The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
|
Chain Sequence |
ATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
|
| publication title |
Crystal Structure of a Type II Dihydrofolate Reductase Catalytic Ternary Complex
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2007-10-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RK2 A; 2RH2 A; 2OAU A; 2VV5 A; 3UDC A; 2RK1 A; 3SFM A; 3T9N A; 1VIE A; 2GQV A; 2P4T A; 1VIF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CP6 A; 4M78 B; 4Y28 E; 4PJO E; 2CZ0 B; 3JCM c; 3Q1J A; 3PVQ A; 4DOV A; 3I56 T; 1IXD A; 5GAN 6; 3MP8 A; 2K5F A; 5GMK l; 1UGS B; 2E3H A; 2A08 A; 2ATC B; 1ZSZ A; 5KYW B; 5CIU A; 2RJD A; 2YDL A; 1JQQ A; 1Q95 G; 1RI0 A; 3TSZ A; 5CQY A; 2DVJ A; 1RL2 A; 2COZ A; 1GBQ A; 5J26 A; 2J06 A; 4FYY B; 1OI1 A; 2AIR B; 3VS1 A; 2GFU A; 5L8R E; 1WYX A; 5C6S A; 4A4K A; 4FYV B; 1AEY A; 3CC7 Q; 3RIR A; 4M77 E; 4RCC A; 5IT9 E; 1NPR A; 5FW9 A; 2YUN A; 3OYE A; 1FMV A; 4M7A C; 2XD0 A; 5A0G A; 3EGX B; 3OYD A; 1UHC A; 3GIB A; 2LT4 A; 3BW1 A; 2O01 E; 3OW2 P; 1VA7 A; 2DBM A; 4M78 D; 1VQP T; 1GFD A; 4ESR A; 1VIE A; 4C92 C; 4JS5 A; 3I5S A; 2I2L A; 2OJ2 A; 3UWN A; 2FO0 A; 5FRO A; 4M75 F; 1VQ5 A; 3SFM A; 1YWP A; 1YCS B; 4R56 A; 1TUG B; 2VGM A; 2ENM A; 3MET A; 2DL3 A; 3DLL A; 5D6Y A; 3M0T A; 3G6E Q; 1WXT A; 3RBB B; 3AHU A; 2CP7 A; 4DBQ A; 2CZ7 B; 3EHR A; 2DEU A; 1VYV A; 2EKO A; 4JLI A; 2ECZ A; 1AWO A; 2EGA A; 2SEM A; 2DXC A; 8AT1 B; 3LW5 E; 1ZSZ B; 3E9G A; 4BE2 A; 1YI2 Q; 3CCE Q; 1M2V A; 2PQW A; 2FPD A; 2DL7 A; 1M90 R; 3CPF A; 2C06 A; 4XTY A; 1ZLM A; 3JV3 A; 1M3A A; 2LX7 A; 3LH0 A; 1JEG A; 3L2Z A; 1BYM A; 4E7K A; 2A28 A; 1WNL A; 4OF1 A; 2MWO A; 4PJN A; 3OYB A; 4JRI A; 1QLY A; 2QAS A; 1WHG A; 2JM8 A; 5EG2 A; 1R0B G; 3F70 A; 2P4R A; 1TG0 A; 4PLI A; 3H0I A; 5I2S A; 3SHW A; 1NJI C; 2AKK A; 4B9X A; 3PIP A; 3HTR A; 2OTL Q; 2HCK A; 1YFN A; 2CP0 A; 4ZGE B; 1QCF A; 4FIB A; 4MDW A; 2LQ8 A; 3E19 A; 4PFO A; 1VQO Q; 3REA B; 1OQK A; 1G3W A; 1PG5 B; 3CEY A; 4BE1 A; 1D1B A; 5CVI A; 1G83 A; 2E70 A; 4Y92 A; 1UJY A; 4OGC A; 1K1Z A; 1U1T A; 5LJ3 d; 2KDS A; 2DKG A; 1YIJ A; 3O5Z A; 3RMS A; 2EYX A; 2PZ1 A; 3ZFJ A; 1KD1 C; 5GAM j; 3I5R A; 5CKB A; 2I0N A; 2E4H A; 2YRD A; 5GAN 2; 4JS4 A; 4J9D A; 3CC7 T; 2AK5 A; 4PKC C; 3I55 A; 1I4K 1; 2DJZ A; 1VQ7 Q; 1VQK Q; 4LDY A; 4BI3 A; 1TU0 B; 1XTD A; 4M77 G; 2JW4 A; 1KG1 A; 1YCY A; 4Q5W A; 1YIT T; 4NL2 A; 3BDL A; 1XJW B; 2KK4 A; 4XU0 A; 4C8Q F; 1RAI B; 4J6Y A; 2CYZ B; 2E5Q A; 3JB9 I; 3TVT A; 4C0Z A; 3V7C A; 5GAN g; 3GLX A; 1OX9 A; 2PUO B; 3LYI A; 2FZG B; 2X3X D; 5FU6 C; 4IIO A; 5D6W A; 4FW2 A; 4M7D F; 4WF2 A; 3QUI A; 4IUR A; 2BE9 B; 4MZP A; 1OZ2 A; 5GAN f; 1TSF A; 4EMK A; 2RJF A; 3JB9 D; 1QP3 A; 4FL6 A; 3CD6 Q; 5J3B A; 3LGL A; 1X6B A; 4KRT A; 2RM4 A; 1NZ9 A; 2R5M A; 3GPL A; 2XDP A; 1N9S A; 1TS9 A; 1YI2 T; 2PU9 B; 1K0S A; 4E2F B; 1Q7Y U; 3M54 A; 4J5Y A; 5GAN 5; 4WCI A; 2BTT A; 3EG1 A; 1ABQ A; 3CCJ A; 3NPF A; 2QTX A; 4PL6 A; 4JRQ A; 3MEA A; 4LE9 A; 1PKT A; 2K6D A; 2RO0 A; 2HL3 A; 2MAM A; 2RNA A; 4M7D G; 2NUT A; 2YXY A; 1NLO C; 2O9S A; 1M27 C; 4IUU A; 1ZHI A; 1PCX A; 2OTL T; 5C0M A; 2K9G A; 4KH0 B; 3VYG A; 2BZ8 A; 2JTM A; 1VQO T; 4V2S A; 3FC3 A; 1YJW Q; 2XMF A; 1Q82 R; 1RLP C; 3OYY A; 2JUF A; 2JTF A; 1XQH A; 3I56 A; 1VQM Q; 1D1C A; 3M0Q A; 5KE2 A; 3PT9 A; 2DL5 A; 3CME A; 4LDU A; 3HHT B; 1X2K A; 2ZGW A; 4LN2 A; 1QCN A; 3MEV A; 4M4Z A; 2RH2 A; 1H8K A; 4KT0 E; 4RTX A; 3UF4 A; 3J81 E; 3CCM T; 1VQ7 T; 5GAN 8; 4EMK B; 1VQK T; 1D0X A; 2KI7 A; 4OMP A; 1MMA A; 2AZS A; 1VQL Q; 3L2W A; 4N0A A; 3QYH B; 4JZ3 A; 5I21 A; 4XAX B; 4M77 C; 3FB9 A; 2CUB A; 4BAC A; 1VQP A; 4FM4 B; 4OML A; 2LP5 A; 3G1J A; 1U06 A; 1M4Z A; 2F2V A; 3M4Y A; 2A37 A; 2K3Y A; 1VQ9 Q; 2AT1 B; 4BI4 A; 4GLM A; 2HBP A; 3NFC A; 4Z8A A; 1CSK A; 2D8H A; 4Z89 A; 5KYY A; 1W6X A; 1X27 A; 2NUT B; 2X3W D; 2CSQ A; 1X75 C; 5IH2 A; 2XKO C; 3HSB A; 1GCP A; 2LCC A; 1Q82 C; 3CD6 T; 2M1H A; 