The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
56
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structure length |
56
|
Chain Sequence |
TFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGQTGYIPSNYVAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
C-SRC TYROSINE KINASE SH3 DOMAIN
|
| publication title |
Two binding orientations for peptides to the Src SH3 domain: development of a general model for SH3-ligand interactions.
pubmed rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Complex (signal transduction/peptide)
|
| total genus |
6
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1994-10-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| C | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AWO A; 2RN8 A; 5L23 A; 2XMF A; 1J3T A; 1BU1 A; 5ECA A; 3LH5 A; 2F2X A; 4RTX A; 1WXT A; 4AFQ C; 1NYF A; 1BK2 A; 1OPL A; 1ZX6 A; 1KIK A; 3NMZ C; 2LJ0 A; 1ZSG A; 2CDT A; 2PZ1 A; 1K76 A; 4RUG A; 1E6H A; 2LQW A; 2CSQ A; 4D8K A; 3M0Q A; 1MUZ A; 1X2Q A; 2KRN A; 1OEB A; 2OJ2 A; 3H0H A; 1BB9 A; 2O9S A; 4CC7 A; 2EBP A; 2X3X D; 2DL3 A; 1CSK A; 1TUD A; 1T0J A; 1ZLM A; 1WXB A; 2K3B A; 1PNJ A; 1H3H A; 1KSW A; 2MOX A; 1PHT A; 2KR3 A; 1RLP C; 1YN8 A; 2D1X A; 2J05 A; 2KT1 A; 1WLP B; 2EYX A; 1YWP A; 2PNI A; 3JV3 A; 2V1R A; 4J9C A; 3TVT A; 3EHR A; 3O5Z A; 2CT4 A; 2A37 A; 4CC4 B; 2EQI A; 2MCN A; 2DRM A; 2FPD A; 4KRT A; 1BBZ A; 4RTW A; 1SRL A; 2K7A A; 3EG2 A; 4RTV A; 1I07 A; 4DEX A; 2KNB B; 2DBM A; 1E7O A; 2RQR A; 3QWY A; 1PWT A; 2A36 A; 1PKS A; 2C0O A; 1QLY A; 1JXO A; 4J9G A; 3REB B; 2LNH B; 4LN2 A; 2HCK A; 2KE9 A; 1LCK A; 2AKL A; 1I1J A; 2BZY A; 3ZL7 C; 1X6B A; 4E6R A; 1W70 A; 5IHK A; 2ED1 A; 4GLM A; 2EPD A; 1K4U S; 3RBB B; 1M3C A; 4HXJ A; 4OMN A; 2DLP A; 2LCS A; 1ARK A; 1Y0M A; 4JZ4 A; 1SHG A; 3THK A; 1UFF A; 2L0A A; 2P4R A; 2EYY A; 4HCK A; 4Z89 A; 