The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
60
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structure length |
60
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Chain Sequence |
HEQTHRAIFRFVPRHEDELELEVDDPLLVELQAEDYWYEAYNMRTGARGVFPAYYAIEVT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Rattus norvegicus
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| publication title |
A unique set of SH3-SH3 interactions controls IB1 homodimerization
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
C-jun-amino-terminal kinase interacting protein 1
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| total genus |
14
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| structure length |
60
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| sequence length |
60
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M0T A; 1JXO A; 3EG2 A; 2C0I A; 3M0R A; 3FJ5 A; 3VRZ A; 5IHN A; 2PTK A; 2GGR A; 1X27 A; 2PNI A; 1WDX A; 1T0J A; 2L3Q A; 1VYU A; 1OEB A; 2DX1 A; 3VS4 A; 2VVK A; 4F17 A; 4J9D A; 2NWM A; 1ZUY A; 2EYZ A; 2EGC A; 2HSP A; 1H92 A; 1K0S A; 2LMJ A; 4OMP A; 4RTX A; 2F2W A; 2YDL A; 3EG3 A; 1WXT A; 3THK A; 1VA7 A; 4HXJ A; 2JXB A; 2GQI A; 2YUO A; 3M0S A; 4AG1 C; 1X2Q A; 1XOV A; 1K0X A; 1A0N B; 2J6O A; 1QWE A; 2J7I A; 2RQW A; 4J9H A; 2D8J A; 1E7O A; 3ZL7 C; 1KSW A; 3TSZ A; 1UEC A; 1Y0M A; 1SSH A; 4JPB W; 1QCF A; 4JZ4 A; 3UAT A; 1UGV A; 1UJ0 A; 1JQQ A; 3I5R A; 2FPF A; 1JU5 C; 1SHG A; 2VWF A; 1X2K A; 1SHF A; 1T3L A; 1ABQ A; 2W0Z A; 5HCK A; 1I1J A; 2VKN A; 2AZS A; 2YUQ A; 3EG0 A; 1M3B A; 5GJV B; 2V1R A; 2CH4 W; 2HCK A; 3CQT A; 4LUE A; 2J6F A; 1CKB A; 2V1Q A; 4GBQ A; 3NHN A; 1RLQ C; 2DNU A; 2EYX A; 5I11 A; 4CC7 A; 2K3B A; 1HJD A; 1WLP B; 1K4U S; 2EBP A; 3R6N A; 3QWY A; 2YT6 A; 2JM8 A; 2KT8 A; 2JS0 A; 4JZ3 A; 1JXM A; 5FWC A; 1AVZ C; 3RBB B; 2DJQ A; 1K9A A; 