The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
119
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structure length |
119
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Chain Sequence |
SKQPDKQRKSQRRAPLHERHKQVRATLSADLREEYGQRNVRVNAGDTVEVLRGDFAGEEGEVINVDLDKAVIHVEDVTLEKTDGEEVPRPLDTSNVRVTDLDLEDEKREARLESEDDSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Mutations outside the anisomycin-binding site can make ribosomes drug-resistant.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L2P
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| molecule tags |
Ribosome
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| total genus |
27
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| structure length |
119
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| sequence length |
119
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| T | PF00467 | KOW | KOW motif |
| T | PF16906 | Ribosomal_L26 | Ribosomal proteins L26 eukaryotic, L24P archaeal |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CD6 A; 3CCU A; 1VQP A; 3CCE A; 2E70 A; 3I56 A; 1UEB A; 2KVQ G; 3CME T; 1K8A C; 3G4S T; 1YJ9 A; 1KQS A; 1JJ2 S; 3CCJ T; 2LCL A; 2QA4 A; 3OW2 A; 1KHI A; 1N8R C; 1YJW T; 5LL6 S; 3CCV A; 3LGL A; 3CCM T; 1KD1 U; 2L3R A; 1VQ6 T; 3CMA T; 3CCL A; 2KDS A; 1EIF A; 1KC8 U; 3CC2 A; 3G71 T; 4ZN3 A; 5IAY A; 2JVV A; 3CC4 A; 1BKB A; 2QEX T; 2LQ8 A; 1VQ4 A; 1VQK A; 1VQN T; 2E6Z A; 3CCQ A; 1QVG A; 1VQM T; 3DB4 A; 1QVF A; 5DLQ E; 1YI2 T; 3J7A F; 3CCR T; 1S72 T; 1YHQ A; 3CPF A; 3CXC S; 1YIT T; 3ER0 A; 1Q86 U; 4RG2 A; 1KC8 C; 1K73 U; 1W2B S; 1VQ8 A; 3CC7 T; 3JAM E; 1VQ9 T; 1M90 U; 1VQ7 T; 2MWO A; 1YJN T; 1VQO A; 2EIF A; 2XHC A; 3PIO A; 2IG0 A; 1VQ5 T; 2JNG A; 5HY6 A; 1VQL T; 1Q81 U; 3KBG A; 5FLX E; 3I55 T; 2OTJ T; 1NZ9 A; 3CME A; 3CCS T; 3CPW A; 3J80 E; 3G4S A; 1M1K U; 4CRI A; 1QVF S; 1K73 C; 1NJI U; 1Q86 C; 3G6E T; 1KQS S; 3OYY A; 1M90 C; 3OW2 S; 1YJW A; 2OTL T; 1Q82 U; 1NPP A; 3CCM A; 1YIJ T; 1KD1 C; 3A5Z B; 1Q81 C; 3CD6 T; 3CCU T; 1VQ6 A; 3CMA A; 1VQP T; 3CCE T; 1XNI