2VWF A; 2J06 A; 3PVQ A; 2W10 A; 1MV0 B; 2O31 A; 3M0U A; 1UDL A; 1GCP A; 2PTK A; 2JM8 A; 2DL5 A; 3VRZ A; 2EGC A; 2ED0 A; 2FRY A; 4R0K A; 3CQT A; 1AOJ A; 4GBQ A; 2KRS A; 2SEM A; 1AWJ A; 2H8H A; 2JTE A; 3M0P A; 1SEM A; 2NWM A; 1NG2 A; 1N5Z A; 2GTJ A; 1M8M A; 2LP5 A; 3M0S A; 2YUO A; 2FEI A; 3EGU A; 2KT8 A; 1YNZ A; 2F2W A; 3M0R A; 1W6X A; 1UJY A; 1VYT A; 3RNJ A; 3REA B; 1Z9Q A; 1X2K A; 4LNP A; 4JJC A; 3VS5 A; 1CKA A; 4OMQ A; 1M27 C; 4K11 A; 5GJW B; 2KRM A; 1Y57 A; 4LUE A; 4J9F A; 2FO0 A; 2MIO A; 2C0T A; 4WCI A; 1OPK A; 4Z8A A; 1XOV A; 4ZNX A; 3I5R A; 1UGV A; 4A63 B; 1IO6 A; 4CC3 A; 3VRY A; 2YSQ A; 2DL7 A; 1YWO A; 1CKB A; 1PRL C; 3EHQ A; 2I0N A; 4JZ3 A; 1T3S A; 1JQQ A; 3NPF A; 2KRO A; 2J7I A; 2DRK A; 1AD5 A; 1OOT A; 5FWC A; 3NGP A; 2DJQ A; 2GTO A; 1MV3 A; 5EC7 A; 4Y92 A; 2KBT A; 2RQU A; 1SSH A; 2HDA A; 1M3B A; 1H8K A; 1JU5 C; 2JMC A; 2YT6 A; 5IXF A; 2CRE A; 1X43 A; 1I0C A; 2AK5 A; 1UEC A; 4AG1 C; 3VS6 A; 2OI3 A; 1RI9 A; 2EYZ A; 5IHN A; 1U06 A; 2CH4 A; 3A98 A; 4J9E A; 2JMA A; 2G6F X; 2A08 A; 2GNC A; 1AZG B; 3VS3 A; 2IIM A; 1M30 A; 1TG0 A; 2DMO A; 2AZV A; 1UHF A; 2O9V A; 2ENM A; 4X1V A; 1K0S A; 4QT7 A; 1W1F A; 1UE9 A; 4LUD A; 4OMO A; 4RTZ A; 1FMK A; 1T0H A; 2FRW A; 4D8D A; 3VS0 A; 3I9Q A; 2L3Q A; 2CSI A; 3TSW A; 2L3S A; 1SRM A; 1GBR A; 3QWX X; 3VS4 A; 1VYV A; 2DYB A; 5FW9 A; 4OML A; 4JPB W; 1NLO C; 3PVL A; 1UTI A; 2L3P A; 2ROL A; 2DL4 A; 1ZUU A; 2LX7 A; 3VS1 A; 1WFW A; 5HCK A; 2YDL A; 1WI7 A; 3IQL A; 1QKW A; 1PRM C; 2CUD A; 5I11 A; 2DIL A; 1WYX A; 2J6O A; 2RNA A; 1K0X A; 4AG2 C; 4HVW A; 1YCS B; 4RTT A; 3EG0 A; 4IIO A; 1SHF A; 4HVU A; 2BZ8 A; 4EIK A; 1QCF A; 2JM9 A; 1AVZ C; 4AFS C; 4JJD A; 2DF6 A; 5IHI A; 2KEA A; 2DX1 A; 4F14 A; 2KYB A; 2GGR A; 1GBQ A; 2RQW A; 3R6N A; 2JS2 A; 2DA9 A; 2KYM A; 1NEG A; 1YP5 A; 1GFD A; 1RLQ C; 2DL8 A; 1WIE A; 1JEG A; 1M3A A; 1NLP C; 1AWW