The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
b'HEQTHRAIFRFVPRHEDELELEVDDPLLVELQAEDYWYEAYNMRTGARGVFPAYYAIEVT'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A unique set of SH3-SH3 interactions controls IB1 homodimerization
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
C-jun-amino-terminal kinase interacting protein 1
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| source organism |
Rattus norvegicus
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
14
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-01-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1U06 A; 2AKK A; 2FEI A; 4OMO A; 2A08 A; 2PZ1 A; 2CSQ A; 2DRM A; 2DE0 X; 2LP5 A; 2D0N A; 5EC7 A; 1NLO C; 5HCK A; 2K3B A; 2OAW A; 3O5Z A; 1TUD A; 1N5Z A; 3ULR B; 1X2Q A; 2ECZ A; 2KRS A; 1GCQ C; 1MV3 A; 4IIO A; 2G6F X; 2BTT A; 1ZBJ A; 2JMA A; 4K11 A; 5FWB A; 2JXB A; 1M27 C; 2RQV A; 1QWF A; 2FO0 A; 1PWT A; 4RTY A; 2JW4 A; 2K7A A; 2IIM A; 2M51 A; 2LNH B; 1B3Q A; 1YN8 A; 4RTX A; 2KRN A; 1CKB A; 1SHF A; 2JMC A; 2RF0 A; 1QCF A; 4J9C A; 3EHR A; 4J9F A; 1SRM A; 2LMJ A; 4AFQ C; 2GBQ A; 1GRI A; 2XMF A; 2LQN A; 4WCI A; 1SRL A; 2X3X D; 4X1V A; 2LQW A; 1AD5 A; 2V1Q A; 1ZX6 A; 2DMO A; 2LCS A; 4RTV A; 1T3L A; 1GCQ A; 4JPB W; 2RQR A; 2FPF A; 1GFD A; 1OEB A; 5GJW B; 2L3Q A; 1NEG A; 2KNB B; 4AG2 C; 1V1C A; 1GCP A; 1WXU A; 2EW3 A; 1UDL A; 1VA7 A; 2DLP A; 3VS7 A; 2EVR A; 2NUZ A; 4A63 B; 1PKT A; 2MCN A; 3EHQ A; 2DBM A; 4ZNX A; 1UG1 A; 1ZLM A; 2X3W D; 3UA7 A; 1ZSG A; 2MOX A; 1AWO A; 4J9I A; 1KJW A; 1W6X A; 2HEQ A; 2AK5 A; 3M0Q A; 2KYM A; 3QWX X; 5IXF A; 3THK A; 4FSS A; 1UTI A; 3EG0 A; 1SEM A; 2DYB A; 1NYF A; 3M0S A; 4JJD A; 2ABL A; 1T0J A; 2CUD A; 1K76 A; 4J9B A; 1SPK A; 1AOJ A; 2MIO A; 1QKX A; 4JJB A; 4JZ4 A; 3EG3 A; 1RLQ C; 2EGE A; 4LNP A; 2D1X A; 1ABQ A; 3VS2 A; 1I07 