The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
|
sequence length |
80
|
structure length |
80
|
Chain Sequence |
GSSGSSGEIAQVTSAYVASGSEQLSLAPGQLILILKKNTSGWWQGELQARGKKRQKGWFPASHVKLLGPSSERASGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the fourth SH3 domain of human intersectin 2 (KIAA1256)
rcsb |
| molecule tags |
Endocytosis/exocytosis
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Intersectin 2
|
| total genus |
8
|
| structure length |
80
|
| sequence length |
80
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-05-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2K9G A; 2L2P A; 2FRY A; 3NGP A; 2LJ1 A; 4D8D A; 1X43 A; 4RUG A; 3VS2 A; 2LZ6 B; 2DBK A; 2AZS A; 2HSP A; 2J05 A; 1JU5 C; 2EGA A; 3UA7 A; 3EGU A; 2J6K A; 2O9V A; 3M0U A; 2EVR A; 2D8H A; 1M3C A; 3JV3 A; 3TSW A; 2DL8 A; 4HVU A; 4RTV A; 1NLO C; 1UHF A; 1WXT A; 3U23 A; 3M0S A; 4X1V A; 1SRL A; 2K6D A; 1NEB A; 2YDL A; 2NUZ A; 1YNZ A; 1AZG B; 2X3X D; 1TUD A; 1GCQ A; 3VS0 A; 2CT3 A; 1EFN A; 4OMN A; 2LX7 A; 1UE9 A; 4WCI A; 1I07 A; 2C0O A; 2FRW A; 2DA9 A; 1VYT A; 1HSQ A; 4J9G A; 1NM7 A; 2CUB A; 4Z88 A; 2KYM A; 3VS7 A; 2YSQ A; 3NHN A; 4GBQ A; 3KFV A; 1M3A A; 1I0C A; 2J6F A; 4IIO A; 4RTX A; 4J9H A; 4AG2 C; 1YWO A; 2DM1 A; 2JM9 A; 4JZ4 A; 1M8M A; 2CH4 W; 2JXB A; 2RPN A; 3GBQ A; 3PVQ A; 2DL4 A; 1ARK A; 4RTU A; 1OPL A; 2JMC A; 1AD5 A; 2DL3 A; 1ZLM A; 1BK2 A; 2K2M A; 4DEX A; 1UEC A; 1M30 A; 1SRM A; 1GCP A; 3CQT A; 4AG1 C; 2KYB A; 5I11 A; 2JM8 A; 2FG0 A; 1AZE A; 2RN8 A; 5FWC A; 2GNC A; 1MUZ A; 2EYZ A; 3I5S A; 2L0A A; 4AFS C; 1JXM A; 2AZV A; 2JW4 A; 4RTY A; 1NG2 A; 2LJ3 A; 1T0H A; 1W6X A; 1Y57 A; 1BU1 A; 2CSQ A; 1MV0 B; 2A28 A; 1E6H A; 1ZBJ A; 1NYF A; 1Z9Q A; 2VVK A; 2PNI A; 1M27 C; 4OMP A; 2KGT A; 3TSZ A; 1FYN A; 1KSW A; 1H8K A; 1G2B A; 4HVV A; 3UA6 A; 1T3S A; 1T3L