The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
|
sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
MEYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural analysis of the yeast SH3 domain proteome
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Pin3p
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PWT A; 1GFC A; 2GTJ A; 2DMO A; 1Y0M A; 2AZV A; 1VYU A; 2DJQ A; 1X69 A; 1K0S A; 1X43 A; 2RF0 A; 1YCS B; 2J05 A; 1Y57 A; 4Z89 A; 3EHQ A; 1XOV A; 1OPL A; 2YDL A; 3UA6 A; 1I1J A; 2D8J A; 2DVJ A; 2K79 A; 1GCP A; 4D8D A; 1HSQ A; 4Z8A A; 1MV0 B; 2GQI A; 4RTZ A; 2J6K A; 1WXT A; 2LCS A; 2DBM A; 1W6X A; 3VS5 A; 4J9G A; 1UG1 A; 1WX6 A; 1ZUY A; 1M8M A; 1BBZ A; 2JMA A; 2OAW A; 1LCK A; 2CH4 W; 1OEB A; 2F2V A; 2J6O A; 3JV3 A; 4ZNX A; 1KIK A; 1VYV A; 5EC7 A; 1KJW A; 2DL4 A; 4RUG A; 2YUO A; 3PE0 A; 1K1Z A; 2JXB A; 3NGP A; 2JMC A; 2KRS A; 2EYY A; 1SHG A; 1YWO A; 1G83 A; 3I9Q A; 2I0N A; 2GTO A; 1NYG A; 3ZL7 C; 2MOX A; 1J3T A; 2JM8 A; 1UHC A; 4AG2 C; 2DF6 A; 1BU1 A; 2F2W A; 4X1V A; 1AZG B; 2DNU A; 4JPB W; 1M3B A; 1YN8 A; 3TVT A; 2BTT A; 1ZSG A; 2RQW A; 1PKT A; 2DRM A; 1FYN A; 3H41 A; 2H8H A; 1MUZ A; 2FPE A; 1AEY A; 1QWF A; 1U3O A; 4GBQ A; 2M0Y A; 1NG2 A; 1JO8 A; 2D0N A; 3TSZ A; 4JJD A; 2DM1 A; 2HBW A; 3M0T A; 2HCK A; 4ESR A; 2AK5 A; 1QKX A; 1ARK A; 1IO6 A; 2K6D A; 4F16 A; 2KR3 A; 4CC3 A; 2GGR A; 1GL5 A; 3ULR B; 4HXJ A; 2L3S A; 3EG1 A; 2D1X A; 2B86 A; 2L3Q A; 2EYZ A; 4AG1 C; 2ENM A; 1WLP B; 1WXB A; 1NLP C; 2KT1 A; 4CC4 B; 2AZS A; 3NHN A; 2K2M A; 2SEM A; 1X27 A; 4RTW A; 1AWJ A; 1PRL C; 1UE9 A; 4OML A; 2KYM A; 3H0I A; 5I11 A; 2JS2 A; 2AKL A; 2PNI A; 2PZ1 A; 1X2K A; 2YSQ A; 1UUE A; 2JTE A; 2AKK A; 2CH4 A; 5FW9 A; 2GNC A; 1WA7 A; 4HCK A; 2FG0 A; 3VRY A; 1YNZ A; 3VS7 A; 4FSS A; 2C0I A; 4AFQ C; 2EYW A; 3NMZ C; 4JZ3 A; 2ROL A; 2OJ2 A; 4J9E A; 1AWX A; 1W1F A; 2JW4 A; 2KXD A; 4GLM A; 2CRE A; 4JJC A; 5ECA A; 2DE0 X; 4J9H A; 1NEB A; 4RTX A; 1PNJ A; 3VS3 A; 1I0C A; 1S1N A; 2CT4 A; 1SRL A; 2P4R A; 2KNB B; 3M0S A; 2FRW A; 3REA B; 2DIL A; 4M4Z A; 1UFF A; 2XMF A; 1WDX A; 1SHF A; 3VS0 A; 5FWB A; 2L3P A; 1RI9 A; 2DLP A; 2K3B A; 4AFS C; 1SEM A; 