A; 2LQN A; 3UA7 A; 2NUZ A; 2DM1 A; 2ECZ A; 1OV3 A; 1G83 A; 3VS7 A; 5FWB A; 2EGE A; 4OMP A; 2HSP A; 2K6D A; 3TSZ A; 2M0Y A; 1K9A A; 3EG3 A; 4RTY A; 1U3O A; 4CC2 A; 3UA6 A; 1NM7 A; 2K9G A; 1HJD A; 2L2P A; 1G2B A; 2B86 A; 2ROT A; 2W0Z A; 3KFV A; 2V1Q A; 2D8J A; 2DNU A; 2O2O A; 3PE0 A; 3SEM A; 2C0I A; 2RPN A; 4AFZ C; 2KXC A; 2A28 A; 1VA7 A; 1ZUK A; 1ZUY A; 1KFZ A; 2EGA A; 4F16 A; 2RF0 A; 2GBQ A; 3C0C A; 3H41 A; 2M51 A; 2ABL A; 4J9B A; 1V1C A; 4AFU C; 2J6F A; 1NEB A; 2KGT A; 2KXD A; 1ZBJ A; 4Z88 A; 4RTU A; 4HVV A; 3GBQ A; 1GRI A; 2JT4 A; 1HSQ A; 1SPK A; 2D0N A; 1H92 A; 1WDX A; 5IH2 A; 2BTT A; 4IIM A; 1K1Z A; 2BZX A; 4LE9 A; 1GL5 A; 2LMJ A; 2VVK A; 1ABO A; 2YUP A; 2RQT A; 4F17 A; 2ESW A; 3ULR B; 4M4Z A; 1B07 A; 2YUQ A; 1FYN A; 1U5S A; 1GCQ C; 1WXU A; 2JW4 A; 1WA7 A; 2FG0 A; 3UAT A; 1ABQ A; 1UUE A; 1B3Q A; 1AWX A; 4J9H A; 2OAW A; 4ORZ A; 3UF4 A; 2JXB A; 2QDL A; 2EW3 A; 1T3L A; 4J9D A; 1RUW A; 2GQI A; 2E5K A; 2EKH A; 2CUB A; 1UHC A; 1UJ0 A; 3M0T A; 2LJ1 A; 3NHN A; 2DBK A; 3H0F A; 4FSS A; 2EVR A; 2HEQ A; 1KJW A; 1A0N B; 2LJ3 A; 4J9I A; 1TUC A; 3H0I A; 1EFN A; 2X3W D; 2CH4 W; 1E6G A; 3EG1 A; 1AEY A; 1X27 A; 2D8H A; 2JS0 A; 2LZ6 B; 1NYG A; 2RQV A; 2K79 A; 1VYU A; 1HD3 A; 2DE0 X; 2RMO A; 1X6G A; 2O88 A; 3VS2 A; 1PKT A; 1S1N A; 2HBW A; 1X69 A; 2CT3 A; 4JJB A; 2F2V A; 1GCQ A; 3SHW A; 1JXM A; 2EYW A; 1UG1 A; 2VKN A; 1QWF A; 2YUN A; 1Z9Z A; 1AZE A; 3I5S A; 3U23 A; 2J6K A; 5I22 A; 5GJV B; 4DEY A; 1GFC A; 3FJ5 A; 1JO8 A; 1QWE A; 2FPE A; 4ESR A; 5IXB A; 2AKK A; 4OMM A; 2SRC A; 2AZS A; 3I35 A; 1WX6 A; 2DVJ A; 2K2M A; 2FPF A; 1QKX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5IN1 A; 2XMF A; 3CCU A; 3RMS A; 1OI1 A; 1M90 C; 4C92 E; 3LH5 A; 4RTX A; 2E64 A; 1TU0 B; 1VQ7 A; 3G6E A; 1NYF A; 1OPL A; 3J81 E; 2ZAE A; 4BY6 B; 1R77 A; 1C6V X; 3H0H A; 4AMC A; 3JCM W; 4C8Q F; 2QI2 A; 