A; 2KRN A; 1PNJ A; 4K11 A; 1KJW A; 1W1F A; 2J7I A; 2W0Z A; 1E6G A; 4AFZ C; 1B3Q A; 2LCS A; 4RTW A; 1X2K A; 1T0J A; 2F2W A; 2J6O A; 3VS6 A; 2OAW A; 1YWP A; 3PVL A; 1QKW A; 2KBT A; 2FPF A; 1U5S A; 2YUO A; 3SHW A; 3UF4 A; 2GTJ A; 3REA B; 4F17 A; 2ROL A; 1AEY A; 1JO8 A; 1QWF A; 1K4U S; 2SEM A; 1ZUU A; 2A37 A; 1N5Z A; 2C0I A; 1AWX A; 2ROT A; 3EHQ A; 2DYB A; 4JJC A; 1WXU A; 2DRM A; 2EPD A; 1YP5 A; 4IIM A; 2M51 A; 4EIK A; 3QWY A; 1ZX6 A; 1S1N A; 3M0T A; 2KNB B; 2EBP A; 3ULR B; 1SPK A; 1PHT A; 2ESW A; 3C0C A; 1UGV A; 2MCN A; 2RNA A; 1GBR A; 1RUW A; 2G6F X; 3QWX X; 2DE0 X; 2HBW A; 2BTT A; 4J9I A; 2ENM A; 2OI3 A; 1HJD A; 1RLP C; 1WFW A; 2KT8 A; 2MOX A; 2DIL A; 1PRM C; 1UG1 A; 2YUQ A; 2LQN A; 2RQR A; 2FPE A; 2EQI A; 2OJ2 A; 2F2V A; 3NMZ C; 4J9C A; 1JXO A; 2W10 A; 1AWJ A; 2L3P A; 2X3W D; 2DNU A; 2DLP A; 2BZX A; 2V1Q A; 1VYU A; 2XMF A; 1BBZ A; 2FO0 A; 5IHK A; 2JT4 A; 1E7O A; 1NEG A; 1X6G A; 5IXF A; 1X2Q A; 1TG0 A; 1UTI A; 4F14 A; 2PTK A; 1PKS A; 1OOT A; 3IQL A; 2B86 A; 1GL5 A; 3TVT A; 2DF6 A; 3R6N A; 1NYG A; 3FJ5 A; 4Z89 A; 1V1C A; 2ABL A; 2AK5 A; 4KRT A; 2KXD A; 5GJW B; 2O9S A; 5FW9 A; 1VYV A; 4JPB W; 1ABQ A; 1Z9Z A; 3UAT A; 1WXB A; 2KEA A; 2EYW A; 3RNJ A; 1PWT A; 1ABO A; 1IO6 A; 4RTT A; 4J9F A; 4OML A; 2GBQ A; 3H0F A; 1NLP C; 2L3Q A; 1HD3 A; 1WIE A; 1MV3 A; 4AFU C; 5I22 A; 2DL5 A; 2CSI A; 2LP5 A; 3PE0 A; 2MIO A; 4CC2 A; 4LE9 A; 2DMO A; 4ESR A; 3O5Z A; 1QWE A; 2H8H A; 1K0S A; 1YCS B; 2ED1 A; 2O31 A; 2IIM A; 2JMA A; 2D1X A; 3THK A; 2AKL A; 1SEM A; 1WYX A; 2KRS A; 1OPK A; 2DRK A; 5IXB A; 2GQI A; 4QT7 A; 5FWB A; 3EG2 A; 1SHG A; 1UHC A; 4OMM A; 1X69 A; 3LH5 A; 1J3T A; 4J9B A; 2D8J A; 2P4R A; 2EGE A; 2CT4 A; 4M4Z A; 2KT1 A; 1PKT A; 4OMQ A; 1AOJ A; 1B07 A; 1WX6 A; 2CRE A; 2K7A A; 4JZ3 A; 2CH4 A; 2LMJ A; 2J06 A; 2BZ8 A; 3M0P A; 1WI7 A; 2DBM A; 2LJ0 A; 1X6B