The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
3
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
TFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGQTGYIPSNYVAPS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
1H and 15N assignments and secondary structure of the Src SH3 domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
SRC TYROSINE KINASE SH3 DOMAIN
|
| source organism |
Gallus gallus
|
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| total genus |
3
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1994-03-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2NUZ A; 2BZY A; 2JM8 A; 2FPD A; 1WXU A; 3M0U A; 1U5S A; 1WFW A; 2OAW A; 3IQL A; 1M3C A; 3H0H A; 2JXB A; 2MCN A; 4GLM A; 1HD3 A; 2ED0 A; 2M51 A; 1WXB A; 3RNJ A; 3VS1 A; 1K0S A; 4Z88 A; 1AWO A; 3EG1 A; 5GJV B; 2OI3 A; 1YCS B; 2P4R A; 1OPL A; 1UGV A; 2O2O A; 2JT4 A; 1G83 A; 3TSZ A; 3VS0 A; 5FWC A; 4JPB W; 5IH2 A; 1ABQ A; 1I1J A; 2KT1 A; 4ORZ A; 1PNJ A; 2ROL A; 2ED1 A; 2DL8 A; 3VRZ A; 1UJ0 A; 1HJD A; 1M8M A; 4HVW A; 4X1V A; 4HVV A; 3VS2 A; 2ENM A; 1OEB A; 1PRM C; 3UA7 A; 3TSW A; 5EC7 A; 1E6G A; 1X6G A; 3I5R A; 5FWB A; 1JO8 A; 5HCK A; 1FMK A; 2XMF A; 1ZUY A; 4AFZ C; 2CH4 W; 2I0N A; 1ZUK A; 1KIK A; 1SHF A; 2CSQ A; 1TUC A; 2CUD A; 1RUW A; 3O5Z A; 4F16 A; 2C0T A; 2KRO A; 2GTO A; 3I9Q A; 4AFQ C; 3QWY A; 3CQT A; 3UA6 A; 1T3L A; 2K7A A; 3EHQ A; 1VYV A; 1ARK A; 3VS5 A; 2SRC A; 4ZNX A; 2B86 A; 2DF6 A; 1IO6 A; 1QCF A; 2KXC A; 4RTW A; 2KXD A; 1K9A A; 1NYF A; 2YUP A; 4JZ3 A; 1A0N B; 2DL7 A; 2EGA A; 1JXM A; 2E5K A; 1JQQ A; 1WXT A; 4A63 B; 4AFS C; 4E6R A; 1PKS A; 4OMQ A; 3H41 A; 2EVR A; 1GBQ A; 2JM9 A; 2EBP A; 5IXB A; 2KGT A; 4CC7 A; 1YWP A; 2FPE A; 4RTX A; 1QWF A; 1AEY A; 2AKL A; 3VS6 A; 1K0X A; 1GRI A; 2RF0 A; 2W10 A; 2V1R A; 2YDL A; 3M0Q A; 4HCK A; 3THK A; 2GBQ A; 1UE9 A; 2FRW A; 4EIK A; 2L3Q A; 1UJY A; 2JMC A; 2L3P A; 2DE0 X; 1I0C A; 1T3S A; 2GQI A; 2YUO A; 2K79 A; 5L23 A; 1S1N A; 1UTI A; 4OMN A; 1KJW A; 2HSP A; 3I35 A; 2ROT A; 2VWF A; 1Z9Z A; 1ZSG A; 1E6H A; 4LE9 A; 1X2K A; 3SEM A; 2KNB B; 1SRM A; 2H8H A; 1QKW A; 1GCQ A; 2A28 A; 2PZ1 A; 1N5Z A; 1PWT A; 2D8J A; 3C0C A; 2LCS A; 3RBB B; 2FG0 A; 1PRL C; 