The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
b'MEYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Pin3p
|
| publication title |
Structural analysis of the yeast SH3 domain proteome
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
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| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ROL A; 1AWO A; 1ZBJ A; 1E6H A; 3JV3 A; 1I1J A; 2J06 A; 2P4R A; 2CUB A; 1UDL A; 5GJW B; 2C0I A; 1YNZ A; 4CC2 A; 3H0H A; 1H8K A; 3UF4 A; 2J6K A; 1KIK A; 1K9A A; 2LQW A; 1M3A A; 1X43 A; 4Z88 A; 3PVQ A; 3VRY A; 2A37 A; 1PKS A; 1VYV A; 3R6N A; 3PVL A; 1WLP B; 2HBW A; 2HCK A; 1QWE A; 2OJ2 A; 3VS3 A; 1SRM A; 2SRC A; 2HDA A; 1ZUY A; 2LJ1 A; 1UFF A; 1QLY A; 2GGR A; 2LQN A; 1AD5 A; 1U5S A; 3QWX X; 4GBQ A; 2FG0 A; 3M0R A; 3THK A; 1JQQ A; 3LH5 A; 4D8K A; 2KGT A; 4ESR A; 2F2W A; 2KE9 A; 2EGA A; 2K2M A; 4AFZ C; 1GL5 A; 1OV3 A; 2L0A A; 4AFQ C; 2IIM A; 1YWP A; 4AG2 C; 3SEM A; 3EHR A; 2DF6 A; 1MUZ A; 3CQT A; 5IHI A; 1RLP C; 2M0Y A; 1WIE A; 3VS4 A; 1AZE A; 2ABL A; 4CC3 A; 2X3W D; 1A0N B; 2PNI A; 1T3L A; 4RTX A; 2KT8 A; 4J9F A; 2KXC A; 3H41 A; 4D8D A; 2DL8 A; 2JM9 A; 1XOV A; 2M51 A; 2DLP A; 2DE0 X; 4HCK A; 5IHN A; 1Y57 A; 2EVR A; 1AWJ A; 4LNP A; 2AZV A; 1UHC A; 1WYX A; 3EG0 A; 4EIK A; 4Z8A A; 1KJW A; 2EYW A; 2FPE A; 4RTZ A; 3H0F A; 2O88 A; 3VS1 A; 4KRT A; 1SRL A; 3I5R A; 3REA B; 2K7A A; 1FMK A; 4IIM A; 1LCK A; 2YUP A; 2RPN A; 2GQI A; 1CSK A; 1YWO A; 4LE9 A; 5I22 A; 2C0T A; 1VYT A; 2D8H A; 1WFW A; 3TSZ A; 2K9G A; 2FRY A; 1QKX A; 4RUG A; 1WXU A; 4J9B A; 4DEY A; 2DBM A; 1SSH A; 1YCS B; 2RQU A; 3I35 A; 1GFD A; 1YN8 A; 3O5Z A; 5IHK A; 2DRM A; 2VVK A; 2GNC A; 1YP5 A; 2JMA A; 2CT4 A; 4RTY A; 1WX6 A; 2XMF A; 2NWM A; 2RNA A; 4E6R A; 2DA9 A; 2V1Q A; 1RI9 A; 4OMP A; 1OPK A; 1QKW A; 1SHF A; 5FWB A; 1GBQ A; 2DX1 A; 4IIO A; 2L3P A; 1ZLM A; 1K0X A; 4HVW A; 1W1F A; 1X6B A; 4HXJ A; 2YDL A; 2A36 A; 1W70 A; 2EW3 A; 2NUZ A; 2OI3 A; 3NGP