The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
72
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structure length |
72
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Chain Sequence |
PLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Key interaction modes of dynamic +TIP networks.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Microtubule-associated protein RP/EB family member 1
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| total genus |
14
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| structure length |
72
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| sequence length |
72
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-07-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF01302 | CAP_GLY | CAP-Gly domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | CAP Gly-rich-like domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CP3 A; 1TXQ A; 2E3H A; 1LPL A; 2E3I A; 1WHK A; 3E2U A; 2CP7 A; 1WHJ A; 2HL5 C; 1IXD A; 2COY A; 2CP5 A; 1WHL A; 1WHG A; 2CP2 A; 2MPX C; 1WHH A; 2HKN A; 2CP6 A; 2HKQ B; 2CP0 A; 2HQH A; 1TOV A; 2Z0W A; 2HL3 A; 4B6M A; 2COZ A; 2M02 A; 3RDV A; 2COW A; 2E4H A; 3TQ7 P; 2QK0 A; 1WHM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RL2 A; 3JCM c; 1V76 A; 1KC8 R; 4HVU A; 2CSI A; 5ECA A; 1Q82 U; 2JMA A; 3V8L A; 1OZ3 A; 2DVE A; 2DIL A; 3GIB A; 1KQS A; 1PD1 A; 2NUT A; 1FMW A; 4HT8 A; 3CXC S; 1AD5 A; 4M4Z A; 5GMK l; 2K4Y A; 5C0M A; 1CKB A; 1K73 R; 4OGE A; 2KRN A; 2VWF A; 3CCU T; 1VQ6 A; 3CME T; 3LGL A; 1W2B P; 4PJL A; 3EFO A; 2RPN A; 4IIO A; 2EGA A; 1OU8 A; 1OX9 A; 4K11 A; 4PL6 A; 4BB7 A; 3QDF A; 2CP2 A; 3U23 A; 5LJ3 j; 3F70 A; 4CC2 A; 5KYX A; 4C8Q A; 5GMK i; 3MCA B; 4FYX B; 1K0S A; 3P8H A; 3I55 Q; 2A0F B; 4C92 C; 3DB3 A; 3PGG A; 1QCN A; 4PJO C; 2F2W A; 1OUL A; 4RTT A; 4R56 A; 3TSW A; 2VVK A; 1GBQ A; 4RTU A; 1VQ5 A; 3R6O A; 2RNA A; 3PMI A; 2OTJ T; 1YNZ A; 4ELZ C; 5J3B A; 3QXE B; 1X6B A; 1H92 A; 4IUQ A; 1OI1 A; 2YUQ A; 1AHJ B; 4LUD A; 1R0C B; 1HYO A; 2L8D A; 2EJG A; 3S3N A; 4BI4 