The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
69
|
structure length |
69
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Chain Sequence |
GSHMPKMEVFQEYYGIPPPPGAFGPFLRLNPGDIVELTKAEAEHNWWEGRNTATNEVGWFPCNRVHPYV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein/signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Novel recognition mode between Vav and Grb2 SH3 domains.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
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| total genus |
11
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| structure length |
69
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| sequence length |
69
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-08-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1OV3 A; 2JS0 A; 4HXJ A; 5GJW B; 4D8D A; 1ZUY A; 4CC3 A; 2DRM A; 4DEX A; 3ZL7 C; 4EIK A; 3M0S A; 2FPE A; 2LCS A; 3EG3 A; 1WYX A; 5L23 A; 1M3A A; 1SEM A; 3VS5 A; 5GJV B; 1SHF A; 4J9B A; 5HCK A; 1Y0M A; 1AWW A; 5I22 A; 4RTU A; 2VVK A; 3C0C A; 1ZSG A; 1OOT A; 1QKX A; 1VYU A; 1WXU A; 2D8J A; 2K2M A; 2RQT A; 3CQT A; 2EQI A; 1PKS A; 1VA7 A; 2EW3 A; 1N5Z A; 3REA B; 2EGA A; 2K9G A; 2OI3 A; 2DIL A; 3EG0 A; 1W1F A; 4RTT A; 2OJ2 A; 3VS0 A; 1AWX A; 4J9E A; 4ZNX A; 2L2P A; 4JPB W; 1UUE A; 3A98 A; 4OMO A; 1AEY A; 3RBB B; 1KIK A; 1GCQ A; 3NHN A; 2JMC A; 4Z88 A; 1UJ0 A; 2CDT A; 2F2V A; 3O5Z A; 5FW9 A; 1RI9 A; 4LN2 A; 4OMP A; 1VYT A; 2GTJ A; 4RTX A; 2CT4 A; 1MV3 A; 2RN8 A; 1GCQ C; 1GBQ A; 3TSW A; 2CH4 A; 5IH2 A; 2LJ1 A; 2L3Q A; 1VYV A; 4X1V A; 2LJ3 A; 2CUB A; 1WIE A; 1X6B A; 3SEM A; 4ESR A; 3M0R A; 2HCK A; 1AD5 A; 1V1C A; 2V1R A; 3I5S A; 2KYB A; 4AFZ C; 2YUO A; 2J6K A; 2KGT A; 3I35 A; 2LZ6 B; 2RQU A; 1T3L A; 2DRK A; 1UJY A; 2DL8 A; 2NUZ A; 3H0H A; 2YT6 A; 4J9D A; 1U06 A; 1I1J A; 2K6D A; 1T3S A; 4F14 A; 1YCS B; 1G83 A; 