The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
VDYIVEYDYDAVHDDELTIRVGEIIRNVKKLQEEGWLEGELNGRRGMFPDNFVKEIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Atypical Polyproline Recognition by the Cms N-Terminal SH3 Domain.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
CD2-ASSOCIATED PROTEIN
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| total genus |
12
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-10-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DBK A; 3UA6 A; 2O31 A; 1JU5 C; 4JZ4 A; 4J9E A; 3EHQ A; 4F14 A; 4K11 A; 1PWT A; 2DJQ A; 1WXT A; 2KBT A; 4AG2 C; 5EC7 A; 3C0C A; 1WXB A; 1VYU A; 2GTO A; 2JM8 A; 3R6N A; 1PHT A; 3FJ5 A; 4LN2 A; 3M0S A; 4CC2 A; 1RI9 A; 1G2B A; 5L23 A; 1NYF A; 2AZV A; 1W70 A; 3H0I A; 4QT7 A; 2LNH B; 1V1C A; 5GJV B; 1SHG A; 1B3Q A; 1ABO A; 3M0R A; 2GQI A; 4EIK A; 4RTV A; 2L3S A; 1H3H A; 4RTW A; 2J06 A; 1I1J A; 1WFW A; 2D1X A; 4LE9 A; 1GBQ A; 1AWX A; 2YUO A; 4J9H A; 1NEB A; 1WXU A; 2ED0 A; 1A0N B; 1UEC A; 1X43 A; 2K6D A; 1M8M A; 1X27 A; 4CC7 A; 1Z9Z A; 2CSI A; 1PKS A; 1AEY A; 1MV3 A; 1X6G A; 2DYB A; 2DL5 A; 1UHF A; 3VS6 A; 1AZE A; 1PKT A; 2HEQ A; 2DA9 A; 1ZX6 A; 2LCS A; 3UAT A; 2F2V A; 2KXC A; 1GBR A; 3VS3 A; 4ESR A; 1ZUU A; 3NGP A; 4OMQ A; 1HD3 A; 2KNB B; 1UE9 A; 2J6K A; 1AZG B; 2SEM A; 4J9B A; 1OV3 A; 1MV0 B; 2C0T A; 1TUC A; 3NPF A; 2KGT A; 1KJW A; 2VVK A; 3SEM A; 4DEX A; 2AK5 A; 1I0C A; 1B07 A; 2ED1 A; 3SHW A; 2VKN A; 1AVZ C; 2AZS A; 4ORZ A; 2RQR A; 5I11 A; 2CSQ A; 2EYX A; 1UTI A; 2SRC A; 3VS0 A; 2DIL A; 4IIM A; 1UDL A; 2CT3 A; 2LJ3 A; 2L3P A; 4LUE A; 3REA B; 1VYT A; 1WA7 A; 2K9G A; 2J7I A; 2OJ2 A; 3RNJ A; 4ZNX A; 3JV3 A; 1AWW A; 2L0A A; 1K76 A; 2KRO A; 4J9I A; 1WYX A; 5IHN A; 5IXF A; 3ZL7 C; 1PNJ A; 1ZBJ A; 1QKX A; 2PNI A; 1OOT A; 1M3B A; 2X3X D; 4D8K A; 