A; 1ABO A; 2QAZ A; 3HRT A; 2VXF A; 2C0I A; 2LCS A; 3VKI A; 3VU3 C; 1PRM C; 1X27 A; 3MPU B; 3M9Q A; 2LCC A; 1IGU A; 1D1B A; 2A28 A; 1TUC A; 4C5H A; 5GAN 6; 2MOX A; 4Z8A A; 1BI2 A; 2GQI A; 2GCX A; 3M0S A; 4RMO A; 2H8H A; 2AIR B; 3SHW A; 3H8Z A; 3M56 A; 3E1S A; 1JJ2 A; 2VB6 A; 3PVL A; 2CZ0 B; 4RCC A; 2YLC A; 1K9A A; 1VQ6 Q; 3CCQ A; 3QBY A; 4HVW A; 1W70 A; 4XAX B; 1G8X A; 1GCQ A; 1V29 B; 3JCM J; 1QVG S; 2HEQ A; 3RER A; 2QQS A; 1RAF B; 2KRM A; 2E6Z A; 2EYQ A; 1WI7 A; 1N27 A; 3A8G B; 1MV0 B; 2EGE A; 2KSS A; 3M4Y A; 1Q95 G; 5FW9 A; 1U5S A; 1WHM A; 4IUV A; 4KUL A; 4PK4 A; 1PG5 B; 4FYW B; 4ORZ A; 5GAM f; 1NM7 A; 1UJ0 A; 3WVE B; 3EG2 A; 1OZ2 A; 1YJ9 A; 3FIF A; 1YI2 A; 3C0C A; 2JTF A; 2P0K A; 2LC4 A; 1QCO A; 1I07 A; 3CCJ A; 3OA6 A; 2HKN A; 3INZ A; 4M77 F; 4N4G A; 2XKO C; 2CDT A; 2HQH A; 3J81 E; 1QCF A; 1HXD A; 2LZ6 B; 1QP2 A; 2FZK B; 4ZGE B; 3CPW P; 1M1K U; 3OYN A; 4C5E A; 1QVF A; 1YIJ T; 1KD1 R; 3HTR A; 1IZ6 A; 1Y07 A; 1D3B B; 2DBK A; 2O9V A; 3FRN A; 4XTW A; 1M4Z A; 2LT1 A; 1Q7Y U; 3RBB B; 4RTV A; 1W2B S; 4XU0 A; 1NBE B; 2DYB A; 1BU1 A; 2RH2 A; 1VQN A; 2Y90 A; 5FRO A; 1PD0 A; 3G1J A; 2HD0 A; 2E10 A; 2G3R A; 4RG2 A; 3EG0 A; 1Y7X A; 1G3S A; 1PKS A; 2OTL T; 2GGR A; 5GAM d; 2K5I A; 3CMA T; 2RHI A; 4MML A; 1PWT A; 3C12 A; 1AVZ C; 1NJI C; 2WAC A; 1TOV A; 2DLP A; 3OSV A; 3VS2 A; 3UWN A; 3OS0 A; 3KUF A; 5GMK j; 5HKC A; 2E6N A; 1M2V A; 3WXM B; 3QG1 A; 4MZP A; 3GPL A; 2L3R A; 2DXT A; 5I11 A; 2AZS A; 1Y96 B; 1M8M A; 2L89 A; 1WHG A; 4LDU A; 4C8Q C; 3NGP A; 1NEG A; 3GP8 A; 1M90 R; 2K2M A; 1HD3 A; 4M7A B; 3FLG A; 3OYY A; 2CT4 A; 4C92 E; 3ULR B; 2QA4 A; 4OMO A; 2KDS A; 2HNI A; 2DXU A; 1WLP B; 1SHF A; 3BDU A; 4JZ4 A; 4NL3 A; 1LPL A; 1LJO A; 1FMV A; 1X2Q A; 1YJ9 Q; 4L59 A; 1MUZ A; 1YI2 Q; 3JCM X; 1YIT T; 1LOJ A; 1KJW A; 2ESW A; 1OV3 A; 1M8V A; 1ZHI A; 1ZLM A; 4M77 C; 4E7S A; 3X26 B; 3CCE A; 1XJW B; 2DD4 A; 2CSQ A; 2NUZ A; 1B34 B; 4KH0 B; 4ZN3 A; 2HSE B; 4EMK B; 1YWO A; 4RTX A; 1PKT A; 1R77 A; 2W0Z A; 2XDP A; 2ZPH B; 2LRQ A; 2MAM A; 7AT1 B; 2L3Q A; 4HCB A; 1SRL A; 1R0B G; 2J7I A; 3RKW