The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
60
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structure length |
60
|
Chain Sequence |
GPLGSPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDIIKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Motor protein
|
| source organism |
Mus musculus
|
| publication title |
Myosin 1E SH3
rcsb |
| molecule keywords |
MYOSIN 1E SH3
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| total genus |
13
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KRO A; 1SEM A; 3U23 A; 3NHN A; 1M30 A; 1I1J A; 2L2P A; 2J6O A; 1JU5 C; 5FWB A; 3THK A; 2DVJ A; 2YT6 A; 2HCK A; 2K3B A; 1CSK A; 2JW4 A; 2O88 A; 3LH5 A; 2YDL A; 2SEM A; 1AWX A; 2EPD A; 4JJC A; 4R0K A; 2JS0 A; 1HSQ A; 1GCP A; 3M0P A; 1AD5 A; 2KBT A; 1GRI A; 1NLP C; 2G6F X; 4JJB A; 2J05 A; 3QWX X; 2CSQ A; 1AWJ A; 2DNU A; 3TSZ A; 2YUO A; 1PRL C; 2SRC A; 4JZ3 A; 1QKW A; 1M8M A; 1X2K A; 1JO8 A; 1UJ0 A; 1EFN A; 2A36 A; 4AFZ C; 2DL3 A; 1GCQ C; 4LUE A; 3SHW A; 3A98 A; 2CH4 A; 4Z88 A; 1K0X A; 1KIK A; 2B86 A; 2O9V A; 2NUZ A; 2ROT A; 3CQT A; 1K9A A; 1FYN A; 4GBQ A; 3I5S A; 1JQQ A; 1U5S A; 2RQR A; 1OPL A; 3M0R A; 2DL7 A; 2JS2 A; 1ABQ A; 2KXC A; 2I0N A; 2J6F A; 2DMO A; 2RNA A; 2DBM A; 2HDA A; 2VVK A; 1QWF A; 3PVQ A; 2AZV A; 3EG1 A; 5I11 A; 1JEG A; 2JXB A; 1HD3 A; 4X1V A; 1YWO A; 3GBQ A; 1MV0 B; 2LQN A; 5EC7 A; 2GBQ A; 1YN8 A; 2LX7 A; 1W70 A; 3VRZ A; 2DF6 A; 2P4R A; 1OV3 A; 1M3A A; 4RTZ A; 1U3O A; 1TUD A; 3M0U A; 4LE9 A; 2A08 A; 2NWM A; 2KT8 A; 2CH4 W; 4EIK A; 1KJW A; 2HSP A; 4RTX A; 3TSW A; 1H8K A; 4OMQ A; 1PWT A; 3SEM A; 4D8D A; 2LJ0 A; 2L3S A; 3I5R A; 3I35 A; 2DL8 A; 1Y57 A; 2JTE A; 1MUZ A; 1ZUY A; 3VRY A; 4LNP A; 1WFW A; 1ZX6 A; 2BTT A; 1H92 A; 1TUC A; 3NGP A; 2ESW A; 4OMP A; 1I07 A; 3H0I A; 1B07 A; 4J9F A; 1BU1 A; 3R6N A; 2F2X A; 2OAW A; 4Z89 A; 2O31 A; 2JM9 A; 1GBQ A; 4AG2 C; 1T3L A; 2GGR A; 3H0F A; 2YSQ A; 1RLP C; 4RUG A; 2ABL A; 2F2V A; 2KE9 A; 2KT1 A; 2JMA A; 4A63 B; 1VA7 A; 2EGE A; 2CDT A; 2PNI A; 1QLY A; 2CUD A; 1PHT A; 2ED1 A; 4HVU A; 2CT4 A; 3QWY A; 2ROL A; 1FMK A; 1W1F A; 3M0T A; 2O9S A; 4J9D A; 2IIM A; 2RMO A; 1WI7 A; 1J3T A; 2VKN A; 3M0Q A; 1K76 A; 2LMJ A; 1WDX A; 1E7O A; 1PKS A; 4ESR A; 1G2B A; 1GFC A; 2OJ2 A; 4JJD A; 2C0I A; 4OMM A; 4E6R A; 1BBZ A; 1WLP B; 2D8H A; 5IHK A; 1ZUK A; 4Z8A A; 2DJQ A; 5FW9 A; 5I22 A; 2ECZ A; 2MCN A; 4J9H A; 3VS7 A; 5IXF A; 2J06 A; 4IIM A; 3PE0 A; 4LN2 A; 2XMF A; 1YNZ A; 1RUW A; 2GTJ A; 2BZY A; 2AK5 A; 1UJY A; 4F17 A; 1KFZ A; 2AZS A; 4J9G A; 2EKH A; 2L3P A; 1UHC A; 1YWP A; 1WA7 A; 1VYU A; 2RPN A; 3M0S A; 2FPD A; 2RQV A; 1A0N B; 4OMO A; 1SHF A; 1ZLM A; 2C0O A; 2E5K A; 2BZ8 A; 4QT7 A; 2KRM A; 3VS5 A; 1HJD A; 4HXJ A; 1G83 A; 2DIL A; 4J9C A; 1WXT A; 1S1N A; 1SRM A; 2EYZ A; 1WXU A; 3VS4 A; 2LZ6 B; 5GJV B; 3VS2 A; 1U06 A; 4HCK A; 5FWC A; 1YCS B; 1H3H A; 2FEI A; 2LP5 A; 2V1Q A; 1NLO C; 1XOV A; 4RTU A; 1PRM C; 3EG0 A; 2PTK A; 1NM7 A; 2F2W A; 1AOJ A; 4CC3 A; 5IH2 A; 1B3Q A; 3ULR B; 2KXD A; 2EYW A; 1M3B A; 2RN8 A; 2FRY A; 1VYV A; 1SPK A; 4J9I A; 1E6G A; 4OMN A; 5IHN A; 2EGC A; 4RTV A; 3H41 A; 1UDL A; 1X6G A; 5ECA A; 4AFQ C; 3KFV A; 1SRL A; 2M51 A; 1PKT A; 4J9E A; 3VS0 A; 4DEX A; 2LQW A; 4CC7 A; 4OML A; 1N5Z A; 2J7I A; 1AWO A; 5HCK A; 4CC4 B; 3EHR A; 2GQI A; 3JV3 A; 4M4Z A; 4RTT A; 3C0C A; 2C0T A; 2JMC A; 1AZE A; 2HBW A; 2BZX A; 4D8K A; 2A28 A; 2RQT A; 2L0A A; 4RTY A; 2K9G A; 1NEB A; 1K0S A; 2J6K A; 4CC2 A; 1BK2 A; 1AVZ C; 1UGV A; 3UF4 A; 5GJW B; 3REB B; 3PVL A; 1CKA A; 3TVT A; 2QDL A; 2EYX A; 1NG2 A; 2KEA A; 1UTI A; 2EBP A; 1X6B A; 3O5Z A; 3H0H A; 4K11 A; 1CKB A; 1NYG A; 1YP5 A; 3RBB B; 2DL5 A; 4ORZ A; 2GTO A; 1UEC A; 4Y92 A; 4ZNX A; 2FPE A; 2YUN A; 2CT3 A; 3EG3 A; 3FJ5 A; 3I9Q A; 3ZL7 C; 1ARK A; 2D1X A; 1SHG A; 2ENM A; 3NPF A; 1OPK A; 2K2M A; 3UAT A; 2CRE A; 3VS6 A; 1GBR A; 2DE0 X; 3EHQ A; 2DLP A; 2V1R A; 4WCI A; 4HVV A; 2HEQ A; 1GCQ A; 4F14 A; 2O2O A; 2DL4 A; 2PZ1 A; 2H8H A; 1T0J A; 2GNC A; 2X3X D; 2EVR A; 2KNB B; 1UHF A; 2L3Q A; 1I0C A; 1OEB A; 3RNJ A; 1AWW A; 1NEG A; 2EW3 A; 1RLQ C; 2MOX A; 3REA B; 4DEY A; 1AEY A; 3UA6 A; 1LCK A; 1M3C A; 1QWE A; 1WYX A; 2K7A A; 2A37 A; 2RQW A; 2KYM A; 1Y0M A; 2ED0 A; 2D0N A; 3UA7 A; 2LJ1 A; 1RI9 A; 1WX6 A; 2DA9 A; 4IIO A; 4F16 A; 1UFF A; 1X43 A; 2KR3 A; 5L23 A; 2KRN A; 4AG1 C; 4LUD A; 1X69 A; 4FSS A; 1ZSG A; 2K6D A; 1WIE A; 2DM1 A; 2DYB A; 3EG2 A; 2VWF A; 1AZG