The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
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Chain Sequence |
b'AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYG'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Proto-oncogene C-crk
|
| publication title |
Changing protein backbone topology: Structural and dynamic consequences of the backbone cyclization in SH3 domain
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
5
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-06-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2YUO A; 4JZ3 A; 4CC2 A; 4CC3 A; 2KRS A; 3KFV A; 3R6N A; 2JS0 A; 4RTX A; 1M8M A; 2QDL A; 3H0I A; 5IXB A; 2HSP A; 2SEM A; 4ORZ A; 2DMO A; 2OAW A; 2GTO A; 2KGT A; 1N5Z A; 1XOV A; 3A98 A; 1T3S A; 1UGV A; 4HVW A; 4AFS C; 1SHF A; 1OOT A; 2DRK A; 2I0N A; 2EYZ A; 3TVT A; 2DM1 A; 2DNU A; 2K9G A; 1ZSG A; 4JJD A; 2F2X A; 2YDL A; 2YUP A; 1JXM A; 3PVQ A; 1M3A A; 2DIL A; 4AG1 C; 4F14 A; 4J9D A; 3VS7 A; 4AFU C; 2MOX A; 1NLP C; 2GBQ A; 3RBB B; 1QKW A; 2VWF A; 3EG0 A; 2GQI A; 2O2O A; 1Z9Z A; 2FPE A; 4J9B A; 4HCK A; 5IXF A; 1PRL C; 3M0R A; 3VS6 A; 3QWY A; 2LQW A; 1GBQ A; 1TUD A; 2D0N A; 2KBT A; 1K9A A; 4OMO A; 1AZE A; 3EG2 A; 1SHG A; 1Y0M A; 4EIK A; 2CSI A; 2EGE A; 1NLO C; 2DLP A; 2FRY A; 3H0F A; 3I5S A; 2V1R A; 1WA7 A; 2NWM A; 5I11 A; 2EPD A; 1MV0 B; 1K0S A; 2KT8 A; 2JM9 A; 2BTT A; 1VYV A; 2K3B A; 1SRL A; 2HCK A; 3H41 A; 4RTZ A; 4LN2 A; 3ZL7 C; 1T3L A; 3O5Z A; 2E5K A; 2EW3 A; 2D8H A; 4J9H A; 1ZUU A; 2YUQ A; 2DJQ A; 1OPK A; 2DL7 A; 2J6F A; 3U23 A; 2YSQ A; 4J9E A; 2ECZ A; 4OMM A; 4AFZ C; 2CH4 W; 2EYX A; 3I35 A; 1UHF A; 2KXD A; 5GJW B; 1RI9 A; 1E7O A; 1ARK A; 2W10 A; 3JV3 A; 1OPL A; 1FYN A; 3GBQ A; 1BB9 A; 2JMA A; 1UHC A; 1W6X A; 1B3Q A; 2C0T A; 2PTK A; 2K79 A; 2A37 A; 1QLY A; 2DL8 A; 2J05 A; 4A63 B; 2D1X A; 1BU1 A; 2V1Q A; 1HJD A; 2D8J A; 2M51 A; 4CC7 A; 2A08 A; 2GTJ A; 1K1Z A; 2CRE A; 2EYY A; 1HD3 A; 4LUE A; 2KEA A; 4ZNX A; 4DEY A; 1BK2 A; 1QCF A; 4QT7 A; 2O9V A; 2RQU A; 1WFW A; 1AZG B; 2ESW A; 2AZV A; 2O9S A; 3I5R A; 4DEX A; 4IIM A; 1WXB A; 1NYF A; 1M30 A; 1K0X A; 1AWW A; 2EQI A; 1CKB A; 2FG0 A; 1PKT A; 1AWX A; 1A0N B; 2LJ0 A; 2DA9 A; 1M3C