The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
64
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structure length |
64
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Chain Sequence |
b'PLDQPSCKALYDFEPENDGELGFREGDLITLTNQIDENWYEGMLHGQSGFFPLSYVQVLVPLPQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Endophilin-A2
|
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain of rat endophilin A2
rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
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| molecule tags |
Endocytosis
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| total genus |
11
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| structure length |
64
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| sequence length |
64
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-01-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KNB B; 4GLM A; 3EG0 A; 1YWO A; 2JMC A; 1SEM A; 1BU1 A; 1PHT A; 2OI3 A; 1SPK A; 2FG0 A; 1WIE A; 2FO0 A; 3NHN A; 2XMF A; 2FRW A; 2EYX A; 1M3B A; 1YCS B; 2ABL A; 2A08 A; 2ROL A; 1M30 A; 1UHC A; 1E7O A; 2KRO A; 2RF0 A; 3UAT A; 1WI7 A; 2ROT A; 1U5S A; 2JW4 A; 2O9V A; 1NYG A; 1ZBJ A; 3I9Q A; 2LX7 A; 2ED0 A; 1SRL A; 2O9S A; 1BBZ A; 2DRM A; 2J06 A; 1UDL A; 2J6K A; 1UJ0 A; 1KIK A; 1CKB A; 1JU5 C; 2HSP A; 1JO8 A; 1RUW A; 1WYX A; 2DM1 A; 3EHQ A; 1ZX6 A; 1OV3 A; 1TG0 A; 2H8H A; 1U06 A; 1BB9 A; 2BZY A; 2SRC A; 2FEI A; 2V1R A; 4OMN A; 2K7A A; 2GBQ A; 2OJ2 A; 1AWO A; 1AZG B; 4RTV A; 1A0N B; 2C0O A; 5I11 A; 2LP5 A; 2EW3 A; 2PTK A; 1FYN A; 2JMA A; 1JXM A; 1T0J A; 2CH4 W; 4RTW A; 4HCK A; 1AWW A; 2A37 A; 4RTT A; 1OEB A; 1RLP C; 2FRY A; 3H41 A; 3PVL A; 2BTT A; 2F2X A; 3M0R A; 1UHF A; 3R6N A; 1N5Z A; 2L3P A; 2OAW A; 1X43 A; 2LQW A; 1X6B A; 2RN8 A; 2EYY A; 5L23 A; 4E6R A; 1VA7 A; 3PE0 A; 2LNH B; 3CQT A; 1RI9 A; 1SHG A; 2RMO A; 4J9B