The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
61
|
structure length |
61
|
Chain Sequence |
SEDIIVVALYDYEAIHHEDLSFQKGDQMVVLEESGEWWKARSLATRKEGYIPSNYVARVDS
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the human Hck SH3 domain and identification of its ligand binding site.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
HEMATOPOIETIC CELL KINASE
|
| total genus |
9
|
| structure length |
61
|
| sequence length |
61
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1998-03-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K1Z A; 2GNC A; 2MOX A; 2KBT A; 1SPK A; 1AVZ C; 1T3L A; 1NM7 A; 2G6F X; 4JZ3 A; 1ZUY A; 3TSZ A; 2RF0 A; 5FW9 A; 1ZLM A; 1JXM A; 2JS2 A; 4CC7 A; 2JMA A; 2O31 A; 1H92 A; 1YNZ A; 2FRY A; 1CKA A; 2DYB A; 4RTT A; 2BZ8 A; 1KIK A; 1GFC A; 3FJ5 A; 2KYM A; 4DEX A; 1PKT A; 2PNI A; 1X2Q A; 3C0C A; 3TSW A; 2A36 A; 1MV3 A; 3NHN A; 1RLP C; 3VS2 A; 4D8D A; 4X1V A; 5IH2 A; 1VYV A; 2RN8 A; 1UHF A; 2JM9 A; 1QCF A; 2F2X A; 2YUO A; 2FPE A; 3I35 A; 2J05 A; 1M3C A; 5IXF A; 2FPF A; 3H0I A; 2EYY A; 2CT4 A; 2O9V A; 1PKS A; 2E5K A; 1TUC A; 2ENM A; 2MCN A; 4IIM A; 2LCS A; 4RTV A; 4R0K A; 1VA7 A; 4RTX A; 4AG2 C; 2KEA A; 1YWP A; 5GJV B; 2CDT A; 2EBP A; 4AFS C; 4J9H A; 2L3Q A; 5FWB A; 2X3W D; 2CT3 A; 1JU5 C; 1ZX6 A; 2DNU A; 2RQR A; 2C0I A; 4WCI A; 1TUD A; 3REA B; 3EGU A; 5L23 A; 3SEM A; 1QLY A; 1UGV A; 2J6K A; 1UTI A; 2KYB A; 1H3H A; 1GBQ A; 1OEB A; 2OJ2 A; 3I5S A; 1TG0 A; 2F2W A; 2CSQ A; 3NMZ C; 2DVJ A; 1AEY A; 2K6D A; 3REB B; 1GBR A; 2A28 A; 1M3A A; 3PE0 A; 1E7O A; 2YDL A; 2DF6 A; 1ABO A; 2KNB B; 1PRL C; 4RTZ A; 1U5S A; 4J9E A; 2L3P A; 2DL3 A; 3VS3 A; 3EHQ A; 2W10 A; 3U23 A; 3ZL7 C; 1OV3 A; 1GRI A; 2LJ1 A; 3THK A; 2ABL A; 1UHC A; 3M0T A; 4Z88 A; 2CH4 W; 2DRM A; 2K2M A; 1AWX A; 4A63 B; 3UA7 A; 2K9G A; 3UA6 A; 1JXO