The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
MEYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| publication title |
Structural analysis of the yeast SH3 domain proteome
rcsb |
| molecule keywords |
Pin3p
|
| total genus |
11
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| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1YWP A; 2DF6 A; 2LQN A; 2JW4 A; 3UAT A; 1E6H A; 1SHF A; 4CC3 A; 1AZG B; 2LP5 A; 2AZS A; 1Y0M A; 3REA B; 3VS1 A; 1GCQ C; 2KT8 A; 4RUG A; 3M0U A; 1NLP C; 2RQT A; 4OMN A; 3M0Q A; 2DJQ A; 2DE0 X; 1QWE A; 1AEY A; 3EGU A; 3EG0 A; 1NYF A; 2DNU A; 2J6K A; 1MUZ A; 2CDT A; 4Y92 A; 1GFC A; 4EIK A; 4RTZ A; 4HVW A; 2EYZ A; 5IXF A; 2LX7 A; 1RI9 A; 1AZE A; 1WYX A; 1IO6 A; 1UHF A; 4DEX A; 2CRE A; 1K1Z A; 2JS0 A; 1X6B A; 5FWC A; 3NPF A; 5GJV B; 3TVT A; 1TUD A; 2EYX A; 1CKB A; 3FJ5 A; 3ZL7 C; 2O31 A; 2RN8 A; 4JZ4 A; 2CSI A; 1Z9Z A; 3H0F A; 2LJ1 A; 1VYT A; 2KBT A; 2V1Q A; 3U23 A; 1KIK A; 1OEB A; 1I0C A; 1JU5 C; 3VS2 A; 1UDL A; 1M3C A; 2EGA A; 2YUO A; 1AWW A; 1JXO A; 1YN8 A; 2LJ3 A; 4X1V A; 1AWO A; 1RLP C; 1OPK A; 2CUD A; 2AKL A; 1NLO C; 2CH4 W; 3RBB B; 1HSQ A; 2CH4 A; 4AG2 C; 2O9S A; 3I5S A; 2GGR A; 2PNI A; 2O2O A; 4J9F A; 1M30 A; 3M0R A; 1AVZ C; 2NUZ A; 2CT4 A; 5I22 A; 2DX1 A; 4F14 A; 2YUQ A; 4LN2 A; 2QDL A; 2LMJ A; 3EG3 A; 5IH2 A; 3EG2 A; 2C0O A; 2O9V A; 2X3W D; 2A28 A; 1ZUY A; 2FEI A; 1GBQ A; 2HSP A; 1SRM A; 2YSQ A; 2RQU A; 1X6G A; 3JV3 A; 2YDL A; 2JXB A; 2K9G A; 2KR3 A; 2XMF A; 3RNJ A; 2VVK A; 2A36 A; 3R6N A; 2RPN A; 2DRK A; 1MV0 B; 1N5Z A; 2D1X A; 1OV3 A; 3PE0 A; 1NM7 A; 4JJC A; 1VYU A; 1H8K A; 2DLP A; 3I5R A; 1G2B A; 4OMQ A; 2I0N A; 3M0T A; 1I1J A; 4CC4 B; 4D8D A; 1QWF A; 1X2K A; 1PWT A; 1MV3 A; 2KYB A; 2EW3 A; 3IQL A; 2ENM A; 1KSW A; 1M27 C; 2K7A A; 2J05 A; 1WIE A; 1NG2 A; 3PVQ A; 2CUB A; 2FPD A; 1AD5 A; 1OOT A; 2EGE A; 4RTY A; 2GBQ A; 4JZ3 A; 1WX6 A; 2KRO A; 2YT6 A; 5IHI A; 2CT3 A; 2H8H A; 3NHN A; 1FMK A; 3QWY A; 4JPB W; 2E5K A; 2MOX A; 1W70 A; 2ROT A; 2KE9 A; 1CKA A; 1VYV A; 1CSK A; 2LJ0 A; 3VS0 A; 2V1R A; 2G6F X; 1LCK A; 1U5S A; 2BZX A; 1M3A A; 2DA9 A; 3SEM A; 3TSZ A; 3THK A; 4CC2 A; 1UJ0 A; 3PVL A; 