A; 5J3B A; 1SSF A; 1IZ6 A; 3I56 T; 5IT9 E; 1M1K C; 2DO3 A; 1YBY A; 3HKS A; 3LGF A; 4ZN1 A; 3G71 A; 4TVR A; 3CPW S; 1NJI C; 1K8A U; 1JJ2 A; 1YJ9 T; 1X6O A; 3J81 E; 1K9M U; 4X34 A; 1RL2 A; 2LVM A; 4YTL A; 2QEX A; 2QA4 T; 2JOY A; 1VQN A; 3P8B B; 3CCV T; 2JUF A; 1VQM A; 5A2Q E; 3DLL A; 1YI2 A; 3CCR A; 1S72 A; 3PIP A; 1QVG S; 1YIJ A; 1NPR A; 3DB3 A; 3CCJ A; 1YIT A; 3CC7 A; 3CCL T; 1VQ7 A; 1VQ9 A; 1YJN A; 3CC2 T; 1Q7Y U; 1M1G A; 1K9M C; 1XTD A; 1VQ5 A; 3CC4 T; 2MI6 A; 1VQL A; 3I55 A; 2OTJ A; 1VQ4 T; 2MWP A; 2G3R A; 3CCS A; 1VQK T; 3CCQ T; 3CXC A; 5J26 A; 3TRE A; 3G6E A; 1YHQ T; 1W2B A; 2CKK A; 1VQ8 T; 2OTL A; 1Q7Y C; 1N8R U; 5DM7 R; 1VQO T; 4QQD A; 1Q82 C; 3LH0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2XDB A; 2O4X A; 3M0T A; 1OEB A; 4C5H A; 2YRC A; 2DXU A; 3CCJ T; 2QA4 A; 1NM7 A; 4IUU A; 3VS0 A; 4N4I A; 3CCM T; 1NJI R; 1AOJ A; 1KIK A; 2NUZ A; 2E65 A; 4BY6 B; 1PD1 A; 2JVV A; 2LQK A; 4M7A A; 3PMI A; 3EHQ A; 4KH0 B; 5FWC A; 2M0Y A; 2O9V A; 5KYY A; 2FPE A; 1VQ8 A; 4M78 G; 3JAM E; 1VQ9 T; 3UAT A; 3QDF A; 4UC4 A; 1MV3 A; 3EGX A; 1VQL T; 3PNW C; 2XIC A; 2ROT A; 1YHQ Q; 3EG9 B; 3QWX X; 1TUD A; 2A3L A; 1QWE A; 5GAO m; 4M7D G; 2HD0 A; 4A4G A; 4LDU A; 3HSB A; 4HCZ A; 4M78 D; 2QDL A; 1GCQ A; 1A0N B; 1IZ6 A; 1SSF A; 1RLQ C; 5D6W A; 4M78 A; 1HJD A; 2LZ6 B; 5HK0 A; 4A4F A; 4J5Y A; 4C92 B; 3CCV T; 3NTK A; 1KSW A; 4LDY A; 3DLL A; 2PVD B; 3CMA Q; 1WHH A; 1D1A A; 4HT8 A; 2DZ9 A; 2GFA A; 3TQ7 P; 4M7D A; 5LJ5 f; 1TG0 A; 2QEX Q; 1XTD A; 2D1X A; 1G3T A; 3HL8 A; 1Y57 A; 1OQK A; 1YI2 Q; 1S72 Q; 1UGR B; 2FG0 A; 2HZY A; 1OV3 A; 4JZ3 A; 3OS0 A; 4JDS A; 3TRE A; 1HK9 A; 1JBM A; 1UG1 A; 5CQY A; 1WJQ A; 3S3N A; 4FYW B; 3RR6 A; 3MP1 A; 4WTO B; 5GAO q; 2AK5 A; 2VXF A; 5A0L A; 2KR3 A; 3M53 A; 4Y91 A; 1I8F A; 3M57 A; 2JMC A; 3Q1J A; 1G3W A; 4J9H A; 1TSF A; 4BB7 A; 1WQ7 A; 1RLP C; 2PQW A; 2X51 A; 3CCL A; 3VS1 A; 4QKU A; 3OQ5 A; 3CC2 A; 1WXB A; 3PVQ A; 2LJ1 A; 2QG9 B; 1ZSZ A; 2CZ6 B; 3SWN A; 3JCM d; 2VV5 A; 1MMD A; 3JCM W; 4FT2 A; 2YRD A; 2E4H A; 2E6Z A; 3S6W A; 1QVG A; 1ZA2 B; 2HSP A; 1K8A R; 3J7A F; 2MCN