B; 2DBK A; 4RTW A; 2D8J A; 1VYT A; 2CUB A; 1UUE A; 4GLM A; 1ABO A; 2KYB A; 2X3W D; 2W0Z A; 3IQL A; 2M0Y A; 2DRK A; 2AKL A; 1K4U S; 1UE9 A; 2EYY A; 2YUQ A; 4JZ4 A; 1M27 C; 4HVW A; 2AKK A; 2JM8 A; 2LJ3 A; 2EGA A; 2EQI A; 1E6H A; 1KSW A; 4AFU C; 1Z9Z A; 1TG0 A; 1GL5 A; 1QKX A; 2MIO A; 3EGU A; 1NYF A; 1T0H A; 4AFS C; 1OOT A; 2DX1 A; 1T3S A; 2FO0 A; 1Z9Q A; 1MV3 A; 2FG0 A; 2KGT A; 2LCS A; 1K1Z A; 2FRW A; 4KRT A; 2OI3 A; 2CSI A; 1V1C A; 1JXO A; 1ZBJ A; 3VS1 A; 1QCF A; 2JT4 A; 1WXB A; 2W10 A; 1IO6 A; 3VS3 A; 5IXB A; 2RQU A; 1SSH A; 2FPF A; 3NMZ C; 2LNH B; 2KRS A; 1W6X A; 2K79 A; 4J9B A; 1PNJ A; 1X27 A; 2DRM A; 5IHI A; 1ZUU A; 4JPB W; 2RF0 A; 1JXM A; 1BB9 A; 2YUP A; 1X2Q A; 1UG1 A; 1GFD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3A5Z B; 1SEM A; 3T9N A; 1BI1 A; 3HHT B; 2RO0 A; 1M30 A; 1I1J A; 3QYG B; 2DTI A; 3RKW A; 3CXC P; 2X4X A; 3THK A; 2WSE E; 4GY5 A; 2HCK A; 4E7L A; 4KUD K; 2O4X B; 2O88 A; 1AWX A; 4M7A G; 1HSQ A; 1LVK A; 2MF2 A; 3CCS T; 3X28 B; 1U1S A; 4BY6 B; 1NLP C; 3FDR A; 3M54 A; 1Y71 A; 3OYJ A; 4XK8 E; 3CCU T; 2SRC A; 3MJX A; 2V8I A; 3L2Q A; 3G71 A; 1QKW A; 2ZZD A; 1YJ9 A; 1X2K A; 5GAM g; 5KYN A; 1EFN A; 1N8R U; 1M1G A; 1QVF A; 1W2B A; 2CH4 A; 4Z88 A; 2DYI A; 1FMW A; 2E64 A; 1KIK A; 2B86 A; 2ROT A; 5CKB A; 4QVD A; 4QQG A; 2K4Y A; 3V7R A; 1WHH A; 1ZSZ A; 4OF1 A; 3OB9 A; 1Y96 A; 5GAN 6; 4E7H A; 3JCM e; 3CCR Q; 2RNA A; 5CQY A; 3V8L A; 2HDA A; 4IUV A; 1QWF A; 4M77 F; 4N4I A; 1M4Z A; 4DOW A; 1DJ7 B; 2JXB A; 3OYI A; 3GBQ A; 3CC7 A; 4ME7 A; 2F5T X; 5EC7 A; 1YN8 A; 1VQP A; 1OV3 A; 2DVE A; 4LE9 A; 2K3X A; 1K9M U; 4D6W A; 4EIK A; 3FEO A; 1KJW A; 3JCM X; 2M1H A; 4KBM B; 2LJ0 A; 2L3S A; 3I35 A; 4PJJ A; 2YRV A; 1Y57 A; 1MUZ A; 3HL8 A; 3LW5 E; 3TCJ A; 3A8M B; 3CMA A; 1RAA B; 2NUP A; 4A54 A; 2BTT A; 2VV5 A; 1IZ6 A; 3S3N A; 1H92 A; 3NGP A; 2CP0 A; 5LJ3 j; 3SWN C; 2E65 A; 2XHC A; 3CCR T; 2RHU A; 5GAN e; 2QA4 A; 2NLU A; 4BE2 A; 3ZBD A; 1T3L A; 4Z02 A; 3VUB A; 1QP2 A; 1YJN T; 3ER0 A; 3WVE B; 4A4F A; 2KE9 A; 5FU7 B; 4BDZ A; 1VA7 A; 1VQN A; 2PNI A; 2QQA A; 2RHI A; 5LJ3 h; 4M75 F; 3CCQ Q; 1PHT A; 4ZTJ A; 1G8X A; 3QWY A; 1W1F A; 1TH7 A; 1C1A A; 2O9S A; 3P8B B; 1WI7 A; 3QUI A; 1LJO