The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
GSMSAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEAKPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure and ligand-binding site of the SH3 domain of the p85 alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN
|
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| source organism |
Bos taurus
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| total genus |
6
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-07-19 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J9C A; 1WYX A; 1XOV A; 4ORZ A; 2RQW A; 3CQT A; 4Z8A A; 1UE9 A; 1WA7 A; 4HVU A; 1S1N A; 2BZX A; 2W0Z A; 1UUE A; 5L23 A; 1QCF A; 4LN2 A; 4D8K A; 1WXT A; 2A28 A; 4R0K A; 4J9I A; 2CT4 A; 2K6D A; 3RBB B; 2E5K A; 1SEM A; 1ZBJ A; 2KXD A; 1AEY A; 1CKB A; 4LE9 A; 4JZ3 A; 2KNB B; 2MCN A; 1YWO A; 2AKK A; 2V1R A; 2W10 A; 1GRI A; 1VYV A; 2KRO A; 3PVQ A; 2HSP A; 1AOJ A; 2YUQ A; 1SSH A; 1E6G A; 2FO0 A; 3H0H A; 4IIO A; 1K76 A; 2ESW A; 2B86 A; 3H41 A; 4CC4 B; 2AZS A; 3VS6 A; 4WCI A; 4OMQ A; 4GBQ A; 2RMO A; 2G6F X; 1Z9Z A; 1AWO A; 4OMN A; 1E7O A; 2GNC A; 2O9S A; 1K0X A; 2JS0 A; 2GQI A; 3C0C A; 1T3S A; 4J9G A; 1T0H A; 1UDL A; 4J9F A; 2OAW A; 3TSW A; 2KRS A; 1UG1 A; 1ZSG A; 1KJW A; 3VS7 A; 4F17 A; 4KRT A; 1GCQ A; 2LJ1 A; 4E6R A; 3EHQ A; 1K9A A; 1PKT A; 4CC2 A; 4JJD A; 1WXB A; 2KR3 A; 1H92 A; 4FSS A; 1YNZ A; 2CH4 W; 1W6X A; 2MIO A; 1NEB A; 2YSQ A; 3O5Z A; 1M8M A; 1NM7 A; 1X69 A; 5GJV B; 2O2O A; 1H3H A; 1FYN A; 1KFZ A; 2DRM A; 3EGU A; 4J9E A; 5I22 A; 1U3O A; 2YUP A; 1NG2 A; 1UEC A; 2L3S A; 3LH5 A; 1K0S A; 2XMF A; 1UGV A; 2DYB A; 1AWW A; 1Z9Q A; 5IH2 A; 3REB B; 2C0T A; 1E6H A; 1AD5 A; 3PE0 A; 1ZUY A; 4AG1 C; 4LUD A; 4RTY A; 2LJ3 A; 4OMO A; 2DA9 A; 1BBZ A; 2JM9 A; 4Y92 A; 4JPB W; 2DBM A; 4OMM A; 2HEQ A; 2GTJ A; 2F2V A; 2KBT A; 1X6B A; 2JMA A; 2K2M A; 1OPL A; 4AFU C; 3VS4 A; 2DLP A; 2JMC A; 3M0P A; 2I0N A; 1GCP A; 2RF0 A; 3ULR B; 3UA7 A; 3M0R A; 4F16 A; 2CSQ A; 2FPF