2FRY A; 2JM8 A; 2FG0 A; 2EYW A; 1AOJ A; 1WXT A; 4RTX A; 1WLP B; 1XOV A; 4M4Z A; 1X69 A; 2JMA A; 4RTT A; 4AFS C; 4FSS A; 3VS6 A; 3M0S A; 1NEB A; 1GBR A; 2DL3 A; 3VS3 A; 1B3Q A; 1HJD A; 4AFQ C; 1UHC A; 2FO0 A; 1QKX A; 2L3Q A; 4AG1 C; 3ULR B; 1SPK A; 3I35 A; 4E6R A; 3CQT A; 3A98 A; 4HVV A; 4J9B A; 2X3X D; 1H92 A; 1TUC A; 4J9C A; 5I11 A; 4HCK A; 3M0P A; 5ECA A; 2C0T A; 2YUP A; 2RMO A; 2HCK A; 2AKK A; 2SRC A; 4Z8A A; 2KXC A; 4CC7 A; 1EFN A; 1U06 A; 1UEC A; 2LCS A; 1B07 A; 4LE9 A; 4LUD A; 4F16 A; 2DL4 A; 1K76 A; 2ABL A; 3I9Q A; 2K2M A; 1WXU A; 4ESR A; 2HEQ A; 1UTI A; 4RTW A; 1PRL C; 2DMO A; 3O5Z A; 2F2X A; 3VRZ A; 2K79 A; 1GL5 A; 1AWJ A; 2EQI A; 2J6O A; 1T3S A; 1M8M A; 1RUW A; 2J7I A; 2BZ8 A; 2BTT A; 3REB B; 2AZV A; 5L23 A; 1G83 A; 1WA7 A; 3UF4 A; 2RNA A; 1TG0 A; 1RLQ C; 1WI7 A; 3UA7 A; 1YCS B; 2P4R A; 2W10 A; 1YP5 A; 3H0I A; 2GQI A; 2O88 A; 4OMO A; 4RTV A; 1BBZ A; 4OMP A; 1E7O A; 2EBP A; 2KT1 A; 2EGC A; 1X27 A; 4KRT A; 5EC7 A; 1PKS A; 2DM1 A; 1UFF A; 1UGV A; 4R0K A; 1K0X A; 2LQW A; 2LNH B; 2DBK A; 2EKH A; 2L2P A; 1KJW A; 1BK2 A; 2ED1 A; 5GJW B; 4RTU A; 1T0J A; 2D8J A; 1A0N B; 4Z88 A; 4IIO A; 2GTO A; 4K11 A; 3LH5 A; 2LZ6 B; 1H3H A; 1SEM A; 2KXD A; 2FRW A; 2KRM A; 4DEY A; 1ZUK A; 2ROL A; 2AK5 A; 2L3P A; 4HXJ A; 2EPD A; 3UA6 A; 4J9I A; 1M3B A; 2J06 A; 1AWX A; 2FPF A; 5IHN A; 4LUE A; 2F2W A; 4J9H A; 2KYM A; 1JQQ A; 2VKN A; 2VWF A; 1X43 A; 1OPL A; 4IIM A; 1SSH A; 1U3O A; 4J9D A; 4ZNX A; 2PTK A; 5IHK A; 1E6G A; 4D8K A; 1GRI A; 1ABQ A; 1SHG A; 2DIL A; 2SEM A; 2HDA A; 2JMC A; 1ZSG A; 4QT7 A; 4GLM A; 2M0Y A; 2JS2 A; 2DL8 A; 3EG1 A; 3GBQ A; 3NGP A; 1JEG A; 2KNB B; 2HBW A; 1PRM C; 2ECZ A; 5FW9 A; 1UJY A; 4OMM A; 4OML A; 1VA7 A; 2PZ1 A; 3VS5 A; 1JXM A; 2W0Z A; 1X2Q A; 2EVR A; 1SRL A; 5HCK A; 2OAW A; 1T3L A; 4A63 B; 2ED0 A; 2RF0 A; 2MIO A; 1ZLM A; 2KGT A; 2FPE A; 2GTJ A; 1I07 A; 1ZBJ A; 2M51 A; 5IXB A; 1GCP A; 1NEG A; 1J3T A; 4WCI A; 4F17 A; 1Z9Q A; 2RQW A; 1ARK A; 1T0H A; 4ORZ A; 2D8H A; 1WFW A; 1WDX A; 1W1F A; 2CSQ A; 1QKW A; 2YUN A; 2BZY A; 3C0C A; 2DRM A; 4JJB A; 1S1N A; 2ESW A; 1BU1 A; 2F2V A; 2DL5 A; 1PKT A; 2A37 A; 3VRY A; 2NWM A; 1YNZ A; 3EHQ A; 2L0A A; 2KRS A; 2J6F A; 2JT4 A; 3SHW A; 2RQR A; 1WXB A; 1W6X A; 4AFU C; 1UUE A; 1FYN A; 1YWO A; 2JM9 A; 1K0S A; 1GFD A; 2DVJ A; 1UG1 A; 2OJ2 A; 1ZX6 A; 1K9A A; 1PNJ A; 1KFZ A; 1HD3 A; 1QLY A; 4GBQ A; 4AFZ C; 2L3S A; 2IIM A; 4J9E A; 2RQV A; 4Z89 A; 2DYB A; 2GNC A; 2K6D A; 1PHT A; 1ABO A; 4JJD A; 3H41 A; 1QCF A; 2EYY A; 5FWB A; 3NMZ C; 2DL7 A; 2KEA A; 2KRN A; 1UE9 A; 4LNP A; 3VS4 A; 4HVU A; 2K3B A; 1ZUU A; 4J9G A; 2MCN A; 1Y57 A; 3TSW A; 3H0H A; 2C0I A; 3VS7 A; 2JTE A; 1NYG A; 1JO8 A; 1K4U S; 1BB9 A; 3KFV A; 2A08 A; 3EHR A; 2OI3 A; 1V1C A; 2B86 A; 2DBM A; 1GCQ A; 2D0N A; 3QWX X; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YWP A; 2JW4 A; 3RKW A; 4A4G A; 3UAT A; 2LP5 A; 2R58 A; 5GAM j; 4QVZ A; 2R5A A; 4JLI A; 2BKD N; 3M5A A; 3M0U A; 1N8R U; 2RQT A; 5CVI A; 1X75 C; 2DE0 X; 1QWE A; 3EGU A; 2KI7 A; 1SF9 A; 1TWB A; 2DTH A; 1VQ9 A; 5GMK j; 3I56 A; 2KK4 A; 3JCM Q; 2BE9 B; 4Y92 A; 4B6M A; 3JB9 I; 4EIK A; 4PJO B; 1UHF A; 1W2B A; 3CC4 T; 4DOW A; 1EX4 A; 3JCM c; 1KQ1 A; 1RI0 A; 2LTO A; 3L2R A; 2V8I A; 3EGX A; 2KBT A; 5D7U A; 2V1Q A; 1KIK A; 3E19 A; 1OEB A; 1JU5 C; 4PJJ A; 1KHC A; 1YJ9 Q; 3OY9 A; 5D6Y A; 3QYH B; 1B34 A; 1RAD B; 3ASK A; 2LJ3 A; 3GNG A; 4N4I A; 2CP7 A; 1AWO A; 4J83 A; 3WVE B; 1RAG B; 1NLO C; 3RBB B; 2GQV A; 1HSQ A; 4AG2 C; 2EJF A; 2XHC A; 2PNI A; 4JRK A; 4C92 E; 4Q5W A; 2NUZ A; 5KYY B; 2CT4 A; 4PFO A; 3PFS A; 3LLR A; 2CP6 A; 5LJ5 j; 4PNO A; 5IH2 A; 4C5H A; 4WF2 A; 1RAH B; 2XD0 A; 1GBQ A; 4JJN K; 3M53 A; 3CCJ A; 2RQU A; 3JV3 A; 5GAN 7; 1IZ6 A; 2VVK A; 2A36 A; 3CCL Q; 4E7K A; 1NPP A; 1MV0 B; 1YJW Q; 1K73 R; 2D1X A; 4O5V A; 1M1F A; 2DLP A; 1VQ8 T; 3CXC P; 4B9W A; 4D6W A; 2I0N A; 3H6Z A; 5I21 A; 4CC4 B; 5C0M A; 5GAO n; 4FIB A; 5LJ3 g; 3JCM W; 1DJ7 B; 1MV3 A; 1YIT T; 1Q7Y C; 4M7A C; 2EW3 A; 1G3S A; 4FYV B; 2KY9 A; 1B7T A; 3I55 T; 2J05 A; 1FWZ A; 1D3B B; 2MF2 A; 3X26 B; 3MP1 A; 2CUB A; 1AD5 A; 4C92 D; 1OOT A; 3FDR A; 5GAM d; 4EMK A; 4C8Q C; 4JRI A; 3ZBD A; 2KRO A; 1M2V A; 1YJN A; 3LGL A; 3NHN A; 3CEY A; 5GAN 3; 2QDY B; 1TH7 A; 3CD6 Q; 3BDL A; 1WJS A; 3GLX A; 2WAC A; 1W70 A; 1YJ9 A; 3SD4 A; 4J6Y A; 2EJG A; 2WSE E; 1U5S A; 2BZX A; 