A; 5FWC A; 3EG3 A; 2ECZ A; 3IQL A; 2CSI A; 2PZ1 A; 1G2B A; 2DMO A; 1ABO A; 2W10 A; 4JJD A; 2BZX A; 2L2P A; 2PTK A; 1WDX A; 5FW9 A; 2JM8 A; 2GTO A; 2O31 A; 2ESW A; 1W6X A; 1U3O A; 1UE9 A; 4LUD A; 1ABQ A; 1NLP C; 2K3B A; 3NHN A; 4J9D A; 1BB9 A; 2O9S A; 2RMO A; 1N5Z A; 2RQW A; 2CH4 A; 4M4Z A; 2L3S A; 2CRE A; 2EYZ A; 2JS2 A; 2QDL A; 5ECA A; 4A63 B; 2DL7 A; 2DL3 A; 2EPD A; 1PRM C; 1K0S A; 1TG0 A; 2YT6 A; 2DL5 A; 5GJV B; 1AWX A; 4OMM A; 3VS0 A; 4RTT A; 4AFU C; 3KFV A; 1NG2 A; 1FYN A; 1SPK A; 2DM1 A; 1JU5 C; 1X27 A; 2JXB A; 2RQV A; 1Z9Q A; 3VRZ A; 2K6D A; 1PKT A; 2DRK A; 2F2X A; 2FEI A; 2DJQ A; 3PE0 A; 3VS6 A; 2ENM A; 1K76 A; 1NEB A; 1WA7 A; 1ARK A; 3M0Q A; 4JJC A; 1NYF A; 3C0C A; 4RTU A; 4R0K A; 2YSQ A; 4HVU A; 4DEX A; 5IXB A; 3I9Q A; 4JJB A; 4LN2 A; 1J3T A; 1EFN A; 1UTI A; 1CKB A; 3ZL7 C; 3RBB B; 1PNJ A; 1E7O A; 3EGU A; 1RLQ C; 1T3S A; 2CT3 A; 2YUN A; 1QCF A; 1UJY A; 2LZ6 B; 5I11 A; 2J7I A; 1HJD A; 1NYG A; 4ZNX A; 1QWF A; 2KRO A; 1WI7 A; 2LP5 A; 4F16 A; 1KFZ A; 4OMN A; 2D1X A; 1BK2 A; 2K79 A; 2BZY A; 2I0N A; 2EKH A; 2KEA A; 2VKN A; 1T0H A; 1HD3 A; 3A98 A; 2F2V A; 2EGE A; 2FPF A; 1OEB A; 2VWF A; 1K4U S; 1NLO C; 2RQT A; 4JPB W; 1E6G A; 4OMO A; 1AWW A; 1SEM A; 2A28 A; 3NPF A; 4Z89 A; 1ZUK A; 4AFS C; 4FSS A; 1H3H A; 1K1Z A; 2J6F A; 1BU1 A; 1M3B A; 4Y92 A; 1TUC A; 1G83 A; 4WCI A; 2AKL A; 5EC7 A; 2BTT A; 2CDT A; 2LNH B; 2LMJ A; 3NMZ C; 1MV3 A; 2ED1 A; 1UEC A; 2EGC A; 3EHQ A; 1VYU A; 1AVZ C; 3TVT A; 3M0S A; 2FRW A; 1HSQ A; 2JTE A; 2KNB B; 2ROT A; 2HEQ A; 2KT1 A; 3UAT A; 2ED0 A; 2JMC A; 2D8J A; 2YUO A; 5HCK A; 3U23 A; 1M30 A; 1UG1 A; 3VS5 A; 2O2O A; 3I5S A; 1S1N A; 3GBQ A; 2JS0 A; 1SHG A; 5IH2 A; 2OAW A; 2KRM A; 4F14 A; 3UA6 A; 2HSP A; 1B07 A; 3VS7 A; 3REB B; 2GTJ A; 4F17 A; 1RUW A; 2LX7 A; 2DNU A; 2V1R A; 1WXB A; 2W0Z A; 1X6G A; 4RTV A; 1Z9Z A; 2DYB A; 2RQR A; 4CC4 B; 1H92 A; 1WXT A; 3ULR B; 1X2Q A; 2FO0 A; 2KXD A; 3H0I A; 2KYB A; 1MV0 B; 2KRS A; 4LUE A; 2JW4 