2CRE A; 2LQN A; 2ESW A; 1CKA A; 2D8H A; 1YNZ A; 2JTE A; 2I0N A; 2O2O A; 4OMP A; 4RTX A; 4E6R A; 1XOV A; 2KT1 A; 5GJW B; 1VYV A; 1K0S A; 3M0T A; 3PVL A; 4RTT A; 3EG0 A; 1NLP C; 5IHK A; 1EFN A; 3I5R A; 2YUQ A; 1H92 A; 1NLO C; 2FPE A; 2MCN A; 1T3L A; 4OMO A; 1N5Z A; 2JM9 A; 2K2M A; 4DEY A; 3VRY A; 2DL7 A; 2P4R A; 5ECA A; 2YDL A; 2DL3 A; 2EVR A; 2O9V A; 1Y57 A; 2L3Q A; 3EG2 A; 2AKL A; 3GBQ A; 2LZ6 B; 4D8D A; 1IO6 A; 1QLY A; 3QWX X; 2BZX A; 4JZ3 A; 3H0H A; 2DL8 A; 2DVJ A; 2KYM A; 1QKW A; 1S1N A; 4OMM A; 1GRI A; 2EYW A; 3RBB B; 3M0Q A; 1GL5 A; 1Z9Q A; 2DBM A; 2LP5 A; 4AFS C; 1K9A A; 2CUB A; 3EG1 A; 3EG3 A; 3IQL A; 3LH5 A; 4KRT A; 2LJ1 A; 1ZUK A; 4AG1 C; 2C0O A; 2EBP A; 1ARK A; 1M3A A; 4FSS A; 1E7O A; 2EYZ A; 2RQW A; 3PE0 A; 1KSW A; 1OPK A; 2JMC A; 1SHF A; 2OI3 A; 4AFQ C; 1WIE A; 2KT8 A; 4R0K A; 3VS5 A; 4X1V A; 4IIO A; 3NHN A; 2FO0 A; 3I9Q A; 1AWO A; 1JQQ A; 2HCK A; 2OAW A; 2DMO A; 4AFU C; 4F17 A; 2RPN A; 2VWF A; 2J6O A; 4CC3 A; 1UG1 A; 2IIM A; 3PVQ A; 3TSW A; 1W6X A; 2BZ8 A; 2FEI A; 2AKK A; 4A63 B; 2FRY A; 2CT4 A; 2MOX A; 4Z88 A; 2JT4 A; 2ABL A; 1AWJ A; 2YUP A; 1YP5 A; 2H8H A; 1OEB A; 1YWP A; 1TG0 A; 2RF0 A; 1X2K A; 1HSQ A; 3VRZ A; 1T0H A; 2KXD A; 4J9C A; 1BBZ A; 1K1Z A; 3EGU A; 1M3C A; 1RLQ C; 4LNP A; 1AD5 A; 1E6H A; 3UF4 A; 1PRM C; 4OML A; 2JS0 A; 1QWE A; 1T3S A; 1JXM A; 1YCS B; 4Z8A A; 4WCI A; 1M30 A; 2D8J A; 4HVU A; 2M0Y A; 1I07 A; 2RQU A; 2DRK A; 1YWO A; 2BZY A; 1NG2 A; 1ZUY A; 1UFF A; 4HXJ A; 2DF6 A; 4RTU A; 1RLP C; 4LUD A; 1G83 A; 2GGR A; 2NWM A; 4HVV A; 2F2X A; 1AOJ A; 2B86 A; 1TUD A; 3THK A; 2JMA A; 2CH4 A; 4HVW A; 1WI7 A; 2LQW A; 2PZ1 A; 1SPK A; 2W0Z A; 1H8K A; 3VS4 A; 2KEA A; 5FW9 A; 1U5S A; 1NM7 A; 3QWY A; 1ZSG A; 2GTJ A; 3NMZ C; 1X2Q A; 1UUE A; 1NYG A; 3TSZ A; 2EYY A; 2O88 A; 1CSK A; 2EQI A; 1GFC A; 2CUD A; 2A37 