The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
ASTQPTHSWKVGDKCMAVWSEDGQCYEAEIEEIDEENGTAAITFAGYGNAEVTPLLNLKPVEEG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SURVIVAL OF MOTOR NEURON-RELATED-SPLICING FACTOR 30
|
| publication title |
Structural Basis for Dimethyl-Arginine Recognition by the Tudor Domains of Human Smn and Spf30 Proteins
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Rna binding protein
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| total genus |
9
|
| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-10-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4C5H A; 2RI5 A; 2RJD A; 4FL6 A; 2R57 A; 1H3Z A; 5CIU A; 3S3O A; 4A4F A; 3UWN A; 3OQ5 A; 3FLG A; 3LLR A; 3P8H A; 1KHC A; 4BDZ A; 5M9O A; 4BDY A; 4IUV A; 2RHU A; 3OYD A; 3DB4 A; 4IUT A; 4PL6 A; 2RI2 A; 4HCZ A; 2FHD A; 4ZTF A; 1WJR A; 3MEW A; 2JTF A; 3FEO A; 4GY5 A; 3LGF A; 3MEU A; 3SD4 A; 3OS1 A; 4QW2 A; 4QQ6 A; 2RHY A; 3H6Z A; 1N27 A; 2LDM A; 2GF7 A; 2MWP A; 3ME9 A; 3DLM A; 5KCO A; 4CRI A; 3CEY A; 4L59 A; 2DIG A; 3FC3 A; 3L42 A; 3C4S A; 2LCC A; 5J26 A; 3S3M A; 3QBY A; 2O4X A; 2PQW A; 3MP1 A; 3QII A; 4BAC A; 4NS5 A; 2M1H A; 4A4E A; 3FDR A; 3S3N A; 3LGL A; 3MET A; 3MEA A; 2RO0 A; 2RHI A; 2K3Y A; 3L2U A; 3OYB A; 3NTK A; 3OYG A; 3MP8 A; 4N4G A; 4QVZ A; 4BE0 A; 4ZTJ A; 2O4X B; 3DB3 A; 3OA6 A; 2X35 A; 2RHX A; 4IKF A; 2K3X A; 1OZ3 A; 4E7J A; 5KCH A; 2L3R A; 3L2Q A; 3PMT A; 3OYJ A; 4UC4 A; 3NTI A; 5D6X A; 3OYN A; 5IN1 A; 2QQS A; 1OI1 A; 2X4W A; 3OYK A; 4A4G A; 2EQM A; 2HQX A; 2XDP A; 4IUQ A; 2EQU A; 2BKD N; 2WAC A; 2QQR A; 3Q1J A; 5FRN A; 4OVA A; 2L89 A; 3O8V A; 2DIQ A; 3OMG A; 3OYL A; 4EDU A; 3NTH A; 3EAE A; 3QJ6 A; 3OY9 A; 2CKK A; 3P8D A; 2RHZ A; 3MO8 A; 4E7I A; 3H8Z A; 3E9G A; 2F5K A; 4E7K A; 4II1 A; 3F70 A; 2X4Y A; 3L2R A; 2EFI A; 5FRO A; 3PMI A; 4E7H A; 3OB9 A; 3MP6 A; 2R58 A; 2LVM A; 1WJQ A; 3OYF A; 3MEV A; 3OYH A; 2LTO A; 3ASK A; 3LYI A; 4IUR A; 4QQG A; 4RG2 A; 3L2W A; 4X34 A; 2E6N A; 2GFU A; 5D6Y A; 