A; 3A8G B; 1W2B S; 2CZ7 B; 2HKN A; 3VU3 C; 4QVZ A; 4KT0 E; 1VQ5 T; 2AIR B; 2JN0 A; 5GAM f; 3E9G A; 2EYY A; 1NJI U; 2QQS A; 1M2O A; 2K3X A; 2EKH A; 3H8Z A; 1RAD B; 3CCM A; 2K5F A; 3A5Z B; 1Q81 C; 4J9D A; 1S1N A; 3V7C A; 5HK3 A; 2RQR A; 4XAX B; 1JXO A; 4XTV A; 4XTX A; 5KYX A; 4AFU C; 3X24 B; 2EQI A; 3FDR A; 4OMP A; 1TS9 A; 3VV0 A; 2QK0 A; 2ENM A; 2JTF A; 1VOM A; 2HL5 C; 1Y07 A; 1SSH A; 1VQ9 A; 2QI2 A; 1VQL A; 5LJ5 j; 3V7S A; 3HP9 A; 2CP5 A; 2WAC A; 2K3B A; 2D8H A; 3UA6 A; 3RMQ A; 1AEY A; 1BIB A; 3C94 A; 4LUD A; 3HPW A; 5KYU A; 4N4G A; 2BUD A; 2K2V A; 4QQG A; 1Q82 C; 4A53 A; 3ZFJ A; 6AT1 B; 5GAN g; 2DM1 A; 4J9I A; 4ZTJ A; 2JMA A; 3THK A; 1WHG A; 4CC3 A; 4RUG A; 1KQS A; 2HBW A; 2CUD A; 2J6O A; 2DK3 A; 2KYM A; 1N6A A; 2BTT A; 3FLG A; 4RTV A; 3CCV A; 1R0B G; 3FJP A; 4ME7 A; 1KQ2 A; 4DBF A; 1VIE A; 1M8V A; 2D0Q B; 5LJ5 d; 2MK5 A; 1MND A; 3HFN A; 1R8O B; 1PRL C; 1IHW A; 2BZY A; 1OOT A; 1WLP B; 3QPH A; 2P4R A; 4PJO E; 2EIF A; 1KFZ A; 2DL8 A; 3PFS A; 1QCN A; 2CP3 A; 2DZC A; 3VS6 A; 3ME9 A; 3CCS T; 1T0J A; 3OSS C; 1TWB A; 2ECZ A; 4A4E A; 2CZ1 B; 3OYY A; 1LOJ A; 2ED0 A; 2CS7 A; 1U3O A; 2MMP A; 4JRI A; 4PKC C; 5CR2 A; 4PJO C; 1IRX A; 2G6F X; 3I56 T; 1I4K 1; 5CCA A; 2ABL A; 1K8A U; 1YJ9 T; 1ZUY A; 1RL2 A; 5C6S A; 5FU6 C; 3RKW A; 4L59 A; 4NOY A; 2KEA A; 1NPR A; 1UTI A; 3H41 A; 1VQ5 A; 1QMC A; 1ZQ1 A; 2DA9 A; 2MI6 A; 1U1T A; 3MET A; 4F7U B; 2DER A; 2EFI A; 2ZPB B; 4QQ6 A; 5LJ3 f; 3D7S B; 1VQ7 Q; 4HXJ A; 3MKD A; 4PJN A; 1NEB A; 5FU6 B; 3EHR A; 1FX7 A; 4PFZ A; 1IO6 A; 1T3S A; 2L0A A; 3CME T; 2HNI A; 4JS4 A; 1G8X A; 3CQT A; 2YUO A; 2EQU A; 2E6N A; 2XMF A; 1O9S A; 4OMM A; 2F69 A; 2SRC A; 4IIO A; 2K79 A; 3NMZ C; 3OY9 A; 2VVK A; 4B9W A; 4QVD A; 2OI3 A; 3PTA A; 3JRZ A; 2J06 A; 1O75 A; 4KUD K; 1MMG A; 3EH2 A; 3OYL A; 2RB6 A; 2KXD A; 1D3B B; 2RHI A; 2XI9 A; 1VIF A; 3MO8 A; 3CC4 Q; 4IUR A; 1M3B A; 4R56 A; 1I5O B; 1XJW B; 3UWN A; 5LJ5 e; 3QJ6 A; 2BE9 B; 1Q7Y R; 2YT6 A; 1M2V A; 4MZT A; 4BE2 A; 1VQO Q; 1YFN A; 4M77 B; 5CKD A; 4A63 B; 2RQV A; 3CCU T; 1PSF A; 2ZAE A; 4II1 A; 4E7H A; 5IT9 E; 2FB7 A; 3QYH