The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
DATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
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| source organism |
Escherichia coli
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| publication title |
Novel crystallization conditions for tandem variant R67 DHFR yield a wild-type crystal structure.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
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| total genus |
12
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| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2011-06-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2P4T A; 3UDC A; 2VV5 A; 2RK2 A; 2GQV A; 2RH2 A; 1VIE A; 3T9N A; 3SFM A; 1VIF A; 2RK1 A; 2OAU A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RBB B; 3V7C A; 1ZSZ A; 3CCJ T; 5IXF A; 4RTU A; 1Y71 A; 3A8M B; 4M7D B; 2LJ1 A; 3IQL A; 2CP7 A; 2Y4Y A; 2CUD A; 2C0O A; 3MPU B; 1QWE A; 4LUD A; 3KXT A; 3QPH A; 3OYN A; 2Z0W A; 1RI0 A; 4J9D A; 1Z9Q A; 5FU6 B; 3NHN A; 2YLC A; 5CQX A; 3PFS A; 2YUP A; 2HL3 A; 1QMC A; 3JB9 H; 3V7S A; 3CCM A; 1M2O A; 2CH4 W; 3LH0 A; 1UG1 A; 2COW A; 1VQM A; 1D0Y A; 2ED1 A; 3EFR A; 1QLY A; 3M53 A; 4M78 G; 4F16 A; 1OPK A; 5KYN A; 1A0N B; 5GAN g; 2DE0 X; 1WHK A; 4IUT A; 1VOM A; 3VS6 A; 1U5S A; 2YRV A; 1AEY A; 3EH1 A; 3CCE Q; 3MET A; 4M78 C; 4J7I A; 2X3X D; 4FYV B; 5IHK A; 1XQH A; 2J6K A; 1B34 B; 1R77 A; 2HSP A; 3LYI A; 4AFU C; 1VQO Q; 1S72 T; 2EYZ A; 2RQU A; 4A53 A; 3VKI A; 5GJV B; 3H0F A; 1K73 C; 4D6W A; 3LGF A; 2EGC A; 3A8G B; 4ELY C; 4KH1 B; 4M75 F; 1X2Q A; 4PKC C; 1G3T A; 3PNW C; 3RIR A; 1KC8 R; 3HSB A; 1YIJ T; 4QT7 A; 4IUU A; 1SHF A; 2CP0 A; 3M0S A; 1TUD A; 4C8Q C; 3E1S A; 4BD3 A; 4M78 D; 1K9M R; 2DL8 A; 2E1H A; 3HP9 A; 2I2L A; 2JJ9 A; 1PWT A; 1I5L A; 1VQ7 Q; 3JCM h; 2K6D A; 2BTT A; 2WSF E; 1VYV A; 3I35 A; 1M90 C; 3UA6 A; 2OI3 A; 2DET A; 2FRY A; 3CMA A; 1WQ7 A; 1D3B A; 1I81 A; 3M56 A; 1OQK A; 1G5V A; 1BI0 A; 5GMK m; 1YIT Q; 2H3J A; 