The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
60
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structure length |
60
|
Chain Sequence |
GPLGSPQCKALYAYDAQDTDELSFNANDIIDIIKEDPSGWWTGRLRGKQGLFPNNYVTKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
MYOSIN 1E SH3
|
| publication title |
Myosin 1E SH3
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule tags |
Motor protein
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| total genus |
13
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| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-07-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AFU C; 2V1Q A; 2J6K A; 3IQL A; 2J7I A; 4LUE A; 3ZL7 C; 1QWE A; 3VS1 A; 3M0P A; 1OOT A; 1T3L A; 3EGU A; 1I1J A; 1NM7 A; 2KYB A; 2XMF A; 2A08 A; 2AZS A; 2LJ3 A; 3JV3 A; 1X2Q A; 2DIL A; 4HCK A; 1K4U S; 1H92 A; 2J6F A; 1J3T A; 1JO8 A; 1YP5 A; 2LCS A; 1UUE A; 2RPN A; 2KRO A; 1Y0M A; 1QKX A; 1ZUU A; 3H0I A; 2O9S A; 2RQT A; 2M51 A; 4ESR A; 1M30 A; 3M0Q A; 4ZNX A; 2K7A A; 1AOJ A; 1BBZ A; 4FSS A; 4HVU A; 1QLY A; 1GFC A; 1WX6 A; 4CC3 A; 2DL5 A; 4RUG A; 3I35 A; 1AZE A; 1K0X A; 3C0C A; 1WFW A; 1WXU A; 2GTJ A; 3M0T A; 4WCI A; 1K76 A; 2J6O A; 2LNH B; 1W6X A; 2A28 A; 2DF6 A; 4X1V A; 2DE0 X; 2KGT A; 2JW4 A; 2YUP A; 1PWT A; 2DL3 A; 2M0Y A; 2B86 A; 2C0O A; 4LE9 A; 1AEY A; 1UHC A; 2FRW A; 1KSW A; 2KYM A; 2SRC A; 2FPE A; 1AZG B; 1RUW A; 2BTT A; 1MUZ A; 4RTZ A; 1Z9Q A; 1EFN A; 2ENM A; 4IIM A; 1HJD A; 1HD3 A; 1W1F A; 2ED0 A; 4J9F A; 1AD5 A; 2AKK A; 2ECZ A; 1YWP A; 2ROT A; 3EG3 A; 1VYT A; 3GBQ A; 2O88 A; 3EG0 A; 2CUD A; 3I5S A; 2VWF A; 2PNI A; 4OMM A; 3RNJ A; 3M0U A; 2BZX A; 4Y92 A; 1BU1 A; 3PVQ A; 2LQW A; 3SEM A; 2CH4 A; 1GCQ A; 2PZ1 A; 2CSQ A; 2RNA A; 2DRM A; 2KNB B; 2RN8 A; 4CC2 A; 1ARK A; 1E7O A; 4JJC A; 1SRL A; 1KJW A; 2K9G A; 2F2W A; 2NWM A; 2DX1 A; 2C0I A; 1TUD A; 1UGV A; 1GRI A; 3VS0 A; 2LMJ A; 5IHN A; 1UDL A; 5GJV B; 3LH5 A; 1X27 A; 1TG0 A; 2L3S A; 1CKB A; 1Y57 A; 1UHF A; 2DA9 A; 2DNU A; 2CSI A; 