A; 4JZ3 A; 4AG1 C; 1TUD A; 1X2K A; 4CC7 A; 3EG2 A; 2B86 A; 1UGV A; 2KRN A; 1AOJ A; 4X1V A; 1JXM A; 1NEG A; 1UHF A; 2J05 A; 2DL4 A; 2C0O A; 1PWT A; 1GRI A; 2L3Q A; 2D0N A; 4J9H A; 1PHT A; 2E5K A; 1PRL C; 3M0T A; 5L23 A; 1JEG A; 2KBT A; 2KYM A; 1CKA A; 4JZ4 A; 4HVV A; 2JT4 A; 2CUD A; 1X69 A; 1AEY A; 2CSQ A; 2DIL A; 1JXO A; 2AKK A; 4J9E A; 5IXF A; 2GBQ A; 1BBZ A; 1IO6 A; 3SHW A; 1KSW A; 1GCP A; 1M3C A; 3M0P A; 4QT7 A; 2EQI A; 1Y0M A; 2EYY A; 2CH4 W; 4GLM A; 1GFC A; 3M0U A; 1ZSG A; 3TSW A; 3EG1 A; 1I07 A; 1T0J A; 1VA7 A; 1M8M A; 2AZS A; 1I0C A; 2A08 A; 2BZ8 A; 1GBR A; 2SEM A; 3UA7 A; 4OML A; 1GCQ A; 2AK5 A; 4K11 A; 2MCN A; 1AZG B; 3FJ5 A; 2LJ3 A; 1UUE A; 2MOX A; 1JO8 A; 4J9G A; 2RN8 A; 1U06 A; 1OOT A; 1ZX6 A; 4J9C A; 4ORZ A; 2O9V A; 1NM7 A; 4J9I A; 3RNJ A; 4OMQ A; 1M27 C; 2MIO A; 1UJ0 A; 2DVJ A; 2H8H A; 2YUQ A; 1OPL A; 1B3Q A; 2EYX A; 2DBK A; 2G6F X; 3VS2 A; 2X3X D; 3QWY A; 4RTW A; 2LCS A; 1ZUU A; 2RF0 A; 2LJ0 A; 1V1C A; 2J6O A; 2EBP A; 1GCQ C; 2FPD A; 2KR3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2V8I A; 2M16 A; 5KYU B; 1ZBJ A; 3JV3 A; 1M2V A; 5A0G A; 2KVQ G; 1UDL A; 1QW1 A; 2DXU A; 1YNZ A; 4M7D A; 3OW2 S; 3CXC A; 4HT9 A; 2DVE A; 3HSB A; 2LQW A; 1QVG S; 4E7K A; 3EG9 B; 4MDX A; 2A0F B; 4M75 E; 3VRY A; 2A37 A; 3MEV A; 3JAM E; 3ASK A; 1K8A U; 2E70 A; 1BI3 A; 1WHJ A; 3TRE A; 2OJ2 A; 3CCQ A; 1H64 1; 2SRC A; 5GAO r; 4X34 A; 1QLY A; 1N9R A; 2RK2 A; 3A8L B; 3QWX X; 1ZQ1 A; 4GBQ A; 3JB9 G; 4OVA A; 4IUV A; 3SWN A; 1D3B A; 2FG0 A; 5AYF A; 1DJ7 B; 5CR2 A; 3LH5 A; 5DLO A; 3L2W A; 1LVK A; 2EGA A; 3ZFJ A; 3M55 A; 2F69 A; 1OV3 A; 3ER0 A; 4JUV A; 4RKU E; 2QQR A; 4BUG A; 2OTJ Q; 1MUZ A; 2M0Y A; 1Y7X A; 3VS4 A; 1NPP A; 3E2U A; 4C0Z A; 4KT0 E; 1PD0 A; 1A0N B; 3QYG B; 3H9N A; 1Q95 G; 3NTH A; 4JS5 A; 5FU6 B; 2RJF A; 3LYI A; 2DTH A; 2DTO A; 4D8D A; 2DL8 A; 2R57 A; 3PIO A; 2BKD N; 2BIV A; 2CKK A; 4RCC A; 4HCK A; 3QJ6 A; 2DD4 A; 1VQO T; 3OYJ A; 2AZV A; 2HL3 A; 5KE3 