A; 2JXB A; 1KFZ A; 1MUZ A; 1SSH A; 2K79 A; 2W10 A; 4J9G A; 3A98 A; 2MIO A; 1K4U S; 3I5S A; 2YUN A; 4GBQ A; 2LMJ A; 2KRN A; 1RUW A; 1WDX A; 2RQV A; 2C0I A; 1JEG A; 4GLM A; 1NEG A; 2RMO A; 4HCK A; 2HSP A; 2D0N A; 1QCF A; 2DRM A; 2FPF A; 2DNU A; 4JJD A; 1J3T A; 2HDA A; 4F16 A; 3M0P A; 1GCP A; 1FYN A; 3VS2 A; 4RUG A; 4RTZ A; 2DX1 A; 1ZLM A; 1YN8 A; 2KR3 A; 2PTK A; 3ULR B; 1BB9 A; 1SRM A; 5I22 A; 5HCK A; 1Y0M A; 4J9D A; 4RTY A; 1X6B A; 1UGV A; 2LX7 A; 1GCQ A; 1JXO A; 2XMF A; 1QWF A; 2GNC A; 2ROL A; 4J9F A; 2KRM A; 1UJY A; 1BK2 A; 4Y92 A; 2J6F A; 2FG0 A; 2KE9 A; 3H0F A; 2HBW A; 1JO8 A; 3O5Z A; 2A28 A; 4JJC A; 3KFV A; 2CH4 W; 2RNA A; 2X3W D; 1LCK A; 2JW4 A; 2DL4 A; 2K7A A; 3REB B; 2JS2 A; 3VS7 A; 4M4Z A; 2EKH A; 2FRW A; 1WX6 A; 1SEM A; 3H41 A; 2CDT A; 1HJD A; 1T0J A; 1PRL C; 1UHC A; 3EHR A; 5FWC A; 5IXB A; 3CQT A; 1CKB A; 1VA7 A; 1BU1 A; 2G6F X; 2GBQ A; 4OMN A; 2KYB A; 2M51 A; 5FWB A; 1UJ0 A; 5IH2 A; 1K0X A; 1OPL A; 1FMK A; 2YSQ A; 4JJB A; 2DLP A; 1GFD A; 2EW3 A; 2A08 A; 2KRS A; 2F2W A; 3U23 A; 3I35 A; 2O9S A; 3VS1 A; 1E6G A; 1ABQ A; 1GCQ C; 1X69 A; 2V1Q A; 2DE0 X; 2RN8 A; 3UA7 A; 2BTT A; 2V1R A; 3TVT A; 1SRL A; 1M27 C; 2LJ0 A; 2A36 A; 4Z89 A; 1W1F A; 4JPB W; 5IHI A; 2EGC A; 2NUZ A; 3M0U A; 4AFZ C; 2EGA A; 2QDL A; 2YT6 A; 4CC4 B; 1WLP B; 2EGE A; 2L2P A; 1U06 A; 2ROT A; 2DM1 A; 2EPD A; 2ECZ A; 2E5K A; 2RQT A; 1KIK A; 2K3B A; 2ENM A; 2FPD A; 1U3O A; 2J05 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DBK A; 2O31 A; 2RA2 A; 2G3R A; 2QGG A; 3EHQ A; 4M7A F; 5GAM f; 2KBT A; 1WXB A; 3R6N A; 4M77 F; 1JBM A; 1RAH B; 1BYM A; 4KUL A; 2D6F A; 4OGC A; 3FJP A; 3M54 A; 3H0I A; 2CZ7 B; 4M78 C; 2LNH B; 3QDF A; 3M0R A; 3OYF A; 3M4Y A; 4EIK A; 2L3S A; 1VQ7 Q; 1G3T A; 1Q7Y U; 1I1J A; 3LGL A; 2E64 A; 3M58 A; 4J6X A; 2ED0 A; 2Y4Y A; 1JJ2 P; 