The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
GPLGSPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDIIKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Myosin 1E SH3
rcsb |
| molecule keywords |
MYOSIN 1E SH3
|
| molecule tags |
Motor protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
13
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3FJ5 A; 1BB9 A; 1YCS B; 1JU5 C; 1AVZ C; 1ZUY A; 2EW3 A; 2JMA A; 3M0R A; 4QT7 A; 1UUE A; 4R0K A; 2O2O A; 1Y57 A; 2C0O A; 2KGT A; 2JMC A; 2LQW A; 3M0P A; 1H3H A; 2DJQ A; 3VS0 A; 1NYF A; 4RTW A; 1GBR A; 4DEX A; 4K11 A; 2YT6 A; 2LP5 A; 2HBW A; 2W0Z A; 1WXU A; 1QWF A; 2YUQ A; 1M8M A; 2K6D A; 2ABL A; 3PVQ A; 3REB B; 5IHI A; 2KT1 A; 3UA6 A; 2JS2 A; 2DF6 A; 2F2X A; 2A28 A; 2KRN A; 2YDL A; 2KBT A; 4F17 A; 1QKW A; 1SRM A; 3QWX X; 2LMJ A; 1Z9Q A; 1K0X A; 2AKK A; 1ABO A; 1QLY A; 2NWM A; 2L3Q A; 1K0S A; 1VYU A; 2DL5 A; 2SEM A; 1K1Z A; 5IHK A; 5HCK A; 1X6G A; 2L3P A; 2ROL A; 3EGU A; 1JEG A; 2CH4 W; 2KRM A; 2D8J A; 4OMQ A; 3UAT A; 4J9C A; 5L23 A; 3M0S A; 4J9H A; 2GNC A; 2EYW A; 3O5Z A; 2A36 A; 1BBZ A; 3EG3 A; 2YUP A; 1HSQ A; 2O31 A; 1YWO A; 1CKB A; 3TSW A; 1ZUK A; 4LE9 A; 1M3B A; 1UJ0 A; 1XOV A; 1AWW A; 2IIM A; 2MOX A; 2GTJ A; 2L3S A; 4LNP A; 4JJB A; 1U5S A; 1KSW A; 2C0I A; 2J06 A; 2FPE A; 4CC7 A; 4RTZ A; 2RPN A; 4JPB W; 5IXB A; 1WIE A; 1J3T A; 4KRT A; 1GCQ C; 2GGR A; 2D8H A; 4A63 B; 1TG0 A; 1PNJ A; 3TVT A; 1AZG B; 1WFW A; 3VRY A; 1X27 A; 2LQN A; 2KYM A; 4J9D A; 5FWB A; 4RTV A; 3I9Q A; 2CRE A; 1HJD A; 2V1R A; 5IHN A; 4IIM A; 4HXJ A; 2K79 A; 1YNZ A; 3EHQ A; 1B3Q A; 1FYN A; 3A98 A; 1ZSG A; 4RTY A; 4Z88 A; 1JXO A; 3VRZ A; 3H0H A; 3IQL A; 1U06 A; 1OPL A; 2KYB A; 2RN8 A; 2DBK A; 3H0F A; 1AZE A; 2RQV A; 1E6H A; 1UHC A; 2JT4 A; 2JM9 A; 4JZ3 A; 2RNA A; 5FWC A; 1RLP C; 2HCK A; 4OML A; 1ZLM A; 2EKH A; 2MCN A; 4RTT A; 2CSQ A; 2DL8 A; 2K2M A; 1WXT A; 2X3W D; 1ABQ A; 2DRM A; 2FPF A; 2JS0 A; 2BZX A; 2KR3 A; 3NPF A; 3VS5 