B; 1X6O A; 5IHI A; 2VXE A; 3QSU A; 3EG1 A; 1VYT A; 1QCF A; 4FIB A; 1M8M A; 3TCJ A; 5GAN h; 4AFQ C; 3JCM g; 1K0S A; 3EFR A; 1K9M C; 1B34 A; 4FW2 A; 3G7Z A; 1Q81 R; 1VQ4 T; 3CCS A; 2Z0W A; 3CCQ T; 2HL3 A; 3F70 A; 3LH5 A; 2LQW A; 4PJO D; 5GMK h; 1NEG A; 1G83 A; 5CQX A; 3M4Y A; 1Y71 A; 3JCM P; 5KH6 A; 2YLC A; 3I56 A; 4GBQ A; 1JU5 C; 2ZPF B; 2DTH A; 2KT1 A; 1EX4 A; 1KK7 A; 2D8J A; 2MAM A; 1QVF P; 1YJ9 A; 1Y7X A; 1UHC A; 4ORZ A; 3M59 A; 4KGX B; 5AT1 B; 3UA7 A; 1Y96 B; 2X3X D; 3H9N A; 4XU0 A; 3JCM Q; 5D6Y A; 2ZPH B; 3M56 A; 4NS5 A; 4PNO A; 3V8J A; 2VB6 A; 2DNU A; 1WHL A; 3CPW P; 2KRS A; 4AT1 B; 1GFC A; 1Q82 R; 4BDZ A; 4EMK C; 3DKM A; 2VKN A; 4A4K A; 2XK0 A; 3M4G A; 4LD6 A; 3DB4 A; 4ELY C; 1QVF A; 2O4X B; 4N0A A; 4B9X A; 2RM4 A; 4KBM B; 2QQA A; 5HY6 A; 1VQP Q; 3TSW A; 2XD0 A; 3CME A; 3CPW A; 1M1K U; 4JJC A; 4JZ4 A; 5I2S A; 1H8K A; 1KG1 A; 2YXY A; 1W4S A; 2A0F B; 1OI1 A; 4M7A B; 2A7Y A; 2RI3 A; 4MDX A; 2X4X A; 2KQW A; 1YBY A; 4ZN1 A; 1OU8 A; 4PJM A; 3UT1 A; 1X69 A; 2LCC A; 1VQ6 Q; 1RAA B; 1DJ7 B; 5LJ5 g; 3L2W A; 2E3H A; 2DXB A; 1Q7Y U; 3VRY A; 2K2M A; 1NYF A; 2D9T A; 4XTZ A; 2FZG B; 1RI0 A; 3OS2 A; 1YIT Q; 2CYZ B; 2GQV A; 5KCO A; 3JCM b; 4LXC A; 3VS5 A; 1D0X A; 1TH7 A; 3ZBD A; 3EGD B; 3RMS A; 1QKX A; 3CCU A; 2E70 A; 4J9C A; 3KXT A; 4D6W A; 3OYD A; 4ESR A; 2AKK A; 2XG8 D; 3GLX A; 3U23 A; 1N8R C; 2NUT A; 1X2K A; 1PD0 A; 2IPO B; 2KK4 A; 3RKY A; 4M7D B; 3RUX A; 3NGP A; 2JW4 A; 3SDZ A; 1WPY A; 4EIK A; 1VYV A; 2E5K A; 4BY6 C; 4E7S A; 5CAI A; 3REA B; 2QA4 Q; 4Z02 A; 3OA6 A; 1VQ4 A; 2P0Q A; 3CCQ A; 1OPK A; 5DLQ E; 1RAF B; 3CCR T; 1YCY A; 2NLU A; 2R58 A; 4JS5 A; 3C4S A; 4KUI A; 4ANJ A; 2DL4 A; 2DEU A; 5FRN A; 1I5L A; 1ZHI A; 1X01 A; 3I55 T; 4C92 E; 1FMV A; 1N27 A; 4C92 F; 1ACM B; 3A8O B; 1VQ8 Q; 2VC8 A; 3G6E T; 3JV3 A; 2M1H A; 3MJX A; 2OTL T; 1WX6 A; 2L5Q A; 4GY5 A; 3JCM h; 2L3S A; 2E12 A; 2DXC A; 1X6B A; 2YWW A; 1ZSZ B; 5KYW A; 2SEM A; 1Q82 U; 3QJY A; 4RTX A; 3LW5 E; 3HKS A; 1NLO C; 1JJ2 A; 4C92 C; 2XU8 A; 1UGS B; 4PJL A; 2QAZ A; 2JUF A; 3RIR A; 4AFZ C; 5FU7 B; 2EVR A; 2K5L A; 2DBK A; 3KUF