The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
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sequence length |
75
|
structure length |
75
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Chain Sequence |
TNKRGERRRRRCQVAFSYLPQNDDELELKVGDIIEVVGEVEEGWWEGVLNGKTGMFPSNFIKELSGESDELGISQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SH3-domain kinase-binding protein 1
|
| publication title |
Investigation of Domain B from Human Cin85 Protein: Structure, Dynamics and Proline-Rich Motif Binding
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
6
|
| structure length |
75
|
| sequence length |
75
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-11-30 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VS5 A; 1SSH A; 2J06 A; 1E6H A; 4GBQ A; 2X3X D; 1UEC A; 2GBQ A; 1UJ0 A; 2LJ0 A; 1JQQ A; 2JXB A; 4DEX A; 1PWT A; 1TG0 A; 2CRE A; 1ABQ A; 2RPN A; 3H0H A; 1SHG A; 3H0I A; 1HJD A; 2KBT A; 4AG2 C; 3TVT A; 2F2X A; 1K0S A; 1AD5 A; 2M51 A; 4OMM A; 4RUG A; 1X2Q A; 4OMQ A; 4X1V A; 2HBW A; 2ED1 A; 1AEY A; 4LE9 A; 2EYZ A; 1U06 A; 2D8J A; 1VYT A; 1OPL A; 2CDT A; 2CT3 A; 3ULR B; 4WCI A; 1FMK A; 3PVL A; 4DEY A; 1CSK A; 2AK5 A; 4HVU A; 1GBQ A; 2YUO A; 1UFF A; 2O31 A; 1AZG B; 3NMZ C; 2DM1 A; 1XOV A; 1ZBJ A; 2DL4 A; 1X43 A; 1YP5 A; 1M30 A; 2YDL A; 1KJW A; 1BU1 A; 2DMO A; 5HCK A; 1MUZ A; 2YUQ A; 1K0X A; 1T3L A; 3A98 A; 3VRY A; 3UA6 A; 2BZX A; 2EYY A; 4HXJ A; 4GLM A; 1NM7 A; 2CSI A; 2ESW A; 3RBB B; 2EYW A; 4RTV A; 1M8M A; 4D8K A; 2RNA A; 1J3T A; 1VYU A; 3VS0 A; 3EHR A; 2LZ6 B; 4M4Z A; 4K11 A; 2NWM A; 5FWB A; 1X2K A; 3LH5 A; 4IIO A; 1OEB A; 1JEG A; 2K3B A; 4KRT A; 1T0J A; 3EGU A; 2KXD A; 1YWO A; 4AG1 C; 1JXM A; 2CUB A; 2EBP A; 1BK2 A; 5EC7 A; 1WXB A; 1AWW A; 2EW3 A; 2KT1 A; 2LJ1 A; 1W70 A; 2ABL A; 3U23 A; 4J9F A; 4EIK A; 3UAT A; 2KYM A; 2O9V A; 2KEA A; 1NYG