The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
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Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the complex between the N-terminal SH3 domain of CrkII and a proline-rich ligand
rcsb |
| molecule keywords |
Adapter molecule crk
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Mus musculus
|
| total genus |
10
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-07-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EYY A; 2KGT A; 2OJ2 A; 4J9C A; 1KFZ A; 4OMN A; 2LX7 A; 4JZ4 A; 1SRL A; 1VYT A; 5GJV B; 4RTW A; 1OPK A; 2A28 A; 1RLP C; 2NWM A; 2D8J A; 1M30 A; 3M0P A; 1M3C A; 2O9S A; 2J05 A; 1X6B A; 1NG2 A; 2AK5 A; 4RTU A; 2W0Z A; 4Z89 A; 1SHF A; 3PVL A; 3UA7 A; 2JXB A; 2RQU A; 4J9G A; 2MOX A; 1ZBJ A; 2AKL A; 2EGE A; 1BU1 A; 2DL5 A; 4J9F A; 1UE9 A; 4QT7 A; 3EG3 A; 5L23 A; 3JV3 A; 2CSQ A; 5EC7 A; 1UDL A; 3I35 A; 3EHQ A; 2O88 A; 1OPL A; 2DLP A; 2RN8 A; 2J7I A; 3UAT A; 1FMK A; 1NEB A; 1MV3 A; 3I5R A; 1X2K A; 2F2W A; 2L0A A; 1K1Z A; 4JZ3 A; 1HSQ A; 1YCS B; 1X43 A; 3RBB B; 1K76 A; 1ZSG A; 2A37 A; 2F2V A; 4D8K A; 2LJ1 A; 1U06 A; 1ZLM A; 2BZX A; 3UA6 A; 1GCQ C; 3VS0 A; 3PVQ A; 1AZG B; 2J6O A; 5IHN A; 1NYF A; 3H0H A; 3M0R A; 3NGP A; 5IHI A; 2ABL A; 2KRN A; 2QDL A; 4ESR A; 1E6H A; 1JEG A; 3SHW A; 1UJ0 A; 2EGA A; 1G2B A; 2PTK A; 1SHG A; 2DL8 A; 4A63 B; 2ED1 A; 2CT4 A; 4DEY A; 3KFV A; 3PE0 A; 2I0N A; 2CDT A; 2BZY A; 1WYX A; 4HXJ A; 2A08 A; 2YSQ A; 5FWC A; 1WXT A; 2JTE A; 3NHN A; 3M0U A; 1GL5 A; 1E6G A; 1UHC A; 4KRT A; 2W10 A; 2HSP A; 1PRL C; 3REA B; 2AZS A; 1UJY A; 1BK2 A; 2C0I A; 5I11 A; 2CSI A; 1YNZ A; 1IO6 A; 2D8H A; 2EKH A; 1X6G A; 4DEX A; 1M8M A; 1JQQ A; 2FEI A; 1VA7 A; 1W70 A; 1FYN A; 1EFN A; 5IHK A; 2J06 A; 1MUZ A; 1Y0M A; 1K9A A; 4F17 A; 1WFW A; 4CC3 A; 1Z9Z A; 2ED0 A; 2CRE A; 4AG2 C; 2V1Q A; 4RTV A; 2JT4 A; 2X3W D; 2RF0 A; 4LUD A; 4HVV A; 1ZX6 A; 4J9H A; 1UEC A; 4F14 A; 1ARK A; 1U3O A; 2KEA A; 3U23 A; 2L3S A; 5I22 A; 4AG1 C; 2OAW A; 4AFS C; 3FJ5 A; 2LP5 A; 2D1X A; 2L2P A; 1AWX A; 2G6F X; 4CC4 B; 4AFU C; 2RQT A; 1M27 C; 1QWE A; 1WDX A; 1X27 A; 2ENM A; 1I1J A; 1XOV A; 2C0O A; 3H0I A; 5IH2 A; 1W6X A; 