The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
|
Chain Sequence |
MEYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Pin3p
|
| publication title |
Structural analysis of the yeast SH3 domain proteome
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AFQ C; 2KRN A; 2GNC A; 1H92 A; 4OMO A; 1X27 A; 2D8J A; 1QWE A; 1WX6 A; 1M8M A; 4RTT A; 2EBP A; 2GBQ A; 1RI9 A; 1NYG A; 1SHG A; 4JJB A; 2RN8 A; 1WI7 A; 3I35 A; 5IHK A; 3PE0 A; 2DL8 A; 1QWF A; 1RLQ C; 4WCI A; 5IH2 A; 1JU5 C; 4CC2 A; 1N5Z A; 2CH4 A; 2ECZ A; 1WDX A; 2EYZ A; 1PKS A; 1X2K A; 1CSK A; 2V1R A; 1UTI A; 1FYN A; 4J9G A; 2JMA A; 2LQN A; 1OEB A; 1FMK A; 2CDT A; 3EGU A; 2RNA A; 4J9B A; 1AWW A; 1JXO A; 1M3A A; 4LUE A; 2BZY A; 2LNH B; 2DF6 A; 4ORZ A; 3SHW A; 4D8D A; 1UE9 A; 2KGT A; 1IO6 A; 1X2Q A; 2KRM A; 1SSH A; 3VS2 A; 2AKK A; 1PHT A; 2KNB B; 1VYT A; 2HDA A; 1K4U S; 2X3X D; 1JO8 A; 1AOJ A; 3O5Z A; 2M0Y A; 2P4R A; 1QCF A; 3CQT A; 3QWY A; 4D8K A; 2NUZ A; 1SEM A; 1GCP A; 3I5R A; 2KYB A; 4AG2 C; 1Y57 A; 1GBR A; 1W6X A; 1RUW A; 1ZLM A; 2FPF A; 5ECA A; 3EG2 A; 1WXT A; 2A37 A; 1ZX6 A; 4A63 B; 1X6G A; 2DRM A; 4CC4 B; 2DLP A; 2EGA A; 1T0H A; 2PNI A; 2DM1 A; 2BZX A; 4HVW A; 3NMZ C; 2DRK A; 2B86 A; 2K7A A; 1GBQ A; 2CUD A; 2CSQ A; 1HD3 A; 1NYF A; 2DA9 A; 2YSQ A; 2CH4 W; 1I0C A; 2JMC A; 4K11 A; 4J9D A; 1M30 A; 2HBW A; 1WXU A; 3A98 A; 2GTO A; 3M0Q A; 2YUN A; 1LCK A; 1NLP C; 1KJW A; 1OV3 A; 2J05 A; 4EIK A; 1MV0 B; 2YUO A; 3I5S A; 4OMN A; 4Z88 A; 3FJ5 A; 3THK A; 1AZG B; 1HSQ A; 3M0P A; 2KT1 A; 1GCQ A; 1YWO A; 2A28 A; 2L3S A; 2O9V A; 2EGE A; 3VS1 A; 1UFF A; 2O31 A; 1NEG A; 3EG3 A; 1K9A A; 2J06 A; 2L2P A; 4J9I A; 1J3T A; 2K3B A; 2DE0 X; 2KRO A; 2I0N A; 5IXB A; 3H41 A; 4RTY A; 1ZBJ A; 5I22 A; 2JXB A; 2LX7 A; 1I1J A; 2CRE A; 1XOV A; 2DYB A; 4LE9 A; 1U5S A; 1JQQ A; 1ZUU A; 2AZV A; 3TSZ A; 2J6K A; 3M0S A; 3RNJ A; 2IIM A; 2JTE A; 2KRS A; 2DVJ A; 3VRY A; 4OMP A; 1OPK A; 2KE9 A; 5IXF A; 2DX1 A; 2RQU A; 2RQT A; 3GBQ A; 4ESR A; 4JZ4 A; 3VS4 A; 1WLP B; 1KFZ A; 2FEI A; 2CUB A; 2K6D A; 1T3S A; 3I9Q A; 2FRY A; 2DBK A; 2EYW A; 2EPD A; 1AD5 A; 1K1Z A; 2VKN A; 4J9C A; 2RF0 A; 3EG1 A; 