A; 2O88 A; 2KBT A; 1UUE A; 2HDA A; 1QWF A; 4OMQ A; 1PNJ A; 1AZE A; 1K0S A; 2DYB A; 3VS0 A; 3H0H A; 3EG1 A; 2YT6 A; 1G83 A; 2CUB A; 3UA6 A; 2DL3 A; 2L2P A; 1NEB A; 3U23 A; 2J05 A; 1WX6 A; 4J9I A; 4Z89 A; 2G6F X; 3LH5 A; 1WXB A; 1WFW A; 4OMP A; 1YN8 A; 4LUE A; 2J6F A; 4JJC A; 2ESW A; 1PKT A; 1GCQ C; 1ZUY A; 2DL8 A; 2DLP A; 2NWM A; 1NM7 A; 1PKS A; 3JV3 A; 4R0K A; 2DE0 X; 2CT4 A; 3M0S A; 3M0U A; 3IQL A; 4IIM A; 2HCK A; 5FW9 A; 5IHI A; 1CSK A; 2VVK A; 4HVW A; 1ABO A; 2RQV A; 4KRT A; 4OMM A; 5IH2 A; 1T3L A; 1K76 A; 2DBM A; 3I5S A; 3M0T A; 1WXT A; 4CC3 A; 2KRS A; 4F17 A; 1K9A A; 4DEY A; 4DEX A; 2DL5 A; 3TVT A; 1K1Z A; 2CT3 A; 4AFS C; 2JTE A; 4AFQ C; 3EGU A; 3PVQ A; 2DL7 A; 2CRE A; 1AWX A; 2CSI A; 4RUG A; 4RTZ A; 4CC7 A; 2K6D A; 2KRN A; 2GNC A; 2KE9 A; 2SEM A; 1E6H A; 3VRY A; 3VS3 A; 2DIL A; 2K2M A; 3C0C A; 4IIO A; 2YUP A; 2QDL A; 3ZL7 C; 2LCS A; 2K3B A; 5EC7 A; 3NMZ C; 5HCK A; 3A98 A; 3EHR A; 1ZLM A; 3EG3 A; 4LNP A; 5FWC A; 2YUQ A; 1RLQ C; 4JPB W; 1OPL A; 1UGV A; 2KXD A; 2LQN A; 1UJY A; 1NLP C; 1YP5 A; 3RBB B; 1U3O A; 4ORZ A; 3M0Q A; 2DA9 A; 3VS1 A; 2DF6 A; 1AOJ A; 4AFZ C; 2J6O A; 2EGE A; 5IHK A; 2FPE A; 3H0F A; 1XOV A; 2GGR A; 4RTY A; 2D1X A; 1UFF A; 1VYT A; 1JXO A; 5GJV B; 2LJ0 A; 1QLY A; 3I5R A; 1K4U S; 4ZNX A; 1KSW A; 2E5K A; 1B3Q A; 1NLO C; 1SRM A; 4EIK A; 2J7I A; 2JT4 A; 5IHN A; 1QCF A; 4F14 A; 1WA7 A; 4F16 A; 1YNZ A; 1QKW A; 2DX1 A; 4J9H A; 4J9C A; 1MUZ A; 1NYF A; 1YWP A; 2KGT A; 2MIO A; 2DVJ A; 2EPD A; 2DRK A; 4LUD A; 1TUD A; 3EG2 A; 5IXB A; 5FWB A; 3SEM A; 1I07 A; 3QWX X; 1V1C A; 2KT8 A; 1WLP B; 2DMO A; 4GBQ A; 2NUZ A; 3QWY A; 2CSQ A; 1SHF A; 2JXB A; 1ABQ A; 4Y92 A; 2FPF A; 1JEG A; 1MV0 B; 1QKX A; 1H92 A; 3FJ5 A; 1PWT A; 2CUD A; 4ESR A; 2C0T A; 2DL4 A; 2M0Y A; 2AKK A; 2M51 A; 3NGP A; 1GFC A; 1X2K A; 2L3Q A; 4OML A; 2EKH A; 4HVU A; 2O2O A; 1FMK A; 4RTX A; 2I0N A; 1UEC A; 4RTU A; 1UG1 