A; 1OEB A; 1HJD A; 2AKL A; 4ZNX A; 2CDT A; 2DIL A; 2LQW A; 2RQT A; 1PWT A; 1PRL C; 1RUW A; 2QDL A; 1WDX A; 4IIM A; 2EYX A; 2LP5 A; 2C0O A; 3UA6 A; 2HCK A; 2L3P A; 2X3W D; 5EC7 A; 2KEA A; 2YUO A; 4LUE A; 2EYW A; 1CSK A; 3NGP A; 4LNP A; 4HVW A; 3SEM A; 3THK A; 3M0S A; 2DVJ A; 2EGC A; 4QT7 A; 2FRY A; 2A36 A; 1X43 A; 2J06 A; 4HXJ A; 1QLY A; 1K4U S; 1M3A A; 1AWX A; 3I5S A; 3H0F A; 4RTV A; 2LZ6 B; 1NYF A; 1SHG A; 2K79 A; 4CC3 A; 3IQL A; 1RLP C; 2BZ8 A; 3VS5 A; 2EQI A; 1ZX6 A; 3VS3 A; 1N5Z A; 2J6O A; 5FWC A; 2RQR A; 5HCK A; 1A0N B; 1NLP C; 3H0I A; 2ENM A; 3UF4 A; 2OJ2 A; 2FRW A; 4GLM A; 2DMO A; 1SRL A; 3I5R A; 4OML A; 2DL8 A; 2LX7 A; 5GJW B; 1X2Q A; 2DF6 A; 2ROT A; 1Y0M A; 3UAT A; 2EKH A; 1WLP B; 4OMP A; 1UHF A; 1WI7 A; 2M51 A; 2DNU A; 2K9G A; 1AZE A; 3I35 A; 2KXC A; 2BZY A; 3M0Q A; 1AZG B; 2LNH B; 1OOT A; 1RLQ C; 2D0N A; 1WIE A; 1OPK A; 1ABO A; 1FMK A; 2VWF A; 4AFZ C; 1MV3 A; 1ARK A; 2A37 A; 2K7A A; 2LJ0 A; 2H8H A; 2SRC A; 2LMJ A; 1UJY A; 1WX6 A; 2HBW A; 2JT4 A; 4RTU A; 2EBP A; 3NPF A; 1VYT A; 2D8J A; 1YWP A; 3QWX X; 1GBQ A; 2F2X A; 2DL4 A; 5FW9 A; 1UTI A; 2CT3 A; 3VS2 A; 1MUZ A; 3PVL A; 1BB9 A; 1KIK A; 2DE0 X; 2ED0 A; 3KFV A; 4AFS C; 2DL3 A; 1HD3 A; 3VS0 A; 1OV3 A; 3SHW A; 2DJQ A; 1H8K A; 1T3L A; 1SHF A; 1AVZ C; 1NLO C; 3EHR A; 2PZ1 A; 1GFC A; 1U5S A; 2MOX A; 2VKN A; 4DEX A; 2DL7 A; 3NMZ C; 1BU1 A; 1CKA A; 1GCQ C; 1ZUK A; 1PKS A; 4RTZ A; 3TSZ A; 2YDL A; 4JJB A; 2EPD A; 1JXO A; 2PTK A; 3GBQ A; 4Z89 A; 5IXB A; 1M3C A; 1EFN A; 3R6N A; 3EG3 A; 1I1J A; 4RTX A; 3M0T A; 2JS2 A; 2M0Y A; 1G2B A; 2DM1 A; 1W70 A; 4M4Z A; 2RQV A; 2LQN A; 5IHN A; 1YCS B; 2CSI A; 4J9D A; 2EYZ A; 2VVK A; 4X1V A; 3EG2 A; 2J7I A; 2KT8 A; 3VRZ A; 2SEM A; 2ED1 A; 1SRM A; 2FG0 A; 4J9H A; 1YN8 A; 4RTW A; 2KYB A; 2D1X A; 2KYM A; 3TVT A; 2BTT A; 1BK2 A; 2L3Q A; 1TG0 A; 2CRE A; 2HDA A; 2CH4 A; 2NUZ A; 2J6K A; 2RQU A; 1M3B A; 1UHC A; 1ZLM A; 3VS1 A; 1UFF A; 1PHT A; 2EYY A; 3RNJ A; 1JEG A; 1B3Q A; 1PRM C; 1V1C A; 1ZUU A; 2NWM A; 2DL5 A; 