2C0O A; 3GBQ A; 1PWT A; 4K11 A; 1M27 C; 2MCN A; 1XOV A; 2O9S A; 1K9A A; 1JXM A; 1GFD A; 2M51 A; 2DL5 A; 3IQL A; 1SPK A; 1CSK A; 1SSH A; 4RTZ A; 1J3T A; 2O2O A; 1HSQ A; 5IHI A; 3I5R A; 1PKT A; 2OAW A; 2KYM A; 1X2K A; 1GFC A; 2GNC A; 2DNU A; 1ZX6 A; 1ZUK A; 4LUE A; 2SRC A; 2A36 A; 1LCK A; 2X3W D; 4HVW A; 5FWC A; 2MOX A; 1QKW A; 4J9C A; 5IHN A; 4R0K A; 3KFV A; 2L0A A; 1GBR A; 2JM9 A; 2BZX A; 2KNB B; 1K0X A; 2KT8 A; 2KE9 A; 2A28 A; 2LP5 A; 2LQW A; 1AVZ C; 2J7I A; 1SRL A; 1K4U S; 3M0T A; 4OML A; 5EC7 A; 4JJC A; 1I07 A; 1H3H A; 4J9G A; 1UHF A; 2B86 A; 1QWE A; 1U5S A; 2KXC A; 2ROL A; 2FRY A; 2YSQ A; 1H8K A; 2D0N A; 1YN8 A; 4J9I A; 4Z89 A; 1QCF A; 2CRE A; 1JQQ A; 2CT3 A; 2HDA A; 2FO0 A; 1UFF A; 4GBQ A; 2EYW A; 2LX7 A; 2DMO A; 4RTV A; 1OEB A; 1QWF A; 3THK A; 4AG1 C; 4LUD A; 4OMM A; 1UEC A; 2BTT A; 4JZ4 A; 1ZUU A; 2EBP A; 4A63 B; 2RQW A; 2KBT A; 2YDL A; 2CSI A; 1AWO A; 1GRI A; 1MUZ A; 2DA9 A; 2GBQ A; 1KJW A; 1UDL A; 2EKH A; 2LQN A; 1CKB A; 1TUD A; 2GQI A; 2CUD A; 3REB B; 4JZ3 A; 1UHC A; 3M0U A; 4J9H A; 2RQV A; 4IIM A; 2L3P A; 3UA7 A; 1YWP A; 2DJQ A; 1BU1 A; 2RQR A; 2CH4 W; 2O31 A; 1ABO A; 2EYY A; 2EGE A; 1E6H A; 2V1Q A; 2G6F X; 4WCI A; 2LJ0 A; 1WFW A; 2YUN A; 2ABL A; 2O9V A; 2DBM A; 3R6N A; 1HD3 A; 2BZY A; 4HVV A; 1WX6 A; 2P4R A; 1RUW A; 2EGC A; 1JXO A; 5I11 A; 3M0Q A; 3VS7 A; 2KR3 A; 2MIO A; 3H0I A; 4E6R A; 1HJD A; 4KRT A; 1UGV A; 3TVT A; 2ED1 A; 4LE9 A; 2DBK A; 1NYF A; 2EVR A; 4QT7 A; 2L3S A; 2JT4 A; 2DX1 A; 1WXB A; 4Y92 A; 2AKK A; 4JJB A; 2SEM A; 1SHG A; 2AK5 A; 3NGP A; 3TSZ A; 1NG2 A; 4OMQ A; 2FRW A; 3M0P A; 2DL4 A; 3UA6 A; 2RPN A; 1NEB A; 2W0Z A; 1K1Z A; 3PE0 A; 1MV0 B; 1U3O A; 2F2X A; 3I9Q A; 3VS1 A; 1ZBJ A; 2AZV A; 4AFQ C; 3UAT A; 1PRM C; 3VS6 A; 2J6F A; 1JO8 A; 2DL7 A; 1SRM A; 3VS3 A; 1M3B A; 4GLM A; 4IIO A; 2CSQ A; 1TG0 A; 2H8H A; 1AWJ A; 4D8K A; 2DL3 A; 1RLQ C; 5IXB