The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MSGARCRTLYPFSGERHGQGLRFAAGELITLLQVPDGGWWEGEKEDGLRGWFPASYVQLL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution NMR structure of SH3 domain of growth arrest-specific protein 7 (GAS7) (fragment 1-60) from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) Target HR8574A
rcsb |
| molecule keywords |
Growth arrest-specific protein 7
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
6
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-08-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UF4 A; 4JZ4 A; 4Z88 A; 2A28 A; 2VWF A; 2DBK A; 4OMO A; 1AWO A; 4F17 A; 2OAW A; 1XOV A; 2FG0 A; 1GCQ A; 2K79 A; 2YDL A; 3IQL A; 1PNJ A; 2EBP A; 1EFN A; 2EGA A; 2OI3 A; 2GNC A; 2SEM A; 4ESR A; 2DMO A; 2RQW A; 3R6N A; 2HCK A; 1QLY A; 2QDL A; 2AK5 A; 2KNB B; 2DL7 A; 2KYB A; 4AFZ C; 1T0J A; 4JPB W; 4AFS C; 5L23 A; 1Z9Q A; 1QKW A; 1SSH A; 2HSP A; 2M0Y A; 3EGU A; 4JJB A; 2RF0 A; 1M27 C; 4LN2 A; 2LP5 A; 1SHG A; 3VS7 A; 2LCS A; 2EYX A; 3PE0 A; 1BBZ A; 2JM8 A; 1I0C A; 2CT3 A; 1AZE A; 4IIO A; 2B86 A; 2JTE A; 2GTO A; 3CQT A; 2GGR A; 1ZSG A; 2CH4 A; 4RTW A; 1KFZ A; 2RMO A; 1WA7 A; 4LUE A; 5IXF A; 1JO8 A; 1I1J A; 1ZX6 A; 4LUD A; 1ABQ A; 1NLP C; 2DIL A; 1QKX A; 2C0I A; 3EG0 A; 4D8D A; 2KYM A; 1ZUK A; 2HBW A; 3VRZ A; 1ZUU A; 1X43 A; 3VRY A; 2EYW A; 3UA7 A; 4Z8A A; 4CC3 A; 1K0S A; 2A37 A; 5GJV B; 5HCK A; 4J9B A; 3NMZ C; 2F2X A; 2DJQ A; 2LMJ A; 2L3S A; 2X3X D; 4DEX A; 2CSI A; 2DF6 A; 1FYN A; 1ARK A; 1Z9Z A; 2D0N A; 2RNA A; 2I0N A; 2MIO A; 1NEG A; 4HXJ A; 5IHI A; 1TUD A; 1ABO A; 2V1Q A; 4AFQ C; 2JS2 A; 1MV3 A; 1NG2 A; 1RLQ C; 3TVT A; 2K3B A; 2AZV A; 1J3T A; 1H3H A; 2JT4 A; 1AWX A; 1M3C A; 2V1R A; 1ZLM A; 2KRN A; 3U23 A; 2O2O A; 2C0O A; 1MUZ A; 2YUO A; 2CDT A; 2YT6 A; 2E5K A; 1RLP C; 2DNU A; 4J9G