3VYH B; 3JAM E; 2SRC A; 4C8Q D; 1V76 A; 4HVU A; 1EZZ B; 3AT1 B; 2VWF A; 1VQ9 T; 3M55 A; 1KIK A; 4KRT A; 2QDL A; 5LJ3 g; 2EVR A; 4GBQ A; 2L0A A; 4E7J A; 5GAN j; 3GBQ A; 2DVE A; 3OW2 A; 2X35 A; 1FMK A; 3Q1J A; 1Q86 U; 3H0H A; 3LW5 E; 4DOV A; 1C6V X; 3PGG A; 2A0F B; 1TS9 A; 2RHY A; 1GCQ C; 1ABO A; 4C8Q B; 3C94 A; 3P8H A; 2EAY A; 1Q81 R; 3EG1 A; 4E7S A; 1WI7 A; 2K9G A; 3OMG A; 5LJ3 e; 3QWY A; 4Z89 A; 1QP3 A; 5KYW B; 1LNX A; 3ZL7 C; 3OYM A; 1NYG A; 2X51 A; 5LJ5 j; 1YNZ A; 2K3B A; 3CCR Q; 1DJ7 B; 1YP5 A; 1NE8 A; 3CC7 Q; 1YCS B; 2B8A A; 1WHH A; 1D0X A; 2J6O A; 4M77 F; 2FPE A; 4HA8 A; 1NPR A; 1WJQ A; 2K3Y A; 1ZX6 A; 2EYX A; 2NWM A; 1KK7 A; 2MYS A; 3C0C A; 2K2V A; 1NM7 A; 3GLX A; 8AT1 B; 3T9N A; 2YUN A; 2CH4 A; 1VQ5 Q; 1Q82 C; 1VQ7 A; 1VQM T; 4RG2 A; 4F7U E; 3UT1 A; 4PJO F; 4ESR A; 5HKC A; 3EGX B; 5A2Q E; 2RK2 A; 2QXF A; 1UGS B; 4ZGD B; 1N6A A; 3C4S A; 3VYG A; 1KHI A; 2NUT B; 4EIK A; 1YIT A; 4B9X A; 1VQN Q; 1TUC A; 2MWO A; 3CCL A; 4FW2 A; 1OPL A; 1HK9 A; 1YJN A; 1ZUY A; 2RI3 A; 4M4Z A; 2FHD A; 4M77 E; 3TSW A; 3OW2 S; 2YLB A; 2LQW A; 1NPP A; 3G4S Q; 1W1F A; 5I22 A; 4LDU A; 1D1B A; 4JRI A; 2XHC A; 2XG8 D; 1T0J A; 3ZFJ A; 2X4J A; 2IVW A; 1TG0 A; 2EIF A; 4NS5 A; 4XU1 A; 4PJO E; 2BE9 B; 3CCU Q; 1IHV A; 3O5Z A; 5CAI A; 3M4G A; 1FXX A; 3M59 A; 2HSE B; 3JSC A; 2QEX A; 1PKT A; 3V7R A; 3CPW P; 1CKA A; 5GAN 6; 1WLP B; 1V1C A; 4CC7 A; 3ASK A; 5KYY A; 2P0Q A; 1MMN A; 2QTV A; 2CZ6 B; 4RCB A; 2QQS A; 2VUB A; 1Y96 B; 3CMA T; 1MMA A; 1EFN A; 1X2K A; 3CCS A; 2JT4 A; 3QZ9 B; 5KYU A; 3L2Q A; 3CCR A; 4RTY A; 1IGQ A; 5CR2 A; 7AT1 B; 4JJD A; 1SHG A; 2D0N A; 1TUG B; 2DXC A; 1M8M A; 4KGV B; 3X26 B; 2GQV A; 1MNE A; 2V1Q A; 1M1K C; 3OSV A; 1WYX A; 4BAC A; 2Y4X A; 3JCM g; 3RKY A; 5FLX E; 2X4W A; 2XID A; 4J6Y A; 4J6W A; 2M0O A; 3QJY A; 2HQH A; 1K9A A; 4HCC A; 1S72 Q; 1AWO A; 2RH2 A; 2YUO A; 4LDV A; 4PJM A; 2RHX A; 3EHR A; 2XMF A; 2ZGW A; 4D8D A; 3A8O B; 5GAN 7; 6AT1 B; 1M3A A; 1YIJ Q; 4RCC A; 3JCM P; 3EGD B; 1VQN A; 3R6N A; 1BKB A; 1C0M A; 3G71 Q; 