2CH4 A; 2L0A A; 2LJ3 A; 1UDL A; 4QT7 A; 5EC7 A; 2BZ8 A; 1JO8 A; 1NLP C; 2DL3 A; 3PVL A; 4RTY A; 2KNB B; 4HVV A; 1QKX A; 1FMK A; 2JTE A; 4DEY A; 5IXB A; 2KEA A; 4HCK A; 1GRI A; 2DMO A; 3SHW A; 1PNJ A; 1K76 A; 1AD5 A; 2M0Y A; 1ZLM A; 4OMO A; 3TSW A; 2LJ1 A; 2D8H A; 2G6F X; 2EYW A; 4J9B A; 2KT1 A; 2LQW A; 2CSQ A; 1X69 A; 2LX7 A; 1IO6 A; 3SEM A; 3PVQ A; 1PKS A; 2F2V A; 1YCS B; 1WXU A; 3REB B; 1UG1 A; 2A28 A; 2CDT A; 2L2P A; 4AG2 C; 3UA6 A; 2DYB A; 4JJB A; 2EW3 A; 1G2B A; 4Z88 A; 2K9G A; 2KR3 A; 1BBZ A; 4E6R A; 2ROT A; 2D0N A; 2EKH A; 1CKA A; 3C0C A; 4J9C A; 5IHK A; 1FYN A; 2X3X D; 4RTZ A; 2M51 A; 2A08 A; 1GL5 A; 2CUD A; 1UE9 A; 3I35 A; 3IQL A; 3PE0 A; 1SRL A; 3LH5 A; 1GCP A; 2L3S A; 1M8M A; 1AWO A; 1RUW A; 1LCK A; 2O9S A; 4OML A; 1S1N A; 2DIL A; 2JM9 A; 2DL5 A; 4IIM A; 2ESW A; 2FEI A; 5ECA A; 1ABO A; 2FG0 A; 3I5S A; 2C0O A; 2DBK A; 3QWX X; 1YP5 A; 1WXB A; 1X43 A; 4J9G A; 1ZUU A; 2FO0 A; 2DLP A; 2ED1 A; 2KRS A; 4EIK A; 1M3A A; 1X6B A; 2CT3 A; 2DL8 A; 1GCQ C; 1NEG A; 1UTI A; 1WX6 A; 5IH2 A; 1E6G A; 1TUD A; 2LQN A; 2NUZ A; 3RNJ A; 1W6X A; 1T0H A; 1U06 A; 4CC4 B; 3A98 A; 1X6G A; 1SEM A; 1M3C A; 5IHI A; 4LUD A; 2RN8 A; 2QDL A; 1TG0 A; 1TUC A; 1YNZ A; 2JMC A; 4R0K A; 1HSQ A; 1W1F A; 1I07 A; 1U5S A; 1YWP A; 2GTJ A; 4JJC A; 1UFF A; 1AOJ A; 4M4Z A; 2AK5 A; 3VS3 A; 3VS2 A; 3U23 A; 1KJW A; 4LN2 A; 3EG1 A; 4ZNX A; 1ZSG A; 2RF0 A; 2E5K A; 1KIK A; 3O5Z A; 2RQV A; 3H0I A; 1MV0 B; 4X1V A; 2YUP A; 4FSS A; 2EVR A; 1AZE A; 2EGA A; 4K11 A; 5GJW B; 3REA B; 1E6H A; 5FWB A; 1M30 A; 2CRE A; 2P4R A; 2FRW A; 2HDA A; 4Y92 A; 1Z9Z A; 1GBR A; 2IIM A; 4AFQ C; 2LNH B; 2HEQ A; 4J9F A; 1NM7 A; 1WFW A; 2KXC A; 5I22 A; 2EYY A; 1GBQ A; 2K7A A; 3NPF A; 1PHT A; 2OI3 A; 1CSK A; 1AWJ A; 1BK2 A; 1KFZ A; 4D8K A; 2DL4 A; 2DRM A; 3VS6 A; 2BTT A; 4KRT A; 3VS7 A; 1MV3 A; 2AZV A; 2FRY A; 2HBW A; 2LJ0 A; 1ARK A; 2KGT A; 1RI9 A; 