A; 3EAE A; 3L2Z A; 5FRO A; 2OJ2 A; 4M78 B; 4HT9 A; 4B9X A; 5D6X A; 1BBZ A; 2JJ9 A; 1YIJ Q; 2D8H A; 1ACM B; 4E7S A; 1ZUK A; 2E6Z A; 5I22 A; 1QQJ A; 4J9H A; 2J06 A; 4EMH A; 4M77 A; 2BZY A; 1UJY A; 3MET A; 4HA8 A; 4J9G A; 2FYK A; 2L3P A; 3F70 A; 4C0D B; 4ANJ A; 1RAF B; 2F1L A; 4J7I A; 3S6W A; 4QQ6 A; 1S72 Q; 3M59 A; 2RQV A; 2C0O A; 3CCQ T; 2PU9 B; 1M9S A; 2HZY A; 3MP8 A; 4KT0 E; 1WXT A; 1MMG A; 1SRM A; 2EYZ A; 1M8V A; 3VS4 A; 3G4S Q; 2A3L A; 4PJO D; 3EFO B; 1ZHI A; 4IUP A; 1YIJ T; 3MKD A; 2PTK A; 4XU1 A; 1AOJ A; 3LH0 A; 5IH2 A; 2IVW A; 2GFA A; 2GF7 A; 2X35 A; 5GMK e; 2FRY A; 1D0Z A; 5EG2 A; 2CP3 A; 5KYY B; 4LDV A; 2GCX A; 3OYE A; 3H41 A; 1MMN A; 5ECA A; 4FSX A; 4AFQ C; 2X4W A; 3PIO A; 2KVQ G; 5GAN 3; 3KFV A; 5I2M A; 3FC3 A; 2M51 A; 7AT1 B; 2LQW A; 5CO7 A; 1S72 T; 3LWI A; 1D3B A; 1XTD A; 4XTX A; 3OYH A; 2X51 A; 4M7A B; 4PJO E; 2CZ0 B; 4QW2 A; 3V7S A; 3OBY A; 3OYY A; 2XI9 A; 4C8Q C; 2RHZ A; 4WTO B; 1RAD B; 2P0K A; 4D8K A; 2Y4X A; 1RAH B; 3QG1 A; 5I2S A; 3CME Q; 2OX7 A; 1U1T A; 2L0A A; 3G71 Q; 1NE8 A; 3G4S T; 4JRI A; 1K0S A; 2MWP A; 4LD6 A; 2J6K A; 2MK5 A; 4HKE A; 1AVZ C; 4J6X A; 5GJW B; 4FYY B; 1KQS P; 3REB B; 3OS5 A; 1CKA A; 5GMK i; 3A8H B; 3QKJ A; 2EYX A; 2COZ A; 1PSE A; 2EBP A; 3O5Z A; 1YJW A; 2MPX C; 1YFN A; 4K11 A; 3RDV A; 1VQO A; 4II1 A; 4M7D D; 1NYG A; 1YP5 A; 1VQM A; 3BE3 A; 2GTO A; 2E3H A; 2YUN A; 2CT3 A; 3EG3 A; 9ATC B; 3FJ5 A; 1NPR A; 2YRD A; 4RMO A; 4J8O A; 4BI3 A; 1QVG P; 2DE0 X; 3OS1 A; 3V8J A; 2V1R A; 4WCI A; 4HVV A; 3RER A; 1G3T A; 5CKD A; 4XTY A; 2O2O A; 4DBH A; 4E7K A; 1OUL A; 2DL4 A; 3BDU A; 3J7A F; 3CME T; 2YLC A; 3G71 T; 4IUT A; 3EH2 A; 1XNI A; 4JDS A; 1UHF A; 2H3E B; 3E9F A; 1OEB A; 2X4Y A; 3FLG A; 4M7D E; 2HKN A; 5GAO q; 4E7I A; 1KQS A; 1I4K 1; 1K73 C; 1M3C A; 2RQW A; 2NYS A; 5LJ3 e; 3SFM A; 3CPF A; 2RJC A; 5D7U A; 2LJ1 A; 1WX6 A; 2QQS A; 4IIO A; 3M4Y A; 2ATC B; 4AG1 C; 1X75 C; 1OX9 A; 4FSS A; 4IKF A; 3LGF A; 1N9S A; 2VWF A; 1AZG B; 1VQ4 Q; 3RIR A; 1Q95 G; 2COW A; 1VYT A; 4L6V 5; 3OY9 A; 2VUB A; 4GLM A; 1FMV A; 3M9Q A; 5KYU A; 2X3W D; 4FT2 A; 3PFS A; 1OQK A; 3JCM V; 2OTJ A; 2FHD A; 3LYI A; 4JZ4 A; 2KK4 A; 4BE1 A; 4M75 B; 2E5Q A; 4RCB A; 2OTL Q; 3SWN