4XTY A; 5LJ3 j; 1M90 U; 4CC7 A; 3N5B B; 2X3X D; 4X9C A; 3QZ5 B; 1TUD A; 2MI6 A; 3EGD A; 2X4Y A; 4A4K A; 2GF7 A; 5KYX B; 1S72 Q; 1WJR A; 4MML A; 2KT1 A; 1WLP B; 4XTX A; 1MGQ A; 1YIJ Q; 3S3M A; 2RA2 A; 5LJ5 g; 2V1R A; 4C92 A; 5I2M A; 5LL6 S; 3CCR T; 3MJX A; 2CT4 A; 2EQI A; 4M7A B; 3NFC A; 2QGF B; 1BBZ A; 4C0Z A; 2L5Q A; 4C8Q C; 3BY7 A; 4DEX A; 3CCM T; 1EIF A; 1PD1 A; 5IAY A; 3QDR B; 3V8L A; 1W2B A; 2O01 E; 1YIJ T; 4IUP A; 4C8Q E; 2C0O A; 3OMG A; 1JXO A; 3REB B; 2HQE A; 1LCK A; 1VQP Q; 1I1J A; 3VJP A; 3ZL7 C; 1X6B A; 2Y4X A; 4E6R A; 2EJ9 A; 1W70 A; 1QVP A; 1WHJ A; 1R0C B; 4C92 D; 3HRS A; 4R55 A; 2DLP A; 2DEU A; 2OTL Q; 2JNG A; 1VQN A; 1UGS B; 3RER A; 1SHG A; 4J83 A; 2RJE A; 1UFF A; 2L0A A; 2P4R A; 4HCK A; 3PVQ A; 1MV0 B; 3M0U A; 1M8V A; 2DAQ A; 2PTK A; 4JRP A; 2JM8 A; 2DL5 A; 3RMQ A; 1F1B B; 1WZO A; 3CBP A; 5GAO r; 3UDC A; 2KRS A; 2SEM A; 3GOX A; 2H8H A; 4FYV B; 1SEM A; 4QW2 A; 4C8Q A; 2GTJ A; 3M0S A; 1BI1 A; 1MMN A; 1W6X A; 1UJY A; 4LD9 K; 1JJ2 P; 5GAN d; 4OF1 A; 3SWN C; 5GAN e; 2K5I A; 4BDY A; 4JLG A; 1M2V A; 1X2K A; 2AT1 B; 2XKO C; 4ZGJ B; 4AT1 B; 5CR2 A; 3L2U A; 3RKW A; 4J9F A; 2CP2 A; 4M7D F; 4JRI A; 4E2F B; 2QTV A; 1G3T A; 2XDB A; 4J8O A; 4MDW A; 4C5H A; 3I56 T; 2P84 A; 1T3S A; 1QW1 A; 4C8Q D; 3X20 B; 4EMK B; 4LDU A; 4L5G A; 5LJ5 j; 4XK8 E; 4A4H A; 1SSH A; 1U1S A; 3ZEH A; 1H8K A; 4ZGE B; 1JU5 C; 3A1P A; 2JMC A; 4ATO A; 5IXF A; 5GAN 2; 2CRE A; 4RCB A; 2LVM A; 4AG1 C; 3VS6 A; 3OMC A; 2OI3 A; 2FYK A; 3MP6 A; 3ASK A; 1PC0 A; 3LWH A; 1U06 A; 2CH4 A; 5CCA A; 3A98 A; 2GFU A; 4M7D C; 2JMA A; 3SWN A; 2GNC A; 5DLQ E; 1TG0 A; 4EPC A; 3CPW P; 1OX8 A; 2AZV A; 2ENM A; 2JOY A; 1N6A A; 1UE9 A; 4FL6 A; 1VQ4 T; 2K57 A; 1FMK A; 2JTM A; 5LJ3 f; 1KC8 C; 2PUO B; 5KCH A; 3OW2 A; 3V8J A; 4Y28 E; 3EGD B; 2DD5 A; 1BI2 A; 3MCA B; 3VS0 A; 2IG0 A; 2CP0 A; 1LOJ A; 4M75 G; 2L3S A; 1DJ7 B; 