A; 1TUD A; 3UA7 A; 2L0A A; 2LJ3 A; 1ARK A; 3VS3 A; 1G83 A; 1A0N B; 1T3L A; 1RI9 A; 1X2Q A; 1AWJ A; 4ZNX A; 3TSZ A; 3GBQ A; 2EGE A; 2CT3 A; 2ED0 A; 2D1X A; 3EHR A; 1GCP A; 1SPK A; 2HDA A; 3REA B; 2D0N A; 3EG0 A; 3RNJ A; 2GQI A; 4F16 A; 2EYX A; 1M27 C; 1PWT A; 2SRC A; 4AFQ C; 3PVL A; 2PZ1 A; 4X1V A; 4EIK A; 1AD5 A; 2OAW A; 1Z9Z A; 1UEC A; 2VWF A; 2EVR A; 1E7O A; 1ZBJ A; 3LH5 A; 4D8D A; 2HEQ A; 4M4Z A; 5IXF A; 3I35 A; 1GL5 A; 4OMM A; 2EYZ A; 4WCI A; 2RQU A; 3ZL7 C; 4ESR A; 2AZV A; 2CUD A; 2B86 A; 2EQI A; 2LNH B; 3R6N A; 2RQW A; 1E6G A; 1WXB A; 1I07 A; 1S1N A; 4LUD A; 2KE9 A; 1AOJ A; 3NMZ C; 2GBQ A; 1UE9 A; 4JJD A; 2J6O A; 2J6F A; 2M0Y A; 2DMO A; 1T0J A; 1W1F A; 2DVJ A; 2DX1 A; 2KNB B; 2YUN A; 3VS6 A; 4Y92 A; 1NLO C; 4AG2 C; 2A37 A; 3VS7 A; 3U23 A; 1FMK A; 2KT8 A; 1WX6 A; 2HSP A; 2O9S A; 3NHN A; 5GJV B; 1PRL C; 4CC3 A; 2RQT A; 2F2W A; 1CKA A; 2AZS A; 2FRY A; 2DIL A; 2W10 A; 2XMF A; 1W70 A; 2ESW A; 2FO0 A; 2CUB A; 5EC7 A; 1UFF A; 1GCQ A; 1YN8 A; 1NEG A; 2X3X D; 1EFN A; 2J6K A; 2K9G A; 1SEM A; 2FEI A; 1UG1 A; 4E6R A; 1UTI A; 1B07 A; 2DBM A; 2BTT A; 4AFS C; 4RTU A; 1GFD A; 2DL4 A; 4CC4 B; 1H8K A; 2PNI A; 2QDL A; 2LZ6 B; 2ECZ A; 1AWO A; 1M3C A; 4OMO A; 1X2K A; 3I5R A; 4AFZ C; 2KXC A; 2FRW A; 1WLP B; 1QWE A; 1LCK A; 4JJC A; 1M30 A; 2J7I A; 4Z8A A; 3UF4 A; 1GRI A; 1GFC A; 1WI7 A; 2I0N A; 2P4R A; 4HVV A; 1K9A A; 2EYY A; 1H92 A; 3C0C A; 1W6X A; 3H0I A; 3KFV A; 2LJ0 A; 1NEB A; 4AFU C; 1PKS A; 1RUW A; 4J9E A; 5IH2 A; 1UHF A; 1JXM A; 1N5Z A; 1ZX6 A; 3H41 A; 3VS2 A; 4OMP A; 1KIK A; 2BZY A; 2YSQ A; 3JV3 A; 2GTO A; 4J9F A; 1OPK A; 2AKL A; 2ROT A; 4OMN A; 1AWX A; 4GBQ A; 4ORZ A; 2KRS A; 2YUO A; 1I1J A; 1V1C A; 1X43 A; 2A08 A; 2DNU A; 1VYT A; 2LCS A; 4CC2 A; 2JXB A; 1BK2 A; 4RTX A; 3EG1 A; 2RQR A; 1SRL A; 2O88 A; 2J05 A; 1T0H A; 1TUC A; 2ENM A; 2KXD A; 1MUZ A; 1T3S A; 3SEM A; 4AG1 C; 1X69 A; 2G6F X; 2VVK A; 4J9B A; 1X6B A; 1NM7 A; 2VKN A; 1AEY A; 1YWP A; 2OI3 A; 4HCK A; 