A; 2L2P A; 1X69 A; 2L3P A; 2DRM A; 2KR3 A; 2EKH A; 1YCS B; 2CT3 A; 1GCP A; 2HEQ A; 2M0Y A; 2A28 A; 2IIM A; 3TSW A; 2LZ6 B; 2EGA A; 3EG3 A; 1GL5 A; 2CH4 A; 2JMC A; 4HXJ A; 1QWF A; 2FEI A; 4JJB A; 1NM7 A; 1OEB A; 1SPK A; 1WX6 A; 2H8H A; 2HDA A; 4OML A; 4J9C A; 3VS3 A; 4OMN A; 2DL3 A; 3M0P A; 1E6G A; 3EGU A; 1UDL A; 2FPD A; 2DX1 A; 1PRM C; 4RTY A; 2C0O A; 2DF6 A; 1ABQ A; 2NUZ A; 1ZLM A; 2YUN A; 4R0K A; 2AK5 A; 1MV3 A; 3REA B; 3NPF A; 3PVL A; 5FWC A; 1WIE A; 1JEG A; 3I9Q A; 2ED0 A; 1GFC A; 3VS5 A; 2GNC A; 2AZS A; 1H3H A; 1FMK A; 2JT4 A; 4D8D A; 1AD5 A; 3NMZ C; 4LUD A; 2BZX A; 2DBM A; 2RQR A; 3M0T A; 5HCK A; 1AEY A; 4K11 A; 3VS1 A; 2P4R A; 2CT4 A; 1QKX A; 2W0Z A; 4KRT A; 4RUG A; 2K6D A; 1X6G A; 1V1C A; 5IHK A; 3CQT A; 2DVJ A; 2HBW A; 4F16 A; 1UUE A; 1X6B A; 2ABL A; 2B86 A; 4J9G A; 3NGP A; 1SEM A; 2DL4 A; 3FJ5 A; 2L3Q A; 2LP5 A; 4RTW A; 3H0H A; 1BBZ A; 1H8K A; 4X1V A; 3UF4 A; 1KJW A; 2VVK A; 4IIO A; 1JXO A; 2X3W D; 3REB B; 2MIO A; 4ESR A; 1ABO A; 1X27 A; 1X2K A; 4F17 A; 1TG0 A; 1SRM A; 1YN8 A; 4RTV A; 1E6H A; 1K76 A; 1I1J A; 1GCQ C; 1GFD A; 1OV3 A; 2A36 A; 2EVR A; 3M0Q A; 4JZ4 A; 2FO0 A; 1WXT A; 5IHI A; 1NEG A; 1AVZ C; 3THK A; 1VYT A; 1U5S A; 2LQN A; 5L23 A; 2C0I A; 4OMQ A; 1RUW A; 1YNZ A; 4J9F A; 2ENM A; 2KRN A; 1B07 A; 1UE9 A; 2EGC A; 1PHT A; 1X2Q A; 2OJ2 A; 4GLM A; 2F2V A; 1ZUK A; 1T0J A; 1GBR A; 1WYX A; 1NEB A; 4JPB W; 2DE0 X; 4HVV A; 4RTT A; 1EFN A; 2ROT A; 1PKS A; 1JO8 A; 1AWJ A; 1GRI A; 1PNJ A; 4J9I A; 1YWP A; 2J7I A; 2KT1 A; 1ZBJ A; 1Y57 A; 1LCK A; 1SSH A; 2KYM A; 1QWE A; 2EBP A; 2RN8 A; 4CC4 B; 2RMO A; 1S1N A; 3VRY A; 4WCI A; 1AOJ A; 1X43 A; 3VS2 A; 1UJY A; 1U3O A; 2MCN A; 2RPN A; 2LCS A; 2XMF A; 2K7A A; 2GGR A; 2JXB A; 2K2M A; 2JTE A; 2AKL A; 3RNJ A; 4LNP A; 1W70 A; 2CUD A; 1IO6 A; 2DBK A; 3TSZ A; 2ED1 A; 3ULR B; 1NYG A; 2O31 A; 1RLQ C; 4Z89 A; 3NHN A; 2O88 A; 3PE0 A; 2F2W A; 4AG2 C; 3UAT A; 1CSK A; 2BZ8 A; 5IH2 A; 3LH5 A; 1JQQ A; 3M0S A; 2KYB A; 1YWO A; 4GBQ A; 1CKA A; 4Y92 A; 3UA7 A; 2RQT A; 2LX7 A; 2KE9 A; 4AFQ C; 3EHR A; 2DYB A; 4E6R A; 4Z8A A; 1WI7 A; 2KRO A; 4RTU A; 1WLP B; 2KXC A; 4D8K A; 1KSW A; 2LNH B; 2YT6 A; 1H92 A; 3UA6 A; 1PWT A; 2FPF A; 5IHN A; 5I22 A; 2ROL