A; 1B07 A; 2D8J A; 2P4R A; 2H8H A; 1WX6 A; 4ORZ A; 5IXB A; 4AFQ C; 1SRL A; 2GBQ A; 2YSQ A; 4J9I A; 3M0U A; 1SEM A; 1WI7 A; 1X6G A; 1CSK A; 1X27 A; 1QKW A; 2XMF A; 2KXD A; 4HVU A; 5IHN A; 4JJB A; 4ESR A; 2CSI A; 1E6H A; 4LN2 A; 3VS7 A; 3I5R A; 1GCQ A; 1NEG A; 2ROL A; 1KJW A; 2KRS A; 2O2O A; 1SRM A; 1WDX A; 1NYF A; 3VS6 A; 3M0S A; 2KGT A; 1BB9 A; 1NYG A; 2AKL A; 2D8H A; 2AKK A; 2DBK A; 2DX1 A; 3GBQ A; 2EKH A; 4J9B A; 2V1Q A; 2VKN A; 1ZUU A; 1Y0M A; 4HVW A; 2HBW A; 2GTJ A; 5FWC A; 4QT7 A; 4M4Z A; 1GCQ C; 1YCS B; 1KSW A; 2DL5 A; 2JTE A; 3EG1 A; 1CKB A; 1M27 C; 3PVQ A; 2LZ6 B; 1PHT A; 4HVV A; 2PZ1 A; 2YUN A; 1JEG A; 1QWF A; 4Z89 A; 2V1R A; 4CC2 A; 3ULR B; 2HEQ A; 1EFN A; 1WFW A; 2L3S A; 3M0Q A; 4LUD A; 5ECA A; 4RUG A; 1MV0 B; 1BBZ A; 2VVK A; 2X3X D; 5EC7 A; 3H0H A; 4JPB W; 2JW4 A; 3VS5 A; 3EG2 A; 2OAW A; 1T0H A; 4HCK A; 2JXB A; 1KFZ A; 2A37 A; 2GQI A; 3VRY A; 2D1X A; 2VWF A; 3UAT A; 2EVR A; 2K7A A; 2RNA A; 3NPF A; 3QWX X; 1HD3 A; 4J9C A; 1NLO C; 4LUE A; 2RQV A; 4RTY A; 2DL8 A; 4AG1 C; 2EYW A; 2QDL A; 1AWW A; 2KRO A; 1HSQ A; 1SHG A; 2J6F A; 2J7I A; 2DM1 A; 4Z8A A; 1G83 A; 4J9D A; 1XOV A; 2RQT A; 4RTU A; 2LP5 A; 4OMO A; 1W6X A; 5HCK A; 5GJW B; 1X69 A; 1V1C A; 1Z9Q A; 2ED0 A; 4JZ4 A; 3VS1 A; 2BZY A; 2M0Y A; 1RI9 A; 4IIO A; 1UJ0 A; 2D0N A; 1A0N B; 1PRM C; 2EGE A; 2RQW A; 4K11 A; 1NLP C; 1BK2 A; 1X2K A; 2KR3 A; 4CC4 B; 1NG2 A; 2GTO A; 2YT6 A; 1Y57 A; 2KXC A; 4JJC A; 1S1N A; 2DIL A; 1OPL A; 2I0N A; 4F14 A; 1ABQ A; 1UE9 A; 2LJ3 A; 1ARK A; 1WXT A; 5IHI A; 1QWE A; 2DRK A; 1M3B A; 2RMO A; 3LH5 A; 2F2V A; 3VS0 A; 2YUP A; 1I0C A; 2CH4 A; 2EGA A; 4J9F A; 2KE9 A; 4F16 A; 4OML A; 4Y92 A; 2FPD A; 1X43 A; 4EIK A; 2EPD A; 2DL4 A; 2DBM A; 1UJY A; 1I1J A; 2DA9 A; 4J9G A; 4ZNX A; 1I07 A; 1WA7 A; 2HDA A; 2FO0 A; 2YUQ A; 2DMO A; 1GCP A; 1WXU A; 5I22 A; 1OPK