3QWX X; 3HRU A; 3TCJ A; 4C92 B; 1KC8 U; 3MEV A; 3QKJ A; 2WAC A; 3E1S A; 3OW2 S; 1FMW A; 3CCQ A; 3WVE B; 1G3W A; 2QEX A; 3X25 B; 1KQS A; 1WFW A; 4IUT A; 1VQK A; 2CKK A; 1Q7Y R; 2LCC A; 1QKW A; 1XNI A; 3E2U A; 2DIL A; 2RNA A; 4AG2 C; 3OYG A; 4HVW A; 3EG0 A; 1YJ9 Q; 2DIG A; 3OYK A; 1AVZ C; 4AFS C; 3VUZ A; 2QQS A; 3HPW A; 4JRQ A; 5HKC A; 5HK3 A; 1KQS S; 2RQW A; 2GGR A; 3E19 A; 3CD6 A; 4C0F A; 1VQO Q; 3CC4 Q; 1ZBX A; 2DA9 A; 2XU8 A; 2RJD A; 2LQK A; 3INZ A; 3JCM b; 1NEG A; 2XG8 D; 3CCS T; 1QVG P; 1VQ6 T; 2RK2 A; 1M3A A; 1NLP C; 3CC7 Q; 2JZ2 A; 4IUR A; 2NUZ A; 1TTH B; 2RHX A; 2VC8 A; 4MZP A; 2EGE A; 6AT1 B; 4OGC A; 3TSZ A; 4RTY A; 1K9A A; 2PQW A; 1U3O A; 2L89 A; 3CCJ A; 4N4I A; 2YRD A; 2FZG B; 4A54 A; 3O8V A; 4C8Q B; 2EJF A; 5M9O A; 3OYE A; 2QAZ A; 4E7L A; 1PSE A; 5KYY A; 1HK9 A; 2O2O A; 4JS4 A; 2RPN A; 1YBY A; 4ZN1 A; 3CC7 T; 4KUL A; 4A4F A; 4FYW B; 5AYF A; 1M2V B; 5GAN h; 4TVR A; 1ZUY A; 2EGA A; 1RAE B; 2K5F A; 3UPU A; 3QII A; 2GBQ A; 2KVQ G; 2X51 A; 3C0C A; 3H41 A; 2M51 A; 1GXI E; 2J6F A; 1NE8 A; 1ZBJ A; 4X34 A; 5GAN 6; 2QQA A; 3QPH A; 4EMH A; 1H92 A; 1WDX A; 3G4S A; 4C5I A; 5CKB A; 2LMJ A; 2ZCF B; 3OBW A; 4F17 A; 5LJ5 f; 2DZ9 A; 1U5S A; 1KK7 A; 2JW4 A; 2H3J A; 4BY6 C; 2FG0 A; 1X01 A; 2CP7 A; 1VIE A; 4FU6 A; 4J9H A; 2F69 A; 2PVD B; 3PMT A; 3SWN B; 4A4G A; 1TUG B; 1YIT T; 1K73 R; 4J9D A; 1T3L A; 4BI4 A; 1RUW A; 2GQI A; 3CCE T; 3NTI A; 3OB9 A; 1JJ2 S; 1Q95 G; 4PJO G; 3G71 A; 3M0T A; 1UJ0 A; 1VQ9 Q; 2COZ A; 5A0D A; 5GMK e; 3NHN A; 2EVR A; 3CC2 A; 3PGG A; 1KJW A; 5GAM g; 3RES A; 3ZFJ A; 1M2O A; 5HY6 A; 4BUG A; 1YJN A; 3OYB A; 3PTA A; 1D0Z A; 1YHQ T; 2LZ6 B; 4M7A C; 2RMO A; 2XI9 A; 1D0Y A; 1WHH A; 2O88 A; 4FT2 A; 3I55 A; 3OYI A; 3CME T; 2CT3 A; 1BCO A; 2DZC A; 2F2V A; 1BI0 A; 3SHW A; 5LJ3 d; 5LJ3 e; 2M02 A; 5FRM A; 3J80 E; 4E7Z A; 1UG1 A; 2VKN A; 2VYT A; 4MZM A; 1K8A C; 