The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
ATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| source organism |
Escherichia coli
|
| publication title |
Crystal Structure of a Type II Dihydrofolate Reductase Catalytic Ternary Complex
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
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| total genus |
11
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2007-10-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2P4T A; 2VV5 A; 2OAU A; 3UDC A; 2RK2 A; 1VIE A; 3T9N A; 3SFM A; 2RH2 A; 1VIF A; 2RK1 A; 2GQV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1X69 A; 2RHZ A; 2DYI A; 1FYN A; 2O2O A; 2KK4 A; 2QI2 A; 3L2V A; 1ZA2 B; 3QDR B; 2QEX Q; 3I55 A; 1AHJ B; 2EJG A; 1VQL Q; 1TTH B; 3JCM d; 1VQP A; 1X01 A; 1OU8 A; 1VQO A; 3ULR B; 2HSP A; 1B34 A; 3TCJ A; 1VA7 A; 4AT1 B; 2A7Y A; 3F70 A; 4IIO A; 1AWO A; 5GAN 2; 5A0G A; 1AD5 A; 2NUP A; 3FEO A; 2RHI A; 1M3B A; 2DTI A; 3UA7 A; 1UGV A; 1M3A A; 2ZZD A; 1AVZ C; 2MCN A; 2V8I A; 1M1G A; 3JCM Q; 5CKH A; 3BFM A; 2OTL T; 2MAM A; 1V1C A; 3CEY A; 2X4W A; 1SSF A; 2LJ0 A; 3J80 E; 4X9C A; 1YN8 A; 2L2P A; 3E19 A; 3HFO A; 2FPF A; 4BB7 A; 2C0O A; 5GAN h; 2OTL A; 4EMK B; 2ZPG B; 1TSF A; 1WHK A; 3OYD A; 5C0M A; 2A28 A; 5CKE A; 1TOV A; 1UG1 A; 5GAN d; 1TXQ A; 3M0Q A; 1IXD A; 1Q7Y R; 3I55 Q; 1VQP Q; 1MMA A; 3G71 A; 4C8Q G; 1UHF A; 1VQO Q; 2IG0 A; 3IQL A; 2XMF A; 4R56 A; 4AFZ C; 1VQ6 T; 3REB B; 2JT4 A; 2K5L A; 3UA6 A; 1ABO A; 1PM3 A; 1M9S A; 4FYX B; 4OB0 B; 3QUI A; 3TQ7 P; 2J6K A; 1EFN A; 2E1H A; 5GAM h; 2CP0 A; 1D09 B; 3OSV A; 2LT4 A; 3MHX A; 1YCY A; 5AT1 B; 1VQ7 T; 1JO8 A; 1Q86 R; 4IUQ A; 3LWH A; 4FU6 A; 3VU3 C; 2YWW A; 5AYF A; 2KSS A; 2DET A; 4BI3 A; 4E6R A; 1Q82 U; 5GAM d; 3QHS A; 2OTL Q; 2NUP B; 2P84 A; 4OMO A; 6AT1 B; 1SRL A; 3KFV A; 2FB7 A; 4QQG A; 4BAC A; 4PJO E; 3V7C A; 3V8K A; 1VQ7 A; 3HSB A; 2XID A; 3BDL A; 5FRO A; 4PJM A; 5GAN f; 3CPW S; 2LX7 A; 2KYM A; 3VRZ A; 1YHQ T; 3HRU A; 1Q81 U; 3BE3 A; 3EGU A; 4DBQ A; 2V1R A; 3CCR T; 5I22 A; 1JRI A; 3G71 Q; 1QKW A; 4OMN A; 3JCM J; 1T0J A; 1M4Z A; 2MI6 A; 4RTV A; 2E5Q A; 1NYG A; 3ME9 A; 5A2Q E; 1YHQ A; 1CKA A; 5I2S A; 3Q1J A; 1H64 1; 1KJW A; 5IXB A; 2GCX A; 1D3B B; 2M02 A; 2LX9 A; 2XKO C; 2X3X D; 5EG2 A; 4C0D B; 2D8J A; 2ZPB B; 1MUZ A; 2K2V A; 3QZ5 B; 4QT7 A; 3EH1 A; 3GP8 A; 2AHJ B; 4R0K A; 2DTO A; 1AT1 B; 2DJQ A; 5LL6 S; 4BY6 B; 1Y71 A; 4RCC A; 2ABL A; 2EQU A; 4XK8 E; 3AT1 B; 4E2F B; 3S3M A; 2RI2 A; 5CQY A; 1WXU A; 2AZV A; 3OYL A; 1VQ9 T; 2BZ8 A; 1K9A A; 1SF9 A; 1VQ4 T; 4JLI A; 2QQR A; 2XDD A; 2DFU A; 3VKI A; 3M53 A; 1VQ7 Q; 3MEA A; 1BI3 A; 3L2Z A; 3P8D A; 3KXT A; 1NM7 A; 1W4S A; 1X27 A; 1G2B A; 2DL3 A; 1VQ9 A; 3PNW C; 2YUP A; 5KE3 A; 3JB9 F; 4C92 E; 1R0C B; 1M90 R; 2L8D A; 3I9Q A; 1VQ4 A; 4F16 A; 4M75 C; 3ZFJ A; 2EPD A; 2KNB B; 3EG3 A; 4M75 F; 3QG1 A; 4M75 D; 4E7I A; 4YTL A; 3GIB A; 4M7D G; 3UAT A; 2RI5 A; 3RKW A; 1YHQ Q; 1RAF B; 2H3J A; 1VQ5 A; 1YIJ T; 5I11 A; 3N5B B; 5KYY B; 1GCQ A; 1WYX A; 2BZY A; 2DER A; 4N4I A; 1WHH A; 2QDY B; 3E9G A; 5FWB A; 3SEM A; 4M77 E; 3AHU A; 2CP7 A; 5GMK j; 1YJN T; 1YIJ A; 2Y90 A; 2BE7 D; 2AK5 A; 4F7U E; 2CZ6 B; 1WNL A; 1QVP A; 3HP9 A; 2XU8 A; 3BW1 A; 4KBM B; 2HZY A; 5DM7 R; 1K4U S; 3L2W A; 1RUW A; 1QKX A; 2DF6 A; 3VS5 A; 2CP3 A; 4AG2 C; 1KHC A; 2M1H A; 4B6M A; 2DIG A; 2V1Q A; 4ZN3 A; 4XTW A; 1VQ9 Q; 2LCL A; 2KGT A; 2R5M A; 4DBR A; 1PSE A; 1VQ4 Q; 3CCM A; 1WHG A; 4XU2 A; 2RB6 A; 2GQI A; 4QKU A; 3KBG A; 2YLC A; 4JUV A; 4XU0 A; 1JJ2 A; 1Y07 A; 3LX7 A; 1HXD A; 4M78 A; 3WXM B; 3I35 A; 1Z9Q A; 1BCM A; 1VQ5 Q; 1R77 A; 4FYV B; 1IGQ A; 2FRW A; 4JRK A; 5FLX E; 2O88 A; 1MND A; 2CZ7 B; 4J9H A; 3A98 A; 4C8Q C; 4ZN1 A; 2F1L A; 1UEB A; 2HSE B; 2VGN A; 4JPB W; 1YIJ Q; 3MP1 A; 3GOX A; 4C8Q F; 3L2R A; 2OJ2 A; 1BI2 A; 1NPR A; 4JLG A; 3GNF B; 4BI4 A; 3VRY A; 3TU4 K; 1I81 A; 1Q86 C; 3S3O A; 2DXC A; 2VKN A; 1R0B G; 2RJF A; 4MDX A; 4JS4 A; 2HMA A; 5GAN g; 4M7A G; 2XDB A; 2ZGW A; 4EPC A; 2XIC