A; 2E5K A; 4HXJ A; 3VS3 A; 3VRZ A; 3H0I A; 1I1J A; 4GLM A; 1UJY A; 2DJQ A; 1OEB A; 5IHI A; 2RQV A; 1CSK A; 2D0N A; 1TUC A; 4ORZ A; 4LN2 A; 1XOV A; 1WLP B; 4R0K A; 1A0N B; 1JQQ A; 2YT6 A; 2RF0 A; 1K0X A; 1W70 A; 4CC3 A; 1PRL C; 2ECZ A; 1Y0M A; 2JTE A; 4AFQ C; 2EYY A; 3VS5 A; 4CC4 B; 2QDL A; 1FMK A; 1ZUK A; 1ZUY A; 1KFZ A; 1U3O A; 3REB B; 2C0T A; 2SRC A; 2HDA A; 1GCQ C; 2LNH B; 4F16 A; 1K9A A; 2EYX A; 2EKH A; 1OV3 A; 1RI9 A; 2YUP A; 3H0H A; 2JS0 A; 4Y92 A; 1H3H A; 2KXC A; 1RLQ C; 4CC7 A; 4A63 B; 3RBB B; 2DX1 A; 2PZ1 A; 1VA7 A; 4HCK A; 2VWF A; 3EG3 A; 3I5R A; 2CDT A; 2EGC A; 4D8K A; 3VS4 A; 4RTZ A; 3EHR A; 2GTO A; 1YN8 A; 1BB9 A; 1UJ0 A; 2M0Y A; 3M0Q A; 2AKK A; 1H92 A; 4LUD A; 4J9D A; 1QLY A; 3EG0 A; 2I0N A; 3NPF A; 2CUD A; 1GFC A; 2K3B A; 2O2O A; 4J9E A; 2DVJ A; 2RQW A; 2DL7 A; 2NWM A; 4Z8A A; 1U06 A; 1QCF A; 2FPD A; 1AWW A; 1UFF A; 4JJD A; 2RQT A; 3H41 A; 2ED0 A; 5IHN A; 1SSH A; 1WA7 A; 2HCK A; 4DEY A; 1JEG A; 2KE9 A; 3ZL7 C; 2YUN A; 2A36 A; 2VKN A; 4JJB A; 2RQU A; 4LNP A; 3SEM A; 1GFD A; 1GBQ A; 3A98 A; 5L23 A; 4E6R A; 3VRY A; 5GJV B; 1SHF A; 2RMO A; 5EC7 A; 1M3B A; 2LQW A; 4LUE A; 2GGR A; 1X27 A; 3I9Q A; 1WDX A; 2KRO A; 1ZSG A; 5ECA A; 1AWO A; 2KRM A; 2O88 A; 5IH2 A; 2F2X A; 1CKA A; 1CKB A; 2EW3 A; 1LCK A; 4HVW A; 2JS2 A; 1QKX A; 2K79 A; 3I35 A; 1G83 A; 2KR3 A; 1KIK A; 2A08 A; 5HCK A; 4OMO A; 2HEQ A; 1GRI A; 1K76 A; 1UUE A; 3M0R A; 1AVZ C; 2V1R A; 3EG1 A; 2BZY A; 4ZNX A; 2L3S A; 4FSS A; 3VS1 A; 1UDL A; 2FEI A; 1K1Z A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2FRY A; 3NGP A; 4PJL A; 1X43 A; 2QG9 B; 5HY6 A; 4GLK A; 2WSF E; 3VS2 A; 4ZGJ B; 1YJW Q; 2AZS A; 1R0C B; 4IUT A; 4M77 D; 3OYE A; 4A4E A; 1JU5 C; 3UA7 A; 3EGU A; 2J6K A; 2RJE A; 3TSW A; 2X4W A; 3CCR Q; 5GAO m; 1QQJ A; 1WXT A; 3LW5 E; 2VV5 A; 1TS9 A; 3CCS A; 2XG8 D; 4HCC A; 