A; 4J9E A; 1OPK A; 5ECA A; 4OML A; 1QLY A; 1JU5 C; 3I35 A; 1AEY A; 2K9G A; 1YNZ A; 1BBZ A; 3I5S A; 3SEM A; 2K2M A; 1VYU A; 4EIK A; 1M3C A; 1PRM C; 2ROL A; 2VVK A; 4J9H A; 2YSQ A; 2GQI A; 4OMN A; 4OMM A; 3UA6 A; 5IHI A; 2ROT A; 2P4R A; 4OMP A; 1K0S A; 1WXB A; 1RLP C; 3NGP A; 2W0Z A; 1WFW A; 4LUE A; 1JXM A; 2FPE A; 4HVV A; 2CDT A; 1VYT A; 2JM8 A; 2CH4 A; 2KGT A; 1QKW A; 1X27 A; 1M8M A; 1ABO A; 1RUW A; 1PKS A; 1K9A A; 3I5R A; 4RTT A; 2F2W A; 2EBP A; 1ZUY A; 1YWP A; 1WYX A; 1WLP B; 1WDX A; 3EG2 A; 2BZY A; 2GNC A; 4J9G A; 4Z89 A; 1UHC A; 3PVL A; 2O88 A; 2DM1 A; 1WX6 A; 2J6K A; 2W10 A; 1M3B A; 1H92 A; 2FRW A; 1M3A A; 1VYV A; 2HDA A; 2KEA A; 2EYW A; 2DVJ A; 2KXC A; 1IO6 A; 1UHF A; 2A36 A; 3I9Q A; 2PTK A; 2DA9 A; 2KYB A; 4LUD A; 3UF4 A; 3CQT A; 3VS0 A; 2V1R A; 5GJV B; 3JV3 A; 2DNU A; 2KR3 A; 1AZG B; 2O2O A; 2NWM A; 1U5S A; 2H8H A; 2SEM A; 2D8H A; 3KFV A; 1H3H A; 4RTU A; 2EGC A; 4DEY A; 1ARK A; 4ORZ A; 4R0K A; 2DL7 A; 1LCK A; 1FYN A; 3VS1 A; 2DJQ A; 3PE0 A; 1J3T A; 1H8K A; 1WIE A; 2YUQ A; 3NMZ C; 2LJ1 A; 1G83 A; 1G2B A; 2BZX A; 1I0C A; 2I0N A; 4DEX A; 2OJ2 A; 2A37 A; 4JZ3 A; 1NM7 A; 3M0P A; 4GBQ A; 2A28 A; 4E6R A; 3REB B; 4F16 A; 2D8J A; 1X43 A; 1HD3 A; 2BZ8 A; 2RQT A; 1T0H A; 2JS2 A; 5IHK A; 4QT7 A; 2KRO A; 1W70 A; 2EGA A; 4LN2 A; 3REA B; 1MV0 B; 2C0T A; 4ESR A; 2J6O A; 1E7O A; 2RMO A; 1TG0 A; 2LZ6 B; 2DL3 A; 4F17 A; 2L2P A; 2O9S A; 2EPD A; 2SRC A; 4CC2 A; 1UE9 A; 2DF6 A; 2LJ0 A; 1GL5 A; 2L0A A; 2J05 A; 1Z9Q A; 2K79 A; 5IHN A; 2DX1 A; 1UEC A; 1AWJ A; 1EFN A; 2FRY A; 3NHN A; 1HSQ A; 2DL4 A; 1B07 A; 1OOT A; 4CC3 A; 1UUE A; 2YUN A; 5IXB A; 2JM9 A; 3EG1 A; 4AG1 C; 3PVQ A; 3IQL A; 1BK2 A; 1JXO A; 4AFZ C; 1X6G A; 2DBK A; 1Y0M A; 4CC4 B; 4D8D A; 1WI7 A; 1UJY A; 1RI9 A; 5FWC A; 2AKL A; 2RQW A; 3GBQ A; 5I11 A; 2GTJ A; 4RTW A; 1JEG A; 1KFZ A; 1YCS B; 1K1Z