The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
71
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structure length |
71
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Chain Sequence |
GSSGSSGLLARALYDNCPDCSDELAFSRGDILTILEQHVPESEGWWKCLLHGRQGLAPANRLQILSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of RSGI RUH-036, an SH3 domain from human cDNA
rcsb |
| molecule keywords |
HEF-like protein
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
7
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| structure length |
71
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| sequence length |
71
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5FWC A; 2PTK A; 2OJ2 A; 1V1C A; 1X6B A; 4LUD A; 2SEM A; 5L23 A; 4J9D A; 2RQV A; 4OMN A; 1N5Z A; 1NLO C; 1W6X A; 2D0N A; 3A98 A; 2LP5 A; 1RI9 A; 1ZLM A; 2DF6 A; 2EPD A; 5GJV B; 2EYW A; 1X69 A; 4RTV A; 4AFU C; 3M0P A; 2PNI A; 2FPF A; 2F2V A; 2KBT A; 2A28 A; 1BBZ A; 1I1J A; 4HVU A; 2DA9 A; 3CQT A; 1K76 A; 3I5R A; 3NPF A; 1GCQ A; 2VVK A; 1OOT A; 2KYM A; 4AG2 C; 1G83 A; 4J9H A; 1SPK A; 1E7O A; 1GFD A; 1VYT A; 3THK A; 2HEQ A; 4RTW A; 1SHF A; 2KYB A; 1X6G A; 2DL3 A; 1T0J A; 2L2P A; 2DVJ A; 2BZY A; 1OPL A; 1AD5 A; 1MUZ A; 2FEI A; 2V1R A; 4R0K A; 2J6O A; 4LE9 A; 2RQU A; 1M3C A; 2K7A A; 4OMQ A; 2LQW A; 1PHT A; 1ARK A; 3EHR A; 4Z8A A; 4Z88 A; 1WX6 A; 5IH2 A; 2CH4 A; 1UJY A; 2YDL A; 2FPD A; 2CDT A; 3VS0 A; 3I5S A; 2LJ0 A; 2CT3 A; 3NHN A; 1YN8 A; 2EYZ A; 1VYV A; 2LJ3 A; 2G6F X; 2EYY A; 2BZX A; 4J9I A; 2LZ6 B; 1QKX A; 2JTE A; 1UGV A; 4HVW A; 3SHW A; 2VWF A; 1UTI A; 2M0Y A; 2O88 A; 2KNB B; 3VRY A; 1PNJ A; 2B86 A; 4GLM A; 2DL4 A; 1H8K A; 2FRW A; 2GTJ A; 1WI7 A; 3M0R A; 1WXT A; 2GQI A; 1WXB A; 2JS0 A; 2GBQ A; 5IHN A; 2GTO A; 2KXC A; 4AG1 C; 2C0O A; 2RQT A; 3VS1 A; 1PKS A; 1YWO A; 2LNH B; 3M0S A; 1WFW A; 4KRT A; 2DRM A; 2O9V A; 4GBQ A; 1UJ0 A; 1AWW A; 1ZX6 A; 2KRS A; 1KJW A; 2DBM A; 1S1N A; 1OV3 A; 4M4Z A; 3JV3 A; 4ZNX A; 1K4U S; 3EG3 A; 2AZV A; 3NGP A; 