A; 2OTJ T; 2F69 A; 3X25 B; 4J5Y A; 2Z0W A; 3CCM Q; 1RAB B; 5FU7 C; 1M1K R; 5IHI A; 4OMF B; 4O5V A; 3E1S A; 3MP8 A; 5IHK A; 1AZE A; 4E7Z A; 5GJW B; 4B9W A; 1T3L A; 2PU9 B; 1NPP A; 2O31 A; 3FRN A; 4AMC A; 1GBQ A; 2RD1 A; 4RTZ A; 1O9S A; 1WJS A; 2RQR A; 2YDL A; 2CRE A; 2CH4 A; 3BY7 A; 2CKK A; 2O9V A; 1BIB A; 2HBP A; 1CKB A; 5GAM g; 3LW5 E; 5KH6 A; 1HK9 A; 1U5S A; 2DBK A; 4LD9 K; 2DXU A; 4JZ3 A; 1ZX6 A; 3ER0 A; 4LDU A; 3X24 B; 2DL5 A; 3CCS T; 4E7H A; 2LQK A; 4J9G A; 4OMQ A; 3RES A; 4AFQ C; 1LOJ A; 4KUL A; 5LJ5 h; 1W2B S; 4KT0 E; 3CCL A; 3M59 A; 4GY5 A; 3DLM A; 1NEB A; 1TUC A; 2K5F A; 4EMG A; 5HK0 A; 1G3Y A; 1KIK A; 1YWO A; 3RIR A; 2RA2 A; 3CBO A; 2V26 A; 3MCA B; 4X9D A; 4C8Q A; 3L2U A; 1VUB A; 2K79 A; 4Z8A A; 4Y92 A; 3M56 A; 2VXF A; 5GAN 4; 4LDX A; 4HVW A; 1NEG A; 3P8H A; 3UF4 A; 3V8J A; 2DK3 A; 4ZGE B; 1E6G A; 4PJO B; 3SB2 A; 4PKC C; 2SEM A; 2FL7 A; 2VYT A; 4RTT A; 4II1 A; 5DY9 A; 3GLX A; 4M7D F; 1Q86 U; 1UGP B; 3HRS A; 1G3T A; 3M55 A; 1GFC A; 2L5Q A; 4LDW A; 2KXC A; 2Y4Y A; 1QP2 A; 4KGV B; 3UPU A; 1JXO A; 3FJ5 A; 5CKB A; 2RQU A; 3JCM c; 2DYB A; 3VYG A; 4J9D A; 1GFD A; 1FWZ A; 4OB2 B; 5FU6 B; 1GL5 A; 2EIF A; 3CCL Q; 5D7U A; 2QXF A; 3EFO A; 5LJ5 f; 2EYQ A; 3V7R A; 2DIQ A; 2G3R A; 4PLI A; 5GAN 6; 5CCA A; 1K9M C; 4HCC A; 3JB9 J; 2F5T X; 2VAS A; 4QVD A; 2A37 A; 3CD6 Q; 2EAY A; 1MMD A; 1C0M A; 1X6B A; 2JTE A; 3OBW A; 4CC3 A; 1UFF A; 4AFU C; 4CC2 A; 3G4S T; 1ZSZ B; 2CZ1 B; 3EGX A; 8ATC B; 4QQ6 A; 2CUB A; 3JAM E; 2DNU A; 3L42 A; 4RG8 A; 2GBQ A; 3G4S A; 1QLY A; 3PVL A; 3J7A F; 2X4Y A; 3A8H B; 2ZCF B; 4C92 B; 1JQQ A; 2NWM A; 1AZG B; 3NTH A; 1N27 A; 2RQV A; 1D1A A; 1QCN A; 1KQ1 A; 1Y7X A; 3CBM A; 2RJD A; 3TSW A; 3TRE A; 4A4E A; 5LJ3 j; 2LT1 A; 4PK4 A; 1TH7 A; 3OS0 A; 2PQW A; 1FX7 A; 4OP0 A; 4KUD K; 3JRZ A; 3CCU T; 1NLP C; 1OZ3 A; 4RTY A; 1UEC A; 2DPP B; 3VS4 A; 3FC3 A; 3HPW A; 1VIE A; 5D6X A; 1M90 U; 1OU9 A; 5CKD A; 4GLM A; 3OQ5 A; 4CC4 B; 5GAN 7; 2HQX A; 3CCE T; 4TVR A; 3O8V A; 4LDV A; 