A; 1UE9 A; 2DVJ A; 1UEC A; 2DL5 A; 1NYF A; 1GRI A; 1UTI A; 2AKK A; 1KIK A; 1E6G A; 2LJ3 A; 1T0H A; 4GBQ A; 1CSK A; 4CC7 A; 3NHN A; 1K76 A; 2CRE A; 1U06 A; 2KBT A; 1FMK A; 2ABL A; 2FPE A; 2L2P A; 2CT4 A; 1CKA A; 4CC2 A; 1GCQ C; 2PNI A; 2O31 A; 4AG1 C; 2BZX A; 2W0Z A; 3PVQ A; 3M0P A; 4HVV A; 3VS0 A; 4OML A; 1BK2 A; 1K0X A; 2KRO A; 1PRL C; 1SHF A; 4QT7 A; 1YN8 A; 1UGV A; 2F2W A; 4OMM A; 2EGC A; 2DL8 A; 1AWW A; 4K11 A; 2CUD A; 2KRM A; 3M0S A; 2EYY A; 1A0N B; 5IXB A; 2LJ1 A; 1RI9 A; 1GFD A; 2RQV A; 2D1X A; 4F14 A; 2C0T A; 1UG1 A; 2KXD A; 3VS1 A; 2IIM A; 2J7I A; 4J9E A; 4EIK A; 1G83 A; 2A36 A; 1N5Z A; 1TG0 A; 1VA7 A; 2EGE A; 4X1V A; 5EC7 A; 1PHT A; 2ED1 A; 1WLP B; 3M0U A; 4RTU A; 2NWM A; 1ZUY A; 4R0K A; 1AVZ C; 2HEQ A; 4OMP A; 4HVU A; 4HCK A; 2JM9 A; 2KT1 A; 2RQT A; 3H41 A; 3O5Z A; 2LX7 A; 2YUQ A; 1QWF A; 2DBM A; 2DE0 X; 4DEY A; 3JV3 A; 2OJ2 A; 2RQU A; 1WX6 A; 2J6K A; 4E6R A; 1YCS B; 1OPL A; 2JS0 A; 1OEB A; 1RUW A; 1AZG B; 2CSQ A; 2K9G A; 2M51 A; 2O9S A; 1PKS A; 1GCP A; 1M3A A; 2K6D A; 5IHN A; 1KSW A; 1YWO A; 4FSS A; 1E6H A; 3KFV A; 2JW4 A; 1YNZ A; 3THK A; 2ED0 A; 1UDL A; 2KR3 A; 1GFC A; 1M30 A; 2DM1 A; 2RN8 A; 3PVL A; 4RTZ A; 2W10 A; 2ROT A; 2MCN A; 3I35 A; 1M8M A; 3EG1 A; 1OV3 A; 3RBB B; 2DYB A; 1M3B A; 2PZ1 A; 3RNJ A; 1G2B A; 4HVW A; 1UFF A; 1VYT A; 1LCK A; 1OPK A; 2EPD A; 2DX1 A; 3UAT A; 3SEM A; 2FRY A; 2LQN A; 3EHR A; 1YWP A; 3EG3 A; 5I11 A; 3FJ5 A; 2JXB A; 1K4U S; 2H8H A; 1T3S A; 3REB B; 2DRM A; 4JZ3 A; 1JXO A; 2ROL A; 2JMA A; 2LJ0 A; 4JJD A; 1VYV A; 1X27 A; 2DLP A; 1GL5 A; 4OMN A; 5FWB A; 2A08 A; 4A63 B; 2O88 A; 1OOT A; 4J9F A; 3TSW A; 4J9C A; 1E7O A; 2FRW A; 2HDA A; 3REA B; 3UA6 A; 2DL4 A; 5FWC A; 1BB9 A; 1WXU A; 1AOJ A; 2FO0 A; 2J06 A; 4GLM A; 4M4Z A; 1K9A A; 2KT8 A; 3QWX X; 1WDX A; 3VS6 A; 1K1Z A; 2P4R A; 3M0T A; 3VS3 A; 2LQW