2CT3 A; 4L59 A; 2LX7 A; 4FYV B; 3CCV T; 3EH1 A; 2DA9 A; 2ZPH B; 2CUB A; 4C8Q C; 2EFI A; 3VS7 A; 2X9H A; 3KFV A; 2BUD A; 4IIO A; 2X4Y A; 2JM9 A; 2IVW A; 2P0P A; 1M8M A; 2E64 A; 3C94 A; 2VYT A; 3QXE B; 3PVQ A; 4M7D C; 3QDF A; 1NPP A; 1LJO A; 3CBP A; 1AD5 A; 2DL3 A; 4KUI A; 4DEX A; 1UEC A; 1QMC A; 3CCU T; 1SRM A; 1GCP A; 3CQT A; 1ACM B; 2KYB A; 2AIR B; 3H8Z A; 2FG0 A; 2Y4Y A; 3JCM V; 1VQP T; 2L8D A; 3CXC P; 3ME9 A; 2P0Q A; 4J8O A; 3RUX A; 4AFS C; 1JXM A; 3CC2 T; 2LJ3 A; 2QQB A; 2CSQ A; 4PFZ A; 4M78 C; 1MV0 B; 4N4I A; 1YIJ Q; 1E6H A; 1H64 1; 4EMH A; 2JVV A; 1ZBJ A; 4O5V A; 1Z9Q A; 5FU7 B; 3NTI A; 4FCY A; 3EGX B; 4OMP A; 2KGT A; 3TSZ A; 1FYN A; 2DD4 A; 1JRI A; 3LWH A; 3UA6 A; 1T3S A; 4ZTF A; 2KRN A; 2DXU A; 5KCH A; 4K11 A; 5GAM h; 1VQ7 A; 1W1F A; 2J7I A; 4M7A E; 2YLB A; 2LCS A; 3JB9 D; 5FRO A; 5DM7 R; 1FMV A; 1V29 B; 2I2L A; 3FDR A; 1KD1 R; 4M75 F; 1S72 A; 1LOJ A; 2D6F A; 4E47 A; 3UF4 A; 1N6A A; 4C5E A; 5CKD A; 2ROL A; 3CCJ T; 3CCM T; 2SEM A; 3RMQ A; 1OU8 A; 4ME7 A; 1N5Z A; 1AWX A; 3M4G A; 3EHQ A; 3PGG A; 2RA2 A; 1JB0 E; 1YP5 A; 3I56 T; 1S1N A; 1WHL A; 1BCO A; 2ESW A; 5CAI A; 2WSE E; 4C0D C; 2BKD N; 1EZZ B; 2QTX A; 1WQW A; 2FZC B; 2OI3 A; 1RAE B; 2VGM A; 3CC2 A; 2CZ1 B; 2DZC A; 3MJX A; 3JAM E; 1WFW A; 2DIL A; 1PRM C; 1MNE A; 4F7U B; 2M9U A; 3TQ7 P; 5HK0 A; 3M53 A; 2X3W D; 5LJ3 d; 1TWB A; 1WHG A; 2V1Q A; 2QI2 A; 2HL5 C; 1X2Q A; 1TG0 A; 4Y91 A; 3GLX A; 2RHX A; 2COW A; 2DF6 A; 1QVG S; 1V1C A; 1ZQ1 A; 2KXD A; 1OZ3 A; 2F69 A; 2QYZ A; 3RIR A; 3VJP A; 1JJ2 S; 4JPB W; 1ABQ A; 2JZ2 A; 4M7D A; 1QCN A; 1PWT A; 3HPW A; 4RTT A; 3QYG B; 4PJO E; 4J9F A; 5KH6 A; 2QEX Q; 3LWI A; 3ZFJ A; 3QHS A; 1HD3 A; 1KQ1 A; 1MV3 A; 3OSS C; 1F1B B; 3NFC A; 4J7I A; 4AFU C; 4A4K A; 2LP5 A; 1Q81 C; 4F7U G; 1Q81 R; 3M56 A; 4CC2 A; 2CS7 A; 3O5Z A; 2ZGW A; 3RR6 A; 4FM4 B; 2IIM