The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
|
sequence length |
67
|
structure length |
67
|
Chain Sequence |
GSLKVRALKDFWNLHDPTALNVRAGDVITVLEQHPDGRWKGHIHESQRGTDRIGYFPPGIVEVVSKR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
NMR solution structure of the CASKIN SH3 domain
rcsb |
| molecule keywords |
Caskin-2
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
9
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-01-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3R6N A; 1NLP C; 3QWX X; 1PRL C; 1BK2 A; 2K6D A; 5IHI A; 1CKB A; 3VS2 A; 1ZX6 A; 1KJW A; 4QT7 A; 1PWT A; 2CH4 A; 2HSP A; 1YN8 A; 1X6B A; 1Z9Q A; 3TSZ A; 1KIK A; 2K3B A; 2FRY A; 2J6F A; 3SEM A; 2RNA A; 2D0N A; 2RPN A; 1J3T A; 2DBK A; 1ZBJ A; 2EQI A; 2GQI A; 3VS4 A; 5FWB A; 3VS6 A; 1UG1 A; 3I5S A; 4GLM A; 3VS1 A; 1QWE A; 1W70 A; 4J9H A; 4Z89 A; 1VA7 A; 1Z9Z A; 1WXT A; 3TVT A; 3I5R A; 2EYZ A; 2ECZ A; 3REA B; 2BZ8 A; 3IQL A; 2DL7 A; 3I35 A; 5FWC A; 4OMN A; 4RTZ A; 3VRZ A; 1PRM C; 1X43 A; 1H92 A; 2A28 A; 5IXF A; 2AZS A; 1UJ0 A; 2JW4 A; 4CC4 B; 2JMA A; 1GFD A; 2DM1 A; 1AOJ A; 1GRI A; 2JT4 A; 2EYX A; 3LH5 A; 1WYX A; 2O9S A; 2CSQ A; 3M0U A; 2LX7 A; 1OEB A; 1MV0 B; 1V1C A; 1AVZ C; 3M0Q A; 1U06 A; 2J06 A; 4RTV A; 1SSH A; 4HCK A; 1GCQ A; 1WDX A; 2DYB A; 4LUE A; 1N5Z A; 2O2O A; 3CQT A; 3ULR B; 1RUW A; 1YCS B; 2J7I A; 2L2P A; 4OMQ A; 1CSK A; 3EHQ A; 1UHF A; 1TG0 A; 2FEI A; 2PTK A; 2FPE A; 2RF0 A; 1NEB A; 2M51 A; 2F2X A; 5FW9 A; 3ZL7 C; 1M3C A; 2HBW A; 1QKW A; 2BTT A; 4AFU C; 1AZG B; 2MOX A; 1QWF A; 2J6O A; 1NLO C; 3NHN A; 2EGC A; 1I1J A; 2HEQ A; 1NYG A; 4R0K A; 2L0A A; 2K79 A; 2EYY A; 2SRC A; 1OOT A; 1HD3 A; 2CUB A; 2D8H A; 1X6G A; 2FPF A; 1AZE A; 3PE0 A; 4J9C A; 2X3W D; 2DIL A; 2RQV A; 2EKH A; 1K4U S; 2YSQ A; 3UAT A; 5I11 A; 2D1X A; 2YDL A; 2KRS