4LUD A; 2K79 A; 2KRS A; 1G83 A; 3H0H A; 2EBP A; 1JEG A; 1ABO A; 1QCF A; 1JXO A; 1XOV A; 3TVT A; 1WIE A; 3NPF A; 4J9H A; 4R0K A; 5FWC A; 5I11 A; 2CH4 W; 2DBK A; 2FG0 A; 2JS0 A; 5IH2 A; 1G2B A; 2LQN A; 3REA B; 2JXB A; 2KE9 A; 1ZUY A; 3NMZ C; 3UA7 A; 3A98 A; 2G6F X; 1N5Z A; 2L0A A; 1NEG A; 2L3Q A; 1K9A A; 2AZV A; 2W10 A; 1RLP C; 4RTW A; 5HCK A; 1X69 A; 2L2P A; 4DEX A; 4M4Z A; 3R6N A; 4JZ4 A; 2DVJ A; 2YSQ A; 2A36 A; 2YT6 A; 3THK A; 1BK2 A; 1B3Q A; 3PVL A; 3TSZ A; 4AFS C; 4JZ3 A; 4F16 A; 3UA6 A; 1ZX6 A; 2O2O A; 1WLP B; 3EG2 A; 1OPK A; 4RTT A; 2DMO A; 2YUN A; 3O5Z A; 2D8J A; 2EGE A; 3VS2 A; 1GCQ C; 4AFZ C; 2FEI A; 1AWX A; 1PKT A; 2RQU A; 4LNP A; 4RTY A; 1AWW A; 2DM1 A; 3UF4 A; 1FYN A; 2EGA A; 2JMA A; 2I0N A; 2ESW A; 1Z9Z A; 5IXF A; 1H3H A; 5GJW B; 4J9I A; 2K3B A; 4HVW A; 4JJD A; 2AK5 A; 2KEA A; 3VS6 A; 1NYF A; 1T0H A; 1WXT A; 1RI9 A; 2O9V A; 4AG1 C; 5IHK A; 2E5K A; 2RQR A; 3KFV A; 1WYX A; 2RMO A; 1M8M A; 2J05 A; 2CRE A; 2FO0 A; 1SHG A; 1S1N A; 2KXC A; 4J9D A; 4RTU A; 4F17 A; 2KRM A; 1ZUK A; 4OMO A; 2SEM A; 2LP5 A; 2GQI A; 2H8H A; 1NLP C; 1M3B A; 1B07 A; 1ZLM A; 3TSW A; 4K11 A; 2EYZ A; 2EGC A; 1X6G A; 1MV3 A; 2HSP A; 1HSQ A; 4Z89 A; 1E6G A; 1SHF A; 1OEB A; 1TUC A; 1KFZ A; 2BZY A; 1M3A A; 1SSH A; 1SPK A; 3QWX X; 1JU5 C; 1M27 C; 1VA7 A; 2KR3 A; 2JMC A; 2DL8 A; 1M3C A; 2YDL A; 2RF0 A; 1QWF A; 2P4R A; 2QDL A; 1UE9 A; 2D8H A; 4J9E A; 3NHN A; 2OJ2 A; 4HVV A; 1ZBJ A; 1UEC A; 2JM8 A; 2GTO A; 4HXJ A; 3M0S A; 4RTV A; 1AWJ A; 2JTE A; 1JQQ A; 2DRK A; 2HBW A; 3VS4 A; 1UFF A; 4F14 A; 1GFD A; 3M0R A; 2IIM A; 1OPL A; 3SHW A; 2FPF A; 2DYB A; 4J9C A; 1SEM A; 4DEY A; 2O31 A; 1X6B A; 5L23 A; 1WXB A; 1A0N B; 2C0T A; 1PKS A; 2HCK A; 1NLO C; 2K6D A; 2RQW A; 2LZ6 B; 2NUZ A; 1YNZ A; 2CT3 A; 2ROL A; 4Z8A A; 3UAT A; 5FWB A; 3EHR A; 1H8K A; 1PHT A; 2EW3 A; 5ECA A; 4GBQ A; 2KRN A; 4RTX A; 2L3P A; 4CC7 A; 1VYU A; 2ED1 A; 2PTK A; 1FMK A; 1NG2 A; 2YUQ A; 2FRY A; 1AVZ C; 1T3S A; 2A37 A; 2GGR A; 4OMQ A; 1IO6 A; 1ZSG A; 1PNJ A; 1SRM A; 1UJ0 A; 