A; 1UDL A; 2NWM A; 2DE0 X; 2O88 A; 2C0T A; 4FSS A; 3O5Z A; 3EG0 A; 1PWT A; 2KT8 A; 3KFV A; 1J3T A; 1VYT A; 2B86 A; 3EG3 A; 3TVT A; 1UUE A; 1K76 A; 2JMC A; 4E6R A; 2SRC A; 4JJD A; 4AFZ C; 4DEY A; 4LNP A; 1SHF A; 2FRW A; 4HXJ A; 1GL5 A; 3JV3 A; 1AZE A; 2HCK A; 1G2B A; 2ED1 A; 2LQN A; 1LCK A; 3M0R A; 1AWO A; 3CQT A; 1T0J A; 2IIM A; 2DJQ A; 1WYX A; 2M51 A; 1WLP B; 2SEM A; 2L2P A; 3A98 A; 2J06 A; 2BZX A; 1ZUK A; 2K79 A; 1VYU A; 2JT4 A; 1ZBJ A; 2AZS A; 1GFD A; 1AD5 A; 3RBB B; 2KRN A; 1BU1 A; 2ROT A; 4OMM A; 2RQU A; 3RNJ A; 4OMQ A; 3NGP A; 2LJ0 A; 2BTT A; 4AFU C; 5IHK A; 1U06 A; 1H8K A; 1FMK A; 2J6O A; 1OOT A; 1AZG B; 1AWJ A; 2PTK A; 2LNH B; 2LX7 A; 1N5Z A; 1YWO A; 1RUW A; 4LE9 A; 1YP5 A; 3IQL A; 2K3B A; 4GBQ A; 1NEB A; 2DLP A; 1B3Q A; 2NUZ A; 3SHW A; 3H0F A; 1HJD A; 4KRT A; 1WIE A; 2CUD A; 1X6B A; 2ECZ A; 1Z9Z A; 1QKX A; 1ZSG A; 4D8K A; 2LQW A; 2EYZ A; 3I9Q A; 1AOJ A; 3UF4 A; 2CUB A; 1UG1 A; 1M30 A; 2FEI A; 4RTW A; 2LMJ A; 4GLM A; 1MUZ A; 1IO6 A; 1W70 A; 2EGC A; 2MIO A; 2JS0 A; 2HSP A; 2C0O A; 2DL7 A; 1WXB A; 1UEC A; 3PVL A; 1K0X A; 2JM8 A; 1SSH A; 2RPN A; 2KRM A; 2KT1 A; 3M0P A; 1K0S A; 3R6N A; 4CC3 A; 2L0A A; 1JO8 A; 3EHR A; 5I11 A; 1PNJ A; 1E6G A; 1RLQ C; 2O9S A; 3VS4 A; 2GGR A; 2EYX A; 2FG0 A; 4F17 A; 2ESW A; 3H41 A; 1YN8 A; 1K9A A; 1U3O A; 1UFF A; 2CRE A; 3QWY A; 1FYN A; 2AK5 A; 1W1F A; 2EQI A; 4OMN A; 2OI3 A; 2W0Z A; 1M8M A; 2EW3 A; 1K4U S; 3VRZ A; 2A08 A; 1JQQ A; 1T3S A; 4OMP A; 2AZV A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQ7 T; 3MP8 A; 3P8B B; 3G7Z A; 1VQ4 A; 3CCQ Q; 4OB2 B; 3TSZ A; 1S72 T; 2JS2 A; 5GAN f; 4M7D C; 2QA4 T; 2QGF B; 1GFC A; 4E7S A; 1KQ2 A; 1YIT A; 3C4S A; 2QTX A; 1YJ9 A; 1PKT A; 2DD4 A; 3CD6 T; 3TSW A; 2K3X A; 4FYW B; 3VKI A; 1RLP C; 4FCY A; 4X1V A; 1OU9 A; 1MGQ A; 2JM9 A; 5CKE A; 1QCF A; 3CCJ Q; 