1K4U S; 4LUE A; 1OEB A; 2K3B A; 2JTE A; 1M3A A; 4Z89 A; 1G2B A; 4J9G A; 4D8K A; 2OJ2 A; 2CSI A; 4J9I A; 2DM1 A; 1VA7 A; 1NG2 A; 1I0C A; 1MV3 A; 2L2P A; 2H8H A; 3I5S A; 1RLQ C; 2LJ1 A; 1KFZ A; 1PKT A; 1UJY A; 2MIO A; 1UDL A; 2JM8 A; 3M0U A; 1BU1 A; 2LX7 A; 2DLP A; 1SSH A; 1U3O A; 2M51 A; 3SHW A; 1KJW A; 1K76 A; 3M0T A; 1MV0 B; 1ZUU A; 1HD3 A; 2FPD A; 2RF0 A; 2DL7 A; 1NYG A; 1YP5 A; 2DA9 A; 2CT4 A; 2KRO A; 2DRK A; 5I11 A; 2FG0 A; 1GBQ A; 1CSK A; 2RMO A; 2AK5 A; 1IO6 A; 5GJW B; 2EPD A; 5FW9 A; 1WYX A; 2DE0 X; 2K7A A; 1WA7 A; 2ED1 A; 1NLP C; 2DL3 A; 5ECA A; 2CH4 A; 2EGA A; 2JW4 A; 3NGP A; 2EGC A; 4F14 A; 3THK A; 4HVW A; 1JO8 A; 1QCF A; 1SHG A; 1WDX A; 1UGV A; 4IIO A; 4GLM A; 2EBP A; 2PTK A; 4FSS A; 1PHT A; 2V1Q A; 1OOT A; 3VS1 A; 1Y0M A; 3QWY A; 2O9V A; 3RBB B; 1JQQ A; 2DYB A; 4HVU A; 3CQT A; 2F2V A; 2BZ8 A; 2KEA A; 1QKX A; 1SHF A; 3PE0 A; 2E5K A; 1VYV A; 3VS4 A; 1PRM C; 4LN2 A; 1OV3 A; 3EG2 A; 5I22 A; 2NUZ A; 2CDT A; 4JZ4 A; 2C0T A; 3M0Q A; 4DEY A; 4RUG A; 3ULR B; #chains in the Genus database with same CATH topology 4MZT A; 2C06 A; 4M7A E; 1YCS B; 1D0Z A; 3M0R A; 4QT7 A; 1UUE A; 4R0K A; 2E65 A; 5GAN 6; 4C8Q F; 4IKF A; 4C92 B; 2R5A A; 2KGT A; 2VXF A; 5LJ5 e; 2DFU A; 2HBP A; 3HFO A; 5AT1 B; 3M0P A; 1H3H A; 4DOV A; 4K11 A; 2HBW A; 1KQ2 A; 2W0Z A; 1VQM Q; 3MCA B; 3CBP A; 1QWF A; 4LDW A; 1Q81 R; 3PVQ A; 2EQM A; 4QKU A; 4M75 F; 1D3B B; 5LJ3 j; 2KT1 A; 2D6F A; 1Q86 R; 5CKE A; 2MAM A; 2RO0 A; 1YI2 A; 1NJI U; 2E70 A; 3JB9 H; 4UC4 A; 1I5O B; 2DET A; 4CI0 C; 3LWI A; 1YHQ T; 3QWX X; 4FSX A; 2CS7 A; 3JAM E; 1K0X A; 4C5I A; 2NWM A; 4GY5 A; 5DLQ E; 1WJS A; 1M90 U; 1PG5 B; 5J3B A; 5HK0 A; 2SEM A; 3EGU A; 4OMQ A; 3L2V A; 3CD6 Q; 3S3N A; 1XNI A; 4RCC A; 3AT1 B; 1MGQ A; 3X24 B; 3BDL A; 4M78 C; 4II1 A; 6AT1 B; 2P84 A; 4LE9 A; 5LJ3 e; 1M3B A; 1XOV A; 4OF1 A; 3M54 A; 4DBQ A; 1OZ2 A; 3OYK A; 4EMH A; 4ZN1 A; 2VXE A; 1WJQ A; 2RPN A; 4JPB W; 4BI4 A; 3KXT A; 1WIE A; 3LLR A; 3VUB A; 