3CBO A; 1UDL A; 4D8D A; 2LJ1 A; 2HQE A; 1BIA A; 4K11 A; 5LJ5 j; 2LNV A; 1OYX A; 1TH7 A; 3M9Q A; 1FXX A; 3ZBD A; 2EGE A; 2DFU A; 1N8R R; 1J3T A; 4N4H A; 4KUD K; 5GAO n; 1B3Q A; 1KQS S; 2EQU A; 2RHU A; 2KT1 A; 4QVD A; 1PSF A; 2EFI A; 4JLG A; 2RN8 A; 5GMK m; 1ZA1 B; 1I8F A; 4ZTJ A; 2GCX A; 1SKU B; 5CAI A; 1WQW A; 9ATC B; 1AZG B; 4F7U F; 3CCU T; 4QT7 A; 3VU3 C; 4IUP A; 2KR3 A; 4M78 E; 4OMN A; 2OI3 A; 2KBT A; 2VKN A; 4PJL A; 4M7D C; 5CK9 A; 1WZO A; 1ZX6 A; 4RG2 A; 2DYB A; 4CRI A; 2Y90 A; 1YJW T; 1U5S A; 4HCZ A; 3TRE A; 4DBF A; 2Y4Y A; 2NYS A; 2X51 A; 1P92 A; 3OB9 A; 4M7A A; 1KQ2 A; 3M0P A; 2VWF A; 2DAQ A; 5GAM d; 2DIQ A; 3HKS A; 1RAG B; 1TXQ A; 2RPN A; 3L2U A; 3V8K A; 4C92 A; 2WSE E; 4O6J A; 2EQK A; 2JJ9 A; 4XTV A; 5KYY B; 2COW A; 1WLP B; 1SRM A; 2R57 A; 2KYB A; 4EMH A; 1VYT A; 2DL4 A; 2RK1 A; 1W4S A; 2LJ0 A; 3CC7 A; 1VIF A; 2DTI A; 1YJN T; 2LDM A; 4IUQ A; 4J6X A; 1Q86 U; 1N8R C; 2EAY A; 2RQU A; 2X4J A; 3OYF A; 1M3B A; 1PKS A; 2XDD A; 2DMO A; 5LJ3 j; 2LCL A; 1M1K U; 1MGQ A; 4XK8 E; 1YIT A; 2OAU A; 1OV3 A; 2LQK A; 2QQB A; 3GP8 A; 2YHT A; 1V1C A; 3OW2 S; 3V7S A; 1JXO A; 4R0K A; 2QA4 Q; 4P5N A; 2H8H A; 2DM1 A; 5GAN h; 1X01 A; 3OS0 A; 3TCJ A; 1HD3 A; 5IXB A; 4A4E A; 4FT2 A; 3I9Q A; 1AWX A; 1W2B P; 4D8K A; 4OMM A; 3VYH B; 3EG9 A; 3X25 B; 4ZTF A; 4M7A B; 2CRE A; 3QDR B; 2J7I A; 1MND A; 4E7J A; 4EDU A; 3NTK A; 3I35 A; 1ARK A; 4C0D C; 2M0O A; 1IGU A; 2BZY A; 2QQR A; 3OYH A; 5HY6 A; 4C92 B; 1DJ7 B; 2QQS A; 4R55 A; 1QWF A; 5A0L A; 1M1F A; 4LDX A; 1G8X A; 3TU4 K; 2RJE A; 4E7I A; 2XDB A; 4E47 A; 2X4X A; 1N9R A; 5GAN e; 1SEM A; 3KUF A; 4ORZ A; 3CCV Q; 3JCM P; 2V1R A; 1WDX A; 5FU7 B; 1ZQ1 A; 1FWZ A; 4GBQ A; 1K73 U; 2OTL A; 2V8I A; 4OMQ A; 1VQO A; 2E65 A; 4X34 A; 2FPF A; 4TVR A; 1PC0 A; 1HK9 A; 2VXF A; 3CCR Q; 3J80 E; 3L2Q A; 2SRC A; 1UGP B; 5KYX A; 2JS0 A; 4FYX B; 2KY9 A; 2XG8 D; 3QXE B; 3CCS Q; 1UGQ B; 5CQX A; 1SSF A; 3V8J A; 4AFS C; 3EGU A; 1S1N A; 2E3I A; 2GNC A; 