2RI3 A; 3CCV Q; 4C5H A; 5C0M A; 3O8V A; 4FYY B; 5KYX A; 2ATC B; 2FPF A; 1BKB A; 1RAB B; 2E5K A; 1TUC A; 2F1L A; 4R0K A; 4RTX A; 1ACM B; 1YWP A; 3CPW S; 2JVV A; 3EFS A; 1M90 U; 4ELZ C; 4PK4 A; 3QYG B; 4FYV B; 2L3Q A; 2HNI A; 4GY5 A; 3TRE A; 2YWW A; 4MZT A; 3OA6 A; 4A4H A; 2FZC B; 1JU5 C; 1ZX6 A; 4M7A D; 1N27 A; 4C8Q C; 3REA B; 3EGU A; 4PJN A; 3GF5 A; 4JLG A; 2J6K A; 4IUP A; 1OEB A; 1YFN A; 2CSQ A; 2DVJ A; 5D6W A; 3CCL Q; 3CC4 A; 3OSV A; 4QQG A; 2K57 A; 2ZZD A; 3DB3 A; 2A28 A; 2NYS A; 1M3A A; 3PE0 A; 1OU8 A; 2ZPF B; 2KNB B; 3FB9 A; 3CCU A; 2VYT A; 1U5S A; 3SFM A; 3MP6 A; 3WXM B; 4J9E A; 4HKE A; 3VS3 A; 2JTF A; 2W10 A; 1OV3 A; 4DQ2 A; 2LJ1 A; 5KE3 A; 3RER A; 1VQK T; 1D09 B; 2HAX A; 2ABL A; 3QBY A; 3SD4 A; 4LXC A; 1TOV A; 3INZ A; 1VQM Q; 3ZFJ A; 3LX7 A; 1OZ2 A; 2CH4 W; 2DRM A; 3D7S B; 3UDC A; 1JXO A; 1B07 A; 2P4R A; 2HL3 A; 1VQO Q; 4RCB A; 1SRL A; 1LPL A; 2GBQ A; 4NS5 A; 2X51 A; 3OY9 A; 3M0U A; 2YRC A; 2XIC A; 5LJ5 g; 5LJ3 h; 1NPR A; 1QKW A; 4M7A G; 4L59 A; 2MAM A; 2XKO C; 4HVU A; 4M77 E; 4OGE A; 3VYH B; 1M1K R; 4EMK B; 3X20 B; 2ROL A; 2IPO B; 3X26 B; 2E5Q A; 3VS6 A; 1IHV A; 2RO0 A; 1SSF A; 3M53 A; 1VQP A; 2DXB A; 2QQR A; 1RAC B; 1Q81 U; 3OB9 A; 2AKK A; 3L42 A; 2DX1 A; 4J9B A; 2QEX Q; 1Y0M A; 2GTJ A; 3M4Y A; 3S6W A; 1QVF P; 4QT7 A; 3G4S A; 3CMA A; 2VXF A; 3CCE Q; 2DL5 A; 3DB4 A; 2WSF E; 3N5B B; 4KGZ B; 2JTE A; 3E9F A; 1XQH A; 1M27 C; 4ZTJ A; 1PHT A; 2LC4 A; 5CIU A; 2F5T X; 4GLK A; 2V1R A; 5LJ3 g; 1VQ9 Q; 3ULR B; 5I21 A; 1ZA1 B; 1EFN A; 1WFW A; 2L3S A; 4LUD A; 1VQ6 T; 1VQN T; 2ZPB B; 1K8A U; 2L89 A; 1BBZ A; 5KCH A; 3H0H A; 3HFN A; 3JCM f; 3G6E A; 3RKY A; 2MWP A; 2D1X A; 5LJ5 f; 5A2Q E; 4JRK A; 2E10 A; 3RKX A; 3X24 B; 3OYI A; 2RM4 A; 3NPF A; 2KI7 A; 3QWX X; 1Q82 U; 4J9C A; 1KD1 U; 1NLO C; 2EYW A; 1O75 A; 2J6F A; 1YJW Q; 2J7I A; 3ER0 A; 