2O2O A; 2J6K A; 1AWW A; 2JS2 A; 3I9Q A; 1UJY A; 1ZBJ A; 2CSI A; 2DRK A; 2XMF A; 3NGP A; 1G83 A; 2JW4 A; 2AKK A; 4ESR A; 3H0F A; 3UF4 A; 5L23 A; 2EPD A; 4IIO A; 2H8H A; 3GBQ A; 1OPK A; 2GTO A; 2K2M A; 3EHR A; 1NYG A; 2RQU A; 3EGU A; 3KFV A; 2X3W D; 2C0T A; 2ENM A; 1ZUK A; 2F2X A; 3VS5 A; 1ZX6 A; 4RTV A; 2A37 A; 4RTW A; 2KXD A; 1V1C A; 1NYF A; 1UHF A; 2B86 A; 1Y57 A; 2LCS A; 4Z8A A; 1GFD A; 1MUZ A; 1T3S A; 2DVJ A; 4HVW A; 1BB9 A; 2KRO A; 2KRM A; 3ULR B; 1I0C A; 2OJ2 A; 3VS0 A; 2GNC A; 2ABL A; 2PZ1 A; 2JT4 A; 3JV3 A; 2AKL A; 1PWT A; 2GBQ A; 4D8D A; 2DF6 A; 3EHQ A; 1SRM A; 3VRY A; 1VYV A; 2MOX A; 1PRM C; 2FPD A; 4J9E A; 1GCQ A; 1B3Q A; 4WCI A; 2LP5 A; 2CUB A; 2K79 A; 1NEB A; 2KYB A; 3NMZ C; 2W10 A; 2O9V A; 4J9I A; 1VYT A; 2DBM A; 4RTU A; 4CC3 A; 1N5Z A; 2A36 A; 1PKT A; 1NG2 A; 2O31 A; 3M0U A; 2KE9 A; 2EGE A; 4RTT A; 4GLM A; 2RQT A; 1K1Z A; 1H8K A; 1WA7 A; 4ORZ A; 1U3O A; 4AFU C; 3VS1 A; 1GFC A; 3H0H A; 1UHC A; 1AZG B; 1QKW A; 4LNP A; 2JMA A; 1WIE A; 2ECZ A; 2J05 A; 1M27 C; 1QWF A; 1JEG A; 2LZ6 B; 4Z89 A; 2YUN A; 2RNA A; 2MIO A; 2RQR A; 4F14 A; 1EFN A; 4AFS C; 4OMN A; 3UA7 A; 2MCN A; 1NLO C; 3H41 A; 2O88 A; 1B07 A; 2FPE A; 2BZY A; 4OMQ A; 1OV3 A; 4F16 A; 2KRN A; 2D1X A; 2DL7 A; 4DEX A; 1WI7 A; 1J3T A; 1SPK A; 4HVU A; 2ED0 A; 2YSQ A; 1Z9Q A; 2CT4 A; 1AEY A; 2SEM A; 4OMM A; 4JJD A; 3M0P A; 1H3H A; 1UUE A; 2SRC A; 1QLY A; 2BZX A; 2KYM A; 2I0N A; 1YWO A; 1BU1 A; 1HD3 A; 2EQI A; 1OOT A; 3TVT A; 2RPN A; 5FW9 A; 2ROL A; 2DA9 A; 4RUG A; 2RMO A; 1AWX A; 1W70 A; 2K6D A; 4A63 B; 4CC2 A; 1WYX A; 1OPL A; 2KBT A; 2J06 A; 1RLP C; 2DM1 A; 4AFZ C; 2L3P A; 1PRL C; 3M0Q A; 5IXF A; 2DE0 X; 1YN8 A; 4LE9 A; 2OAW A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5CQX A; 3N5B B; 1JXO A; 1QP2 A; 2C0I A; 2PU9 B; 5IHN A; 1UGS B; 1RAE B; 2DAQ A; 4ZTJ A; 1S72 Q; 1UB4 A; 4X9C A; 1VYU A; 1VQM A; 3I56 Q; 2BE9 B; 