2KRM A; 2X3X D; 1W1F A; 2O9V A; 2RN8 A; 1JXM A; 2RPN A; 4F14 A; 4A63 B; 4CC7 A; 2O31 A; 3U23 A; 1I07 A; 2A08 A; 2EVR A; 1PNJ A; 2D8H A; 4RTT A; 2L0A A; 2O88 A; 3I9Q A; 1I0C A; 2ABL A; 2FPD A; 1YP5 A; 1AWJ A; 2FEI A; 3JV3 A; 1GFD A; 4AG2 C; 1UJ0 A; 5FWB A; 4ESR A; 3QWY A; 4EIK A; 1JQQ A; 1G83 A; 2GBQ A; 2F2W A; 2EGA A; 2C0I A; 2ROL A; 2IIM A; 1NYG A; 4J9B A; 1JU5 C; 1QKW A; 2J6F A; 2CUD A; 1QKX A; 4DEY A; 1J3T A; 2KGT A; 2KE9 A; 2DRK A; 3M0U A; 1ABQ A; 1IO6 A; 1WXU A; 4AFQ C; 1TUD A; 1SPK A; 2FPE A; 1M27 C; 2JM8 A; 5IXF A; 2GTO A; 2JW4 A; 3NHN A; 1WFW A; 2DBK A; 4K11 A; 2PNI A; 1QWE A; 3A98 A; 2ECZ A; 1GL5 A; 3FJ5 A; 1Y57 A; 2J05 A; 1JO8 A; 1KSW A; 1MV0 B; 2RNA A; 4RUG A; 1X2K A; 2GGR A; 5ECA A; 2OI3 A; 2DX1 A; 2LCS A; 2AK5 A; 2EGE A; 4JZ4 A; 2CUB A; 1X6G A; 1LCK A; 1NEG A; 2V1Q A; 2P4R A; 3ZL7 C; 1X27 A; 5IHK A; 4D8D A; 2L2P A; 4JJC A; 2YUN A; 4HCK A; 1QWF A; 1K1Z A; 1T0J A; 2JTE A; 2KT1 A; 3REA B; 2EW3 A; 1HSQ A; 1U06 A; 4HVV A; 2KRN A; 1TUC A; 1B07 A; 2JXB A; 5I11 A; 2YT6 A; 2K3B A; 3EG0 A; 3VRY A; 1RI9 A; 5IHI A; 4Z88 A; 3EG1 A; 1VA7 A; 1VYU A; 2AZV A; 1M30 A; 1GBR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4BDZ A; 4EMK A; 2JZ2 A; 4FL6 A; 1JJ2 A; 2ZPF B; 4II1 A; 1FMW A; 3QBY A; 3P8B B; 3RR6 A; 4LN2 A; 3M58 A; 3PMT A; 4J9I A; 2CT4 A; 3EGD A; 3ZBD A; 3OSS C; 3MP8 A; 3URG A; 2XD0 A; 4ZGD B; 2P84 A; 3GP8 A; 4JZ3 A; 3A8M B; 2CZ1 B; 3X26 B; 2VB6 A; 2V1R A; 3RER A; 3HHT B; 3PVQ A; 1EIF A; 5GMK h; 1SSH A; 3H0H A; 1Q95 G; 4IIO A; 3E19 A; 3CC7 T; 4V2S A; 3M56 A; 2L5Q A; 4CC4 B; 2AZS A; 2JJ9 A; 3VS6 A; 2I2L A; 4OMQ A; 4GBQ A; 3QKJ A; 1KQ2 A; 2O9S A; 4BB7 A; 4F7U F; 2JS0 A; 1N8R C; 1K73 U; 4E7L A; 2Y90 A; 1W2B A; 2XG8 D; 1UDL A; 4C8Q F; 4M7D F; 3TSW A; 2IVW A; 1UG1 A; 1ZSG A; 2LQ8 A; 4F17 A; 1GCQ A; 2LJ1 A; 5FU7 C; 1K9A A; 2YRV A; 1OI1 A; 4JJD A; 1WXB A; 4JDS A; 5I21 A; 2FB7 A; 1YNZ A; 4HCC A; 2CZ6 B; 1HXD A; 2FVU A; 1NEB A; 2LT4 A; 2PQW A; 5GAN 7; 3EFO A; 1KFZ A; 2DRM A; 2FYK A; 3GPL A; 