2H8H A; 2K9G A; 3A98 A; 1QKW A; 1HD3 A; 2L3Q A; 3M0Q A; 2XMF A; 3VS6 A; 2EYZ A; 1T3S A; 2DL4 A; 1M3A A; 3EG0 A; 4OMO A; 1PKT A; 1I0C A; 1B3Q A; 2DIL A; 4RTY A; 1RUW A; 2ESW A; 2AKK A; 1GBR A; 4J9B A; 1VYU A; 3VS3 A; 4IIM A; 2JW4 A; 1GRI A; 3CQT A; 1E7O A; 4EIK A; 3VRZ A; 2V1R A; 2LNH B; 1J3T A; 4JJB A; 3GBQ A; 4RUG A; 1T0H A; 4OML A; 2K6D A; 4K11 A; 3SEM A; 2D0N A; 3TSW A; 1YN8 A; 2J6K A; 2DYB A; 2O9V A; 3VS5 A; 2EVR A; 2NUZ A; 1AWO A; 2GGR A; 2EYX A; 2YT6 A; 4OMM A; 1WLP B; 1WA7 A; 2RMO A; 1YWO A; 1X2Q A; 3H41 A; 1PNJ A; 3REB B; 2LCS A; 2LZ6 B; 2DRK A; 4LN2 A; 2GQI A; 5IXF A; 1UTI A; 2DMO A; 2HCK A; 2DJQ A; 4AFQ C; 3VS7 A; 2EBP A; 1AWJ A; 1CKA A; 2K2M A; 2CH4 A; 2GTO A; 2FPD A; 2YUQ A; 1UG1 A; 1W1F A; 5IXB A; 2KRS A; 2M51 A; 1GCQ A; 5ECA A; 3VS2 A; 1GBQ A; 2CUD A; 2KYM A; 3C0C A; 2M0Y A; 2OI3 A; 1AEY A; 1RI9 A; 4ZNX A; 2EGC A; 2HBW A; 4CC7 A; 3UF4 A; 3TVT A; 3I5S A; 2ROL A; 2YUO A; 3QWY A; 2RQR A; 2KRO A; 1PKS A; 1OV3 A; 5FWB A; 2DVJ A; 1LCK A; 2JM8 A; 1BBZ A; 1H92 A; 2ECZ A; 2J6F A; 1MV0 B; 3H0F A; 4OMQ A; 1ABO A; 1OOT A; 2KYB A; 3QWX X; 3NPF A; 1AOJ A; 1H3H A; 1QKX A; 1T0J A; 2DX1 A; 2ROT A; 1WIE A; 2LJ0 A; 2FRW A; 3ULR B; 1AWW A; 4R0K A; 3ZL7 C; 1X69 A; 2PNI A; 3EGU A; 4OMP A; 2K7A A; 2HEQ A; 4F16 A; 4X1V A; 1JXM A; 2O2O A; 2KT8 A; 2C0T A; 2KBT A; 2KXC A; 2E5K A; 4WCI A; 2RPN A; 1M3B A; 2RNA A; 2GNC A; 4RTX A; 2KXD A; 3EHR A; 4IIO A; 4LE9 A; 1QWF A; 3VS4 A; 2P4R A; 2KR3 A; 1OEB A; 2B86 A; 2VKN A; 1YP5 A; 3IQL A; 1ZUY A; 4M4Z A; 3R6N A; 1NEG A; 1A0N B; 2BTT A; 4GLM A; 2LJ3 A; 4J9E A; 1GFD A; 2KRM A; 1KSW A; 2DF6 A; 1WXU A; 1AVZ C; 1T3L A; 3M0T A; 1WX6 A; 2HDA A; 2LMJ A; 1WXB A; 1V1C A; 1Z9Q A; 1CSK A; 1WI7 A; 1PRM C; 4RTT A; 1H8K A; 1RLQ C; 1CKB A; 1BB9 A; 1KJW A; 2YUN A; 4HVW A; 1NM7 A; 1ABQ A; 2EYW A; 2JMA A; 3M0S A; 3RNJ A; 2F2X A; 1B07 A; 2DM1 A; 4FSS A; 4Z88 A; 2A36 A; 2JS0 A; 1JXO A; 2KNB B; 4ORZ A; 1ZUU A; 1TG0 A; 1NYG A; 1NLO C; 1SSH A; 4RTZ A; 1KIK A; 2FO0 A; 1NLP C; 1AD5 A; 2DL7 A; 1SEM A; 2EQI A; 1U5S A; 4LUE A; 2DBM A; 4Z8A A; 1GFC A; 1SRM A; 1AZE A; 2KE9 A; 4JJD A; 1HJD A; 1K4U S; 4JPB W; 1N5Z A; 2K79 A; 3THK A; 2YDL A; 2FG0 A; 2FPE A; 1G83 A; 