1YWP A; 3PVL A; 2LX7 A; 4HVV A; 4ORZ A; 3EGU A; 1CSK A; 2ABL A; 3M0Q A; 1JXM A; 2HSP A; 1AWO A; 1UTI A; 5IHI A; 1GBR A; 3UAT A; 4HVU A; 2LQN A; 3CQT A; 1TG0 A; 3NPF A; 1WIE A; 4OMM A; 1UJY A; 1QWE A; 1WI7 A; 4AFZ C; 4EIK A; 3UA7 A; 4J9I A; 1GRI A; 3R6N A; 3A98 A; 2V1R A; 1G2B A; 1NEG A; 2CDT A; 1YP5 A; 2GBQ A; 1H8K A; 4OMQ A; 3H0F A; 2DBK A; 2FPD A; 3VS2 A; 1UGV A; 2JS0 A; 1H92 A; 2LNH B; 4RTU A; 1AZE A; 2EKH A; 4RTY A; 3PVQ A; 2KRM A; 4AFU C; 2RNA A; 1WFW A; 1HJD A; 2ED1 A; 1M30 A; 1HD3 A; 1PRM C; 3EG0 A; 2VKN A; 2KRO A; 4J9B A; 3VRZ A; 2JT4 A; 4Z88 A; 3VS4 A; 1X2Q A; 2KRN A; 1MV3 A; 1N5Z A; 2KBT A; 1VYT A; 1ZBJ A; 5IXF A; 2LJ3 A; 1B07 A; 1VA7 A; 4D8K A; 5GJV B; 1JQQ A; 2MCN A; 3I35 A; 2C0T A; 2VVK A; 1SPK A; 1CKA A; 1W70 A; 1CKB A; 2L0A A; 3UF4 A; 5IXB A; 2LJ0 A; 2O2O A; 3SEM A; 1E6G A; 2A08 A; 1K76 A; 2F2X A; 4A63 B; 4LN2 A; 1WYX A; 2M51 A; 4DEY A; 4LNP A; 1FMK A; 2LP5 A; 1GCQ C; 2DL7 A; 4LUE A; 3THK A; 2BZY A; 1GCQ A; 1JU5 C; 3M0U A; 2ROT A; 2FRY A; 1E7O A; 3LH5 A; 3U23 A; 5FWC A; 4E6R A; 2K9G A; 1U06 A; 4Y92 A; 2YUP A; 3M0R A; 2KE9 A; 5GJW B; 1BK2 A; 5HCK A; 3QWX X; 4RTV A; 2V1Q A; 2OI3 A; 4KRT A; 3IQL A; 2J7I A; 3RBB B; 1UHF A; 1TUC A; 1U5S A; 1OV3 A; 5I22 A; 2VWF A; 2C0O A; 2RQR A; 2A36 A; 2QDL A; 2EGA A; 1KFZ A; 1Z9Q A; 1K4U S; 2ESW A; 1SSH A; 1X6B A; 1K9A A; 1OPK A; 1AVZ C; 1JEG A; 4DEX A; 2EGC A; 2YUN A; 4J9C A; 3EG3 A; 1ABQ A; 1GBQ A; 1QCF A; 1AWW A; 1NM7 A; 4LE9 A; 1T0H A; 3I5R A; 3EHR A; 1M27 C; 2A28 A; 4OMO A; 2LJ1 A; 2EPD A; 2KEA A; 1EFN A; 2E5K A; 4J9F A; 1PHT A; 2RN8 A; 4WCI A; 3TSW A; 4IIO A; 1A0N B; 1WXU A; 1M3A A; 4IIM A; 2DL5 A; 2EQI A; 4JZ4 A; 2X3W D; 3FJ5 A; 2JM9 A; 1SRM A; 2SRC A; 1RLQ C; 2IIM A; 1T0J A; 2KT8 A; 2ED0 A; 5L23 A; 2W10 A; 2O9V A; 2CSQ A; 1T3L A; 3H0H A; 2A37 A; 5IHN A; 4RTT A; 2D8H A; 2CSI A; 4F17 A; 3EG2 A; 2EYX A; 1E6H A; 3VS1 A; 2HEQ A; 1AD5 A; 3I5S A; 1QKW A; 3M0P A; 3O5Z A; 4QT7 A; 1ZX6 A; 1UJ0 A; 2LMJ A; 2J6F A; 2EBP A; 4K11 A; 1H3H A; 1I07 A; 2W0Z A; 2KGT A; 2DA9 A; 2NUZ A; 1AOJ A; 1Z9Z A; 2RPN A; 1GFD A; 2G6F X; 2J06 A; 1NYF A; 2CT3 A; 1RUW A; 1UEC A; 4HVW A; 3KFV A; 2KYB A; 2RQU A; 