The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Endocytosis
|
| source organism |
Rattus norvegicus
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| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| molecule keywords |
Endophilin-A2
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| total genus |
11
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2V1Q A; 3JV3 A; 3VS5 A; 2DRM A; 1GFD A; 1ZSG A; 3M0Q A; 5FWC A; 1QCF A; 2JMC A; 2HBW A; 1MUZ A; 2DL7 A; 2W10 A; 2YDL A; 3I35 A; 1GCQ C; 1NEG A; 1M8M A; 4LUD A; 2FG0 A; 1X2Q A; 2ABL A; 5IHN A; 2DX1 A; 1K76 A; 2LP5 A; 2CH4 A; 2D0N A; 1TG0 A; 4JJC A; 1PKT A; 2GNC A; 3A98 A; 4HVW A; 4GBQ A; 2EYY A; 3VS2 A; 2DIL A; 4HVV A; 4RTW A; 2NWM A; 4AG2 C; 4KRT A; 1SHF A; 4OMP A; 4DEY A; 2ROL A; 1WA7 A; 2C0T A; 1SRM A; 2L2P A; 4LNP A; 1AEY A; 1QWF A; 2GGR A; 1JEG A; 1ZBJ A; 1KJW A; 2DF6 A; 2DMO A; 4Z8A A; 1JQQ A; 1UE9 A; 2RN8 A; 4RTV A; 1H3H A; 2EQI A; 2FPF A; 1VYT A; 2KRS A; 2DYB A; 2F2W A; 4J9D A; 3VS3 A; 1GCQ A; 5ECA A; 2DBK A; 2EYZ A; 1RLP C; 3M0T A; 2PTK A; 2RNA A; 1W1F A; 2BZY A; 2BTT A; 1NM7 A; 3EG3 A; 2L3P A; 4AG1 C; 2O31 A; 1GFC A; 2DL4 A; 1Z9Z A; 5IH2 A; 2MIO A; 2IIM A; 1JXO A; 1J3T A; 2VKN A; 1Y0M A; 3H0H A; 3VS1 A; 3VS6 A; 3PVL A; 4DEX A; 1TUC A; 2C0I A; 4K11 A; 1IO6 A; 1K9A A; 2ED1 A; 2LMJ A; 2OAW A; 2J6F A; 2QDL A; 2YT6 A; 2YUP A; 1JU5 C; 1BB9 A; 2LJ0 A; 2DJQ A; 3VRZ A; 2MOX A; 1U3O A; 1UG1 A; 2KXC A; 1I0C A; 2BZ8 A; 2GTJ A; 2J7I A; 1KSW A; 2A36 A; 2DVJ A; 2I0N A; 2AZS A; 4EIK A; 2HEQ A; 2CUB A; 3NHN A; 3M0U A; 3I9Q A; 1KIK A; 1JO8 A; 1AWX A; 3M0R A; 2CDT A; 2CT4 A; 2D8H A; 3UA7 A; 1M3C A; 4R0K A; 2DL8 A; 4CC2 A; 3C0C A; 1WFW A; 2RQW A; 1UTI A; 4J9H A; 2EGA A; 3IQL A; 1PHT A; 2MCN A; 2EVR A; 4J9E A; 1CKA A; 1EFN A; 1OV3 A; 4Z89 A; 1NYF A; 1OPL A; 2AKK A; 1NLP C; 2LJ3 A; 2KYM A; 2FO0 A; 5FWB A; 5L23 A; 1VYV A; 2K7A A; 1WXU A; 2EYX A; 2PNI A; 2KR3 A; 3H41 A; 3TSW A; 5I11 A; 1SHG A; 2O9S