A; 1WIE A; 2DA9 A; 1X2Q A; 1WI7 A; 3I5R A; 1UJ0 A; 2BZY A; 2EYZ A; 3TSZ A; 2YSQ A; 1H92 A; 2J6O A; 1BU1 A; 2AZS A; 1JXM A; 4LE9 A; 2ECZ A; 4D8K A; 1TUC A; 3M0Q A; 2J6F A; 3GBQ A; 2X3W D; 1HJD A; 1V1C A; 2FPF A; 2GTJ A; 3NGP A; 2FEI A; 4RTT A; 1KJW A; 1U3O A; 1Y57 A; 2F2V A; 3H0F A; 3VS4 A; 4Y92 A; 1GBR A; 5IHK A; 3VS2 A; 2J05 A; 2DRK A; 4AFU C; 2RQR A; 1UHF A; 5IH2 A; 4ORZ A; 1JU5 C; 1NM7 A; 2EW3 A; 4J9I A; 4OMQ A; 2D8J A; 4J9D A; 3LH5 A; 2AKL A; 2YUP A; 1B3Q A; 1JQQ A; 2KXC A; 2LZ6 B; 2K7A A; 3C0C A; 1HSQ A; 2GQI A; 2G6F X; 4IIM A; 2EQI A; 3ULR B; 2ESW A; 4AG2 C; 1NLO C; 1S1N A; 1CKB A; 1AD5 A; 2CH4 W; 2LNH B; 1X2K A; 1I07 A; 3I9Q A; 1HD3 A; 3ZL7 C; 2EVR A; 1H8K A; 4RTY A; 4LNP A; 1SRM A; 2DL3 A; 3SHW A; 2YUN A; 3A98 A; 3VS5 A; 4ZNX A; 1UJY A; 2D8H A; 4JJC A; 1IO6 A; 2SRC A; 3NPF A; 2KE9 A; 1U5S A; 1JEG A; 2L0A A; 2RPN A; 3H0I A; 5ECA A; 1WXT A; 2K2M A; 4RTV A; 3EG2 A; 2XMF A; 2JMC A; 1X6B A; 5FW9 A; 1UHC A; 1QCF A; 1SEM A; 1MV0 B; 1PRM C; 1W1F A; 2KGT A; 2MOX A; 3H0H A; 1WXB A; 4WCI A; 1PKT A; 1Y0M A; 2KRS A; 1AEY A; 2L3P A; 2FPD A; 2NUZ A; 2EKH A; 1W70 A; 1SPK A; 5I22 A; 4Z89 A; 2ENM A; 4KRT A; 1B07 A; 1YP5 A; 1PWT A; 4RUG A; 1W6X A; 1WFW A; 2BTT A; 2GBQ A; 1QWE A; 4F16 A; 3EHQ A; 4RTX A; 3I5S A; 2BZ8 A; 2PTK A; 1VYU A; 1X69 A; 2VKN A; 2CUB A; 1WYX A; 1AWJ A; 1X6G A; 1GBQ A; 1NYG A; 1UUE A; 3M0R A; 3QWY A; 2L3Q A; 2O9V A; 5GJW B; 1ZBJ A; 4J9H A; 1NEB A; 1T3L A; 2KEA A; 1SRL A; 4CC4 B; 2VVK A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2M1H A; 3SB2 A; 2BUD A; 4ZTJ A; 2KSS A; 4Z88 A; 3HFO A; 3GPL A; 1U1S A; 1PC0 A; 4PJO E; 4KGV B; 4Y91 A; 2K79 A; 3OS5 A; 1EFN A; 2OI3 A; 2LT4 A; 2SEM A; 4PJL A; 1YIT Q; 1M2V B; 2YRD A; 4M75 E; 2HCK A; 4YTL A; 1QLY A; 2QDL A; 5FU6 B; 3CCU T; 4LDV A; 2AK5 A; 2X4Y A; 4AFS C; 4M75 A; 4EMH A; 2QI2 