3V7R A; 1F1B B; 3RMS A; 2QYZ A; 4RTX A; 4MDX A; 4F7U A; 2YDL A; 4HXJ A; 3KUF A; 2GQI A; 2GQV A; 1M90 U; 1IHW A; 3L2R A; 2J6O A; 5AYF A; 3CME Q; 3CD6 Q; 4J9H A; 2D8J A; 1YI2 A; 4FT4 A; 4DQ2 A; 1QCF A; 1UJ0 A; 4C8Q G; 3I5R A; 2FPF A; 2FVU A; 1SHG A; 1T3L A; 4IUT A; 1K8A R; 2DZ9 A; 3EG0 A; 5HKC A; 2RHI A; 1U8R A; 2CH4 W; 3CQT A; 4XTW A; 4LUE A; 2HL3 A; 1CKB A; 2V1Q A; 1OX9 A; 3NHN A; 1RLQ C; 3CCM Q; 2QXF A; 3CC7 Q; 1WLP B; 1KK7 A; 2YT6 A; 4FW2 A; 3SDZ A; 4CI0 C; 1JXM A; 2X4W A; 3INZ A; 2NUP A; 2L0A A; 2QAZ A; 8AT1 B; 1MMN A; 4C8Q A; 4C92 C; 2LJ3 A; 3OS2 A; 2RK1 A; 1VQ6 Q; 4QQ6 A; 4M77 G; 2X35 A; 1JO8 A; 2FZC B; 1VQP A; 2IVW A; 3OS1 A; 3OYY A; 4BE2 A; 3QUI A; 1WNL A; 4DEY A; 1M1K C; 3E2U A; 1AD5 A; 5HK3 A; 1ZLM A; 1Q7Y U; 3QDR B; 2D8H A; 2CZ1 B; 4E7I A; 4EMK B; 3OW2 S; 1Y96 B; 3CC4 Q; 4PJN A; 1HYO A; 1X69 A; 3ME9 A; 2F2V A; 3OYJ A; 3JCM P; 1M5Q 1; 3NTK A; 4C0D B; 1N8R C; 2A28 A; 3ZFJ A; 2CDT A; 4JJB A; 4XAX B; 4Z88 A; 1VQN T; 1YJW A; 3E9G A; 3HRS A; 5KYN A; 2KR3 A; 5KYY A; 3UPU A; 2H3J A; 2QEX A; 3CEY A; 4E6R A; 1SKU B; 1WHK A; 4RG2 A; 3S3M A; 4IUV A; 1G8X A; 2EKH A; 2PVO B; 3C0C A; 5IHK A; 2HQE A; 1QVG S; 5CK9 A; 2YLC A; 5DY9 A; 1JJ2 A; 1YIJ Q; 2YXY A; 1OI1 A; 3LH5 A; 5KYX A; 2E1H A; 3E9F A; 4M78 B; 4QVD A; 1AWO A; 1RUW A; 3OS5 A; 3QHS A; 4PLL A; 1S1N A; 2DIL A; 2RI3 A; 4N0A C; 2C0O A; 2DBK A; 1ZSZ A; 3SB2 A; 4FYV B; 1WXB A; 1M1K U; 4F7U E; 4PFO A; 3J80 E; 5KYU A; 2DL8 A; 1VQ7 T; 1SSF A; 1TUD A; 1T0H A; 1U06 A; 2MPX C; 3A98 A; 2DD5 A; 1VQL A; 5CR2 A; 1TG0 A; 1TUC A; 1PD1 A; 3LW5 E; 2JMC A; 2DEU A; 4R0K A; 1HSQ A; 4EDU A; 1I07 A; 3RKW A; 4M7A E; 1MHN A; 1B34 A; 3VS3 A; 1Y71 A; 3U23 A; 5GAN 4; 1XQH A; 1KJW A; 5CIU A; 3LWI A; 2E5K A; 1BIA A; 1R0B G; 3EGX A; 1KIK A; 2K5F A; 3E19 A; 4BE0 A; 3CC2 T; 2RQV A; 4IUU A; 1NBE B; 2KY9 A; 2RH2 A; 2YUP A; 2QQS A; 3CCJ Q; 3I55 Q; 1D0Y A; 1AZE A; 