2D8J A; 2EKH A; 1AWJ A; 1T3L A; 1YCS B; 2DL8 A; 1GCQ C; 1ZBJ A; 4FSS A; 3TSZ A; 2KT8 A; 5EC7 A; 1EFN A; 3VS2 A; 1PWT A; 2KRO A; 1M8M A; 5IHI A; 2HSP A; 2J6K A; 1ZUK A; 2MOX A; 2JM9 A; 2QDL A; 1K1Z A; 1CKB A; 1AOJ A; 1QWE A; 4CC4 B; 4JJD A; 2JS2 A; 1UDL A; 3R6N A; 2YUP A; 4HVV A; 1NM7 A; 4IIM A; 2OAW A; 2LJ1 A; 1AEY A; 1XOV A; 2ABL A; 1NYF A; 1UUE A; 2HDA A; 2YUQ A; 2LQN A; 2JXB A; 2O9S A; 2DBK A; 2P4R A; 5IXF A; 2PZ1 A; 2ECZ A; 1ABO A; 2CT4 A; 2YT6 A; 3UA7 A; 2CUD A; 1BB9 A; 4OMO A; 1SHG A; 2HCK A; 4CC7 A; 4AFQ C; 1BU1 A; 4CC2 A; 2DJQ A; 2MIO A; 2X3X D; 3QWY A; 1YP5 A; 2EGC A; 2MCN A; 4RTX A; 1GBQ A; 5IXB A; 1H92 A; 5I22 A; 1X2Q A; 4F14 A; 3VS7 A; 1SSH A; 2A37 A; 3TSW A; 4HCK A; 1FYN A; 1G2B A; 1U5S A; 3VS3 A; 2EGA A; 1QKW A; 3KFV A; 2RN8 A; 1UEC A; 2EBP A; 4WCI A; 2EGE A; 1M27 C; 2KEA A; 2F2W A; 3PE0 A; 2W0Z A; 2DNU A; 2ED1 A; 4JZ3 A; 3UF4 A; 1U3O A; 1X43 A; 1WIE A; 1TUD A; 4LN2 A; 2C0I A; 2DM1 A; 3VS6 A; 1SRL A; 2M51 A; 1VA7 A; 3M0T A; 3SEM A; 1E6H A; 2CSI A; 2JM8 A; 2KRM A; 3RNJ A; 4LNP A; 3IQL A; 1ZUY A; 2DYB A; 1X2K A; 2J7I A; 1ZSG A; 1JO8 A; 2EW3 A; 2VKN A; 2DIL A; 4J9C A; 4A63 B; 3VRZ A; 1Z9Q A; 2W10 A; 2SRC A; 1KSW A; 4E6R A; 1TUC A; 1B07 A; 4JPB W; 1CSK A; 1J3T A; 2E5K A; 1GRI A; 3REB B; 2OI3 A; 2F2X A; 3RBB B; 4D8K A; 1I0C A; 2KXD A; 5GJW B; 2C0T A; 2GGR A; 3H0H A; 1H3H A; 2YUN A; 3C0C A; 1A0N B; 4RTU A; 4ESR A; 4J9B A; 1AWO A; 1NEB A; 2ROL A; 3VS4 A; 5I11 A; 2K3B A; 1BK2 A; 1QCF A; 1KFZ A; 1NEG A; 1U06 A; 2BZ8 A; 1GBR A; 2AZS A; 2J06 A; 3H0F A; 4D8D A; 2DL7 A; 2FG0 A; 1UHC A; 4JJB A; 2NWM A; 1TG0 A; 2RNA A; 2EQI A; 4Z89 A; 1GCP A; 1KIK A; 4OML A; 1NLP C; 2ESW A; 2DMO A; 2A08 A; 2L3Q A; 1JXO A; 2RMO A; 2KT1 A; 1CKA A; 3UA6 A; 4ORZ A; 1Y0M A; 2RF0 A; 2V1Q A; 3GBQ A; 1WDX A; 1HJD A; 3EGU A; 4AFZ C; 2DL5 A; 2CUB A; 4K11 A; 3LH5 A; 4IIO A; 2LX7 A; 2X3W D; 2KGT A; 3EG1 A; 1YWP A; 2K6D A; 2JMC A; 3ZL7 C; 2L0A A; 3H41 A; 3M0U A; 1GL5 A; 1PKT A; 2ENM A; 1SRM A; 2AKL A; 2GNC A; 3EHQ A; 2RQR A; 1AWX A; 