The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
NSQLVVRAKFNFQQTNEDELSFSKGDVIHVTRVEEGGWWEGTHNGRTGWFPSNYVREIKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| source organism |
Rattus norvegicus
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| publication title |
Cbl promotes clustering of endocytic adaptor proteins.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Rho guanine nucleotide exchange factor 7
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| total genus |
11
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-08-03 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NYG A; 2EYW A; 4JJD A; 2BZ8 A; 4J9H A; 1GCQ C; 2KXD A; 1WXB A; 1CKB A; 1PRM C; 1M27 C; 1HSQ A; 1K76 A; 1FYN A; 1UG1 A; 2MIO A; 1K0S A; 3EG2 A; 1Z9Z A; 1BU1 A; 1GCP A; 1UGV A; 1AD5 A; 1PKS A; 3EHR A; 1CSK A; 1IO6 A; 1AWO A; 3M0P A; 3TVT A; 1Z9Q A; 1UJY A; 2EBP A; 1GBQ A; 1NLP C; 1UE9 A; 1XOV A; 2E5K A; 2FRY A; 2CSQ A; 3VS6 A; 2I0N A; 2DNU A; 2RQU A; 1S1N A; 2AK5 A; 3U23 A; 4J9D A; 2JT4 A; 4RTV A; 3VS2 A; 1UFF A; 2KRO A; 3PVQ A; 2JM9 A; 3KFV A; 4GLM A; 4D8D A; 4FSS A; 4J9G A; 1Y57 A; 1WDX A; 3EGU A; 1WXT A; 1QKW A; 1W6X A; 3NHN A; 4WCI A; 2EYZ A; 4F17 A; 1ZUU A; 3M0U A; 2RQT A; 1AWJ A; 2KT8 A; 3LH5 A; 2ENM A; 2GTO A; 3CQT A; 2O9S A; 2B86 A; 2D8J A; 2LCS A; 4JZ3 A; 1T3L A; 2FRW A; 5HCK A; 2LNH B; 1WIE A; 2J6F A; 3VS3 A; 4OMP A; 2RQV A; 2KBT A; 4AFS C; 4J9B A; 3UA7 A; 2V1Q A; 1GFC A; 1I1J A; 3EG3 A; 1KJW A; 2HSP A; 2KNB B; 4CC2 A; 3H0I A; 2CSI A; 1U06 A; 4LNP A; 3ULR B; 2CH4 A; 1BBZ A; 1W1F A; 4CC7 A; 2A08 A; 2EYX A; 3JV3 A; 1ZX6 A; 4OMM A; 2L3S A; 1MV0 B; 1AZG B; 1U3O A; 1JQQ A; 3EHQ A; 2DRM A; 2FG0 A; 1WFW A; 1EFN A; 2JMA A; 3M0T A; 2EVR A; 2A37 A; 1X2K A; 1I0C A; 2KEA A; 2O88 A; 3C0C A; 1VYU A; 1JU5 C; 1WA7 A; 1RUW A; 2OI3 A; 2VWF A; 3PE0 A; 1BB9 A; 1BK2 A; 2VVK A; 1X69 A; 3REA B; 1UUE A; 1T0H A; 4OMO A; 4DEX A; 1UTI A; 2DYB A; 2LZ6 B; 1K0X A; 4RTW A; 3VS7 A; 3ZL7 C; 2EGE A; 3M0S A; 2AZS A; 2EYY A; 