The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
|
structure length |
64
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Chain Sequence |
PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
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| molecule tags |
Endocytosis
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| molecule keywords |
Endophilin-A2
|
| total genus |
11
|
| structure length |
64
|
| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NLO C; 3ZL7 C; 1KFZ A; 1I1J A; 1CSK A; 4LUD A; 1I0C A; 4RTZ A; 1UEC A; 4JZ4 A; 1PWT A; 3H0I A; 2JXB A; 4J9C A; 2LJ0 A; 2J6O A; 4F16 A; 2YSQ A; 2EYX A; 2OJ2 A; 2DIL A; 2SRC A; 1WDX A; 2BZX A; 4Y92 A; 2FPF A; 1M3C A; 3O5Z A; 4GLM A; 1SRM A; 2DMO A; 3THK A; 2FRW A; 1M3A A; 2RN8 A; 1WLP B; 2J6F A; 2W10 A; 2KRO A; 2LCS A; 5IHI A; 2GTO A; 4JZ3 A; 2ENM A; 2KE9 A; 1WXU A; 1E7O A; 2PNI A; 2EYY A; 4IIM A; 3VS5 A; 2ED1 A; 1U3O A; 1UDL A; 4R0K A; 3PE0 A; 2RQW A; 2OI3 A; 4JJB A; 1BK2 A; 2CH4 W; 4HXJ A; 1UJY A; 4GBQ A; 2D0N A; 2LZ6 B; 4K11 A; 2P4R A; 2RQV A; 1ZSG A; 1SPK A; 1U06 A; 4CC2 A; 3VS6 A; 4IIO A; 2SEM A; 2J06 A; 4LE9 A; 1ARK A; 1PRM C; 2RPN A; 4ESR A; 2ED0 A; 4J9E A; 3VS1 A; 3EG1 A; 2O88 A; 1E6G A; 1CKB A; 1SHF A; 2K6D A; 1H3H A; 1QCF A; 2JS0 A; 3RBB B; 1NEB A; 4RTX A; 1AZG B; 1QKW A; 1JO8 A; 2D1X A; 3I9Q A; 1Z9Q A; 2HEQ A; 1G2B A; 1OV3 A; 2CRE A; 4J9F A; 5GJW B; 1ZX6 A; 2KXC A; 4J9D A; 1WFW A; 2LP5 A; 3EG0 A; 2DF6 A; 2DL4 A; 4RTW A; 2JMC A; 1AEY A; 1VA7 A; 2J05 A; 2RMO A; 1W1F A; 3UA7 A; 1NYF A; 4A63 B; 1BBZ A; 2CUB A; 4AFZ C; 1GCQ C; 1J3T A; 1A0N B; 1K1Z A; 1AZE A; 2CT3 A; 3NGP A; 2LQN A; 3EG2 A; 1TG0 A; 2DE0 X; 1LCK A; 3SEM A; 4AG2 C; 2KRM A; 3SHW A; 1X6B A; 2O2O A; 2KYM A; 2JM8 A; 4F17 A; 5ECA A; 1B07 A; 1UTI A; 3UA6 A; 3JV3 A; 1YP5 A; 3R6N A; 2HSP A; 2KEA A; 4HVU A; 1GFC A; 3QWX X; 1PKS A; 2YUP A; 4FSS A; 4Z89 A; 2EGE A; 2JTE A; 2EBP A; 1GCQ A; 4CC4 B; 1SHG A; 2EPD A; 2BZY A; 1JXM A; 3NHN A; 1TUC A; 1YWP A; 4Z88 A; 2GBQ A; 2BTT A; 1FMK A; 2X3W D; 2W0Z A; 4J9I A; 2AK5 A; 1SEM A; 3QWY A; 2ROT A; 4OMP A; 2K2M A; 2EGC A; 1WXB A; 2J6K A; 2F2X A; 2DX1 A; 1MUZ A; 5FW9 A; 2L0A A; 1OPK A; 2DA9 A; 