A; 2GTJ A; 1WDX A; 4K11 A; 4D8K A; 4Z88 A; 1H3H A; 1ZUU A; 2LZ6 B; 2P4R A; 2A36 A; 3VRZ A; 5GJW B; 2YUO A; 1NG2 A; 1K0X A; 5I22 A; 2MOX A; 4JJB A; 2VKN A; 2DJQ A; 4LN2 A; 4HXJ A; 2JM9 A; 2D0N A; 4OMO A; 3KFV A; 1WXU A; 2ENM A; 1T0H A; 1E6G A; 2LJ3 A; 3UF4 A; 1W70 A; 2RQW A; 3VS5 A; 4JZ3 A; 1W6X A; 1JQQ A; 2VWF A; 2V1Q A; 2BZ8 A; 1PRM C; 4JJD A; 2B86 A; 2F2W A; 1Y57 A; 2JS2 A; 3SHW A; 1GBQ A; 2AZV A; 1AEY A; 1LCK A; 3ULR B; 2HEQ A; 3RNJ A; 2A28 A; 2D8H A; 4CC2 A; 3M0P A; 1PRL C; 1Y0M A; 3VS2 A; 2EGC A; 1M3C A; 1GRI A; 4Z8A A; 3O5Z A; 2X3X D; 1M27 C; 2HBW A; 2EQI A; 4HVV A; 1GL5 A; 5IXF A; 1J3T A; 1TUC A; 2YUN A; 1X2Q A; 1G2B A; 2CDT A; 2D8J A; 2ECZ A; 2GTO A; 1GFD A; 1KFZ A; 4CC4 B; 4D8D A; 4AG2 C; 3TSW A; 1GCQ A; 2BZX A; 1UE9 A; 1Z9Q A; 2X3W D; 4J9E A; 2RQR A; 3VS6 A; 2K9G A; 2RNA A; 2LJ1 A; 2EVR A; 1X69 A; 4X1V A; 2KYB A; 2DNU A; 1QWE A; 1I0C A; 1VYU A; 4A63 B; 4JZ4 A; 1I1J A; 2EGA A; 2F2V A; 2O31 A; 1EFN A; 1HJD A; 4QT7 A; 2W0Z A; 4M4Z A; 1ARK A; 3REA B; 1B07 A; 2RPN A; 2W10 A; 4WCI A; 1GCP A; 2IIM A; 1VYV A; 1SSH A; 1HD3 A; 2YDL A; 1NEG A; 2JS0 A; 1KJW A; 1Z9Z A; 3VS7 A; 4AG1 C; 2AKL A; 1OOT A; 4J9G A; 2KYM A; 3GBQ A; 2KR3 A; 2L3S A; 2DBK A; 2KEA A; 2EYW A; 1UTI A; 1BK2 A; 2CH4 A; 2AZS A; 2YSQ A; 1AD5 A; 3I35 A; 4J9F A; 2MCN A; 1W1F A; 4AFU C; 4LE9 A; 1ZUK A; 2AK5 A; 1M8M A; 4FSS A; 2KXC A; 2PNI A; 2L0A A; 1AVZ C; 1ZSG A; 2JM8 A; 2K79 A; 2EBP A; 3NPF A; 3VS4 A; 1HSQ A; 1GBR A; 2KRM A; 4J9D A; 1X27 A; 1AWJ A; 2RQT A; 1MV3 A; 3UA7 A; 2EYZ A; 2KT1 A; 3TSZ A; 1X6G A; 3THK A; 1T3S A; 1M3A A; 2LMJ A; 2GQI A; 2C0I A; 5ECA A; 1CKA A; 1H8K A; 2FPD A; 1OPK A; 3H0I A; 1S1N A; 1IO6 A; 2RQU A; 2ED1 A; 2PZ1 A; 3REB B; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KNB B; 2JMC A; 1BU1 A; 2VAS A; 4PL6 A; 2FG0 A; 2C06 A; 3JRZ A; 2XMF A; 4OMF B; 4FYW B; 4DBQ A; 1YCS B; 2EJ9 A; 1M30 A; 1UHC A; 