A; 3NGP A; 2K9G A; 1E6H A; 2W0Z A; 2RQW A; 1ARK A; 2KE9 A; 1GBQ A; 2LZ6 B; 4LN2 A; 2I0N A; 2LP5 A; 1S1N A; 2JMC A; 2EVR A; 2O9V A; 4LNP A; 2KRM A; 2J05 A; 2RMO A; 2VWF A; 1MV3 A; 4OMP A; 4CC2 A; 4F17 A; 1ZSG A; 3TSW A; 1AWJ A; 4RTW A; 2DJQ A; 1NM7 A; 2BZY A; 1FMK A; 3SHW A; 1G2B A; 1G83 A; 3U23 A; 1CKA A; 2KRN A; 4DEY A; 1UDL A; 2V1Q A; 1RI9 A; 1HSQ A; 1UUE A; 1T0J A; 1WXB A; 4KRT A; 2V1R A; 2MCN A; 2J6K A; 1JEG A; 3H41 A; 2KXD A; 4JJD A; 2KBT A; 2VKN A; 4GBQ A; 4JJB A; 1YWO A; 3GBQ A; 4J9B A; 1UGV A; 1UTI A; 2CDT A; 3I9Q A; 2LCS A; 1UE9 A; 2P4R A; 2X3X D; 2DL5 A; 2OJ2 A; 2SEM A; 2A08 A; 2KXC A; 2YUP A; 1UHC A; 2FG0 A; 1FYN A; 2DF6 A; 2ESW A; 4M4Z A; 3EG0 A; 2GBQ A; 1GBR A; 2LMJ A; 1NEG A; 4JZ4 A; 2AK5 A; 4JZ3 A; 3QWY A; 1K1Z A; 1U5S A; 1X69 A; 2LJ1 A; 3VS7 A; 4RTT A; 2K2M A; 2H8H A; 2DLP A; 5GJW B; 1K0X A; 2L3Q A; 1AWO A; 3O5Z A; 3UA6 A; 1IO6 A; 2C0T A; 3NPF A; 2EW3 A; 1W6X A; 1JO8 A; 1WXU A; 1PKS A; 2JS0 A; 2KT1 A; 2CT3 A; 3M0R A; 5L23 A; 2L3P A; 2RN8 A; 2DNU A; 1YNZ A; 1E6G A; 5IXB A; 2YUQ A; 1ZUK A; 1QCF A; 1M3B A; 3RNJ A; 2GTJ A; 4AG1 C; 5HCK A; 4ESR A; 3FJ5 A; 2EBP A; 3VS0 A; 1QKX A; 1PHT A; 1E7O A; 2D8J A; 2RQR A; 4J9F A; 2OAW A; 2DA9 A; 2FRW A; 2XMF A; 4HVV A; 3M0P A; 1ZUU A; 4Z8A A; 2DRK A; 3JV3 A; 1UEC A; 1Y0M A; 1YP5 A; 1QLY A; 2DBM A; 4J9I A; 2O31 A; 1SRL A; 1GCP A; 1K0S A; 1AD5 A; 1ZUY A; 1JXO A; 4RTX A; 1WIE A; 2DL8 A; 5ECA A; 2HDA A; 2PNI A; 2ABL A; 1M27 C; 1KSW A; 3REB B; 4JPB W; 2K7A A; 1NYF A; 4X1V A; 1VYU A; 1K76 A; 2GNC A; 2YUO A; 3UA7 A; 2KR3 A; 3EG2 A; 2RQU A; 4J9D A; 1ABQ A; 1BB9 A; 2LJ3 A; 1Y57 A; 3H0H A; 1LCK A; 2CH4 W; 1A0N B; 4CC3 A; 2DL3 A; 3PVL A; 4EIK A; 4F14 A; 4ZNX A; 1ZLM A; 2KYB A; 4IIO A; 1T3S A; 1AEY A; 1SPK A; 2VVK A; 2CUD A; 4WCI A; 2JS2 A; 5GJV B; 2AKK A; 2OI3 A; 1GCQ C; 2KT8 A; 