1PKT A; 1GRI A; 4DEY A; 4J9F A; 4JJC A; 1I07 A; 1K0X A; 3ZL7 C; 2DNU A; 1E7O A; 2AZS A; 1A0N B; 4AG1 C; 4OMQ A; 2FRW A; 2JW4 A; 2A36 A; 3RBB B; 2A08 A; 1QLY A; 2DBM A; 2KYM A; 2JM9 A; 2W0Z A; 1NEB A; 1X69 A; 2O88 A; 1ZSG A; 2KXC A; 3NGP A; 1KIK A; 2GTJ A; 2C0I A; 1RLP C; 1ZUY A; 2L3P A; 4AFS C; 1AEY A; 5FWC A; 4LN2 A; 1B07 A; 1UHC A; 1PNJ A; 1H8K A; 1Y0M A; 1TUC A; 2EYX A; 4Z89 A; 1AVZ C; 4JPB W; 2O2O A; 1AWJ A; 3QWX X; 1T0J A; 2GQI A; 4HXJ A; 3KFV A; 4RUG A; 2RPN A; 2JS2 A; 2DMO A; 2SRC A; 4HCK A; 3VRZ A; 1PRL C; 2DL3 A; 3C0C A; 2J7I A; 3VS0 A; 1NLO C; 1UGV A; 1UHF A; 1X6B A; 3H0H A; 3UAT A; 1QKX A; 1WA7 A; 3IQL A; 1BBZ A; 1K76 A; 1MUZ A; 1PRM C; 3EG0 A; 4AFZ C; 4LUD A; 4FSS A; 1SRM A; 1Z9Q A; 1ABQ A; 4RTX A; 2AKL A; 1WIE A; 4DEX A; 1YP5 A; 1SPK A; 2HSP A; 2FPE A; 1UG1 A; 1BB9 A; 2AK5 A; 2LJ1 A; 1HJD A; 2X3W D; 3M0R A; 2BTT A; 2V1Q A; 2F2W A; 2FPD A; 2W10 A; 5EC7 A; 1K0S A; 1AWO A; 2F2V A; 3M0T A; 3H0F A; 2RQV A; 1SRL A; 2M51 A; 1M3C A; 1YNZ A; 2MOX A; 1U3O A; 5FW9 A; 4E6R A; 2JM8 A; 3TSW A; 1ZUK A; 1X43 A; 1AWX A; 4JJD A; 2LQW A; 2KR3 A; 3JV3 A; 4LNP A; 1UEC A; 2C0T A; 1YN8 A; 4Y92 A; 3VS5 A; 2BZ8 A; 2D0N A; 2ESW A; 4HVU A; 1GCQ C; 1E6H A; 2EKH A; 1S1N A; 2F2X A; 2DL4 A; 4GLM A; 1B3Q A; 4OMM A; 3NHN A; 3SEM A; 3EHR A; 1UJY A; 1AZE A; 4J9E A; 1W1F A; 3TVT A; 4Z8A A; 3UF4 A; 2PTK A; 1VA7 A; 2GGR A; 1G2B A; 1YWP A; 5IHI A; 1JEG A; 2EGC A; 2JS0 A; 1GFC A; 2DJQ A; 1T3L A; 1UJ0 A; 1PWT A; 4JZ3 A; 3VS6 A; 4RTZ A; 5L23 A; 1GL5 A; 1M27 C; 4CC3 A; 2YUP A; 1WYX A; 3PVL A; 2L3Q A; 2EW3 A; 1OOT A; 1U06 A; 2KT8 A; 2KXD A; 1UUE A; 2DIL A; 1H3H A; 1OPL A; 2O9S A; 4HVV A; 5I11 A; 4F14 A; 2ENM A; 2ABL A; 5IHN A; 4OML A; 2K2M A; 1ABO A; 2C0O A; 2CSI A; 2KEA A; 1MV3 A; 2RMO A; 1E6G A; 2RQW A; 2QDL A; 2OJ2 A; 4RTV A; 4ZNX A; 1QKW A; 4F16 A; 4AFU C; 2EQI A; 3M0U A; 5FWB A; 1CKB A; 1GFD A; 1JXM A; 1G83 A; 2XMF A; 2FO0 A; 2SEM A; 2DL5 A; 2ED1 A; 1SHF A; 1TUD A; 4KRT A; 2J6F A; 4RTW A; 4J9H A; 1V1C A; 2VWF A; 1BK2 A; 4X1V A; 2YT6 A; 3U23 A; 4CC7 A; 3VS7 A; 3H0I A; 1NG2 A; 2ROL A; 1EFN A; 2NWM A; 4RTU A; 2FG0 A; 1BU1 A; 1W70 A; 2YUQ A; 3LH5 A; 