2MF2 A; 1UEC A; 2DYI A; 3CME Q; 1I81 A; 4XQ3 A; 4M7D D; 4XU2 A; 2K5F A; 4CC7 A; 2LX9 A; 2X4W A; 5CKH A; 1Y96 A; 1MV3 A; 2DTO A; 3VS6 A; 3OSV A; 3CD6 T; 3V8L A; 4LDY A; 2MWP A; 2CGH A; 1WHJ A; 1YFN A; 4EMH A; 2IPO B; 1RAC B; 1PKT A; 1UB4 A; 2LCS A; 1ZA1 B; 3UAT A; 4ESR A; 1M5Q 1; 3RKW A; 3LW5 E; 1VQM T; 4PJJ A; 2BE9 B; 4M7D E; 3NGP A; 4E7Z A; 5CKF A; 4NL2 A; 1YJN Q; 4LDX A; 1OV3 A; 4GLK A; 4DQ2 A; 1W4S A; 2K3Y A; 2AK5 A; 4AT1 B; 3QHS A; 1I0C A; 2PVD B; 4DBF A; 1B07 A; 4DOW A; 2ED1 A; 1AVZ C; 2O01 E; 5GAO m; 1FWZ A; 4FL6 A; 5I11 A; 3VS0 A; 1UDL A; 3JCM b; 3REA B; 1VYT A; 4Y91 A; 2J7I A; 1NPP A; 1WHM A; 2QAZ A; 2GCX A; 3JCM W; 3CXC S; 4B6M A; 2NUP B; 2COZ A; 2KRO A; 3TQ7 P; 2OTJ A; 4BDY A; 5IXF A; 3ZL7 C; 1G3Y A; 1ZA2 B; 1QKX A; 1XTD A; 2DXU A; 5FU7 C; 1M3B A; 2CRE A; 3QUI A; 5FU7 B; 2D8H A; 1YNZ A; 2DPP B; 4E6R A; 2OAU A; 1XOV A; 2KT1 A; 1D09 B; 5GJW B; 1VYV A; 1QVG S; 1VQ8 T; 4C8Q D; 3OB9 A; 3EG0 A; 1N27 A; 1NLP C; 1M2O A; 4E2F B; 4C92 C; 2YUQ A; 5CR2 A; 1H92 A; 3JCM e; 3M59 A; 5LL6 S; 3CCM A; 2OTJ Q; 2FPE A; 2LDM A; 2Z0W A; 2MCN A; 3MEV A; 5KYU B; 2EQK A; 1ZBX A; 2OTL Q; 2JM9 A; 5CKD A; 5CK9 A; 2YDL A; 4C5I A; 1M1K U; 4JRQ A; 3GBQ A; 4IUR A; 4M78 D; 4B9W A; 1S72 A; 2DD5 A; 4JZ3 A; 3N5B B; 3HP9 A; 1U1S A; 4C8Q E; 4ANJ A; 4DA4 A; 1N8R R; 5KYW A; 5AYF A; 1GL5 A; 4AFS C; 3MET A; 1K9A A; 3EG1 A; 4KRT A; 4AG1 C; 1VQL A; 3CCM Q; 1R0B G; 3L1A A; 2M0O A; 2EQM A; 1E7O A; 2C06 A; 2EYZ A; 1ACM B; 4DBH A; 4FW2 A; 4ZN1 A; 5LJ3 d; 4M75 C; 2KT8 A; 3VS5 A; 1S72 Q; 1QP2 A; 3NHN A; 3JCM g; 5I2S A; 2HCK A; 1Y7X A; 1DJ7 B; 5LJ3 g; 2OAW A; 4J83 A; 4E7I A; 2VWF A; 1YJW A; 1UG1 A; 5FRM A; 2CP2 A; 2E6Z A; 4Z88 A; 4BI4 A; 1WHL A; 1AWJ A; 4F7U B; 2GFU A; 3JB9 D; 2EJF A; 1TG0 A; 1YJ9 Q; 3DB3 A; 1EZZ B; 3MEU A; 1YJW Q; 4JLI A; 2KSS A; 1HSQ A; 2LQK