A; 2A08 A; 1UHC A; 1X69 A; 2KXD A; 2XMF A; 5FW9 A; 2RF0 A; 1AWW A; 1ZLM A; 3CQT A; 1S1N A; 4HVU A; 5IHK A; 2O88 A; 2EPD A; 1AVZ C; 1W70 A; 3ZL7 C; 2K9G A; 1WI7 A; 1HSQ A; 2OI3 A; 3H0F A; 2KEA A; 2ENM A; 4WCI A; 2W0Z A; 1FMK A; 3KFV A; 1K0S A; 1K0X A; 4E6R A; 2KBT A; 2V1R A; 3REB B; 2JS2 A; 4AFS C; 4F14 A; 1YWO A; 2HCK A; 1G83 A; 1M30 A; 4J9F A; 1K4U S; 3VS7 A; 2JMA A; 2AZV A; 1T3S A; 3M0P A; 1X43 A; 3QWY A; 3NPF A; 1PKS A; 1Y57 A; 1GCP A; 1SRL A; 3EG0 A; 3I5R A; 4OMO A; 2LJ1 A; 4FSS A; 2NUZ A; 2K6D A; 1ZUK A; 2OJ2 A; 3VS4 A; 4Z88 A; 2E5K A; 4OMN A; 5EC7 A; 2YUN A; 1PRL C; 3SEM A; 3U23 A; 2DM1 A; 2LQW A; 4JPB W; 2VVK A; 1BK2 A; 3PE0 A; 1BU1 A; 1GBQ A; 1AWO A; 1ARK A; 2L3S A; 2X3W D; 1UUE A; 2C0O A; 1KFZ A; 1N5Z A; 1W6X A; 1X6G A; 1V1C A; 1YNZ A; 1YCS B; 1E6H A; 1MV0 B; 1AWJ A; 1ABO A; 2EGC A; 1LCK A; 4OMQ A; 1H8K A; 4JZ3 A; 4GLM A; 4QT7 A; 3EHR A; 1UJ0 A; 2KT8 A; 4HCK A; 1QLY A; 2ECZ A; 2J06 A; 5HCK A; 2YSQ A; 4Y92 A; 2DBM A; 1WDX A; 1GBR A; 2H8H A; 2KE9 A; 1NLO C; 2D8J A; 1CSK A; 2CSQ A; 3VRY A; 3GBQ A; 5I22 A; 1XOV A; 3VS0 A; 1OPK A; 3H0I A; 4J9I A; 2FPE A; 4IIO A; 1U06 A; 2FRW A; 4LN2 A; 4HXJ A; 3ULR B; 2JM8 A; 4ZNX A; 1AD5 A; 2RQR A; 2KGT A; 1X27 A; 1SPK A; 5GJV B; 5IHI A; 2G6F X; 1AZE A; 2O9V A; 4RTX A; 2P4R A; 3EHQ A; 2VWF A; 2DNU A; 3R6N A; 2A37 A; 4D8D A; 1WX6 A; 1G2B A; 1K1Z A; 2K3B A; 4OML A; 2KYB A; 2AKL A; 2KRN A; 4RTT A; 2DL5 A; 2RQU A; 4J9C A; 2ROT A; 2M0Y A; 4IIM A; 1SSH A; 2EBP A; 2KRM A; 4A63 B; 2GTO A; 4CC3 A; 1T0J A; 1HD3 A; 1E7O A; 1U5S A; 1X6B A; 3M0S A; 3UAT A; 2FEI A; 2LQN A; 1YWP A; 2FRY A; 4AFU C; 2GBQ A; 1QKW A; 1UGV A; 4JJD A; 1NG2 A; 3QWX X; 4RUG A; 2LCS A; 2JXB A; 1CKB A; 2EGE A; 2AK5 A; 4AFQ C; 2KT1 A; 1WXB A; 1T3L A; 1M3A A; 4RTY A; 2EKH A; 2EYW A; 1JXM A; 1WIE A; 1AOJ A; 2JS0 A; 1SEM A; 1NEB A; 4F16 A; 3SHW A; 2RMO A; 4M4Z A; 4OMM A; 4CC7 A; 2JT4 A; 1A0N B; 1TUD A; 2ESW A; 1B3Q A; 2D1X A; 3O5Z A; 2KNB B; 2J6O A; 4D8K A; 1YP5 