3UPU A; 2L3R A; 3SEM A; 2VXE A; 2RO0 A; 3X28 B; 1UJ0 A; 4J5Y A; 2JM8 A; 2FG0 A; 2KAF A; 1QCN A; 2XDB A; 1OYX A; 2EYW A; 2ZZD A; 5HKC A; 1ZSZ C; 1VQN T; 3L42 A; 4RTT A; 4BAC A; 1QVF A; 3P8H A; 1WHG A; 1AHJ B; 3EGX B; 1QVG S; 1D1B A; 2LQ8 A; 4IKF A; 2HL3 A; 4PLI A; 5GAO q; 5J3B A; 3MEA A; 3JCM P; 1B3Q A; 3DKM A; 1TSF A; 1B34 B; 3CCE Q; 2K57 A; 4ZN3 A; 4O6J A; 3H9N A; 2X3X D; 2MWO A; 2HSE B; 4OB3 B; 2PUO B; 2E1H A; 1VQ5 A; 4HCK A; 3OYB A; 4ELZ C; 2C0T A; 1VQO T; 2YUP A; 4DOV A; 1Q7Y U; 2HCK A; 1ZQ1 A; 2AKK A; 2SRC A; 5GAN 6; 7AT1 B; 5LJ5 d; 4XK8 E; 4M78 D; 4MZM A; 3OB9 A; 4PFP A; 1GXI E; 1B07 A; 3J7A F; 4LUD A; 4Y91 A; 1JB0 E; 4LDV A; 5CR2 A; 2OTJ Q; 4F16 A; 2DL4 A; 1K76 A; 2ZPG B; 2QQB A; 3I9Q A; 5CO7 A; 2E6Z A; 5GAM g; 2DIQ A; 5I2S A; 4JUV A; 1I81 A; 4TVR A; 1YIJ A; 3OW2 A; 4FW2 A; 2A3L A; 1VUB A; 1PRL C; 3CC7 A; 2F2X A; 2M1H A; 1AWJ A; 5IAY A; 5CKE A; 4M77 D; 1LVK A; 1T3S A; 2J6O A; 3GF5 A; 4M75 B; 3V8L A; 5HK3 A; 2E64 A; 3A8O B; 1D09 B; 2J7I A; 4M7A A; 2QXF A; 1W4S A; 3PGG A; 3CCU A; 5GAN 4; 2RNA A; 1WI7 A; 2FB7 A; 3SWN A; 5GMK l; 3Q1J A; 4EMK B; 3S3O A; 3NTH A; 5D6X A; 4C8Q A; 2YLB A; 3EGD B; 1N9R A; 1VQ9 T; 3MCA B; 3I56 T; 4OMP A; 1E7O A; 1NJI R; 1JRI A; 2EBP A; 1U1T A; 1IB8 A; 4KRT A; 2QEX Q; 2HNI A; 3GIB A; 5FU6 C; 5GAN 5; 3OYG A; 1UFF A; 1X01 A; 4FW1 A; 5GAM e; 1K0X A; 2VGM A; 2LNH B; 1EZZ B; 3RER A; 1PCX A; 2R5M A; 4QKU A; 2D0Q B; 4OP0 A; 1P92 A; 3A1P A; 5LJ5 g; 4F7U G; 3MET A; 3URG A; 4DEY A; 1ZUK A; 2ROL A; 2AK5 A; 3VUB A; 5LL6 S; 3QSU A; 2EPD A; 3UA6 A; 4J9I A; 5IHN A; 4RG2 A; 4J9H A; 2KYM A; 1K9M C; 2O01 E; 1OPL A; 2MYS A; 1Q7Y R; 2DYI A; 3G71 A; 4PJN A; 2XI9 A; 3DB4 A; 1E6G A; 1WHH A; 2L5Q A; 4JDS A; 2YHT A; 3PMI A; 1LNX A; 5J26 A; 5CKF A; 2JS2 A; 1YHQ Q; 3NGP A; 3CCJ T; 2HBW A; 1JBM A; 5FW9 A; 4OMM A; 2EQK A; 3VS5 A; 1JXM A; 1X2Q A; 2EVR A; 4M7D A; 5LJ5 e; 3G6E A; 1JJ2 A; 3JRZ A; 1VQP Q; 1RAI B; 3OYJ A; 5KYN A; 4PJO C; 4F17 A; 4J7I A; 2YRV A; 1T0H A; 2CSQ A; 1WHM A; 2DRM A; 2F2V A; 2O4X B; 2CZ6 B; 1YJN T; 1Q86 C; 5KH6 A; 1MGQ A; 1OZ3 A; 5J39 A; 2RHU A; 3CCQ A; 4C92 G; 1VQ4 A; 1PG5 B; 1W6X A; 1UUE A; 1FYN A; 3A5Z B; 2QA4 Q; 