A; 1LCK A; 2FG0 A; 3THK A; 1SRL A; 2LQN A; 1JU5 C; 2V1R A; 1JO8 A; 4ORZ A; 1IO6 A; 2A36 A; 2L3Q A; 3I35 A; 3VS1 A; 2LQW A; 1VA7 A; 2DA9 A; 2GNC A; 2YT6 A; 4RTT A; 1M27 C; 4CC2 A; 2D8H A; 1VYV A; 2DLP A; 5IHI A; 2CH4 A; 4J9C A; 1GRI A; 3M0Q A; 4CC7 A; 2JS0 A; 1BBZ A; 2K79 A; 1UDL A; 2D0N A; 2B86 A; 1NEB A; 3NHN A; 2FEI A; 1KIK A; 2X3W D; 2CSQ A; 1YWP A; 3PE0 A; 3NPF A; 2DYB A; 2KYB A; 1K9A A; 1A0N B; 4IIM A; 2DBK A; 1NLP C; 2LCS A; 1PRM C; 3VRZ A; 2KRM A; 3JV3 A; 3EHQ A; 3H0F A; 3KFV A; 2L0A A; 3QWY A; 4R0K A; 1AVZ C; 4CC3 A; 2KXC A; 1K1Z A; 2RQV A; 1UGV A; 4Y92 A; 2FPF A; 3EG0 A; 1MV0 B; 1OV3 A; 3SEM A; 1QWE A; 1AZE A; 2VVK A; 1RUW A; 2RN8 A; 2J6F A; 2FPE A; 1YN8 A; 1KFZ A; 2EGC A; 3VS2 A; 4AFQ C; 4J9D A; 4D8D A; 4JZ4 A; 2JM9 A; 1WDX A; 3VS3 A; 3PVQ A; 1QCF A; 4AFZ C; 3EG1 A; 2DBM A; 1Z9Q A; 5GJW B; 2FPD A; 1ZX6 A; 1GCP A; 2DRM A; 2J7I A; 1ZLM A; 1PHT A; 1RLP C; 1ARK A; 2XMF A; 2A37 A; 2LNH B; 1SPK A; 1WI7 A; 1NEG A; 2RQU A; 4RTZ A; 5FW9 A; 1GCQ A; 4OMO A; 1TUC A; 3NGP A; 2J6O A; 1QKX A; 2YSQ A; 1WYX A; 4J9G A; 1JXO A; 4E6R A; 2W10 A; 2P4R A; 2L3S A; 2GTO A; 2AZV A; 2I0N A; 1WXU A; 2OI3 A; 3I5S A; 3I9Q A; 3UF4 A; 2KR3 A; 2KRS A; 1CKA A; 1NG2 A; 3CQT A; 4Z89 A; 4ESR A; 2LJ3 A; 1CKB A; 1H8K A; 1W6X A; 2F2W A; 2VKN A; 3QWX X; 2EQI A; 4J9E A; 1ZUY A; 3M0U A; 2OJ2 A; 2SRC A; 4LNP A; 4F16 A; 3GBQ A; 1I0C A; 1OOT A; 2C0O A; 2QDL A; 1UG1 A; 1WX6 A; 1HSQ A; 1UTI A; 4OML A; 1ZSG A; 3FJ5 A; 4RTU A; 2EYX A; 1QKW A; 3IQL A; 1E7O A; 1WA7 A; 1ABO A; 1Y57 A; 2DRK A; 4QT7 A; 2LX7 A; 1H92 A; 2SEM A; 1H3H A; 2O88 A; 2DL3 A; 4J9H A; 3R6N A; 2C0I A; 2A28 A; 2M0Y A; 1RI9 A; 1X69 A; 2JT4 A; 2DL7 A; 1RLQ C; 1BB9 A; 2JMC A; 1G83 A; 2EGA A; 3I5R A; 1AWX A; 4HCK A; 1FYN A; 2EGE A; 1SHF A; 1U5S A; 2CH4 W; 1M3B A; 3UA7 A; 4F14 A; 2PNI A; 5IXF A; 2CUD A; 2RQR A; 2KNB B; 4JJD A; 2KE9 A; 1I07 A; 3M0T A; 4HVW A; 4OMP A; 4OMN A; 2L2P A; 1PKT A; 5L23 A; 1Y0M A; 2JS2 A; 1GFD A; 2L3P A; 1GCQ C; 1KSW A; 2HCK A; 2FO0 A; 2DX1 A; 2ED0 A; 2HEQ A; 2D1X A; 2GQI A; 5FWC A; 4Z88 A; 2OAW A; 3M0P A; 1PKS A; 4RTX A; 1UHF A; 3VS4 A; 1OPK A; 2RQW A; 3VS6 A; 2PZ1 A; 4LUE A; 2YUN A; 2G6F X; 2K9G A; 2DF6 A; 5ECA A; 1NYF A; 4LUD A; 1WIE A; 2EPD A; 1UHC A; 1T0H A; 2BZY A; 1N5Z A; 1M3C A; 1K4U S; 3EG2 A; 1G2B A; 1AWJ A; 1SEM A; 2E5K A; 4JJC A; 5IXB A; 2KT8 A; 3C0C A; 2JW4 A; 2LMJ A; 4FSS A; 1UUE A; 1W1F A; 2C0T A; 2ECZ A; 2JM8 A; 1AWO A; 1E6G A; 3SHW A; 2AKL A; 2GGR A; 1GBR A; 1U3O A; 2AKK A; 1PNJ A; 3RNJ A; 1TUD A; 2PTK A; 1WLP B; 2MIO A; 1M3A A; 5GJV B; 2BTT A; 3TSZ A; 2GTJ A; 3ZL7 C; 1ZUK A; 4A63 B; 2K6D A; 2VWF A; 2CT4 A; 4JPB W; 2K2M A; 2EVR A; 3TSW A; 4RTY A; 4AFS C; 1WXT A; 3M0R A; 1AOJ A; 2MOX A; 2AZS A; 4J9B A; 2YUP A; 2DE0 X; 1NLO C; 2JMA A; 2A08 A; 1QLY A; 1ZUU A; 3VS7 A; 3REB B; 5IH2 A; 4HVV A; 4JZ3 A; 1T3S A; 2DJQ A; 5IHK A; 2FRW A; 1B3Q A; 2ROL A; 2FRY A; 3M0S A; 4RTW A; 2LP5 A; 2DL5 A; 2RQT A; 1WFW A; 1Z9Z A; 5IHN A; 2MCN A; 1YCS B; 2ROT A; 1UE9 A; 1HD3 A; 1B07 A; 2JTE A; 1EFN A; 2DIL A; 4Z8A A; 2DVJ A; 3O5Z A; 4LN2 A; 1UJY A; 1K76 A; 2IIM A; 2J05 A; 4CC4 B; 1MV3 A; 1X6G A; 2KGT A; 4J9I A; 2DNU A; 2KRN A; 2KRO A; 3EG3 A; 2H8H A; 2O9S A; 1X27 A; 4ZNX A; 2J6K A; 4AFU C; 2EKH A; 2O2O A; 4F17 A; 1I1J A; 3H41 A; 1GL5 A; 2RF0 A; 2W0Z A; 2K7A A; 2HDA A; 1V1C A; 1X6B A; 2BZ8 A; 2DL8 A; 1S1N A; 2V1Q A; 1PRL C; 1QWF A; 5I11 A; 2NUZ A; 2F2V A; 5I22 A; 4JJB A; 2RMO A; 2ENM A; 2HSP A; 1GFC A; 3REA B; 1YNZ A; 1SRM A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3VS5 A; 3NFC A; 4PJN A; 2F5T X; 4QVZ A; 3CCU A; 1Q95 G; 1E6H A; 3OMC A; 5CO7 A; 4EMH A; 1JQQ A; 3ZBD A; 3E1S A; 2JXB A; 3OYE A; 4IKF A; 3OSV A; 1PWT A; 1VQ6 Q; 2P4T A; 3CCL A; 3H6Z A; 2LC4 A; 1WHG A; 2F2X