A; 1YHQ A; 1WJQ A; 1WNL A; 4J9D A; 2QQB A; 1ZBX A; 1VQ8 A; 3DKM A; 4A53 A; 4IIM A; 2FEI A; 1VA7 A; 1K1Z A; 2C0T A; 1VQN Q; 3CCR A; 2E65 A; 2CP7 A; 5CVI A; 5EC7 A; 3C94 A; 1BI3 A; 2KBT A; 4A54 A; 2K79 A; 4BE0 A; 2LJ3 A; 2X51 A; 1QMC A; 2LX7 A; 1RAH B; 5L23 A; 2FZC B; 1WXT A; 2RJC A; 1H3Z A; 4HKE A; 4XU3 A; 1K9M R; 4F16 A; 3JCM P; 2YXY A; 3M0Q A; 1GCQ C; 1VQK T; 1KFZ A; 1W4S A; 1QVG A; 3OYA A; 2XHC A; 4F7U F; 4JDS A; 2V8K A; 4IKF A; 4M7A E; 4MDW A; 4E7K A; 1Q82 R; 1UB4 A; 1VYV A; 4QT7 A; 1N8R U; 2A08 A; 3ASK A; 1NG2 A; 4J8O A; 3CPW S; 4HXJ A; 5D7U A; 2DK3 A; 2LJ1 A; 3JB9 D; 3TSZ A; 1VQ4 T; 1KHI A; 1AOJ A; 4M7D B; 1NJI U; 1RI9 A; 3CC7 A; 5CKE A; 1WJS A; 3G71 A; 2P0Q A; 1SPK A; 1Q86 C; 1BI1 A; 1ZUY A; 1RAD B; 4KUI A; 2DPP B; 5CQY A; 4M78 B; 1UEB A; 2ZZD A; 5FU6 C; 4BAC A; 4XK8 E; 2XK0 A; 4J7F A; 3MEV A; 1YBY A; 3CXC P; 2ZPI B; 2JW4 A; 2K57 A; 4M75 B; 3TQ7 P; 1X75 C; 3CCM T; 4J6Y A; 1B7T A; 1WQW A; 2BE7 D; 2HBP A; 1KG1 A; 4PJM A; 3LWH A; 4M77 G; 3CCV T; 4PJO A; 1WX6 A; 3DLM A; 5D6X A; 2GTO A; 2DIQ A; 1XQH A; 2EKH A; 4EMG A; 1RLP C; 2YWW A; 1I8F A; 4A4K A; 1VQO A; 1MND A; 1VQL T; 2P4R A; 2D6F A; 4LE9 A; 5I22 A; 1W2B A; 1VQ8 Q; 2M02 A; 2LTO A; 3LH0 A; 1KIK A; 5CKH A; 1GBR A; 3O5Z A; 3LLR A; 1ZBJ A; 4OB0 B; 2RHZ A; 2L3P A; 2CUB A; 3CCR Q; 2KRS A; 2A37 A; 5CCA A; 1RAB B; 2FRY A; 1VQ9 T; 5KE3 A; 2FPD A; 2GBQ A; 2HBW A; 1SF9 A; 3ER0 A; 3L2V A; 2F2X A; 1ACM B; 2ZPB B; 2MIO A; 4OMQ A; 3I56 A; 3HKS A; 3OBW A; 1A0N B; 1RUW A; 3JB9 J; 3G4S A; 3CC2 T; 8ATC B; 2KQW A; 1IHW A; 1IRE B; 4HVV A; 2XG8 D; 1EFN A; 3JCM b; 5FLX E; 4C8Q E; 3CCS A; 1NYG A; 4JLG A; 4WCI A; 4ATO A; 4JRK A; 1D0Z A; 1S1N A; 3EH1 A; 4B6M A; 1BI0 A; 2VV5 A; 3X20 B; 5J39 A; 4Y91 A; 1M3A A; 4FIB A; 1YJW T; 2X35 A; 3AHU A; 2DEQ A; 3OMG A; 2EQU A; 4V2S A; 2J06 A; 2F69 A; 2QG9 B; 2EWN A; 4ZTF A; 3G71 Q; 2K3X A; 2X4J A; 1VOM A; 4KH1 B; 1M27 C; 3MP8 A; 1QQJ A; 2DD5 A; 2VC8 A; 3MKD A; 2RA2 A; 1U06 A; 2QDL A; 2D0Q B; 4A4E A; 2KT1 A; 5GAO m; 2JS0 A; 4XTU A; 1E6H A; 5LJ5 h; 1ZSG A; 3M0R A; 4E7L A; 3OYK A; 3FEO A; 3QHS