A; 1BB9 A; 2O31 A; 3RBB B; 2K6D A; 2DRK A; 2EQI A; 1KSW A; 3EGU A; 3UAT A; 2CT3 A; 2RNA A; 1QWE A; 3NPF A; 3TVT A; 1UGV A; 2FG0 A; 1T3S A; 1GFC A; 2L3S A; 2KBT A; 3C0C A; 2HSP A; 2ED1 A; 2C0O A; 4CC7 A; 2L3P A; 1YWO A; 1K0X A; 1X6B A; 3R6N A; 2J7I A; 3M0U A; 1JO8 A; 4D8K A; 4LE9 A; 1SSH A; 4AFU C; 2FPD A; 1CSK A; 1AVZ C; 2QDL A; 2OI3 A; 2J06 A; 3VRY A; 1YP5 A; 3U23 A; 3TSW A; 3VS3 A; 1E6G A; 4HXJ A; 2HBW A; 1TUC A; 2CUB A; 3VRZ A; 4Y92 A; 1S1N A; 4M4Z A; 4JJC A; 3H0F A; 1NG2 A; 2YDL A; 1OV3 A; 2PNI A; 2GGR A; 2KT1 A; 2YUP A; 1SHG A; 4HVW A; 1I1J A; 4J9D A; 2M0Y A; 1AWX A; 2EYY A; 2RN8 A; 1AWW A; 3VS4 A; 2EKH A; 2JT4 A; 3SHW A; 1M30 A; 2LX7 A; 2J6F A; 3QWY A; 2AZV A; 2YT6 A; 1AZE A; 1UJ0 A; 1KIK A; 2KXD A; 5FW9 A; 3H0H A; 2F2X A; 3LH5 A; 5I22 A; 1NYG A; 1Z9Z A; 2RQU A; 1BU1 A; 1XOV A; 2B86 A; 4Z88 A; 1FMK A; 1NLP C; 2CT4 A; 4GLM A; 2HCK A; 4RUG A; 1X2K A; 2RPN A; 2ED0 A; 3VS5 A; 4IIM A; 2EYX A; 1X69 A; 2KRM A; 2CH4 W; 1MUZ A; 2EYZ A; 1JQQ A; 3ZL7 C; 2ENM A; 1Y57 A; 1W1F A; 1GBQ A; 2KE9 A; 3VS6 A; 1PRL C; 3M0T A; 1ZUU A; 2E5K A; 4KRT A; 2DIL A; 1OPL A; 2CSI A; 2DL8 A; 1HJD A; 1PNJ A; 2GTO A; 3RNJ A; 1NEB A; 3FJ5 A; 4AFS C; 1GBR A; 3M0R A; 4RTZ A; 2JS0 A; 1UFF A; 2CRE A; 1ZUK A; 4HVU A; 2YUO A; 4OMQ A; 3TSZ A; 2LJ3 A; 1K4U S; 4Z8A A; 4HCK A; 3A98 A; 1E6H A; 2O9V A; 5IH2 A; 2ESW A; 3H0I A; 3H41 A; 2DL5 A; 2F2V A; 1U3O A; 4F14 A; 2VKN A; 5L23 A; 1CKA A; 1A0N B; 1WXT A; 1WA7 A; 2VWF A; 1PHT A; 2JTE A; 2C0I A; 2KT8 A; 2AZS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FEI A; 2KAF A; 2EJF A; 2O4X B; 1PM3 A; 2P84 A; 4EMH A; 2RK2 A; 3OMC A; 2L3R A; 3ULR B; 1TXQ A; 1X2Q A; 3JCM c; 2ECZ A; 1YJ9 A; 3HP9 A; 5GAN e; 5FWB A; 1M27 C; 2F5T X; 1TTH B; 1VQK T; 3CCM T; 4E7I A; 2EQU A; 1U1T A; 2JW4 A; 1NBE B; 2K7A A; 2DER A; 1VQN A; 3CCQ A; 1YN8 A; 