A; 4R56 A; 3OYD A; 3QII A; 3I55 A; 4M78 A; 4OB1 B; 2K5I A; 2RJF A; 2EJG A; 3OB9 A; 3L2V A; 2K4Y A; 2QXF A; 4JS4 A; 4E7K A; 4FYY B; 4PJN A; 1Y96 A; 3QBY A; 3CCQ A; 3O8V A; 2CP6 A; 2HD0 A; 4M4Z A; 3CCE Q; 4J6W A; 5FU6 B; 3P8D A; 4OMQ A; 1WX6 A; 1B07 A; 2CRE A; 4P5N A; 2CH4 A; 2LMJ A; 4QQG A; 5GAN 3; 4XQ3 A; 3CC4 Q; 5GAN h; 2QAZ A; 3VRZ A; 2CP2 A; 1TUG B; 2E41 A; 1QVG A; 3OYI A; 4OB2 B; 1H3Z A; 3JCM e; 5LJ3 h; 2D0N A; 1TUC A; 4Y28 E; 2XDD A; 2QTV A; 1B34 A; 3E1S A; 1YHQ T; 1XOV A; 4R0K A; 1FMW A; 5FLX E; 5A0G A; 1BYM A; 2BE7 D; 3OA6 A; 2VAS A; 1VQ5 A; 1W4S A; 2ECZ A; 1Y0M A; 2JTE A; 3VS5 A; 1AT1 B; 3VV0 A; 1FMK A; 3HTR A; 5LJ5 e; 3C12 A; 1U3O A; 3REB B; 1TOV A; 4QVC A; 2LNH B; 3P8B B; 3G4S T; 1WQ7 A; 1M2V A; 3RKY A; 1OV3 A; 4NOY A; 4B9W A; 2DFU A; 2YUP A; 1UEB A; 4QVD A; 1BIA A; 4FIB A; 4PJO B; 3JCM X; 1NZ9 A; 1RLQ C; 4CC7 A; 2ZPF B; 3RBB B; 4MZP A; 1VQL Q; 2DX1 A; 1M2O A; 5GMK i; 1VA7 A; 2COZ A; 3CD6 A; 2NYS A; 3MKD A; 3I5R A; 4WF2 A; 3JCM g; 2YRV A; 3EH2 A; 4D8K A; 2V8K A; 3ZEH A; 3EHR A; 1Q95 G; 1D09 B; 2M0Y A; 2DXT A; 2VXE A; 2HBP A; 2AKK A; 3GOX A; 4XU0 A; 1QLY A; 2I0N A; 1D0Z A; 2CUD A; 3NPF A; 5KYU A; 5I21 A; 4CRI A; 2RQW A; 4Z8A A; 5D6Y A; 5LJ5 g; 2CP3 A; 2DEU A; 3VUZ A; 2FPD A; 4PKC C; 1AWW A; 3OW2 S; 3ASK A; 4JJD A; 3H41 A; 2EQU A; 2ED0 A; 1VQM A; 3MEU A; 1FX7 A; 2HCK A; 2JOY A; 3T9N A; 2EWN A; 4M7D F; 2JJ9 A; 3JSC A; 2DET A; 3J7A F; 3V7R A; 2KE9 A; 1Q82 C; 2K5F A; 1Q82 R; 4PJO G; 7AT1 B; 4C0F A; 1VQN T; 3OY9 A; 2E6Z A; 4JLG A; 3Q1J A; 4J6Y A; 4M7A C; 4E6R A; 5EC7 A; 1M3B A; 3HL8 A; 2XID A; 4LUE A; 1I5L A; 3I9Q A; 2KRM A; 2DKG A; 4M78 F; 4E7J A; 1CKA A; 2HQE A; 3I35 A; 1SSF A; 2KR3 A; 4PJJ A; 1KIK A; 2R5M A; 2KY9 A; 3PFS A; 5CKE A; 1IHW A; 5AYF A; 3E9G A; 3JB9 J; 1D1C A; 2X4X A; 3S6W A; 1KC8 C; 1KC8 R; 3M57 A; 2FZK B; 1BI3 A; 1I81 