4J9D A; 4JJB A; 3REB B; 2DYB A; 2O9S A; 3QWY A; 2DRK A; 2O31 A; 4LUD A; 2K7A A; 1RLP C; 2CUD A; 2NWM A; 4CC2 A; 5IH2 A; 2O88 A; 2FEI A; 1BB9 A; 1B3Q A; 4R0K A; 2HDA A; 3GBQ A; 1ZUU A; 1V1C A; 2LQW A; 2PTK A; 4OMP A; 2EVR A; 2X3X D; 1OOT A; 2FO0 A; 2RQT A; 4CC7 A; 1KSW A; 2L2P A; 1X6G A; 2DL3 A; 2LZ6 B; 1TUD A; 4F14 A; 2MIO A; 2RQV A; 2YUQ A; 2FPF A; 3SHW A; 1NLO C; 2KXC A; 2ECZ A; 2DL8 A; 1ZLM A; 2EW3 A; 3RNJ A; 2DX1 A; 1ZUK A; 1QLY A; 1UDL A; 2RMO A; 3VS6 A; 3C0C A; 1ABO A; 2YT6 A; 1T3S A; 1PKS A; 2BZ8 A; 4OMN A; 5IHK A; 2CUB A; 1JXO A; 1M3C A; 2BZX A; 1K0X A; 2EGE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2GTJ A; 4PLI A; 3QDR B; 1Y0M A; 4EMH A; 1X6O A; 3DKM A; 1X43 A; 1K8A R; 1Y71 A; 3QDF A; 3CCM A; 2OTL Q; 3WVD B; 1Q7Y R; 1RAF B; 3HPW A; 3E1S A; 2K79 A; 4HCC A; 1HSQ A; 4Z8A A; 2EKO A; 1TS9 A; 1NZ9 A; 2LCS A; 2J6K A; 1WXT A; 2L3R A; 3UPU A; 2DBM A; 4C5G A; 2LC4 A; 3VS5 A; 4J5Y A; 1UG1 A; 2K5I A; 2QA4 T; 2YRD A; 3CXC S; 1BBZ A; 1D1C A; 2RI3 A; 4EMK B; 1QCO A; 1VQL Q; 3JV3 A; 2DKG A; 4EPC A; 2V8K A; 2X35 A; 1O9S A; 4XTZ A; 1BCM A; 2JXB A; 4M7D D; 3PIP A; 2JMC A; 3G71 A; 5J26 A; 1K73 R; 1UEB A; 1QVF S; 4JDS A; 1PSF A; 4FIB A; 2DEU A; 1TU0 B; 4XTX A; 2EJF A; 4AG2 C; 1K8A C; 1BU1 A; 4PFZ A; 1AZG B; 3V8L A; 3C12 A; 4M78 B; 2LT4 A; 4M77 C; 3RDV A; 4M7A C; 3L2Z A; 2RQW A; 3TU4 K; 4M7D A; 1F1B B; 4J6Y A; 5LJ5 h; 2FL7 A; 1U3O A; 4GBQ A; 4ZN3 A; 4BE2 A; 2M0Y A; 3T9N A; 5LJ5 f; 2MWP A; 4E2F B; 1W4S A; 4C8Q C; 3CCS Q; 5AT1 B; 2DM1 A; 3G6E A; 1OU9 A; 3X25 B; 2HCK A; 4F16 A; 5HY6 A; 5LJ3 j; 1OI1 A; 1G3Y A; 2D1X A; 2B86 A; 4PJO D; 2ENM A; 2EJ9 A; 1OZ3 A; 3A5Z B; 4B9W A; 1Q81 C; 4RTW A; 3N5B B; 3OYJ A; 4C5H A; 2X51 A; 1M2O A; 2M16 A; 2AKL A; 3CCU Q; 1AT1 B; 1QVF A; 2PNI A; 4M75 G; 1YI2 Q; 2QA4 A; 2YSQ A; 2JN0 A; 4L59 A; 2CH4 A; 5HK0 A; 2QGF B; 3VRY A; 4WTO B; 2C0I A; 4AFQ C; 3MJX A; 2DPP B; 3JCM V; 4HT8 A; 2FZG B; 2O4X B; 1AWX A; 4DBH A; 3NTH A; 2DO3 A; 1PNJ A; 2QEX A; 1TWB A; 2CT4 A; 4QKU A; 4GLK A; 4M75 F; 2FRW A; 1VQN Q; 1VQ4 A; 1UFF A; 4RG8 A; 1WDX A; 2E70 A; 2MAM A; 1H3Z A; 2DLP A; 3MHX A; 4JRP A; 4ANJ A; 3I55 T; 4ORZ A; 3G6E T; 1S72 