3CME Q; 1ZSZ B; 5KYY A; 4C0D C; 1VQ4 T; 1SRM A; 3OYG A; 5CQY A; 2LMJ A; 1R77 A; 2E12 A; 1SRL A; 2X3X D; 2DXC A; 2CZ6 B; 3UT1 A; 2WSE E; 2LCS A; 4XU2 A; 3CC7 Q; 2RQR A; 3E2U A; 3O8V A; 2FPF A; 4N0A C; 2CP6 A; 1NEG A; 2GFA A; 2L3Q A; 4HT9 A; 4AG2 C; 1GCP A; 2FHD A; 4MDW A; 1UDL A; 2PQW A; 4OGE A; 1G5V A; 1KHI A; 3CMA T; 1JBM A; 1SG5 A; 3A8O B; 3FLG A; 1PKT A; 2MYS A; 2MCN A; 3OW2 A; 3L2Q A; 2OTJ A; 4C92 G; 4A4H A; 9ATC B; 2XHC A; 2JN0 A; 1HK9 A; 5CIU A; 3EG9 B; 3UA7 A; 4IUU A; 5A0D A; 2MOX A; 3LGL A; 1Q86 R; 5CVI A; 2V8J A; 2KYM A; 1UGR B; 3THK A; 1YJW T; 4PJO G; 4JJD A; 4KGV B; 4M75 E; 1TWB A; 2HKQ B; 4J9B A; 1N9R A; 3PIP A; 1AOJ A; 4KT0 E; 5LJ3 j; 4IKF A; 3EG3 A; 1WQ7 A; 2I2L A; 4IUP A; 1ABQ A; 1BI1 A; 2GQV A; 3I55 Q; 1VQ8 A; 1HYO A; 4BB7 A; 1VQO T; 3HTR A; 5LJ5 f; 1AEY A; 2K9G A; 3I5S A; 4LD6 A; 1MMG A; 5J3B A; 5HY6 A; 1G8X A; 3INZ A; 4C0Z A; 4MZM A; 5IHI A; 4M75 F; 1BCM A; 4OMP A; 5CKD A; 3NGP A; 2W0Z A; 2QAZ A; 4XK8 E; 3RES A; 2EQK A; 2VAS A; 1Q82 C; 2P0P A; 4NL2 A; 1VQ5 Q; 1EZZ B; 2NUT B; 2PVO B; 5KYW A; 3I5R A; 4RTT A; 4FYW B; 5KYU B; 1K9M R; 1YWP A; 3HPW A; 1WLP B; 1WDX A; 2A0F B; 1VQM T; 2NUP A; 2EKO A; 3PVL A; 4JUV A; 2DM1 A; 5LJ5 g; 1H92 A; 4ZN3 A; 1M1K C; 1ZSZ C; 3QPH A; 4C8Q F; 4HT8 A; 1PCX A; 3NTK A; 1XQH A; 5GJV B; 1Y96 B; 5CCA A; 1VQP T; 2KR3 A; 1AZG B; 4KUI A; 1KQ2 A; 4RTU A; 4DEY A; 1OUL A; 4V2S A; 1FYN A; 1X75 C; 3WVD B; 3EGD B; 1J3T A; 3NMZ C; 2LJ1 A; 3OYB A; 1Q81 R; 1G83 A; 5GAN d; 1I0C A; 2E3H A; 4DEX A; 3OY9 A; 2WSF E; 4JZ3 A; 4M77 B; 2HL5 C; 1YJN Q; 3JCM X; 2CYZ B; 4FYV B; 2JS2 A; 2JZ2 A; 5IHK A; 4QT7 A; 1GXI E; 3REA B; 1V76 A; 1N9S A; 2C0T A; 2LQ8 A; 2J6O A; 1E7O A; 2MAM A; 4PNO A; 3EFS A; 3M9Q A; 3NTI A; 3GF5 A; 3CCL A; 2LZ6 B; 2DL3 A; 1I4K 1; 4F17 A; 3OYM A; 3JB9 H; 5GAM d; 3L2R A; 2EPD A; 1M90 C; 2LJ0 A; 3CPW P; 