4M7D A; 1UGR B; 3ZEH A; 3CCU A; 1JJ2 P; 4M75 G; 4BDZ A; 4F7U B; 1UB4 A; 4IIM A; 5FRM A; 4KRT A; 3CC2 T; 4LUD A; 3LGF A; 2K2M A; 3FDR A; 2RHY A; 1BI1 A; 3CCE A; 3I55 T; 3EFO B; 1VQP T; 1ZA1 B; 3JCM h; 4JJD A; 1VQO T; 3QZ9 B; 3CC2 A; 2NYS A; 3G4S Q; 3VS3 A; 4JZ4 A; 1X6G A; 2QA4 T; 3QJY A; 1D0X A; 2EKH A; 2L0A A; 1WA7 A; 2BE9 B; 1IZ6 A; 2G6F X; 2HQH A; 3H8Z A; 2FYK A; 2RQT A; 2KT1 A; 3LH0 A; 1TG0 A; 2CYZ B; 5I21 A; 1OV3 A; 2QA4 A; 3VYH B; 2A08 A; 1WLP B; 1WQW A; 2CGH A; 2XHC A; 2ZPH B; 1YIT A; 4JJC A; 3OYK A; 2JUF A; 3TEE A; 1IRX A; 5CK9 A; 5CKF A; 3FIF A; 2K6D A; 2L3R A; 1AWX A; 3H9N A; 2BZX A; 1OX9 A; 3HKS A; 2M0O A; 1WHL A; 2RJE A; 3HRT A; 4VUB A; 1SRM A; 3CCU Q; 4Y28 E; 3MEV A; 1NE8 A; 1QQJ A; 2PZ1 A; 3EGD B; 2QAS A; 1ZUK A; 5CVI A; 3RR6 A; 3L1A A; 3GPL A; 3SWN B; 2WSF E; 4D6W A; 3CCE Q; 5GMK m; 1RI9 A; 3OYB A; 1U8R A; 1QVG A; 3G71 T; 3I5R A; 1P92 A; 3CC2 Q; 2C0T A; 4A4K A; 3QBY A; 1M2O A; 2M9U A; 2ZPE B; 4M78 E; 2MWO A; 3CCV A; 2X4J A; 3JCM f; 2MOX A; 2QTX A; 4IUR A; 1OUL A; 4NS5 A; 5A0D A; 4J9I A; 4CI0 C; 4ZNX A; 3OMC A; 2X35 A; 2BUD A; 2JTM A; 3QSU A; 3QWX X; 2QA4 Q; 3CCQ T; 4MDW A; 4M7A A; 3OW2 A; 3NHN A; 1NJI R; 4J9B A; 1YIT Q; 2EKO A; 2LQ8 A; 3M4G A; 4FL6 A; 4WF2 A; 4C0Z A; 5LJ5 g; 4J6X A; 2DEU A; 2A0F B; 2GQV A; 4PLL A; 2I2L A; 1U1T A; 1J3T A; 5HK3 A; 2J6O A; 4CRI A; 3CCQ A; 1WPY A; 1M1K U; 2QAZ A; 4FYY B; 1SSH A; 2LQN A; 5IT9 E; 3A8O B; 1B34 B; 4JDS A; 2LVM A; 4ELZ C; 1ARK A; 5IN1 A; 1RAG B; 1OX8 A; 2LZ6 B; 2RHU A; 1QVF P; 4CC7 A; 4RTU A; 3JCM V; 3G6E A; 1QWF A; 2JZ2 A; 1GXI E; 1LNX A; 3CCV Q; 4MMK A; 3CXC P; 1M2V A; 2MK5 A; 4HCB A; 4KH1 B; 1D0Y A; 1SKU B; 3ZL7 C; 1K1Z A; 3M0U A; 1JXM A; 3EAE A; 5GAN 8; 2DVJ A; 2EYY A; 3MP6 A; 4QQD A; 2D6F A; 4RTX A; 4EIK A; 2QK0 A; 2D8H A; 1X2Q A; 1GRI A; 4K11 A; 3JCM e; 4PJL A; 1YNZ A; 3C94 A; 4FIB A; 5KYU A; 1O75 A; 3RDV A; 3S3N A; 1T3S A; 2LRQ A; 3CCQ Q; 2GFU A; 1UGS B; 1G83 A; 3OYJ A; 2HL5 C; 4D8K A; 1G5V A; 3I56 T; 3R6N A; 1C1A