2E3H A; 3MP8 A; 3REA B; 5FWB A; 4A4E A; 2CRE A; 4Y92 A; 3JAM E; 1Z9Z A; 2LDM A; 3EFS A; 3PT9 A; 1BI3 A; 3UT1 A; 1TXQ A; 3CCV T; 2LNH B; 5LJ3 d; 4J9F A; 1X6O A; 1NM7 A; 1WFW A; 4ZN1 A; 2HL5 C; 2MF2 A; 5LJ3 e; 5LJ5 g; 4M7D F; 3NPF A; 2FHD A; 1AWJ A; 2JNG A; 3LLR A; 2MWO A; 3VYG A; 4J7F A; 3RES A; 2E64 A; 3JSC A; 2RHU A; 3VS6 A; 4KRT A; 4BB7 A; 3SWN A; 4J8O A; 1K73 R; 3C4S A; 1QMC A; 2E41 A; 4ELY C; 3I56 T; 3DLM A; 2COY A; 1WJS A; 1U1S A; 4J83 A; 2JS2 A; 1ZBJ A; 2YHT A; 2DRK A; 3LGL A; 3UWN A; 3QPH A; 3CCR A; 1G83 A; 4DBH A; 1IGQ A; 3JCM g; 5FU6 B; 5L23 A; 2EPD A; 1K9M U; 4MML A; 2ZAE A; 4XU0 A; 1VQ8 A; 3CCL A; 3EHR A; 3M54 A; 1NYG A; 4E7K A; 2RQU A; 3QG1 A; 3EGU A; 4OP0 A; 3G6E Q; 5GAM d; 2LC4 A; 5FRN A; 2ENM A; 1ZUK A; 4M7D D; 1JJ2 P; 5CQY A; 3VS5 A; 3URG A; 1Y7X A; 5GAM e; 1M90 R; 2A37 A; 5GAN d; 2V8K A; 3X20 B; 3OQ5 A; 2E3I A; 3MEV A; 2MYS A; 2QK0 A; 5GAN e; 4II1 A; 2HKQ B; 1JRI A; 4PJJ A; 4L59 A; 1V76 A; 3CCU A; 1GFD A; 3NFC A; 1MUZ A; 1QVF P; 3ULR B; 4M75 C; 3G4S A; 3JV3 A; 1KQS A; 2DET A; 4BY6 C; 2RO0 A; 4C0F A; 3EHQ A; 4FYW B; 1NZ9 A; 4PJO G; 4XU3 A; 2RHZ A; 1PRM C; 1GCQ A; 1YJN A; 2LP5 A; 2CUB A; 4J6Y A; 2DJZ A; 5LJ3 h; 1WHM A; 4IUP A; 5FLX E; 4QVZ A; 3JRZ A; 4J9I A; 3JCM V; 3OY9 A; 2XI9 A; 4EPC A; 2RJE A; 4RCC A; 4CC3 A; 1N5Z A; 3OMC A; 3CPW A; 2QTV A; 1WHH A; 3QSU A; 3LYI A; 2PUK B; 3QO3 A; 3JB9 G; 1U3O A; 1I81 A; 1OUL A; 1VQP T; 5GAN 7; 5GMK h; 1FXX A; 3A8H B; 1Q7Y R; 5FU7 C; 4EMK A; 1Y96 A; 4LNP A; 4BI4 A; 3TEE A; 4QVC A; 3JB9 J; 1JEG A; 4C5E A; 1Q81 U; 1NPR A; 2E12 A; 2MIO A; 4Q5W A; 2KSS A; 1LPL A; 1B07 A; 4Y28 E; 1N9S A; 2FPE A; 1WHL A; 3EFR A; 4NOY A; 2KRN A; 2IPO B; 1YIJ T; 3S3O A; 5IN1 A; 5A0L A; 3G71 Q; 4LXC A; 3M53 A; 3OW2 A; 5GAM h; 2DK3 A; 2X4X A; 3BFM A; 3HP9 A; 3M58 A; 4XQ3 A; 3RDV A; 2DER A; 1WPY A; 2QEX T; 4BE1 A; 1C1A A; 5GAN h; 1VQK A; 4N4I A; 2RPN A; 4QW2 