A; 3A8G B; 4J83 A; 2ABL A; 3SWN B; 2CP6 A; 1JXM A; 3FB9 A; 3UAT A; 4YTL A; 1TG0 A; 1WIE A; 1QWE A; 3EG9 B; 4BI8 B; 1WI7 A; 4EIK A; 1BCO A; 2QG9 B; 4ME7 A; 3L1A A; 3JCM d; 2V1R A; 2DTO A; 3JCM h; 2DIQ A; 3EGX B; 1VIE A; 3J80 E; 1H8K A; 1HYO A; 2IPO B; 5C6S A; 1MMA A; 3V8J A; 3BY7 A; 1ZSZ C; 4JJN K; 4RTY A; 3PVQ A; 1EX4 A; 4RG2 A; 1YHQ Q; 2QEX Q; 3JCM J; 1JJ2 S; 1M2V B; 2ED1 A; 1M30 A; 1Q7Y U; 4KBM B; 4C8Q G; 3LH0 A; 5IXF A; 1B07 A; 1VA7 A; 1VUB A; 1UGS B; 1UGQ B; 3CBO A; 2HQX A; 1CKA A; 4BDY A; 1W70 A; 3UF4 A; 1VQ6 Q; 4RKU E; 4XU0 A; 8ATC B; 5IXB A; 3PIO A; 2O2O A; 3PMI A; 3SEM A; 1E6G A; 2ZPB B; 1H64 1; 1K76 A; 3V8K A; 1N8R U; 4BD3 A; 2F2X A; 2QXF A; 3OYB A; 4LN2 A; 2RI5 A; 1WYX A; 5AYF A; 1FMK A; 2LP5 A; 1M1K U; 2HKQ B; 2E3H A; 3M55 A; 3QHS A; 1WGS A; 5GAO r; 2DL7 A; 1MHN A; 2A7Y A; 2FRY A; 3M5A A; 1E7O A; 3LH5 A; 3ZBD A; 5GAN 2; 2HZY A; 4E6R A; 3CCQ A; 2CZ7 B; 3G71 T; 2JJ9 A; 4OB0 B; 2KE9 A; 5GJW B; 4XU2 A; 2ZZD A; 3QWX X; 3CCU A; 3CCL T; 2OI3 A; 2JNG A; 3IQL A; 2J7I A; 1VQO A; 1TUC A; 3L2W A; 3CPW A; 1OV3 A; 2MPX C; 5I22 A; 3EFR A; 4RMO A; 1LOJ A; 1KQS S; 2RQR A; 5IN1 A; 2KVQ G; 1KFZ A; 3PMT A; 1Z9Q A; 3LWI A; 4MDX A; 1K4U S; 1WZO A; 4J6X A; 2P84 A; 1QVP A; 1AVZ C; 3BW1 A; 4J9C A; 1ABQ A; 4NOY A; 4C92 F; 3A8L B; 4J7F A; 2JUF A; 5FLX E; 5CKE A; 4FYY B; 3OYA A; 4PJJ A; 1T0H A; 3OYY A; 3EHR A; 5GAN 5; 1D1B A; 3OYL A; 4M78 G; 2EPD A; 1PD1 A; 3OMC A; 3EGD A; 2K3X A; 1XJW B; 1G3S A; 2O4X A; 1IHW A; 4J7I A; 2R5M A; 3G6E Q; 1EIF A; 1KC8 U; 2RJD A; 3V7C A; 7AT1 B; 2XDD A; 1KQ2 A; 4PL6 A; 1LVK A; 5A0L A; 2KT8 A; 5L23 A; 2O9V A; 5LJ3 h; 1MNE A; 1VOM A; 4C0F A; 1T3L A; 1G3W A; 2CSI A; 2R57 A; 5LJ3 f; 1RAD B; 5GAN j; 3VS1 A; 2VAS A; 1R8O B; 1KD1 U; 4K11 A; 1H3H A; 2EQM A; 4E47 A; 1WHJ A; 1TUG B; 1KD1 R; 4IKF A; 2E5Q A; 1GXI E; 3E9G A; 4J8O A; 4JS5 A; 2XDP A; 3GOX A; 3OW2 A; 2CT3 A; 1TH7 A; 1I4K 1; 1YCY A; 1RUW A; 2VC8 A; 2VGN A; 4WF2 A; 1UEC A; 3DB3 A; 2KYB A; 1VQ9 Q; 2RQU A; 4HT9 A; 1TSF A; 3QWY A; 5GAN h; 1I8F A; 2RH2 A; 2DRK A; 1WPY A; 2Y4X A; 2K7A A; 1Q81 U; 1QW1 A; 5D6W A; 4CC2 A; 1B3Q A; 2HDA A; 4N4G A; 4DBR A; 1V1C A; 1VQ5 T; 4CC7 