The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
58
|
structure length |
58
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Chain Sequence |
AEYVRALFDFNGNDEEDLPFKKGDILRIRDKPEEQWWNAEDSEGKRGMIPVPYVEKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the complex between the N-terminal SH3 domain of CrkII and a proline-rich ligand
rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule keywords |
Adapter molecule crk
|
| total genus |
10
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2016-07-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4K11 A; 2CUB A; 2FPF A; 1E6G A; 4HVV A; 1QKW A; 4HCK A; 2EBP A; 3I5S A; 2A08 A; 1UTI A; 1CSK A; 2YDL A; 1S1N A; 2D8H A; 1PRM C; 1WXB A; 3NMZ C; 4ORZ A; 4RTY A; 1LCK A; 4J9D A; 2EYW A; 3NGP A; 1NG2 A; 2YT6 A; 1SHG A; 3ZL7 C; 1RI9 A; 2EYZ A; 4AG2 C; 1YN8 A; 1HJD A; 2MCN A; 2IIM A; 5EC7 A; 1JQQ A; 1X69 A; 1RLP C; 2JW4 A; 4J9E A; 2JTE A; 1YWO A; 3UA6 A; 4JPB W; 5I11 A; 1AWX A; 4RTZ A; 4GBQ A; 4CC3 A; 1W6X A; 2JS0 A; 2F2V A; 1M3B A; 3EGU A; 2GQI A; 3REA B; 2EYX A; 3RNJ A; 4AFS C; 5I22 A; 1TUC A; 1B3Q A; 4LN2 A; 1JO8 A; 1WX6 A; 5HCK A; 2ESW A; 2EKH A; 1N5Z A; 1H8K A; 2EGE A; 1KJW A; 2O9S A; 1RLQ C; 3EG1 A; 1WYX A; 3RBB B; 2FO0 A; 2M51 A; 4EIK A; 2MOX A; 2DL7 A; 2HDA A; 2DL3 A; 2LX7 A; 2V1R A; 1ARK A; 3FJ5 A; 2LMJ A; 2CSI A; 1AZE A; 1VYU A; 4J9B A; 4LE9 A; 1MV0 B; 1OV3 A; 1T0H A; 1K1Z A; 2KNB B; 4Z8A A; 2BZ8 A; 2C0I A; 4CC7 A; 3UF4 A; 2J06 A; 5ECA A; 2ECZ A; 1SSH A; 2ED1 A; 2KBT A; 2JT4 A; 4D8D A; 2ENM A; 2P4R A; 2GBQ A; 2PZ1 A; 2JMA A; 5IXF A; 1XOV A; 3I9Q A; 4J9I A; 3THK A; 1PKS A; 2AZS A; 3H0I A; 1YNZ A; 2KYM A; 3H0F A; 2L3P A; 1CKB A; 1NYF A; 1WXU A; 2L3S A; 1ZSG A; 2KRS A; 2J05 A; 2DL4 A; 2KRO A; 2CSQ A; 2EW3 A; 1ZUK A; 1PKT A; 1QLY A; 1AD5 A; 1U3O A; 2MIO A; 4JZ3 A; 2DLP A; 