A; 1JU5 C; 5GJV B; 1G2B A; 3VS0 A; 3IQL A; 4FSS A; 4HVU A; 5FW9 A; 4Z88 A; 3EG1 A; 1M27 C; 2EYW A; 1UEC A; 1T0H A; 2KRM A; 2RNA A; 1G83 A; 3C0C A; 3SHW A; 2X3X D; 1ZX6 A; 1GCQ A; 2VKN A; 2DL5 A; 4OMP A; 1W1F A; 2RQV A; 1WDX A; 5ECA A; 2CSQ A; 3VS4 A; 1U06 A; 1UFF A; 1VYU A; 2G6F X; 2CDT A; 4JJC A; 1M3B A; 2BZY A; 5EC7 A; 4M4Z A; 2JM8 A; 1AWO A; 4LE9 A; 2JW4 A; 2PZ1 A; 5FWB A; 1MUZ A; 1RLP C; 3M0U A; 3SEM A; 2RF0 A; 1ZUY A; 2L0A A; 1TUC A; 2LJ1 A; 2LMJ A; 2RQW A; 2CUB A; 1I0C A; 2SRC A; 2J6K A; 1UG1 A; 2AKK A; 2KNB B; 2JS2 A; 1UTI A; 1J3T A; 2LJ3 A; 1KFZ A; 1I07 A; 2OI3 A; 2PNI A; 1YP5 A; 1KIK A; 1Z9Q A; 3QWX X; 2FRW A; 1K4U S; 1NG2 A; 2L3S A; 3EHQ A; 2J06 A; 3VRZ A; 1VA7 A; 1WXU A; 2J6O A; 1UJ0 A; 1HSQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2X9H A; 1IHV A; 4JZ3 A; 3E1S A; 2QQB A; 1FWZ A; 3R6N A; 2JS0 A; 5FRM A; 3I56 A; 3JCM W; 5GAO l; 3CPW S; 1Q7Y U; 3OY9 A; 1WGS A; 2OAW A; 1Q82 C; 4MDX A; 1D1C A; 4MMK A; 2EYZ A; 1PSE A; 2RK2 A; 4OB3 B; 3KUF A; 3CC7 T; 1O75 A; 2F2X A; 4GLK A; 1M3A A; 4AG1 C; 4C92 A; 4AFU C; 3OMC A; 2PVD B; 3RBB B; 1VQL T; 4E7S A; 3MEV A; 5GAN e; 3JCM b; 1YHQ A; 5IXF A; 1PRL C; 3VUB A; 4QQG A; 3QWY A; 5J3B A; 1NZ9 A; 1GBQ A; 3PT9 A; 5CKD A; 1W2B A; 1TUD A; 3CEY A; 4DOW A; 4M75 C; 2D0N A; 1SF9 A; 1FXX A; 1BI3 A; 1SHG A; 1UB4 A; 1Y0M A; 5GAN 8; 2QGG A; 3CCU T; 3EGX A; 2EGE A; 2DK3 A; 1H64 1; 1NLO C; 2FRY A; 1TU0 B; 3TCJ A; 3H0F A; 2V1R A; 1WA7 A; 2NWM A; 2RK1 A; 1MV0 B; 2JN0 A; 2KT8 A; 2EYQ A; 4NL2 A; 1TSF A; 4MML A; 1VYV A; 2HQE A; 3CPW A; 2ZZD A; 2LT4 A; 1Q81 C; 2HCK A; 3H41 A; 1YJW T; 3S6W A; 4M75 F; 5LJ3 h; 5IN1 A; 2RO0 A; 3OYH A; 3MHX A; 2D8H A; 4J9H A; 2NUT A; 1W4S A; 2CH4 W; 2M16 A; 3A8O B; 3QYH B; 2NUP A; 4M78 B; 1RI9 A; 1E7O A; 2W10 A; 3V8J A; 1RAI B; 1VOM A; 2E65 A; 3BY7 A; 1VQN T; 4QVC A; 2RHI A; 1YJ9 A; 3C4S A; 2C0T A; 4M7D B; 1VQM T; 2CZ6 B; 2DL8 A; 2J05 A; 2DIG A; 4J6W A; 2O4X B; 3BDU A; 2JOY A; 4A63 B; 1HJD A; 2B8A A; 5FRN A; 2LQK A; 3L1A A; 2OTL T; 2QG9 B; 2QK0 A; 2RJD A; 4ZN3 A; 1G8X A; 2XDB A; 5LJ3 j; 1HD3 A; 4OVA A; 2KEA A; 4DEY A; 1BK2 A; 4QT7 A; 4C8Q E; 4C5H A; 4FCY A; 2O9V A; 4PFZ A; 3JCM X; 2O9S A; 3I5R A; 1WQ7 A; 4JS4 A; 1VQ9 