1NEB A; 2VVK A; 3R6N A; 1AZE A; 2MIO A; 1JEG A; 2AKK A; 2DRK A; 1GFD A; 4RTT A; 3PVQ A; 4Z89 A; 4J9H A; 4K11 A; 1V1C A; 1CSK A; 1QWE A; 3EGU A; 2EYZ A; 3H0I A; 2DYB A; 1OOT A; 2KRN A; 1H3H A; 2CUB A; 2RMO A; 2J05 A; 1CKA A; 2DL3 A; 1MV0 B; 2HBW A; 4JJD A; 1UG1 A; 2ECZ A; 1U3O A; 2CT4 A; 1YWO A; 2LJ3 A; 5IXF A; 2KBT A; 2RQT A; 4RTU A; 1K1Z A; 1M30 A; 2F2W A; 2AZV A; 1UHC A; 4M4Z A; 2DVJ A; 1I07 A; 2DL4 A; 1U06 A; 2HEQ A; 2W0Z A; 1AWJ A; 3NMZ C; 1MV3 A; 1T0H A; 1AVZ C; 3H0F A; 1H8K A; 1W70 A; 3M0P A; 2RQW A; 4IIM A; 2FEI A; 3PE0 A; 1AD5 A; 2RQR A; 4ESR A; 1H92 A; 2EYX A; 3TVT A; 2LJ1 A; 1VYT A; 2PNI A; 2GNC A; 4J9E A; 2F2X A; 4DEX A; 3PVL A; 3NPF A; 1W6X A; 1K76 A; 1NEG A; 1TUD A; 4CC2 A; 2DL5 A; 3ZL7 C; 2KR3 A; 4OMP A; 1UEC A; 2CT3 A; 2SEM A; 2IIM A; 4F14 A; 4HXJ A; 4HVU A; 2FO0 A; 3GBQ A; 1RI9 A; 4IIO A; 2K9G A; 2LX7 A; 2VKN A; 2RQV A; 4OMO A; 2J06 A; 3JV3 A; 4Z8A A; 2DIL A; 2C0O A; 4LN2 A; 2BZX A; 4OML A; 2BTT A; 1JU5 C; 1ZBJ A; 5GJW B; 2HDA A; 1AWW A; 1GCQ C; 2D8H A; 2LP5 A; 2CRE A; 2EGE A; 2C0I A; 3UAT A; 2KYM A; 2LNH B; 2RQU A; 1J3T A; 2DA9 A; 1WA7 A; 2EGC A; 2JMA A; 1T0J A; 1UUE A; 2PTK A; 2D1X A; 2EYW A; 1NM7 A; 1JXO A; 4J9B A; 2KYB A; 3M0R A; 4DEY A; 1AZG B; 4CC3 A; 2G6F X; 1SHG A; 3KFV A; 3UF4 A; 1Y57 A; 2DMO A; 2AK5 A; 4J9D A; 2ABL A; 1WIE A; 5IHN A; 4D8K A; 1YNZ A; 3SHW A; 2FPF A; 1K4U S; 2A08 A; 2RNA A; 3M0T A; 4KRT A; 2RPN A; 1WX6 A; 3A98 A; 4JZ4 A; 3EG0 A; 2JW4 A; 2BZ8 A; 2HCK A; 2K3B A; 2KRM A; 2O9V A; 4RTY A; 3EHR A; 1RLQ C; 4FSS A; 4AG2 C; 1AOJ A; 1SPK A; 1OPK A; 5I11 A; 2KEA A; 2J7I A; 4OMM A; 5FW9 A; 3ULR B; 2GGR A; 2KRS A; 1TG0 A; 2KT8 A; 2L0A A; 2EPD A; 2CDT A; 3EG2 A; 4AG1 C; 2DBM A; 1EFN A; 2J6K A; 1B07 A; 1CKB A; 1GBR A; 1UFF A; 2L2P A; 2DX1 A; 2LQN A; 4LNP A; 1X43 A; 2O88 A; 1SRL A; 1YP5 A; 3VS3 A; 2DRM A; 3QWX X; 1SEM A; 1SSH A; 2V1Q A; 2K6D A; 2O9S A; 3VS7 A; 1X69 A; 2MOX A; 3REB B; 2GTJ A; 1PKT A; 2L3S A; 1LCK A; 3I5S A; 1Y0M A; 2EW3 A; 4RTV A; 1ABO A; 2DJQ A; 2EQI A; 3NGP A; 1M3B A; 1WI7 A; 5IHK A; 2QDL A; 2X3X D; 1NLP C; 2FRY A; 2J6F A; 2O31 A; 3LH5 A; 1G2B A; 1W1F A; 1WYX A; 5IHI A; 2DNU A; 3U23 A; 4J9C A; 1X27 A; 2YUQ A; 4LUE A; 4JJB A; 2NWM A; 1HSQ A; 