The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Cytoskeleton
|
| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Crystal structure of a Src-homology 3 (SH3) domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
ALPHA-SPECTRIN SH3 DOMAIN
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| total genus |
11
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1993-05-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EG1 A; 2DL3 A; 1X2Q A; 2O9S A; 1PWT A; 4FSS A; 2LMJ A; 4OMM A; 4LUD A; 1GBQ A; 1Y0M A; 2YDL A; 3JV3 A; 4CC2 A; 4RTY A; 3NGP A; 1YP5 A; 1U3O A; 2K7A A; 2HDA A; 1X2K A; 1AZE A; 4RUG A; 3R6N A; 1U5S A; 2J6K A; 1GFD A; 1MV0 B; 1T0J A; 1QWF A; 2L3Q A; 1OPK A; 2DMO A; 2JMC A; 3O5Z A; 4HXJ A; 2L0A A; 4J9B A; 1SHG A; 4RTX A; 4OMO A; 2AKL A; 2L3P A; 2EYX A; 2JMA A; 2J7I A; 1UJY A; 3IQL A; 1TUC A; 1HJD A; 2M51 A; 3UA7 A; 4AFZ C; 2A37 A; 2KGT A; 2LJ3 A; 1NYG A; 4CC7 A; 1ZUY A; 4DEX A; 4CC4 B; 2KNB B; 4OML A; 5IHK A; 5IXB A; 2DL8 A; 1WFW A; 3I5S A; 1NEB A; 3VS1 A; 4OMN A; 1AOJ A; 3RBB B; 2FPF A; 3QWX X; 4IIO A; 4AFQ C; 1SPK A; 2AKK A; 1XOV A; 2KBT A; 1YWP A; 3M0R A; 2W10 A; 1ZUK A; 3SHW A; 5IH2 A; 2ED0 A; 2VKN A; 1HSQ A; 1A0N B; 2K6D A; 2JM8 A; 2C0O A; 2X3W D; 1K76 A; 1WXB A; 2F2V A; 2KR3 A; 2V1R A; 4Z89 A; 1PKS A; 2A28 A; 2KYB A; 2EGE A; 1AWW A; 2RQV A; 2P4R A; 2V1Q A; 1PRM C; 1GBR A; 2GTJ A; 2GGR A; 3H0I A; 1M27 C; 4WCI A; 3VRZ A; 5IHI A; 3CQT A; 1JO8 A; 1AWX A; 1VYU A; 3EG3 A; 3TVT A; 4D8D A; 4E6R A; 3VS5 A; 1M3A A; 2ABL A; 3EG2 A; 2DNU A; 1WXU A; 4AFU C; 1U06 A; 1GFC A; 2GQI A; 4F14 A; 1M30 A; 1Y57 A; 1WX6 A; 2FPD A; 1S1N A; 1BK2 A; 2RQU A; 1K1Z A; 1QLY A; 1HD3 A; 2E5K A; 2FEI A; 4F16 A; 2CDT A; 2BZX A; 1PHT A; 2A36 A; 1K0X A; 1NLP C; 2DE0 X; 2CT3 A; 2PTK A; 1QKW A; 3TSZ A; 1ARK A; 1W1F A; 1SSH A; 2EPD A; 1QCF A; 1UDL A; 3H0H A; 1NG2 A; 2ECZ A; 2FPE A; 3M0U A; 1UTI A; 3KFV A; 2D8J A; 2RQR A; 2EBP A; 2DL5 A; 3SEM A; 4ESR A; 2O88 A; 1T3S A; 4HVU