A; 4A54 A; 1Y96 A; 5LJ3 d; 4KRT A; 2RB6 A; 4N4I A; 1SRL A; 1ZSZ A; 1M2V B; 4TVR A; 3CEY A; 2XU8 A; 1IGQ A; 1C1A A; 5KYW A; 4M7D B; 4M78 G; 1LCK A; 3NTI A; 3FLG A; 3OBY A; 4ZGD B; 3HPW A; 2YUP A; 4BI8 B; 3CCE T; 2FL7 A; 2FZK B; 5KYY A; 2XIC A; 5LJ3 f; 1PC0 A; 2C0T A; 1VYT A; 1WFW A; 2X4W A; 2P4T A; 2EAY A; 1QKX A; 1KC8 C; 1Q82 U; 1WXU A; 3CCL A; 2CP7 A; 4N0A C; 4Z02 A; 4LDV A; 2GFA A; 5LJ5 d; 4KGV B; 1Q7Y C; 4VUB A; 2QI2 A; 2OTL T; 1YP5 A; 1D3B B; 2JMA A; 1K9M C; 1S72 Q; 5GAN 7; 4IUT A; 2DA9 A; 5AT1 B; 2FHD A; 1GBQ A; 1Q7Y R; 1M90 R; 1I5L A; 4B6M A; 1QVF A; 1ZLM A; 3OA6 A; 2XDB A; 4C92 F; 4HCB A; 5LJ5 f; 3CCQ Q; 1W1F A; 1KD1 C; 1Q86 U; 3L1A A; 4HXJ A; 2DYI A; 2YDL A; 5D6Y A; 3CCM T; 2NUZ A; 4EPC A; 1RAC B; 3EG3 A; 5FWC A; 3O8V A; 2PZ1 A; 2DMO A; 1NZ9 A; 5GAN 5; 1KD1 R; 1LNX A; 2PTK A; 1JJ2 A; 4FYV B; 3JCM V; 2JM8 A; 1W6X A; 2YRV A; 1O75 A; 1BCM A; 4LUD A; 3MKD A; 5GAN h; 5HKC A; 1R8O B; 3OMG A; 3NHN A; 2X51 A; 4C8Q G; 2CH4 A; 3QBY A; 2K3X A; 1IXD A; 1RAD B; 4EMK A; 2DL3 A; 1PRM C; 1Y96 B; 1PCX A; 3MP1 A; 4M78 A; 1TUG B; 2YT6 A; 1ZSZ B; 1WNL A; 3CMA A; 4PJO A; 1AWX A; 3HTR A; 5KYW B; 4HKE A; 4FT4 A; 4RTT A; 3CD6 Q; 2CP3 A; 4A4K A; 3MP8 A; 1FYN A; 2DM1 A; 2XDD A; 3OB9 A; 3P8H A; 5KYY B; 4XTY A; 3QZ5 B; 2XI9 A; 1X27 A; 2JXB A; 1Z9Q A; 5I2M A; 3PE0 A; 2FEI A; 5A0D A; 2E64 A; 3J7A F; 4BE0 A; 3FRN A; 4JJC A; 3DLM A; 4RTU A; 7AT1 B; 2YSQ A; 4C0D B; 5IXB A; 4JJB A; 1J3T A; 3I55 T; 1CKB A; 3ZL7 C; 3RBB B; 1PNJ A; 1VQM A; 3G6E A; 2YUN A; 4FYW B; 4R55 A; 2PUK B; 1BIB A; 4ZNX A; 5C6S A; 5DM7 R; 3QII A; 4BY6 B; 4PL6 A; 2EYQ A; 2LP5 A; 1MHN A; 2QA4 T; 2KK4 A; 3CCL Q; 2I2L A; 4EDU A; 4C8Q E; 1K4U S; 4J6Y A; 1YI2 T; 1NLO C; 2QTX A; 2RQT A; 1E6G A; 3BDU A; 4E47 A; 1AWW A; 4LD9 K; 2A28 A; 1K1Z A; 1WPY A; 2J6F A; 4DOW A; 1G83 A; 2HMA A; 4WCI A; 2AKL A; 2ZZD A; 3CPW A; 4OMF B; 3CCS Q; 2ED1 A; 2R58 A; 3CCU A; 2ATC B; 1PG5 B; 3TVT A; 2E65 A; 2JTE A; 2ROT A; 1M1K U; 4EMK B; 