1HD3 A; 1M3B A; 1W70 A; 1AVZ C; 2J6F A; 4RUG A; 3EG2 A; 2LCS A; 2RQW A; 4X1V A; 2JW4 A; 4DEY A; 4CC3 A; 2ED0 A; 2HBW A; 2I0N A; 2IIM A; 2L3P A; 4OMP A; 3UAT A; 1UG1 A; 2EVR A; 2K2M A; 1K9A A; 1VYU A; 1JXM A; 2A36 A; 1X27 A; 1RLP C; 3QWX X; 2K79 A; 1RUW A; 3TVT A; 1ABQ A; 2FPE A; 1K0S A; 2YSQ A; 2RPN A; 2DE0 X; 2O2O A; 2K9G A; 3M0Q A; 2CSQ A; 2DX1 A; 1PRL C; 4HXJ A; 3REA B; 4AFS C; 4DEX A; 1I07 A; 1UE9 A; 4OMM A; 1JU5 C; 1AZE A; 1GFC A; 1LCK A; 1SEM A; 2D8H A; 2CH4 W; 5HCK A; 2L3S A; 1UFF A; 1FMK A; 4Y92 A; 2DLP A; 1JEG A; 3NMZ C; 1B3Q A; 1E6G A; 3EG0 A; 3I9Q A; 4EIK A; 1M3A A; 1WYX A; 2XMF A; 5ECA A; 3O5Z A; 2O31 A; 4JZ4 A; 1IO6 A; 4RTT A; 3PVQ A; 1QWF A; 2NUZ A; 3I35 A; 1OEB A; 3ULR B; 3U23 A; 1M30 A; 1NG2 A; 2FO0 A; 5FWB A; 2LMJ A; 4J9E A; 2AK5 A; 1W1F A; 5FW9 A; 2H8H A; 2JMA A; 2KE9 A; 5IHK A; 1Z9Z A; 2CRE A; 2DRK A; 1UHF A; 2JT4 A; 4LUE A; 4F17 A; 2KRN A; 1WXU A; 2KR3 A; 1T3S A; 1WA7 A; 2FRY A; 3FJ5 A; 1NYG A; 2D1X A; 4RTZ A; 4QT7 A; 1Y57 A; 1T0H A; 3VS5 A; 2J05 A; 4F16 A; 1ZUU A; 1MV3 A; 1PRM C; 2YUO A; 3PVL A; 1K0X A; 4JJC A; 1HSQ A; 2AKK A; 4J9G A; 4RTY A; 1YNZ A; 3H0I A; 1RLQ C; 1AZG B; 1JQQ A; 4J9F A; 1QLY A; 2BTT A; 1OPK A; 2EYX A; 2ROT A; 1WLP B; 1MV0 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1PSE A; 2EJG A; 1X6B A; 4LUD A; 2CGH A; 5HK0 A; 2RQV A; 3MET A; 2LP5 A; 2HD0 A; 1ZLM A; 3I56 Q; 4P5N A; 1X69 A; 5CQX A; 1VQN A; 3EH1 A; 3UDC A; 4M7A A; 2E4H A; 4AFU C; 5GMK j; 3RKW A; 2HKN A; 2VB6 A; 4QKU A; 1R77 A; 4BDY A; 2Y90 A; 1X75 C; 3M0P A; 4LDW A; 4OB1 B; 1KQ2 A; 4XK8 E; 5GAO p; 2RB6 A; 2RJC A; 1MGQ A; 3CQT A; 4JS4 A; 3NPF A; 1GCQ A; 1NBE B; 5LJ3 f; 3HRU A; 1OOT A; 5GAN 3; 3QDF A; 4PFO A; 3LWH A; 1HXD A; 1GFD A; 2KY9 A; 3FJP A; 4LXC A; 2H3E B; 5HY6 A; 4RTW A; 2DL3 A; 1T0J A; 2WAC A; 3CCL T; 1VQ8 Q; 4OF1 A; 5IT9 E; 5A0L A; 4BI3 A; 5GAN g; 2V1R A; 3CC2 A; 1U1T A; 1M3C A; 4OMQ A; 4Z8A A; 4OB2 B; 1KD1 R; 1QP2 A; 2D0Q B; 4Z88 A; 1TH7 A; 4M7A E; 5HK3 A; 3M55 A; 2PVD B; 2P0Q A; 1VQ4 A; 2XID