3SDZ A; 3MEU A; 3QZ5 B; 2BUD A; 4E7L A; 3JCM e; 4MZT A; 1VQO T; 3VJP A; 3G4S A; 1X01 A; 3PIO A; 3RMS A; 1QW1 A; 2EYQ A; 3VRY A; 3CC4 Q; 2LC4 A; 4Y92 A; 3VS1 A; 3E9G A; 2D8H A; 4N4G A; 3EHQ A; 2RQR A; 3J7A F; 2X4Y A; 3TCJ A; 3CCU A; 1K8A U; 2RN8 A; 3JCM c; 1Q86 R; 2ENM A; 3CCV Q; 1RAE B; 4FCY A; 1JB0 E; 1UEB A; 1Y57 A; 4N0A C; 2OX7 A; 5GAN h; 1N8R R; 3OYL A; 2EQU A; 2WSE E; 1VQ7 T; 3HRS A; 4EMK A; 1VQ9 Q; 4X9C A; 4C0D C; 4F04 B; 3OYC A; 1RLQ C; 2CSQ A; 2VVK A; 4IIM A; 1QCF A; 4VUB A; 1YIT T; 4F7U B; 2XIC A; 5D7U A; 3CCL T; 2KSS A; 3OBY A; 1YJN T; 5IT9 E; 2FPF A; 1HD3 A; 2FO0 A; 1K1Z A; 3X25 B; 4C5G A; 4KBM B; 3QII A; 1W2B A; 2HBP A; 5HK3 A; 4J9B A; 2RM4 A; 5A0L A; 5LJ5 h; 2L3R A; 3FC3 A; 1X27 A; 5GAN 4; 4JRK A; 2COZ A; 2FVU A; 4PLL A; 2KT8 A; 3C12 A; 1HJD A; 2C06 A; 2F2V A; 3ULR B; 1D1C A; 3EG9 A; 1YWO A; 2A36 A; 5KCO A; 1QVG P; 4C92 C; 4J6X A; 2ED0 A; 3OBW A; 2O2O A; 2EGA A; 1QCO A; 4ME7 A; 3QSU A; 1JRI A; 2RF0 A; 2EFI A; 3G71 A; 3CME A; 2LP5 A; 4C0D B; 1X75 C; 4Z02 A; 3TVT A; 3CCM Q; 4M7D G; 2HEQ A; 4M78 F; 4WF2 A; 4FM4 B; 1H64 1; 2W10 A; 3CBO A; 3KBG A; 2RQT A; 3BDU A; 3CC4 A; 1IRX A; 3RNJ A; 4YTL A; 3CCR T; 5GAM j; 2EKH A; 1VYT A; 3RKW A; 1Y07 A; 1PCX A; 5CK9 A; 2DD4 A; 1YJW Q; 4C92 D; 1AT1 B; 3REA B; 3EFO B; 1WA7 A; 4B6M A; 3JB9 G; 1IXD A; 2J7I A; 2RJE A; 4WTO B; 1I8F A; 1RAA B; 3CCV A; 2K4Y A; 1PSE A; 1ARK A; 1ZSZ B; 3HKS A; 4C5I A; 1KC8 C; 2ZPB B; 1T0H A; 5FU6 C; 3UWN A; 1FMV A; 3RMQ A; 1Q7Y U; 2O31 A; 1YN8 A; 2QDY B; 1J3T A; 1K9M C; 4M7D D; 2GFA A; 2HKN A; 1I5O B; 3HPW A; 2HNI A; 2KGT A; 4C92 B; 1VQN T; 2VV5 A; 1ZHI A; 4EPC A; 3OYK A; 5KE3 A; 5FRN A; 3CXC P; 4ORZ A; 1ZA1 B; 4JUV A; 4GLM A; 4DEX A; 2JOY A; 3G4S T; 1BB9 A; 3QKJ A; 2DYI A; 1LVK A; 2G3R A; 3JB9 D; 4MZM A; 2R57 A; 4JLI A; 3EAE A; 4X9D A; 1YHQ Q; 1JXM A; 2K5F A; 4BY6 C; 2MPX C; 5GAO p; 4ZN3 A; 4DA4 A; 1K73 U; 3MJX A; 4P5N A; 3MKD A; 2VXF A; 3QDF A; 5I21 A; 2CZ7 B; 3CCU T; 3CMA Q; 3F70 A; 1VQ6 A; 2CZ0 B; 5D6X A; 2RA2 A; 1Q95 G; 3TQ7 P; 2DKG A; 