The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
58
|
structure length |
58
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Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
|
| publication title |
Changing protein backbone topology: Structural and dynamic consequences of the backbone cyclization in SH3 domain
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
5
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-06-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2O88 A; 2F2X A; 2DE0 X; 1PWT A; 2DVJ A; 2DRK A; 1MV0 B; 1AWW A; 2ABL A; 2O9V A; 4A63 B; 1GCQ C; 2EVR A; 1T3S A; 2CT4 A; 1KFZ A; 4F17 A; 4LUD A; 2RNA A; 2MCN A; 1RUW A; 3VS0 A; 1TG0 A; 2EQI A; 4JZ4 A; 1JQQ A; 2W10 A; 3RBB B; 4FSS A; 1NM7 A; 2O9S A; 1W1F A; 2KRS A; 1AOJ A; 4J9I A; 1SEM A; 2RF0 A; 2ROT A; 4Z89 A; 2DYB A; 2J06 A; 1E6G A; 2CSI A; 3ULR B; 1I07 A; 3SEM A; 2D1X A; 2A37 A; 2G6F X; 1M27 C; 1M3A A; 1SHG A; 2K3B A; 4RTV A; 1PNJ A; 1Y0M A; 3EG0 A; 5IHI A; 2M51 A; 1AD5 A; 3GBQ A; 1B07 A; 2RMO A; 3SHW A; 2BZX A; 3QWX X; 4AG1 C; 4E6R A; 4DEX A; 1M30 A; 1WA7 A; 1OPL A; 1T0J A; 4J9E A; 1TUD A; 1N5Z A; 1W6X A; 3NPF A; 4RTW A; 1WXB A; 4OMP A; 3REA B; 4EIK A; 2DA9 A; 3I5S A; 2HCK A; 3EG1 A; 1YP5 A; 2PNI A; 2K2M A; 2VKN A; 1W70 A; 4OMQ A; 1UE9 A; 1M3C A; 3LH5 A; 5ECA A; 1VYV A; 1UJ0 A; 4RTU A; 2K79 A; 1NEB A; 2D8J A; 4GBQ A; 5I11 A; 2AKL A; 2GTO A; 1GBR A; 3VS2 A; 4RTX A; 1QKW A; 1RLQ C; 2GBQ A; 3NGP A; 3RNJ A; 4ESR A; 2AZS A; 1K0X A; 4RUG A; 1ZLM A; 2KXD A; 1AZE A; 4M4Z A; 3QWY A; 2YSQ A; 1ARK A; 2KRO A; 1JU5 C; 2JTE A; 5EC7 A; 2XMF A; 2FPE A; 3M0Q A; 1AWO A; 2D8H A; 1X27 A; 3NMZ C; 3H41 A; 5IH2 A; 2K9G A; 4HVW A; 3VS7 A; 1PKT A; 1AEY A; 1E6H A; 1GBQ A; 2F2V A; 2NWM A; 1UGV A; 3NHN A; 1K4U S; 2X3W D; 2C0O A; 1LCK A; 1VYT A; 1G83 A; 1PHT A; 3I5R A; 2JMA A; 3VRZ A; 4JPB W; 3R6N A; 1K0S A; 2P4R A; 3EG3 A; 2EGC A; 1GCP A; 1UEC A; 5IXB A; 4JJD A; 1U06 A; 2KR3 A; 2J05 A; 4AFU C; 1XOV A; 2LNH B; 2IIM A; 1KJW A; 2A08 A; 2JM9 A; 1CKA A; 2DL8 A; 1OEB A; 1X6B A; 1VA7 A; 2BZY A; 2ESW A; 1AVZ C; 4J9F A; 2JXB A; 2DLP A; 4WCI A; 2FEI A; 2PTK A; 2V1R A; 2LQN A; 4LE9 A; 4QT7 A; 2J7I A; 4OMO A; 2EYX