2L3Q A; 4CC2 A; 2L2P A; 5IXB A; 1X43 A; 2F2X A; 2SEM A; 4AFU C; 4F17 A; 2EGC A; 1W70 A; 2CDT A; 2RQT A; 5FW9 A; 1T0J A; 3EG0 A; 4OMN A; 1YCS B; 2RN8 A; 1KSW A; 2VKN A; 2BZY A; 2CT4 A; 1TUD A; 1SHF A; 5GJW B; 4QT7 A; 1B07 A; 1H92 A; 4OMQ A; 1JEG A; 2JMC A; 2GGR A; 5IHI A; 5GJV B; 4F16 A; 2EVR A; 1Y57 A; 2LQN A; 2O9V A; 2HSP A; 1NEG A; 1PWT A; 1X27 A; 2YSQ A; 2E5K A; 2FRW A; 2J6O A; 1K0S A; 1X6B A; 2DF6 A; 2K79 A; 3CQT A; 2DBM A; 1JXM A; 3VS5 A; 4ESR A; 1M8M A; 4JZ4 A; 4LUD A; 1UGV A; 1X2K A; 2DNU A; 4KRT A; 2LQW A; 2AKL A; 3VS1 A; 2RPN A; 2LCS A; 2SRC A; 4RTT A; 1NM7 A; 3VS6 A; 2HBW A; 2DRK A; 1Z9Q A; 1E7O A; 2B86 A; 4OML A; 1GFD A; 4ZNX A; 2CH4 W; 1G83 A; 1BB9 A; 1WA7 A; 2KRM A; 2DVJ A; 3KFV A; 2FPE A; 5L23 A; 2FEI A; 2O2O A; 2KXC A; 1K76 A; 3JV3 A; 2W0Z A; 4RTV A; 2CRE A; 3EG3 A; 2DRM A; 2O31 A; 3PE0 A; 1QCF A; 2RMO A; 1KFZ A; 3VS2 A; 3TVT A; 4M4Z A; 4JJD A; 4AG1 C; 1QKX A; 2JXB A; 1ABQ A; 2EPD A; 1GRI A; 3O5Z A; 1UE9 A; 2K9G A; 1PRL C; 1HSQ A; 1I07 A; 3PVL A; 5IH2 A; 2DL8 A; 2RNA A; 2OI3 A; 3A98 A; 2FPD A; 2JM9 A; 1MUZ A; 2FRY A; 1K0X A; 1GFC A; 2OAW A; 4GLM A; 2ROT A; 4RTX A; 1X2Q A; 4JJC A; 2DMO A; 3VRY A; 1K4U S; 4J9C A; 1GBQ A; 3IQL A; 4A63 B; 1ZLM A; 2RF0 A; 2ROL A; 3SHW A; 2XMF A; 4Y92 A; 2KRN A; 2OJ2 A; 5IHK A; 1U5S A; 4WCI A; 2YUN A; 4E6R A; 1M27 C; 2GNC A; 3VS3 A; 2EYY A; 1IO6 A; 2RQW A; 2D8J A; 1SRL A; 4RUG A; 2VWF A; 4HVU A; 3I35 A; 1SPK A; 1EFN A; 2A28 A; 4IIO A; 2DJQ A; 4JJB A; 2ABL A; 2D0N A; 1FYN A; 2FG0 A; 1WIE A; 1JU5 C; 1AEY A; 4CC4 B; 2J6K A; 3REB B; 1SRM A; 4OMO A; 2K7A A; 1SEM A; 2L0A A; 4OMP A; 2RQV A; 2CUD A; 3M0P A; 2C0T A; 1WLP B; 3I5R A; 3M0U A; 3R6N A; 2A37 A; 1H3H A; 1WDX A; 2NUZ A; 4F14 A; 4R0K A; 2KE9 A; 1UUE A; 2W10 A; 1RUW A; 1AWO A; 1BU1 A; 1HD3 A; 2KGT A; 2AZV A; 2PTK A; 3U23 A; 2LJ0 A; 1WXT A; 