1S72 A; 3X28 B; 4XTU A; 3X26 B; 3HRT A; 3MEU A; 4JJN K; 3HRS A; 1TUG B; 3JCM P; 1B07 A; 3CCS Q; 1VQ9 T; 3CPF A; 2EFI A; 2PVD B; 3G4S Q; 1UUE A; 3CCU Q; 4PFO A; 5IXB A; 2DIQ A; 3DB3 A; 2FZC B; 1PSE A; 3OYK A; 1X6G A; 3UPU A; 4D8D A; 3E1S A; 3AHU A; 2XD0 A; 2AKL A; 5I11 A; 2FVU A; 2NLU A; 3HL8 A; 4RCC A; 5DLO A; 1BB9 A; 1EIF A; 2EQI A; 2K3Y A; 2EYQ A; 5FRN A; 5KYX B; 4DOW A; 2KMT A; 2CT3 A; 2RNA A; 1YBY A; 2FB7 A; 3TVT A; 2FG0 A; 1M2V A; 2DXT A; 2KBT A; 3C0C A; 2HSP A; 2M16 A; 4JRK A; 2ED1 A; 1M5Q 1; 4GY5 A; 5A0L A; 2L3P A; 1YWO A; 3RIR A; 2LT1 A; 1QP2 A; 4DBF A; 4FYX B; 1AT1 B; 2ZPH B; 3R6N A; 1UB4 A; 1D0Z A; 1JO8 A; 1ZA2 B; 1M9S A; 4D8K A; 1M4Z A; 3CME T; 3SFM A; 1K9M U; 5DY9 A; 4AFU C; 3P8B B; 2QDL A; 3RKW A; 4IUT A; 3LH0 A; 3CBO A; 2LTO A; 1R8O B; 1QVP A; 2G3R A; 3RMS A; 1YIT T; 1YP5 A; 3N5B B; 2E41 A; 3U23 A; 2CZ7 B; 2MI6 A; 3JRZ A; 2HBW A; 4N4I A; 1TUC A; 2CP0 A; 1QMC A; 2RJD A; 2V8I A; 1S1N A; 4JJC A; 1TSF A; 3H0F A; 1NG2 A; 2LNV A; 3CC4 A; 3CC7 T; 4JDS A; 1OV3 A; 4KGX B; 1VQ4 Q; 1TU0 B; 1YHQ A; 2YUP A; 4A53 A; 4HVW A; 5C6S A; 1WJQ A; 3FJP A; 4CI0 C; 2RN8 A; 2VGN A; 2DEQ A; 3JCM Q; 3SHW A; 3QO3 A; 2RHZ A; 1M30 A; 3MKD A; 1SSF A; 4B6M A; 4M77 C; 3QYH B; 3CCE T; 5A2Q E; 1KIK A; 2FL7 A; 3H0H A; 3RKX A; 5CO7 A; 2HAX A; 2RJE A; 4GLK A; 2RQU A; 1XOV A; 2WSC E; 1O9S A; 1QVG S; 3CMA Q; 4M78 E; 5IAY A; 2K2V A; 2EYX A; 2RD1 A; 4B9X A; 4BY6 B; 2YLB A; 2CGH A; 1MUZ A; 5AT1 B; 2YRC A; 1R0B G; 2ENM A; 3S3N A; 5GAM h; 2XG8 D; 1N8R C; 5J26 A; 3OYC A; 1ZUU A; 4M7D B; 3UDC A; 3I55 T; 2QGG A; 1YJW Q; 1HJD A; 5FU6 C; 4AFS C; 2R5M A; 5L8R E; 4QW2 A; 1OU8 A; 4HCK A; 1SF9 A; 3FEO A; 4C92 E; 3A98 A; 3H9N A; 2OTL Q; 2DL5 A; 1QQJ A; 3M59 A; 4F14 A; 1TOV A; 5I2S A; 3OBY A; 3URG A; 1QVG P; 4M7A C; 4FW1 A; 1RAH B; 1A0N B; 1WXT A; 2CKK A; 2P4T A; 1WA7 A; 2DYI