1GFC A; 1XOV A; 1VYU A; 1E7O A; 2K2M A; 3EG3 A; 1X2Q A; 2A37 A; 4J9G A; 3REA B; 2YSQ A; 3VRY A; 1NG2 A; 2EYY A; 2EKH A; 2M0Y A; 2YT6 A; 1QKX A; 2CSI A; 2LZ6 B; 1BU1 A; 4F17 A; 1FYN A; 4JJC A; 1ZLM A; 2KE9 A; 3FJ5 A; 2LQW A; 4Y92 A; 1AWX A; 1GCP A; 3NHN A; 2DLP A; 3VS4 A; 1ZX6 A; 1NLO C; 5ECA A; 4RTZ A; 2CH4 A; 1UHF A; 1VA7 A; 1GL5 A; 2DM1 A; 2AZS A; 4R0K A; 2LJ0 A; 2A36 A; 2DBK A; 1UDL A; 1RLP C; 1WLP B; 1M27 C; 2LMJ A; 4QT7 A; 1KFZ A; 5I22 A; 1X6B A; 2OJ2 A; 1KSW A; 1YN8 A; 1OV3 A; 1PHT A; 1WDX A; 4RUG A; 1MUZ A; 2X3W D; 4LUD A; 4D8D A; 2JS2 A; 4GBQ A; 4WCI A; 3M0S A; 1BB9 A; 1BBZ A; 4CC4 B; 2F2V A; 4AFU C; 1BK2 A; 1NYG A; 1QLY A; 2D0N A; 4J9I A; 1M3A A; 2J6O A; 2JS0 A; 2JTE A; 1ZUU A; 1B3Q A; 4J9F A; 2YUN A; 2ESW A; 2RN8 A; 1Z9Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2E10 A; 4M7A A; 3M0U A; 2E41 A; 3FC3 A; 1M3C A; 3H0H A; 3M9Q A; 4GLM A; 4FYV B; 2L5Q A; 3BY7 A; 1EIF A; 3INZ A; 2DXB A; 3CC2 T; 5GMK m; 1SSF A; 1YCS B; 2P4R A; 1YJN T; 2M9U A; 2L3R A; 4QQ6 A; 2IG0 A; 2RJC A; 4JPB W; 3TCJ A; 3JAM E; 1PCX A; 2ROL A; 5J26 A; 1YJ9 A; 2JOY A; 3E2U A; 5GAO r; 5CK9 A; 1K8A U; 4HVV A; 3VS2 A; 3ZEH A; 4IUR A; 1OEB A; 3UA7 A; 5EC7 A; 3I5R A; 1X01 A; 3CCL Q; 1VQL Q; 1M9S A; 5HCK A; 2XMF A; 5KYX B; 2DO3 A; 4M75 A; 2E5Q A; 1K9M R; 1KIK A; 3LW5 E; 4ELZ C; 2RHU A; 3QJ6 A; 3LWH A; 4F16 A; 2DFU A; 1R77 A; 2C0T A; 3UWN A; 2GTO A; 4EMK A; 4NL2 A; 3TU4 K; 5C6S A; 3P8B B; 3FEO A; 2CP6 A; 2JNG A; 3EHQ A; 4F7U F; 2ATC B; 5A0L A; 4C8Q B; 5GAN 5; 3MCA B; 3VS5 A; 2SRC A; 3CCL T; 1VQL T; 4YTL A; 2DF6 A; 1IO6 A; 2JN0 A; 2KMT A; 1PD1 A; 4C92 G; 2QTX A; 5LJ3 g; 2KXC A; 4RTW A; 2KXD A; 2YUP A; 2MAM A; 1H64 1; 1RAG B; 5LJ3 j; 3OW2 P; 4N4H A; 4A63 B; 1PKS A; 3LLR A; 2CKK A; 3H41 A; 1GBQ A; 2B8A A; 2EBP A; 4BDY A; 3HTR A; 1HXD A; 4KH1 B; 1K73 R; 2DD4 A; 3PGG A; 3JCM d; 2LCL A; 3PIO A; 3CCU Q; 4RTX A; 3AHU A; 2KDS A; 1AEY A; 1K9M U; 4ZTF A; 2EJ9 A; 2RHX A; 1GRI A; 2RF0 A; 3M55 A; 5GAM f; 2YDL A; 2VYT A; 4HCK A; 3THK A; 2LX9 A; 5FRN A; 3QKJ A; 3V8K A; 2HNI A; 4EIK A; 2L3P A; 4B9X A; 1T3S A; 1N27 A; 3EGD A; 2RI2 A; 3I35 A; 1R0B G; 4BY6 C; 2ROT A; 4M78 E; 2X35 A; 3QJY A; 1ZSG A; 1QVG A; 3CCU T; 4M7A D; 3CCQ A; 3CC7 