1GL5 A; 4JJC A; 2FPE A; 2P4R A; 2YSQ A; 2LJ0 A; 4J9C A; 2DL4 A; 3A98 A; 1OOT A; 2FPD A; 4ZNX A; 2JS2 A; 2DE0 X; 2QDL A; 1QWE A; 2LMJ A; 4HCK A; 1ZBJ A; 2RF0 A; 2JMC A; 3NMZ C; 2L3P A; 2DMO A; 2EGA A; 2FEI A; 1SRM A; 1VA7 A; 4RTT A; 2O2O A; 1I07 A; 2IIM A; 1SRL A; 4K11 A; 4Z89 A; 2GGR A; 1A0N B; 2GTJ A; 2YUP A; 2PZ1 A; 5EC7 A; 2J7I A; 2DBM A; 2K6D A; 4RTU A; 1RI9 A; 2C0T A; 4X1V A; 3SEM A; 2RQR A; 4Y92 A; 1K1Z A; 1ARK A; 2YT6 A; 5FWB A; 2NUZ A; 3I5S A; 1M3A A; 1JO8 A; 1NLO C; 4Z88 A; 4KRT A; 2DA9 A; 2CUD A; 2LQN A; 2XMF A; 2KT1 A; 2JW4 A; 2DLP A; 2HBW A; 1X6B A; 5IHN A; 1QCF A; 1LCK A; 1SHG A; 1GFD A; 3REB B; 2LJ1 A; 4F16 A; 5FW9 A; 3I9Q A; 4D8K A; 2KXC A; 1E6H A; 3IQL A; 2NWM A; 2KE9 A; 3VS1 A; 2BZX A; 2SEM A; 2KR3 A; 1NEB A; 1GCQ A; 2HCK A; 2ROL A; 2ABL A; 1YWP A; 2JTE A; 2HDA A; 1OPK A; 1PWT A; 4AG2 C; 2CRE A; 1X27 A; 1NG2 A; 2DF6 A; 2YDL A; 1JEG A; 2O9V A; 1JXM A; 3RBB B; 2KYM A; 2EKH A; 4RTZ A; 1UHF A; 2EQI A; 1SPK A; 2K7A A; 2JXB A; 2KRN A; 1ABO A; 1VYT A; 4EIK A; 1HJD A; 4RTY A; 4ORZ A; 1TG0 A; 2EW3 A; 2ED0 A; 2PTK A; 4J9F A; 1NYF A; 1SHF A; 2L0A A; 2J6K A; 1H3H A; 1PRL C; 5L23 A; 2DBK A; 4LUE A; 3THK A; 1VYV A; 2K3B A; 2DIL A; 1TUD A; 3GBQ A; 4AFZ C; 2MOX A; 2EGC A; 4F14 A; 2A28 A; 1AVZ C; 4GBQ A; 3M0Q A; 1QLY A; 4AFU C; 2DL8 A; 3SHW A; 2CH4 W; 2J06 A; 4LUD A; 2A36 A; 2VKN A; 4J9E A; 2AZV A; 3UF4 A; 2GQI A; 3VS5 A; 4E6R A; 1YCS B; 4CC3 A; 1WYX A; 4A63 B; 2AKK A; 4AG1 C; 2DJQ A; 5FWC A; 5IHI A; 2DRK A; 2DL7 A; 3UAT A; 4M4Z A; 2X3X D; 1FMK A; 1AWX A; 2CDT A; 5IXF A; 4R0K A; 4OML A; 1WI7 A; 1PNJ A; 1UEC A; 2OAW A; 2K2M A; 2LX7 A; 1UHC A; 3H0F A; 3O5Z A; 4J9I A; 1TUC A; 3NGP A; 2D8H A; 1WLP B; 2ED1 A; 2BZY A; 2ESW A; 1M8M A; 1SEM A; 5IXB A; 1ZSG A; 2RMO A; 2LQW A; 2CT3 A; 1G83 A; 1X2Q A; 1M3C A; 2X3W D; 3VRZ A; 2BTT A; 2YUN A; 2J05 A; 4JPB W; 1KSW A; 1E7O A; 2K79 A; 1HD3 A; 2KRS A; 4HXJ A; 2CUB A; 5I22 A; 3M0R A; 2D1X A; 1E6G A; 1N5Z A; 1CKA A; 3VRY A; 2RQW A; 1V1C A; 4HVW A; 2RPN A; 3EG0 A; 1YN8 