A; 2VUB A; 1K8A C; 4CRI A; 3J80 E; 5GAN g; 1TS9 A; 4MZT A; 2KT8 A; 3A8O B; 2ZCF B; 2R58 A; 4O6J A; 3WVD B; 4M7D D; 2K9G A; 3BDL A; 1WPY A; 2CP0 A; 2YHT A; 2ZPF B; 1VQM Q; 4M78 D; 5FU7 C; 3CCU A; 4DA4 A; 3CME A; 1D1A A; 3HL8 A; 4LDV A; 2DO3 A; 2O4X A; 1YFN A; 5HCK A; 2K6D A; 2J6F A; 2LT4 A; 4M75 D; 3LX7 A; 5GAN 4; 1M1K R; 4OML A; 3TU4 K; 4ZTJ A; 2CP5 A; 3CC4 T; 3OYH A; 1BKB A; 2RK1 A; 1Y71 A; 2ABL A; 2LQN A; 3N5B B; 2Z0W A; 3QWY A; 2KMT A; 2YUO A; 1J3T A; 2RQT A; 1MV3 A; 1MNE A; 2PNI A; 1Q7Y R; 2HSP A; 2L0A A; 4OMN A; 4BY6 B; 4JS5 A; 3VRY A; 3I56 Q; 1M2V B; 2CKK A; 2LDM A; 1FMK A; 1UHF A; 1ZSZ B; 3G4S Q; 3G6E T; 1UTI A; 2D1X A; 4Y92 A; 4CI0 C; 5GAO p; 1TUD A; 2ECZ A; 1X43 A; 3A5Z B; 3I55 T; 2MMP A; 3SWN B; 3ZEH A; 3CCS Q; 1IHV A; 2H3J A; 4X9C A; 2CGH A; 2OTJ A; 4LDY A; 4PLI A; 3MEU A; 3QII A; 4J83 A; 1KHC A; 3CPW A; 1UDL A; 4F7U G; 3JCM V; 2G6F X; 4QW2 A; 1E7O A; 4D8K A; 2SEM A; 3JB9 F; 5CQX A; 3M55 A; 2QEX Q; 2D8H A; 5AT1 B; 3A8H B; 1RAA B; 2JS2 A; 1GFC A; 3UPU A; 1D09 B; 2LQW A; 1T0J A; 1VQ7 T; 3OYE A; 3MHX A; 5LJ5 e; 2LP5 A; 1ZA2 B; 1WHK A; 1QVP A; 4J9F A; 4DBF A; 1I81 A; 5GAM e; 4QQG A; 5IXB A; 4J9H A; 2K3Y A; 1RAE B; 2AKL A; 5KYW A; 4XTY A; 5LL6 S; 4C0Z A; 1Q81 R; 2W10 A; 2K5F A; 3EHR A; 1UGS B; 3GLX A; 4M77 A; 2FYK A; 4NL2 A; 2DEU A; 3CCU Q; 3CME Q; 3I5S A; 3NPF A; 2MWO A; 3V7S A; 1K4U S; 1KC8 C; 2YSQ A; 3Q1J A; 2KI7 A; 1RI0 A; 4ZN1 A; 3CPF A; 1KQ1 A; 1OX8 A; 2HQX A; 5GJW B; 1UEC A; 1KK7 A; 3KBG A; 4DBH A; 5HY6 A; 1K73 C; 3QJ6 A; 1OPL A; 1UFF A; 4E2F B; 4OMF B; 3RIR A; 4JJB A; 3OYJ A; 3GF5 A; 4QVZ A; 4X9D A; 2DXC A; 2P84 A; 1H8K A; 4FYY B; 5A0D A; 2E41 A; 4DEX A; 4HCZ A; 2OTJ Q; 2Y4Y A; 2KYM A; 2A7Y A; 3EGD A; 2H3E B; 4KBM B; 2O2O A; 3RMQ A; 2O01 E; 3FJP A; 4OB1 B; 4E7I A; 1YIJ A; 1T3L A; 1H64 1; 3MP6 A; 3SDZ A; 2YDL A; 4C0D C; 5CIU A; 5LJ3 h; 1QWF A; 2PTK A; 2JNG A; 2E4H A; 5LJ5 f; 1N8R R; 5CKD A; 2GFA A; 4C92 B; 1AWO A; 2VAS A; 4BUG A; 1SG5 A; 4PJO B; 2DX1 A; 2IIM A; 1JQQ A; 4C0F A; 5GAN j; 4AG1 C; 2XMF A; 2QGG A; 2OTL A; 1NE8 A; 5GAN 3; 2BZY A; 3CMA