 B; 1VQ8 A; 2CT4 A; 2ZPE B; 1VIE A; 1Q81 R; 2EBP A; 1PG5 B; 1M90 U; 4OB3 B; 4Z02 A; 4J6Y A; 2V8J A; 4PFZ A; 5FLX E; 5IHK A; 2RHU A; 3QYH B; 3UA7 A; 3CCE Q; 3JAM E; 1XOV A; 2GNC A; 4QW2 A; 3OYB A; 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4J9G A; 1YP5 A; 1T0H A; 4PFP A; 1RUW A; 1A0N B; 4JZ4 A; 2DA9 A; 1BCO A; 2J6K A; 5GAO r; 2HDA A; 3EGX A; 3PVQ A; 5KYY B; 3INZ A; 4LXC A; 1OYX A; 1WYX A; 1TTH B; 5FRM A; 2DER A; 2JTF A; 4O6J A; 2XG8 D; 2CZ1 B; 2ABL A; 3CCR Q; 2V26 A; 3MP8 A; 1KSW A; 1BK2 A; 3KFV A; 2LQ8 A; 1JEG A; 4M78 B; 1FMW A; 1PCX A; 2RQT A; 5CKD A; 2DL8 A; 5IXB A; 1WHK A; 1KC8 C; 5LJ5 e; 1RAB B; 1G2B A; 3RKY A; 2LC4 A; 4WCI A; 5GAO n; 4OB2 B; 4YTL A; 1Q7Y C; 3P8H A; 2DTI A; 1BB9 A; 2HQE A; 5KYU B; 3VYH B; 1AZG B; 2KEA A; 2YRV A; 3OYK A; 3H6Z A; 4Q5W A; 1FX7 A; 1YNZ A; 1AT1 B; 3M5A A; 3OB9 A; 4R0K A; 5GAN 4; 1Y0M A; 3JCM d; 4RCB A; 2EW3 A; 2VWF A; 1X6G A; 2D9T A; 3E9F A; 3JB9 J; 1FMV A; 2OTL A; 1ABQ A; 1BIA A; 3GBQ A; 3TCJ A; 3FLG A; 3M0R A; 3QPH A; 1WXU A; 3OSS C; 2QK0 A; 3KBG A; 5J26 A; 1AHJ B; 5GMK l; 1SKU B; 2DJQ A; 4OMM A; 1RAG B; 2OTL T; 2YT6 A; 1IZ6 A; 2COZ A; 4RTY A; 4PJN A; 1YJW A; 4IKF A; 4PJO F; 1XJW B; 1SHF A; 1Q82 C; 2OTJ Q; 1VQ7 A; 2JTE A; 3JB9 H; 4FCY A; 4M77 E; 3FIF A; 5FWB A; 4M7A E; 3NTK A; 4N4I A; 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