A; 2KGT A; 2HEQ A; 3I5R A; 4RTX A; 1MUZ A; 1YWO A; 2K9G A; 2DL5 A; 1PKT A; 2M51 A; 2RNA A; 3TSZ A; 1MV3 A; 2GNC A; 3VS4 A; 1QKX A; 3I35 A; 1X6G A; 1NM7 A; 1KFZ A; 2FO0 A; 2YUO A; 1WXU A; 4Z8A A; 2KRM A; 2ECZ A; 1K9A A; 3H0H A; 5GJW B; 1AZE A; 2CT4 A; 2ROT A; 2F2X A; 4DEY A; 2C0I A; 1WX6 A; 3EG1 A; 5IHK A; 2L2P A; 5GJV B; 2LP5 A; 3UA6 A; 1ABQ A; 1YNZ A; 2D0N A; 1OEB A; 1M30 A; 5I11 A; 1H8K A; 1NEG A; 2C0O A; 2DL3 A; 2O31 A; 1B07 A; 1B3Q A; 3PVL A; 1U5S A; 1ZUY A; 1T3S A; 4AFQ C; 2J6O A; 1X43 A; 1W70 A; 4QT7 A; 1GRI A; 2DM1 A; 1OV3 A; 2FPF A; 4JJB A; 1JXO A; 1ZLM A; 1H92 A; 1G2B A; 2G6F X; 3QWY A; 2DX1 A; 4RUG A; 3H41 A; 1ZUK A; 4ESR A; 1RLP C; 1UDL A; 2F2V A; 2OJ2 A; 3VS0 A; 3FJ5 A; 1J3T A; 4JZ4 A; 1Y0M A; 1YP5 A; 4LN2 A; 1UJ0 A; 2AKL A; 4HVU A; 4OMN A; 2W10 A; 2M0Y A; 2L3Q A; 3TSW A; 5ECA A; 1AEY A; 3RNJ A; 3NPF A; 2V1R A; 2LJ3 A; 4IIM A; 2YUQ A; 2MCN A; 4LE9 A; 1T0J A; 2RN8 A; 1QWF A; 2SRC A; 1PHT A; 2EPD A; 1SSH A; 2JM8 A; 3QWX X; 2W0Z A; 5IH2 A; 1OPL A; 2DVJ A; 3R6N A; 2KYB A; 1K4U S; 4HVV A; 1KIK A; 4OMQ A; 2H8H A; 1AWW A; 4IIO A; 1AOJ A; 2GBQ A; 2F2W A; 1M3B A; 2JS0 A; 2PNI A; 4CC4 B; 1GBR A; 1RLQ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QQS A; 2BZ8 A; 5LJ3 g; 5C6S A; 4M7D D; 4GLK A; 1N9R A; 1LPL A; 1HSQ A; 2VXE A; 1K76 A; 2XD0 A; 1UG1 A; 2CS7 A; 3G1J A; 1BU1 A; 4XTZ A; 3T9N A; 1PKS A; 4XTW A; 1CSK A; 3MEV A; 1UJY A; 4EPC A; 1XOV A; 4M7A G; 3VS6 A; 4CI0 C; 1S1N A; 2V8K A; 4Z02 A; 3MEW A; 2RJF A; 2JT4 A; 3PVQ A; 3OYG A; 5KCO A; 4BI4 A; 5GAN 5; 3EGU A; 1TTH B; 5GAN 3; 3MP1 A; 4WCI A; 4C92 B; 4F17 A; 3M0U A; 2RQT A; 3LH5 A; 1D0Z A; 1PD0 A; 4XU2 A; 2MYS A; 3CQT A; 4HCZ A; 5GAO m; 1PG5 B; 2FRW A; 2LNH B; 1WIE A; 2YRC A; 2J6F A; 3M53 A; 1C1A A; 1VQM T; 4OMP A; 4ANJ A; 2DYI A; 3TEE A; 2COW A; 1WJR A; 3M57 A; 1YIT A; 1QMC A; 2JZ2 A; 5GAM e; 4M78 C; 1VQ8 A; 2E6Z A; 4CC2 A; 4PLI A; 4XTX A; 1QQJ A; 1VQK A; 1QVF A; 3HTR A; 4IUT A; 3ULR B; 3HPW A; 3MEA A; 2PVG B; 2WSC E; 1ZX6 A; 4FCY A; 5CQX A; 