1TWB A; 2DL8 A; 1UEC A; 4N4G A; 1U1S A; 1WI7 A; 1K8A U; 2G3R A; 1AZE A; 3CMA Q; 1D0Z A; 2CT3 A; 3U23 A; 3CCM A; 1VQ7 A; 3EG9 B; 2RHX A; 2ED1 A; 1EIF A; 1X6G A; 1Z9Q A; 4CC2 A; 1SRL A; 4JJD A; 1R0C B; 2M9U A; 3CC4 Q; 4LD6 A; 1YHQ T; 3QWY A; 3OBW A; 2CKK A; 3QJ6 A; 3CCL T; 3QZ9 B; 4A4G A; 1XOV A; 4J9F A; 2JT4 A; 3THK A; 4FW1 A; 1NJI R; 2DBK A; 1NYG A; 1M8V A; 5LJ5 d; 4FSS A; 2JN0 A; 4OP0 A; 4XTX A; 2O88 A; 3HL8 A; 2BUD A; 1VQ8 T; 4M75 A; 3RKW A; 1H3H A; 2KNB B; 2DXT A; 1VQ6 Q; 4OVA A; 3CQT A; 4VUB A; 3G4S Q; 1WFW A; 2DRK A; 3M59 A; 3S3M A; 1QWE A; 4CI0 C; 3M57 A; 4FU6 A; 8ATC B; 3OS2 A; 4HCB A; 1QQJ A; 2JTE A; 2AKL A; 5GAO l; 2XU8 A; 2ZPE B; 3QHS A; 4PFP A; 1KD1 R; 4J8O A; 3FEO A; 2HSP A; 2YT6 A; 3H41 A; 1B07 A; 5KYX B; 4A53 A; 3H0F A; 4ZN1 A; 4PJO F; 2FZK B; 2RK2 A; 3A8L B; 4XTZ A; 1W70 A; 3FJ5 A; 3S3N A; 3RER A; 3PIO A; 3TQ7 P; 2P0Q A; 1ZA2 B; 2HMA A; 3CCV T; 2K2M A; 3M58 A; 1NM7 A; 3CC2 Q; 1SHF A; 6AT1 B; 2QEX Q; 3CCU A; 2OTJ Q; 1SSH A; 1S72 T; 2LQN A; 1KK7 A; 4IUV A; 1BU1 A; 2HKN A; 1QVF P; 5HK0 A; 3GNF B; 3CBM A; 1Q86 R; 2VGN A; 1YJW A; 1OPL A; 4M78 C; 4ZN3 A; 3CCR T; 5GAO p; 1M1K R; 4M77 F; 4RTW A; 1YP5 A; 4L59 A; 1FMK A; 5ECA A; 2D0Q B; 2X4Y A; 3EH2 A; 4PJO G; 2DJQ A; 2BIV A; 5D7U A; 3QDF A; 2E12 A; 1HYO A; 3PTA A; 4FCY A; 1UHF A; 3M4G A; 4O5V A; 2OX7 A; 2V26 A; 3UAT A; 5GMK j; 4PLL A; 4M75 B; 3JB9 G; 1K9M U; 1K4U S; 4RTZ A; 5HK3 A; 1BI1 A; 1WIE A; 2LRQ A; 1X2Q A; 4PFZ A; 3KFV A; 3OSS C; 2LNH B; 3UA6 A; 1I0C A; 1NLP C; 5AYF A; 5CKE A; 1YJN A; 3CC4 T; 3DKM A; 3VUB A; 4EIK A; 4DOW A; 3A1P A; 3H9N A; 5GMK i; 2ZPI B; 5CO7 A; 2F2W A; 4OB0 B; 1MNE A; 3G71 Q; 5GAM g; 5L23 A; 4DBH A; 3MHX A; 4ZNX A; 4C8Q A; 4Z02 A; 4KGZ B; 1I5L A; 2COY A; 1I5O B; 2DZC A; 1D0Y A; 1M2V B; 2D0N A; 2L3R A; 4RKU E; 5KE3 A; 4MDX A; 3R6N A; 5GAM f; 3G4S T; 3EFO A; 1OX8 A; 1Q86 C; 4KH1 B; 2EYW A; 3LGF A; 3C95 A; 1RAA B; 1UEB A; 3BE3 A; 4M75 D; 2WSC E; 4M7D A; 3OYJ A; 2DD4 A; 