5IH2 A; 1JQQ A; 1OPL A; 2JXB A; 4K11 A; 4Y92 A; 2M0Y A; 1WFW A; 4A63 B; 2ROT A; 1WA7 A; 2AKL A; 4HVU A; 1VYT A; 2KRO A; 2YT6 A; 2B86 A; 1UJY A; 2CRE A; 3C0C A; 3KFV A; 2EGE A; 1SHG A; 2DMO A; 2W10 A; 2KEA A; 4E6R A; 2DVJ A; 2KNB B; 4FSS A; 1K9A A; 2C0O A; 4OMM A; 2C0I A; 4RTU A; 4J9E A; 2DE0 X; 2DL4 A; 4RUG A; 1X2Q A; 1OPK A; 1U3O A; 2LQW A; 1HJD A; 2LNH B; 2HCK A; 1T0H A; 2A36 A; 2LJ0 A; 2EGA A; 2E5K A; 4LE9 A; 2GTO A; 2G6F X; 1WLP B; 4DEX A; 4AFZ C; 1MUZ A; 2LQN A; 1TUD A; 2YUN A; 3NMZ C; 4J9G A; 5EC7 A; 3VRY A; 1GFC A; 3VS3 A; 4OML A; 1H8K A; 2ED0 A; 1B3Q A; 2CSI A; 3EHR A; 4IIM A; 2F2W A; 2KGT A; 1X2K A; 2JM9 A; 4F16 A; 1M30 A; 1WI7 A; 4AFS C; 1AWW A; 1NG2 A; 1BBZ A; 2L3S A; 2F2V A; 3H0I A; 3M0S A; 2EYW A; 4LUD A; 2GGR A; 2MIO A; 1SHF A; 1RLQ C; 1SRM A; 2IIM A; 3M0T A; 1SEM A; 1YWP A; 1H3H A; 3EG3 A; 4RTY A; 2RQT A; 2KYM A; 2DX1 A; 1KFZ A; 1JU5 C; 2NWM A; 1B07 A; 1UFF A; 2JTE A; 1W1F A; 1ABO A; 1BU1 A; 2NUZ A; 3UF4 A; 1M3A A; 5IHN A; 2CT4 A; 5IHK A; 1X27 A; 4JJC A; 1I07 A; 3PVQ A; 2FO0 A; 1XOV A; 2BZX A; 3VS5 A; 1TUC A; 1EFN A; 4HXJ A; 2QDL A; 2DRM A; 2FPD A; 3RBB B; 2PZ1 A; 4ORZ A; 4AG2 C; 1JXM A; 2A37 A; 4HVW A; 4OMO A; 1I0C A; 3A98 A; 4Z88 A; 4D8K A; 1OV3 A; 1VYV A; 3EGU A; 4CC7 A; 2ENM A; 2O88 A; 1PKT A; 2AZV A; 2ROL A; 1T3L A; 3EG1 A; 2EPD A; 1AWX A; 1PNJ A; 2ED1 A; 5I22 A; 2JM8 A; 4AFQ C; 1WX6 A; 1M8M A; 3THK A; 1GL5 A; 1RLP C; 4D8D A; 3H0F A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GMK j; 1NLP C; 3QWX X; 3HSB A; 3L1A A; 4M75 G; 5IHI A; 4NS5 A; 5CK9 A; 1PWT A; 2HSP A; 1YN8 A; 3M5A A; 1KK7 A; 1MMD A; 1KIK A; 3SEM A; 3OYD A; 2D0N A; 1ZBJ A; 1YJ9 A; 3VS4 A; 5KYN A; 1VQP Q; 4Y28 E; 4C5E A; 1WJS A; 4GLM A; 4ZTJ A; 1KHI A; 3S3N A; 4KH1 B; 5CCA A; 5KYW A; 4EPC A; 1Z9Z A; 3FRN A; 4P5N A; 3TVT A; 4C5G A; 1N8R