A; 1Z9Q A; 2V8K A; 3TU4 K; 3EGU A; 4C92 G; 3OSS C; 1QVF S; 4ZGJ B; 1FXX A; 4LN2 A; 1SHG A; 3A8G B; 3VS7 A; 5DM7 R; 2LCS A; 3PE0 A; 1BBZ A; 2FZG B; 1I5O B; 1I0C A; 1YBY A; 2B86 A; 5GMK l; 1Y7X A; 4FL6 A; 3ZFJ A; 2JTE A; 3C94 A; 3CQT A; 1W4S A; 4RTW A; 1KFZ A; 1WHJ A; 1WA7 A; 5IXF A; 1JO8 A; 1QVG A; 2DIL A; 3UWN A; 1QKX A; 2NUP A; 3JCM e; 4C0F A; 5CR2 A; 3CC7 Q; 2QA4 A; 3Q1J A; 1LVK A; 3OW2 A; 5KYX A; 1K0S A; 1O75 A; 2HQX A; 3X20 B; 4E7L A; 2FYK A; 2RHI A; 2DIG A; 5GMK i; 2DJQ A; 2LMJ A; 2QQ9 A; 2L3S A; 3GNF B; 1UGP B; 3OYK A; 4FCY A; 2X3X D; 4J6X A; 3LW5 E; 3SDZ A; 1VQ4 Q; 4DEX A; 2DF6 A; 1ARK A; 3KXT A; 2RNA A; 1NEG A; 2K3Y A; 2PQW A; 1MMA A; 2VC8 A; 5IHI A; 2JS2 A; 1PSE A; 1YJ9 A; 1RLQ C; 4C5I A; 2K3B A; 1J3T A; 1AWX A; 1M3C A; 2RA2 A; 3MEW A; 1D0X A; 2DD4 A; 4Y28 E; 5GAN 6; 2O2O A; 4E7K A; 4BAC A; 2XD0 A; 2YUO A; 2CDT A; 4XTY A; 2YT6 A; 1UE9 A; 4KUL A; 2KAF A; 1M8V A; 4M77 D; 2JJ9 A; 2R5A A; 1CSK A; 4JDS A; 1K76 A; 1JRI A; 5C6S A; 4II1 A; 2HL5 C; 2K5I A; 3R6O A; 1U06 A; 3CCL T; 2DPP B; 5FLX E; 2B8A A; 2L2P A; 3CC2 A; 1CKA A; 2ZPE B; 2PNI A; 4JJN K; 2BZX A; 2GFU A; 5I2S A; 5D7U A; 4UC4 A; 1VQ6 T; 1UGS B; 4IUP A; 1PRL C; 1X6O A; 2MYS A; 2P84 A; 4QT7 A; 1WJR A; 2F2W A; 3JSC A; 4B9X A; 2DL8 A; 2NUT B; 2COY A; 3OYC A; 2V8J A; 2HQE A; 3M0S A; 1QQJ A; 1BI3 A; 2M16 A; 5IXB A; 2MMP A; 1RI9 A; 4PK4 A; 3P8H A; 3G4S T; 2Z0W A; 4M77 C; 2IIM A; 4A53 A; 3I56 T; 1VQL T; 3CD6 T; 4M77 A; 2CP2 A; 4FYX B; 4EIK A; 3V7C A; 1TWB A; 1PD1 A; 2X4X A; 2VGN A; 4ANJ A; 3M56 A; 3M0U A; 2VB6 A; 4BY6 B; 3CCR Q; 1ZUY A; 1Q7Y U; 1UGQ B; 1X01 A; 4OMP A; 4HVU A; 3JCM b; 1KQ2 A; 3M4Y A; 3V7S A; 2KT1 A; 4LDU A; 2LX7 A; 1XTD A; 2EFI A; 4DEY A; 1G5V A; 5I2M A; 4C92 C; 2E12 A; 1VQK T; 4C92 A; 4KUI A; 2OJ2 A; 2E65 A; 2XI9 A; 3JB9 F; 2EQK A; 2M0O A; 5A0L A; 3CCU A; 2NLU