1VYV A; 1TG0 A; 2D1X A; 2CT3 A; 2G6F X; 2LMJ A; 3VS3 A; 4IIM A; 2LJ0 A; 3EHQ A; 2KBT A; 1Z9Z A; 2CT4 A; 1WFW A; 1ARK A; 1CKA A; 2HEQ A; 2LJ3 A; 3NPF A; 3PVQ A; 1WXB A; 1M3B A; 2HCK A; 2K9G A; 2LP5 A; 2ROT A; 1KSW A; 2K79 A; 2MIO A; 3UA6 A; 2D8H A; 3REA B; 5HCK A; 2JT4 A; 1VYU A; 5GJW B; 2ED0 A; 2DL7 A; 3R6N A; 4M4Z A; 3ULR B; 2OAW A; 2VVK A; 2MCN A; 2J6O A; 4F17 A; 2LZ6 B; 2H8H A; 2EVR A; 2EYY A; 1YCS B; 2OI3 A; 2PZ1 A; 5GJV B; 3UA7 A; 2YDL A; 4IIO A; 3REB B; 1UDL A; 1NM7 A; 4R0K A; 4GBQ A; 2RQR A; 2E5K A; 2LCS A; 4QT7 A; 2L0A A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1G3S A; 4NS5 A; 2DXT A; 1H92 A; 4OMO A; 3VV0 A; 1U1S A; 1X27 A; 3M9Q A; 1K8A U; 3CMA Q; 1M8M A; 2EBP A; 1RI9 A; 1VQ6 Q; 3FB9 A; 4M77 C; 3L2W A; 2FZK B; 2ZPE B; 2DL8 A; 4A4K A; 2ECZ A; 1PKS A; 1X2K A; 2LX9 A; 1LNX A; 1TH7 A; 2V1R A; 2L3R A; 2JN0 A; 4C5G A; 1NJI R; 2JMA A; 3FLG A; 4JUV A; 2A0F B; 2RK2 A; 1OEB A; 4M75 C; 2HNI A; 2CDT A; 2QA4 Q; 3RMS A; 2GQV A; 2OAU A; 1M3A A; 3CCL T; 3G1J A; 2DF6 A; 1QVF S; 2FHD A; 2KGT A; 1X2Q A; 3GNG A; 1VQN Q; 3OS2 A; 1IGQ A; 2FVU A; 5FU6 B; 5A0G A; 3AT1 B; 1PHT A; 2K57 A; 3EAE A; 3G71 Q; 2DFU A; 1AOJ A; 3EG9 B; 2H3J A; 3OYM A; 2DET A; 4KBM B; 4M7A B; 2M0Y A; 3RIR A; 2P4R A; 1SEM A; 4QKU A; 3I5R A; 3VYH B; 3JSC A; 1PM3 A; 4J6X A; 1Y57 A; 3HTR A; 1W6X A; 1RUW A; 4J83 A; 3X25 B; 4QVC A; 3ZBD A; 2PUK B; 1WJR A; 5ECA A; 3CC7 A; 2DRM A; 2GCX A; 2DLP A; 5KCO A; 1M2V B; 4HVW A; 2HSE B; 3OA6 A; 2K7A A; 1Y07 A; 2LTO A; 1NYF A; 3MJX A; 4C92 C; 2CH4 W; 1I0C A; 3E19 A; 3PIO A; 2E3I A; 4PFZ A; 2GTO A; 2E6N A; 3G6E T; 1QCO A; 2HL5 C; 4MML A; 1KJW A; 4O6J A; 1FX7 A; 4EIK A; 3FJ5 A; 3THK A; 1AZG B; 2A28 A; 5D7U A; 3VS1 A; 3M54 A; 2O31 A; 3OW2 A; 2BKD N; 1J3T A; 3V8K A; 2K3B A; 2KRO A; 3I56 A; 1VUB A; 2JXB A; 1OX9 A; 4E7H A; 1S72 A; 1XOV A; 2DYB A; 1JQQ A; 3NFC A; 1YIJ A; 1JBM A; 2OTJ T; 2J6K A; 4PJO F; 5I2S A; 1VQL A; 3HFO A; 4KT0 E; 5CKD A; 3CCJ T; 2DVJ A; 5IT9 E; 1SKU B; 5HY6 A; 2OTL A; 3EFR A; 1Q82 U; 1KQ2 A; 2DX1 A; 1VQ9 T; 4ESR A; 2RH2 A; 1G3T A; 3VKI A; 3OBW A; 3F70 A; 2FRY A; 2EYW A; 1VQ7 T; 3MO8 A; 4KGZ B; 1PKT A; 