U; 3EG9 A; 3A8L B; 3KBG A; 3CPW A; 4C5I A; 2HSE B; 1TWB A; 1MMN A; 3IQL A; 3I35 A; 4OMN A; 2ATC B; 2LVM A; 5KYW B; 4N4H A; 1QVF S; 2A28 A; 3EG9 B; 2EJ9 A; 1KC8 R; 1EIF A; 1GFD A; 4KGZ B; 3LH5 A; 1Y71 A; 1OX8 A; 3M0U A; 2LX7 A; 1V1C A; 3GNF B; 1AVZ C; 3TCJ A; 2IVW A; 3CBM A; 2EQU A; 2L8D A; 4LUE A; 1YBY A; 2O2O A; 3CQT A; 3CCR A; 1RUW A; 1YCS B; 4C0F A; 1B34 B; 3EHQ A; 5DY9 A; 2P0Q A; 2M0O A; 5LJ3 e; 3BE3 A; 3G6E Q; 2M51 A; 1WHL A; 3A5Z B; 2PVD B; 1HXD A; 4O5V A; 1M3C A; 3R6O A; 1K8A R; 4DA4 A; 3I56 T; 1TTH B; 1NLO C; 1YIJ Q; 5HK3 A; 1I1J A; 1NYG A; 3JB9 G; 2K79 A; 3X20 B; 2EYY A; 5IN1 A; 3SWN C; 2EJF A; 1X6G A; 1AZE A; 3PE0 A; 1QVG A; 1VQ9 Q; 2RQV A; 1XJW B; 1XNI A; 4X9C A; 5I11 A; 2GFU A; 3NGP A; 4PNO A; 4BI3 A; 4M7D D; 4C8Q C; 5AT1 B; 2W0Z A; 3CMA T; 1YJN A; 1VQL Q; 1ARK A; 2OTL A; 3M56 A; 3RDV A; 1WHG A; 2LP5 A; 3HFN A; 1S1N A; 1W4S A; 4M77 C; 3PFS A; 2KDS A; 2EVR A; 2DTO A; 4A54 A; 1M1G A; 4C92 D; 1VQ8 T; 4KUD K; 2QXF A; 2KRM A; 4C92 E; 4OMP A; 4CC2 A; 2RJD A; 4F17 A; 3OYE A; 5DLO A; 1RAC B; 2E5Q A; 1G5V A; 1NJI R; 4V2S A; 5KYX A; 3EAE A; 4ATO A; 2Z0W A; 3OYN A; 1CKA A; 1UDL A; 4KUL A; 1RI9 A; 5I2S A; 5KYX B; 5CAI A; 1T0J A; 1WXB A; 4KRT A; 4BY6 C; 1M2O A; 2V1R A; 1Y96 B; 4ZN3 A; 2RHX A; 4JJB A; 4M78 C; 3SWN A; 3OW2 P; 1UGV A; 1UE9 A; 4J6Y A; 2DVE A; 2DL5 A; 4XTY A; 1NJI U; 4E7K A; 2SEM A; 2E65 A; 2A08 A; 4C8Q A; 4C8Q F; 3SWN B; 4EMH A; 1ZA2 B; 1FX7 A; 4MDW A; 2ESW A; 4M4Z A; 2D9T A; 3C95 A; 1GBR A; 3CC7 T; 5KCH A; 4M77 F; 1QVP A; 3QWY A; 1K1Z A; 1X69 A; 3Q1J A; 2DXC A; 1YJ9 T; 4C8Q B; 2H8H A; 3QYG B; 3BDU A; 3MEV A; 2CS7 A; 3MP1 A; 4M77 B; 5LL6 S; 3OYK A; 2FL7 A; 4ANJ A; 1AWO A; 2FZG B; 1OU9 A; 4E7H A; 2M16 A; 4IUU A; 1W6X A; 1Q95 G; 2KT1 A; 2QEX A; 1I8F A; 5C6S A; 2DNU A; 3C94 A; 2YUQ A; 5D6X A; 2LQK A; 3OS2 A; 3M9Q