4N4G A; 1ZX6 A; 5A0D A; 5GAO l; 1K9M U; 3CCR Q; 5D6W A; 5CKD A; 2L3S A; 2IIM A; 2QGF B; 4Z89 A; 2XK0 A; 2OAU A; 2K6D A; 4M7D F; 3DLM A; 2RH2 A; 1VQM A; 4IUP A; 3CME Q; 3VS4 A; 1LOJ A; 1R0B G; 3VS7 A; 4ANJ A; 5GAO r; 1BCO A; 2A08 A; 3P8D A; 1VQ5 T; 5M9O A; 1V1C A; 2B86 A; 1GCQ A; 4OML A; 3JCM V; 2LT1 A; 3RMQ A; 1SHF A; 4IUR A; 1Y0M A; 4A54 A; 2K3Y A; 2LNV A; 3CBM A; 3REA B; 6AT1 B; 3CMA Q; 2KT8 A; 4RUG A; 3CCS A; 2E70 A; 4OMN A; 3M0Q A; 9ATC B; 2DJQ A; 1AEY A; 4M78 F; 2J6K A; 3L2U A; 4KGZ B; 1MUZ A; 1Q86 U; 2OTL Q; 2K4Y A; 1YIJ T; 4M7D B; 2EYZ A; 4BE1 A; 3C94 A; 2M9U A; 4X9C A; 4X9D A; 3CC7 T; 4DBQ A; 4P5N A; 4DEX A; 3CC2 Q; 1K1Z A; 1X6B A; 3TVT A; 1TUD A; 2EYX A; 1CKB A; 2X4X A; 5FRM A; 2O31 A; 1MMA A; 2RN8 A; 2HZY A; 4JZ4 A; 1Z9Z A; 3H0F A; 4PJO A; 3CCU T; 1TUG B; 3VS2 A; 2JN0 A; 1UDL A; 1M3C A; 3CCR A; 2YUO A; 1AWW A; 1JXO A; 4X1V A; 2DZ9 A; 2CUD A; 2AKL A; 2XIC A; 2KSS A; 4XU0 A; 1VQL A; 4II1 A; 1K9M R; 2GGR A; 4E7I A; 5I22 A; 4M78 B; 3MO8 A; 2YUQ A; 4LN2 A; 2EJ9 A; 2DTI A; 3EFO A; 1BI1 A; 2E3I A; 1KC8 C; 2QQR A; 2C0O A; 3M56 A; 4WTO B; 1ZUY A; 4F04 B; 1N9S A; 2A0F B; 3QPH A; 1WHL A; 5KYU A; 1SRM A; 1X6G A; 2KR3 A; 2E3H A; 1RL2 A; 4PJM A; 2H3J A; 3RNJ A; 3R6N A; 2R57 A; 2RPN A; 2RHY A; 4EMG A; 3L2Q A; 1NM7 A; 1H8K A; 3I5R A; 1HYO A; 2QTV A; 2CKK A; 4PJO F; 4M77 B; 4A4E A; 5A2Q E; 3M4G A; 2E12 A; 1WJR A; 2P0K A; 2Y4X A; 3O8V A; 1QVG P; 1PWT A; 2KYB A; 3WVD B; 3G71 T; 2RJD A; 2ENM A; 2K7A A; 4BDZ A; 3L2W A; 2P84 A; 1NG2 A; 1YFN A; 3OYF A; 4FSX A; 2BUD A; 1YI2 Q; 2CP3 A; 2EGE A; 4RTY A; 3C12 A; 2MI6 A; 1Q86 R; 4C0D B; 2YT6 A; 2H8H A; 4XQ3 A; 2LQK A; 4J6X A; 1H64 1; 1IHW A; 1D3B A; 4UC4 A; 1U1S A; 2F5T X; 4EMK C; 2RK2 A; 5C6S A; 3OYL A; 2CP5 A; 3SDZ A; 2ROT A; 2LJ0 A; 1CSK A; 2V1R A; 2G6F X; 3G6E T; 1SSF A; 3QJY A; 5GAN 2; 3TSZ A; 2X4W A; 4CC2 A; 3JCM X; 3L2V A; 2FZG B; 2FRY A; 4M7A E; 1VQK A; 1AOJ A; 2JZ2 A; 1XOV A; 4M4Z A; 2JMA A; 4MDX A; 4FSS A; 1KC8 U; 3LH0 A; 2QG9 B; 3VS6 A; 5KE3 A; 5AYF A; 1GBR A; 2HMA A; 4ZGD B; 4YTL A; 1O75 A; 2H3E B; 4C8Q E; 1QKX A; 2VYT A; 4XTY A; 4AG1 C; 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