A; 2F2W A; 3VRY A; 4AFU C; 2HSP A; 2KRS A; 1OPL A; 1JEG A; 2LNH B; 1CKA A; 3RNJ A; 1ARK A; 1AZE A; 1KSW A; 2M0Y A; 4AG2 C; 2A08 A; 2EYZ A; 2AKL A; 5ECA A; 1T0H A; 2X3X D; 3EG1 A; 2DM1 A; 4M4Z A; 2LMJ A; 3H0F A; 1W70 A; 1W6X A; 4F17 A; 1K0S A; 1TUC A; 3EG2 A; 2FEI A; 3EGU A; 2DVJ A; 3QWY A; 2IIM A; 1Y57 A; 4CC4 B; 3NMZ C; 2AZS A; 1UTI A; 2DLP A; 2D1X A; 4AFS C; 2W10 A; 4HVU A; 2ECZ A; 1X2Q A; 2D8H A; 2EYX A; 2K3B A; 4CC2 A; 2ED0 A; 1PRL C; 5IXF A; 1BK2 A; 2O88 A; 1M3C A; 2RMO A; 4F16 A; 3VS2 A; 2VWF A; 2JM8 A; 1RLP C; 4RTW A; 2ESW A; 4RUG A; 2K7A A; 2JW4 A; 1ZLM A; 2DYB A; 2EPD A; 1YP5 A; 4JJD A; 1GL5 A; 1K76 A; 1NYG A; 1QLY A; 3UF4 A; 2J06 A; 2QDL A; 3H41 A; 2RNA A; 4LNP A; 1E6G A; 1IO6 A; 2VKN A; 2JMA A; 1H92 A; 2KXD A; 2JXB A; 2C0T A; 1T0J A; 2PZ1 A; 2K79 A; 2GGR A; 2A37 A; 1GCP A; 1X6G A; 1ABQ A; 3U23 A; 4RTY A; 3PVQ A; 3SHW A; 1YWO A; 2J05 A; 1BBZ A; 1M8M A; 4CC7 A; 1E7O A; 1UE9 A; 1WLP B; 2PNI A; 1AOJ A; 1M30 A; 4FSS A; 1WXT A; 2E5K A; 3EHR A; 1G2B A; 5IHK A; 1EFN A; 2JS2 A; 2KRN A; 3QWX X; 1Z9Z A; 1I0C A; 4J9F A; 1X27 A; 2FPD A; 1OPK A; 2DE0 X; 1NLP C; 3NPF A; 2ENM A; 2KRM A; 1FYN A; 2NWM A; 1NLO C; 4ORZ A; 1JU5 C; 2KEA A; 1YNZ A; 2YUQ A; 3ULR B; 5FWB A; 4OMN A; 1AZG B; 2DF6 A; 1NEG A; 2JTE A; 2RF0 A; 3LH5 A; 1Z9Q A; 4Z8A A; 2ROT A; 1PNJ A; 3VRZ A; 4DEY A; 2XMF A; 1PHT A; 1S1N A; 2J6O A; 1FMK A; 1UG1 A; 2KT1 A; 3PVL A; 1BB9 A; 2HBW A; 2GTO A; 1WI7 A; 1B3Q A; 2HEQ A; 1X69 A; 1WA7 A; 3VS4 A; 2YUP A; 1NM7 A; 1WDX A; 3EHQ A; 2FPF A; 1B07 A; 2KRO A; 3FJ5 A; 1A0N B; 1KFZ A; 2PTK A; 2FG0 A; 3JV3 A; 2C0I A; 4HCK A; 1X43 A; 2I0N A; 2BZ8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4EDU A; 4KUD K; 3A8M B; 1YJW A; 2V8K A; 2OTL A; 5I2M A; 4AMC A; 4EIK A; 2FPE A; 2LCS A; 1I5O B; 3EG3 A; 4B9W A; 4J7I A; 2IVW A; 1SHF A; 5HCK A; 1KHC A; 5HY6 A; 3CBP A; 4J6Y A; 1WXU A; 