A; 2DBM A; 3TSW A; 2FPF A; 3VS3 A; 2HEQ A; 2RQU A; 2L3P A; 3H0F A; 2DX1 A; 2F2W A; 3FJ5 A; 2AZV A; 4CC2 A; 2K6D A; 2ENM A; 1UUE A; 2JMC A; 1PRM C; 1BB9 A; 1ZSG A; 2DBK A; 3PVQ A; 1YWP A; 2JT4 A; 2KYM A; 1EFN A; 1ZX6 A; 3C0C A; 1RLP C; 1GL5 A; 1B3Q A; 2ED1 A; 2KXC A; 4OML A; 2CUD A; 2VVK A; 1ABQ A; 2ECZ A; 2LCS A; 1AWJ A; 1I1J A; 2LX7 A; 3I9Q A; 1NYF A; 1X2Q A; 2FRY A; 1ZUK A; 2GQI A; 3O5Z A; 1WYX A; 4IIO A; 1AWX A; 2KT8 A; 2DMO A; 5FWC A; 1KIK A; 1YNZ A; 1TUC A; 2DRM A; 2EYW A; 2LP5 A; 2PZ1 A; 1H92 A; 2CH4 W; 1MV3 A; 2RQV A; 1GFD A; 3PE0 A; 2YUO A; 1ZUU A; 2I0N A; 1BBZ A; 4AG2 C; 4JJC A; 1Z9Q A; 2BTT A; 2BZ8 A; 2KNB B; 4Z8A A; 1WDX A; 2EYZ A; 4HXJ A; 2LJ3 A; 5L23 A; 2AKK A; 2DNU A; 2EGA A; 2L2P A; 2JM8 A; 3UA7 A; 1UTI A; 2GNC A; 1YCS B; 2YUQ A; 4Y92 A; 2A28 A; 5FW9 A; 2OJ2 A; 4AFS C; 3I35 A; 2J6K A; 1JO8 A; 1UHF A; 1ZUY A; 1QWE A; 3VS1 A; 3UA6 A; 2YUP A; 5GJV B; 1SPK A; 2LMJ A; 5IXF A; 2OAW A; 3PVL A; 1BK2 A; 2FRW A; 2GGR A; 1HSQ A; 2EYY A; 2KRN A; 2O2O A; 1G2B A; 1PKS A; 5GJW B; 1HJD A; 1Y57 A; 2J6F A; 1KSW A; 1NEG A; 4HCK A; 4LN2 A; 5IHN A; 1QLY A; 2LQW A; 1WX6 A; 1V1C A; 3IQL A; 2DL3 A; 2L3Q A; 1OOT A; 1WFW A; 2DM1 A; 3VRY A; 3ZL7 C; 2KRM A; 2DIL A; 2CUB A; 2EW3 A; 1QCF A; 3EHR A; 1JXM A; 3M0S A; 4JJB A; 2RQT A; 3JV3 A; 2MIO A; 4HVU A; 4JZ3 A; 2CRE A; 2HSP A; 1CKB A; 1I0C A; 2AK5 A; 4CC7 A; 2E5K A; 2DF6 A; 2LZ6 B; 4F14 A; 2SEM A; 2JW4 A; 1WXU A; 3UAT A; 3VS5 A; 1ZBJ A; 1GFC A; 4J9H A; 2A36 A; 4AFZ C; 1OV3 A; 1T0H A; 2JS2 A; 1UJY A; 2J6O A; 4OMN A; 3KFV A; 1M3B A; 1FYN A; 1X69 A; 4R0K A; 2W0Z A; 3VS6 A; 2KYB A; 4LNP A; 2JS0 A; 2YUN A; 1UG1 A; 3EG2 A; 2YDL A; 1MUZ A; 1NYG A; 4J9B A; 3VS4 A; 1K76 A; 2YT6 A; 1YN8 A; 2K7A A; 4OMM A; 1J3T A; 4HVV A; 1JXO A; 4RTZ A; 1WIE A; 2MOX A; 5I22 A; 1UDL A; 2LJ0 A; 1HD3 A; 4X1V A; 4CC4 B; 2HDA A; 1U3O A; 4LUE A; 5HCK A; 2KE9 A; 3EHQ A; 1FMK A; 2ED0 A; 1Z9Z A; 1OPK A; 1U5S A; 3A98 A; 2RQR A; 4J9C A; 4RTT A; 1QKX A; 4ORZ A; 3UF4 A; 1T3L A; 4D8K A; 1ABO A; 1SSH A; 1X2K A; 2RPN A; 2L3S A; 2M0Y A; 2EKH A; 1X43 A; 1SRL A; 2CH4 A; 2B86 A; 2KGT A; 4K11 A; 5FWB A; 2C0I A; 4IIM A; 2DL4 A; 3H0H A; 3M0P A; 2OI3 A; 1X6G A; 1K1Z A; 2DJQ A; 2HBW A; 2GTJ A; 3THK A; 2CSQ A; 2KBT A; 2LJ1 A; 3M0T A; 4RTY A; 2QDL A; 4ZNX A; 4CC3 A; 2FPD A; 1H8K A; 1GCQ A; 1NG2 A; 1SRM A; 2V1Q A; 2KEA A; 1WXT A; 1CSK A; 2EPD A; 2H8H A; 2FG0 A; 2L0A A; 3CQT A; 2DL7 A; 3TSZ A; 3EGU A; 1GRI A; 1NLP C; 1UHC A; 2FO0 A; 2CDT A; 3U23 A; 1VYU A; 3M0R A; 5IHK A; 4J9G A; 2RQW A; 4AFQ C; 2O31 A; 1S1N A; 2VWF A; 1UFF A; 3M0U A; 2X3X D; 4Z88 A; 1BU1 A; 1PRL C; 2SRC A; 2DL5 A; 2RN8 A; 4D8D A; 1E7O A; 4J9D A; 4F16 A; 2KT1 A; 1WLP B; 4DEY A; 1NLO C; 2ROL A; 1IO6 A; 1SHF A; 2C0T A; 1H3H A; 2EBP A; 3REB B; 4GLM A; 3TVT A; 1M8M A; 2EGE A; 1AZG B; 2CT3 A; 2D0N A; 1QWF A; 4KRT A; 1YWO A; 3H0I A; 2NUZ A; 1RI9 A; 1WI7 A; 1K9A A; 1A0N B; 1JEG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VYG A; 3PFS A; 1M90 U; 4BY6 C; 1N6A A; 5FU7 C; 2DRK A; 2O9V A; 1JRI A; 4FYW B; 3V7S A; 2CT4 A; 2E65 A; 4DBQ A; 2XIC A; 2RJD A; 4M7A A; 4KBM B; 2MCN A; 4QVC A; 3VS0 A; 3OYM A; 3EH1 A; 3CXC P; 1JQQ A; 4JDS A; 1PD0 A; 4O5V A; 1QP2 A; 4KGX B; 3OB9 A; 1SEM A; 4OB0 B; 3OS2 A; 3L2R A; 1RAF B; 2A37 A; 4E7S A; 3F70 A; 5IHI A; 2DTO A; 2RHI A; 2RHZ A; 2L89 A; 1B07 A; 2YLB A; 4N0A C; 3OSV A; 3A8O B; 3JB9 D; 4E6R A; 1FX7 A; 1M30 A; 1NJI U; 4GLK A; 1WA7 A; 4BI4 A; 3I56 T; 4J9E A; 3JCM d; 4RTW A; 3REA B; 3D7S B; 3CCS A; 4PJO A; 2QGG A; 3I5S A; 4BUG A; 1QVG A; 4BD3 A; 5FRM A; 1W70 A; 3LH5 A; 4LDX A; 2K79 A; 3LH0 A; 4BE1 A; 5I11 A; 4EPC A; 4FYY B; 1QKW A; 3ZFJ A; 3NGP A; 1W2B S; 4RUG A; 1ZLM A; 3PTA A; 2RJF A; 1JB0 E; 3QWY A; 5CCA A; 3BE3 A; 2YSQ A; 1LNX A; 1ARK A; 1IRE B; 2JTE A; 2XMF A; 2LC4 A; 2MK5 A; 4M7A G; 3UPU A; 1Q7Y C; 4M78 F; 4C5I A; 1WHH A; 2D8H A; 5LJ5 g; 3NMZ C; 3H41 A; 3DLL A; 2KDS A; 4XU3 A; 5DLQ E; 2CP2 A; 1GBQ A; 2O4X B; 3CME T; 4E2F B; 1K4U S; 5GMK j; 2C0O A; 1VQO Q; 4DOW A; 3I5R A; 1O9S A; 2JMA A; 2Y90 A; 2O01 E; 3RKW A; 3EG3 A; 3CCL A; 3CPF A; 1GCP A; 2DO3 A; 1U06 A; 4EMG A; 2KR3 A; 4E7L A; 1VOM A; 4KH0 B; 4AFU C; 2IIM A; 2K5L A; 1KJW A; 3OYB A; 2QA4 Q; 1K73 C; 2DL8 A; 4ZGE B; 2DZ9 A; 1X6B A; 1YCY A; 2DFU A; 2PVG B; 4PJO G; 2OTL Q; 1M90 R; 2ESW A; 4J9F A; 1I8F A; 8AT1 B; 5GAM h; 2KMT A; 4MZP A; 4LE9 A; 4QT7 A; 4E7H A; 4OMO A; 3SD4 A; 3CC7 T; 2DBM A; 