The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
|
Chain Sequence |
b'MEYVEALYQFDPQQDGDLGLKPGDKVQLLEKLSPEWYKGSCNGRTGIFPANYVKPAF'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Pin3p
|
| publication title |
Structural analysis of the yeast SH3 domain proteome
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Protein binding
|
| total genus |
11
|
| structure length |
57
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| sequence length |
57
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-01-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4FSS A; 4RTT A; 1BU1 A; 1UEC A; 2ROL A; 1QWE A; 4X1V A; 1KIK A; 2A08 A; 2BZX A; 1K4U S; 1ZX6 A; 4LNP A; 1U3O A; 4J9C A; 2IIM A; 1RI9 A; 1SPK A; 1H92 A; 1H3H A; 1OOT A; 4OMQ A; 1UG1 A; 3M0S A; 1MV0 B; 5IXF A; 1G83 A; 1GFD A; 2EYX A; 1YNZ A; 2GTJ A; 1NM7 A; 1BB9 A; 2AZS A; 2G6F X; 2YDL A; 1PNJ A; 4ZNX A; 1WXU A; 2YUO A; 1U5S A; 4J9G A; 1RLQ C; 2RPN A; 3JV3 A; 1JEG A; 3THK A; 1M3A A; 4CC4 B; 1ABQ A; 1VA7 A; 2DF6 A; 2LP5 A; 3M0P A; 2KBT A; 1GBQ A; 2KXC A; 1ZBJ A; 1VYV A; 1PHT A; 1HSQ A; 1HJD A; 2MIO A; 1JO8 A; 1SEM A; 2K9G A; 1NEB A; 2LMJ A; 4LE9 A; 5GJW B; 2V1Q A; 4AG1 C; 1NLO C; 2EGC A; 1NYG A; 2XMF A; 1WFW A; 2BTT A; 2W10 A; 1XOV A; 2LCS A; 1NEG A; 2K2M A; 2VWF A; 3VS4 A; 2EKH A; 3EG1 A; 2D1X A; 1Z9Q A; 2K6D A; 1X6G A; 2DL3 A; 1SRL A; 1NG2 A; 1TG0 A; 1K76 A; 3PVL A; 1AZE A; 2A36 A; 3UA7 A; 1G2B A; 2BZ8 A; 1E6G A; 1M8M A; 3KFV A; 2PNI A; 4R0K A; 1T3S A; 1X2Q A; 2AKK A; 1AWJ A; 4OMO A; 1WI7 A; 2RF0 A; 1V1C A; 2H8H A; 4RTW A; 2KYB A; 3CQT A; 4M4Z A; 3SHW A; 4AFQ C; 2C0I A; 2K7A A; 1GCQ C; 2DL5 A; 3VS1 A; 2RQW A; 2YUP A; 3H0I A; 2DYB A; 3M0Q A; 1SHG A; 3VRY A; 1UUE A; 2L3S A; 4LN2 A; 1X69 A; 1ABO A; 3PVQ A; 1NLP C; 4F16 A; 1VYU A; 1JXO A; 2KYM A; 4ESR A; 2DNU A; 4RTX A; 2O88 A; 3H0F A; 1QKW A; 1WXB A; 2LNH B; 1AWO A; 1W1F A; 1GCQ A; 1JQQ A; 2O31 A; 2B86 A; 1H8K A; 2EYW A; 3EHR A; 1AWW A; 1U06 A; 2L3P A; 3ZL7 C; 3A98 A; 1QCF A; 4Y92 A; 1OPL A; 1B07 A; 2JM8 A; 1IO6 A; 2GQI A; 2KXD A; 1KJW A; 1K0S A; 4IIM A; 2DVJ A; 4J9B A; 3REB B; 2GTO A; 4Z88 A; 1TUD A; 5EC7 A; 3VS6 A; 2LJ3 A; 1I0C A; 4AFS C; 1OV3 A; 4F17 A; 5HCK A; 2FRY A; 4GLM A; 2JMA A; 2LJ0 A; 2J06 A; 5IHN A; 1B3Q A; 4JJD A; 2LQN