1M30 A; 3SEM A; 2K6D A; 3NHN A; 4IIM A; 3VRZ A; 1OOT A; 3TSZ A; 1ZBJ A; 5IHN A; 3M0Q A; 4J9F A; 2DIL A; 4D8K A; 3M0R A; 4DEX A; 1NYG A; 3H41 A; 1YWP A; 1ZUU A; 2AKK A; 2PNI A; 1WFW A; 2LP5 A; 2AK5 A; 3GBQ A; 1I1J A; 5FWB A; 1BBZ A; 4Z88 A; 2K2M A; 2DM1 A; 2C0O A; 1PNJ A; 2GTJ A; 1M3C A; 2CH4 A; 2EGA A; 1I0C A; 2KT8 A; 2YUO A; 4AFZ C; 1T3L A; 1AWJ A; 1OPL A; 1X6G A; 1ABO A; 1ZX6 A; 2GTO A; 2J6F A; 1A0N B; 1AVZ C; 2BZX A; 3EHQ A; 2A36 A; 2KT1 A; 3UA7 A; 1OPK A; 1WI7 A; 2KYB A; 2LZ6 B; 3NPF A; 1GL5 A; 1UEC A; 1JXO A; 2EQI A; 1T3S A; 1UFF A; 3ULR B; 4AFQ C; 3LH5 A; 1GCQ C; 2DBK A; 2HEQ A; 4J9G A; 1YP5 A; 2BTT A; 1NLO C; 2LJ3 A; 2LNH B; 1AOJ A; 2DL5 A; 4J9H A; 2DA9 A; 3H0H A; 2M0Y A; 3QWX X; 3TSW A; 2F2W A; 2VVK A; 4OMM A; 3M0S A; 1W1F A; 1UHF A; 1M3A A; 1UHC A; 2K3B A; 2I0N A; 1CKA A; 1U06 A; 3VS7 A; 2JS2 A; 1UG1 A; 3UAT A; 2D1X A; 1UDL A; 2YUQ A; 2JM8 A; 4LUE A; 2X3X D; 1KIK A; 5FWC A; 2X3W D; 3M0T A; 1UJ0 A; 1VA7 A; 2NWM A; 2G6F X; 2DE0 X; 4Z89 A; 1PHT A; 2DX1 A; 1TG0 A; 1NLP C; 4HXJ A; 1UJY A; 1V1C A; 4LNP A; 2ED0 A; 1AWW A; 2QDL A; 2YUP A; 1BK2 A; 2DYB A; 3PVQ A; 2J7I A; 2O88 A; 3EG2 A; 1QWE A; 2RQR A; 1QWF A; 1GCQ A; 1Z9Z A; 3EHR A; 2H8H A; 3VS0 A; 1E6H A; 1VYV A; 2KR3 A; 1AZG B; 2CT3 A; 4RTW A; 1FMK A; 1G2B A; 1OEB A; 4X1V A; 4FSS A; 1NEB A; 1VYT A; 1K9A A; 4RTU A; 2V1Q A; 4DEY A; 1GCP A; 2HCK A; 4HVW A; 1Y0M A; 3QWY A; 2KXD A; 2RQU A; 3C0C A; 1MV3 A; 1J3T A; 1GBR A; 2KEA A; 2LJ1 A; 3VS4 A; 1ZUY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CEY A; 4EMH A; 4K11 A; 5GMK j; 1VQN A; 4R55 A; 4BY6 C; 3OYK A; 2FPF A; 4HVV A; 4M7A F; 3EFO A; 1TU0 B; 4HCK A; 2EBP A; 4JLG A; 3L1A A; 1VQ5 Q; 3RKW A; 4PJM A; 2D8H A; 1PRM C; 5D6Y A; 4ORZ A; 2XHC A; 4J9D A; 4DBF A; 2EYW A; 1KHC A; 4NOY A; 1SHG A; 4XTY A; 2JZ2 A; 1RI9 A; 3NTH A; 1Y71 A; 