1PRM C; 3VRZ A; 4KRT A; 2LJ1 A; 1QKW A; 2LX7 A; 2X3X D; 4EIK A; 1BB9 A; 2ABL A; 1T0J A; 4AG2 C; 2EYX A; 2MCN A; 2J06 A; 4D8D A; 4OMP A; 1AWO A; 4OML A; 2HDA A; 4JJB A; 2X3W D; 1GBQ A; 1PRL C; 4JPB W; 1U5S A; 2EYY A; 2RQV A; 2EVR A; 2EKH A; 1VYV A; 4AFQ C; 2FPD A; 1NYG A; 3FJ5 A; 3H41 A; 5EC7 A; 2DJQ A; 2DL7 A; 2V1R A; 3EG1 A; 2VKN A; 1CSK A; 5I22 A; 3VS3 A; 1KIK A; 4ORZ A; 1X2K A; 1ABQ A; 1NEB A; 1CKA A; 2D0N A; 1WA7 A; 3RBB B; 1OV3 A; 3CQT A; 4J9G A; 2KT1 A; 4LN2 A; 2LJ0 A; 4J9B A; 2GNC A; 2VVK A; 1YWO A; 1GBR A; 2AKL A; 1W70 A; 1X43 A; 2DL4 A; 2EQI A; 2W0Z A; 1K0S A; 1YCS B; 3VS7 A; 1UJY A; 3EHQ A; 3U23 A; 4OMN A; 3VS5 A; 1U06 A; 1U3O A; 2DBM A; 4D8K A; 4QT7 A; 2KBT A; 2MOX A; 3H0F A; 1WDX A; 2F2V A; 1E6H A; 3I5R A; 2OI3 A; 4A63 B; 2D1X A; 2HEQ A; 4E6R A; 1GL5 A; 1I0C A; 2JT4 A; 1JXM A; 2JS2 A; 1MV0 B; 3PE0 A; 1GCP A; 4GLM A; 1V1C A; 2JM9 A; 4CC4 B; 2CUB A; 2EYW A; 2CT4 A; 2KT8 A; 4IIO A; 2DLP A; 3REB B; 5IXB A; 2CDT A; 1UTI A; 2MIO A; 3ULR B; 1UG1 A; 1I07 A; 4Z88 A; 3QWY A; 2EPD A; 2OAW A; 5IHI A; 2F2X A; 2GBQ A; 1K1Z A; 2KXD A; 3VRY A; 2BZ8 A; 5FW9 A; 1RLQ C; 3I9Q A; 2YUO A; 1YN8 A; 2K2M A; 1WI7 A; 3NGP A; 1LCK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1G5V A; 3M55 A; 1MMD A; 1VUB A; 4JLI A; 4OB2 B; 3M0P A; 4IUV A; 2CZ1 B; 3EGU A; 3UDC A; 2KYB A; 2XMF A; 2EIF A; 2AZS A; 5CKD A; 2BIV A; 1X2Q A; 2DIL A; 3R6O A; 1YJN T; 3FJP A; 3CCR T; 1RAD B; 2LCS A; 2RPN A; 1BCO A; 4E7Z A; 1Y0M A; 1ZUU A; 3H0I A; 4B9W A; 2EAY A; 2RQT A; 4C8Q A; 3A1P A; 5AYF A; 2L3R A; 4IUQ A; 1IXD A; 2K7A A; 4X34 A; 2PVO B; 4HVU A; 4FSS A; 2QA4 Q; 5GMK j; 1QLY A; 1WX6 A; 4A4K A; 4CC3 A; 4NOY A; 1K0X A; 2HL3 A; 1WXU A; 2RD1 A; 4BI8 B; 5GAO r; 2J6O A; 1W6X A; 2A28 A; 4X1V A; 2KGT A; 4C8Q B; 3GNG A; 2QXF A; 3CXC P; 3HL8 A; 3LWH A; 1BYM A; 2B86 A; 3CCV A; 4C5I A; 2RJE A; 1AEY A; 2FRW A; 3CCS Q; 1KC8 U; 3TU4 K; 1D0X A; 2BTT A; 1EFN A; 1PCX A; 3JB9 H; 5GMK h; 2ENM A; 3CC4 Q; 1W1F A; 2ED0 A; 4C5E A; 1KHI A; 3EH1 A; 3EG3 A; 5GAM e; 