3PMI A; 4M78 F; 5I22 A; 1U3O A; 3CCM Q; 2YUP A; 1VQN Q; 3MPU B; 1K0S A; 4WF2 A; 1AWW A; 4L59 A; 5FRN A; 2HZY A; 4XTZ A; 4LDU A; 3LYI A; 4C92 B; 2C0T A; 2DK3 A; 2RHZ A; 4LXC A; 3WVD B; 5KYY B; 2LVM A; 4RTY A; 2DA9 A; 2JM9 A; 2DKG A; 4D6W A; 5I2M A; 1YBY A; 4Y92 A; 1M1K R; 1U8R A; 1RAH B; 1Y96 B; 4ZTF A; 3CCU Q; 2JMA A; 2RI5 A; 2JN0 A; 4AFU C; 3V8J A; 2F5T X; 2D6F A; 3M0R A; 1BKB A; 4XQ3 A; 4M78 A; 2AKL A; 2R57 A; 2CDT A; 2DIL A; 2RQT A; 1PRL C; 4EDU A; 3UA6 A; 3OW2 S; 2RJF A; 4MZP A; 2QQ9 A; 3H9N A; 4PJO G; 2BE7 D; 1VQ4 A; 4J8O A; 1WPY A; 1CSK A; 3OA6 A; 2RM4 A; 3OYK A; 4HVW A; 2ZCF B; 3QII A; 2A36 A; 3A8G B; 3JCM g; 4YTL A; 3OB9 A; 1AT1 B; 3OBW A; 3H0F A; 4RTV A; 2LZ6 B; 4L5G A; 4CC3 A; 4HKE A; 3CBO A; 5GMK j; 2XI9 A; 4RMO A; 1IHV A; 3V8K A; 3CXC P; 2LX9 A; 4OGC A; 3UF4 A; 1YJ9 Q; 4CRI A; 1I4K 1; 4ELY C; 3DB4 A; 2LX7 A; 2RH2 A; 5GJW B; 1H3Z A; 2DF6 A; 5KYX B; 3A8O B; 5CAI A; 2EKH A; 1WLP B; 4OMP A; 1WJS A; 1LOJ A; 1WI7 A; 1VQ4 T; 2QQA A; 2M51 A; 1QP2 A; 3MKD A; 3OYN A; 1I81 A; 2R5M A; 5LJ3 f; 1Q86 U; 2GFA A; 2LDM A; 3I56 A; 1OOT A; 3FIF A; 3A8L B; 2DAQ A; 1ZSZ B; 2HKQ B; 1VQ7 Q; 1OPK A; 3J81 E; 2ZZD A; 1R0C B; 1SF9 A; 2K7A A; 2LJ0 A; 4RCC A; 2LMJ A; 3G6E Q; 2BIV A; 2HBW A; 2EBP A; 5GAM g; 3CCE A; 1Y7X A; 1YWP A; 4M77 D; 2DIG A; 1GBQ A; 4PJJ A; 2MK5 A; 2HSE B; 3WXM B; 1UTI A; 4MZT A; 3P8H A; 1BB9 A; 1IB8 A; 4DBQ A; 4E2F B; 3VS0 A; 1M1K C; 3SHW A; 2DJQ A; 3T9N A; 2EQJ A; 5CK9 A; 1T3L A; 2OX7 A; 4LD6 A; 2MWO A; 1JBM A; 3HKS A; 4EMH A; 1M1F A; 3EHR A; 3I56 T; 1BCO A; 1QVP A; 4E7Z A; 3J7A F; 1BU1 A; 1S72 A; 4RTZ A; 2YDL A; 4M75 B; 3ZEH A; 5A0G A; 5GAM f; 3MP6 A; 1M4Z A; 4BE2 A; 4J7F A; 5LJ5 g; 1EFN A; 1M9S A; 3CCE T; 4EMK B; 4KH0 B; 3M0T A; 3SDZ A; 1C6V X; 2KSS A; 2RO0 A; 4IUR A; 5GAN 5; 4PJL A; 4C5H A; 2EYZ A; 1N8R U; 4C0D C; 2DZC A; 2EQK A; 4MDW A; 3OS1 A; 3MEW A; 2OTL Q; 4ANJ A; 3EGD B; 4KUL A; 4PLI A; 1SRM A; 1M8V A; 1N6A A; 1S72 T; 3TVT A; 1TG0 A; 1SG5 A; 2HDA A; 3CEY A; 1K9M U; 2EQU A; 