A; 3EGD A; 2CDT A; 5FU7 C; 1S72 Q; 5CAI A; 3OS0 A; 2G6F X; 4IUP A; 3E9F A; 1YIT T; 1QKX A; 1K73 U; 2CZ7 B; 3L42 A; 1SKU B; 2O88 A; 2XD0 A; 5KYX B; 5GAM g; 4GLM A; 2GTJ A; 3D7S B; 2E65 A; 3VU3 C; 8AT1 B; 2GBQ A; 3PMT A; 2A0F B; 4C5E A; 2QQ9 A; 2C0O A; 4PK4 A; 2X51 A; 1GXI E; 1ZHI A; 2DRM A; 4E7L A; 2QGG A; 4LDX A; 1AWW A; 2E64 A; 1ZX6 A; 5GAN e; 1F1B B; 2DBM A; 1KHI A; 2H3J A; 5DY9 A; 2YXY A; 5CCA A; 1K4U S; 4LDV A; 4PJO B; 2F5T X; 2RHY A; 3G7Z A; 2RJF A; 3OQ5 A; 2DEU A; 3CCL A; 3L2W A; 2CKK A; 1K73 C; 2YRC A; 3OBW A; 4M75 C; 1EFN A; 1N8R U; 4J5Y A; 2L3R A; 1ZUK A; 2MOX A; 4XTY A; 2AHJ B; 2QDL A; 2QAZ A; 3JB9 I; 3CCQ T; 5HKC A; 1QWE A; 5LJ3 d; 1PCX A; 3MO8 A; 4M7D G; 2JJ9 A; 2OAW A; 4M7D B; 3HFN A; 1Q81 U; 4C0D B; 3EAE A; 3L2U A; 2X9H A; 5GAM e; 5IN1 A; 4KUI A; 2HDA A; 1NJI R; 5GAN 5; 2LQN A; 1YIT A; 4NS5 A; 1BI2 A; 3QII A; 3VV0 A; 2O9S A; 3OMC A; 3QO3 A; 5GAO m; 1YJ9 Q; 3QJ6 A; 2HAX A; 2HCK A; 2YRV A; 3X24 B; 3CC7 Q; 1BU1 A; 5GMK h; 3MP8 A; 4X34 A; 4BI8 B; 3QWY A; 1YP5 A; 2EGC A; 5CKD A; 3ZEH A; 3E9G A; 4FYX B; 1Y07 A; 4D6W A; 3CC4 Q; 3T9N A; 2A37 A; 1RAA B; 4HCK A; 4II1 A; 4IUQ A; 1U5S A; 3CD6 T; 3E1S A; 4KH0 B; 4EMK B; 4DA4 A; 2VXF A; 2KQW A; 1ZSZ C; 3VUB A; 3M4G A; 5I2M A; 1VQM T; 1SSF A; 2DK3 A; 1U8R A; 1WIE A; 2DYI A; 3QXE B; 3CMA A; 1QCO A; 1Q81 C; 3SEM A; 2NLU A; 3X25 B; 5LJ5 g; 4A4G A; 2DVE A; 4XU2 A; 2OTL Q; 1AHJ B; 2CSI A; 3MEW A; 5KE3 A; 4LNP A; 3IQL A; 4BDZ A; 2DER A; 2LRQ A; 2AT1 B; 2J7I A; 1JO8 A; 2EW3 A; 5FLX E; 4ZGJ B; 2VKN A; 2RK2 A; 2VUB A; 1BIA A; 3P8D A; 3I55 T; 2W10 A; 1QVP A; 3CCQ A; 3R6O A; 4E6R A; 4PJO F; 1G3Y A; 5C0M A; 1M1G A; 4XAX B; 1NE8 A; 3HPW A; 1R0C B; 1VQ7 T; 3OYI A; 3CCV Q; 4ZN1 A; 4C92 D; 1GRI A; 3HSB A; 2OI3 A; 4D8K A; 3RBB B; 1WGS A; 1I0C A; 2DFU A; 1QVG S; 6AT1 B; 2C0T A; 2KI7 A; 3H0H A; 3E2U A; 4LDY A; 3C0C A; 1YFN A; 4Y91 A; 4DOV A; 1AWO A; 3A8M B; 2ROL A; 3L2R A; 1JB0 E; 2M1H A; 5D6W A; 4E7I A; 4M7D F; 1OI1 A; 1D09 B; 1TSF A; 2QAS A; 2BZ8 A; 2HMA A; 2J06 A; 3H0F