2GCX A; 2QQ9 A; 3E19 A; 1WNL A; 2GGR A; 4AT1 B; 3QYH B; 3QYG B; 5I21 A; 2ZPI B; 1WFW A; 3N5B B; 1X27 A; 2LQN A; 3CCE Q; 3MJX A; 2YLB A; 2COW A; 3ER0 A; 1XTD A; 2V1R A; 4M7A A; 1WQ7 A; 1B34 A; 2K79 A; 3CCR A; 1YNZ A; 3VYG A; 2E41 A; 3A98 A; 3L2Q A; 4RTY A; 1YCY A; 1JXO A; 1TUG B; 3UPU A; 1RAI B; 2E6Z A; 2HL3 A; 2X4Y A; 1IGQ A; 1U06 A; 1OPL A; 4PJO F; 1TH7 A; 3LYI A; 2JTM A; 2QTV A; 4OB3 B; 4OML A; 1ZLM A; 1OI1 A; 1VQK T; 2MCN A; 2BE7 D; 2K2V A; 1M1K U; 2RH2 A; 2CSQ A; 1YJ9 T; 4M7D A; 1WXT A; 3M53 A; 1ABQ A; 4XAX B; 2DRM A; 2M02 A; 2JS0 A; 4FT4 A; 2BZX A; 3G6E Q; 2O01 E; 1VQL T; 1PSF A; 2QEX A; 4FYX B; 2L0A A; 3JCM h; 3D7S B; 1G83 A; 1A0N B; 4XTV A; 1T3L A; 5KCH A; 3CCS Q; 2OTL A; 4ZNX A; 3GBQ A; 5GAM j; 2CT3 A; 2ED0 A; 2Y4Y A; 3G4S A; 4M77 E; 5GMK j; 3JB9 F; 2YHT A; 3EGD A; 4FYV B; 3REA B; 5C0M A; 4EMK B; 4RG2 A; 5CCA A; 3GPL A; 1M27 C; 3L42 A; 3OW2 S; 2SRC A; 4EIK A; 3H6Z A; 1F1B B; 1Z9Z A; 3WVE B; 2YWW A; 3BW1 A; 3JB9 J; 4LD9 K; 2DXC A; 1ZBJ A; 5GAN 5; 1K8A R; 4QW2 A; 4D8D A; 5IXF A; 2HSE B; 5GAM e; 1S72 T; 5GAN h; 1RAE B; 1PCX A; 1WHL A; 1WQW A; 2XU8 A; 1RAG B; 3TU4 K; 3EG9 B; 5GMK e; 1H3Z A; 5IT9 E; 1QP3 A; 4XQ3 A; 1I07 A; 1S1N A; 3CCQ A; 3FLG A; 4EPC A; 3GP8 A; 2RI3 A; 2DMO A; 1W1F A; 2DVJ A; 2KNB B; 1VQN T; 1RAA B; 3VKI A; 3I56 T; 3U23 A; 1JJ2 A; 2XD0 A; 2HQE A; 1PRL C; 4CC3 A; 3RKX A; 2RQT A; 4M77 F; 2DO3 A; 5FRN A; 2ESW A; 2HKN A; 3L2W A; 2CUB A; 1GCQ A; 8AT1 B; 2VGM A; 4JRI A; 4FYW B; 2VB6 A; 1TU0 B; 1LNX A; 2FEI A; 1UG1 A; 4E6R A; 4HCC A; 2CP7 A; 3CCV T; 5CQX A; 1UTI A; 2K3X A; 1YIT A; 4RTU A; 2PNI A; 2QDL A; 4PJN A; 3ZBD A; 4C0D B; 4E7S A; 1BI2 A; 3ZEH A; 4KGX B; 3QPH A; 3QZ9 B; 3A8L B; 3CCU Q; 4OMF B; 5LJ5 f; 1VQ4 T; 5D6W A; 3BFM A; 3EFO A; 2PQW A; 3CCM T; 1WLP B; 1QWE A; 2AT1 B; 4M77 A; 3EGX B; 2I2L A; 4ZTF A; 1MHN A; 3QZ5 B; 1G3W A; 2RK1 A; 3QXE B; 1BYM A; 4KUL A; 5GAN 8; 1W6X A; 1K9M R; 2RHY A; 1UHF A; 4FW1 A; 4PJL A; 3OYH A; 1ZX6 A; 1OX8 