4Z8A A; 5CKF A; 3MEV A; 1SG5 A; 4BI3 A; 4P5N A; 2RK2 A; 4OMO A; 1I81 A; 1YIT T; 2HD0 A; 2MWO A; 1V1C A; 1Z9Q A; 1BCO A; 1YJ9 T; 3VS1 A; 3ASK A; 4PJM A; 1RI9 A; 3FEO A; 2JNG A; 3I56 A; 4JS5 A; 1VQ4 Q; 1XTD A; 2RQW A; 4K11 A; 4OB1 B; 1BK2 A; 2GTO A; 4PJO A; 3OS5 A; 2EIF A; 6AT1 B; 2ZPG B; 2YXY A; 1UE9 A; 2LJ3 A; 2RJF A; 3VU3 C; 4FSX A; 4JLI A; 1Q95 G; 2DRK A; 5GMK h; 2DEQ A; 1WJS A; 2CZ1 B; 3VS0 A; 1I0C A; 4M77 A; 4J9F A; 2XD0 A; 7AT1 B; 4E7H A; 2EPD A; 2OTL A; 2DL4 A; 2DBM A; 4ZNX A; 4WTO B; 1G3T A; 3MHX A; 1UDL A; 1FX7 A; 2JUF A; 2HZY A; 2O88 A; 4BD3 A; 1M90 R; 2DIQ A; 3O5Z A; 2X9H A; 2KT8 A; 2B86 A; 3PIO A; 3EG3 A; 2RD1 A; 2MI6 A; 2JMC A; 4C92 B; 2RI5 A; 4JJD A; 2CZ0 B; 4AFZ C; 4HXJ A; 2RJC A; 1T0J A; 2IIM A; 5FU7 B; 1SKU B; 1VQ8 Q; 2SEM A; 1U1T A; 3A98 A; 2M1H A; 1M1K C; 1TU0 B; 2BZX A; 5FRO A; 2COY A; 1BIA A; 1VYU A; 1ZBJ A; 3OYY A; 2KRN A; 4RG8 A; 2RQU A; 1NJI R; 4NOY A; 5HKC A; 3LWH A; 1H8K A; 2YLC A; 1B34 A; 3E19 A; 2J6O A; 1AZG B; 4PL6 A; 1N9S A; 2LNH B; 3RDV A; 1WHJ A; 2I2L A; 2COZ A; 3CC2 Q; 3KBG A; 4M77 D; 3V8K A; 5KCO A; 1NEB A; 1S72 A; 2DLP A; 2NUZ A; 1HJD A; 2X4X A; 4BY6 B; 2QA4 A; 4R55 A; 3CCR T; 2PQW A; 2MPX C; 4LDY A; 5FLX E; 2RHZ A; 3VJP A; 4XAX B; 4JUV A; 2CUB A; 3LH0 A; 4N4G A; 3OYD A; 3PMI A; 1IXD A; 1I8F A; 1KQ1 A; 3AHU A; 1W70 A; 3QHS A; 1QVF S; 3KXT A; 2JS0 A; 2FL7 A; 1UEC A; 3PVL A; 2JM8 A; 2KRM A; 2KT1 A; 3UWN A; 2CKK A; 1K0S A; 2KY9 A; 2OTJ A; 3EG9 B; 2GGR A; 1Q81 R; 1PG5 B; 4PJO G; 3JCM W; 3ME9 A; 3L2U A; 2PVD B; 2LVM A; 4BE1 A; 3JAM E; 2VGN A; 3L2R A; 4V2S A; 1M8M A; 1YJN T; 3CMA Q; 3H9N A; 1UGS B; 2A08 A; 4M77 G; 3RR6 A; 2CP3 A; 1JQQ A; 2E70 A; 4OMP A; 4XU3 A; 3QJY A; 2GNC A; 2KBT A; 4JRP A; 2Y4X A; 1K8A R; 1YHQ Q; 1T3L A; 1N6A A; 4JZ3 A; 4JS4 A; 2RF0 A; 1Y07 A; 2IVW A; 1LOJ A; 3OSS C; 3FJP A; 5CR2 