2MCN A; 3DKM A; 5L8R E; 3GPL A; 3QO3 A; 1JQQ A; 1X69 A; 4DBQ A; 2JW4 A; 2X9H A; 2P4T A; 5CIU A; 1VQM Q; 3UA6 A; 4C5G A; 4LXC A; 2A0F B; 5I11 A; 4O5V A; 4M78 C; 2JS0 A; 1IHW A; 2PU9 B; 1M3B A; 3EGU A; 1QMC A; 4ZGJ B; 4M77 G; 3VU3 C; 2EYX A; 3UT1 A; 3QYG B; 1VQP Q; 1BI1 A; 1I4K 1; 4HCZ A; 4F7U E; 3ZBD A; 1WX6 A; 2EQJ A; 3M58 A; 3EGD B; 2QK0 A; 1H8K A; 1KJW A; 3EG1 A; 4EIK A; 1Q86 C; 2DL7 A; 1ARK A; 3FJ5 A; 1M1G A; 2KMT A; 1YJN A; 1VYU A; 2KDS A; 1MV0 B; 1TXQ A; 2BZ8 A; 1VQN T; 2QQB A; 3UF4 A; 1RAF B; 2EQM A; 1YJW A; 2ECZ A; 1SSH A; 4QKU A; 1R0B G; 2ENM A; 3X26 B; 2GBQ A; 2PZ1 A; 1KK7 A; 3I9Q A; 3HRT A; 4J9I A; 4PFP A; 3X20 B; 3OYG A; 1PKS A; 3H0I A; 3MEU A; 1YNZ A; 2KYM A; 4FYX B; 5C6S A; 3CC2 T; 1D0Z A; 3MKD A; 1ZSZ B; 2KRS A; 2J05 A; 4D6W A; 2DXT A; 1TSF A; 3X24 B; 3NTK A; 4PJO A; 1PKT A; 1QLY A; 2Y4Y A; 5FRM A; 2MIO A; 2X4Y A; 1KQS A; 2L2P A; 5IXB A; 4Z02 A; 5GAO p; 3VUB A; 1D1A A; 3QYH B; 2NUP B; 3OYE A; 3QSU A; 1W70 A; 3QG1 A; 2CDT A; 3M57 A; 2DET A; 1YCS B; 3SWN C; 3I55 A; 5GAN 5; 2JJ9 A; 4OB3 B; 4MZP A; 1YJ9 Q; 4M7A E; 1U8R A; 3CME A; 2GGR A; 3CCM A; 2LT1 A; 2H3J A; 4F16 A; 2EVR A; 1VOM A; 2QTV A; 3CCQ A; 4C8Q D; 4PFZ A; 5CCA A; 3GOX A; 1YJW T; 5CKF A; 1NEG A; 1PWT A; 1K8A C; 2GF7 A; 1YIT Q; 2J6O A; 3JB9 H; 3G4S A; 5LJ5 j; 4C92 D; 3VS5 A; 4M77 A; 3RER A; 1UGV A; 2H3E B; 2MWP A; 5GAM f; 2R5A A; 1Q86 R; 1XQH A; 2LCS A; 2DRK A; 1Z9Q A; 2VYT A; 1OX9 A; 5I21 A; 1E7O A; 1VQ7 Q; 5A2Q E; 1G83 A; 3MP6 A; 1WA7 A; 2DVJ A; 3KFV A; 5KCO A; 5IN1 A; 3HKS A; 4A4G A; 2FB7 A; 3H9N A; 3CCL Q; 4XQ3 A; 4E7Z A; 4FCY A; 3JV3 A; 2DTH A; 3EG3 A; 1BYM A; 2RA2 A; 2HSE B; 2A7Y A; 4M7A G; 2QGG A; 4M4Z A; 5LJ3 e; 3LX7 A; 1QKX A; 2JXB A; 3CCU Q; 4FT2 A; 3I55 T; 3OYH A; 4JJN K; 2DVE A; 2GQV A; 2RNA A; 4PJL A; 3FRN A; 3CCM T; 2YLC A; 3OW2 S; 2HKN A; 3CCQ T; 1GFC