The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Endophilin-A2
|
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
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| molecule tags |
Endocytosis
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| total genus |
11
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WDX A; 2LMJ A; 4GLM A; 1K0X A; 1JQQ A; 4HCK A; 4CC4 B; 1PKS A; 1ZX6 A; 1E6G A; 5IHN A; 1T0J A; 1ZBJ A; 2CRE A; 3VS0 A; 2JT4 A; 1HJD A; 1YWO A; 2K6D A; 4A63 B; 3VS3 A; 1SSH A; 1GBQ A; 4IIO A; 2K9G A; 4HXJ A; 2E5K A; 1JEG A; 2CT3 A; 2KEA A; 3I5S A; 2VVK A; 3EG1 A; 4AFS C; 2FPE A; 1WLP B; 1FYN A; 1NLP C; 2KRN A; 1E7O A; 1GCQ C; 1SEM A; 1ZUY A; 2SEM A; 4OMO A; 4J9E A; 1YP5 A; 1XOV A; 2LZ6 B; 2EBP A; 3M0T A; 4JPB W; 2GBQ A; 2DE0 X; 2SRC A; 5I11 A; 4CC7 A; 2ABL A; 1GCQ A; 3IQL A; 1SHG A; 2KBT A; 1K0S A; 2DL4 A; 3R6N A; 1B3Q A; 3JV3 A; 1NM7 A; 1UFF A; 2ED1 A; 2RF0 A; 5FWB A; 1QCF A; 1U3O A; 2O88 A; 2O9V A; 2FPD A; 1UDL A; 2DL3 A; 5FWC A; 4ESR A; 2AKK A; 1BU1 A; 1LCK A; 2A37 A; 3CQT A; 1I1J A; 1SRM A; 1K1Z A; 4JZ3 A; 4CC2 A; 4HVW A; 4F16 A; 2P4R A; 1UGV A; 1M27 C; 2PZ1 A; 1ABO A; 4J9H A; 4D8D A; 2K7A A; 3TSZ A; 4F17 A; 2LCS A; 1MV3 A; 2FRW A; 3EGU A; 3H0H A; 2K2M A; 2DIL A; 1VYU A; 2CH4 W; 3EG3 A; 2ESW A; 2CH4 A; 3C0C A; 2RQW A; 5FW9 A; 2RNA A; 2B86 A; 1J3T A; 2JM8 A; 2C0I A; 1AOJ A; 2YUQ A; 4AG1 C; 1RLQ C; 2DRK A; 2EYW A; 4LNP A; 1X2K A; 4ORZ A; 1YWP A; 4RTZ A; 2KGT A; 4FSS A; 3ULR B; 3EG2 A; 1JXM A; 4GBQ A; 1UHF A; 1KFZ A; 5EC7 A; 1H92 A; 1X6G A; 3EHR A; 2W10 A; 2LX7 A; 1W1F A; 1K4U S; 2JMA A; 4OMN A; 2GTO A; 3RBB B; 3M0R A; 4J9I A; 2BZY A; 2RMO A; 1QKW A; 1T0H A; 2DBK A; 1RUW A; 3I9Q A; 1AWO A; 2EW3 A; 3VRZ A; 1SPK A; 1QWF A; 5HCK A; 3VS6 A; 1WI7 A; 1VYT A; 2YSQ A; 2ECZ A; 2W0Z A; 1OPK A; 2J7I A; 2JW4 A; 2KT8 A; 5ECA A; 3PVQ A; 2DNU A; 4J9D A; 2KYM A; 2DMO A; 4DEY A; 4Y92 A; 2K3B A; 2ENM A; 1GBR A; 3QWY A; 4RTU A; 2NUZ A; 2M51 A; 3QWX X; 1T3S A; 1AZG B; 1BBZ A; 1SHF A; 2BTT A; 3LH5 A; 3M0P A; 1WXT A; 2RQT A; 1NEB A; 1GCP A; 1VA7 A; 4JJB A; 5IXB A; 5I22 A; 2GGR A; 2RPN A; 2YUP A; 5L23 A; 1T3L A; 4ZNX A; 2PTK