A; 2NLU A; 1D1A A; 2KK4 A; 1K0X A; 5C0M A; 2EQI A; 3CME Q; 5DLO A; 1M90 C; 4C8Q B; 1PKT A; 4J7F A; 1AWX A; 4OF1 A; 4BI8 B; 2DD4 A; 4ZGJ B; 1K73 R; 1M3C A; 3CCL Q; 5LJ3 e; 2KR3 A; 1YCS B; 2L5Q A; 3RKX A; 3TSW A; 2DTI A; 2XDD A; 5GAM h; 5L8R E; 2FEI A; 1OEB A; 1SPK A; 2H8H A; 3OA6 A; 4OML A; 1TUG B; 3MEA A; 3I55 T; 3VS3 A; 4OMN A; 4HT9 A; 2K3Y A; 4JUV A; 2QA4 Q; 2KSS A; 3EGU A; 1TS9 A; 1UDL A; 2FPD A; 3OYE A; 4F7U A; 1K73 U; 1MMG A; 1ZLM A; 2YUN A; 1KD1 R; 2K5L A; 3JCM Q; 1MV3 A; 3HRS A; 3FRN A; 1QVG P; 3OW2 P; 1VQP A; 3FEO A; 1WZO A; 2LDM A; 1FMK A; 5CAI A; 3S3N A; 2XK0 A; 2BZX A; 4V2S A; 2DBM A; 3HFN A; 5HCK A; 3GIB A; 2CT4 A; 2W0Z A; 3CCM T; 1V1C A; 2FZG B; 1RAB B; 2DVJ A; 1RAA B; 3OS1 A; 4F7U E; 2IVW A; 3GNF B; 4HCZ A; 3CD6 T; 4BI3 A; 3E19 A; 4LXC A; 2B86 A; 4J9G A; 3NGP A; 1ZSZ C; 3SFM A; 1KD1 U; 2OTJ A; 2LVM A; 2DL4 A; 4BI4 A; 3NFC A; 3JB9 G; 1YJN T; 2LP5 A; 3H0H A; 4HCC A; 1WQW A; 1H8K A; 1VQ4 Q; 4X1V A; 3UF4 A; 3CCE T; 2E5Q A; 2RB6 A; 4WTO B; 1JJ2 A; 3JB9 I; 4Y91 A; 1OU8 A; 5GAM e; 4F04 B; 1ABO A; 2M1H A; 5FLX E; 5FU6 C; 1G3S A; 1TG0 A; 3BE3 A; 4MZT A; 2K57 A; 1YIT A; 1GCQ C; 3RKY A; 3M0Q A; 4C5G A; 2PUO B; 2FO0 A; 4JRI A; 5IHI A; 4LD6 A; 1B34 B; 1QVF A; 1NEG A; 5CIU A; 2HZY A; 1LOJ A; 3LLR A; 1U5S A; 1RUW A; 1YNZ A; 3PNW C; 4J9F A; 1I4K 1; 1B07 A; 2VYT A; 5LJ3 d; 3X20 B; 5KE2 A; 3E2U A; 2HSE B; 2QAZ A; 2BIV A; 2F2V A; 1K8A U; 1GBR A; 5KYY B; 2COW A; 1WYX A; 1NEB A; 3CCJ T; 1HYO A; 3MP8 A; 2DE0 X; 3RMQ A; 2R58 A; 7AT1 B; 2EFI A; 3OSS C; 5LJ5 g; 2DAQ A; 4C8Q D; 4ZGD B; 1JO8 A; 1AWJ A; 1N9S A; 1YWP A; 5KYU B; 5CQX A; 5KCO A; 3VRY A; 3VS2 A; 1NBE B; 2D0Q B; 3EFO A; 1K9M R; 4J5Y A; 1IRX A; 1IRE B; 2LCS A; 2XMF A; 1PSF A; 2AT1 B; 3MKD A; 2GGR A; 3CCS Q; 3TEE A; 1W70 A; 4N4I A; 1VUB A; 3TSZ A; 5GMK m; 3CCV Q; 2DXT A; 4X34 A; 5D7U A; 4Z89 A; 1IXD A; 1VQ6 Q; 3HL8 A; 3M9Q A; 1KQ1 A; 2BZ8 A; 1VQK Q; 4C92 C; 5IH2 A; 1Y96 A; 4M7A A; 3A5Z B; 3G4S A; 2WAC A; 4M75 E; 4XTX A; 3QXE B; 1CKA A; 3UA7 A; 1OI1 A; 4AT1 B; 2LX7 A; 3N5B B; 5HK0 A; 1IZ6 A; 1NJI C; 1G3W A; 2PU9 B; 4E6R A; 1WI7 A; 4M77 G; 4RTU A; 1YIJ Q; 2JUF A; 4M75 B; 2KI7 A; 2LNH B; 2QXF A; 3ME9 A; 3P8B B; 2EJF A; 1PWT A; 2ROL