4LD6 A; 2E5Q A; 4BD3 A; 5J39 A; 4QQD A; 3OS2 A; 2RJC A; 2GFA A; 2XK0 A; 3LX7 A; 4C5G A; 3OYA A; 2YRV A; 1WJS A; 3UT1 A; 4BE2 A; 1XNI A; 2MWO A; 1MHN A; 3OYC A; 1OYX A; 4PLI A; 3OYM A; 2X4X A; 3L2V A; 4IUU A; 2G3R A; 4N4H A; 3E9F A; 2R5M A; 2L8D A; 2BUD A; 2RJE A; 2JZ2 A; 3BDL A; 5D6W A; 4B9X A; 5KE3 A; 3OYE A; 2EQK A; 3OS0 A; 2IG0 A; 3M9Q A; 2RJF A; 3PFS A; 4B9W A; 3ZEH A; 3OMC A; 2EQJ A; 2VYT A; 1SSF A; 3QKJ A; 5FRM A; 3LH0 A; 2DAQ A; 1G5V A; 5C0M A; 4N4I A; 4BE1 A; 5KH6 A; 2HQE A; 4A4H A; 4C5I A; 4Q5W A; 4PLL A; 3PNW C; 4C5E A; 4E7L A; 3OYI A; 2P0K A; 4Z02 A; 2BIV A; 2M16 A; 5C6S A; 4FU6 A; 1WGS A; 2RI3 A; 3GOX A; 4IUP A; 5KE2 A; 2LRQ A; 1RI0 A; 2NLU A; 1OZ2 A; 3KUF A; 2EKO A; 2B8A A; 3S6W A; 2M0O A; 2R5A A; 2D9T A; 5IAY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1PRM C; 4M7D D; 1M3B A; 3I35 A; 4DQ2 A; 1TSF A; 3CC2 A; 3NFC A; 2ZPG B; 5GAN 2; 1U1T A; 3VUZ A; 3CCQ Q; 2WSC E; 1H8K A; 4J6X A; 4RTU A; 3SD4 A; 1RAC B; 3M57 A; 2RHY A; 4HVU A; 2XU8 A; 4MMK A; 1WHL A; 3HKS A; 1MUZ A; 4MZT A; 3EH2 A; 2QG9 B; 2DX1 A; 2LMJ A; 3MEA A; 2RHI A; 1VOM A; 4ZGJ B; 4QVZ A; 4JLI A; 2O4X B; 1ZA1 B; 4IKF A; 3WVE B; 3V8J A; 3SWN C; 2FPF A; 5D6X A; 1K8A R; 3HSB A; 5GAN 5; 2EQU A; 2FPD A; 2FEI A; 1BIB A; 2KRO A; 3I55 T; 3CC4 T; 5GMK h; 1RL2 A; 3LWH A; 3A8O B; 4JRI A; 3PMI A; 3VS4 A; 5GAN e; 3OB9 A; 1YFN A; 1WJQ A; 2OTL Q; 2K5F A; 4DOV A; 2EIF A; 5KYY B; 1YI2 Q; 1GBR A; 4XTY A; 3SDZ A; 1NYG A; 4X34 A; 5GJW B; 1I1J A; 3JV3 A; 2D0Q B; 2E5Q A; 3GNG A; 2DA9 A; 4QQD A; 4OGC A; 4ZGE B; 2GBQ A; 3BW1 A; 2DNU A; 1LNX A; 1YHQ A; 1WDX A; 3PVQ A; 2LC4 A; 3L2V A; 1AZG B; 2YSQ A; 2LNH B; 1JQQ A; 2VVK A; 2DPP B; 2PTK A; 2FRW A; 3ZEH A; 1HSQ A; 3V7R A; 4OMP A; 3E1S A; 4PJL A; 2HQE A; 1AWX A; 2GQV A; 2V8J A; 3JB9 G; 3RKX A; 4E7L A; 3CCE A; 1QP2 A; 4FU6 A; 3REA B; 2LRQ A; 2XID A; 4OB0 B; 3EG1 A; 3CCL A; 2RI5 A; 2K3B A; 3QZ5 B; 1M2V B; 3JCM b; 1KHC A; 3HFN A; 2RF0 A; 1Y96 B; 4J8O A; 2KI7 A; 2RI2 A; 1N5Z A; 4C92 C; 2HCK A; 3J80 E; 2CSQ A; 2E10 A; 4M78 A; 3MEU A; 1WI7 A; 5CKD A; 5LJ5 e; 3CEY A; 1S72 Q; 3A8M B; 2QYZ A; 1VQ4 Q; 4M78 E; 4M7A A; 2FZG B; 1YWP A; 2DL8 A; 4C92 F; 3DB3 A; 1TUD A; 4M7A E; 3NHN A; 4UC4 A; 1JJ2 P; 1QVG S; 3OYY A; 1TOV A; 3CD6 Q; 1KQS S; 5GAM e; 3REB B; 4M75 B; 1I4K 1; 3J81 E; 4HCC A; 2CS7 A; 3JB9 I; 4AMC A; 3SB2 A; 2DXT A; 2L89 A; 3OYL A; 2DIQ A; 2JN0 A; 3EAE A; 4M77 A; 1UHC A; 3ZFJ A; 2BZX A; 1EFN A; 4PK4 A; 2ZCF B; 1YBY A; 1U1S A; 2R58 A; 2BE9 B; 4M77 E; 1NBE B; 1IZ6 A; 3A1P A; 4QQG A; 1M3A A; 1M5Q 1; 1NZ9 A; 1XJW B; 1UGQ B; 3PGG A; 2RJC A; 1N8R R; 4RTY A; 3RMQ A; 3VU3 C; 3OYA A; 1YJN Q; 4C8Q D; 1Y0M A; 4R56 A; 3D7S B; 3JCM J; 5KE3 A; 3G71 A; 4PFZ A; 3HPW A; 2EBP A; 1I81 A; 1D0X A; 4C0D B; 3G6E T; 2RJF A; 4B9W A; 2KQW A; 2YWW A; 2I0N A; 2DEQ A; 2D8H A; 1VUB A; 5GAN 6; 2LP5 A; 2V26 A; 4PNO A; 4Q5W A; 5I2S A; 1D1A A; 3SEM A; 3R6N A; 1D1B A; 1YP5 A; 5IH2 A; 2KBT A; 1K0S A; 5HY6 A; 1QWE A; 1TWB A; 1U06 A; 4CC7 A; 2LCS A; 5HK3 A; 3CQT A; 2F69 A; 4M78 G; 2M02 A; 5CO7 A; 3I56 A; 3A98 A; 3MJX A; 4C0G A; 4EMH A; 1ZBX A; 3VRZ A; 2JMC A; 4C0F A; 1C6V X; 1UG1 A; 3ULR B; 4DBR A; 2RH2 A; 4M7A G; 2V1Q A; 1ZQ1 A; 1UDL A; 5EG2 A; 1VQL T; 4JUV A; 4J6W A; 4C0Z A; 3H41 A; 1ZSZ C; 5CKF A; 3CME Q; 4JRK A; 1ZUU A; 3JCM c; 1M4Z A; 2GNC A; 3QG1 A; 4P5N A; 5DY9 A; 2MOX A; 3FJ5 A; 1T0J A; 2KNB B; 1WLP B; 2QQR A; 2DZC A; 1BCO A; 3NTH A; 2FVU A; 1QCO A; 3UAT A; 3O5Z A; 2DF6 A; 4RCC A; 2HMA A; 4IUR A; 5GAN 7; 3TSZ A; 1UGV A; 1IO6 A; 3UPU A; 4NL3 A; 3NMZ C; 1IHW A; 1YIJ Q; 3OS2 A; 2MYS A; 2GFA A; 2KRM A; 4M7D C; 2OTJ T; 2F2W A; 2FL7 A; 2DXU A; 2K6D A; 3CCM T; 2DBM A; 2Y90 A; 2K57 A; 3HRT A; 4MML A; 4OGE A; 8ATC B; 3QKJ A; 1M8M A; 4LNP A; 1K8A C; 2OI3 A; 3HHT B; 1Q95 G; 2LNV A; 3QDF A; 2ZGW A; 4M7D F; 2K2M A; 5L23 A; 4V2S A; 5CVI A; 1D0Z A; 2PVO B; 2JTM A; 2ZPF B; 3CCM Q; 1E6G A; 2YUN A; 3M0T A; 3I55 A; 3SWN B; 1G3W A; 1W2B S; 1VQM T; 1ARK A; 3E19 A; 3JCM P; 4RTZ A; 2XDB A; 2PVG B; 5LJ3 f; 4BI3 A; 3M0P A; 1TH7 A; 2LDM A; 4D8K A; 4CRI A; 