A; 1X01 A; 1KK7 A; 2Z0W A; 3I55 Q; 4AT1 B; 3OS1 A; 3CCJ A; 2HNI A; 1NLO C; 4QVC A; 3M59 A; 2FHD A; 1YJ9 Q; 2BKD N; 3UT1 A; 2RM4 A; 4CI0 C; 1ZUK A; 2XIC A; 2X4W A; 2YT6 A; 1T3S A; 2D6F A; 3HRU A; 2CUB A; 9ATC B; 2DIG A; 1JXO A; 2BZX A; 3CMA T; 4C92 C; 1GFC A; 5FU6 B; 2RI2 A; 2DJQ A; 4JLI A; 1LPL A; 3RMQ A; 5GAN 3; 1K0S A; 5A0D A; 3JSC A; 4MZT A; 1Y57 A; 2RHZ A; 3S6W A; 3EHQ A; 4M78 D; 2A0F B; 2EJG A; 1U8R A; 3AT1 B; 4M7D G; 3UA6 A; 3BDL A; 2D8J A; 3QJ6 A; 1N8R R; 1MV0 B; 2GCX A; 3NTI A; 4M75 C; 5KCO A; 2LQK A; 2ZCF B; 2VXE A; 4J9G A; 3RES A; 1ZUY A; 1SG5 A; 2JMA A; 1LCK A; 2CH4 W; 3OW2 S; 2DJZ A; 1S72 T; 1QQJ A; 4EMK A; 2YRC A; 3I55 A; 2KQW A; 4FYX B; 4RUG A; 1OX8 A; 5KCH A; 3RR6 A; 2DTH A; 1K1Z A; 4E7I A; 4FSX A; 3MET A; 2EYY A; 1RAH B; 1ZA1 B; 3BE3 A; 3F70 A; 2KI7 A; 1YWO A; 2I0N A; 1FX7 A; 5FRO A; 2GTO A; 1NYG A; 3ZL7 C; 1Q7Y C; 3JB9 F; 3FIF A; 4DOV A; 2JM8 A; 2ZGW A; 2F1L A; 2O01 E; 2CP7 A; 1IRX A; 1VQM T; 3NFC A; 4M77 B; 4M7A B; 3VUB A; 4X1V A; 5DLO A; 4PK4 A; 2DNU A; 5GAN 6; 5CQY A; 4O5V A; 1WQW A; 1WHM A; 5KYU B; 5LJ3 g; 1ZSG A; 2H8H A; 1MUZ A; 3OW2 P; 1AEY A; 4QVZ A; 5GAN 4; 1O75 A; 3G4S Q; 1NG2 A; 5GMK l; 2F69 A; 2KSS A; 4ELZ C; 3INZ A; 1RL2 A; 2D0N A; 4E7Z A; 1D0Y A; 3CCR A; 3CCE Q; 2HBW A; 1JJ2 A; 4M77 G; 4M7A G; 1M1K C; 4DBQ A; 1ARK A; 1IGQ A; 1Q81 R; 1VQ7 A; 2PUK B; 2HKN A; 4IUR A; 4CC3 A; 5KYY A; 1GL5 A; 1LJO A; 3QYG B; 4M77 F; 4M7A F; 4C8Q D; 1WLP B; 1WXB A; 1NLP C; 1Q86 R; 1PSE A; 2QA4 Q; 4BAC A; 1WHH A; 3Q1J A; 2JTF A; 2SEM A; 4OML A; 2DET A; 3C4S A; 4F7U B; 1M90 U; 2CYZ B; 2PZ1 A; 1X2K A; 1LNX A; 2P4T A; 3M54 A; 2OTL T; 2AKK A; 2LCL A; 3HRS A; 1D3B B; 2RD1 A; 1RAE B; 4HCK A; 1MMD A; 4LD6 A; 3VS7 A; 3NMZ C; 2WSC E; 2RHI A; 2OJ2 A; 4HKE A; 3G7Z A; 4GLM A; 1YI2 A; 3E9F A; 2G3R A; 1M90 R; 3SD4 A; 3JCM c; 2RHU A; 3MPU B; 1FMV A; 2AT1 B; 3REA B; 1SHF A; 5FWB A; 5GAM g; 3EG9 A; 4NS5 A; 1SEM A; 2RJC A; 5KYU A; 1NE8 A; 3EGU A; 3QG1 A; 2NLU A; 3OBW A; 4PJO B; 2MYS A; 5KH6 A; 1AWO A; 1UTI A; 5IHI A; 3X20 B; 4N0A A; 5CAI A; 3WVE B; 2VXF A; 4X9C A; 5J3B A; 3QBY A; 3QZ9 B; 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