The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
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structure length |
64
|
Chain Sequence |
PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Endophilin-A2
|
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
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| molecule tags |
Endocytosis
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| total genus |
11
|
| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4R0K A; 2KR3 A; 4HVW A; 1GCQ A; 1WIE A; 2M0Y A; 1UE9 A; 1Z9Z A; 1ZBJ A; 2OI3 A; 1S1N A; 3THK A; 1SHG A; 2GNC A; 3H0H A; 2EYW A; 1AWJ A; 1GRI A; 2KRM A; 2FPD A; 1B07 A; 2NWM A; 3M0Q A; 2VWF A; 4JJB A; 2L0A A; 3EG0 A; 1MUZ A; 2D8H A; 4KRT A; 1H3H A; 1BBZ A; 2RF0 A; 2MCN A; 1X27 A; 2DLP A; 4AFS C; 2RNA A; 1WXU A; 2JW4 A; 2A36 A; 1M30 A; 3VS3 A; 4CC3 A; 5FWB A; 1M27 C; 2K9G A; 4J9G A; 1E6H A; 1UTI A; 4WCI A; 4Z88 A; 2KEA A; 3JV3 A; 1OPL A; 4LE9 A; 1KIK A; 2JS0 A; 1JEG A; 2RN8 A; 1RUW A; 2RQW A; 2EPD A; 2ENM A; 2B86 A; 3VS2 A; 4RTT A; 1WXB A; 4OMP A; 4DEX A; 2KT1 A; 3EHR A; 2CUD A; 1JU5 C; 1K0S A; 2CSI A; 2LQN A; 3H0I A; 2LNH B; 1U3O A; 1VYV A; 1SHF A; 2GQI A; 1I0C A; 2L2P A; 4J9E A; 1PRM C; 2JMA A; 1YWP A; 2GTJ A; 1ZSG A; 3VS4 A; 1M3C A; 2GTO A; 2LJ0 A; 1PKS A; 2BZY A; 2FPE A; 4CC4 B; 2CUB A; 1H92 A; 2SEM A; 2DJQ A; 2L3S A; 1AVZ C; 2KRO A; 1UDL A; 1SSH A; 2EYY A; 1YN8 A; 2LJ1 A; 2C0T A; 1EFN A; 1SEM A; 2KXD A; 2X3X D; 1K76 A; 4GLM A; 3VS7 A; 3GBQ A; 2KRS A; 1WA7 A; 2LQW A; 4IIO A; 2D8J A; 1VA7 A; 3R6N A; 1CSK A; 3TSW A; 3KFV A; 2QDL A; 1I1J A; 3M0P A; 2YT6 A; 2HEQ A; 2O9S A; 2VVK A; 2MIO A; 1G83 A; 3O5Z A; 3SHW A; 2DL4 A; 1SRL A; 4D8D A; 1KJW A; 2AZV A; 1ZUK A; 3PE0 A; 1NLP C; 2YUN A; 1W70 A; 2J6O A; 1K1Z A; 3A98 A; 2C0I A; 1AWX A; 2M51 A; 1E6G A; 2PNI A; 3H0F A; 2BZ8 A; 4K11 A; 1G2B A; 2EBP A; 3VRZ A; 2I0N A; 3VS5 A; 1A0N B; 4OMO A; 5GJW B; 1UUE A; 2DIL A; 2K3B A; 2P4R A; 2ROT A; 5I22 A; 3IQL A; 1TG0 