1NEG A; 3PVQ A; 3PVL A; 3M0T A; 4LNP A; 2A37 A; 1K4U S; 2O9V A; 1W6X A; 1TUD A; 2DYB A; 1QLY A; 1K0X A; 1UGV A; 1NG2 A; 1E6H A; 1UFF A; 2CSQ A; 2YUQ A; 1K76 A; 2CDT A; 1AWW A; 2H8H A; 2KRN A; 1W70 A; 2OAW A; 2CH4 A; 1QWF A; 3REA B; 1T0J A; 4ZNX A; 2KXD A; 2KYB A; 2CSI A; 1QKX A; 1Z9Z A; 2L3Q A; 1GL5 A; 3TSW A; 4CC3 A; 2DL5 A; 4KRT A; 2BZ8 A; 1ZBJ A; 2V1R A; 2O31 A; 4LUE A; 1NYG A; 1WI7 A; 1UHF A; 2V1Q A; 2RQR A; 2L3S A; 5EC7 A; 2HCK A; 4Z8A A; 2GQI A; 1K0S A; 3M0R A; 2RQU A; 1GRI A; 2GGR A; 2GNC A; 2D8H A; 1WIE A; 1K9A A; 1AD5 A; 2JM9 A; 2RF0 A; 1VYT A; 1SRL A; 1GBR A; 2DLP A; 1JQQ A; 1PNJ A; 1WYX A; 2J7I A; 2MIO A; 2MCN A; 1M27 C; 3H0H A; 3UF4 A; 2DL8 A; 2DJQ A; 3NPF A; 1KJW A; 4CC7 A; 3VS7 A; 2PZ1 A; 2AZV A; 2DBK A; 2MOX A; 3M0U A; 1ABO A; 2LMJ A; 1VYV A; 2FPD A; 2C0T A; 2DRK A; 2JT4 A; 2F2V A; 3TSZ A; 1ZLM A; 1Y57 A; 3CQT A; 4JJD A; 2B86 A; 1T3S A; 2EVR A; 3EG3 A; 1FYN A; 4EIK A; 1MV3 A; 4D8K A; 4RTU A; 2VKN A; 2C0O A; 5I22 A; 1UG1 A; 4JPB W; 1M8M A; 4E6R A; 2K9G A; 3GBQ A; 1YCS B; 2EW3 A; 2C0I A; 2VVK A; 4J9B A; 1HSQ A; 1GCP A; 2K3B A; 3I5R A; 4AFS C; 4J9G A; 1V1C A; 2KR3 A; 3I35 A; 1MV0 B; 5HCK A; 4HVW A; 1RLQ C; 1PKT A; 2DBM A; 2CT4 A; 1VYU A; 3TVT A; 2EYZ A; 2EYW A; 2NWM A; 2X3X D; 3REB B; 1U5S A; 3I5S A; 4OMO A; 2HBW A; 3UAT A; 2DVJ A; 5IXB A; 2O9S A; 3H41 A; 4J9H A; 1PRL C; 2YUO A; 2KRS A; 3RNJ A; 2K79 A; 5I11 A; 1ZUY A; 2GTJ A; 1RI9 A; 1BU1 A; 5L23 A; 4F14 A; 2EGA A; 1Y0M A; 1X69 A; 4DEX A; 1OEB A; 5IHN A; 1YWO A; 1I07 A; 2FRY A; 1M30 A; 3C0C A; 1CKA A; 1NM7 A; 2PTK A; 2QDL A; 1T0H A; 2ABL A; 2A08 A; 1UJ0 A; 3H0F A; 4OMM A; 2DNU A; 1QWE A; 5FWB A; 4RTT A; 4RTY A; 2L2P A; 2EQI A; 2XMF A; 4HVV A; 2KGT A; 1KSW A; 2G6F X; 3VS0 A; 5IXF A; 2LX7 A; 1X2K A; 2IIM A; 4OMN A; 2FO0 A; 5IH2 A; 2YUN A; 1XOV A; 2FEI A; 4OMQ A; 2ECZ A; 2JMA A; 3U23 A; 1ZUU A; 1WA7 A; 1SSH A; 4DEY A; 2DM1 A; 3M0Q A; 1NLP C; 3A98 A; 1RLP C; 3IQL A; 1AWX A; 1H8K A; 1S1N A; 2RNA A; 1JXO A; 4AFU C; 2JS2 A; 3EHQ A; 1GFD A; 1WX6 A; 2A28 A; 1UE9 A; 2HDA A; 1YN8 A; 2E5K A; 2YT6 A; 2A36 A; 1ABQ A; 1PHT A; 3KFV A; 4HCK A; 1JU5 C; 2JW4 A; 2M0Y A; 2AZS A; 1WXT A; 1EFN A; 2ESW A; 2L3P A; 4ORZ A; 