A; 2JS0 A; 1OEB A; 4B6M A; 2RHY A; 3EAE A; 1AZG B; 2FL7 A; 2QXF A; 1M3A A; 1K9M R; 1KSW A; 4JUV A; 1ZA2 B; 5CK9 A; 2JW4 A; 1ACM B; 3QPH A; 2OTL Q; 4OB3 B; 4E7Z A; 3EG9 A; 1KQS S; 1M30 A; 2ZAE A; 2ROT A; 1NBE B; 3EG1 A; 2JTM A; 2DYB A; 2WSF E; 3JCM c; 2AIR B; 2ZGW A; 3CPW A; 2LQ8 A; 1YJ9 Q; 1LCK A; 1JJ2 S; 2DX1 A; 4J6Y A; 2DD5 A; 2FRY A; 1YWP A; 3QYH B; 4J83 A; 5CCA A; 2F5K A; 3OYB A; 1T3S A; 3REB B; 2DRM A; 2P4T A; 1KQ1 A; 4R56 A; 2MF2 A; 2E41 A; 4BDY A; 4JJD A; 3FC3 A; 1NE8 A; 3LH0 A; 3MET A; 1BYM A; 1W2B S; 3A8H B; 5GAN 8; 4LD6 A; 2ZCF B; 3G71 Q; 5GAO l; 1U1T A; 3REA B; 1BB9 A; 3HRS A; 2WSE E; 2J06 A; 1VIF A; 2NYS A; 4FT4 A; 4M4Z A; 1K9A A; 3CCQ T; 4B9W A; 2GQV A; 4IUV A; 4JRQ A; 2P4R A; 3VS3 A; 4EPC A; 4M7D B; 3CXC P; 3SWN B; 3RMQ A; 3M53 A; 2E10 A; 5CQY A; 2YSQ A; 3JB9 D; 3HKS A; 3RER A; 2ECZ A; 3GBQ A; 5AYF A; 4PNO A; 1N8R R; 1K9M U; 1OU8 A; 2FEI A; 5LJ5 d; 2FZC B; 4CI0 C; 1VQ4 T; 3QG1 A; 1NJI C; 1U3O A; 4FM4 B; 2ZPG B; 5FRN A; 4AFU C; 3MP6 A; 3CCL A; 2QAZ A; 1NM7 A; 2XIC A; 2A7Y A; 4J8O A; 3L2V A; 2IPO B; 4IKF A; 2AKL A; 2YUP A; 5KYY A; 1B3Q A; 4X34 A; 2LNV A; 4A4F A; 3G7Z A; 1VQ6 A; 5KCO A; 1UEB A; 2K7A A; 4KT0 E; 1BIA A; 4C8Q G; 4HT9 A; 3EFO B; 4AG2 C; 1CKB A; 4XU3 A; 4OMF B; 1YI2 Q; 1I07 A; 2HKQ B; 3L1A A; 3I55 Q; 4EMG A; 3G4S A; 3CCU Q; 1HD3 A; 4IUQ A; 4L5G A; 2EVR A; 3I56 A; 1VQL A; 3CD6 A; 1GXI E; 4LNP A; 2A3L A; 5LJ3 d; 3A98 A; 1UJY A; 1IO6 A; 2COZ A; 3NPF A; 3RIR A; 2RPN A; 2VV5 A; 3H0I A; 5GAO n; 5ECA A; 4M78 F; 1KD1 R; 4IUT A; 2VAS A; 1QCF A; 5DY9 A; 2KGT A; 5AT1 B; 4WCI A; 2KRS A; 3JCM W; 2HL3 A; 1N8R C; 1S72 T; 2VGM A; 5HY6 A; 1WFW A; 2QQA A; 2JTF A; 2HNI A; 1N6A A; 1Y96 B; 2BZ8 A; 4PJO G; 1N9S A; 4JS5 A; 2RK1 A; 2FZK B; 2M02 A; 2QTV A; 2Y4Y A; 5CVI A; 3RES A; 1AWJ A; 3L2Q A; 4WTO B; 5GMK m; 3CCR T; 4PL6 A; 4J9H