5FU7 C; 5CKF A; 2AHJ B; 4QVC A; 1WI7 A; 4EMK A; 1BKB A; 2ROT A; 5CQY A; 1XNI A; 4C8Q A; 1NYG A; 4N0A A; 4OP0 A; 3MP8 A; 2RH2 A; 1XTD A; 4J6X A; 1YJ9 A; 1BBZ A; 1QVF A; 5GAN 6; 4M75 F; 1RAF B; 2DRM A; 3DLL A; 4F7U B; 1UJ0 A; 2HSP A; 2DM1 A; 3EHQ A; 1S72 T; 3NFC A; 1TG0 A; 1U06 A; 1BB9 A; 2BZY A; 4OB2 B; 1VQK A; 3SFM A; 1M90 R; 3CCS T; 2GBQ A; 2OJ2 A; 1OI1 A; 5LJ5 j; 3CC2 Q; 2LCL A; 4FU6 A; 1BYM A; 2V26 A; 3CPW A; 3L2V A; 2C0O A; 5KE2 A; 1I5O B; 2JMA A; 1K73 R; 1JXM A; 1NZ9 A; 1T0J A; 3QDF A; 1AWW A; 3OS1 A; 1OEB A; 4LDW A; 4OGE A; 2FRY A; 2BTT A; 1UHF A; 2HZY A; 2L3P A; 1R77 A; 2L8D A; 1X43 A; 1K73 C; 2LQW A; 2RN8 A; 5KCO A; 2DAQ A; 3BY7 A; 4M75 A; 3PE0 A; 2DK3 A; 2RJE A; 1YFN A; 4OGC A; 1VUB A; 5A2Q E; 1RI9 A; 3QDR B; 4RCC A; 2KBT A; 3VUB A; 1QWF A; 5CKH A; 1AZE A; 4NOY A; 3VKI A; 2E12 A; 3ER0 A; 4KGV B; 1WHM A; 2YT6 A; 3OMC A; 4FL6 A; 3X28 B; 1SKU B; 3QO3 A; 2WAC A; 4FW1 A; 2J05 A; 3RMS A; 1WX6 A; 3HRT A; 3J80 E; 1S72 Q; 4M7D B; 3JCM f; 2JJ9 A; 1YN8 A; 4FIB A; 3KUF A; 3JCM b; 3CCS Q; 4PJO E; 5GAM d; 2J6F A; 2V8I A; 2HSE B; 3PMT A; 2I2L A; 1ZUY A; 2MYS A; 1NM7 A; 3JV3 A; 3MEV A; 4M7D E; 3O8V A; 4R0K A; 5GAM g; 1D0X A; 1CSK A; 2RQV A; 4FT4 A; 2CP6 A; 1HK9 A; 3MPU B; 3LWI A; 4GY5 A; 3I5S A; 4BD3 A; 4DEX A; 1K1Z A; 4MMK A; 2LT1 A; 1KD1 U; 1QCN A; 3RR6 A; 4JS4 A; 1TUG B; 4RTZ A; 4CC7 A; 1KQ1 A; 1MND A; 2GNC A; 2YRC A; 5GAO q; 2DIL A; 4C92 E; 2K2M A; 1YJ9 Q; 4RMO A; 3ZL7 C; 2EIF A; 1Q82 C; 2K3B A; 2HAX A; 4J7I A; 4LNP A; 4J7F A; 1PSF A; 1RLQ C; 3GPL A; 1PCX A; 1YP5 A; 2QA4 T; 3M0Q A; 5LJ3 h; 3LX7 A; 5FU6 B; 2DF6 A; 2ZCF B; 2BUD A; 1B34 A; 2R5A A; 3TCJ A; 4DOW A; 3H0F A; 3C94 A; 3EFR A; 3FJP A; 1NPR A; 1UFF A; 2D1X A; 1EIF A; 3QZ5 B; 5KYU A; 3G7Z A; 4N4G A; 1QLY A; 3I5R A; 4JLG A; 1AHJ B; 3RIR A; 3VJP A; 3CCU T; 1UGP B; 2CZ7 B; 2FHD A; 1JRI A; 4F16 A; 2O4X B; 3L2U A; 3CCJ A; 4DBR A; 2PU9 B; 