A; 4M78 A; 5GAO l; 4A4F A; 3MP1 A; 2FB7 A; 4C5G A; 4E7Z A; 1AWX A; 4CC2 A; 2OAU A; 2F69 A; 1RLP C; 2DM1 A; 3HFO A; 2L3P A; 2V8J A; 1D3B B; 3JCM f; 3M0Q A; 2EFI A; 3BE3 A; 4IUQ A; 3AT1 B; 1JJ2 S; 5L8R E; 3CMA Q; 2CZ6 B; 2WSC E; 3EG2 A; 2V8I A; 3M0R A; 3FJ5 A; 2QI2 A; 1X27 A; 4M77 B; 3TQ7 P; 1T0J A; 2L3Q A; 1OEB A; 2DX1 A; 4QQD A; 2VVK A; 3CCE A; 4FYY B; 1QP3 A; 4J9D A; 2NWM A; 2XK0 A; 4FW1 A; 3CCJ T; 4FIB A; 2HSP A; 4OMP A; 4LDU A; 1WXT A; 1VA7 A; 2YUO A; 3OYB A; 3M0S A; 4AG1 C; 1XOV A; 1A0N B; 1KQS P; 1QWE A; 2J7I A; 2RQW A; 5CAI A; 3L42 A; 3FB9 A; 1PG5 B; 4RG8 A; 3TSZ A; 4LDV A; 4ZGJ B; 1RAD B; 3UAT A; 2LRQ A; 4JZ4 A; 1C0M A; 1VQ7 A; 2LQK A; 4JJN K; 2DTO A; 1JU5 C; 2VWF A; 3HFN A; 4HA8 A; 4PLI A; 2W0Z A; 1I1J A; 3OSS C; 1QCO A; 2YUQ A; 5GJV B; 3A8M B; 1BCM A; 3CPW P; 4HT8 A; 4GBQ A; 5LJ5 j; 3HSB A; 4CC7 A; 3RKY A; 1HJD A; 4B6M A; 1I5O B; 3OYN A; 1K4U S; 2EBP A; 1M2O A; 2YRC A; 1TWB A; 2JS0 A; 3M9Q A; 3CC2 A; 3GP8 A; 2DJQ A; 4C8Q F; 1I8F A; 1RAI B; 2JN0 A; 3HHT B; 2CH4 A; 1YIT A; 1IHV A; 5EC7 A; 2K4Y A; 1MND A; 1NLP C; 3OYL A; 3M55 A; 4M7D E; 2DL3 A; 1BYM A; 5GMK l; 2VAS A; 1FMK A; 4PNO A; 2RHX A; 5GAN 8; 2L89 A; 2CKK A; 1MNE A; 1YJ9 Q; 1JB0 E; 1KHC A; 1GRI A; 4V2S A; 1PNJ A; 1K76 A; 2M0Y A; 3CCR T; 4E7L A; 3OW2 P; 1K9M R; 3EGD B; 3TCJ A; 3J7A F; 5EG2 A; 1VQ8 T; 3SEM A; 3M57 A; 1S72 A; 1KQ1 A; 1WXU A; 3REB B; 3OYA A; 4M77 F; 2L2P A; 5KCO A; 3I56 A; 2DYB A; 1M9S A; 1G2B A; 2VYT A; 2RJF A; 4C8Q D; 4OB0 B; 1WHJ A; 6AT1 B; 1Q82 U; 1QVG P; 1M1F A; 3CME A; 3CD6 A; 3CCU T; 2DZC A; 4XTU A; 1GL5 A; 2EWN A; 3I35 A; 3IQL A; 4E7J A; 1SRL A; 2HAX A; 3G4S T; 1M8M A; 2L3S A; 3F70 A; 1BKB A; 1LCK A; 2P0P A; 2DL5 A; 3EH1 A; 4JRI A; 2FEI A; 2QTX A; 2FG0 A; 2XG8 D; 1YP5 A; 1R8O B; 1Q86 U; 2FO0 A; 3S6W A; 3LX7 A; 1YJN T; 2KRS A; 4EIK A; 1M3A A; 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