A; 1WIE A; 1ZLM A; 4Z88 A; 1PKT A; 2MCN A; 2H8H A; 2JXB A; 1KJW A; 3EG0 A; 5I22 A; 4J9I A; 2FG0 A; 2OAW A; 3NMZ C; 1WYX A; 4JJD A; 4JJB A; 1MV3 A; 2LNH B; 2J06 A; 2YUN A; 1UFF A; 1EFN A; 1CSK A; 1RLP C; 2DF6 A; 2JS2 A; 4F17 A; 2DBK A; 2KRN A; 1W70 A; 1AEY A; 3I5R A; 2YSQ A; 3UAT A; 2FRY A; 2XMF A; 2RPN A; 2A08 A; 2J05 A; 2GNC A; 1GCQ C; 1BBZ A; 2ROT A; 2K2M A; 1JXO A; 1OEB A; 1WLP B; 1KSW A; 2KEA A; 2RQT A; 2C0I A; 2DRM A; 4OMQ A; 2BZY A; 3VS2 A; 2D8H A; 1UG1 A; 1OPL A; 1I07 A; 2LJ0 A; 1M8M A; 2ED1 A; 2K79 A; 1I1J A; 2YUP A; 2O2O A; 1AVZ C; 4AFS C; 2KRM A; 2CUD A; 2DJQ A; 1JQQ A; 2DL7 A; 3U23 A; 2DBM A; 4M4Z A; 5FWB A; 2HEQ A; 2LCS A; 1QKX A; 2F2X A; 2L2P A; 2K9G A; 3NHN A; 1N5Z A; 2NUZ A; 2PNI A; 2QDL A; 1YN8 A; 1H8K A; 4RTU A; 1SHF A; 2F2W A; 1E6H A; 2G6F X; 2K3B A; 2DA9 A; 2LQN A; 2CT4 A; 4DEY A; 5I11 A; 5GJW B; 3I35 A; 2EKH A; 1QWE A; 1X27 A; 2LJ1 A; 1AD5 A; 2BTT A; 3REB B; 2ESW A; 4A63 B; 1SRM A; 1M3B A; 1GL5 A; 4KRT A; 4J9F A; 5FW9 A; 1Z9Z A; 2HBW A; 2AZV A; 2PZ1 A; 3VRY A; 1WI7 A; 1H3H A; 2J6F A; 3I9Q A; 3EHR A; 1TG0 A; 1GCP A; 4J9C A; 3PVL A; 1IO6 A; 2DVJ A; 3REA B; 3THK A; 1X69 A; 3QWY A; 4HVV A; 1W6X A; 1X6B A; 1KFZ A; 2DRK A; 2MIO A; 1YNZ A; 4JZ3 A; 1ABO A; 4J9H A; 3ULR B; 2J6O A; 1PRL C; 1RLQ C; 2EGC A; 2VWF A; 3UA6 A; 4LE9 A; 2O9V A; 4ZNX A; 3H0F A; 3PE0 A; 1GCQ A; 1NLO C; 4RTW A; 2CSI A; 1G2B A; 2JTE A; 4RTZ A; 2ROL A; 2YT6 A; 3VS3 A; 2CH4 A; 3VS4 A; 2D1X A; 4RTV A; 2EQI A; 1WDX A; 2KYM A; 4Z8A A; 4Y92 A; 2D0N A; 4ORZ A; 2RN8 A; 3LH5 A; 2SRC A; 3M0Q A; 3PVQ A; 1WXT A; 3EGU A; 1AWO A; 1VA7 A; 2EVR A; 3H41 A; 1BB9 A; 2O31 A; 2KRS A; 2DIL A; 1ABQ A; 1CKA A; 1OV3 A; 1ZX6 A; 1NM7 A; 2LQW A; 2GTO A; 4GBQ A; 1RI9 A; 4GLM A; 1V1C A; 2CRE A; 4HCK A; 1UGV A; 2LP5 A; 3A98 A; 4LNP A; 1WA7 A; 3M0T A; 1J3T A; 4OMP A; 2RQW A; 2KE9 A; 4LUE A; 1SRL A; 1NYF A; 4EIK A; 5GJV B; 2AZS A; 1H92 A; 1E6G A; 1UUE A; 2OJ2 A; 4J9G A; 1UHC A; 4CC3 A; 2L3S A; 2IIM A; 2CUB A; 2JW4 A; 