A; 2E41 A; 1G2B A; 5KYW A; 1YI2 A; 3IQL A; 4C92 F; 3MET A; 1RAE B; 2ATC B; 2CGH A; 3S3O A; 2EYW A; 1Q7Y C; 2VGM A; 1D0Z A; 2RNA A; 1V29 B; 3SHW A; 4LDW A; 4M78 G; 4XU1 A; 1W1F A; 4IKF A; 2ZPG B; 3CCQ T; 1TWB A; 1UFF A; 1VYU A; 2CZ7 B; 2BZY A; 1M1F A; 1AWO A; 5A0G A; 3CC7 Q; 1RLP C; 4LDU A; 4E2F B; 2RF0 A; 2H3E B; 4M7D G; 1TUC A; 4PLI A; 2CUB A; 3PFS A; 2JZ2 A; 2AKK A; 2YXY A; 3RMS A; 1UGR B; 2JS2 A; 1G3Y A; 3QG1 A; 1J3T A; 1UGQ B; 2VV5 A; 1VQL Q; 1C1A A; 2OI3 A; 2YLC A; 1Z9Q A; 4PK4 A; 3BFM A; 2EQJ A; 1OX9 A; 2JTF A; 1NG2 A; 3WXM B; 2AIR B; 4OB0 B; 4HT8 A; 2L3S A; 3EHQ A; 1F1B B; 3M4Y A; 3J7A F; 3E9G A; 3CCU Q; 2LX9 A; 3QYG B; 4CC2 A; 4BD3 A; 2YHT A; 2F1L A; 2O01 E; 2CZ1 B; 4RTX A; 1D0Y A; 1BCM A; 1BI2 A; 5IXB A; 4C8Q F; 2HSP A; 1W2B P; 2SEM A; 4ORZ A; 5LJ5 j; 4KUD K; 2KGT A; 2VB6 A; 1D3B B; 1T3S A; 1SHF A; 3DB3 A; 1YJW Q; 4IUV A; 2DRK A; 3OYM A; 3MEU A; 1I5O B; 2YDL A; 1O9S A; 5CKF A; 3TU4 K; 2DIL A; 4DOV A; 5GAO r; 4F14 A; 4BB7 A; 3CPW P; 5KCH A; 1V76 A; 1M2V B; 1WNL A; 1NLP C; 5DY9 A; 3J81 E; 1VQN Q; 3ASK A; 5I2M A; 3EG0 A; 2GQI A; 1MND A; 1Z9Z A; 2FPE A; 3VS6 A; 1MNE A; 1MMA A; 1VQM Q; 2G3R A; 3M4G A; 3RR6 A; 2DZC A; 3CMA T; 4GY5 A; 3SB2 A; 3EG2 A; 5GAO n; 4N0A A; 2CSI A; 4HA8 A; 4FYY B; 2KQW A; 1UEB A; 2OTL Q; 3V8K A; 5I11 A; 4KH0 B; 2V8K A; 3OYY A; 2GFU A; 1QP2 A; 4M75 D; 4L59 A; 1Y7X A; 2LT1 A; 4LN2 A; 3CCS T; 4EPC A; 5KH6 A; 1N8R R; 5KYX B; 2ECZ A; 4AFZ C; 1NJI R; 1VQ5 T; 4F7U F; 3CC4 A; 1WHK A; 2EYX A; 2KXD A; 1ARK A; 4FW1 A; 1KK7 A; 1ZSZ B; 2X4Y A; 4IUU A; 3G71 Q; 3G6E T; 1BB9 A; 3OYL A; 1VQ6 T; 5DM7 R; 4M7A D; 1X75 C; 2V8I A; 4B6M A; 2PTK A; 3RES A; 3L2R A; 2K79 A; 4LDX A; 2RHX A; 4EMK C; 2V1Q A; 3I55 Q; 5J39 A; 4CC7 A; 1K73 C; 2A08 A; 1I8F A; 3OS5 A; 5FU6 B; 2GCX A; 1N8R U; 1XJW B; 1YIJ T; 2GFA A; 1IGQ A; 2CRE A; 2EYY A; 4ZNX A; 4LUE A; 2VXF A; 3Q1J A; 1VQ7 T; 1RL2 A; 1SG5 A; 2RQU A; 1WFW A; 4DBF A; 1AZG B; 4DEX A; 4JRP A; 1KQ2 A; 4IIM A; 8ATC B; 2EWN A; 3V7S A; 3DLM A; 3CCM Q; 1KHI A; 4JS5 A; 4FL6 A; 3VV0 A; 4LDY A; 1A0N B; 4BUG A; 3UDC A; 1KD1 C; 3CD6 Q; 4NL3 A; 4BE0 A; 2M0Y A; 5CKH A; 2YRD A; 5LJ5 d; 1VQL A; 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