2K3B A; 1QLY A; 4J9D A; 2FRY A; 2JS2 A; 3VS1 A; 5FW9 A; 2LQW A; 2VWF A; 2GBQ A; 4AFZ C; 2MCN A; 3NMZ C; 1UGV A; 4D8D A; 4CC2 A; 3TSZ A; 2CH4 W; 2IIM A; 3O5Z A; 1UFF A; 2DNU A; 1K0S A; 1QCF A; 2DRM A; 2DA9 A; 1UUE A; 2LQN A; 4Y92 A; 4J9I A; 2JM9 A; 2AZV A; 5HCK A; 4E6R A; 1I07 A; 1Y57 A; 1ZUK A; 2DE0 X; 1PHT A; 2GTJ A; 2KT1 A; 1JU5 C; 2BZ8 A; 2SRC A; 1TUC A; 1YWP A; 2JMC A; 2CT3 A; 2PZ1 A; 3I9Q A; 4GBQ A; 4HVU A; 1K0X A; 2O31 A; 1SPK A; 2RQW A; 5GJW B; 1UHF A; 1PWT A; 2CUB A; 3EG2 A; 2EPD A; 2SEM A; 3LH5 A; 2EW3 A; 2MIO A; 3EG1 A; 3VRY A; 2RQV A; 4LNP A; 4HCK A; 1VYV A; 4JJC A; 2X3X D; 2VVK A; 2YUP A; 2DBK A; 1GCP A; 2DL3 A; 1S1N A; 1JO8 A; 2FPF A; 2L3P A; 1TUD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KGT A; 2OJ2 A; 5GMK m; 3EFO A; 3BDL A; 1LJO A; 4IUQ A; 2J05 A; 1YJW A; 1B7T A; 1YJ9 A; 4RTU A; 1SHF A; 1QP3 A; 3PVL A; 3J7A F; 4DA4 A; 1PD0 A; 4J9G A; 4M7A C; 4M7D D; 1D1C A; 1ZBJ A; 2K2V A; 3I56 Q; 4PJO D; 3JV3 A; 5A0G A; 3P8B B; 3GNG A; 1U1S A; 1MV3 A; 3JB9 D; 2CZ6 B; 2L0A A; 4M7D G; 3VUZ A; 4JZ3 A; 1YCS B; 2HL5 C; 2LJ1 A; 5GAO l; 2LQ8 A; 1K8A U; 1UB4 A; 2CKK A; 2K5L A; 2J6O A; 5LJ5 e; 1RAB B; 3JB9 G; 4HA8 A; 3PTA A; 1RAC B; 5IHI A; 4R55 A; 2KRN A; 4PLL A; 2EGA A; 4O6J A; 3L2Q A; 1S72 T; 5I2M A; 5IN1 A; 2ED1 A; 2B8A A; 1IGU A; 4J6X A; 4X34 A; 2E3H A; 1M4Z A; 3QDR B; 4IKF A; 1OQK A; 2BZY A; 1WYX A; 3EGD A; 3SWN C; 3G7Z A; 5CK9 A; 1QQJ A; 1WXT A; 2RI5 A; 2JTE A; 1N9R A; 3CCM A; 2HSP A; 4FYX B; 5GAN d; 1BK2 A; 3JCM X; 1YNZ A; 2JZ2 A; 4DBF A; 1IO6 A; 3CC7 Q; 4D6W A; 2OTJ A; 2JTF A; 5GAN f; 3JCM d; 1M8M A; 2GF7 A; 2FEI A; 1VA7 A; 2MYS A; 3V7R A; 1FYN A; 3V7C A; 1PSF A; 4M75 B; 1MUZ A; 2MMP A; 1Y0M A; 3RDV A; 4F17 A; 3OW2 S; 3CMA A; 2XG8 D; 2X4Y A; 1Z9Z A; 3JCM f; 3VYG A; 4NOY A; 3X25 B; 2CRE A; 2WSC E; 1OUL A; 4RTV A; 1C0M A; 3HTR A; 1R77 A; 2WAC A; 5CQY A; 2HAX A; 4XTV A; 3G1J A; 1ARK A; 1YJN T; 3SD4 A; 5I22 A; 2L3S A; 4PFP A; 4AG1 C; 2OAW A; 2FZC B; 4OP0 A; 1OX9 A; 2L2P A; 4M77 E; 4RCC A; 1X27 A; 1XOV A; 1W6X A; 1VQK A; 1U1T A; 5J39 A; 2X4X A; 2P0K A; 1QKW A; 3M0Q A; 2EYZ A; 2PUO B; 4PFZ A; 3EG0 A; 1PKT A; 1QMC A; 1I0C A; 5GAM j; 1B3Q A; 1WPY A; 1JB0 E; 