A; 1I07 A; 1FYN A; 2F2X A; 4JJB A; 2BZX A; 3I5S A; 2L0A A; 1WYX A; 4LE9 A; 2LZ6 B; 1QWE A; 2K2M A; 1RUW A; 2KRO A; 2CSI A; 4AFZ C; 2HSP A; 1RLQ C; 1M3B A; 2DLP A; 4LUE A; 1OOT A; 1OEB A; 1VA7 A; 2K79 A; 1YN8 A; 1WLP B; 3NMZ C; 2JW4 A; 2CUD A; 3EGU A; 4JZ4 A; 1UDL A; 1ZUU A; 1I1J A; 2B86 A; 1ZUY A; 1PNJ A; 2CT3 A; 3PVQ A; 2L3Q A; 1T0H A; 3LH5 A; 1UJY A; 1AZG B; 2GQI A; 2YUO A; 1X2K A; 1UHF A; 2J6K A; 2DE0 X; 4ORZ A; 1UEC A; 3RBB B; 3RNJ A; 1B07 A; 2FPD A; 3FJ5 A; 2J05 A; 2JTE A; 2M51 A; 2JM9 A; 2PZ1 A; 1H92 A; 1PWT A; 2CH4 W; 1NYG A; 2DRK A; 2SEM A; 1ZX6 A; 2LNH B; 3TSZ A; 1E6G A; 3UA6 A; 5IXB A; 1MV3 A; 2DA9 A; 3EG1 A; 4RTU A; 2F2V A; 2RQV A; 1UFF A; 3REA B; 2LX7 A; 3THK A; 1HJD A; 4J9B A; 4ESR A; 2RQT A; 2ED0 A; 1GL5 A; 5GJW B; 2A28 A; 2DL3 A; 2O2O A; 2X3X D; 2HDA A; 2EW3 A; 2YUQ A; 3EG2 A; 5IXF A; 4X1V A; 2RPN A; 1PRM C; 1Z9Q A; 2CRE A; 1RI9 A; 1QKX A; 4J9G A; 3NGP A; 4RTZ A; 4CC4 B; 4F17 A; 1M27 C; 1GRI A; 3TVT A; 1ABQ A; 3UF4 A; 2SRC A; 1VYU A; 1WXT A; 1BBZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2YRC A; 3VS5 A; 2XD0 A; 2QEX T; 1UGQ B; 3CCJ A; 3JCM P; 3OYK A; 1ZSG A; 3CC7 Q; 4DBF A; 2M02 A; 1JJ2 S; 3I35 A; 2W10 A; 1GCQ C; 2EJG A; 3LH0 A; 4F7U E; 3VKI A; 2FG0 A; 1M2V B; 1X2Q A; 2CP0 A; 4M77 G; 1VQ7 Q; 4PJO A; 2I2L A; 2YWW A; 2GNC A; 3M4Y A; 2HQH A; 5IT9 E; 5FRN A; 2O4X B; 1MMA A; 4XU1 A; 4C8Q B; 4BAC A; 1WA7 A; 3VYH B; 2VYT A; 1SRM A; 2EJF A; 5KE2 A; 4LNP A; 1KQ1 A; 1K8A C; 2GGR A; 2V8J A; 2DMO A; 4F04 B; 2CP3 A; 2EFI A; 4QQD A; 1VQN T; 3S3M A; 1UE9 A; 2FL7 A; 3J81 E; 2EQI A; 1D0Z A; 1JJ2 P; 2FPF A; 2XDD A; 4C8Q C; 1O75 A; 4J6W A; 5ECA A; 3OYA A; 3M0T A; 4LDU A; 1U1T A; 2RNA A; 3CXC S; 4EDU A; 1NM7 A; 4AG1 C; 2O31 A; 3PT9 A; 4ELZ C; 5IH2 A; 1JXO A; 2GCX A; 1J3T A; 1Y0M A; 3H0H A; 3G71 A; 4GLK A; 3VS1 A; 1D3B A; 1B7T A; 1TUC A; 1YIT T; 3MKD A; 4PJO B; 3GIB A; 1KQS A; 1M1F A; 1VQN Q; 4L59 A; 2YLB A; 2DXT A; 3VRZ A; 2KXC A; 2MWO A; 2BZ8 A; 