A; 2KT8 A; 1E7O A; 3OA6 A; 4FT4 A; 3HTR A; 4M7A B; 5GAM f; 5DLO A; 3I56 A; 1K76 A; 3UWN A; 2EGA A; 4BI8 B; 5KCH A; 2E70 A; 3EG1 A; 3G6E Q; 4IUT A; 4C8Q E; 2FZK B; 2X9H A; 2JMC A; 3H0H A; 2LCS A; 5FRN A; 5FW9 A; 1VQ5 T; 1WXT A; 1YI2 T; 1WJR A; 4HVV A; 2E4H A; 3M57 A; 5CAI A; 5GAN e; 3PT9 A; 2ROT A; 2VXE A; 1N9S A; 3J81 E; 1SPK A; 2CP2 A; 3CC7 T; 3M9Q A; 1YI2 A; 1XTD A; 3E2U A; 3M54 A; 4FYW B; 1VQK T; 1IHV A; 1I8F A; 2J6F A; 1WXB A; 4UC4 A; 4QVC A; 3H0F A; 2WSE E; 2EW3 A; 3GBQ A; 2R58 A; 3JCM P; 2PVG B; 5EC7 A; 3PVQ A; 2JS2 A; 3R6O A; 4J9F A; 3CC7 A; 2GFA A; 1VQK A; 2CP5 A; 2KI7 A; 3SFM A; 1H92 A; 2QGF B; 3QXE B; 3DLL A; 1ZBX A; 2B8A A; 3REA B; 2DM1 A; 4PJO C; 3FJP A; 1WHJ A; 3CCM T; 3I56 Q; 5KYW A; 4ATO A; 2VWF A; 1OEB A; 1KHI A; 1FMK A; 5KYU B; 4PJO F; 4PJO D; 3DB4 A; 1K0X A; 4HA8 A; 3JV3 A; 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4BUG A; 4M77 C; 1WFW A; 2AT1 B; 1M27 C; 1YCS B; 2P0Q A; 3QO3 A; 1I1J A; 3HL8 A; 3CPW A; 1WDX A; 4M77 F; 3DB3 A; 1KC8 R; 1KQS S; 2YXY A; 4M77 D; 4A4H A; 2DRK A; 3EG2 A; 4L6V 5; 4HCK A; 4M78 B; 5KYN A; 2K3B A; 4HCZ A; 4DEX A; 3CCL T; 1UTI A; 2PUK B; 4BE2 A; 4J9C A; 1TUG B; 2RF0 A; 3OYA A; 4WCI A; 1RI0 A; 1MMN A; 5IXF A; 2COW A; 1XOV A; 2JOY A; 3MKD A; 5ECA A; 3RER A; 3CD6 T; 4WTO B; 2DTH A; 1KQ2 A; 4M75 B; 2GNC A; 1VYU A; 2EQI A; 1TU0 B; 3LH5 A; 1D0Z A; 2D1X A; 5KYX A; 1LCK A; 2DVE A; 3CD6 A; 1X75 C; 1OQK A; 5GAN 3; 5M9O A; 1NJI U; 4B9X A; 3V8L A; 2ED1 A; 2RHX A; 3M4Y A; 1TS9 A; 1UJ0 A; 2KAF A; 5DLQ E; 4J6Y A; 2LNV A; 2LNH B; 1I4K 1; 8AT1 B; 3OMG A; 4FSX A; 3M0R A; 4L59 A; 3SHW A; 3SWN C; 4M7A E; 1FMW A; 4RTW A; 4EMK C; 2RNA A; 3MEW A; 2RPN A; 2DL7 A; 4ELY C; 2VV5 A; 2BIV A; 2B86 A; 2EYW A; 2Y4X A; 3T9N A; 2EJF A; 2OAW A; 3OS2 A; 2AKK A; 2CS7 A; 3E9F A; 3VS1 A; 2YUQ A; 1EIF A; 4HT9 A; 2DD5 A; 2ENM A; 1N5Z A; 4NOY A; 2PVD B; 4MZP A; 2DIL A; 3MJX A; 5GMK i; 3CBP A; 3M0T A; 4A63 B; 4QW2 A; 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