3CBP A; 1TWB A; 2JMC A; 4M78 B; 2MPX C; 1PSF A; 2E3H A; 3BFM A; 1OZ2 A; 1UG1 A; 3VS5 A; 1VQ9 A; 1OU8 A; 3E9G A; 4PJO B; 4BI4 A; 3ZBD A; 3OYL A; 2HL5 C; 4F17 A; 3LW5 E; 3VS7 A; 5J39 A; 4E7J A; 2LX7 A; 1JBM A; 4PNO A; 1X6G A; 1Z9Z A; 4KUL A; 2RK1 A; 2JTM A; 4CC4 B; 1RAB B; 5CQY A; 3HL8 A; 1FX7 A; 3ULR B; 1YI2 A; 2O01 E; 1FMW A; 2KYB A; 1MNE A; 2KRS A; 3AHU A; 3ME9 A; 4JZ3 A; 2VXF A; 4ZGE B; 1X2K A; 2KRN A; 1M1F A; 3CC4 T; 3CC7 T; 3L2Z A; 5FU7 C; 1UHF A; 2MF2 A; 2C0O A; 1GRI A; 1KK7 A; 1PHT A; 2AIR B; 1PRL C; 3M0T A; 1JEG A; 1VIE A; 4M7A G; 2KYM A; 5LJ3 h; 1MND A; 2MMP A; 2JT4 A; 2GCX A; 3QZ9 B; 4E7S A; 1BI2 A; 1X69 A; 2RHZ A; 4OB0 B; 1AEY A; 2CSQ A; 4J9E A; 2GBQ A; 5HK0 A; 1KSW A; 1D0X A; 3M0P A; 2M9U A; 2CZ1 B; 4GLM A; 2CH4 W; 1VQM Q; 3G6E Q; 1ZSG A; 5GMK m; 1JB0 E; 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2JUF A; 3HP9 A; 1OI1 A; 4AFQ C; 3PT9 A; 1YWP A; 1LOJ A; 5CAI A; 1X01 A; 4RG2 A; 4J7F A; 5IHI A; 1RLP C; 2RI5 A; 8ATC B; 2ABL A; 3OYI A; 4C92 C; 2X3W D; 3VV0 A; 2QYZ A; 2PNI A; 2VAS A; 4RTX A; 3OYC A; 1VQ8 T; 1TS9 A; 2BUD A; 1KG1 A; 2RA2 A; 1VQL T; 2LT1 A; 4F7U F; 2DE0 X; 4O6J A; 3X20 B; 3D7S B; 2EYW A; 1AT1 B; 2L3R A; 2FPE A; 3H0F A; 3VS1 A; 3L42 A; 3REA B; 3S6W A; 3RKW A; 1M9S A; 1I5O B; 2MWP A; 2LCC A; 1D09 B; 2B8A A; 3PIP A; 3OYM A; 2V8K A; 3CXC P; 2YRC A; 4IIM A; 1G3W A; 3CCR Q; 1KC8 U; 5DY9 A; 1YWO A; 1Q81 C; 3X28 B; 5I22 A; 4J83 A; 4WTO B; 1QVF S; 2RO0 A; 4F04 B; 1Q7Y U; 1M90 U; 2DBM A; 1Q81 R; 2CGH A; 4E7I A; 1U8R A; 1YCS B; 4M7D E; 1IHV A; 3MEA A; 2VGN A; 2QEX A; 3NTK A; 2GQV A; 2XMF A; 4XAX B; 4E6R A; 2DJZ A; 2V1Q A; 4OMP A; 9ATC B; 1SHF A; 5FWB A; 1KD1 U; 5LJ3 j; 3LWH A; 5GMK j; 4FW1 A; 4IIO A; 4OB3 B; 3OYE A; 3FDR A; 3G71 A; 1KQS A; 3VUB A; 4NL3 A; 1YJW Q; 3TEE A; 2VGM A; 1VQ6 T; 2AHJ B; 2CSI A; 1ABO A; 2W10 A; 4MZM A; 2VUB A; 2O31 A; 1YIJ A; 1U3O A; 1ABQ A; 3PGG A; 1IHW A; 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