1VQ9 A; 3E1S A; 1VQ6 T; 1LJO A; 1D0Z A; 3G1J A; 4F7U B; 1JJ2 S; 2F5K A; 3SFM A; 1NJI C; 1WHM A; 3J80 E; 3RNJ A; 4Y92 A; 2PUO B; 3JCM J; 1PD1 A; 3MJX A; 1BU1 A; 1OU9 A; 3HRT A; 3PVQ A; 4NS5 A; 4XU0 A; 5HK0 A; 3SEM A; 3RMS A; 2CH4 A; 2RNA A; 3OYI A; 2CSQ A; 2DRM A; 2HL5 C; 2RN8 A; 3ZEH A; 4CC2 A; 3ZBD A; 1KJW A; 4KUI A; 2F2W A; 2C0I A; 2LMJ A; 3MP1 A; 4XU1 A; 4FM4 B; 3DLL A; 5GJV B; 1X27 A; 2AHJ B; 2QTX A; 4BAC A; 5LL6 S; 2RHU A; 3EFS A; 3A8L B; 4GLK A; 2ZGW A; 2COY A; 2CSI A; 2M16 A; 2KRS A; 1JEG A; 1QVG S; 3HHT B; 5DY9 A; 3C12 A; 3MHX A; 3C95 A; 4M75 F; 8AT1 B; 3PIO A; 3NPF A; 5J3B A; 3OQ5 A; 4J9H A; 3X24 B; 3OA6 A; 4IUR A; 5I11 A; 2E5Q A; 1IB8 A; 4KGV B; 3NTI A; 2MWP A; 3MP8 A; 2XK0 A; 1TU0 B; 3M56 A; 3MEA A; 3P8D A; 3CCE Q; 4JRK A; 1N5Z A; 1NEG A; 2L0A A; 3OBY A; 3HSB A; 1YCY A; 4DBR A; 2QAZ A; 1O9S A; 2DEU A; 4M7D F; 2YSQ A; 3CCM Q; 3Q1J A; 2YT6 A; 2K4Y A; 1BK2 A; 1B3Q A; 3MEV A; 2JTM A; 1W2B P; 3BDL A; 1ZA2 B; 4F16 A; 3UA6 A; 1ZX6 A; 2VGN A; 4N0A C; 1WLP B; 2NLU A; 1EIF A; 1NBE B; 4ME7 A; 1RI0 A; 2DMO A; 5GAO p; 4XQ3 A; 1Y71 A; 2EGE A; 3RKY A; 4XTU A; 4QQG A; 1AWX A; 1VQ5 Q; 2RQU A; 4ZN1 A; 3JCM c; 1M2O A; 3LX7 A; 3VU3 C; 3WVD B; 3M58 A; 4MZT A; 1PC0 A; 4J9I A; 4M7A C; 2VXE A; 2QDY B; 4OMF B; 2R58 A; 2KMT A; 5IHK A; 1YJ9 T; 2E5K A; 3HPW A; 2J05 A; 2CRE A; 3MCA B; 4D6W A; 3CD6 A; 4N0A A; 4OMO A; 3PIP A; 2LP5 A; 2HAX A; 4PJO A; 4M77 A; 1M3B A; 2F1L A; 2HMA A; 3TSW A; 1ZQ1 A; 3MEW A; 2HSP A; 4BD3 A; 1HSQ A; 3L2U A; 1YJW T; 4ELZ C; 4FT4 A; 4Z89 A; 1E6G A; 1HXD A; 3FLG A; 1BI1 A; 1KC8 C; 1TUC A; 2BZY A; 3QUI A; 1M3A A; 1VQN A; 1SPK A; 3SWN C; 4PJO B; 4ZTF A; 5KE2 A; 2XD0 A; 1QWF A; 4M77 D; 2P4R A; 4J9E A; 3CXC S; 3UWN A; 1Q82 C; 4M78 C; 4DBH A; 1QCO A; 1BI2 A; 4X9D A; 2DTH A; 4X9C A; 4IUP A; 2XHC A; 2COZ A; 1JQQ A; 2XKO C; 1WI7 A; 3CCQ Q; 2HKN A; 5GAN 8; 4M7A B; 3LGL A; 5CO7 A; 1BKB A; 2FPF A; 4DBF A; 4LD9 K; 1WXB A; 2XU8 A; 2C0T A; 1K73 U; 1YHQ Q; 3QO3 A; 2RQW A; 1JRI A; 2FL7 A; 3TEE A; 3M57 A; 1YNZ A; 