3RUX A; 1WXU A; 2EBP A; 3JCM V; 3GNG A; 1M1K C; 1ZUY A; 4HA8 A; 1BBZ A; 5EC7 A; 3G6E T; 1VUB A; 4PJJ A; 5GAO q; 2FPE A; 3ER0 A; 1BB9 A; 2H3J A; 1U3O A; 1LJO A; 3PFS A; 1QP2 A; 1ZSZ C; 1R77 A; 3CCQ Q; 1MMD A; 1Y7X A; 1WJQ A; 2DYI A; 3CCE T; 4JRP A; 2RA2 A; 1VQ5 Q; 4J9G A; 1OUL A; 3CC2 T; 1T3L A; 2OTJ T; 3JCM d; 3GF5 A; 2KYM A; 2F1L A; 2DLP A; 2EJF A; 5LJ3 e; 4XTU A; 1QVP A; 3PNW C; 2KGT A; 3SWN A; 2LTO A; 4KUL A; 4NL3 A; 3X20 B; 1UE9 A; 4XU1 A; 1FYN A; 4NS5 A; 4DEY A; 1WGS A; 3MCA B; 4F04 B; 2E10 A; 2BKD N; 2M16 A; 2CP3 A; 2QXF A; 2MK5 A; 4OGE A; 3WVD B; 3X24 B; 1YNZ A; 2MMP A; 4C8Q B; 2KMT A; 2L3Q A; 1VQN T; 1W2B A; 2BE7 D; 1AVZ C; 2E1H A; 4JJC A; 4PJO C; 1JXM A; 3OYI A; 3JB9 J; 5GAN 7; 1KC8 U; 2NUP A; 3EFO B; 2NWM A; 2HDA A; 1WHL A; 4M7D B; 3EAE A; 4HVW A; 1MMG A; 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2RMO A; 1IRE B; 3LX7 A; 2VUB A; 3VUZ A; 3JCM b; 2CZ1 B; 3E1S A; 1VQM T; 3CCJ Q; 4E7L A; 1KFZ A; 3M5A A; 3OYN A; 4OMO A; 2DK3 A; 2EYQ A; 1OOT A; 1SHG A; 4OB1 B; 3RKX A; 4EMK C; 1RAD B; 1WHJ A; 2VYT A; 3R6O A; 3VS5 A; 2GFA A; 2L5Q A; 1AWJ A; 1G3S A; 2MIO A; 3D7S B; 3CC4 A; 2QQA A; 2RI5 A; 1C1A A; 3M0R A; 1RUW A; 1YJ9 T; 1VQL T; 1IRX A; 2RB6 A; 2DPP B; 2ZPB B; 4ATO A; 3L2V A; 1AOJ A; 2YUP A; 1LOJ A; 3PMT A; 5GAO m; 3I56 Q; 4IKF A; 1WXB A; 4QVZ A; 1Y0M A; 5DLQ E; 3RES A; 1M90 U; 1K9M C; 3HRS A; 3OA6 A; 1QVF A; 2GGR A; 1SF9 A; 1WA7 A; 3G7Z A; 2HQH A; 3CME Q; 3M53 A; 1Q7Y R; 3O8V A; 1VQ9 T; 2DNU A; 2WAC A; 2X35 A; 2HL5 C; 3G4S A; 3JCM W; 1LNX A; 4F7U B; 3GOX A; 2YRV A; 5LJ3 g; 1CKA A; 1SPK A; 2ZCF B; 3H8Z A; 3QBY A; 2D8J A; 2E64 A; 2KEA A; 2ROT A; 4UC4 A; 1M9S A; 2O4X A; 4M78 F; 2GF7 A; 3G6E A; 1UG1 A; 2QDY B; 5LJ3 f; 2XI9 A; 3EG0 A; 1W1F A; 2AHJ B; 3RDV A; 3ME9 A; 5I2M A; 2DA9 A; 4JUV A; 3CXC P; 2YRC A; 3V7R A; 5GAM e; 2J6F A; 1YI2 A; 3CCE A; 3C0C A; 3OQ5 A; 4CC3 A; 1SG5 A; 4OMF B; 1OZ3 A; 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