4WCI A; 1OOT A; 1T3L A; 3M0S A; 4M4Z A; 2VWF A; 1H92 A; 2D8J A; 2DL3 A; 2KNB B; 1OPL A; 2DL7 A; 4AFQ C; 1AOJ A; 1AVZ C; 2KT1 A; 4D8D A; 5GJV B; 4AG1 C; 3EGU A; 5FWC A; 1UUE A; 1X27 A; 2KT8 A; 2EKH A; 1X2Q A; 2F2W A; 1M3B A; 1N5Z A; 1RUW A; 1HJD A; 2I0N A; 1ZUK A; 3FJ5 A; 2LNH B; 2M51 A; 2AKL A; 1IO6 A; 3LH5 A; 2LJ1 A; 2KBT A; 4OML A; 2AKK A; 4X1V A; 1UHC A; 1X6G A; 2ROL A; 1GBQ A; 2DRM A; 1YNZ A; 3ULR B; 1BB9 A; 1G83 A; 5IHK A; 4LN2 A; 1B3Q A; 1JEG A; 2RQT A; 2NUZ A; 4RTV A; 3VRY A; 1AWO A; 1HD3 A; 3NMZ C; 3VS4 A; 1X43 A; 4RUG A; 3VRZ A; 1AWJ A; 3VS2 A; 4QT7 A; 2K7A A; 4JJC A; 3VS3 A; 2CUD A; 2FPE A; 2YDL A; 1KIK A; 2LQW A; 2FG0 A; 3EHR A; 3M0P A; 2LJ3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3V7C A; 3CPW S; 3ZL7 C; 5CQY A; 1M8V A; 3JSC A; 1I1J A; 4X9C A; 4FYV B; 5KYX B; 1K73 R; 4RTZ A; 2HMA A; 4JRP A; 1PWT A; 2GCX A; 2J6O A; 5A0L A; 3BW1 A; 1WQW A; 2YSQ A; 1WJR A; 1SG5 A; 3OYJ A; 4E7Z A; 2CP0 A; 1VQP Q; 4ME7 A; 1PSF A; 3BY7 A; 1M3C A; 3JB9 H; 1SRM A; 3E19 A; 2FZC B; 1KHI A; 4B9W A; 1V29 B; 4OB0 B; 2AT1 B; 4HKE A; 2HZY A; 5LJ5 e; 1WLP B; 2J6F A; 2W10 A; 5GAN f; 2E3I A; 4JLG A; 3OW2 P; 1JJ2 A; 2ENM A; 3P8B B; 4ELY C; 4C5I A; 3S6W A; 2PNI A; 4IIM A; 2QXF A; 2ED1 A; 2OI3 A; 4JJB A; 2KY9 A; 1LJO A; 1JJ2 S; 4M7D C; 2V8J A; 1Y96 B; 3OY9 A; 1UJY A; 2LZ6 B; 3QJY A; 3J80 E; 3EFS A; 1WJS A; 1U06 A; 2VGM A; 4LE9 A; 1JRI A; 3F70 A; 2ED0 A; 4J9E A; 2RI2 A; 5GAN 7; 4BD3 A; 3EG1 A; 3JCM Q; 2LNV A; 4PFP A; 2K6D A; 4M7A F; 2JS0 A; 2MI6 A; 3NTI A; 1AZG B; 5CCA A; 3QSU A; 5CKF A; 3CCJ A; 4FM4 B; 2OTJ Q; 4PLL A; 4BI3 A; 2HNI A; 4M77 B; 4CRI A; 3OS5 A; 3P8D A; 3QBY A; 1TSF A; 3EG0 A; 2RJE A; 5LJ5 g; 3OYE A; 1XTD A; 3CCV Q; 2KK4 A; 1W1F A; 1QMC A; 3UA7 A; 2EQU A; 3CD6 Q; 1GCQ C; 5GAO r; 1J3T A; 1A0N B; 2QAS A; 4J7F A; 1JBM A; 2CT3 A; 1VQP A; 2XKO C; 3NTK A; 1PSE A; 1QVG P; 2KRM A; 1N8R U; 4J7I A; 1Q82 U; 2P4T A; 1O75 A; 2KYM A; 4F17 A; 1B07 A; 1UTI A; 2KQW A; 1Q7Y C; 4C92 F; 3RKW A; 1VQ8 Q; 1YJW T; 2GFA A; 4Z89 A; 2EGE A; 1OU9 A; 5GAO p; 4CC4 B; 3CME A; 3E2U A; 4C8Q B; 3HRT A; 2E65 A; 2LDM A; 1ZA2 B; 3WXM B; 1WHM A; 2EKO A; 3VYH B; 2QYZ A; 4FW1 A; 3WVE B; 4JRI A; 4J9I