3DB3 A; 4CI0 C; 2E41 A; 2KY9 A; 1QVP A; 1VQ9 T; 1NBE B; 2WSF E; 3M0U A; 3DKM A; 2E4H A; 1KIK A; 3M0R A; 2CDT A; 5IAY A; 1M90 C; 4RKU E; 3UA7 A; 4IUR A; 2JVV A; 3TQ7 P; 3HFO A; 1WFW A; 1UTI A; 2D0Q B; 3IQL A; 2CKK A; 3CC2 Q; 2ZCF B; 3CPW S; 1YIT Q; 2NLU A; 2E6N A; 1OV3 A; 1R77 A; 3N5B B; 2CZ1 B; 4XU3 A; 2K7A A; 4F7U F; 2JN0 A; 2QYZ A; 4M77 B; 4MML A; 4J5Y A; 2KR3 A; 2KVQ G; 3H41 A; 4DBH A; 3CD6 Q; 3Q1J A; 5I11 A; 3I56 A; 1UHC A; 2KXD A; 1RAG B; 3F70 A; 4J6X A; 2F5K A; 1ZLM A; 1G3T A; 1YHQ Q; 2DXU A; 5GAN 8; 1W70 A; 5A2Q E; 1K9M C; 4M7A G; 4IUU A; 4XTY A; 2K9G A; 4M77 C; 1ZHI A; 2ENM A; 1TXQ A; 4PNO A; 1MMD A; 3M53 A; 2ZZD A; 3REB B; 3OB9 A; 1LNX A; 4D6W A; 2JS2 A; 4F14 A; 1I8F A; 5KYW B; 3OS2 A; 4EMK B; 4FCY A; 4OB3 B; 2VGM A; 2AZV A; 3M0P A; 1X43 A; 4KGX B; 1PKS A; 4ME7 A; 5DLQ E; 1I81 A; 3C12 A; 3I5R A; 4OMO A; 4FT2 A; 1QP2 A; 3WVE B; 2K6D A; 1ZUK A; 2OJ2 A; 4FYX B; 4BB7 A; 1LPL A; 2COW A; 3D7S B; 3CPW A; 2E5K A; 4OMN A; 1BCM A; 3CC4 A; 2YUN A; 4EMK C; 1N8R C; 4M78 F; 4DBR A; 4XK8 E; 2K57 A; 3SEM A; 3AT1 B; 3QO3 A; 2LQW A; 1QMC A; 1BK2 A; 1B34 B; 1GBQ A; 3M59 A; 2L3S A; 3RIR A; 1G8X A; 3GNG A; 2X3W D; 3CBO A; 4JJN K; 3UDC A; 1N5Z A; 3NTK A; 4M77 E; 5CIU A; 2E12 A; 3QII A; 3CCQ A; 1X6G A; 2H3E B; 3LGF A; 1YNZ A; 3CCS Q; 1E6H A; 1IB8 A; 1MV0 B; 2K2V A; 1LCK A; 3A5Z B; 2DD4 A; 2OTL Q; 4M75 D; 4GLM A; 3EHR A; 1UJ0 A; 3C94 A; 1QLY A; 4DA4 A; 3V8J A; 1KK7 A; 4CRI A; 3PGG A; 4Y92 A; 1GBR A; 1WHM A; 3JCM f; 2WSC E; 3GBQ A; 3CCV Q; 3EH1 A; 5CK9 A; 5GAO l; 1QQJ A; 1VQ5 Q; 2FPE A; 1U06 A; 3OYJ A; 4HXJ A; 4N4H A; 2AT1 B; 1AD5 A; 1OU9 A; 1Y7X A; 2KI7 A; 2OAU A; 3G6E A; 1YJN T; 1SPK A; 1BKB A; 1RAB B; 3JB9 D; 4X9D A; 2DEQ A; 2IG0 A; 2VWF A; 4DOV A; 2MYS A; 2A0F B; 2FZK B; 3LGL A; 1VQP Q; 2L5Q A; 1QVG S; 3X20 B; 1EZZ B; 2R5A A; 1VQM T; 3PIO A; 1SSH A; 4NS5 A; 4EMH A; 2KRM A; 5GMK i; 1HD3 A; 4M75 A; 2FEI A; 4HA8 A; 4QQ6 A; 1YWP A; 2FRY A; 1QKW A; 1W2B S; 3EFO B; 3QWX