3FC3 A; 1UGQ B; 4L6V 5; 3CXC A; 3RIR A; 2ESW A; 3CCL T; 2NUP B; 4C5G A; 4M77 B; 4J9B A; 4KUL A; 2VC8 A; 4OB1 B; 4E47 A; 1Y71 A; 4J5Y A; 1M1G A; 1FX7 A; 1DJ7 B; 2DXC A; 1VQ8 T; 1UGS B; 2QAS A; 4JJB A; 3HFO A; 3JRZ A; 3M58 A; 3CPW P; 4M7D C; 2ZZD A; 2K6D A; 2HQH A; 1WHL A; 2EVR A; 2ZCF B; 1G5V A; 3RMQ A; 2IVW A; 3C4S A; 2R5M A; 3QDF A; 4C92 A; 1XNI A; 2JUF A; 2GGR A; 2EYX A; 4RCB A; 4XTZ A; 2VV5 A; 2RMO A; 3CEY A; 1X2Q A; 3MEV A; 4FCY A; 3V8L A; 3CME Q; 1JJ2 S; 2LZ6 B; 2P0P A; 5IXF A; 5LJ3 g; 3M57 A; 1Q86 U; 2RI2 A; 3OYD A; 1K8A C; 2DXT A; 1YIT Q; 4HKE A; 3RKY A; 3VS7 A; 2QAZ A; 3S3M A; 2EBP A; 5GAM d; 4XU0 A; 3JCM J; 1RL2 A; 2JN0 A; 2FZG B; 3BFM A; 2DXB A; 2CH4 A; 2DJZ A; 3OYN A; 3S6W A; 1B34 A; 2ZPG B; 5GAM f; 2FPD A; 1UG1 A; 1KD1 U; 4ELZ C; 4ZN1 A; 2DAQ A; 4PJL A; 1Q82 U; 2K5F A; 3A8G B; 3MET A; 2CUD A; 2P0Q A; 3R6O A; 4KGX B; 3CCV A; 2OI3 A; 3QBY A; 3PT9 A; 4C5H A; 2P4T A; 4ZNX A; 3M59 A; 3MPU B; 3ZBD A; 2KRO A; 1YI2 T; 5KYU B; 1VOM A; 1TSF A; 3CCS T; 2CZ0 B; 2GQV A; 4XAX B; 3NPF A; 4OF1 A; 1K73 R; 2LQK A; 4A4K A; 1H3H A; 1QKX A; 2EFI A; 2LRQ A; 4JJN K; 1WIE A; 3ULR B; 1AWW A; 4R0K A; 2PNI A; 4F16 A; 4X1V A; 1S72 A; 2H3J A; 1N8R R; 3QYG B; 2KXC A; 1WJQ A; 2E5K A; 4FT2 A; 2PVG B; 1M3B A; 1BI2 A; 5J26 A; 2GNC A; 3EHR A; 2FB7 A; 2KVQ G; 2XK0 A; 5LJ3 e; 2F69 A; 1YHQ Q; 4B9W A; 4DBR A; 4KGV B; 1IB8 A; 3VS4 A; 1VQ6 Q; 1OEB A; 2VKN A; 1YP5 A; 3IQL A; 1WHK A; 4BUG A; 2QQS A; 2CZ7 B; 1ZUY A; 3RR6 A; 4ZN3 A; 4GLM A; 3EG9 B; 2DF6 A; 1WXU A; 3LW5 E; 1T3L A; 3M0T A; 1WJR A; 3CD6 T; 2R57 A; 1N9S A; 1Z9Q A; 2DVE A; 4ANJ A; 4BI8 B; 2BKD N; 1H8K A; 1CKB A; 1BB9 A; 4QKU A; 1KJW A; 1NM7 A; 3M0S A; 3HRS A; 2ATC B; 4XTX A; 4EDU A; 4J6Y A; 2F2X A; 1D3B B; 4JDS A; 3CCQ T; 4BDY A; 3BE3 A; 2DM1 A; 4FSS A; 4HCZ A; 4EMK B; 2KY9 A; 4N4G A; 1TH7 A; 3CCJ T; 1VQN A; 4C5E A; 3FLG A; 4ORZ A; 4F7U B; 4M75 A; 4ZTJ A; 1RAI B; 2JJ9 A; 4RTZ A; 1KIK A; 2FO0 A; 1TXQ A; 1VQL Q; 3MEA A; 1NLP C; 3PMI A; 1KQS S; 1AD5 A; 1U5S A; 5GAN 5; 4Z8A A; 1X75 C; 5D7U A; 2DIQ A; 2OAU A; 1Q86 C; 3OQ5 A; 2FHD A; 2FG0 A; 2FPE A; 1G83 A; 4M7D F; 1QLY A; 2EIF A; 4CRI A; 4DBH A; 4PJO F; 1RAG B; 3OYF A; 1X6O A; 1V76 A; 1VQO