A; 2AK5 A; 4B6M A; 4M7A D; 4OMP A; 2JVV A; 1WXB A; 3EFR A; 5FW9 A; 3GLX A; 1OPK A; 3A8G B; 2VXE A; 3HFN A; 1VQK T; 5IAY A; 4ELZ C; 1VQ5 Q; 3I56 Q; 2K57 A; 1NEG A; 5GMK i; 4II1 A; 3RMS A; 1QVP A; 1TUD A; 2E12 A; 4C0D B; 1K0X A; 2HL5 C; 5HKC A; 1C1A A; 1UFF A; 4QQG A; 4XU2 A; 3GPL A; 4L5G A; 1K76 A; 2E41 A; 2KRN A; 3REA B; 4BE1 A; 2HBP A; 3GNG A; 3LGL A; 3UWN A; 1QKX A; 4EMG A; 4OF1 A; 4B9X A; 1YJ9 Q; 3RER A; 4KRT A; 3E9G A; 2MWP A; 1G3W A; 4BE0 A; 5GAM e; 3JRZ A; 1WI7 A; 4HCC A; 4A4G A; 1YCY A; 4M77 G; 2GQI A; 3JB9 G; 3CCU A; 4C92 D; 2RHY A; 3H8Z A; 5C0M A; 5CKE A; 1RAI B; 4DA4 A; 1AD5 A; 1WNL A; 4WF2 A; 5CQX A; 2DLP A; 2MWO A; 2MIO A; 1WYX A; 2J7I A; 2IPO B; 1FXX A; 1M27 C; 3MEW A; 3V8J A; 4DQ2 A; 1KJW A; 2JTF A; 4AT1 B; 2ATC B; 2MOX A; 1D3B A; 1VYV A; 1BKB A; 1ZLM A; 2Y4Y A; 3CCL A; 2B86 A; 2O4X B; 2EVR A; 3KBG A; 1FYN A; 1MV3 A; 3CXC S; 3SD4 A; 4FT2 A; 2VKN A; 5I22 A; 1Q95 G; 3SFM A; 1K73 C; 3GBQ A; 1M1F A; 4J9B A; 4JRQ A; 3I5R A; 2M02 A; 1M2V B; 1MV0 B; 3X28 B; 5LL6 S; 2K3Y A; 1VQ5 A; 4BUG A; 4JS5 A; 1Q81 R; 1UGQ B; 2CT4 A; 2LT4 A; 2EYW A; 4E2F B; 4C92 G; 3RES A; 4OMO A; 2HBW A; 2YHT A; 1YIT T; 5IXB A; 3QYH B; 5KYW B; 1PRL C; 5LJ5 h; 4JRK A; 1AT1 B; 3ME9 A; 4NL2 A; 5IHN A; 5HK3 A; 3CCR A; 1I07 A; 1M30 A; 4J5Y A; 4M7D A; 2BIV A; 1VQM T; 1K8A C; 2PQW A; 2ABL A; 2A08 A; 1UJ0 A; 2X4X A; 4OMM A; 1K9M C; 2DFU A; 5FWB A; 2EQI A; 3CME Q; 4HVV A; 5CKD A; 5GAN 2; 4M75 G; 1KSW A; 4BB7 A; 4XU0 A; 2IIM A; 3CCM Q; 4OMN A; 3DLL A; 2MYS A; 1LVK A; 2ZGW A; 1BIA A; 2FEI A; 2LX9 A; 2DYI A; 3U23 A; 3I55 T; 4BDY A; 1JB0 E; 1SSH A; 3X24 B; 3CCR Q; 1NLP C; 1YIJ A; 3A98 A; 4AFU C; 3EHQ A; 2A28 A; 2HDA A; 1YN8 A; 1KC8 R; 2E5K A; 2YT6 A; 1ABQ A; 3KFV A; 3PIO A; 1N6A A; 4KUI A; 3CCV A; 1BIB A; 1NZ9 A; 2E70 A; 1QP2 A; 2FYK A; 3JB9 F; 2LVM A; 5CAI A; 4WCI A; 1OOT A; 3OYD A; 1LOJ A; 2D8J A; 2DL3 A; 3UT1 A; 4M7A B; 2DL7 A; 4PJO A; 5GAO m; 4AFQ C; 3BDL A; 3JCM V; 4C8Q A; 5KCO A; 1YIT A; 2KT1 A; 1KC8 U; 4M7D B; 3ASK A; 5FWC A; 3QPH A; 1VQN A; 2KT8 A; 2L5Q A; 2F2W A; 5GAN 6; 1RUW A; 1XNI A; 1N8R C; 3FEO A; 3FJ5 A; 2Y4X A; 4XU3 A; 2AKL A; 1IO6 A; 2F5K A; 3JCM c; 4Q5W A; 2M16 A; 5GAM g; 1UHC