2QEX A; 2JT4 A; 4L59 A; 2KR3 A; 3VS3 A; 4PJO B; 1U5S A; 2YRD A; 5KYY A; 3MHX A; 4JDS A; 2KT8 A; 2RNA A; 5EC7 A; 4BE0 A; 1VQ9 T; 1HJD A; 2JTE A; 2FB7 A; 2FZK B; 3QHS A; 4LUD A; 2ESW A; 4XK8 E; 2FPE A; 3CCJ A; 3OBY A; 4J9E A; 4ME7 A; 4IUQ A; 2F2V A; 3CC7 A; 2ATC B; 2KYB A; 3OMG A; 4LXC A; 4DEX A; 2DKG A; 3C0C A; 1TTH B; 5LJ3 d; 1JXO A; 1N8R U; 1PSE A; 2DD5 A; 1WXB A; 3LYI A; 2E6N A; 4MZM A; 4DBF A; 1YJ9 T; 4KBM B; 3M4Y A; 5KYU B; 1X6O A; 3LX7 A; 3UDC A; 5CK9 A; 1NYF A; 4JRP A; 1ZBJ A; 4C92 B; 1Y96 A; 2O31 A; 2BUD A; 4B9X A; 4FSS A; 1Q82 R; 2D6F A; 2J7I A; 2KRN A; 3PFS A; 2VGM A; 3LH0 A; 4FSX A; 4HKE A; 4DA4 A; 2DTI A; 2CDT A; 3T9N A; 4PLL A; 1M9S A; 1ACM B; 1SHG A; 5KYX B; 3I5S A; 4M78 D; 2NLU A; 1MNE A; 2DM1 A; 4EMK B; 2KAF A; 2B8A A; 1VQ5 A; 2M0O A; 4C5H A; 1YIT Q; 3JCM V; 3JCM Q; 4FL6 A; 4J83 A; 2NYS A; 1VQ7 T; 2K2V A; 3QUI A; 1HYO A; 3CPF A; 4M7A D; 2O2O A; 2HDA A; 1TUC A; 3CCE Q; 1G2B A; 1N8R C; 1KD1 R; 3FEO A; 4YTL A; 4QQ6 A; 2RB6 A; 4M75 E; 1C1A A; 2LJ3 A; 1WHG A; 2DIG A; 1YNZ A; 3MP1 A; 4NS5 A; 1N6A A; 4A4E A; 1M3C A; 1VQ7 Q; 3EFO B; 3MP8 A; 2ZPH B; 4M77 D; 1FMV A; 2PUK B; 2A37 A; 2YUP A; 3CXC S; 1QKX A; 2ZPI B; 3GLX A; 2E3I A; 3CCU A; 4C8Q C; 1U3O A; 4HCB A; 2EJF A; 3SHW A; 3JB9 H; 5GAM j; 3OYK A; 2HQX A; 1QVF S; 4OMM A; 4OVA A; 2DLP A; 5KYN A; 4F14 A; 1WX6 A; 4GLK A; 3P8D A; 1VQO A; 3QWX X; 3DKM A; 2BE7 D; 2CYZ B; 2HBW A; 4C8Q F; 4NOY A; 4PJM A; 3A8L B; 2LTO A; 1M2O A; 1WXT A; 3GIB A; 2YRC A; 2EJ9 A; 2VXF A; 3C95 A; 4BE2 A; 2XD0 A; 4EMG A; 3OYC A; 2QI2 A; 3M0U A; 5FU6 B; 3CPW P; 1FMK A; 2DL4 A; 6AT1 B; 2JJ9 A; 2HSP A; 1VQP T; 2A7Y A; 1VQ6 Q; 3EG2 A; 4Y91 A; 4N4I A; 1PKT A; 4RTV A; 1RLP C; 1Y57 A; 4XTV A; 1ZSZ B; 2JMA A; 3CCV T; 2LCL A; 1JO8 A; 4J9C A; 1KSW A; 2DRK A; 4ZTF A; 2R5A A; 4DEY A; 4JPB W; 4E2F B; 2QGF B; 3TEE A; 1H3Z A; 2VUB A; 1S1N A; 4M75 G; 3LLR A; 4ESR A; 1N9R A; 3CCQ T; 2EJG A; 1AEY A; 3PT9 A; 3M0Q A; 4BY6 C; 4ORZ A; 5FWC A; 2BTT A; 2GF7 A; 3ME9 A; 4O5V A; 2OTJ A; 4EPC A; 1VQK