A; 1O75 A; 3CD6 A; 1UHC A; 4BY6 B; 1M90 U; 4JJB A; 2RNA A; 5LJ5 e; 1EIF A; 4PJO A; 1KIK A; 1VQM A; 1LOJ A; 2ESW A; 2DMO A; 2L3Q A; 3OYJ A; 3S3M A; 3UA6 A; 1P92 A; 2CP7 A; 2V1Q A; 1G3S A; 2XI9 A; 2DL5 A; 2CP5 A; 4R55 A; 3A8G B; 5A0D A; 4QVC A; 4K11 A; 3LH5 A; 2V26 A; 4IIO A; 4JLI A; 3NTH A; 2QI2 A; 3GP8 A; 3EG1 A; 1YWP A; 2QTX A; 2JMC A; 2LDM A; 3ZL7 C; 4M7D A; 3CCS Q; 1SRM A; 2LQ8 A; 3RR6 A; 2GNC A; 2ZAE A; 1AWX A; 3I55 A; 4RKU E; 4RUG A; 2WSF E; 2HBP A; 2KSS A; 3I56 T; 3CCL Q; 3OYE A; 1Q95 G; 2M9U A; 4DEY A; 3QHS A; 2IIM A; 1VQ7 A; 2YRD A; 1Y71 A; 1M90 C; 4PJO E; 2I2L A; 1YJN Q; 3CXC A; 1K9A A; 1VYU A; 2MMP A; 2RH2 A; 5CVI A; 3OYC A; 1RLP C; 3SWN C; 3OYM A; 4Y28 E; 1RAF B; 2FPE A; 2HSE B; 1N9R A; 3OBY A; 2F1L A; 2YSQ A; 3JCM J; 4EMK A; 5GAO r; 1MMA A; 2K9G A; 4Z02 A; 3M0Q A; 1QVF S; 2DX1 A; 2COZ A; 4L5G A; 2RK1 A; 1OZ2 A; 1I07 A; 2NUP B; 5AYF A; 1TOV A; 4OMM A; 1AZE A; 1LCK A; 3CPW A; 4CRI A; 2CH4 W; 4KUL A; 2L3S A; 3DLM A; 1VQ8 T; 4M7D E; 4EIK A; 3QYG B; 3EG0 A; 1WYX A; 2O4X A; 1I4K 1; 2CZ0 B; 3OW2 S; 1IO6 A; 1QWF A; 4MDX A; 1HYO A; 2L5Q A; 3SWN A; 3JCM b; 3MJX A; 1VIF A; 1M30 A; 1N9S A; 1S72 T; 4M7A D; 2LMJ A; 4BE2 A; 2AK5 A; 2H8H A; 2JMA A; 5KYW B; 3ER0 A; 1N8R R; 1WJR A; 4J6W A; 2RHU A; 3CMA Q; 1IB8 A; 2KRN A; 1WXU A; 3I56 A; 2CP0 A; 1NYG A; 1QVF P; 4N0A C; 1OYX A; 2LNV A; 3V7R A; 1Q81 R; 3BDU A; 1TWB A; 4PFZ A; 1Y57 A; 4C92 C; 3VS5 A; 2LC4 A; 3LYI A; 3QZ9 B; 2DZ9 A; 1HK9 A; 2PQW A; 1WHH A; 4JJC A; 2AKK A; 4KGV B; 3OMG A; 1YNZ A; 2L89 A; 5CK9 A; 4BE0 A; 1WJQ A; 1Q86 U; 1B7T A; 1AZG B; 1JQQ A; 2EYQ A; 1QLY A; 2BTT A; 4O5V A; 1PD0 A; 2E10 A; 2EYX A; 2ROT A; 3X20 B; 5A2Q E; 2PTK A; 2OJ2 A; 1VQ8 A; 4J9D A; 5AT1 B; 4J8O A; 3N5B B; 2K4Y A; 1LNX A; 4M77 B; 2D0N A; 3A98 A; 1OX8 A; 1VQL Q; 3QPH A; 3G1J A; 1VQ9 T; 5J26 A; 4L59 A; 3LWI A; 1N27 A; 4BUG A; 2K57 A; 2P0K A; 1S72 A; 2KBT A; 4C8Q G; 4HVU A; 2QYZ A; 4C8Q B; 3JB9 G; 2QK0 A; 1YJ9 T; 3RKY A; 2Y4X A; 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