A; 1UGV A; 3TVT A; 1K0X A; 1X2K A; 3EG3 A; 2K7A A; 2AK5 A; 2DMO A; 1AD5 A; 2L3Q A; 2YDL A; 3ZL7 C; 2ED1 A; 4ZNX A; 4RUG A; 4OMQ A; 1AWW A; 5IH2 A; 4M4Z A; 2DA9 A; 2KE9 A; 5IXB A; 1CKA A; 2L3P A; 1VYT A; 2HBW A; 3C0C A; 1AZG B; 2H8H A; 1RI9 A; 1Z9Q A; 4CC2 A; 4Y92 A; 1FMK A; 2JM9 A; 1PHT A; 4F14 A; 1K4U S; 4LUD A; 4LNP A; 1QKX A; 2CT4 A; 4AFZ C; 3M0S A; 1UG1 A; 3I5S A; 2ECZ A; 4HVU A; 2SRC A; 5IHI A; 2DVJ A; 1Y0M A; 2J6K A; 1IO6 A; 1JXO A; 2F2V A; 4OMM A; 4RTZ A; 1WLP B; 2LZ6 B; 2AKL A; 2E5K A; 4J9I A; 2A08 A; 2RQR A; 2O9V A; 2YUP A; 2DM1 A; 2V1R A; 2DX1 A; 2CT3 A; 3NGP A; 3EGU A; 1ABO A; 3H41 A; 1V1C A; 2IIM A; 2DL7 A; 1VYU A; 4QT7 A; 4E6R A; 4Z89 A; 2CH4 W; 2EGC A; 4DEY A; 1YWO A; 1I07 A; 4D8K A; 2O2O A; 2KRN A; 5IXF A; 1T3L A; 1X43 A; 1NYF A; 1SPK A; 1ARK A; 2FO0 A; 1OOT A; 2J06 A; 2KYM A; 2FRW A; 3NMZ C; 2KGT A; 4J9B A; 3I35 A; 3UA7 A; 4RTV A; 1MV0 B; 3M0T A; 4A63 B; 2CSQ A; 2KXC A; 2LJ3 A; 2NUZ A; 1T0H A; 2EW3 A; 4JJC A; 1YP5 A; 4RTU A; 1GBQ A; 4AFQ C; 2D1X A; 1T0J A; 3TSZ A; 3M0U A; 3I5R A; 1OEB A; 1AZE A; 1QWE A; 1W6X A; 2EQI A; 1AWO A; 1K9A A; 2V1Q A; 1U5S A; 4CC7 A; 1JXM A; 2DE0 X; 1N5Z A; 1GFD A; 5EC7 A; 3EHQ A; 5FW9 A; 2DBK A; 2DL8 A; 1GL5 A; 1FYN A; 1GCQ C; 2DBM A; 1BB9 A; 4FSS A; 1RLQ C; 4F16 A; 4RTX A; 3LH5 A; 1AEY A; 1NM7 A; 4J9C A; 5I11 A; 1M8M A; 3NHN A; 2FG0 A; 2BTT A; 1OV3 A; 1U06 A; 1H8K A; 1WX6 A; 4RTY A; 3RBB B; 2JM8 A; 2ROL A; 1X6G A; 2GBQ A; 4ORZ A; 4IIM A; 3RNJ A; 1ABQ A; 3UAT A; 1WDX A; 2AKK A; 2YUQ A; 5HCK A; 1UEC A; 4LN2 A; 1OPK A; 2DF6 A; 1KSW A; 1YCS B; 1YNZ A; 4JJD A; 2X3W D; 3M0R A; 2JMC A; 1PWT A; 3I9Q A; 4J9D A; 2W10 A; 1M3A A; 2PZ1 A; 2RMO A; 4AG2 C; 2MOX A; 3PVL A; 1QCF A; 3PVQ A; 1JO8 A; 4HCK A; 2YUO A; 1ZLM A; 2FRY A; 5FWC A; 1HD3 A; 4RTW A; 4X1V A; 3UA6 A; 5L23 A; 2DL3 A; 4J9H A; 1BK2 A; 2G6F X; 1TUD A; 3EG1 A; 1PRL C; 3FJ5 A; 2JS2 A; 2LP5 A; 2AZS A; 2XMF A; 2HDA A; 2C0O A; 1MV3 A; 1W1F A; 2DRK A; 1BU1 A; 2YSQ A; 2KYB A; 2CDT A; 2KNB B; 