A; 4KGZ B; 1K0S A; 2M51 A; 4OMQ A; 2DXU A; 3OW2 S; 1G3Y A; 5KYU A; 4KUL A; 3JCM V; 2HBW A; 4J8O A; 5LJ5 g; 5KYY A; 5HKC A; 1N6A A; 1VYT A; 1OPL A; 2AK5 A; 4ZGD B; 3ZEH A; 2RHI A; 2O31 A; 3NMZ C; 3HHT B; 3ME9 A; 5LL6 S; 3OA6 A; 3L2V A; 5J26 A; 3LGF A; 3JCM J; 2HAX A; 1K0X A; 4EPC A; 1LNX A; 2BZX A; 1W2B S; 4O6J A; 3FEO A; 4GLM A; 1NM7 A; 2ESW A; 4BAC A; 1SF9 A; 4FW2 A; 1VIE A; 4D8K A; 1LVK A; 4A4K A; 2KSS A; 2DIG A; 1VYU A; 3VS0 A; 1NBE B; 2HQE A; 1JBM A; 4OP0 A; 5FU7 C; 3MPU B; 2VAS A; 2DXB A; 1TH7 A; 2XDP A; 2M0O A; 1YWO A; 4AG1 C; 3HPW A; 3S3N A; 4EMK C; 3LLR A; 1OZ2 A; 2EBP A; 1BK2 A; 3SD4 A; 5HY6 A; 1VQK A; 1PD1 A; 1YIT T; 4EIK A; 3UAT A; 3JCM W; 3CPF A; 3M57 A; 1OU9 A; 1NYG A; 1QVF S; 4C92 C; 3OBY A; 3WVD B; 1JU5 C; 4FYX B; 1JB0 E; 2A36 A; 3I35 A; 2O4X A; 4C5H A; 3CCR A; 2DA9 A; 3I56 A; 3TEE A; 2GNC A; 5CKH A; 2OX7 A; 2EWN A; 1OQK A; 3M55 A; 5IHI A; 2DLP A; 5DLQ E; 2RHZ A; 3CMA T; 2GQV A; 1D0Z A; 4J9C A; 2KY9 A; 3CXC A; 4M78 E; 4HA8 A; 2JS0 A; 5D6X A; 3LWH A; 3JCM X; 1G3W A; 3PE0 A; 3NPF A; 2DYB A; 4GY5 A; 3CC4 T; 5LJ3 d; 3M5A A; 3CBP A; 4M7A E; 1YCY A; 3C12 A; 1NLP C; 1RAC B; 4C8Q E; 2HSE B; 2LCS A; 3A8L B; 5GAM g; 3CCE A; 4YTL A; 3HFN A; 4ZGE B; 4M7D B; 3VRZ A; 2Z0W A; 3I55 A; 1KQS P; 3EFR A; 3X26 B; 1M2O A; 3CC7 T; 4CC3 A; 3C4S A; 1NE8 A; 1MHN A; 4QW2 A; 1RAF B; 3CD6 T; 3NTH A; 4F7U G; 4E7I A; 5I2S A; 1QWE A; 1M1F A; 3OSS C; 2RN8 A; 3MO8 A; 4HT9 A; 1YFN A; 2Y90 A; 3VS3 A; 3PVQ A; 1M1K R; 4NL2 A; 4C92 G; 2E1H A; 5GJW B; 3LX7 A; 4PK4 A; 4OF1 A; 4PLI A; 5C0M A; 1RLP C; 3GP8 A; 1ARK A; 4F7U F; 4DBQ A; 2OTJ Q; 2DER A; 1NEG A; 2RI3 A; 1B34 B; 1YI2 Q; 1K9M U; 3P8H A; 2YSQ A; 3H9N A; 1K9M C; 4Q5W A; 2FVU A; 5LJ3 j; 4C92 F; 2XIC A; 1WXU A; 2OI3 A; 4PJO E; 3A8M B; 1Y96 B; 2KR3 A; 2EJ9 A; 2KRS A; 1CKA A; 4C0D B; 1NG2 A; 4JUV A; 2LJ3 A; 4M77 D; 3OS1 A; 5GAO m; 3CCJ Q; 4DOW A; 4FL6 A; 3MP6 A; 2EQI A; 5GMK j; 4C8Q D; 2E3H A; 2DEU A; 2E6Z A; 2YWW A; 3QPH A; 4LNP A; 1FMV A; 3SWN C; 2XDD A; 2K3Y A; 5GAN d; 4FU6 A; 1KD1 U; 3I55 Q; 3O8V A; 1UG1 A; 1KD1 C; 1SSF A; 1I81 A; 3OYL A; 1UTI A; 4ELZ C; 1ZSG A; 2K57 A; 3FJ5 A; 4RTU A; 2XID A; 2EYX A; 1HK9 A; 2L5Q A; 3IQL A; 5AYF A; 1VQ4 T; 2IPO B; 2VGM A; 1ABO A; 2OTL T; 1FMW A; 1Y57 A; 4M7D C; 2DRK A; 2XG8 D; 1H3H A; 2O88 A; 2DL3 A; 2QAS A; 4J9H A; 2A28 A; 1RI9 A; 2JT4 A; 2JMC A; 1BB9 A; 2BKD N; 1G83 A; 3EGX B; 4HCK A; 1FYN A; 1TWB A; 2EGE A; 3M9Q A; 1HXD A; 4MMK A; 2ZPE B; 3JSC A; 3URG A; 4F14 A; 5IXF A; 2DTI A; 1KC8 U; 4DBF A; 1VQP T; 4OMP A; 1PKT A; 1KC8 C; 3OYA A; 1Y0M A; 2JS2 A; 3CME T; 5KCH A; 1GCQ C; 1KSW A; 2FO0 A; 3INZ A; 5LJ5 e; 3DLL A; 1C0M A; 5FWC A; 2KQW A; 3M0P A; 3CC4 A; 1PKS A; 4M7D A; 1UHF A; 1VQ6 T; 1VQO A; 2RQW A; 1Y71 A; 2EJG A; 3MEW A; 3A8G B; 4A53 A; 3GF5 A; 4PJM A; 3Q1J A; 5GMK h; 3C94 A; 2L8D A; 5ECA A; 3JCM f; 1WIE A; 5GAN j; 4RG8 A; 1N5Z A; 1H3Z A; 2HKN A; 2DFU A; 3VUZ A; 1AWJ A; 3CD6 A; 2E5K A; 2KT8 A; 4FSS A; 1W1F A; 4BDZ A; 4DQ2 A; 2YXY A; 2RH2 A; 2AKK A; 3RNJ A; 1WLP B; 3GLX A; 2K6D A; 3M59 A; 1YIT Q; 2EVR A; 2ZPH B; 3G6E T; 2M16 A; 1ZQ1 A; 2MOX A; 4M78 G; 5M9O A; 1RAH B; 2LQK A; 2DE0 X; 1TS9 A; 2A08 A; 2JMA A; 1PG5 B; 1B34 A; 2JN0 A; 4PFP A; 4BY6 B; 5IH2 A; 2P0Q A; 1Q82 R; 1ZA2 B; 3GPL A; 2ROL A; 2MYS A; 1UGQ B; 3VJP A; 4M7A G; 2IVW A; 1YCS B; 3CMA Q; 4BI3 A; 1Y96 A; 2DET A; 2PVG B; 4M78 F; 1WHH A; 1Q81 U; 5D6W A; 1MV3 A; 1X6G A; 3M54 A; 4LXC A; 3EH1 A; 4IUT A; 2DNU A; 3X25 B; 1Q81 C; 3EG3 A; 4M77 F; 3EAE A; 1RAE B; 1MMG A; 1GL5 A; 4BI8 B; 4MDW A; 2W0Z A; 3QG1 A; 4M7A F; 1VQN T; 2HDA A; 1V1C A; 4J6W A; 2BZ8 A; 4C8Q F; 3OW2 P; 1S1N A; 2RJD A; 4E7S A; 2V1Q A; 1PRL C; 3EFS A; 2NUZ A; 4FW1 A; 2PVO B; 5CAI A; 3M56 A; 1OX9 A; 3M58 A; 2RMO A; 2HSP A; 1ZA1 B; 