2K2M A; 1OU8 A; 3CQT A; 3QDF A; 1PKS A; 2EW3 A; 2OX7 A; 1VQK A; 1R8O B; 3REA B; 3JB9 F; 5LJ5 f; 1WHG A; 2K9G A; 2OI3 A; 4M7A G; 3VUZ A; 4NS5 A; 4RTT A; 5GAN 8; 1Q86 C; 1AWX A; 4ZNX A; 1YHQ T; 3HL8 A; 2RM4 A; 1VQP T; 4CRI A; 1AEY A; 1VQ9 A; 4WF2 A; 3G1J A; 1YI2 Q; 2BE7 D; 2QA4 A; 1D0X A; 4N4I A; 2X4W A; 1MMA A; 1VQL Q; 2F2V A; 3CCV A; 3I55 T; 5LJ5 j; 2DD5 A; 4LN2 A; 1VQ6 A; 1VYT A; 4RTX A; 1LOJ A; 1IXD A; 2QEX Q; 1WJS A; 2RN8 A; 4LDW A; 4PJO F; 4N4G A; 2HZY A; 4PLI A; 2LJ1 A; 1IRX A; 4X1V A; 3CCU A; 4PFO A; 1BI1 A; 1X6B A; 1WQ7 A; 3SEM A; 4C0F A; 3M0R A; 2ZAE A; 1V1C A; 3PMI A; 1WNL A; 2YUO A; 2J6K A; 4JDS A; 3MEV A; 3AT1 B; 4XTU A; 5KYX B; 3PT9 A; 4XTW A; 2IPO B; 3CC2 A; 3QUI A; 2YT6 A; 2QG9 B; 4J9D A; 1YFN A; 3A5Z B; 1PG5 B; 1T3S A; 1G83 A; 2EJF A; 2MCN A; 2PQW A; 4EMG A; 3CXC P; 2F5K A; 3DKM A; 1K73 R; 3OYL A; 3CCL Q; 3BY7 A; 4M75 G; 2LT1 A; 3VYH B; 4OMF B; 2O4X A; 2FZK B; 5LJ3 g; 5I21 A; 1N6A A; 5IHI A; 5GAN 7; 2PUO B; 1X2K A; 2Y90 A; 3LX7 A; 4FT4 A; 3OB9 A; 1C0M A; 2Y4Y A; 3DLL A; 4LUE A; 4KUI A; 1Q7Y U; 1WZO A; 4PJO A; 3X26 B; 2Z0W A; 3P8H A; 4BE0 A; 4J9C A; 3I56 T; 2L0A A; 5DY9 A; 2DZ9 A; 2JM9 A; 3GF5 A; 4M77 C; 2CS7 A; 2KE9 A; 2AT1 B; 4N0A C; 4OML A; 5GMK h; 4Y91 A; 4PKC C; 1H3H A; 2DZC A; 3L2R A; 2DXB A; 1BI3 A; 3OYN A; 1H8K A; 1MHN A; 4Z89 A; 1JQQ A; 2CT3 A; 4OB1 B; 2HDA A; 4C8Q A; 4GBQ A; 3V8L A; 3GNG A; 1OZ3 A; 4P5N A; 4RTV A; 3LYI A; 4OMM A; 4A4E A; 2RA2 A; 2HKN A; 1YIJ A; 3JRZ A; 3HTR A; 2FL7 A; 1GRI A; 2DA9 A; 2GBQ A; 1KJW A; 2R5A A; 1I8F A; 1D1C A; 3A8G B; 1YHQ A; 2HKQ B; 1VQP A; 3LLR A; 3JCM g; 5A0L A; 3REB B; 1K73 C; 3JB9 D; 2JOY A; 1VUB A; 3GLX A; 1ZA1 B; 2CH4 W; 3I55 A; 3GNF B; 1FX7 A; 1YCY A; 4PLL A; 2RHZ A; 4DBF A; 4R56 A; 4IUV A; 5KCO A; 2ABL A; 2ZPF B; 1K9M U; 2DBM A; 2VAS A; 4MMK A; 3CXC A; 2BZY A; 4LDU A; 3JB9 J; 7AT1 B; 1RUW A; 3H0I A; 3HPW