A; 2VWF A; 5KE2 A; 3OYK A; 4AFZ C; 2RHY A; 2YHT A; 4C0D B; 3TSZ A; 1KD1 C; 5M9O A; 9ATC B; 2QK0 A; 1Q82 C; 2I2L A; 2RK1 A; 4PFO A; 1YJW T; 2JM9 A; 3CPW A; 1YJ9 T; 3CCE Q; 2CP3 A; 1GXI E; 2CP5 A; 2KSS A; 1ZUK A; 4M77 G; 1C6V X; 1TUC A; 2O4X B; 1YWP A; 4ELY C; 4DOV A; 1SPK A; 2QXF A; 2XD0 A; 2NUP A; 4M77 A; 2CUB A; 3E2U A; 4QVZ A; 3A8O B; 4PK4 A; 1OU8 A; 2EW3 A; 3TQ7 P; 5C6S A; 5GAM h; 3G4S T; 2MIO A; 4MML A; 3OYH A; 4C8Q D; 2E6Z A; 2HNI A; 1WGS A; 1VQM A; 1PG5 B; 4LD6 A; 4XTU A; 2VYT A; 3LLR A; 3JB9 H; 3JSC A; 1RAH B; 4OGC A; 2DL3 A; 1S1N A; 3CBO A; 1JO8 A; 2XHC A; 1TUD A; 2CP6 A; 2EYY A; 3LYI A; 1OU9 A; 4M7A D; 2EWN A; 4BE0 A; 1VQ5 A; 5GJV B; 3I55 Q; 1UGR B; 3OMC A; 1OPK A; 2A28 A; 2NWM A; 2D8J A; 2BE7 D; 1YBY A; 1X6B A; 3VU3 C; 1YI2 A; 5FU7 B; 1NG2 A; 3CCM T; 2E6N A; 4Z89 A; 3UA7 A; 1VQ9 A; 5I21 A; 2AKL A; 2XKO C; 1BU1 A; 2DL5 A; 3JCM b; 5GAN 4; 3OYA A; 2GFA A; 5L23 A; 2OTJ T; 1W2B P; 3EHQ A; 2O88 A; 2KK4 A; 5DLO A; 2DLP A; 1FMK A; 3MEW A; 3QG1 A; 1X2K A; 4OB3 B; 3CMA T; 3G71 Q; 4NS5 A; 5GMK e; 3CCR Q; 1K1Z A; 4LDV A; 1Y7X A; 1X43 A; 1I8F A; 1EIF A; 2A37 A; 3GP8 A; 1ZLM A; 3VS0 A; 1AZG B; 2DIG A; 1KC8 U; 4C92 E; 4L5G A; 1NE8 A; 1NYF A; 1OX8 A; 5KYU A; 3S3N A; 1K8A R; 2V8K A; 3CC2 Q; 1MNE A; 4ESR A; 2QDL A; 4KBM B; 1E6H A; 2MI6 A; 5D6Y A; 2E70 A; 2DTI A; 3INZ A; 4FL6 A; 1SHG A; 4A63 B; 1N27 A; 4DEY A; 3CXC S; 5L8R E; 1I4K 1; 1W4S A; 5A0D A; 3OYI A; 1VQK T; 2QI2 A; 4II1 A; 2QQB A; 1XJW B; 1WNL A; 3M0U A; 4M78 B; 2LDM A; 2XI9 A; 2AZS A; 3X28 B; 4HCC A; 3DKM A; 4ZGD B; 4M77 C; 2EKH A; 5DY9 A; 1QVP A; 5IHK A; 3G6E Q; 2DFU A; 1I5L A; 3OB9 A; 4LXC A; 1K9A A; 1YIJ A; 3CCJ A; 5LJ5 g; 4B6M A; 5HK0 A; 3RKW A; 3EG9 A; 3ZFJ A; 4AG2 C; 3LGF A; 4A4G A; 2JT4 A; 2RF0 A; 1O9S A; 4LUD A; 4CI0 C; 1ZX6 A; 4J9H A; 5FLX E; 1Y96 B; 3QO3 A; 5AYF A; 1U3O A; 2KEA A; 3JB9 J; 4AFS C; 2COW A; 1NBE B; 2VXF A; 1X01 A; 2M16 A; 1AWX A; 4CC4 B; 3A8L B; 4AFU C; 2RQT A; 1D3B A; 1M27 C; 4LDY A; 2C0O A; 4X9D A; 3VV0 A; 3H0I A; 4EMK A; 2K9G A; 4FYV B; 1D0Z A; 4O5V A; 2RM4 A; 3RES A; 2DL4 A; 2LT1 A; 4J7I A; 4F7U A; 1M3A A; 3CC7 T; 2DIL A; 4FW1 A; 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