A; 4AFZ C; 1Y57 A; 2VWF A; 1VYV A; 2AZV A; 2CT4 A; 2JS0 A; 4K11 A; 2DVJ A; 1UUE A; 2HCK A; 4R0K A; 2YDL A; 2JTE A; 5IH2 A; 1W6X A; 1X27 A; 2M0Y A; 2FEI A; 2KT1 A; 2V1Q A; 2FO0 A; 2DF6 A; 1OPL A; 1V1C A; 1NG2 A; 4OMQ A; 2LJ1 A; 2MCN A; 2C0O A; 2ED0 A; 2O9S A; 2L3S A; 1GL5 A; 2RQR A; 2D0N A; 5GJW B; 2KR3 A; 3UA6 A; 1NYF A; 2J06 A; 2V1R A; 5IHI A; 2J05 A; 2RQU A; 4RTY A; 2JS2 A; 1H8K A; 4D8K A; 1ARK A; 1ZLM A; 2YUO A; 1U06 A; 4JJC A; 2LQN A; 4JZ4 A; 1AZE A; 2O2O A; 4IIM A; 1Z9Z A; 3O5Z A; 2EQI A; 1YN8 A; 1ZSG A; 1K9A A; 1W70 A; 4M4Z A; 1RLP C; 4OMM A; 2DL8 A; 1AEY A; 1S1N A; 2C0T A; 1NEG A; 2GQI A; 3FJ5 A; 2KNB B; 2CUB A; 1CKA A; 4LUD A; 1KIK A; 1BB9 A; 3NGP A; 4J9B A; 2CSI A; 3H0I A; 2LJ3 A; 2EGE A; 4Z8A A; 2DX1 A; 1HSQ A; 2FPF A; 2KYB A; 3THK A; 4RTT A; 2EYX A; 2A28 A; 2EPD A; 4AFU C; 2NWM A; 2D8J A; 3M0Q A; 2KE9 A; 2YUN A; 1UJ0 A; 1G83 A; 1PWT A; 4Z88 A; 4WCI A; 1Y0M A; 2EYZ A; 3UF4 A; 2KXC A; 2XMF A; 3VS5 A; 4X1V A; 2PNI A; 2L3P A; 1YCS B; 2MOX A; 2L0A A; 2L2P A; 3TSW A; 1YNZ A; 2G6F X; 1X6B A; 1RI9 A; 4LE9 A; 2J6F A; 1MUZ A; 1K76 A; 1X69 A; 2DM1 A; 1G2B A; 1CKB A; 1QLY A; 2EKH A; 3NHN A; 1WFW A; 2GNC A; 2MIO A; 3NPF A; 2EGA A; 1JU5 C; 3U23 A; 1WA7 A; 3VS4 A; 1JO8 A; 1IO6 A; 2QDL A; 2VKN A; 2JM9 A; 4EIK A; 2ROL A; 1PRM C; 2FRY A; 3I5R A; 2CDT A; 2F2V A; 5GJV B; 3RNJ A; 1PRL C; 4LUE A; 3M0S A; 1PKT A; 3EHQ A; 4RTX A; 2JXB A; 1OV3 A; 1AD5 A; 4Z89 A; 2DL7 A; 1TUD A; 1M30 A; 2AZS A; 4J9F A; 1I0C A; 1OEB A; 2IIM A; 2KRS A; 4RUG A; 2HSP A; 2X3W D; 2K79 A; 3UAT A; 1HD3 A; 2DA9 A; 2OAW A; 2KXD A; 1CSK A; 2CUD A; 3H41 A; 2LP5 A; 2DYB A; 2LNH B; 1UEC A; 1M8M A; 2L3Q A; 2KRO A; 1UTI A; 2EGC A; 2HBW A; 2RN8 A; 3SEM A; 2J6O A; 1WXU A; 2A36 A; 3EG0 A; 3REA B; 1H3H A; 1M3C A; 2BZ8 A; 3TVT A; 4KRT A; 1AWJ A; 5IXF A; 2AK5 A; 2HDA A; 3VS1 A; 3I35 A; 1ABQ A; 4CC3 A; 2LQW A; 1TG0 A; 3VS2 A; 3REB B; 1A0N B; 1WYX A; 2DRM A; 2J6K A; 5IHK A; 2I0N A; 2KRM A; 4E6R A; 1WX6 A; 2O31 A; 4J9C A; 3GBQ A; 2D8H A; 2ROT A; 3VRY A; 2HEQ A; 4OML A; 1X2Q A; 3M0U A; 4QT7 A; 1UJY A; 2JMC A; 3UA7 A; 1NYG A; 1X43 A; 4DEX A; 2AKL A; 2DBM A; 1N5Z A; 1WXB A; 3PE0 A; 2BZX A; 1UG1 A; 2CSQ A; 1UHC A; 2EYY A; 4HVU A; 1BK2 A; 1MV0 B; 1GFC A; 2F2W A; 1AWW A; 1UE9 A; 4JJD A; 3A98 A; 2DL5 A; 4OMP A; 3VS7 A; 2DJQ A; 2D1X A; 1QKX A; 1Z9Q A; 1NLO C; 1I07 A; 4RTV A; 2OJ2 A; 1GRI A; 1PNJ A; 1M3A A; 1JXO A; 2A08 A; 3NMZ C; 1AVZ C; 2F2X A; 1ZUU A; 4F14 A; 4AG2 C; 1KSW A; 1TUC A; 2X3X D; 4LN2 A; 2YT6 A; 4AFQ C; 2EVR A; 1WIE A; 3H0F A; 3ZL7 C; 1GFD A; 1KJW A; 1FMK A; 1OOT A; 2GTJ A; 1ZUK A; 1E6H A; 2DLP A; 2LJ0 A; 2OI3 A; 1QWE A; 4J9G A; 1EFN A; 1U5S A; 3PVL A; 1M3B A; 4HVV A; 3KFV A; 1PHT A; 2FG0 A; 1B07 A; 4RTW A; 2H8H A; 1SRL A; 2RQV A; 3SHW A; 1AWX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M78 A; 2LMJ A; 2PUK B; 5GMK m; 1D1C A; 2EFI A; 3ASK A; 3JCM c; 4LDW A; 1VQO T; 3CXC P; 1OI1 A; 1ZX6 A; 1E6G A; 4C8Q G; 5IHN A; 1YIJ A; 3JCM b; 1T0J A; 2FB7 A; 3CCR Q; 3CBO A; 2JT4 A; 5I21 A; 4FCY A; 2V8I A; 5KCH A; 2QK0 A; 3JCM J; 3CCJ Q; 1C1A A; 4JDS A; 5HK3 A; 2VVK A; 4FYV B; 4AFS C; 1FWZ A; 2VC8 A; 2MAM A; 5FRO A; 2RK2 A; 1OZ3 A; 3RMS A; 2KRN A; 1SEM A; 4HKE A; 2K57 A; 2E3H A; 3MO8 A; 1DJ7 B; 4OMO A; 1YP5 A; 5LJ3 g; 3CMA T; 4M78 B; 2E12 A; 3CD6 Q; 2DE0 X; 3G4S A; 5GAN f; 4CC7 A; 1G3S A; 2IG0 A; 1WHJ A; 3FJP A; 1SHG A; 2KBT A; 1K0S A; 1K8A R; 3R6N A; 2VV5 A; 1UFF A; 3RES A; 5KYY A; 4PJJ A; 2ED1 A; 1Q82 U; 1U3O A; 2G3R A; 2M0O A; 1VQO A; 5LJ5 h; 1M4Z A; 3OBW A; 1PSF A; 2QEX T; 2RHU A; 1FXX A; 2RJC A; 1IXD A; 3UWN A; 1LCK A; 3CQT A; 3PTA A; 2CP0 A; 1VQK Q; 4O6J A; 4OMF B; 3VYG A; 5CVI A; 2P4T A; 1ABO A; 5DLQ E; 4D8D A; 2QDY B; 3JAM E; 4F17 A; 3OMC A; 3S3O A; 3EGU A; 2GCX A; 1I5L A; 1YIJ Q; 4OB1 B; 2ESW A; 1ZA1 B; 2B86 A; 4ELZ C; 3TQ7 P; 3CMA A; 1AOJ A; 5A0G A; 5KYY B; 4ATO A; 2DRK A; 2HSE B; 2DVE A; 5DM7 R; 2ATC B; 2CZ1 B; 4X9C A; 3ULR B; 1YJN T; 5EC7 A; 1H92 A; 3EHR A; 5D6X A; 4F7U G; 4MML A; 4OMN A; 3CCM A; 3M0R A; 1EIF A; 4E7H A; 2QEX A; 2RMO A; 5M9O A; 1T0H A; 3HP9 A; 5LJ3 j; 3G4S Q; 1RUW A; 2DXT A; 3I9Q A; 2EW3 A; 2NUT A; 3L2W A; 2JJ9 A; 1QWF A; 3VS6 A; 2Y4Y A; 1IHW A; 1KC8 R; 2ECZ A; 1KHI A; 1VIE A; 4PJO F; 3EGD A; 3AHU A; 2DNU A; 4C92 F; 2DMO A; 2DXU A; 4C5G A; 1VQO Q; 3DLL A; 1GBR A; 2NUZ A; 2M51 A; 3QWX X; 