A; 2JMA A; 3HHT B; 2O31 A; 4RTT A; 3OYC A; 2GFA A; 1IRE B; 1WQ7 A; 4M7A C; 5GAM e; 2X4W A; 3CC7 T; 4M78 F; 4Q5W A; 1Q82 R; 4C5G A; 1JBM A; 1X6O A; 5CKD A; 4DA4 A; 1LJO A; 2A36 A; 1OYX A; 3NHN A; 4FW1 A; 2DK3 A; 3VS2 A; 4D8D A; 1R77 A; 4XU0 A; 1UHF A; 3A5Z B; 3BDL A; 4ANJ A; 4QVC A; 3PIP A; 3I56 T; 3L2Q A; 1XJW B; 2O4X B; 3GP8 A; 2HKQ B; 2DXC A; 3I55 A; 1M90 C; 2IG0 A; 2J05 A; 4DBQ A; 5IXF A; 4IUR A; 1M2O A; 1PSE A; 3MKD A; 2ENM A; 1ZBX A; 2GF7 A; 2A7Y A; 1VA7 A; 2E64 A; 3MEA A; 3FDR A; 5GJV B; 2CDT A; 5GAM j; 2EBP A; 2M0O A; 4IUQ A; 1U8R A; 1W2B A; 2K2V A; 2EYQ A; 3QPH A; 3OYH A; 3SWN A; 2OTL T; 2CT3 A; 2WSE E; 4M75 B; 2RQR A; 2E4H A; 4XTY A; 4N4I A; 3JCM Q; 2DIG A; 1RL2 A; 3SEM A; 1QLY A; 2KYB A; 1NJI C; 1D0Y A; 3NMZ C; 2K6D A; 1YIJ Q; 4C92 F; 1GBR A; 1E7O A; 1PM3 A; 2JN0 A; 3EGD B; 1MNE A; 2YDL A; 1RAH B; 3CME Q; 2DF6 A; 3CXC A; 2YHT A; 3M4G A; 1PRL C; 1BI0 A; 2CP0 A; 2ZPI B; 5LJ3 d; 3U23 A; 1VQ6 A; 3EFR A; 1VQN A; 1QP3 A; 2COW A; 3HRT A; 5CAI A; 4Z02 A; 2DXT A; 4KGV B; 1VQ5 A; 5AT1 B; 4A63 B; 3BE3 A; 1D3B B; 2CZ6 B; 1X75 C; 3TEE A; 5IXB A; 4F7U F; 5GAN 5; 1NBE B; 2YSQ A; 1P92 A; 4J9I A; 1WI7 A; 3OYM A; 1I4K 1; 1X6G A; 1X27 A; 2XMF A; 5GAO p; 1B7T A; 2RA2 A; 2XDP A; 2E65 A; 1Y7X A; 2CSI A; 2KDS A; 1Q81 C; 2E3H A; 2HBP A; 2LX9 A; 4LN2 A; 2KSS A; 1GCQ A; 1NEG A; 1N8R U; 1VUB A; 4ATO A; 2YRD A; 2O2O A; 1RI0 A; 2KGT A; 1PD0 A; 2P84 A; 1VQ7 Q; 4R56 A; 3EH1 A; 8ATC B; 3CCJ T; 3RMQ A; 2V1Q A; 2VKN A; 2DAQ A; 2FZG B; 2HBW A; 4LDV A; 4D6W A; 4A54 A; 2MF2 A; 3L1A A; 2E6N A; 4FYX B; 1YCS B; 1K8A C; 3JCM P; 3EG1 A; 3V8J A; 5GAO r; 3DLM A; 3PVQ A; 1G3S A; 2GCX A; 4HVV A; 5FU6 B; 5GAO q; 2PZ1 A; 3LLR A; 1JEG A; 3MEU A; 3HTR A; 4BDY A; 2OTJ T; 2E12 A; 3CD6 Q; 3M0Q A; 2DXU A; 2NUP A; 4RUG A; 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