Q; 4OGE A; 2RI3 A; 2KNB B; 1YIT A; 1GCQ A; 3C0C A; 1QQJ A; 3CBO A; 2RM4 A; 3CPW P; 1WHK A; 1K73 U; 1JEG A; 2DER A; 4RKU E; 1RAI B; 4IKF A; 3PVQ A; 3A8G B; 4J9H A; 1Q82 U; 4K11 A; 1CSK A; 2PVG B; 2LQK A; 1IGQ A; 1H3H A; 2CUB A; 1N8R C; 2CGH A; 1JJ2 A; 1G3Y A; 1MND A; 3PMI A; 1MV0 B; 3HFN A; 1HYO A; 4OB2 B; 4PFZ A; 4EMK C; 3NTK A; 4JRQ A; 3CC7 T; 1D0X A; 1VQ4 A; 1UGR B; 1TTH B; 2DVE A; 3OYD A; 3BDL A; 1PG5 B; 2DD5 A; 2OX7 A; 3RUX A; 1YHQ A; 1FXX A; 1MNE A; 2OTL A; 4M75 D; 1UHC A; 3TQ7 P; 4M4Z A; 1I07 A; 1G3S A; 2HEQ A; 2D9T A; 1MMA A; 4KUL A; 3NMZ C; 3OA6 A; 2NUT B; 3MP1 A; 2EQK A; 5GMK e; 3M0P A; 1LVK A; 2HD0 A; 2RB6 A; 1Q7Y R; 3MET A; 3PE0 A; 1VQM Q; 1H92 A; 2EYX A; 2LJ1 A; 1M90 C; 1KC8 C; 1VUB A; 4A54 A; 3PVL A; 3NPF A; 1W6X A; 1K76 A; 1TS9 A; 3J7A F; 4C8Q D; 2QA4 Q; 2IVW A; 2QQR A; 4OMP A; 4O5V A; 2F5K A; 1M1K R; 3RER A; 3OY9 A; 4ZGD B; 3CCM A; 2IIM A; 4F14 A; 3ASK A; 3MEV A; 3VJP A; 4MDX A; 2V8K A; 1OI1 A; 3A8M B; 1KHC A; 4M7D F; 3OSS C; 1WQW A; 5KYU B; 3JV3 A; 4Z8A A; 3NTI A; 1Q86 R; 1VQM T; 1YJW Q; 1V76 A; 4LN2 A; 1O75 A; 2XIC A; 2BZX A; 3EFO B; 2CP0 A; 4MZT A; 1KD1 R; 2BTT A; 2H3J A; 3QBY A; 1AWW A; 3M53 A; 3E1S A; 1GCQ C; 1JB0 E; 2D8H A; 5DLQ E; 1VQN A; 2CRE A; 2EGE A; 2C0I A; 3UAT A; 2LNH B; 3OYL A; 2QA4 T; 5LJ5 g; 1Q7Y U; 2EGC A; 2JMA A; 3FJP A; 1W2B P; 3OYE A; 3JB9 I; 4A4K A; 5LJ5 j; 3UDC A; 1BCM A; 2ZGW A; 2K5L A; 1RAH B; 4J9B A; 2KYB A; 3L1A A; 1D1B A; 2MYS A; 5AYF A; 3CCV Q; 1YJW T; 3UF4 A; 1BYM A; 2K3X A; 1M1K U; 2YHT A; 4FYY B; 1BI3 A; 2AK5 A; 4TVR A; 4J9D A; 2ABL A; 5IHN A; 1YNZ A; 3JCM f; 2A08 A; 2RNA A; 4ANJ A; 2RPN A; 3A98 A; 3A8H B; 4DOV A; 3ZBD A; 1Q86 U; 4BUG A; 1KD1 U; 4NL3 A; 1WGS A; 3EHR A; 4FSS A; 4J6W A; 8ATC B; 1FMV A; 4EPC A; 1AOJ A; 2DZC A; 4C8Q E; 1XNI A; 2X4X A; 5GAO p; 3CCV T; 5FU6 B; 3J80 E; 2KT8 A; 1KQS A; 1YBY A; 2K4Y A; 2JVV A; 4MMK A; 1G3W A; 3OYN A; 3CCR A; 2HQH A; 5KE2 A; 4ZGE B; 1D1A A; 1B07 A; 1CKB A; 3HRS A; 4L6V 5; 2QG9 B; 1YP5 A; 5GAN h; 1OYX A; 1W4S A; 1U1T A; 2V26 A; 1SSH A; 3GOX A; 3JB9 D; 2O9S A; 1C6V X; 3REB B; 1TWB A; 1ZA1 B; 2F5T X; 1Y0M A; 1C0M A; 1LNX A; 3OBW A; 2XDD A; 1M3B A; 1WI7 A; 5IHK A; 3DLL A; 2FRY A; 2X51 A; 1WYX A; 4LDU