4JJN K; 2MAM A; 3UPU A; 3M0R A; 2DAQ A; 3V8L A; 3H0I A; 5IHI A; 2VYT A; 4OMQ A; 4JS4 A; 1WHG A; 2GTO A; 2LNH B; 2DMO A; 2XDP A; 2E12 A; 1M90 U; 4J9F A; 2VAS A; 3VS5 A; 1IRE B; 4RTW A; 1UFF A; 2DJZ A; 3SWN A; 1Q81 C; 1VQ4 A; 1B07 A; 3MEW A; 2RJC A; 2DVJ A; 5L23 A; 3RR6 A; 2AZS A; 1VIF A; 1YJW A; 1N9R A; 2NUP A; 2KR3 A; 4A63 B; 5GMK i; 5LJ3 d; 2FZC B; 2OAW A; 2M51 A; 5CCA A; 4PK4 A; 3OS2 A; 2BZ8 A; 4BY6 B; 1K8A R; 4ZGJ B; 4MDX A; 1NEG A; 4M7D A; 2JZ2 A; 2F1L A; 2K79 A; 1VIE A; 1TTH B; 2DTO A; 1U3O A; 1D3B B; 3M0T A; 2FZG B; 3I5R A; 1JEG A; 3QXE B; 1KQ1 A; 3L2R A; 4M7A C; 4C8Q G; 1SSF A; 1X69 A; 2JM9 A; 3S3M A; 2ESW A; 5IH2 A; 1JU5 C; 2GCX A; 3FB9 A; 5GAN e; 2B86 A; 4KGX B; 2GFU A; 3G71 T; 2LDM A; 4OVA A; 2QA4 A; 5LJ5 g; 4XTW A; 1KQS S; 1R0C B; 1KSW A; 4A4F A; 5I11 A; 4Y28 E; 3EGU A; 1UJ0 A; 3CC4 T; 2YDL A; 3QO3 A; 1G3Y A; 2PUO B; 5CIU A; 1YHQ A; 3VUZ A; 4BI3 A; 4LXC A; 1NJI R; 2ROL A; 1BK2 A; 1WHL A; 2G6F X; 2JMC A; 1B7T A; 3J81 E; 1R0B G; 2KMT A; 1JJ2 P; 4M7A D; 1BYM A; 4OMO A; 2R58 A; 4E47 A; 2BE7 D; 2GNC A; 1WGS A; 5HK0 A; 3QWX X; 1ZA2 B; 1X6O A; 4M75 E; 3CCV T; 3I56 A; 4ZTJ A; 1GL5 A; 4EDU A; 2QK0 A; 3LWH A; 2LJ3 A; 4QVZ A; 3CCL Q; 1QVG S; 5A0D A; 1YI2 A; 1YJN Q; 5LJ5 e; 1OV3 A; 5AT1 B; 2XD0 A; 1Q82 U; 1GRI A; 1B34 A; 2HBW A; 3E9F A; 1K4U S; 1RI9 A; 2ATC B; 3OS0 A; 2NLU A; 4QQD A; 1JQQ A; 4NOY A; 2X9H A; 1AWX A; 1RL2 A; 2E3I A; 3L1A A; 4LUE A; 1KQ2 A; 1OUL A; 2MWP A; 1M30 A; 5EG2 A; 1E6H A; 4M7A B; 2FRW A; 2QAS A; 2EQJ A; 1NZ9 A; 3JCM X; 3GIB A; 3RER A; 1PD1 A; 3L2V A; 1Z9Z A; 4PJJ A; 2D6F A; 2CT3 A; 1C1A A; 1WPY A; 3VS7 A; 4ZTF A; 4BDZ A; 2YSQ A; 4PFZ A; 1ZBJ A; 2LT4 A; 2QEX Q; 1NLP C; 4BE2 A; 1PC0 A; 2DXU A; 4PFP A; 2E41 A; 1NEB A; 2O9V A; 3RDV A; 3OYH A; 2E70 A; 5D6W A; 5GAM h; 3OMC A; 1QVF S; 2ZZD A; 3M9Q A; 4DOW A; 3FRN A; 3CCS Q; 5C0M A; 2VGN A; 4BUG A; 2Y90 A; 2X3W D; 1VQ6 T; 5KE2 A; 2KT1 A; 2JXB A; 2PU9 B; 4DQ2 A; 2QAZ A; 4WCI A; 1M8V A; 1TOV A; 1Q7Y R; 4JS5 A; 4PLI A; 1RAF B; 2COY A; 1KD1 R; 4M78 A; 