1WI7 A; 2DYB A; 2LMJ A; 2RQU A; 1HJD A; 1WXT A; 2EGA A; 4F17 A; 2BZX A; 3EG2 A; 1B3Q A; 1X6B A; 1PKT A; 1AOJ A; 1HSQ A; 1M3B A; 1QLY A; 1QWF A; 4JZ3 A; 2A37 A; 3SEM A; 2DNU A; 2KT8 A; 1TUC A; 2FEI A; 1XOV A; 2J7I A; 2OAW A; 5IHK A; 2DL5 A; 3QWY A; 2A28 A; 4AFU C; 2JTE A; 2HCK A; 1NEB A; 1SRM A; 3VS6 A; 4HXJ A; 2W0Z A; 1T3S A; 2LX7 A; 2KBT A; 3NPF A; 2K2M A; 2OJ2 A; 4AG1 C; 2J6F A; 2CH4 A; 2ED0 A; 3U23 A; 2F2W A; 2D0N A; 1GBR A; 3VS0 A; 1NEG A; 5GJV B; 2O88 A; 4HVV A; 2EVR A; 4LUE A; 4EIK A; 2HSP A; 4GBQ A; 1RLP C; 3VRY A; 2RQT A; 2RPN A; 1WFW A; 4Z8A A; 3UF4 A; 1ZUY A; 4ESR A; 1PNJ A; 2RQV A; 3QWX X; 1NG2 A; 2F2X A; 5IHN A; 1GFC A; 2K6D A; 3ULR B; 1J3T A; 1GCP A; 1QKW A; 2J05 A; 2CRE A; 1UFF A; 1UJY A; 1X69 A; 2VKN A; 1UHF A; 1NLO C; 1UJ0 A; 4OML A; 1LCK A; 1JQQ A; 1ZUU A; 2O31 A; 1CKB A; 2ABL A; 2FPF A; 2DRM A; 3REB B; 1NYG A; 4OMN A; 1WYX A; 1X2Q A; 3CQT A; 2PTK A; 4JPB W; 1Y57 A; 1ZX6 A; 2ESW A; 5ECA A; 2JT4 A; 4JZ4 A; 2GGR A; 2JXB A; 2EKH A; 1KFZ A; 2EGE A; 2LCS A; 2EYX A; 3REA B; 1E7O A; 2EYZ A; 2K79 A; 1UHC A; 3VS1 A; 4J9F A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2EJ9 A; 5GAN 8; 4FYV B; 1Z9Z A; 3L2W A; 2GNC A; 4M75 F; 3JCM c; 2EYW A; 3RR6 A; 1R8O B; 3J7A F; 5AYF A; 3CPW A; 1YJ9 A; 3OYL A; 2L0A A; 2LX9 A; 5AT1 B; 1H3H A; 1KQS S; 2RJE A; 3BDL A; 2MCN A; 5C6S A; 1IGU A; 3EGX A; 3UDC A; 2CKK A; 4M7D E; 4FSX A; 1K8A R; 3SD4 A; 4ANJ A; 3RER A; 2A36 A; 3V8K A; 4XQ3 A; 1M30 A; 1TWB A; 2DXC A; 4CC3 A; 2L3R A; 1G3Y A; 1M27 C; 4AT1 B; 1VQ5 A; 3OBY A; 4QKU A; 4FW2 A; 1JEG A; 1RUW A; 3M4G A; 3UT1 A; 2PUO B; 4E7L A; 2ENM A; 4XU2 A; 4N4I A; 4RTT A; 4OMP A; 2G3R A; 3EHR A; 5KYY A; 3CME T; 2M02 A; 4FW1 A; 4EMK B; 3CC2 A; 2V8I A; 1VYV A; 2L2P A; 4J9E A; 3MP6 A; 4DBH A; 1RAG B; 1PRM C; 2JMA A; 2GTJ A; 5GAO r; 9ATC B; 2K57 A; 3VS4 A; 3JRZ A; 1OX9 A; 4PJO D; 2VB6 A; 3LX7 A; 3I56 T; 2CS7 A; 2VYT A; 4J6W A; 2RHI A; 3JCM d; 1MMG A; 2FPE A; 4X9D A; 3L2R A; 5LJ3 f; 1FWZ A; 3PIP A; 