Q; 2HBP A; 4FYW B; 1IB8 A; 2M9U A; 4OB2 B; 1EZZ B; 3LGL A; 1JJ2 S; 1WA7 A; 2O01 E; 2K3Y A; 2FYK A; 4JZ3 A; 4PJN A; 2XKO C; 3FJP A; 3VS2 A; 3I56 Q; 4E7J A; 2AZS A; 5IXB A; 1C0M A; 1MGQ A; 1M1K R; 3OW2 P; 2RQT A; 1WZO A; 2EQM A; 1E7O A; 4F7U F; 1KQ1 A; 5GAN f; 5CQY A; 3M53 A; 4J7I A; 1SKU B; 3F70 A; 2XIC A; 1JU5 C; 5FRO A; 3G4S A; 1I5O B; 1UTI A; 4LDU A; 1RAD B; 2CZ6 B; 2DYB A; 2LX9 A; 3ASK A; 1VQM A; 2E12 A; 2OTL T; 2GFU A; 1YI2 T; 3QPH A; 1Q82 U; 2D8J A; 1XOV A; 1T3S A; 2AZV A; 2YRV A; 2BZY A; 3CXC P; 5GMK e; 1NLO C; 3OYM A; 2WSE E; 2G3R A; 1TG0 A; 2K5I A; 2E5K A; 4F17 A; 3OYE A; 2CP5 A; 3FRN A; 3OS0 A; 2DE0 X; 4B6M A; 2E6Z A; 2W0Z A; 2RA2 A; 1QVF P; 3OMC A; 1X27 A; 1GCP A; 2J6F A; 1VQ9 A; 1G3T A; 4KUI A; 1CSK A; 1UGR B; 5GAN d; 4PJO A; 1M8V A; 4A4H A; 2JVV A; 3UA6 A; 3PNW C; 3P8B B; 1QVG A; 1KQS A; 4PJO E; 5LL6 S; 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4C8Q B; 4M77 C; 5I11 A; 2RQW A; 1PWT A; 5IAY A; 1CKA A; 4JJD A; 4OMN A; 2LQK A; 1ZLM A; 3VUB A; 3VV0 A; 1X2K A; 2JM8 A; 2J6K A; 1YJW A; 5GAO n; 1B34 A; 3OS1 A; 4D6W A; 1VQ5 Q; 3OBW A; 4E47 A; 3EGD A; 4M77 F; 3JCM f; 2QA4 A; 1O9S A; 4QKU A; 1OX8 A; 4A4K A; 1M1K U; 2E64 A; 1D3B A; 4N4G A; 3HL8 A; 1VQP A; 3H0H A; 1OQK A; 5CCA A; 4NL2 A; 1X01 A; 3VYH B; 3PE0 A; 4C92 G; 2CZ1 B; 3RER A; 2K3X A; 1AHJ B; 3CME T; 4FW2 A; 4OMF B; 1ABO A; 4F04 B; 2VGN A; 3OYN A; 1K73 R; 2LQN A; 2COZ A; 4A4G A; 2WSF E; 2E70 A; 2L3P A; 2KGT A; 3Q1J A; 1FYN A; 5FW9 A; 4DOW A; 3QXE B; 4ATO A; 3JCM e; 5GAN g; 2VV5 A; 3ER0 A; 2PUO B; 2DYI A; 3JCM d; 2GGR A; 1W2B A; 4AFU C; 4RG2 A; 1V29 B; 3MKD A; 3PIO A; 2RPN A; 3BE3 A; 1YIJ T; 1ZUY A; 1QLY A; 1VQO Q; 2DL7 A; 2LT4 A; 3BFM A; 4IUU A; 4N4H A; 1BKB A; 4QT7 A; 4IIO A; 5D6W A; 3M58 A; 1OU9 A; 4ZGD B; 3M59 A; 1LOJ A; 1ABQ A; 4Z8A A; 2NWM A; 4HVW A; 1JRI A; 4A53 A; 1KK7 A; 2EVR A; 5AT1 B; 1G3Y A; 4GLM A; 4WTO B; 1M1K C; 3FB9 A; 2CP7 A; 4BE1 A; 1KG1 A; 4F7U B; 1AD5 A; 1M90 U; 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