A; 2V1R A; 5LJ3 j; 1KQS S; 1D3B B; 1EIF A; 4EMK B; 1VIE A; 3WXM B; 1DJ7 B; 1WNL A; 2DXB A; 4LDW A; 3VYH B; 3CME Q; 2O4X B; 3CCL Q; 3G6E T; 3EGD B; 4N4H A; 2K9G A; 1IRX A; 3JCM h; 2LZ6 B; 2E70 A; 2RI3 A; 3JB9 I; 5I2M A; 2XI9 A; 2EGA A; 1N9S A; 2XDP A; 3RMS A; 2EVR A; 1GXI E; 1M3C A; 2RHZ A; 2DL8 A; 4RTV A; 3U23 A; 3SFM A; 5GAN 8; 1SRL A; 2MWO A; 3C4S A; 3SD4 A; 2K6D A; 2VC8 A; 2YDL A; 1YNZ A; 2YWW A; 5GMK e; 1VQN A; 2X3X D; 1HXD A; 1FWZ A; 2VXF A; 1VQ9 A; 2PUK B; 2M16 A; 4BE1 A; 4E7S A; 1M4Z A; 3DB4 A; 4C92 D; 3CCR T; 1M1K C; 2FRW A; 1VYT A; 1UGQ B; 1HSQ A; 5D7U A; 3HRT A; 4DBR A; 2KYM A; 3CC7 Q; 4GBQ A; 2XDB A; 3A8M B; 2P0K A; 1YJN Q; 2GCX A; 4J9H A; 1W2B S; 4OP0 A; 2RPN A; 9ATC B; 2PQW A; 5KYN A; 1ARK A; 2JTF A; 4RCB A; 5GAN 7; 2AHJ B; 3CPW S; 2JMC A; 4AMC A; 1ZLM A; 4II1 A; 1BK2 A; 1O9S A; 1M30 A; 2QQS A; 2A7Y A; 3QSU A; 1RAD B; 5I11 A; 1KQS A; 1ZSZ B; 2GNC A; 1MUZ A; 2ZZD A; 3EFO B; 3I5S A; 3M5A A; 1C1A A; 1VOM A; 3ER0 A; 5KE3 A; 2JW4 A; 1NG2 A; 1N8R C; 1IXD A; 3V8J A; 1T0H A; 3G6E A; 3CBO A; 4M77 C; 4X9C A; 1NYF A; 2PNI A; 4RG8 A; 3UDC A; 2LNV A; 1VQ8 Q; 1H8K A; 4BY6 B; 3GIB A; 4MMK A; 2FB7 A; 1PNJ A; 2DK3 A; 3MP1 A; 1YIJ T; 1VQO A; 2KQW A; 3S3M A; 4M7A A; 1X2K A; 2F2W A; 2RHU A; 1QKW A; 2CP0 A; 2PUO B; 1BKB A; 2YLC A; 3KBG A; 1KHI A; 5C0M A; 1PG5 B; 2CP5 A; 2YUO A; 3FJP A; 1YIT Q; 4F17 A; 3CCR A; 4DQ2 A; 1I5O B; 2ZPI B; 1QWF A; 4A4H A; 4PJO D; 2C0I A; 4TVR A; 1W2B A; 2DRM A; 3LGF A; 5GAM d; 2XKO C; 2EYQ A; 2M51 A; 3CPW A; 3M0T A; 3JCM c; 1SPK A; 2DAQ A; 3GF5 A; 2ZCF B; 2E3H A; 3MEA A; 3C0C A; 1UGV A; 4J5Y A; 4FL6 A; 3RER A; 3A8L B; 2LC4 A; 3QWX X; 3E9F A; 3OS1 A; 2Y4X A; 4XK8 E; 2HBW A; 2ENM A; 1RLP C; 4OB3 B; 4QVZ A; 3CMA A; 1N27 A; 1C6V X; 2HNI A; 2KT8 A; 5KE2 A; 3L2Z A; 1RAA B; 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