A; 1BIA A; 3EAE A; 1IHV A; 3LWI A; 3GP8 A; 5GMK h; 3OW2 P; 3EG9 B; 1IXD A; 4JJC A; 1K4U S; 3G4S T; 1IRX A; 3IQL A; 3JAM E; 4OGE A; 3V7R A; 3OYD A; 4IUU A; 4ANJ A; 3VV0 A; 1C0M A; 2KRN A; 2QEX T; 4LDX A; 1I5L A; 5KYY B; 2YUN A; 2HL5 C; 2EYY A; 1IO6 A; 2RQW A; 1K8A R; 2F5T X; 3L2W A; 3OYA A; 2VWF A; 3QBY A; 4IIO A; 4ELZ C; 3KBG A; 2DJQ A; 1LVK A; 4LDY A; 4JJB A; 3HL8 A; 3L2Z A; 2XD0 A; 1QVF S; 1YI2 Q; 3GF5 A; 2KQW A; 2J6K A; 4M75 B; 3REB B; 1SRM A; 1QVF P; 1RAI B; 4N4I A; 3OYJ A; 4HCC A; 4KGZ B; 3OA6 A; 4C8Q F; 3M53 A; 2DXU A; 3L2Q A; 1KD1 C; 4QQG A; 3I5R A; 3HFO A; 2A37 A; 3CCJ T; 1WDX A; 2LCL A; 3QZ9 B; 2KE9 A; 4R0K A; 2W10 A; 4C0F A; 4C92 F; 1HD3 A; 3U23 A; 4A4H A; 1JJ2 A; 2JUF A; 3BDL A; 3ZEH A; 5GAO n; 2K6D A; 2MI6 A; 2DD4 A; 4PJN A; 4IIM A; 5KYX A; 4GLK A; 3KXT A; 4OGC A; 1D0Y A; 3M0Q A; 3A1P A; 4M7A A; 2Z0W A; 2PUK B; 5GAN 8; 3H41 A; 1YWP A; 3FC3 A; 3CCR A; 1D1B A; 2AKK A; 1OYX A; 1H64 1; 1I1J A; 3LWH A; 5GMK i; 2HNI A; 1BBZ A; 3LGL A; 4Z88 A; 2GTJ A; 2KT8 A; 2VXF A; 1EIF A; 4IUV A; 1OPL A; 2DTO A; 2HL3 A; 2GTO A; 1VUB A; 2J6F A; 1A0N B; 3JRZ A; 2F5K A; 2BZX A; 1VIF A; 3CC4 Q; 4QVD A; 1TWB A; 3A8M B; 1Q82 C; 2LVM A; 1UEC A; 2WSF E; 3EFO B; 1T3S A; 2R5M A; 3N5B B; 2RK1 A; 4AFQ C; 5GAN 4; 2LCC A; 3LH5 A; 2HZY A; 1XNI A; 2E64 A; 1GCQ C; 4JRP A; 2O4X B; 1YP5 A; 1NLO C; 2LNH B; 2NUT A; 4J9H A; 2AHJ B; 4B9W A; 5HK3 A; 1VQ9 A; 3MP1 A; 2KAF A; 5DM7 R; 1ZA2 B; 4YTL A; 1W4S A; 5EG2 A; 5LJ5 f; 4UC4 A; 4OMM A; 4P5N A; 1S72 A; 3M0S A; 3PMI A; 1M3A A; 1ZA1 B; 2X51 A; 1U06 A; 3VS7 A; 3C12 A; 2VV5 A; 5CQX A; 1PM3 A; 3UAT A; 2B8A A; 1UDL A; 2YLB A; 4KT0 E; 1KD1 R; 4A4K A; 5FWC A; 5LJ5 h; 1VQ6 T; 1RAD B; 2BIV A; 3CCR T; 5GAO m; 2E4H A; 1YIJ Q; 1UJ0 A; 3LH0 A; 4HXJ A; 2VGM A; 3RES A; 5J39 A; 2EWN A; 4OF1 A; 4M78 D; 2DYB A; 3PVQ A; 5D6X A; 1U1T