A; 1C0M A; 3RKY A; 4M75 G; 3QUI A; 2KEA A; 2JZ2 A; 2VVK A; 2MWO A; 3UF4 A; 1VQ9 Q; 3ME9 A; 5DLO A; 3E9F A; 4KH0 B; 2OAU A; 1Q82 R; 4O5V A; 2VWF A; 7AT1 B; 5D6W A; 1M90 U; 4F17 A; 1JB0 E; 3JCM V; 1B34 A; 3PIO A; 2EGA A; 3VUZ A; 2GNC A; 4ESR A; 1X75 C; 2KK4 A; 5GAM j; 4HKE A; 3EFS A; 3MEA A; 3R6N A; 5GAN j; 2E3H A; 2OTL T; 1T0J A; 5M9O A; 1YCY A; 1QKW A; 1KD1 C; 2M0Y A; 1NPP A; 2RF0 A; 1M27 C; 3DB4 A; 1UGR B; 3LX7 A; 1R77 A; 2E5Q A; 1UB4 A; 4TVR A; 4M78 D; 4HCC A; 1OX8 A; 2I2L A; 3CCQ A; 1MNE A; 1VQ8 A; 1R0C B; 2RJC A; 2GTO A; 1VQ5 T; 2FHD A; 4LUE A; 2JOY A; 1ZX6 A; 1BI0 A; 1I1J A; 3M54 A; 3PMT A; 1VQ6 Q; 4LUD A; 4F7U A; 2C0I A; 4PFO A; 3JB9 J; 3VRZ A; 2DXU A; 2QGG A; 1IGQ A; 1ZUU A; 2LT1 A; 4IUU A; 4X9C A; 4F04 B; 3VRY A; 2PVD B; 2EYQ A; 4DOV A; 3G71 T; 5LJ5 e; 1VQ4 A; 2E6Z A; 3A1P A; 2RD1 A; 3CD6 Q; 1M1G A; 1YHQ Q; 4M78 E; 4P5N A; 5FU7 C; 1RAD B; 4M78 A; 2I0N A; 2MIO A; 1Q82 U; 3E19 A; 1TUD A; 4M7D F; 4ATO A; 3TVT A; 2JT4 A; 1MHN A; 3N5B B; 1YJN Q; 2KRN A; 1M4Z A; 3U23 A; 4LDX A; 1IXD A; 2C0O A; 3FIF A; 1MUZ A; 2E5K A; 1RLP C; 1WHL A; 3EGD B; 2RO0 A; 2K4Y A; 2EJF A; 2DL5 A; 1UTI A; 5GAN 3; 2LJ3 A; 1SG5 A; 5LJ3 e; 2XDB A; 2VXF A; 5KYU B; 3DB3 A; 3PTA A; 1Q95 G; 3ZEH A; 3CCS T; 4XK8 E; 2KBT A; 5CKD A; 1FMK A; 4M77 G; 3LGF A; 1RAI B; 2CZ6 B; 2QTX A; 4XU2 A; 3VKI A; 5CO7 A; 4CC2 A; 4PJO C; 3OBW A; 1R8O B; 4PJO A; 2W0Z A; 3X28 B; 1ZSZ B; 2RJD A; 1QVG P; 1S72 A; 1BK2 A; 1OYX A; 5CKE A; 1YI2 T; 1XJW B; 3I55 T; 3QZ5 B; 1HXD A; 4OMM A; 3EGX A; 2CP3 A; 4M75 C; 1AWW A; 2EYY A; 3OW2 P; 1A0N B; 1QVF A; 2LJ1 A; 3OYY A; 2PU9 B; 4O6J A; 1PD0 A; 1GFD A; 2D1X A; 1D0Z A; 3GOX A; 2XDD A; 2G3R A; 3VS1 A; 4FSX A; 3MHX A; 1WQ7 A; 3JB9 H; 3DLM A; 4EMK A; 4J9E A; 4MMK A; 3CCR A; 2EQM A; 5J3B A; 4E7I A; 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