A; 1ZUK A; 2HL5 C; 2GTJ A; 3VS0 A; 5J26 A; 2D8J A; 2RQR A; 4RKU E; 5GAN 5; 2OAW A; 2DA9 A; 4M78 F; 1VQL A; 2FRW A; 5CKH A; 5A2Q E; 3SB2 A; 4BY6 B; 2JVV A; 4JLG A; 2VYT A; 3G71 T; 1Y0M A; 1OI1 A; 1QCN A; 1YIT A; 4OP0 A; 1QVF P; 1SRL A; 4HA8 A; 3BFM A; 4PJO G; 3HTR A; 3CCR T; 4M78 B; 4RTX A; 4IUQ A; 3CD6 Q; 1QCO A; 2HDA A; 1WJQ A; 2PNI A; 1M27 C; 4JPB W; 1K76 A; 1N9R A; 2XID A; 1M1K U; 1BB9 A; 1Y57 A; 2VXE A; 2AT1 B; 2YLB A; 1EZZ B; 2JOY A; 1A0N B; 1BCO A; 4YTL A; 3OQ5 A; 3CME A; 2QA4 A; 2QG9 B; 3UPU A; 2DET A; 2ZCF B; 3UWN A; 5GAN f; 1T3S A; 1SPK A; 1B7T A; 4N4G A; 4B9W A; 1LOJ A; 2VVK A; 2CUD A; 2QAS A; 2JS2 A; 5KYU B; 5GJV B; 3PMI A; 1JBM A; 4F7U F; 4F7U A; 5KYY A; 4KGX B; 3JCM V; 3NTH A; 2RK1 A; 2RO0 A; 1YJN T; 2OTL T; 4MZM A; 2COZ A; 1WQ7 A; 2QTV A; 1VQK A; 3PNW C; 4PJN A; 4HVU A; 4XK8 E; 4HT8 A; 2CRE A; 1UJY A; 4F7U B; 5KYY B; 4NL3 A; 2PVO B; 1NBE B; 4BE1 A; 8AT1 B; 2L5Q A; 4FSS A; 1K9A A; 4LDY A; 1PG5 B; 4N4I A; 4RTU A; 1SKU B; 4J9E A; 2MK5 A; 3QJY A; 1X2Q A; 3LWI A; 2LQW A; 5GAN e; 2HCK A; 4J7I A; 2EGA A; 4C8Q D; 2E5K A; 1WJR A; 4LE9 A; 2JTM A; 3A1P A; 4D6W A; 4FM4 B; 1RAD B; 4RG2 A; 1WHH A; 8ATC B; 1U1T A; 2DZ9 A; 1JB0 E; 1TUD A; 1I5L A; 3GF5 A; 1PD1 A; 3OA6 A; 2LNV A; 5EC7 A; 3PTA A; 3VRY A; 3I56 Q; 3VS3 A; 2VB6 A; 4E2F B; 3RKW A; 4IIM A; 2F2W A; 1UGS B; 2KGT A; 3OYC A; 2JM9 A; 3I55 A; 2CZ6 B; 1NG2 A; 5CKD A; 1IZ6 A; 3G7Z A; 3QYH B; 1V29 B; 3OYG A; 1FXX A; 2CYZ B; 3BY7 A; 2EAY A; 2RI5 A; 3CC4 A; 2HBP A; 4ME7 A; 1QVG P; 3CMA Q; 2RQT A; 2DX1 A; 2KQW A; 2YXY A; 2EWN A; 1IGQ A; 3MCA B; 3PIP A; 1BU1 A; 1MNE A; 4JJN K; 2AHJ B; 4FSX A; 2ZPH B; 1ACM B; 2K2V A; 1Q81 R; 4JRQ A; 3VKI A; 4J6X A; 3MP6 A; 2FO0 A; 2LQ8 A; 2EQK A; 1TUC A; 1EFN A; 4HXJ A; 2X4Y A; 3CCV Q; 2QDL A; 3LGF A; 4GY5 A; 2WSF E; 4ORZ A; 2EYQ A; 3G4S A; 