A; 1QWE A; 3QPH A; 3EHR A; 4PKC C; 3TEE A; 3DB3 A; 2K5F A; 2H8H A; 1NJI U; 1E6H A; 3VKI A; 1DJ7 B; 5DY9 A; 2L8D A; 4C8Q E; 3CCE Q; 2QQS A; 1AZG B; 5KE3 A; 1FMK A; 2WAC A; 4LDW A; 3OYB A; 4FSS A; 1MMG A; 2QXF A; 4Y28 E; 1VYT A; 2E6N A; 1K9A A; 4E47 A; 3PIO A; 1R8O B; 2V1Q A; 4C92 E; 2CP5 A; 1ZHI A; 5LJ3 j; 3MJX A; 2RQU A; 1NZ9 A; 3C0C A; 1N8R U; 2XU8 A; 1J3T A; 2OTL Q; 1GBR A; 5CKB A; 5CKD A; 1VQ9 T; 2A3L A; 3VS4 A; 4FIB A; 5HKC A; 2CUB A; 3P8D A; 1E6G A; 3QKJ A; 5A0D A; 1S72 T; 4PJO B; 2EJF A; 4ZTF A; 4JLI A; 2QG9 B; 2VC8 A; 2AIR B; 2MPX C; 2V8K A; 4RTY A; 4IUR A; 4EPC A; 2LX9 A; 2DPP B; 1YN8 A; 3RIR A; 3JCM J; 3M55 A; 4C8Q G; 1VQP A; 4BE2 A; 4J9E A; 2RHX A; 1YCY A; 2JOY A; 5HK0 A; 4C92 G; 4CC3 A; 2F2V A; 4B9X A; 2PVO B; 2GQI A; 4PJO C; 2CP3 A; 4ZGD B; 4OP0 A; 5I22 A; 4LD9 K; 1B3Q A; 1RAB B; 4LN2 A; 2ZPB B; 1N6A A; 1VQK Q; 2FYK A; 1K73 C; 4PNO A; 4N0A A; 4M77 B; 1N5Z A; 3QHS A; 1ZQ1 A; 1WYX A; 2FO0 A; 1PG5 B; 3CCV Q; 2DL3 A; 2LX7 A; 2DKG A; 4F04 B; 1KC8 U; 1I8F A; 4LE9 A; 1OV3 A; 1T0H A; 1UEB A; 4ZN1 A; 2JNG A; 2ED1 A; 1WZO A; 2ZAE A; 5CKH A; 2EAY A; 2P4R A; 5GAN g; 2JMA A; 3CD6 Q; 3GNF B; 1XOV A; 4V2S A; 2JTF A; 4M78 F; 3SDZ A; 5KCH A; 4CRI A; 2M16 A; 1CKB A; 2X4X A; 4WF2 A; 1ZSG A; 1YBY A; 1JRI A; 2KRO A; 1VQP T; 2EW3 A; 2HKQ B; 3ZFJ A; 4JZ3 A; 1Q81 U; 3OS0 A; 2E70 A; 4WTO B; 3SD4 A; 3CBM A; 1YJ9 A; 1TUG B; 1YHQ Q; 4C0G A; 2RJE A; 3V7S A; 2V26 A; 2ZPI B; 3EG0 A; 3MEA A; 1VQ8 Q; 1WQ7 A; 2RN8 A; 4E7S A; 2VKN A; 2BZY A; 1YIT A; 3S6W A; 4QT7 A; 4NS5 A; 1B07 A; 2RI5 A; 1JEG A; 2JMC A; 2NLU A; 4A54 A; 4C8Q A; 3QII A; 2BE7 D; 2LQN A; 2ZZD A; 1VQ7 A; 2KSS A; 2YSQ A; 5GAN 3; 3OSS C; 4C92 A; 2DF6 A; 2K79 A; 1K73 R; 2DBM A; 1JXM A; 5KYN A; 3CC2 A; 2DNU A; 2XG8 D; 1OQK A; 2JVV A; 2AKL A; 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