2K3X A; 2D0Q B; 5FW9 A; 1SG5 A; 2DL3 A; 1PRM C; 2QI2 A; 3CCM T; 5DLO A; 3DB4 A; 2D8J A; 3VU3 C; 2FB7 A; 3AHU A; 2PVG B; 2A28 A; 2O88 A; 2PUK B; 4FW1 A; 4V2S A; 1VQ4 T; 2LCC A; 2XI9 A; 3OYB A; 3M0Q A; 4JRQ A; 1WX6 A; 3EG0 A; 1HSQ A; 1RAB B; 1YJW T; 1G2B A; 1GBQ A; 4DEY A; 2RK1 A; 4C8Q A; 2EQI A; 2KAF A; 2YUQ A; 3PE0 A; 4RTT A; 4BE0 A; 2E5K A; 5CKD A; 3JCM d; 4DBR A; 1Y0M A; 2LX9 A; 4DBF A; 1PG5 B; 2HD0 A; 5C6S A; 4J8O A; 3QDR B; 1UUE A; 4M75 C; 2KYM A; 1RAG B; 2JM8 A; 3UAT A; 1P92 A; 4KUL A; 2DL5 A; 5KYW A; 4OML A; 4CC3 A; 1HYO A; 1SEM A; 1N8R C; 3M0P A; 1M2V B; 3NPF A; 2DK3 A; 3PT9 A; 4PFO A; 4OMM A; 1M90 R; 2FG0 A; 3A8L B; 4OMF B; 1ZUK A; 2GBQ A; 4KUI A; 2J06 A; 2DD5 A; 1NYF A; 4M75 D; 1PKS A; 3FLG A; 2V26 A; 1UGV A; 1YHQ T; 3G6E A; 2JVV A; 2A3L A; 5IN1 A; 1KHC A; 2CP2 A; 2JW4 A; 4MZP A; 2VC8 A; 8ATC B; 2P4R A; 1AVZ C; 2F2W A; 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1I1J A; 3LWI A; 1AZG B; 4M77 D; 3PIP A; 3MP6 A; 5CKF A; 3NMZ C; 2KDS A; 5KYX B; 2EGE A; 2AK5 A; 2DM1 A; 1QP2 A; 3MEV A; 3RUX A; 5GAO l; 5J39 A; 2RO0 A; 3ZEH A; 3V8J A; 4E6R A; 2EKO A; 3EGD A; 5J3B A; 4OB0 B; 4PJO D; 2M1H A; 1KC8 U; 1VQ8 A; 4LE9 A; 5GAM e; 4X1V A; 2XDB A; 2QQR A; 2WSC E; 1ZBX A; 1CSK A; 3HRU A; 1ZSZ C; 1MHN A; 1K9M U; 2RHI A; 2OTL A; 2CKK A; 4M77 B; 2K2M A; 4C92 G; 2L89 A; 3UF4 A; 3GPL A; 5GAN f; 4RG8 A; 1Y7X A; 1H92 A; 3OYI A; 2BIV A; 4A4G A; 2DXT A; 1LPL A; 3P8B B; 1VQ6 Q; 2KK4 A; 4FT4 A; 4FYW B; 3TSZ A; 2QEX T; 3GP8 A; 2H3E B; 4PJO B; 3MHX A; 2DIL A; 3CQT A; 4C0F A; 1AWW A; 4PJN A; 4FSX A; 4Z8A A; 5M9O A; 2A7Y A; 3GNG A; 4KH0 B; 2AT1 B; 1PD0 A; 1IZ6 A; 1PM3 A; 4K11 A; 4QVD A; 3CCS T; 2O9S A; 1SSH A; 4E7Z A; 1VQ4 Q; 1M1F A; 4PL6 A; 4EMH A; 5GAO q; 2GF7 A; 1VQP A; 1K8A C; 5LJ5 f; 2VXE A; 1JXO A; 1OI1 A; 3S6W A; 2CP5 A; 5LL6 S; 1MMD A; 1T3L A; 2F5K A; 4C0G A; 4J9E A; 2IIM A; 4RMO A; 2MIO A; 2PNI A; 4C8Q F; 4XK8 E; 1AHJ B; 5IHN A; 2HDA A; 3CPW S; 4RTX A; 1Q81 U; 1YBY A; 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