A; 1PSF A; 3E9F A; 1BYM A; 1UJY A; 2DJQ A; 4R55 A; 1VQ5 Q; 2DTI A; 3L2W A; 1P92 A; 3FJ5 A; 2QTX A; 4A4H A; 4M7D F; 2DNU A; 4LDX A; 2KXD A; 2DET A; 5KYU B; 1UGP B; 4OB2 B; 4LD6 A; 4M78 F; 2RB6 A; 2E5K A; 5IHK A; 2I2L A; 4Z89 A; 1UE9 A; 4M75 F; 1CSK A; 2V26 A; 3PE0 A; 2WSC E; 4FW1 A; 5GAM g; 2DXB A; 2JTM A; 4XTX A; 1LCK A; 2AZV A; 1WA7 A; 2YUP A; 4OP0 A; 1VIF A; 4LD9 K; 3OY9 A; 2F5K A; 1UGR B; 2DZ9 A; 2DBM A; 5LJ5 d; 2LMJ A; 1WFW A; 3NTI A; 2JM9 A; 1AEY A; 2EQJ A; 4KGX B; 1S72 T; 4DQ2 A; 2DRM A; 3MJX A; 2X9H A; 1YIT A; 3GNF B; 4BDZ A; 1VQP T; 1MMG A; 3CXC A; 3UA7 A; 3OYL A; 1KC8 U; 2EW3 A; 5DY9 A; 9ATC B; 5GAN 8; 3CCQ Q; 1M9S A; 5HK0 A; 2KE9 A; 2MI6 A; 4FT2 A; 3EG9 A; 3L2Q A; 5DM7 R; 2COY A; 2R57 A; 2YUN A; 2PZ1 A; 3QJY A; 1YIJ Q; 2XI9 A; 4F7U A; 3EGX A; 3QKJ A; 4OF1 A; 1NYF A; 2DL3 A; 3M0P A; 2GTJ A; 2JN0 A; 4KT0 E; 3C95 A; 1C6V X; 1HSQ A; 5LJ3 e; 3JB9 G; 4PJO E; 2BTT A; 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1VQ9 A; 1KQS S; 3HSB A; 3AT1 B; 3VUZ A; 3HPW A; 2OAW A; 4F17 A; 1FYN A; 2CS7 A; 1OEB A; 2KAF A; 2QTV A; 4M77 B; 1TU0 B; 1SHG A; 2AKK A; 3CCE Q; 2DIG A; 1YJN T; 3FB9 A; 2SRC A; 4X1V A; 3CC2 A; 1RAC B; 4M7A D; 1AZG B; 2MYS A; 2AHJ B; 3OYB A; 3H0H A; 5AYF A; 5GMK m; 2V8I A; 2DKG A; 4M7D G; 1QKW A; 1EIF A; 4E7Z A; 4DBQ A; 1YHQ Q; 2KK4 A; 2YRD A; 3JCM d; 1TTH B; 1MGQ A; 1Y0M A; 1IRX A; 4M78 G; 2LCL A; 3GBQ A; 5GAM j; 3OW2 P; 3MO8 A; 1YJW A; 5LJ3 d; 5FRN A; 5HK3 A; 4OVA A; 1K9M C; 2ED0 A; 2XIC A; 1ZX6 A; 1V1C A; 3BW1 A; 3LGF A; 4M75 G; 2VYT A; 4UC4 A; 1Z9Q A; 5D6Y A; 1YN8 A; 2E1H A; 4J9I A; 3SFM A; 3OYD A; 1Q82 C; 1BCM A; 4RTY A; 3I9Q A; 4LDW A; 1N6A A; 4E7H A; 3QYG B; 4A4F A; 1X69 A; 1AT1 B; 3RNJ A; 5DLO A; 1UGV A; 2KXC A; 3S3O A; 3CCM Q; 1U8R A; 2EJ9 A; 2YLB A; 5D6W A; 2HCK A; 5KYN A; 3OYM A; 2CP6 A; 3URG A; 2JJ9 A; 4FM4 B; 4HCC A; 1TG0 A; 1TWB A; 2E3H A; 1TUG B; 2E3I A; 1I1J A; 3UDC A; 2QDY B; 5FWB A; 3CC7 Q; 3QYH B; 4PFP A; 3CC4 A; 3CQT A; 1JJ2 S; 4M77 E; 1GRI A; 2RN8 A; 2DM1 A; 2ENM A; 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