A; 3UDC A; 4J83 A; 2E3I A; 1G3S A; 3L42 A; 1Z9Z A; 2K4Y A; 1PKT A; 2LNH B; 2CGH A; 3M54 A; 1E7O A; 3V8K A; 4JUV A; 4J6W A; 5GJW B; 1M9S A; 1NE8 A; 1TOV A; 4L6V 5; 4DQ2 A; 2KXC A; 4LDX A; 5KYX B; 3E1S A; 1ARK A; 3H6Z A; 2K6D A; 2R5M A; 3UPU A; 3OS1 A; 4KUL A; 1WHJ A; 1ZBX A; 5LL6 S; 3QHS A; 4RTY A; 1M4Z A; 4XTU A; 5IXB A; 4QT7 A; 2NYS A; 3MEU A; 4WCI A; 3ULR B; 3OYN A; 5KYU B; 1C6V X; 4JPB W; 1QVG P; 4PFO A; 3CCL Q; 3ER0 A; 1Q86 U; 4RG2 A; 3CC2 Q; 1EFN A; 1M90 U; 2ATC B; 2DKG A; 1I81 A; 1MNE A; 2FYK A; 4OP0 A; 3FEO A; 3BW1 A; 2DRM A; 3OS5 A; 1U06 A; 3VKI A; 2FO0 A; 1U8R A; 3A8H B; 4PK4 A; 1PNJ A; 1K1Z A; 3L1A A; 1K73 C; 4LN2 A; 5LJ5 h; 2KY9 A; 3VUZ A; 3INZ A; 3L2U A; 2FRY A; 3I5S A; 3JCM J; 3OYI A; 4RKU E; 1ZA1 B; 4BD3 A; 4QVC A; 4C0F A; 1SPK A; 2EYZ A; 2H3E B; 3CCM Q; 3CCR A; 2V1R A; 1RAI B; 3I9Q A; 2GFU A; 3CCJ A; 1OZ3 A; 2YDL A; 4C92 G; 2C0T A; 1UUE A; 3NTI A; 3JCM X; 1SRM A; 3I55 A; 3C0C A; 1KC8 R; 2GNC A; 3HRU A; 5I11 A; 1PSE A; 1WXU A; 2ROL A; 3CXC A; 3G6E A; 3QXE B; 4DBR A; 4FYX B; 3VS4 A; 2OTL A; 2DEQ A; 2D0N A; 1JXM A; 1VQL Q; 3H0I A; 1WYX A; 5HCK A; 1TU0 B; 2RQT A; 3JB9 H; 2COW A; 4C92 D; 1JO8 A; 2K9G A; 4BI4 A; 3G4S T; 1QWF A; 3OW2 A; 1KQS P; 1NBE B; 4XTY A; 5A0G A; 1T0H A; 1B3Q A; 2HAX A; 3P8H A; 2YUQ A; 1EIF A; 3QYG B; 1K0X A; 2JXB A; 2I2L A; 3NTH A; 3M0R A; 2X3W D; 1EZZ B; 1QW1 A; 4IUQ A; 4C0Z A; 3CCV Q; 2M02 A; 4RG8 A; 5GAN 2; 5GAN 6; 2EQJ A; 4RCC A; 3M0Q A; 1FMK A; 4FSX A; 3OYA A; 1BI2 A; 1NYG A; 2C0I A; 2A37 A; 4KGV B; 5GAN 4; 3QKJ A; 3OYK A; 2QYZ A; 4Z88 A; 3ASK A; 1RI9 A; 1QVF S; 3SEM A; 4N4H A; 3SD4 A; 4E2F B; 1MHN A; 3JB9 D; 2MIO A; 1BIA A; 2RO0 A; 5CVI A; 4FU6 A; 1YIJ T; 5GMK l; 3CCE T; 5IHN A; 4OGC A; 4X9C A; 4F7U E; 5GJV B; 4TVR A; 3CPW S; 4FCY A; 4F7U F; 4PJO F; 4YTL A; 2YSQ A; 4EMH A; 1QQJ A; 4OB1 B; 2RHZ A; 3OBY A; 2A28 A; 3FIF A; 2C06 A; 1H3H A; 5GAM j; 3FC3 A; 1BI1 A; 2RH2 A; 1I07 A; 5HKC A; 2RJC A; 1QVP A; 1QCO A; 2HMA A; 2KAF A; 2B8A A; 2KRN A; 4E7I A; 1AZG B; 4BE1 A; 2HKQ B; 3OYH A; 4E47 A; 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