5GMK i; 2DPP B; 3CCM A; 3LWH A; 2DD4 A; 4Q5W A; 3J7A F; 3CD6 A; 3L2W A; 1D09 B; 3EG9 A; 2AZV A; 2COZ A; 1H64 1; 4M78 D; 5J26 A; 1UUE A; 2JMC A; 2X4X A; 1PRM C; 2DK3 A; 1BB9 A; 1SKU B; 1R0C B; 1VQ5 A; 2JT4 A; 1B34 A; 2DXU A; 1GL5 A; 3JCM J; 4E47 A; 3OMC A; 1Q81 C; 2VVK A; 1ABQ A; 1VQ6 T; 2LX7 A; 3I9Q A; 1NYF A; 1X2Q A; 1ZUK A; 1AWX A; 2EJ9 A; 1YNZ A; 1TUC A; 1K9M C; 4BI3 A; 1UB4 A; 1NJI R; 5GMK e; 4JRQ A; 3G71 Q; 4AG2 C; 3RER A; 4KGZ B; 4KT0 E; 1FMV A; 3G4S Q; 2EYZ A; 3RUX A; 2EGA A; 3MPU B; 2JM8 A; 3FJP A; 1OZ3 A; 2YUQ A; 3OY9 A; 5FW9 A; 2A28 A; 4AFS C; 2OJ2 A; 4M7A C; 2QGF B; 2J6K A; 1JO8 A; 1YIT A; 3MP1 A; 3V8J A; 2CZ6 B; 2YUP A; 1SPK A; 2JN0 A; 4XU0 A; 5IXF A; 2HQH A; 4XTZ A; 3DLM A; 1P92 A; 3S6W A; 1BK2 A; 2FRW A; 2NLU A; 5CQX A; 3CC4 T; 2PUK B; 4M77 F; 1PKS A; 3QJ6 A; 1VQL A; 1I4K 1; 3A5Z B; 5FU6 B; 3G7Z A; 1Y57 A; 5HY6 A; 4LN2 A; 2HAX A; 1QLY A; 2LQW A; 2QYZ A; 1BCM A; 4L5G A; 2DM1 A; 3VRY A; 1VQP Q; 2CUB A; 2EW3 A; 1QCF A; 3EGX B; 1KD1 C; 5J39 A; 3EHR A; 3JCM Q; 2E1H A; 2RQT A; 4C92 A; 4PJO C; 1BYM A; 3EFR A; 2MIO A; 5A0G A; 1YJW T; 4DBR A; 4OF1 A; 5CAI A; 3SWN C; 2R5M A; 1CKB A; 1R77 A; 5J3B A; 3SDZ A; 3L2U A; 1FMW A; 2DF6 A; 4Y28 E; 3UAT A; 3VS5 A; 1M4Z A; 4HA8 A; 3MO8 A; 2H3E B; 2JS2 A; 4NS5 A; 3OYE A; 5KYW A; 4M78 E; 3KFV A; 1M2O A; 3CCR A; 1X69 A; 5GAN g; 3CCQ Q; 4RG2 A; 3CC2 Q; 4PKC C; 5LJ3 j; 4LNP A; 3G6E T; 2JS0 A; 3CCL T; 3OYD A; 3EG2 A; 1KC8 R; 1MUZ A; 1NYG A; 4J9B A; 4C0G A; 4OP0 A; 1YN8 A; 3VKI A; 4OMM A; 2IG0 A; 4ZN3 A; 1AT1 B; 3MP6 A; 1HD3 A; 3NTK A; 2HDA A; 1U3O A; 3EHQ A; 4QVZ A; 2ED0 A; 1U5S A; 4QQD A; 2QTX A; 4J9C A; 3HHT B; 4JRI A; 3CD6 T; 1UGR B; 4EMH A; 2ZGW A; 4KH1 B; 1ZSZ A; 3QZ5 B; 1X01 A; 2DJZ A; 3JAM E; 2GFA A; 2L3S A; 2C06 A; 2EKH A; 1VQ9 T; 2JZ2 A; 1X43 A; 1SRL A; 1YHQ Q; 2KGT A; 2NUT A; 5FWB A; 1VQ5 T; 4FCY A; 4IIM A; 1NPP A; 3LGL A; 3M0P A; 2OI3 A; 4C92 G; 4OGE A; 2XK0 A; 2HMA A; 3OS1 A; 3GLX A; 5LJ5 f; 1X6O A; 2CSQ A; 2EAY A; 2MWO A; 1NG2 A; 1VQN Q; 4MZM A; 5KYX A; 1YJ9 Q; 4FU6 A; 2KEA A; 1Q7Y U; 1N27 A; 3A8G B; 4M75 A; 1RL2 A; 2EPD A; 1OX8 A; 5CIU A; 1GRI A; 2FO0 A; 4MMK A; 4PJO F; 2JNG A; 4M78 B; 3QJY A; 4RKU E; 3MEA A; 1S1N