2KRO A; 4IIM A; 1YWO A; 2FRW A; 2EGA A; 3VS6 A; 1B07 A; 2EYW A; 2CSQ A; 1M3C A; 3UF4 A; 1AZG B; 4AG2 C; 2AK5 A; 1TUD A; 2X3X D; 4X1V A; 1ZBJ A; 2JM9 A; 2FO0 A; 1AWJ A; 4HVW A; 2KXD A; 1YCS B; 3TSW A; 1VYV A; 2VVK A; 4J9E A; 2C0T A; 1FMK A; 2GBQ A; 1GRI A; 2B86 A; 5HCK A; 2HSP A; 5IHN A; 2EYY A; 1X43 A; 1JU5 C; 2YUQ A; 1KIK A; 3FJ5 A; 3M0S A; 2HCK A; 2MOX A; 1K4U S; 5L23 A; 2YUO A; 1K0S A; 2ENM A; 2OI3 A; 1Z9Q A; 1OOT A; 4JJC A; 1T3L A; 4D8K A; 4R0K A; 3GBQ A; 1SEM A; 2JT4 A; 2SEM A; 2CH4 W; 2KXC A; 2RMO A; 2RNA A; 4JPB W; 1ZSG A; 1FYN A; 1ZUU A; 1I0C A; 4K11 A; 3EHQ A; 2RF0 A; 3VS0 A; 2DM1 A; 4JZ4 A; 1RUW A; 1CKB A; 5ECA A; 1NEG A; 2KT8 A; 5EC7 A; 4RTT A; 4AG1 C; 2NWM A; 1X6G A; 5FWC A; 3VS7 A; 1JEG A; 2LZ6 B; 1UE9 A; 3RNJ A; 1T0H A; 4LN2 A; 2JS0 A; 1UEC A; 4J9D A; 2EW3 A; 2EYZ A; 1UJ0 A; 1PNJ A; 3ZL7 C; 5IXF A; 2DX1 A; 2DLP A; 1VYT A; 3C0C A; 3NPF A; 1UHF A; 1MUZ A; 1LCK A; 1E7O A; 1JXM A; 2DYB A; 2W0Z A; 4QT7 A; 1B3Q A; 2BZ8 A; 2I0N A; 2LX7 A; 1BU1 A; 2KT1 A; 1K9A A; 1G83 A; 2M0Y A; 2DL4 A; 3M0P A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CXC S; 2JVV A; 4LDU A; 3EGX A; 3L42 A; 2O9S A; 3GNG A; 4F7U F; 4C8Q D; 3BDL A; 3C94 A; 4RTY A; 3CC2 A; 5KYU B; 2LVM A; 3M55 A; 2XDP A; 3QXE B; 2HQX A; 2K7A A; 5CIU A; 3CMA Q; 4EPC A; 4C8Q E; 1YIT T; 4ZGJ B; 1MV0 B; 2BKD N; 2DTO A; 4M7A A; 2LT1 A; 3MP6 A; 5FU7 B; 4HXJ A; 1YJN Q; 1VQ9 Q; 3PGG A; 2L0A A; 2PU9 B; 3OYM A; 4J9B A; 4HCZ A; 3A8L B; 3OYJ A; 2P0P A; 3MJX A; 1QMC A; 4OMO A; 2JMA A; 3CCS Q; 3IQL A; 3FEO A; 3MO8 A; 4YTL A; 1BCM A; 3G7Z A; 4PLL A; 3JCM X; 2CP0 A; 4PJJ A; 1VQ5 T; 4ZGD B; 1UB4 A; 4DEX A; 4E7K A; 3M59 A; 4E7S A; 1WHM A; 2KNB B; 4OML A; 3R6O A; 3BW1 A; 1JRI A; 3RBB B; 1WJS A; 2LQ8 A; 1M4Z A; 4M78 G; 4IIO A; 2R57 A; 1IXD A; 4C92 B; 3DKM A; 2AKK A; 1VQ9 A; 3CCU A; 2KBT A; 2ZPB B; 2QEX Q; 1YWP A; 3MEU A; 2JOY A; 2VKN A; 1UGP B; 1OUL A; 2K6D A; 1VQ8 T; 2JM8 A; 2OX7 A; 4A4G A; 1D3B B; 3CCV T; 1SKU B; 3N5B