A; 3H41 A; 1U1T A; 2R58 A; 3VUZ A; 2CGH A; 2YSQ A; 3JV3 A; 3OYN A; 3QII A; 3G71 Q; 1PD1 A; 3G1J A; 3MEU A; 4C8Q C; 3X25 B; 1Q81 C; 2KRS A; 1AHJ B; 1I1J A; 2DNU A; 1VYT A; 5LJ3 f; 4CC2 A; 1KHC A; 5LJ3 d; 3EG1 A; 2RQR A; 3CPF A; 1T0H A; 1G3S A; 3P8D A; 3RKY A; 2ENM A; 3SEM A; 3KUF A; 1I8F A; 4Z02 A; 1B7T A; 1KG1 A; 2OI3 A; 4HCK A; 1OEB A; 2JTE A; 5CKB A; 3SFM A; 4J9I A; 5GAN 3; 1G3T A; 3QUI A; 4M75 G; 1NG2 A; 5KYX B; 1I0C A; 1VQO Q; 3EFR A; 1MND A; 4KGV B; 1RLQ C; 1YBY A; 1QVG P; 2R57 A; 2XDB A; 4M78 A; 3QKJ A; 3CPW A; 2JM8 A; 2LX7 A; 4A4E A; 1N27 A; 2A0F B; 2K3Y A; 1VQM A; 1KJW A; 4JRQ A; 1MV0 B; 3E1S A; 1ZUU A; 2ATC B; 2CT4 A; 5KYW B; 2EQJ A; 2KSS A; 5I11 A; 1GBQ A; 4ZGD B; 2E64 A; 2RMO A; 3QO3 A; 1YJW Q; 3CMA A; 4L59 A; 1W4S A; 4ATO A; 2DE0 X; 1OU8 A; 3V8J A; 2ED1 A; 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3M0S A; 2GFA A; 2EKO A; 1IZ6 A; 4N4G A; 2BKD N; 2JNG A; 1Q7Y U; 3G6E A; 4N4I A; 2NUP B; 2YUP A; 4ZTJ A; 1HSQ A; 2CKK A; 2QA4 Q; 1CKB A; 1Y96 A; 4F7U B; 4ZGJ B; 4JLI A; 3OYI A; 3CCS A; 5GAN g; 2IIM A; 2MOX A; 2GTJ A; 3CCQ T; 4N0A A; 2JUF A; 4LNP A; 4E7J A; 1U5S A; 1KQ1 A; 2C0I A; 2J06 A; 4CC7 A; 2KMT A; 3OYE A; 1VQ9 Q; 4RTZ A; 3CC4 Q; 1XJW B; 1J3T A; 4KRT A; 2AIR B; 4BE1 A; 1GCQ C; 2DZ9 A; 4FCY A; 2MYS A; 1ACM B; 2D8H A; 4MMK A; 2BUD A; 4M75 E; 1K73 R; 3CCV A; 2X9H A; 4ELY C; 1YJN Q; 4KH1 B; 3PNW C; 1QVF A; 4HA8 A; 1VIF A; 1I81 A; 1Q81 U; 3I9Q A; 4RKU E; 1VQ4 A; 3FC3 A; 2G3R A; 4IIM A; 4HXJ A; 1Q86 U; 4M77 C; 3EHQ A; 1JB0 E; 3DB3 A; 1ZSG A; 2CP6 A; 3VRZ A; 5I2S A; 3QDR B; 2FL7 A; 3A8O B; 5L8R E; 3VJP A; 3H0F A; 3NFC A; 2RK2 A; 2KI7 A; 2RQV A; 1E6H A; 2NUT B; 2JM9 A; 2BE9 B; 2E6N A; 3TEE A; 1RLP C; 2HCK A; 1ZQ1 A; 4MDW A; 4EMG A; 3CPW S; 4L6V 5; 1K9M C; 1TUD A; 1Q82 R; 2L89 A; 3R6O A; 3VS3 A; 4XTZ A; 1X2Q A; 3QHS A; 4QVC A; 2L3R A; 2RHU A; 2D9T A; 3CCU A; 3JCM W; 1QCO A; 3LGF A; 3V7S A; 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