A; 3BDU A; 1OUL A; 4BY6 B; 5A2Q E; 5FU7 B; 1QMC A; 1WHM A; 2PU9 B; 3OS0 A; 4M7A D; 2ZPH B; 4D8D A; 5KYX B; 1JJ2 A; 3GNG A; 1BI1 A; 4N0A A; 2I2L A; 2KT1 A; 3QDR B; 1Q82 C; 1NLO C; 4FSX A; 1K73 U; 1IO6 A; 2CP7 A; 4GLM A; 4WTO B; 3OYJ A; 3M5A A; 2EGE A; 2VXF A; 3OW2 A; 2NUP A; 3GF5 A; 4KRT A; 1RI9 A; 1WI7 A; 2M02 A; 1K9A A; 1A0N B; 2HQE A; 3M57 A; 1C1A A; 5GMK h; 4PJN A; 3V8L A; 1VQ8 A; 1HK9 A; 2E6N A; 1QVF P; 3RMQ A; 1KG1 A; 2XID A; 4KUL A; 1GCQ C; 1T3S A; 1MGQ A; 2QI2 A; 2Z0W A; 4F17 A; 4PJO D; 2YLC A; 3LGF A; 1PSF A; 3C95 A; 1RUW A; 3CCJ Q; 2EQI A; 4F7U G; 1OU8 A; 2W10 A; 3E19 A; 4JUV A; 3BDL A; 1Q81 U; 4IKF A; 1AOJ A; 1IGU A; 4J9I A; 2RF0 A; 4Z89 A; 1QCO A; 2YRC A; 4M75 G; 2LRQ A; 3QO3 A; 2R57 A; 3CCR T; 2CSI A; 3SEM A; 1K8A U; 3TU4 K; 2D1X A; 3CPW A; 2G6F X; 1M27 C; 3QUI A; 1TWB A; 1SHG A; 2ZPG B; 1K9M U; 4PJL A; 1PNJ A; 1KC8 C; 4PLI A; 2M51 A; 4C92 C; 1VQM T; 2ZAE A; 4C0F A; 4Y91 A; 6AT1 B; 2RMO A; 1OZ2 A; 3SHW A; 3QWX X; 4DEX A; 1TUD A; 1N5Z A; 1W6X A; 4OMP A; 4DOV A; 3TCJ A; 5GMK l; 3C94 A; 5HK3 A; 4M7D G; 1QCN A; 2DA9 A; 5GMK m; 1NE8 A; 4LD9 K; 1YIJ A; 2PNI A; 2K2M A; 4OMQ A; 5A0L A; 3A1P A; 2OTJ A; 2LNV A; 4J83 A; 1VYV A; 1NEB A; 4GBQ A; 2IPO B; 1UEB A; 2BUD A; 5LL6 S; 2QAS A; 2GBQ A; 4QW2 A; 3HKS A; 4ESR A; 3I55 Q; 1AZE A; 4M7A E; 4C8Q G; 2DEU A; 1MMD A; 3G1J A; 4A53 A; 1JU5 C; 3WVE B; 2RHY A; 3JCM b; 1M1K R; 3M0Q A; 1KD1 U; 2OTL A; 1SSF A; 1VQ4 Q; 4XTX A; 2K9G A; 3OYG A; 4WF2 A; 3X26 B; 3CCU A; 3NTI A; 1M2V A; 1UGV A; 3EFO A; 5GAN f; 2E4H A; 1ZSZ C; 1FWZ A; 4XAX B; 1N8R U; 4XTY A; 3CCV Q; 1HYO A; 3JB9 F; 3VRZ A; 4JPB W; 1YI2 A; 1QVG P; 1IHW A; 2XI9 A; 5GAO n; 2VGM A; 2P4R A; 2JOY A; 4XQ3 A; 5IXB A; 1YJN Q; 4JJD A; 3KUF A; 4PJO E; 2XHC A; 2KK4 A; 4O6J A; 2D0Q B; 2J05 A; 2FVU A; 1XOV A; 1EZZ B; 2A08 A; 2JM9 A; 3CMA Q; 2HZY A; 2BZY A; 1Y07 A; 3RIR A; 1AVZ C; 2VYT A; 2QXF A; 3EFO B; 1KQ1 A; 5FRN A; 4M75 C; 3ASK A; 4WCI A; 2FEI A; 1DJ7 B; 2LQN A; 2J7I A; 2EYX A; 2E64 A; 4C92 F; 2RQU A; 2A0F B; 2L3P A; 3H0F A; 3FJ5 A; 4B6M A; 4L59 A; 2K6D A; 2QQS A; 2COW A; 2ENM A; 5LJ5 e; 3G4S A; 1XNI A; 3VJP A; 1VQ8 T; 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