1GFC A; 3CC7 Q; 1X01 A; 4EDU A; 4JRK A; 4GBQ A; 3CD6 Q; 1EIF A; 1VQL A; 3EH2 A; 1UEC A; 3J80 E; 2OTL A; 4MZP A; 4XU0 A; 3EGX A; 5GAM e; 2CRE A; 2RPN A; 1HJD A; 2DJZ A; 3HRS A; 4PFO A; 3TVT A; 3VYG A; 2RHU A; 4Y28 E; 1W2B P; 4X34 A; 4LDU A; 1MMA A; 3FDR A; 2CP0 A; 4JS4 A; 3HTR A; 4PJO G; 4LE9 A; 2EYZ A; 2VC8 A; 3MEV A; 5EG2 A; 2D8J A; 2CDT A; 2DD4 A; 2CT3 A; 3G7Z A; 3JCM Q; 4WCI A; 4JLG A; 4CI0 C; 1CSK A; 1X75 C; 3CBM A; 1H64 1; 1DJ7 B; 1IB8 A; 2LX9 A; 2V26 A; 5CQY A; 2YUO A; 1UFF A; 3S3O A; 2PU9 B; 1GXI E; 2R5A A; 5J39 A; 2YDL A; 2WSC E; 1P92 A; 1YJW T; 1Q7Y U; 1MUZ A; 2YUQ A; 1VQ6 A; 4M75 C; 3A98 A; 3VRY A; 5CK9 A; 4JJN K; 1N9R A; 1Q7Y C; 3BFM A; 2EYY A; 4PJO F; 2CSI A; 2EYW A; 1R0C B; 1G3T A; 4A4H A; 1J3T A; 1QVF P; 3EHR A; 4M4Z A; 2NWM A; 3OYJ A; 1M90 R; 4IIO A; 1U1S A; 2FZC B; 1JEG A; 1RAG B; 2K3B A; 4KRT A; 1T0J A; 1OZ3 A; 2HMA A; 2KXD A; 4Z02 A; 3MHX A; 1JXM A; 2MWP A; 3SDZ A; 2CUB A; 1OU8 A; 1QVG A; 3KUF A; 3N5B B; 5EC7 A; 1AWW A; 2EW3 A; 2KT1 A; 1RAA B; 2ZCF B; 2KYM A; 2O9V A; 4XU2 A; 2FG0 A; 1VQ4 Q; 4HCC A; 1WQ7 A; 2LQN A; 2OTL Q; 3RIR A; 2V1R A; 2L89 A; 1BI1 A; 2L3Q A; 3VS1 A; 4JRP A; 1EZZ B; 2DTH A; 4CC2 A; 6AT1 B; 2D8H A; 4F7U B; 4N4H A; 2R58 A; 3M0Q A; 1VQP Q; 3CPW A; 3WVE B; 1BBZ A; 1N27 A; 4E7K A; 3CME Q; 3L2U A; 5CCA A; 2JTF A; 1NEB A; 4XTY A; 2X3W D; 1YWP A; 1WJS A; 3CCV T; 1BIB A; 5FRM A; 1Q86 U; 4FSX A; 1TSF A; 2KAF A; 2K5I A; 1Q86 C; 4BDY A; 5FU6 C; 3OYI A; 2LVM A; 4J7I A; 1PRM C; 2KRM A; 3H0F A; 4C0F A; 2EIF A; 2QGF B; 3QWY A; 4R0K A; 8AT1 B; 2KXC A; 1QVP A; 1YJ9 T; 2EKO A; 5GMK l; 1QCO A; 4JRQ A; 1OV3 A; 1JJ2 A; 3V7C A; 1X6O A; 1M2V B; 1WPY A; 2DZ9 A; 4J6Y A; 3J81 E; 4E7Z A; 2Y4Y A; 3VS2 A; 4D8D A; 4JZ4 A; 4OB1 B; 2JZ2 A; 4HCB A; 1MNE A; 4E7L A; 1K73 U; 4C92 D; 5A0L A; 3CCS T; 3G6E Q; 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