A; 4FT4 A; 2QQA A; 4QW2 A; 1QCN A; 1RLQ C; 2DFU A; 3RKX A; 2RHU A; 1E6H A; 3PGG A; 3UF4 A; 2JS0 A; 1XQH A; 4J7I A; 1KHI A; 4M7D G; 3MKD A; 1YCS B; 3A8L B; 2D8J A; 2QDY B; 4HVU A; 1I07 A; 5GAO q; 3WXM B; 4BD3 A; 1P92 A; 4JUV A; 5EG2 A; 1UFF A; 4HXJ A; 3BE3 A; 4HVV A; 5KE2 A; 5DLQ E; 2QQR A; 1TUD A; 4C92 D; 2JMA A; 5DY9 A; 1PCX A; 3A8M B; 4DOV A; 4HVW A; 2LQW A; 2OTJ T; 5LJ3 j; 4X9D A; 2PZ1 A; 1SPK A; 3JCM V; 2ZPF B; 3VKI A; 4FM4 B; 4PJO C; 4OB2 B; 2QA4 Q; 3QWY A; 3H9N A; 2GTJ A; 4PJO B; 4BE2 A; 1KC8 R; 1UUE A; 1NYG A; 4J8O A; 3TSZ A; 3TEE A; 4A4G A; 1CSK A; 4KBM B; 3INZ A; 3OYE A; 3CCQ Q; 1GFC A; 2VC8 A; 1MMD A; 3HRS A; 1KFZ A; 1NJI C; 1SSH A; 2K79 A; 4C92 E; 2JTF A; 3E19 A; 2CP0 A; 3EG9 A; 3CCM T; 3OW2 A; 2QTV A; 4GBQ A; 1TUG B; 4FYY B; 3CCR Q; 1JEG A; 2QXF A; 4RKU E; 4HCK A; 4M75 D; 2HSP A; 1JB0 E; 1S72 T; 3V7R A; 1ZSZ C; 2GQV A; 3JCM Q; 2VB6 A; 4PFO A; 4EPC A; 4E7H A; 2R58 A; 3ZFJ A; 1UGS B; 2DX1 A; 1QQJ A; 1VQL T; 2BE7 D; 4C8Q G; 3KBG A; 3E9F A; 4RTY A; 3RDV A; 4QVC A; 3QZ9 B; 5CO7 A; 2QAS A; 2AIR B; 2GNC A; 4J6W A; 4J9F A; 4M77 A; 3L2Q A; 4IUQ A; 2RM4 A; 2CP7 A; 3OQ5 A; 4Y92 A; 3SWN A; 1RAI B; 3EGD A; 3CCE Q; 2KE9 A; 1Q81 C; 3QBY A; 2MPX C; 3OS2 A; 2A28 A; 1RAG B; 1MMG A; 3KFV A; 2RNA A; 4M78 G; 1LCK A; 5KYU A; 2DL4 A; 4R56 A; 4OVA A; 3VS7 A; 4MZP A; 1YJW T; 1BI3 A; 4M4Z A; 3HL8 A; 3G4S A; 5KYN A; 1VQP A; 1SEM A; 2JTM A; 2M9U A; 2RHX A; 3X24 B; 1T0J A; 1PRL C; 1UGR B; 3EFO A; 2DXB A; 4N4H A; 2G6F X; 2GBQ A; 1M8V A; 3CCJ Q; 5GAN 4; 4LDV A; 1VIF A; 5I21 A; 4M7D F; 1YCY A; 1K0X A; 4HT8 A; 1F1B B; 1FMK A; 2YSQ A; 3GNG A; 3LX7 A; 2EIF A; 3M5A A; 2EKO A; 1OU8 A; 3L2Z A; 4VUB A; 4BY6 B; 1E6G A; 2DE0 X; 2BTT A; 2E4H A; 2B8A A; 3EGX B; 1M27 C; 1Y96 B; 1NPR A; 3V7C A; 1BCO A; 3X25 B; 1OUL A; 2LRQ A; 1Q86 C; 4PJO D; 2YLC A; 