A; 1WHM A; 2HQH A; 2I2L A; 3G71 Q; 1OX8 A; 2X4Y A; 4XU0 A; 4LE9 A; 5CIU A; 2DBK A; 1NYF A; 2X9H A; 4PJO D; 3EH1 A; 5CR2 A; 3M53 A; 4TVR A; 4JJB A; 4ZGE B; 1PD0 A; 3NGP A; 1QQJ A; 1VQ5 T; 3E9G A; 3CC7 T; 1VQN T; 3EAE A; 2FRW A; 3PMT A; 2MF2 A; 1OZ2 A; 2GFU A; 3RIR A; 2RI5 A; 3VUB A; 3LH0 A; 1ZQ1 A; 2F2X A; 4FYY B; 3OS2 A; 1ZBJ A; 3CCJ Q; 4MML A; 1JO8 A; 2HSE B; 4C8Q D; 4ANJ A; 1R77 A; 4KT0 E; 2CKK A; 3CCM T; 4IIO A; 1TG0 A; 1YJW Q; 1AWJ A; 4D8K A; 2OTL Q; 2V26 A; 1RLQ C; 2DYI A; 2KRS A; 3I56 A; 4BY6 B; 3L42 A; 4Y28 E; 4BAC A; 1OU9 A; 3EG1 A; 2VV5 A; 2P84 A; 1AT1 B; 2LMJ A; 4F17 A; 3CCS T; 1K0S A; 3ZFJ A; 1SG5 A; 2E5Q A; 2XIC A; 3C12 A; 1WHL A; 2E41 A; 2IIM A; 1VQO T; 2DER A; 1Y57 A; 1XTD A; 2WAC A; 2L8D A; 2D1X A; 1M8V A; 2EWN A; 4MZP A; 2ECZ A; 1VQ9 Q; 4PFZ A; 1UGR B; 1RAG B; 1TU0 B; 2K3B A; 4CC2 A; 3CPF A; 5IXF A; 1BK2 A; 4OB2 B; 4EMH A; 2O88 A; 4J83 A; 4NL3 A; 4C0G A; 3CCV Q; 3INZ A; 2O4X B; 1VQ6 Q; 4PJJ A; 1X6O A; 4Q5W A; 2DYB A; 2EPD A; 2L3R A; 3BE3 A; 2CP3 A; 1G3Y A; 3VV0 A; 2DET A; 1RAA B; 4BB7 A; 2EQU A; 2RJE A; 2RNA A; 3CCU Q; 1U1T A; 1E6G A; 1ZHI A; 2VKN A; 1H92 A; 4PJO B; 3CD6 Q; 2ZGW A; 4B6M A; 3RKX A; 4M7A F; 3JCM f; 3OYC A; 2C0T A; 5FLX E; 2PZ1 A; 1YI2 A; 3G7Z A; 2A37 A; 2M1H A; 1N27 A; 1VQL A; 4RTY A; 3A1P A; 1SKU B; 1BBZ A; 3T9N A; 3QXE B; 1N8R U; 4CC7 A; 1E7O A; 1G3T A; 3SFM A; 2QEX A; 1AOJ A; 5C6S A; 4FYW B; 1M30 A; 2IG0 A; 1YIT T; 3PIP A; 4GLK A; 3M4G A; 4L5G A; 8ATC B; 4C8Q B; 5KYN A; 3GOX A; 1AHJ B; 4RG2 A; 2HL5 C; 1M2O A; 3C94 A; 5GAO p; 2E12 A; 1TUG B; 4HCZ A; 4ZN1 A; 1VQ5 A; 3NPF A; 2EJ9 A; 3CC7 A; 1FYN A; 5I2S A; 4BE2 A; 5GAM d; 2QK0 A; 4E7Z A; 2KEA A; 3ULR B; 1AZG B; 2DF6 A; 1NEG A; 2JTE A; 5GAM e; 4CI0 C; 4F7U G; 4JS4 A; 5GAN 3; 2ROT A; 4M7A A; 4EMK A; 4MDX A; 2V8J A; 2XMF A; 5KCH A; 3M59 A; 3QJY A; 5GMK m; 2ATC B; 2K3X A; 4M75 F; 1TS9 A; 