1NJI U; 4JUV A; 3CC4 T; 2EYY A; 5J39 A; 5D6X A; 4QQD A; 2KXD A; 3OSS C; 4PLI A; 2KRS A; 1W4S A; 4WF2 A; 1ZQ1 A; 5IT9 E; 1QVG P; 3MEV A; 2LT4 A; 3TSW A; 2XG8 D; 1I1J A; 3CCS Q; 3JSC A; 2YT6 A; 1X75 C; 3JCM Q; 5D7U A; 1B34 B; 3JCM W; 1K73 R; 3SHW A; 2XU8 A; 3OW2 A; 2ZPF B; 1WJQ A; 2VAS A; 4M78 E; 1KJW A; 3JCM e; 2OTJ Q; 4QVD A; 4DBQ A; 3BY7 A; 2BUD A; 3KUF A; 2FL7 A; 1PD0 A; 2C0I A; 6AT1 B; 1E6G A; 2VXF A; 4UC4 A; 2BZ8 A; 4JDS A; 2YLB A; 4ZGJ B; 1G2B A; 3VRZ A; 1RAI B; 2WSF E; 3CME A; 1BYM A; 2DFU A; 2DIL A; 2P4R A; 2GQV A; 1TSF A; 1UGV A; 3IQL A; 3G4S Q; 4RCB A; 1V29 B; 2CZ6 B; 2DMO A; 3OYD A; 1BIB A; 2YDL A; 1AWW A; 2MYS A; 2DA9 A; 1CKA A; 4JRP A; 1VYT A; 3GOX A; 1K9M C; 5CKD A; 1AZG B; 1D1C A; 3CCM T; 2DO3 A; 3CD6 Q; 4CC2 A; 1RI0 A; 2QA4 A; 1FMK A; 1KQS A; 3QUI A; 1SSF A; 5KYU B; 1PHT A; 2HNI A; 4C8Q F; 8ATC B; 4LNP A; 1WJS A; 4EMH A; 1K9M U; 4XK8 E; 2CT4 A; 3M0S A; 4EMK C; 3I5S A; 4HVU A; 2DVJ A; 3M4Y A; 4QVZ A; 2F2V A; 4N0A A; 4RTZ A; 3QHS A; 2YXY A; 1WLP B; 2CP6 A; 2E5K A; 4PFZ A; 3SFM A; 3QKJ A; 2V1R A; 3CBO A; 4C8Q G; 5GAO n; 3NGP A; 3H41 A; 2ZGW A; 2IIM A; 3ZEH A; 1F1B B; 1IRE B; 4QT7 A; 4E6R A; 3X25 B; 1YHQ Q; 2EGC A; 4DEY A; 3E19 A; 1LPL A; 2DIG A; 1T3L A; 1KD1 U; 2J06 A; 3P8B B; 2COY A; 3CCR T; 4WTO B; 3NMZ C; 1QW1 A; 1I81 A; 3I35 A; 2HQH A; 2CSQ A; 3MKD A; 3V8L A; 4JJC A; 3CCM A; 3G71 T; 5KYX B; 2K4Y A; 1Q81 R; 2KI7 A; 1QVF S; 3M0U A; 1C0M A; 1WHK A; 1OEB A; 1AZE A; 3FDR A; 1ZSZ B; 2V1Q A; 2RI3 A; 2YRD A; 4MDX A; 1HXD A; 4M77 F; 3PT9 A; 5LJ5 h; 3VJP A; 4Z02 A; 1GFD A; 5EC7 A; 4DBR A; 3H8Z A; 1GL5 A; 1VQK Q; 1AHJ B; 1FYN A; 5KCH A; 4BAC A; 3M53 A; 3HSB A; 1GCQ C; 5A0D A; 4LXC A; 5FRO A; 1M1K C; 4RTX A; 4KGZ B; 1M8M A; 2FG0 A; 3L42 A; 1JRI A; 4FCY A; 2KK4 A; 1YI2 T; 3R6O A; 1W2B S; 4OB1 B; 3RBB B; 4MZT A; 2JM8 A; 3JB9 I; 2BIV A; 2D9T A; 2DIQ A; 1JJ2 S; 3UAT A; 1WDX A; 1VQN T; 2QQS A; 5HCK A; 3JB9 D; 1UGP B; 3QZ5 B; 1KK7 A; 1M2V A; 4M75 E; 2DF6 A; 3JB9 G; 1LOJ A; 3JCM