1U8R A; 5GAN 3; 2V8J A; 4LUD A; 3EG2 A; 3OYL A; 5KYY B; 1Q7Y R; 2X51 A; 4PJO D; 1N9R A; 1WLP B; 5A0D A; 1OU9 A; 4RKU E; 3JCM X; 4EMK C; 2JXB A; 4C8Q C; 1VQ6 A; 4M7D D; 4Y92 A; 3MO8 A; 2FPF A; 2KMT A; 4N0A C; 4WTO B; 3FC3 A; 2QA4 Q; 1Q7Y C; 4C5I A; 2LTO A; 2XG8 D; 5CVI A; 2DL4 A; 1R0B G; 3GF5 A; 3E9G A; 3NGP A; 2NLU A; 4MZT A; 1GFC A; 2OTJ A; 1N9S A; 2E6N A; 5J3B A; 1X2K A; 2MF2 A; 2EKH A; 2O2O A; 3ZFJ A; 2RI3 A; 4RTX A; 2I0N A; 4MDW A; 4ZN3 A; 1KD1 C; 3H6Z A; 3VRZ A; 2A36 A; 4PLI A; 2YUO A; 1NG2 A; 2MWP A; 2RJC A; 3BW1 A; 5IT9 E; 4FSX A; 4LDV A; 4LN2 A; 1BI1 A; 2D0N A; 4C92 D; 1WXU A; 3CCJ T; 2RHY A; 2P0P A; 1E6G A; 4LD9 K; 1M2O A; 4M75 G; 2PVO B; 2RQW A; 4M75 C; 4NL2 A; 2P0Q A; 1W6X A; 1VQ7 A; 1JQQ A; 3I55 A; 3M59 A; 4ANJ A; 3EG9 B; 2LQ8 A; 1PRM C; 1Y57 A; 1SF9 A; 2JS2 A; 1GBQ A; 2AZV A; 2Z0W A; 3JB9 I; 2HEQ A; 2A28 A; 3EH1 A; 4JRI A; 1PRL C; 1Y0M A; 1ZBX A; 2X4W A; 4E7S A; 4PJJ A; 1VQM A; 2HBW A; 2X4J A; 2EQI A; 4ZGE B; 4KUL A; 2OTJ T; 3JAM E; 3CMA A; 3PGG A; 3DB3 A; 1TTH B; 3G71 A; 1X2Q A; 1Q86 U; 4ZTJ A; 2GTO A; 1KFZ A; 4D8D A; 1ZSZ A; 2JZ2 A; 1GCQ A; 2BZX A; 4C5G A; 1K8A R; 1Z9Q A; 3OY9 A; 3CCJ Q; 2RQR A; 3ASK A; 3V7S A; 3MKD A; 4JRP A; 2LJ1 A; 2LVM A; 3M5A A; 2DER A; 4X1V A; 1RI0 A; 1VYU A; 1M2V A; 1K8A C; 2O31 A; 4A4K A; 2RPN A; 1GCP A; 2YLC A; 2DFU A; 2OAU A; 3V8L A; 1VQ6 Q; 3JCM P; 3CD6 T; 1HD3 A; 1NEG A; 3SWN B; 1VQP A; 1UGQ B; 1Z9Z A; 3JCM h; 3ZBD A; 3HL8 A; 2AKL A; 4P5N A; 2KYM A; 2OTJ Q; 2E4H A; 4AMC A; 3CBM A; 2FZC B; 3EGX A; 2DBK A; 4BAC A; 2EYW A; 4GLK A; 3FDR A; 4IUQ A; 1QP3 A; 1AD5 A; 1FXX A; 8ATC B; 1KG1 A; 2JTF A; 3CMA T; 4DBH A; 1MNE A; 1IRE B; 2MMP A; 4ZTF A; 1YIT T; 2L0A A; 3OYK A; 2LNV A; 1AVZ C; 4R56 A; 5FRN A; 2K79 A; 4RCB A; 2CZ6 B; 2E65 A; 2KDS A; 1X27 A; 1M1K R; 4F7U F; 3Q1J A; 3PIO A; 2A0F B; 1W2B P; 1IHW A; 3DKM A; 1M3A A; 1VQ7 Q; 2XDB A; 2C0I A; 3I55 