1RAC B; 1AZG B; 4N4G A; 5HY6 A; 1U3O A; 1DJ7 B; 3VUB A; 2PUO B; 2XDD A; 1Y07 A; 4E7Z A; 3M4Y A; 2FG0 A; 3CC4 A; 3G71 A; 1RI0 A; 4J6W A; 4PJO F; 2O88 A; 4KUL A; 3CBO A; 4MZP A; 4E47 A; 1OI1 A; 4ZGE B; 2OI3 A; 2VWF A; 3UPU A; 4M7A A; 5D6X A; 1BB9 A; 1BK2 A; 1X69 A; 1YBY A; 1VIF A; 4MDX A; 1T0H A; 3RKW A; 4EMG A; 2DYB A; 5KH6 A; 3QZ9 B; 4AT1 B; 1MNE A; 4C92 F; 4M7A E; 2XKO C; 2EGE A; 1IXD A; 3A98 A; 2M1H A; 2FPD A; 2QDL A; 4PFP A; 1IRE B; 2DZC A; 4HCK A; 1RAA B; 4J8O A; 5AT1 B; 1M9S A; 2QA4 Q; 4X9D A; 1AT1 B; 1Q7Y U; 2O2O A; 1K73 U; 1SRL A; 1B34 A; 4PFZ A; 2X4X A; 3H8Z A; 4JRI A; 5DLQ E; 3P8D A; 1VQM A; 4XU1 A; 2GGR A; 1PD1 A; 4EMK A; 2YUP A; 5EC7 A; 2R5A A; 1MND A; 3JB9 D; 3ER0 A; 3CCL A; 2NUT B; 3JCM c; 2K5L A; 1P92 A; 1RI9 A; 4OGE A; 1QVF P; 4PK4 A; 4Y92 A; 2DD5 A; 4FYY B; 2YT6 A; 4MMK A; 2NUZ A; 5CKF A; 1NZ9 A; 1JO8 A; 3HRU A; 2DA9 A; 4OGC A; 2LQN A; 3OYH A; 3CXC S; 4M78 G; 2XMF A; 3CBP A; 1QCF A; 3EFS A; 2CZ6 B; 3QSU A; 2QK0 A; 2MWO A; 3I9Q A; 2QQR A; 3EGD A; 4XU0 A; 4RMO A; 2LVM A; 4II1 A; 1N8R R; 1NEB A; 3OYB A; 2HCK A; 2ROL A; 1TWB A; 1D1B A; 4AG2 C; 2CRE A; 5FU7 B; 1NG2 A; 4E7I A; 4PJN A; 1LNX A; 1ZSZ C; 2K2V A; 2DXB A; 1JXM A; 1K8A U; 2KYM A; 5IAY A; 4PKC C; 3MP6 A; 4OB0 B; 2FL7 A; 4RCC A; 2K7A A; 4M7D B; 5GAO p; 1Q86 C; 4EIK A; 3SWN C; 8AT1 B; 1Q82 R; 2PTK A; 3CC7 Q; 2VUB A; 1K9M C; 2A7Y A; 1BI0 A; 1PRL C; 5L23 A; 1V76 A; 3THK A; 4C0Z A; 5CK9 A; 1B7T A; 2K3B A; 4FW1 A; 3KBG A; 5GAM d; 3E9G A; 2A28 A; 2ZPI B; 3QII A; 4LXC A; 1QLY A; 2DL8 A; 1FMV A; 2E65 A; 1XNI A; 3CCR Q; 4BUG A; 2CH4 W; 1QVF S; 4FM4 B; 4M78 A; 4LUD A; 2FVU A; 1D3B B; 2VKN A; 4J9E A; 3OYN A; 3M5A A; 2LCC A; 3UF4 A; 2GQI A; 4BI3 A; 4CC3 A; 1UGQ B; 1BIB A; 5LJ5 j; 4A63 B; 2XK0 A; 5GAM f; 3OBW A; 2ATC B; 2DRK A; 3UAT A; 2RHY A; 2LNV A; 1RL2 A; 2X3X D; 1FMK A; 1VQ4 Q; 5FLX E; 2VAS A; 3FJP A; 1PM3 A; 1WI7 A; 1YJ9 Q; 4LDV A; 2EQM A; 1OU9 A; 2IG0 A; 2QA4 T; 2OAW A; 4FW2 A; 3CCV Q; 2EYQ A; 3H0F A; 3FB9 A; 4J9I A; 1M1K C; 2OTJ Q; 2QQB