4QQG A; 2EGA A; 5D6X A; 2M02 A; 1RI0 A; 1X01 A; 2EGE A; 2ROT A; 1Q82 R; 1I8F A; 1WJQ A; 1K73 R; 2K3B A; 2QQ9 A; 4ZGD B; 5EC7 A; 1N6A A; 3R6O A; 1JU5 C; 2K5L A; 4RCB A; 4M7A G; 4JZ4 A; 4KGV B; 2XI9 A; 3EH2 A; 4PJO E; 1PWT A; 1KD1 C; 1U8R A; 1K9M R; 1VYU A; 3HHT B; 3I55 A; 4HCB A; 1R77 A; 4CC2 A; 3JCM f; 2RHZ A; 1NYF A; 1X75 C; 2AZV A; 4P5N A; 4QT7 A; 5J3B A; 4MDX A; 1SHG A; 1B3Q A; 1ABO A; 2PUO B; 2X51 A; 4RTV A; 1IHW A; 1EIF A; 2MWO A; 4RTW A; 1BKB A; 2J06 A; 6AT1 B; 1W2B S; 3PIP A; 4E7J A; 2DK3 A; 5FLX E; 4J9H A; 1K8A C; 5GAN 5; 2GF7 A; 2VGN A; 3SD4 A; 2K6D A; 2ZPB B; 4RG2 A; 3JCM h; 4C92 G; 2ZCF B; 3OYD A; 4C8Q F; 1LOJ A; 2PQW A; 1G8X A; 2CSI A; 1B7T A; 2EAY A; 3OYN A; 5CKB A; 3QO3 A; 2HNI A; 2DYB A; 2DL5 A; 2IVW A; 3FB9 A; 5KYX A; 1M1G A; 2X4X A; 3CD6 Q; 4A4E A; 3MPU B; 3O8V A; 3CPW A; 2HEQ A; 1ZX6 A; 3OW2 P; 3PMT A; 2BKD N; 2F2V A; 4M78 F; 5GAO n; 1GBR A; 3CC7 Q; 2DAQ A; 4ZTF A; 1YI2 A; 3BW1 A; 2SEM A; 4J9B A; 1QVF S; 1KQS A; 1M90 U; 1FMW A; 1MV0 B; 2RK1 A; 2C0T A; 3NPF A; 3VYH B; 4Y28 E; 4M75 G; 5KYW B; 5C6S A; 4UC4 A; 1Y07 A; 4LD9 K; 5GAN e; 4BAC A; 4ORZ A; 2CSQ A; 3G4S T; 2FZK B; 4IIM A; 4LUE A; 1VQP T; 4HKE A; 2K9G A; 1YI2 Q; 1PC0 A; 2VXE A; 2OJ2 A; 4IUT A; 3RNJ A; 4JRP A; 1AWW A; 2L0A A; 4J9I A; 1M1F A; 3CBP A; 5DLO A; 1ZBJ A; 5J39 A; 1UGQ B; 1OOT A; 3H6Z A; 5IN1 A; 2ESW A; 2JTE A; 5HKC A; 2I0N A; 3RKY A; 2HZY A; 4RTX A; 2YRC A; 1QW1 A; 3OYB A; 3S3N A; 4QQ6 A; 2RHI A; 2RK2 A; 1VQ8 Q; 4RTT A; 1LJO A; 4X34 A; 3RUX A; 1UEB A; 3JB9 H; 3OYL A; 2QTX A; 1T3L A; 1JRI A; 2RJC A; 2MYS A; 2K2M A; 4DEY A; 3VRY A; 4C0Z A; 4EMK A; 2DL3 A; 2EVR A; 3LWI A; 3EG2 A; 4D8D A; 2LZ6 B; 1XJW B; 2BZX A; 2DVJ A; 1QKW A; 1GRI A; 2MAM A; 3RBB B; 4O5V A; 1Z9Q A; 3LH5 A; 2CUB A; 2P84 A; 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