3CBO A; 7AT1 B; 1WNL A; 3FJ5 A; 1JO8 A; 1IGU A; 2AKK A; 1N9S A; 2SRC A; 3ER0 A; 5GAN 5; 3I35 A; 2K2M A; 1A0N B; 4C5G A; 1QKX A; 3OBY A; 3H9N A; 1K8A U; 3OYL A; 5ECA A; 4M75 F; 1WXT A; 1XJW B; 5L8R E; 3CXC A; 1VQM A; 1NPR A; 1BK2 A; 1KIK A; 3NMZ C; 1VQ8 T; 2LJ0 A; 3JCM Q; 2OTJ T; 1OU9 A; 1ZSG A; 3L1A A; 2QG9 B; 3H8Z A; 4RUG A; 1WGS A; 3CEY A; 4D8K A; 4DQ2 A; 2RH2 A; 4PJL A; 2KRN A; 1OZ2 A; 1BCM A; 3QDF A; 4IUU A; 3KXT A; 2DXB A; 5GAN 4; 1VQL A; 3OYY A; 5CQX A; 2DL3 A; 1CSK A; 1ZLM A; 2K3B A; 2RI5 A; 1LVK A; 1PNJ A; 2LT4 A; 1KSW A; 1PHT A; 2LC4 A; 2J05 A; 3VYH B; 5KYY B; 4M75 C; 3BDL A; 3JV3 A; 2KSS A; 1H64 1; 3QSU A; 3MO8 A; 3OQ5 A; 4ELZ C; 3TVT A; 3EHR A; 3CCL A; 4M75 E; 3O5Z A; 4CC4 B; 4RCC A; 2FHD A; 2BKD N; 3MKD A; 1Q7Y C; 1IZ6 A; 2K7A A; 3DB4 A; 1I07 A; 1FMV A; 2K3Y A; 2KK4 A; 1E7O A; 2A36 A; 2RHI A; 2QA4 Q; 2VAS A; 4J9G A; 2LNH B; 4LN2 A; 2KE9 A; 1LPL A; 1R0B G; 1VQ5 A; 1UGR B; 2A3L A; 1Q7Y U; 1QVG S; 5IHK A; 3CCU T; 1FWZ A; 3RBB B; 3CCV Q; 1VQ7 T; 4HXJ A; 3G6E T; 1KC8 R; 4OMN A; 3OYC A; 4JZ4 A; 3J7A F; 2HQH A; 1AHJ B; 2NLU A; 2EYY A; 4M75 A; 4BI3 A; 1MND A; 2VWF A; 1SG5 A; 1UDL A; 2V26 A; 3SDZ A; 2IVW A; 4HCZ A; 2BE7 D; 3QHS A; 2F1L A; 4XU2 A; 3UT1 A; 4D6W A; 5LJ5 d; 5LJ5 e; 1PD0 A; 1AWJ A; 2JTE A; 4BE0 A; 1N5Z A; 2LP5 A; 1YNZ A; 3OW2 P; 5GMK h; 2H3E B; 3X26 B; 3QXE B; 4C92 C; 2R5A A; 1HYO A; 4OVA A; 1Z9Q A; 4LNP A; 1CKA A; 3V7R A; 2DXC A; 3GPL A; 4OMQ A; 3EG9 A; 4M75 D; 1M27 C; 2AIR B; 2K4Y A; 4LUE A; 4ANJ A; 3CMA A; 2LDM A; 3RR6 A; 2ZPH B; 2C0T A; 5GMK i; 4LDV A; 1XOV A; 4ZNX A; 4J7F A; 1UGV A; 4PFZ A; 4A63 B; 1IO6 A; 5CVI A; 3VRY A; 4BAC A; 2YSQ A; 1CKB A; 3EHQ A; 1KQS P; 2EIF A; 1BIB A; 2I0N A; 4JZ3 A; 4LDY A; 3V7C A; 5LJ3 h; 1AD5 A; 3CCR Q; 5FWC A; 2GTO A; 3JRZ A; 3HP9 A; 2KBT A; 2RQU A; 5KYU A; 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