5GMK i; 2HEQ A; 1X69 A; 2VYT A; 1BYM A; 3QZ5 B; 1UEB A; 1WDX A; 1QP2 A; 3S3O A; 2KRO A; 1WHK A; 2QAS A; 1M90 R; 2PTK A; 2C0I A; 1WJQ A; 4M7D E; 4FW2 A; 1OV3 A; 5KE2 A; 5GJW B; 2P0Q A; 4E7K A; 3QII A; 4CC3 A; 3WVE B; 1U8R A; 3M0S A; 5LJ5 g; 3H9N A; 3VS5 A; 4MZM A; 4N4H A; 1VQO A; 5IT9 E; 3TRE A; 1AWW A; 1YHQ Q; 4RTU A; 3C0C A; 1ZSG A; 1VIF A; 1VQP Q; 3P8D A; 1Q81 R; 5GAO q; 4HKE A; 3X28 B; 3OSV A; 2DIL A; 4RCC A; 3FEO A; 2DTH A; 3EG0 A; 1W1F A; 2WSC E; 3I55 Q; 1GXI E; 1MNE A; 4XU3 A; 4E2F B; 1VQ4 T; 2X51 A; 4C8Q C; 4OMO A; 3A98 A; 2XDB A; 4M75 A; 4XTX A; 2QYZ A; 1GCQ A; 4QVC A; 2KSS A; 1JBM A; 2JMC A; 4Z88 A; 1UJ0 A; 2DPP B; 5FU7 C; 4X34 A; 1KC8 R; 1TOV A; 5CKB A; 1RI9 A; 2LX9 A; 4OMP A; 2DIG A; 2L89 A; 2CT4 A; 4OP0 A; 1WHJ A; 2CP7 A; 1TSF A; 3MP1 A; 2E3H A; 2QI2 A; 5IH2 A; 2R58 A; 3A8O B; 3J80 E; 1VYV A; 5A0D A; 4J5Y A; 2CUB A; 3OS1 A; 4ESR A; 1IHV A; 4O5V A; 1C1A A; 2XK0 A; 1AD5 A; 2DXU A; 3HRU A; 3E9F A; 2LQK A; 4PNO A; 2V1R A; 4LD6 A; 3HHT B; 4M7A D; 2KYB A; 4E47 A; 4KH0 B; 2LZ6 B; 4C0D C; 1T3L A; 1UJY A; 5J3B A; 1YIT A; 2K6D A; 4F14 A; 1YCS B; 3OYD A; 1NJI R; 4OGC A; 1M90 C; 1XOV A; 5L8R E; 2ZCF B; 3G71 A; 1JXM A; 1GFD A; 2M51 A; 5GAN 4; 1LJO A; 2DL5 A; 5M9O A; 2VGM A; 3HP9 A; 3IQL A; 1CSK A; 5GMK j; 1SSH A; 2K57 A; 3OMC A; 3CCR T; 2O2O A; 1HSQ A; 1PKT A; 3I56 Q; 2MWP A; 3SB2 A; 1PSE A; 1LPL A; 3CME T; 5IN1 A; 3JCM W; 1K8A R; 1C6V X; 1Q81 C; 3EH2 A; 2SRC A; 3SWN C; 2A36 A; 2X3W D; 1OUL A; 4HVW A; 3ER0 A; 3QYG B; 4R0K A; 4J8O A; 3E1S A; 3MEW A; 2BZX A; 1D3B A; 1K0X A; 2KT8 A; 2FYK A; 4KH1 B; 2A28 A; 1SRL A; 4FT2 A; 5EC7 A; 1SF9 A; 2RJF A; 5CO7 A; 3QSU A; 4EPC A; 4PL6 A; 2EYQ A; 4J9G A; 2B86 A; 4M75 D; 2JVV A; 3NFC A; 2WSF E; 2FRY A; 2D0N A; 4JJN K; 1YN8 A; 1MMG A; 1QCF A; 5DLO A; 3NTH A; 2FO0 A; 4RCB A; 2HL3 A; 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