1BCO A; 2VXE A; 3X26 B; 2HMA A; 1RAE B; 2ZPG B; 4J6X A; 3M0P A; 5A2Q E; 1WXT A; 4JJB A; 5I22 A; 4M7D E; 3CME T; 4UC4 A; 1YJN A; 2RPN A; 2YUP A; 3ZFJ A; 5DLO A; 4C8Q D; 1QMC A; 4BAC A; 4C8Q C; 5CKB A; 3M9Q A; 3PT9 A; 2NUT B; 5KH6 A; 4MZM A; 1IHV A; 2PTK A; 4AFZ C; 3FDR A; 2JS0 A; 4MZT A; 4K11 A; 2DVJ A; 1UUE A; 3CMA Q; 2EIF A; 3LX7 A; 5IH2 A; 2MI6 A; 4J6W A; 3HRS A; 3GNG A; 1NG2 A; 2LJ1 A; 4FW1 A; 2HQE A; 1GL5 A; 5GJW B; 1U1S A; 5GAO n; 3CCM Q; 2RQU A; 4X34 A; 5GAM d; 1H8K A; 4LDU A; 4M77 E; 3MCA B; 4A4K A; 4D8K A; 3L2Q A; 4FYW B; 2QEX Q; 1U06 A; 2KSS A; 4JJC A; 1NJI U; 4LDY A; 3X28 B; 1M8V A; 1W70 A; 1RLP C; 3CCS T; 4KUD K; 2RJE A; 3M53 A; 1AEY A; 6AT1 B; 2C0T A; 4E7K A; 1OQK A; 2CUB A; 4XTX A; 3CME A; 4M75 G; 3A8G B; 2IPO B; 3H9N A; 1V76 A; 1BB9 A; 4C92 D; 1IB8 A; 3NGP A; 4C92 C; 2QQS A; 2QAS A; 5FLX E; 5J26 A; 2JOY A; 2KYB A; 5CCA A; 4ZGD B; 2ZPF B; 2NWM A; 4MDW A; 5CKF A; 5CQY A; 2YUN A; 1UJ0 A; 1JJ2 S; 1YJN Q; 1G83 A; 1LOJ A; 2COW A; 2PUO B; 3UF4 A; 2KXC A; 2XMF A; 5GAN h; 5I2M A; 3OYD A; 2L0A A; 3NTK A; 2L2P A; 2H3E B; 5CKD A; 1JJ2 P; 4M78 G; 1MUZ A; 3JCM g; 1X69 A; 4C0F A; 5CR2 A; 4E7S A; 5HKC A; 3CCS A; 4XTZ A; 5GAN 8; 3TRE A; 1H3Z A; 3NHN A; 1K73 U; 1TSF A; 5GAM f; 5KE2 A; 2EGA A; 1JO8 A; 3OYJ A; 1IO6 A; 4ELY C; 2VKN A; 4OB3 B; 2JM9 A; 3L42 A; 3OB9 A; 4EIK A; 2ROL A; 3QDF A; 1UGQ B; 5GJV B; 5LL6 S; 4IUQ A; 2CP7 A; 3EHQ A; 2RJF A; 4RTX A; 1MMN A; 4M7A E; 4FU6 A; 3CME Q; 3URG A; 1ACM B; 4J9F A; 1I0C A; 4KBM B; 2IIM A; 1ZSZ C; 2KRS A; 3A1P A; 2LRQ A; 2K79 A; 1G3T A; 1HD3 A; 4ZN3 A; 2OAW A; 2CUD A; 3JB9 H; 2KK4 A; 4A4G A; 3UDC A; 4DOV A; 2DEU A; 2RN8 A; 2DD5 A; 2A36 A; 3EG0 A; 2XDP A; 3WVD B; 1M3C A; 3T9N A; 1AWJ A; 3JCM W; 5KYU A; 5IXF A; 1Q81 R; 4BI4 A; 2HDA A; 3I35 A; 1ABQ A; 3F70 A; 3CCE T; 3CCS Q; 4ZTJ A; 2Y90 A; 5EG2 A; 1TG0 A; 1Y7X A; 1YBY A; 3MP6 A; 3VS2 A; 1WYX A; 2I0N A; 4JRQ A; 1XTD A; 3C95 A; 2HEQ A; 1MHN A; 5CK9 A; 2MWP A; 4A54 A; 2AKL A; 2DBM A; 2XKO C; 3PE0 A; 1WQ7 A; 4MZP A; 5GAO p; 1BI1 A; 4NL3 A; 2CKK A; 4PJO A; 4C92 A; 5KYU B; 4JRI A; 4OMP A; 2DL5 A; 4E7L A; 2XHC A; 3CEY A; 4OB0 B; 1NLO C; 3HRT A; 1WHL A; 2Z0W