1RAG B; 1GRI A; 3V7C A; 3CC7 Q; 4J7F A; 4JJC A; 4Q5W A; 2MWP A; 4AG1 C; 4OMQ A; 3CC4 A; 1D3B B; 2A36 A; 9ATC B; 1I81 A; 3M56 A; 4IUV A; 2DBM A; 2JM9 A; 5AYF A; 1BI3 A; 4C0D C; 2GTJ A; 2DJZ A; 1VQ5 A; 1RLP C; 2L3P A; 2DPP B; 4ANJ A; 3CCQ T; 1B07 A; 1UHC A; 2YHT A; 4BY6 C; 2X51 A; 3CMA T; 1H8K A; 8AT1 B; 1AVZ C; 4C5E A; 1N9S A; 1VQ6 T; 2GQI A; 4HXJ A; 2RPN A; 3ME9 A; 1ZSZ C; 2LRQ A; 4M7A F; 2DL3 A; 2KAF A; 4PJJ A; 4XU2 A; 2J7I A; 2X35 A; 5LJ3 h; 3VS0 A; 3I56 Q; 3PFS A; 4C8Q C; 2P0P A; 4LXC A; 3H0H A; 4BI8 B; 4HCB A; 3L2Q A; 4M77 F; 3UAT A; 2WSC E; 3OMC A; 3RR6 A; 1S72 Q; 3JCM W; 1YIJ Q; 1BBZ A; 1K76 A; 1TXQ A; 1PRM C; 4AFZ C; 1VQL Q; 1FWZ A; 5KH6 A; 2QA4 T; 1KHC A; 4PJO A; 1SRM A; 4KUD K; 2FL7 A; 4EMG A; 3CCU T; 2NUT A; 3MP6 A; 3P8B B; 2OTL Q; 5M9O A; 2KK4 A; 2AKL A; 3L2V A; 2FYK A; 1YP5 A; 2LQ8 A; 3CBM A; 1UG1 A; 1BB9 A; 4M78 A; 3CME A; 2X3W D; 2YWW A; 2F2W A; 2FPD A; 2VV5 A; 3G71 T; 2CP0 A; 5EC7 A; 1AWO A; 3M0T A; 2VYT A; 3CC4 Q; 1IB8 A; 3H0F A; 3OYB A; 1OX8 A; 3OB9 A; 4FT2 A; 4E6R A; 4PLI A; 1YNZ A; 2WSE E; 5FW9 A; 2QGG A; 2NUP A; 4LDV A; 1ZUK A; 5GAO m; 2E41 A; 1X43 A; 4JJD A; 1VQ5 Q; 4ATO A; 4LNP A; 2C0T A; 4FM4 B; 1YN8 A; 1OU8 A; 2CGH A; 4C0Z A; 2VGN A; 4N0A A; 2K5I A; 4JRQ A; 3OSS C; 2RM4 A; 1BIB A; 3J80 E; 3VU3 C; 1S1N A; 1QVF P; 1YFN A; 1QVF A; 3NHN A; 3SEM A; 4ZGD B; 4M7A A; 4HCC A; 1AZE A; 4E7I A; 2L89 A; 3UF4 A; 2COY A; 2BIV A; 4M77 A; 1YWP A; 4ZN3 A; 2JS0 A; 4M7D E; 3CCS A; 4QQ6 A; 3RUX A; 2M0O A; 1UJ0 A; 4C92 F; 1PWT A; 4JZ3 A; 4XU3 A; 1KQS S; 5LJ3 d; 2Y90 A; 1M27 C; 4F7U F; 3ASK A; 4JRK A; 4RG2 A; 4XTY A; 5KYX B; 1OOT A; 1U06 A; 2KT8 A; 4M75 A; 2KXD A; 4LDX A; 3CME Q; 1K9M U; 1H64 1; 4FW2 A; 1H3H A; 1OPL A; 2P84 A; 1IZ6 A; 3OQ5 A; 2ENM A; 2ABL A; 2VXF A; 2F5T X; 2K2M A; 4LDU A; 2C0O A; 1M5Q 1; 2ZZD A; 3Q1J A; 2EQI A; 2MYS A; 1G83 A; 5GAO n; 1RAB B; 2FO0 A; 4YTL A; 2BE7 D; 2ED1 A; 2P0K A; 5CKF A; 4ZTF A; 1TUD A; 3CC7 T; 2J6F A; 1VQM A; 1BK2 A; 1OUL A; 4X1V A; 2MF2 A; 3MEU A; 1D1B A; 1ZQ1 A; 1BU1 A; 5LJ5 j; 1R77 A; 3VYG A; 5KCH A; 1V29 B; 2LT4 A; 4PJO D; 4FIB A; 1IHW A; 4R55 A; 5DY9 A; 3INZ A; 2QK0 A; 2G6F X; 