A; 5KYX B; 1WLP B; 1SEM A; 5IXB A; 3GIB A; 2DVE A; 4M7D F; 2Y4Y A; 2BIV A; 1G83 A; 3JCM P; 4LDY A; 3VRZ A; 5A0D A; 5L8R E; 3RKY A; 1BI3 A; 1KSW A; 1E7O A; 1X01 A; 2CUB A; 5I22 A; 1CKA A; 3VRY A; 4EDU A; 2H3E B; 4JS5 A; 2CP0 A; 3EG0 A; 4M77 D; 2HEQ A; 2KGT A; 3I5R A; 2F5K A; 3WVD B; 2RNA A; 3CBM A; 1PCX A; 3TSZ A; 4L59 A; 3LLR A; 4TVR A; 1NM7 A; 1W2B A; 1WXU A; 4Z8A A; 2KRM A; 3H0H A; 2COZ A; 5GJW B; 1AZE A; 4M77 E; 2F2X A; 3GF5 A; 4KGX B; 4DOV A; 4A4K A; 3EG1 A; 3FDR A; 3H9N A; 5GAN g; 2GFU A; 3GLX A; 2B8A A; 1VQN A; 1HK9 A; 2FZG B; 3LYI A; 2X51 A; 5I11 A; 2C0O A; 1JB0 E; 4O5V A; 2QAZ A; 1KHC A; 2DL3 A; 2DAQ A; 2ZGW A; 3CC7 T; 4AFQ C; 3OS1 A; 5IT9 E; 4QVC A; 4OB2 B; 1QW1 A; 3OB9 A; 3Q1J A; 4PJO D; 2DM1 A; 1M2V A; 2QA4 A; 4JJB A; 1ZLM A; 4J5Y A; 1OX9 A; 2EIF A; 5C0M A; 4KT0 E; 1G3T A; 1WJS A; 2DX1 A; 4C0D C; 1BI2 A; 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3RR6 A; 2OAU A; 2DK3 A; 3J80 E; 2MF2 A; 2JVV A; 2VB6 A; 2RQV A; 5CIU A; 2DKG A; 3CCL Q; 1Q86 U; 1KJW A; 2KNB B; 3H0I A; 2CSI A; 2XI9 A; 1U06 A; 2EJF A; 4LNP A; 1K9M U; 1MMA A; 5LJ5 e; 1YI2 A; 4CC7 A; 2A08 A; 2EYX A; 1EZZ B; 4OMM A; 2L3S A; 1MV0 B; 2CYZ B; 2CZ7 B; 1VQ4 A; 4OMF B; 4C8Q D; 4CRI A; 1YJ9 A; 1W2B S; 2L89 A; 2MK5 A; 3CCV A; 3H6Z A; 1YIJ A; 5CKH A; 3VKI A; 2NUP B; 1WFW A; 3X25 B; 1EFN A; 2JMA A; 3M0T A; 2EVR A; 2A37 A; 1X2K A; 3C0C A; 1JU5 C; 1WA7 A; 4M77 B; 3HSB A; 2GCX A; 1YIT T; 3EG9 A; 4JLG A; 3REA B; 2Z0W A; 3OYJ A; 3E19 A; 1VQ8 T; 4E7S A; 4C8Q E; 4OMO A; 3JCM Q; 4DEX A; 3CMA A; 1UTI A; 3S6W A; 4BY6 B; 1TOV A; 4Q5W A; 3F70 A; 5I2S A; 2CKK A; 3QYG B; 1X6O A; 2AZS A; 2OTL A; 1I81 A; 3CME A; 2FPE A; 2P4R A; 3OW2 S; 1D0Y A; 2CP5 A; 3CD6 A; 2RHX A; 1OOT A; 4BDY A; 4ZNX A; 2JS2 A; 2DE0 X; 3CC4 T; 4OVA A; 2LMJ A; 2EFI A; 2D9T A; 2RF0 A; 5HK3 A; 4C5E A; 1VQO T; 1G3S A; 1M2O A; 2RJD A; 2R58 A; 3ZFJ A; 4A4G A; 2CP7 A; 2DMO A; 2G3R A; 1D09 B; 4DOW A; 2X4Y A; 1VA7 A; 1VQ6 T; 4MZT A; 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