B; 1D1C A; 5FU6 C; 2KR3 A; 2XK0 A; 1JJ2 S; 2KK4 A; 2A28 A; 4TVR A; 3EGD A; 3CCL T; 3CCR T; 4M77 B; 2P4R A; 3FLG A; 3H0I A; 1VQL Q; 3VRZ A; 2DER A; 4BI4 A; 3JCM J; 5IHI A; 5GAO n; 2HL5 C; 1JO8 A; 4DOV A; 1AWX A; 3EG3 A; 3TVT A; 4E6R A; 4M7D D; 2DFU A; 3VS5 A; 4JS4 A; 5GAN e; 3EG2 A; 3Q1J A; 4XK8 E; 2QEX A; 4F14 A; 1M30 A; 3EH1 A; 1Y57 A; 4OB1 B; 1R8O B; 3DLL A; 4KUI A; 1KHI A; 2RJE A; 4M7D E; 2E5K A; 1O9S A; 1M2V A; 2EQK A; 3JCM c; 1OYX A; 1M90 R; 5GAM d; 1PHT A; 2ZZD A; 3DB4 A; 1Q82 C; 1YIT Q; 3M53 A; 3LYI A; 3TSZ A; 4FCY A; 5LL6 S; 4HA8 A; 4ZN1 A; 2D8J A; 2RHY A; 2RQR A; 2EBP A; 2DL5 A; 2O88 A; 5D6X A; 2R5M A; 2X51 A; 1KJW A; 3A8O B; 5I22 A; 2M1H A; 4J9I A; 1N8R C; 2OAW A; 3EAE A; 4JJB A; 3M4G A; 4JJD A; 4B9W A; 1VQ5 Q; 2RJC A; 1UGS B; 2YUN A; 1EFN A; 5CKE A; 2DBK A; 4LDY A; 2EKO A; 2KRN A; 1I5O B; 1W70 A; 3NTI A; 3V8J A; 2OTL T; 1YIT A; 2BUD A; 3BE3 A; 1GCQ C; 4LDX A; 3HL8 A; 3OSS C; 2KEA A; 1BIA A; 4RG8 A; 2E70 A; 1KQS P; 2DRM A; 4OMQ A; 3VS2 A; 1VQ8 Q; 1OU8 A; 1KD1 C; 1WJR A; 3UDC A; 5KYX A; 3CCV Q; 1M8M A; 2YUP A; 2LCL A; 1AVZ C; 3RKX A; 2CZ7 B; 3L2R A; 1RAA B; 2CUD A; 2DJQ A; 2O4X B; 3OW2 S; 3M56 A; 3CCL Q; 2NUT B; 2DBM A; 2L3R A; 4C8Q A; 5FWB A; 5LJ5 f; 1VQM A; 3E1S A; 3QUI A; 4XU2 A; 2PNI A; 4BAC A; 5GMK l; 2G6F X; 2XU8 A; 2M9U A; 1NZ9 A; 2CT4 A; 1I81 A; 3LGL A; 3OBW A; 3WVE B; 2EKH A; 1QWE A; 5GAM g; 2D6F A; 4DBQ A; 3L1A A; 1AD5 A; 2L89 A; 1K73 U; 1M3B A; 2RI5 A; 4J9F A; 3OSV A; 1VQ8 A; 2LC4 A; 3CCM T; 1H3H A; 3I9Q A; 2GF7 A; 4KGZ B; 1TG0 A; 3I56 T; 1N9R A; 1IO6 A; 2DVJ A; 1Q7Y C; 3CCR A; 1D0Z A; 2VAS A; 2E64 A; 4PJO G; 4J6W A; 2DRK A; 1YCY A; 3FDR A; 3JB9 G; 4NOY A; 1YFN A; 3VYG A; 2RB6 A; 4KUL A; 1NLO C; 3MP1 A; 1H3Z A; 4RTW A; 4FIB A; 2I2L A; 4XTY A; 4RTZ A; 5FU6 B; 1RAF B; 3VS3 A; 4FT2 A; 3VS4 A; 2DXB A; 4RTV A; 4A53 A; 2NLU A; 2E6Z A; 4OP0 A; 3BFM A; 4E7L A; 4Y92 A; 2D0N A; 2YLB A; 1VQ7 A; 2E12 A; 2OTL Q; 4KT0 E; 1KC8 U; 1LJO A; 3OYD A; 3EGU A; 1RAH B; 