A; 4F04 B; 1RL2 A; 3JSC A; 4M7D G; 1BI0 A; 3CMA T; 1B34 B; 1GL5 A; 1P92 A; 1TOV A; 3QSU A; 1TUG B; 1M1K R; 5FU6 B; 1QVF S; 5GAN 4; 2LCL A; 1W2B S; 5IT9 E; 1M2V B; 4L5G A; 2NUT B; 2FO0 A; 1K1Z A; 2RHX A; 3VS1 A; 1K8A C; 1PG5 B; 3RMQ A; 2VGN A; 2W10 A; 4XTW A; 2EJG A; 2KRS A; 3QDR B; 4C8Q F; 1UGR B; 4FW1 A; 1X27 A; 2BE9 B; 3EGD A; 3E2U A; 3KBG A; 1GFD A; 1QP3 A; 1LPL A; 3JAM E; 1JU5 C; 2L8D A; 3O8V A; 4FM4 B; 1Q81 C; 2OTL T; 4PJM A; 2QQ9 A; 2JW4 A; 2EPD A; 1KC8 C; 1GCP A; 3M0P A; 3V7C A; 1AD5 A; 4JUV A; 4Y91 A; 3FB9 A; 1BIB A; 2J05 A; 2L5Q A; 1SKU B; 2LQK A; 3RMS A; 3OYM A; 5GAN j; 3TSZ A; 2YUO A; 2OAU A; 1PRL C; 1WHG A; 1JO8 A; 1UB4 A; 1UJ0 A; 2A36 A; 1GCQ C; 3CC2 A; 2K2V A; 4JLI A; 4F7U G; 3G6E Q; 5GMK l; 4E7J A; 3CQT A; 2XDB A; 4C92 C; 1JQQ A; 1U5S A; 1OPL A; 3P8H A; 2I0N A; 2EQK A; 2J6F A; 3JCM b; 3VV0 A; 4IUU A; 3OYF A; 3G1J A; 2AZV A; 3EG1 A; 5GAO n; 1M1K U; 1JEG A; 2JNG A; 1HD3 A; 3BY7 A; 1N6A A; 2LQN A; 4TVR A; 2KAF A; 1W70 A; 4HT8 A; 2DF6 A; 3LX7 A; 3X25 B; 1M3A A; 2COY A; 1TUD A; 3M0U A; 4OGC A; 1YJW Q; 2BUD A; 1VQ9 A; 2KT8 A; 3RKY A; 2MMP A; 1RAI B; 1H8K A; 4OMQ A; 1PWT A; 2DFU A; 1YIT A; 4A4E A; 3QBY A; 3SEM A; 4D8D A; 4PL6 A; 3I5R A; 4M77 D; 4C8Q A; 4C5I A; 2DL8 A; 3G6E T; 2JTE A; 2RD1 A; 4IUR A; 1OZ3 A; 3ASK A; 3VRY A; 4OMF B; 1WFW A; 2CYZ B; 4J7F A; 3OYN A; 2DIQ A; 4V2S A; 2F5K A; 2XDP A; 4MML A; 4OMP A; 1I07 A; 4O6J A; 3A8G B; 3D7S B; 1VQ6 A; 1BU1 A; 2F2X A; 2QTV A; 2OAW A; 4PJO B; 2JM9 A; 1GBQ A; 1VQ5 A; 3QZ5 B; 2YSQ A; 3MP6 A; 1RLP C; 5GAM f; 3RKX A; 1K73 R; 4MDW A; 4RUG A; 2QTX A; 3CCV A; 2DEQ A; 2KT1 A; 3JCM Q; 4EPC A; 1B7T A; 5KYW B; 5GMK j; 1QLY A; 4M77 E; 2XDD A; 1YJW T; 4IUQ A; 3VKI A; 5LJ5 e; 3I56 A; 5KE3 A; 3JCM g; 2EYQ A; 4AMC A; 4PFO A; 2A7Y A; 3OYL A; 2QDY B; 1J3T A; 3M0Q A; 2LMJ A; 4F7U F; 1OU9 A; 1G2B A; 2RHY A; 1JBM A; 1GFC A; 4JJD A; 2EFI A; 4E6R A; 4AT1 B; 8ATC B; 5IHK A; 3GIB A; 3AHU A; 1XQH A; 4Z8A A; 5FW9 A; 5GMK h; 2ECZ A; 3DB3 A; 4CRI A; 3MEU A; 4M75 D; 4LN2 A; 2XMF A; 1YNZ A; 1RUW A; 2AK5 A; 4F17 A; 2HL3 A; 3I55 A; 4YTL A; 4L59 A; 1ZA2 B; 1TXQ A; 1UHC A; 4C5E A; 1Q86 U; 2RPN A; 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