A; 1VQ5 T; 4PJO E; 3QYG B; 5GAN 8; 2HZY A; 1OYX A; 2C0I A; 4XTW A; 2JJ9 A; 1U06 A; 3CEY A; 2A08 A; 2DFU A; 4J83 A; 2CSQ A; 3QSU A; 2DE0 X; 2Y4X A; 1VQ4 A; 1JB0 E; 2OAW A; 1N5Z A; 4C5G A; 4C92 F; 2G6F X; 1ZBJ A; 3VYH B; 4Y91 A; 2DZ9 A; 3MJX A; 3GNG A; 2JXB A; 2RQV A; 4PJJ A; 4ZGE B; 1QWF A; 3R6O A; 4PJO F; 2FO0 A; 2EWN A; 1PWT A; 4RTY A; 3CBP A; 1B3Q A; 2JNG A; 4RTX A; 4AT1 B; 2KRN A; 1CKB A; 1SHF A; 2VC8 A; 2JMC A; 2RI2 A; 4J5Y A; 2EIF A; 1QCF A; 4C0D B; 2HL3 A; 4J9C A; 3CMA A; 2DTO A; 1W2B A; 3OMG A; 4E7K A; 3Q1J A; 5GMK j; 2O4X A; 4RCB A; 4IUR A; 3OW2 P; 2GBQ A; 1YIJ Q; 2GCX A; 1VQP Q; 4X1V A; 1K8A R; 4XTY A; 1AD5 A; 2V1Q A; 1ZX6 A; 3J81 E; 2VGM A; 1T3L A; 1YJN T; 1GCQ A; 2Y90 A; 2YRV A; 1YJW A; 5GJW B; 4OB2 B; 1WXU A; 4M7D D; 2DLP A; 3VS7 A; 3OYL A; 5HK0 A; 2OAU A; 2QG9 B; 4BI4 A; 4F7U B; 4M75 A; 1ZSZ A; 4LDY A; 2DBM A; 5CQX A; 1B34 B; 1Q95 G; 2IPO B; 1VQO A; 1ZSG A; 1W6X A; 3QZ9 B; 4FL6 A; 2HEQ A; 3M0Q A; 5IXF A; 4M7D C; 2GFU A; 3EG0 A; 1BIB A; 3GPL A; 4EMK A; 1NYF A; 2COZ A; 3DLL A; 1T0J A; 3CCS T; 1K76 A; 3G4S T; 3CCU T; 1VQ7 T; 1QKX A; 1MGQ A; 4XAX B; 4JJB A; 5LJ5 j; 4OP0 A; 1RAD B; 2EGE A; 3ER0 A; 2D1X A; 2KI7 A; 1UEB A; 1I07 A; 4J9E A; 3MP8 A; 2L5Q A; 1P92 A; 2A3L A; 4L59 A; 1BBZ A; 1K9M C; 1FMV A; 1WJR A; 5GAN f; 3SEM A; 1QW1 A; 1VYU A; 3RR6 A; 4EIK A; 2VVK A; 3JCM J; 3KBG A; 1BKB A; 4PJM A; 1VQM A; 2ROT A; 1WHJ A; 4PLL A; 1WXB A; 2E64 A; 4PL6 A; 1U8R A; 2JOY A; 4J6X A; 2PUO B; 2OX7 A; 4F7U E; 1JXM A; 2RO0 A; 3ASK A; 1WGS A; 1VYT A; 1OZ3 A; 1IRX A; 2KGT A; 1QKW A; 1M8M A; 1WHL A; 4JS4 A; 3JB9 F; 3L2Z A; 1VQP A; 1OX8 A; 2EBP A; 2ZCF B; 4ELZ C; 2AT1 B; 3EG2 A; 2DKG A; 1UHC A; 2Z0W A; 2QQS A; 2W10 A; 2D9T A; 4PFP A; 2KXC A; 2RA2 A; 1IO6 A; 5GAN g; 4M78 G; 2DA9 A; 1YIT Q; 3CQT A; 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