f; 3CBP A; 1KSW A; 1YJW A; 2CP2 A; 1PM3 A; 5HK3 A; 2QI2 A; 1M3A A; 3CCU A; 2P84 A; 2YRV A; 2M0O A; 2E6N A; 1G5V A; 4HCK A; 5DLQ E; 1VQ9 Q; 4V2S A; 3G71 A; 3OMG A; 2KQW A; 4C92 F; 4FT2 A; 2X4W A; 2RM4 A; 3RDV A; 5L23 A; 2DL3 A; 5CKH A; 4M78 B; 5KYN A; 3G7Z A; 4C0F A; 4BI4 A; 1TUD A; 1Q82 U; 3RKX A; 5GAN h; 4KGV B; 3EGX B; 1G3S A; 3GF5 A; 5CIU A; 2C0O A; 1MV3 A; 2DRK A; 3OS2 A; 1BU1 A; 3QXE B; 2DZ9 A; 1XJW B; 4C5H A; 1BCM A; 2KNB B; 3OS5 A; 3HPW A; 4P5N A; 1WXT A; 4KH1 B; 1B3Q A; 3VKI A; 1PKT A; 4HCC A; 1YI2 A; 3MEA A; 1AOJ A; 1HSQ A; 1RAH B; 2ZCF B; 1PD1 A; 1RAD B; 1NPP A; 2IG0 A; 5KYY B; 2KT8 A; 2LTO A; 4C8Q A; 2FEI A; 2E64 A; 2J7I A; 3T9N A; 2JTE A; 1VQN A; 2HCK A; 1NEB A; 1RAF B; 4JLI A; 4XU3 A; 4N4H A; 2P0Q A; 3VS6 A; 3G6E T; 4DBF A; 2OJ2 A; 4EMK A; 2CH4 A; 3JCM J; 1QVF A; 2ED0 A; 3U23 A; 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2HMA A; 4BE0 A; 4M75 B; 2RNA A; 2JW4 A; 1E6H A; 2QQB A; 1Q7Y R; 2JTM A; 4Z88 A; 2KEA A; 2DER A; 1OPL A; 1O75 A; 4PJJ A; 5LJ3 e; 3MCA B; 2RQW A; 2QG9 B; 4DEX A; 2RJD A; 3CCM Q; 1JU5 C; 1YHQ A; 2CSI A; 3FLG A; 3H0I A; 2LNH B; 4A54 A; 4OMF B; 1SHF A; 4IUU A; 1ZSG A; 1UGQ B; 3SWN C; 1TS9 A; 4M77 E; 3C12 A; 4HKE A; 3S3N A; 2RD1 A; 4EDU A; 1VQM Q; 2GTO A; 2EQU A; 1N6A A; 1PKS A; 4Y91 A; 4CC4 B; 4IUQ A; 2SEM A; 2KRO A; 2CP3 A; 2HQX A; 1SSH A; 1VQ9 T; 4BDZ A; 2RHX A; 2CP5 A; 1SEM A; 2X3X D; 3GBQ A; 5GAN 7; 1WA7 A; 1SG5 A; 2D8J A; 2PVD B; 1CSK A; 3LH0 A; 4NOY A; 2K5F A; 3RIR A; 4JRQ A; 5LJ3 j; 2JN0 A; 4CI0 C; 1OUL A; 3LW5 E; 2O9S A; 1EIF A; 2QK0 A; 8AT1 B; 1KHI A; 2DL4 A; 4J83 A; 1NJI R; 4O6J A; 1SRL A; 1Y96 A; 3MEU A; 1VQ8 T; 1W70 A; 3CCR Q; 3NTI A; 4CRI A; 1M2V B; 4FYY B; 1PSE A; 3A98 A; 2V8J A; 1I4K 1; 2PNI A; 3QYH B; 2CP0 A; 4K11 A; 3AHU A; 3VS5 A; 2GF7 A; 2R58 A; 3G71 Q; 3CC7 Q; 4C0D B; 1UUE A; 1TG0 A; 1XNI A; 3TVT A; 3S6W A; 4M75 C; 3EG3 A; 4F7U A; 5LJ5 f; 4J5Y A; 4KBM B; 4RUG A; 5IH2 A; 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