A; 1X6G A; 2COY A; 1YNZ A; 1G83 A; 1B3Q A; 1JEG A; 2RJD A; 4RTV A; 4J6X A; 1AWO A; 3HPW A; 1HD3 A; 3NMZ C; 3VS4 A; 5GAO q; 5LJ5 j; 3G7Z A; 4QT7 A; 2E10 A; 2X4W A; 1TOV A; 4XTV A; 3CCE T; 1O9S A; 4C5G A; 1MMA A; 3A8M B; 2DEQ A; 2FG0 A; 8AT1 B; 3CEY A; 2DEU A; 2LJ3 A; 2GF7 A; 1KFZ A; 3EG9 B; 4LUD A; 3H0I A; 2JXB A; 4C8Q F; 2LRQ A; 2E1H A; 2EYX A; 2OJ2 A; 4R55 A; 2XU8 A; 1WDX A; 2H3J A; 2HKN A; 1TU0 B; 2DAQ A; 2LQK A; 3M59 A; 3A8H B; 1WZO A; 1RAD B; 3CCV T; 1OZ2 A; 2FRW A; 3G6E A; 3LW5 E; 3OYL A; 1G8X A; 2GTO A; 4JZ3 A; 5J3B A; 2KE9 A; 1VQ7 Q; 4C5E A; 1W2B A; 3EG9 A; 2OX7 A; 4XTW A; 1D1B A; 1E7O A; 1OQK A; 1U3O A; 1UDL A; 2D0Q B; 4OB2 B; 5FU7 B; 3JCM X; 2EJG A; 3CCS T; 3OYB A; 2QGG A; 1BK2 A; 2EQJ A; 2D0N A; 2P4R A; 1ZSG A; 1SPK A; 4CC2 A; 2HQX A; 4IIO A; 1YFN A; 3L2W A; 4UC4 A; 5GAM d; 4PK4 A; 3J81 E; 4N4H A; 1K8A U; 3G71 A; 4PLI A; 2MK5 A; 3CCE Q; 5A0G A; 3M57 A; 4M75 D; 2DZ9 A; 2IG0 A; 2FB7 A; 3LX7 A; 4C0Z A; 4M7A A; 4M78 C; 2K5F A; 2O88 A; 4JJN K; 3RBB B; 3JB9 J; 3E9F A; 4M75 E; 2D1X A; 1Z9Q A; 3G6E Q; 4E7K A; 4C0D C; 1VQK A; 1OV3 A; 4J9F A; 2ZPG B; 5LJ5 d; 1IGQ A; 3OBY A; 5I2S A; 1XQH A; 1WFW A; 3UDC A; 2LP5 A; 4EDU A; 1GXI E; 3C94 A; 3SB2 A; 4RTW A; 2JMC A; 2RB6 A; 1VA7 A; 2J05 A; 2RMO A; 3QG1 A; 1IB8 A; 4M7A E; 3HTR A; 4A63 B; 3OYG A; 1OUL A; 5HK0 A; 2P0K A; 1K1Z A; 4DBH A; 3NGP A; 2LQN A; 2PVO B; 4C92 C; 2DE0 X; 1Q81 U; 3SHW A; 1X6B A; 3M54 A; 2O2O A; 4CI0 C; 4EMH A; 2OAU A; 1M4Z A; 2JM8 A; 4IUT A; 3CCS Q; 5ECA A; 3UA6 A; 4P5N A; 4DBQ A; 4MZM A; 2HSP A; 2KEA A; 4XQ3 A; 4HVU A; 3QWX X; 4NOY A; 3HRS A; 2QQS A; 3QDR B; 2EBP A; 3HL8 A; 2EPD A; 5GMK h; 3X25 B; 2OTL A; 1JXM A; 3CC2 Q; 1TWB A; 4OMF B; 3NHN A; 4KBM B; 1TUC A; 3RIR A; 1N27 A; 2F1L A; 1FMK A; 2DER A; 2L8D A; 1RAA B; 2X3W D; 2K3X A; 1N9S A; 2W0Z A; 2QEX T; 1SEM A; 2K2M A; 3M5A A; 1VQ4 A; 4A53 A; 2K2V A; 4FU6 A; 4M77 D; 4IKF A; 1M1K U; 2HSE B; 5GAO l; 5GMK e; 5KYX A; 3PVL A; 3M0T A; 2AIR B; 2A37 A; 3HKS A; 1VUB A; 2DYB A; 5J26 A; 4O6J A; 1QLY A; 4PJO B; 2EYQ A; 1D09 B; 1UGV A; 1WPY A; 4MZT A; 1RI0 A; 2YUQ A; 1RAC B; 1G3Y A; 4PL6 A; 4KT0 E; 2I2L A; 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