X; 1S72 A; 3CCL Q; 1CKB A; 2AK5 A; 1OQK A; 3MHX A; 3OMC A; 2EYW A; 2YRV A; 1WIE A; 1AOJ A; 5I2M A; 1ZQ1 A; 2KAF A; 2RMO A; 3CBP A; 1QVG P; 3H8Z A; 5L8R E; 1ZA1 B; 1A0N B; 2OTJ Q; 5GMK j; 2F69 A; 4JLI A; 2DER A; 2F5T X; 5LJ3 j; 2F2X A; 2BZX A; 3I5S A; 5FLX E; 3M55 A; 2LZ6 B; 2K2M A; 2F1L A; 2B8A A; 2KRO A; 5KYU B; 1LVK A; 3FIF A; 5DM7 R; 1D0Y A; 3PIP A; 3FDR A; 2DLP A; 2RH2 A; 1OEB A; 1W2B P; 4IUP A; 4MZM A; 3JCM e; 3EGU A; 4JZ4 A; 4ZN3 A; 5FRO A; 3VYG A; 3J80 E; 3QSU A; 1KD1 U; 1RAA B; 3X24 B; 4FT4 A; 4M7A E; 1UJY A; 1X2K A; 3S3N A; 4ORZ A; 1VQO T; 5CO7 A; 5LJ3 f; 5GAN f; 1LJO A; 2DVE A; 2JM9 A; 2LVM A; 1G3Y A; 4ZGE B; 4C92 F; 1NYG A; 1VQK T; 1OUL A; 2BE9 B; 4HCC A; 5IXB A; 4E47 A; 3QJY A; 4HT8 A; 2P4T A; 2CP5 A; 2RA2 A; 1Q95 G; 4JS5 A; 1BYM A; 3WXM B; 1RAC B; 3A8L B; 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3G7Z A; 4PL6 A; 4PJJ A; 2LJ0 A; 2DFU A; 3TCJ A; 5IN1 A; 5GAM g; 4JRK A; 1KSW A; 4Q5W A; 3CCM A; 3E19 A; 3CC7 T; 4EIK A; 3NHN A; 1FWZ A; 2RI2 A; 3I9Q A; 3FRN A; 1JO8 A; 1AWX A; 1VQ8 A; 2D8H A; 3DLL A; 2C06 A; 3JRZ A; 3MO8 A; 1VQ7 T; 2DL8 A; 4B9W A; 3JCM W; 2QK0 A; 4J9H A; 2RQW A; 2EGA A; 4NL3 A; 4DQ2 A; 2EQK A; 3QJ6 A; 4KT0 E; 1AT1 B; 2D9T A; 4J9E A; 1CKA A; 2JOY A; 4PJL A; 2VXE A; 2DO3 A; 1NYF A; 2E6Z A; 2LJ3 A; 4M78 B; 5FWB A; 3I55 A; 1VYV A; 3MEV A; 2EYX A; 4M77 D; 3G71 Q; 1BI1 A; 2PNI A; 2AHJ B; 1VOM A; 3TSW A; 1KD1 R; 3L2Q A; 1C1A A; 2O9S A; 1X69 A; 4FW1 A; 3CQT A; 1S1N A; 1AVZ C; 3QZ5 B; 4M78 C; 3DB4 A; 3E2U A; 1R0C B; 3ZL7 C; 5FU6 B; 1VQ4 A; 4A4K A; 1HSQ A; 2Y4Y A; 1SKU B; 7AT1 B; 3H0F A; 1I5O B; 2DYI A; 4L6V 5; 2W0Z A; 9ATC B; 2CZ0 B; 3LLR A; 1OYX A; 1NE8 A; 3X26 B; 1V76 A; 1D1B A; 1G83 A; 1M30 A; 3CEY A; 4RG8 A; 2X4Y A; 3CME A; 3VS7 A; 5FU6 C; 1V29 B; 1Y57 A; 3OYL A; 4C92 G; 1SRL A; 2RJE A; 4ZTJ A; 5A0G A; 1TTH B; 2LJ1 A; 4FSS A; 1WGS A; 2HKN A; 1M5Q 1; 2NUZ A; 1YIJ A; 4QKU A; 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