Q; 5ECA A; 1V29 B; 3OYY A; 3OYA A; 1M1K C; 2DEU A; 3H0I A; 3CCM T; 1IO6 A; 1JJ2 A; 5GAM h; 4JUV A; 2RJF A; 2KQW A; 1YWO A; 1SEM A; 5GAN d; 3I56 A; 1NJI R; 3PFS A; 3OYF A; 1MMD A; 1M3B A; 1D3B B; 2ABL A; 5GAN g; 1LVK A; 3RER A; 2KK4 A; 1QVG P; 3JSC A; 1VQM Q; 4N4H A; 2LDM A; 1NJI C; 3M57 A; 4F7U A; 3CCQ A; 2RF0 A; 3CMA Q; 4M78 G; 1VQ5 T; 4KH1 B; 5LL6 S; 3CPW S; 1TSF A; 3E9F A; 4VUB A; 3G71 Q; 1M8V A; 1TU0 B; 1ZBJ A; 3I9Q A; 5C6S A; 2ED0 A; 2O9S A; 1TXQ A; 4PJO F; 4B9X A; 1RAB B; 1CKB A; 1JO8 A; 1RUW A; 1WYX A; 1OV3 A; 4LDX A; 4M7D F; 3G4S T; 2SRC A; 3CC4 A; 1KHC A; 5GAN 4; 1X01 A; 2COZ A; 2AT1 B; 1AWO A; 4OF1 A; 4RTV A; 3CCM Q; 1PM3 A; 2EW3 A; 3LW5 E; 4FYV B; 3HSB A; 3GNF B; 1WGS A; 1Y96 B; 2L5Q A; 2YHT A; 4RTT A; 4DBF A; 4JS5 A; 4XU2 A; 1N5Z A; 3C4S A; 4C0D B; 3PTA A; 4UC4 A; 2X9H A; 2GFU A; 3I56 T; 5L23 A; 1D09 B; 4PJO A; 2CP3 A; 1Q81 U; 2QTX A; 4IUP A; 2DIG A; 3CQT A; 1SHG A; 1UUE A; 2HDA A; 3QJ6 A; 3CME A; 4M7D A; 2QG9 B; 1OYX A; 4C92 F; 4OMQ A; 4BY6 B; 2QQB A; 3A1P A; 1M1F A; 3GLX A; 3H0H A; 3HPW A; 1G83 A; 3R6O A; 2CUB A; 2L2P A; 1NEB A; 5HK0 A; 1WHH A; 2K5F A; 4J9I A; 2G6F X; 1WXB A; 1WFW A; 1M90 U; 4OMP A; 2IVW A; 3A5Z B; 3MEW A; 5KYW B; 1ZSZ C; 1PKT A; 1GCQ C; 1OQK A; 2RI2 A; 2DLP A; 3OS5 A; 1N8R R; 4CRI A; 2DE0 X; 2HQH A; 2CT4 A; 3PNW C; 4XTY A; 2K3X A; 1YIJ A; 2RK2 A; 3OSS C; 5FW9 A; 5IHI A; 4HVW A; 5LJ3 e; 1ABO A; 4OMM A; 2DTH A; 4C92 A; 3S3N A; 5IH2 A; 5D6W A; 3PT9 A; 1XJW B; 4XU3 A; 4JLI A; 1K76 A; 3I56 Q; 1N8R C; 4RG2 A; 5J39 A; 1NPP A; 4E7I A; 3QKJ A; 2DXC A; 4DEY A; 2DL5 A; 4II1 A; 4PNO A; 4AFS C; 1WQW A; 4C5H A; 2JTE A; 2DTI A; 2EQK A; 3JCM V; 5GMK l; 5CIU A; 1TS9 A; 2QEX T; 5I21 A; 1K9M R; 4RUG A; 2K6D A; 2KRN A; 1EZZ B; 2KE9 A; 5GAN 7; 3VRY A; 4ZN1 A; 4IIO A; 4E7J A; 1RAE B; 1WHJ A; 3NMZ C; 2YWW A; 5HCK A; 1K9M C; 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