2ROL A; 4Z8A A; 3SWN A; 5FWB A; 1KHC A; 2EW3 A; 4M75 E; 3G4S Q; 5ECA A; 2KRN A; 4C92 C; 4RTX A; 4CC7 A; 2ED1 A; 3G71 Q; 1VQ8 A; 4XU3 A; 3CC2 Q; 2QEX Q; 1NG2 A; 5GAO m; 1AVZ C; 2A0F B; 1HYO A; 5CKF A; 4PKC C; 3SWN B; 1VQ4 T; 8ATC B; 3OYJ A; 2CS7 A; 3QYH B; 2LX7 A; 3CCL T; 1SKU B; 4OGC A; 4M7D E; 2MCN A; 4M78 B; 4NL3 A; 2J06 A; 2EQM A; 2YLB A; 4D8D A; 2LT4 A; 1D1C A; 3EFR A; 4QQ6 A; 3M5A A; 4BDZ A; 4J6Y A; 2O4X A; 3CPF A; 1U5S A; 2MAM A; 2EYY A; 3KXT A; 4FW1 A; 5CR2 A; 1TS9 A; 2EKH A; 4BE0 A; 2A7Y A; 2FZK B; 1NYG A; 1LNX A; 1Q86 R; 4CRI A; 2DL7 A; 4JJN K; 1OZ2 A; 3L2R A; 3EG1 A; 2VKN A; 3MEU A; 4RCB A; 1VQ6 A; 1RAA B; 2DXC A; 1NEB A; 3RBB B; 3X25 B; 3CCU A; 3S3O A; 4J9G A; 1X6O A; 5D6W A; 3A8M B; 3LLR A; 2KT1 A; 1M5Q 1; 2ZZD A; 4JRQ A; 3AHU A; 3FIF A; 1W70 A; 1X43 A; 3JCM g; 1ZSZ C; 1BI3 A; 1XQH A; 2QQB A; 3V8L A; 1Q81 C; 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2DL3 A; 3OYF A; 3CCS T; 2OTL A; 4O6J A; 2C0O A; 4E7L A; 4EMG A; 1UHC A; 2KYM A; 3CC4 T; 1UGP B; 1RUW A; 2FPE A; 2R5M A; 4RTZ A; 1Z9Q A; 5CCA A; 2E10 A; 1HJD A; 1HD3 A; 1WPY A; 1WNL A; 4IKF A; 2KI7 A; 1NJI R; 1NZ9 A; 4A54 A; 1VYT A; 3EG0 A; 1Y96 B; 5GAN f; 2RHZ A; 4MDW A; 1W4S A; 2QYZ A; 5A0G A; 3M0U A; 4ANJ A; 1R0B G; 4HT8 A; 1IRE B; 2LQW A; 2ZAE A; 2DIG A; 1RAF B; 1GCQ A; 3JCM P; 2CKK A; 2KNB B; 4HKE A; 2DXT A; 4JJC A; 2MI6 A; 4C92 F; 5GMK i; 1VQ9 Q; 3E9F A; 1IHW A; 1LOJ A; 3CBO A; 2YRC A; 4E2F B; 3FDR A; 1GRI A; 2EQJ A; 3GIB A; 4A4F A; 1BIB A; 1UDL A; 4ELY C; 3CMA Q; 1PD0 A; 4C8Q C; 4M75 D; 4FW2 A; 3UPU A; 2K79 A; 3H0H A; 2EYQ A; 2DKG A; 1ABO A; 1WHJ A; 3TVT A; 1WIE A; 1VQO Q; 4LDY A; 1M90 C; 4R0K A; 2CH4 W; 1V29 B; 3QXE B; 1G2B A; 4J6X A; 2ZPH B; 3JB9 F; 3L2Q A; 4P5N A; 3CCE T; 1VQ4 A; 2M1H A; 1ZUY A; 4M7D D; 2QAS A; 3NMZ C; 2ZPB B; 3UA7 A; 3CCL A; 1V76 A; 2G6F X; 1QP3 A; 1RLP C; 4RTW A; 5DM7 R; 3CCM T; 1X69 A; 3RUX A; 3R6N A; 4JZ4 A; 2HQX A; 2A36 A; 4KH1 B; 2ZPF B; 1GXI E; 3THK A; 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