1XNI A; 2HQE A; 2LJ0 A; 2DKG A; 3CCS Q; 3EHQ A; 2GFU A; 2KBT A; 3PT9 A; 1KC8 R; 4M78 D; 4C92 A; 1PC0 A; 2HEQ A; 3JCM c; 2E65 A; 3CCE Q; 4F7U A; 1PG5 B; 3I56 T; 1WXB A; 1IRE B; 4PFO A; 2VB6 A; 3HFN A; 1S72 T; 2DXC A; 1OZ2 A; 2MIO A; 1EX4 A; 4OMF B; 3UA6 A; 2D8H A; 5D6X A; 5HCK A; 1VQL T; 3PNW C; 3QDR B; 4XTZ A; 3R6N A; 3DLL A; 2DTH A; 2OAW A; 2QAZ A; 1QP2 A; 2F5K A; 2D0Q B; 5A0D A; 3TQ7 P; 5GAM g; 4KH1 B; 5GJV B; 3BY7 A; 5C6S A; 4IIO A; 3REB B; 3DB4 A; 3JCM e; 1NM7 A; 2G3R A; 4M7A D; 1VQM Q; 1F1B B; 3CC4 T; 5LJ5 e; 2RQR A; 5HK0 A; 4V2S A; 4M77 D; 2E10 A; 4AFQ C; 4JJN K; 1AT1 B; 2V8J A; 2D8J A; 1YJ9 A; 1WX6 A; 4M7D G; 1QP3 A; 1TTH B; 1VQ5 T; 1NYG A; 1SHG A; 2E6Z A; 1IRX A; 2RN8 A; 5IHK A; 5GMK i; 3CXC A; 4JRP A; 1K8A R; 2AT1 B; 1LOJ A; 4M75 D; 5FRM A; 3JB9 G; 4DA4 A; 3X20 B; 4CC2 A; 1N5Z A; 2CH4 A; 2EYZ A; 3I55 A; 5D6Y A; 2EIF A; 1FYN A; 3QJ6 A; 2LQN A; 4QQG A; 1Q7Y U; 5LJ3 f; 3CPF A; 1O9S A; 1AWW A; 1ZSZ A; 3AHU A; 2BZY A; 1UE9 A; 2RK1 A; 3OYN A; 2KRM A; 1SSH A; 4C8Q A; 3VUB A; 2AKK A; 3S3O A; 1YCY A; 2X4J A; 2KNB B; 4FL6 A; 1I4K 1; 3PGG A; 3CME T; 5GAN 7; 4IKF A; 4LD6 A; 3G4S A; 1VQK A; 3M4G A; 3JB9 I; 4FCY A; 4HKE A; 2EAY A; 1D09 B; 4QVD A; 1ZLM A; 4CI0 C; 2FPF A; 3L2R A; 1YJ9 Q; 3H6Z A; 4MDX A; 3EG2 A; 1WXT A; 1EZZ B; 3TCJ A; 1ZX6 A; 4A63 B; 4C92 D; 4WTO B; 4NL3 A; 2CZ1 B; 1NPP A; 4XTW A; 1MMD A; 2XG8 D; 2EGA A; 1FXX A; 2FB7 A; 4XTV A; 5KYX A; 2DM1 A; 2BZX A; 1WGS A; 2A7Y A; 3NMZ C; 1GBQ A; 4Y28 E; 2CUD A; 2CSQ A; 5DM7 R; 1KQS P; 4KGX B; 1KQS A; 1VIF A; 3JCM X; 3I55 Q; 2HBW A; 1WXU A; 5CO7 A; 1YHQ T; 4OP0 A; 4LDW A; 4A4G A; 2AHJ B; 4IUU A; 1YJN A; 4N4G A; 1C6V X; 2J05 A; 3DKM A; 4JDS A; 1MV0 B; 4OMN A; 4E7J A; 1BCM A; 3A5Z B; 2XDB A; 2L3S A; 3E9F A; 1Q7Y C; 1UFF A; 2L2P A; 2J06 A; 3LWI A; 2E5Q A; 4J5Y A; 2DE0 X; 2I0N A; 5IXB A; 2R57 A; 4RTY A; 1NBE B; 1ZBJ A; 3JCM P; 4N4I A; 2ZPB B; 3CC2 T; 2CRE A; 8ATC B; 3VJP A; 2YLB A; 5J26 A; 2AZV A; 3TSZ A; 5J39 A; 5HKC A; 3GOX A; 2LDM A; 3MHX A; 4PJO B; 2NUT B; 3MEW A; 1I8F A; 1WHL A; 5GAN j; 4NL2 A; 3OS0 A; 3G4S Q; 1VQK Q; 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