3X28 B; 2JTM A; 1RAD B; 4BUG A; 1VQ6 Q; 5GAO n; 1TS9 A; 4IUQ A; 1PHT A; 4M77 C; 3RNJ A; 3UDC A; 3LWI A; 4BI4 A; 1V1C A; 2EWN A; 2X4W A; 5CVI A; 1W1F A; 2O9V A; 2RN8 A; 2F5K A; 4A63 B; 1MMD A; 3FB9 A; 3CCS Q; 2L0A A; 2FPD A; 3MCA B; 2FEI A; 4BY6 B; 4KGZ B; 1GFD A; 1KG1 A; 4FU6 A; 3M5A A; 2E6Z A; 4ESR A; 1VQ5 Q; 2GBQ A; 2AIR B; 2ROL A; 2XKO C; 3EFO B; 3RIR A; 4J9B A; 5FRO A; 4DBR A; 1QKW A; 1QKX A; 4DEY A; 4P5N A; 3EGX A; 2KE9 A; 1ABQ A; 1WXU A; 2YXY A; 2FPE A; 1SPK A; 1WFW A; 1RI0 A; 2E4H A; 1QWE A; 4JUV A; 2VUB A; 3A8H B; 4C92 F; 2K2V A; 2COW A; 2J05 A; 1JO8 A; 2DXT A; 2QQB A; 3CBM A; 4QQG A; 2QEX Q; 4JRQ A; 5GAN 4; 4O5V A; 1XJW B; 4NS5 A; 2X51 A; 1MNE A; 2QGF B; 3ZL7 C; 2HL5 C; 1JJ2 P; 1B7T A; 4HCK A; 3OYJ A; 1ZBX A; 1Y71 A; 1NZ9 A; 1QCO A; 3REA B; 4B9X A; 2EW3 A; 4F7U G; 1U06 A; 1TUC A; 2DJZ A; 2JXB A; 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1M8M A; 1YFN A; 1X69 A; 3OSV A; 5GJV B; 4M75 F; 1FYN A; 1N9R A; 4GY5 A; 4RG2 A; 4J9E A; 3RUX A; 1XTD A; 5GAM e; 4TVR A; 3JCM h; 4XAX B; 3E2U A; 1UGV A; 2RJD A; 4ZN1 A; 2M9U A; 4OB1 B; 5J26 A; 1Q81 C; 2HD0 A; 2X35 A; 1U1S A; 3CMA Q; 2QTX A; 1VOM A; 5DM7 R; 3VJP A; 2A7Y A; 1TUG B; 3CD6 T; 2ZPG B; 4J7I A; 2DBM A; 4OMM A; 2HEQ A; 1IXD A; 3OYC A; 3P8D A; 2K2M A; 5CKE A; 1O9S A; 2DTH A; 2DLP A; 2JMC A; 3QYG B; 2I0N A; 2RI3 A; 1BI0 A; 4F16 A; 1YIT T; 3JCM W; 3QJ6 A; 5DY9 A; 2CSQ A; 2O4X A; 2FPF A; 4M77 A; 1KD1 C; 2LQW A; 2R58 A; 2X4J A; 3QZ5 B; 3CXC S; 3S3O A; 4IIM A; 3UT1 A; 2H3E B; 2C0O A; 1KQ1 A; 5LJ5 e; 2X3W D; 2RD1 A; 2V8J A; 5EC7 A; 2YUO A; 3M54 A; 3NGP A; 2CP7 A; 1NJI R; 3L2Z A; 3SEM A; 1ZA1 B; 2FRY A; 2GF7 A; 2ZPH B; 2J06 A; 1VQP Q; 3EFR A; 1QP3 A; 1AWX A; 3I5S A; 4J6X A; 1VQM A; 1VQK A; 3MEU A; 1NYF A; 1SHG A; 2K79 A; 3G1J A; 5FU7 B; 5GAM h; 3PTA A; 3IQL A; 1RLP C; 3CPW A; 1C1A A; 3VV0 A; 5IN1 A; 3VS3 A; 2LCC A; 2FZG B; 3JCM X; 1A0N B; 3GOX A; 3CCR Q; 1WGS A; 4HT9 A; 4QQ6 A; 2FRW A; 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