2QEX T; 4HVW A; 4E7S A; 4FT2 A; 1VYV A; 3EGU A; 4CC7 A; 2O88 A; 1O9S A; 2AZV A; 4B9X A; 4QW2 A; 4LDV A; 1C1A A; 5LJ3 g; 4AFQ C; 1GL5 A; 4D8D A; 4DBQ A; 2E6Z A; 3OSS C; 1YIT T; 2K6D A; 1Q81 U; 2BUD A; 1YCY A; 1RAH B; 5GAN j; 3EFS A; 1X6B A; 1Z9Q A; 2FRY A; 2HQH A; 5CR2 A; 2RPN A; 1J3T A; 5CQX A; 3EH1 A; 3V7S A; 1N8R C; 1BIB A; 3VS1 A; 3X26 B; 2COY A; 3CC7 Q; 3HL8 A; 1W70 A; 4Z89 A; 1W2B S; 1WXT A; 4TVR A; 3CCS A; 1YJ9 Q; 3KXT A; 5D7U A; 3MO8 A; 3CME T; 2WAC A; 4QVC A; 1FMW A; 3QKJ A; 2CZ1 B; 3VRZ A; 4XTV A; 3D7S B; 2CP7 A; 2E6N A; 4XU0 A; 2O4X A; 5GMK m; 2JW4 A; 3URG A; 1VQK T; 2K4Y A; 4BI8 B; 5A0G A; 2HAX A; 4M7D G; 2JT4 A; 1WYX A; 3EFR A; 3QHS A; 2O9S A; 2O4X B; 4PLL A; 4XQ3 A; 4QVZ A; 4VUB A; 4FYY B; 3PIO A; 2J06 A; 2JN0 A; 2QYZ A; 4HCK A; 1GCQ A; 3CMA A; 3VUB A; 3FJP A; 4C92 G; 2L2P A; 3AT1 B; 2F5K A; 3G71 Q; 1AT1 B; 1Y07 A; 3DLM A; 2FPE A; 2RF0 A; 2F2X A; 1VQ8 A; 3CCR Q; 3ZL7 C; 4FL6 A; 3DB4 A; 5GAO n; 2KMT A; 2HEQ A; 2WSE E; 1LNX A; 1VQN A; 4M7A C; 1NPP A; 2O01 E; 3M53 A; 1RAE B; 2FPF A; 1SG5 A; 1IGU A; 2X3W D; 2DIL A; 2RI3 A; 2H3E B; 2VXF A; 4KGV B; 2CGH A; 2YDL A; 3M59 A; 1WHK A; 2KRS A; 4FIB A; 4OMF B; 1N27 A; 3I55 T; 5A0D A; 2K9G A; 2FZC B; 1E6H A; 4QVD A; 2RQW A; 3JCM W; 3JCM b; 4LN2 A; 3CC4 T; 1MMG A; 2O9V A; 3CPF A; 1YJN Q; 2OTL Q; 2HKN A; 4C0Z A; 2VWF A; 2QAZ A; 1MV3 A; 1Q86 R; 1M90 R; 2JZ2 A; 2NUT B; 3TSW A; 2XI9 A; 4M75 C; 3CCM A; 3X28 B; 3SHW A; 4JRI A; 4FU6 A; 1G83 A; 1X75 C; 4DOW A; 3CC7 A; 4IUT A; 1V76 A; 4DEY A; 4WTO B; 4GLK A; 4HCZ A; 2V1Q A; 1HSQ A; 2Y4Y A; 3G4S T; 1D1A A; 5I21 A; 2DTH A; 3OBY A; 1WZO A; 1MMA A; 2X9H A; 5GAM e; 2KXD A; 2PUK B; 4JJD A; 5M9O A; 2ZPI B; 4M7A A; 4M7A F; 5LJ3 f; 1NJI C; 1UTI A; 2CDT A; 3J81 E; 1Q86 U; 2EFI A; 3HKS A; 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