A; 1PM3 A; 3JB9 J; 4QVC A; 1PNJ A; 3HL8 A; 3EFO A; 1VQP T; 1M90 R; 1AVZ C; 2QAZ A; 3CCE A; 4ME7 A; 2JN0 A; 2E70 A; 3OSV A; 2X3X D; 2E3I A; 2XG8 D; 1KD1 C; 5J39 A; 2E5Q A; 1R8O B; 4AFQ C; 1WIE A; 3H0F A; 1OX9 A; 2X4X A; 3ZL7 C; 1FMK A; 2KMT A; 1ZUK A; 1R77 A; 3HFN A; 1TOV A; 4PJO B; 1W2B A; 4EMH A; 4NL2 A; 2OI3 A; 4C92 B; 4J9G A; 1VQL T; 3TEE A; 4DA4 A; 3CPF A; 4HVV A; 1KQS A; 3KFV A; 4BE0 A; 4RTW A; 2H8H A; 2V8K A; 2XDD A; 1SRL A; 4GLM A; 4PLL A; 2VGN A; 3EFO B; 1B34 A; 2LT4 A; 3E9G A; 4HCK A; 4CC4 B; 3P8B B; 4FW2 A; 1ZBJ A; 3RR6 A; 1VQP A; 2K6D A; 2O4X A; 1RAB B; 2L3R A; 1QP3 A; 3OQ5 A; 1SSH A; 1ZSZ A; 4EDU A; 1JEG A; 1Q7Y U; 3MEV A; 4RG2 A; 3S3N A; 5GAM h; 2SEM A; 1VQL A; 1XOV A; 2LZ6 B; 4HCC A; 2EBP A; 3CCE Q; 2ZAE A; 2LTO A; 1B34 B; 5I11 A; 2KVQ G; 2ABL A; 2A0F B; 4C0D B; 2AHJ B; 4E7I A; 3IQL A; 5LJ5 g; 1KD1 U; 2PVD B; 3JV3 A; 2RA2 A; 2P0P A; 1B7T A; 3QZ5 B; 2CZ7 B; 2O4X B; 5FWB A; 1QCF A; 3HTR A; 1AHJ B; 2KDS A; 1YFN A; 2O9V A; 2RM4 A; 2FPD A; 1I8F A; 1G3Y A; 1M1K R; 2AKK A; 1BU1 A; 3D7S B; 5LJ3 d; 2VGM A; 1TWB A; 2JTF A; 1Y71 A; 1I5O B; 1UGV A; 2PZ1 A; 1BI2 A; 4J9H A; 4RMO A; 4FT4 A; 1VQ5 T; 2NLU A; 2FRW A; 1IRX A; 3GF5 A; 5GAN 2; 5GAN 6; 1VQ4 T; 1EZZ B; 1VQP Q; 2RNA A; 1WNL A; 3A8O B; 4XTU A; 1ZQ1 A; 4XAX B; 1J3T A; 2ZZD A; 4DOW A; 4B6M A; 2XIC A; 1RLQ C; 1OYX A; 1OU9 A; 3QJ6 A; 2LNV A; 1X2K A; 4ORZ A; 2LQK A; 2RI2 A; 2X4W A; 4FSS A; 3EG2 A; 1JXM A; 3X24 B; 3V7S A; 1KFZ A; 3O8V A; 3A8L B; 2LX7 A; 3NFC A; 1UGR B; 1N8R C; 4J9I A; 1RAD B; 1VQL Q; 4J8O A; 2QGG A; 1W2B S; 2XDB A; 4PKC C; 2DD4 A; 1SPK A; 2K5F A; 1AT1 B; 1KQS S; 2YSQ A; 2ZGW A; 3M58 A; 3OS5 A; 2J7I A; 2JW4 A; 1U8R A; 1BIA A; 4PJM A; 4LDX A; 2KQW A; 3OYA A; 2RJD A; 4DEY A; 1VQ5 A; 4Y92 A; 5GMK h; 4Y28 E; 3QWY A; 1W2B P; 8ATC B; 5IT9 E; 2NUP A; 1VQ4 A; 3NTI A; 3L2V A; 3CBM A; 1T3S A; 5LJ3 f; 3QJY A; 1SHF A; 2BTT A; 1KQS P; 1QVG S; 2FZK B; 1RAG B; 3J81 E; 1JB0 E; 2GQV A; 5GAN 7; 2GGR A; 2YLC A; 4KGX B; 4RCB A; 1MMG A; 4ZNX A; 5KYN A; 2MMP A; 1Y57 A; 2VWF A; 2AZV A; 2DIG A; 2CT4 A; 2E10 A; 1QVG P; 2JTE A; 1W6X A; 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