A; 4PJO E; 5IHI A; 4A4E A; 1OU9 A; 2LNV A; 4CRI A; 4N4I A; 3JCM X; 2YUQ A; 4LUE A; 2X4W A; 3JCM J; 4N4G A; 2NWM A; 3KXT A; 1GFC A; 2AT1 B; 3FIF A; 3EG3 A; 1X2Q A; 2MI6 A; 2A37 A; 2DEQ A; 4J9G A; 4NS5 A; 1VQP A; 3VRY A; 1R0C B; 2EKH A; 5KCO A; 4M77 C; 2RJD A; 1WHM A; 3DKM A; 2D0Q B; 2QXF A; 1Q81 U; 2KE9 A; 2JZ2 A; 4XU0 A; 3M54 A; 7AT1 B; 3A8L B; 4ZGJ B; 2DLP A; 4FT4 A; 5CQX A; 1ZX6 A; 1K9M C; 3EFR A; 2XHC A; 3EGX A; 4FT2 A; 3QDF A; 1YIJ A; 1FMW A; 2CH4 A; 2ZCF B; 3MO8 A; 4F7U G; 4A4G A; 3JRZ A; 4PJN A; 3G71 Q; 4ZN1 A; 1XTD A; 2LJ0 A; 4XU2 A; 1O9S A; 4HKE A; 1M27 C; 4M77 F; 4QT7 A; 4FM4 B; 1KFZ A; 1IZ6 A; 4JRI A; 1PHT A; 4RUG A; 4JS4 A; 1MUZ A; 4J6Y A; 2KAF A; 5A0D A; 2YXY A; 1PD0 A; 5I21 A; 2EAY A; 5GAM j; 1BBZ A; 4RMO A; 3OS1 A; 1W2B S; 4J9I A; 2J6O A; 3ME9 A; 4C92 E; 3G71 T; 4J9F A; 5CKD A; 3X26 B; 2VXF A; 2RN8 A; 1K73 C; 1Z9Q A; 1NZ9 A; 1M2V A; 4KUI A; 5CVI A; 4BDZ A; 2JM8 A; 3MEW A; 2FPD A; 2RA2 A; 1Q82 C; 2EFI A; 1VQ6 Q; 2EJF A; 4JUV A; 1QVG P; 5FLX E; 1FX7 A; 2M51 A; 3BFM A; 2FL7 A; 3CXC A; 3QYH B; 3CC2 A; 1K0S A; 2GQV A; 4Z02 A; 3EG1 A; 5GJV B; 2QGG A; 1OPL A; 1BI2 A; 4JDS A; 4WF2 A; 2JT4 A; 1D3B B; 3VS0 A; 2DEU A; 5FRM A; 5IH2 A; 2KT1 A; 4XK8 E; 1PNJ A; 2RJE A; 5CKF A; 3D7S B; 1WJR A; 1UJ0 A; 1M8M A; 2A3L A; 1KQ1 A; 1VQ6 T; 1UGQ B; 1JJ2 P; 1PRM C; 1UB4 A; 3G7Z A; 4M78 B; 1WNL A; 4DBQ A; 3CMA A; 1FMK A; 1ZUY A; 2CH4 W; 4N0A C; 2OTJ A; 1SHF A; 2CSQ A; 2DET A; 5CIU A; 1RUW A; 2VUB A; 1YFN A; 2E1H A; 1RL2 A; 2VGN A; 1QVF S; 4AFQ C; 3QWY A; 5LL6 S; 3OS5 A; 1T3L A; 2K7A A; 3QZ5 B; 4A53 A; 1VYV A; 2EQJ A; 1ARK A; 1SG5 A; 4XTY A; 3CCL A; 1VQL A; 4ZNX A; 2E70 A; 5KYY B; 1RI0 A; 4HCB A; 1K9A A; 1A0N B; 3PFS A; 2DL7 A; 2EGA A; 1N9S A; 4DQ2 A; 1WXT A; 1VQ5 Q; 4AFS C; 5DM7 R; 2E12 A; 2EVR A; 4E47 A; 2PUK B; 2KVQ G; 2XI9 A; 4JS5 A; 4GY5 A; 5IXB A; 3R6O A; 1YWP A; 3QSU A; 2FPE A; 1Q7Y C; 2RK2 A; 2COZ A; 1AHJ B; 3QZ9 B; 1R8O B; 1BIA A; 2E6N A; 3S3N A; 4XTU A; 2V1R A; 1QP2 A; 5GAN 7; 4JJN K; 3N5B B; 4J7F A; 2CP7 A; 1Y96 B; 1P92 A; 4EMH A; 3V7S A; 4M7D G; 3CBP A; 1VQ5 T; 3HFO A; 2YUO A; 1I5O B; 1KK7 A; 1S1N A; 1H3Z A; 3OQ5 A; 2FHD A; 2K2V A; 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