1VQK T; 1KG1 A; 2D0Q B; 2M0O A; 2Y4Y A; 4P5N A; 1IRX A; 2K2V A; 4C92 F; 4AMC A; 3E19 A; 4XU3 A; 1Y96 A; 1ZX6 A; 3V8K A; 1VQ4 T; 2P0Q A; 1NE8 A; 5LJ5 j; 5A0L A; 1UGV A; 1C6V X; 3G4S T; 1WA7 A; 5GJV B; 6AT1 B; 1H92 A; 2OJ2 A; 4OVA A; 3HP9 A; 3KXT A; 4KUD K; 3X25 B; 4J83 A; 1EX4 A; 4QQD A; 5CQY A; 4M77 F; 3CME T; 2OTJ T; 3RDV A; 2KRO A; 1D0X A; 1RAE B; 1LPL A; 3UF4 A; 1AZG B; 1JJ2 P; 2RJD A; 1Q86 U; 3VJP A; 1ZBJ A; 2DPP B; 2E4H A; 2FL7 A; 4V2S A; 2AT1 B; 4O6J A; 1M1K U; 1YCS B; 5DLQ E; 1K9M R; 1VYV A; 2VVK A; 1PSF A; 2ZGW A; 5GAN h; 4C0D C; 7AT1 B; 2C0T A; 1VUB A; 5IHN A; 5HCK A; 2EYY A; 3M57 A; 1X43 A; 4QVZ A; 2F5T X; 3PNW C; 4NL3 A; 2HQE A; 2MMP A; 4PL6 A; 1YIJ Q; 2KDS A; 2ZPF B; 2X4W A; 2IVW A; 5GMK i; 2EJF A; 4R0K A; 2EQJ A; 4FM4 B; 2QDY B; 1S72 T; 2SEM A; 4BE0 A; 2CZ1 B; 4CRI A; 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1VQP Q; 3X24 B; 1PD1 A; 3RKW A; 4M75 A; 4CC4 B; 5GAN f; 2VB6 A; 3CD6 T; 3CCU T; 1M90 U; 4HCC A; 3QII A; 4HT8 A; 2DJZ A; 4OMN A; 1AOJ A; 3CPW S; 2RK1 A; 3QDR B; 1YJ9 Q; 2MAM A; 3EFR A; 4BE2 A; 2QYZ A; 3M0R A; 3SHW A; 2ZPH B; 5IH2 A; 2ED0 A; 4J6X A; 1HSQ A; 1A0N B; 5GMK m; 5LJ3 j; 1G3S A; 2C0O A; 1BKB A; 1DJ7 B; 4FYW B; 1OZ2 A; 4M7D C; 2V1R A; 4Z89 A; 4FT4 A; 5DLO A; 1SSF A; 1PC0 A; 1JJ2 A; 2KYB A; 1G3W A; 1MGQ A; 2MWP A; 2GTJ A; 4C0D B; 4EMK A; 4FW1 A; 2DYI A; 3L2Z A; 1RAC B; 2JTF A; 4M78 B; 1VYU A; 2KAF A; 5I2M A; 3CC2 Q; 1M3A A; 2ABL A; 4F7U A; 4FSX A; 1IRE B; 1YI2 A; 1U06 A; 1BI0 A; 2GQI A; 3A8H B; 1RAG B; 2FPD A; 3CBM A; 1WHJ A; 1QLY A; 1K8A C; 1MNE A; 2FEI A; 3HRU A; 2CDT A; 3JRZ A; 2A36 A; 1QKW A; 1OX9 A; 4D6W A; 1SSH A; 3PMT A; 1QCF A; 2QGF B; 1NG2 A; 2K4Y A; 4BY6 C; 2FPE A; 1OU9 A; 4O5V A; 1XTD A; 2COZ A; 1PKT A; 2MCN A; 2FYK A; 3ZBD A; 4L6V 5; 3VU3 C; 2FB7 A; 2MYS A; 2JNG A; 2FG0 A; 1VQN A; 1MV3 A; 4Y28 E; 2J06 A; 1UFF A; 1CSK A; 3ER0 A; 3CD6 Q; 4KH0 B; 3CCU Q; 3HPW A; 5KYW B; 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