A; 2OI3 A; 2A37 A; 2KT1 A; 1RUW A; 4JPB W; 2M51 A; 3NPF A; 1CSK A; 2EBP A; 4J9D A; 1K9A A; 5FW9 A; 2FPF A; 1UDL A; 1UGV A; 1ARK A; 2KRN A; 3EG2 A; 4EIK A; 4OMM A; 1AOJ A; 4J9I A; 3EGU A; 2FEI A; 5IHK A; 1UFF A; 1W70 A; 3NMZ C; 1EFN A; 2DL8 A; 1NYF A; 4AFZ C; 2O2O A; 1MUZ A; 2F2X A; 1UE9 A; 2EYY A; 2D0N A; 1BBZ A; 5GJV B; 4OMP A; 4IIO A; 2C0T A; 5I22 A; 1CKB A; 3RNJ A; 1W6X A; 1YWP A; 2CRE A; 2DBK A; 4J9H A; 4Z89 A; 2KE9 A; 4JJB A; 1YCS B; 2ED1 A; 3H0H A; 2YUN A; 1OPK A; 1I1J A; 2HCK A; 1FYN A; 2JTE A; 1E6H A; 2ABL A; 1AWX A; 4LUE A; 2HBW A; 3IQL A; 2SEM A; 2RQU A; 4QT7 A; 2EW3 A; 2KNB B; 2NUZ A; 1M3B A; 1PKT A; 4E6R A; 1WDX A; 1ZLM A; 4ORZ A; 2JXB A; 2CUD A; 2EGE A; 3H41 A; 2L2P A; 4JZ4 A; 4RTU A; 4OMN A; 1UJ0 A; 5IH2 A; 2EQI A; 2D8J A; 4CC3 A; 1SHF A; 3EG0 A; 2J6F A; 1ZUU A; 1TUC A; 1HD3 A; 3M0U A; 2DM1 A; 1WIE A; 2DL7 A; 2FG0 A; 2LQW A; 2ROT A; 3UA6 A; 3U23 A; 3NHN A; 2DRK A; 2JW4 A; 1MV3 A; 1QLY A; 1S1N A; 2X3X D; 1KSW A; 1UTI A; 2FRW A; 2J7I A; 2DRM A; 2F2V A; 2MOX A; 1T0J A; 4AG2 C; 3VS0 A; 4HVV A; 4JZ3 A; 3RBB B; 2CH4 A; 3PE0 A; 2CT3 A; 1KFZ A; 2FPD A; 2FPE A; 2J05 A; 5I11 A; 2YSQ A; 1PRM C; 1E7O A; 5ECA A; 2LZ6 B; 2KRS A; 2CUB A; 2AKL A; 1WXT A; 4OML A; 2ECZ A; 2RQV A; 3QWY A; 4RTZ A; 2OAW A; 1T3L A; 1LCK A; 1RLP C; 4HCK A; 3I9Q A; 1PWT A; 2EVR A; 3NGP A; 2KGT A; 1FMK A; 1JU5 C; 3M0R A; 3ULR B; 2DIL A; 2L0A A; 1SRM A; 3EHQ A; 3M0T A; 4D8K A; 2KEA A; 3VS5 A; 2LX7 A; 3LH5 A; 2DL4 A; 1PRL C; 1QWF A; 2KR3 A; 2CSQ A; 3C0C A; 4GBQ A; 2QDL A; 2RN8 A; 2JMC A; 1I07 A; 4JJC A; 2A28 A; 4K11 A; 2F2W A; 1GBR A; 2DMO A; 1WYX A; 1CKA A; 1AVZ C; 1A0N B; 1GFC A; 1YWO A; 1JXM A; 2ED0 A; 4HVW A; 2DX1 A; 2FO0 A; 4D8D A; 2PTK A; 2M0Y A; 1X27 A; 4Z8A A; 1X6B A; 2VKN A; 2SRC A; 1PKS A; 3VS2 A; 3TSZ A; 2CT4 A; 1Y0M A; 2JT4 A; 1BK2 A; 3FJ5 A; 2HSP A; 2MCN A; 2K79 A; 2RNA A; 3I5S A; 1VYT A; 2J6O A; 4DEX A; 2GGR A; 1J3T A; 4KRT A; 5L23 A; 2YT6 A; 5IXB A; 4DEY A; 1GRI A; 1K1Z A; 1OEB A; 1AD5 A; 3TSW A; 3QWX X; 2CDT A; 3SEM A; 2DE0 X; 3GBQ A; 1WX6 A; 4RTY A; 1UHC A; 1SSH A; 1M3C A; 1Y57 A; 4F14 A; 1UHF A; 1T0H A; 2GNC A; 4AFU C; 1Z9Z A; 4HVU A; 2KT8 A; 2RMO A; 5IHI A; 2LJ1 A; 5FWB A; 3I35 A; 2O9V A; 4RUG A; 1AZG B; 2X3W D; 4CC7 A; 2D8H A; 2CH4 W; 3O5Z A; 2EYZ A; 1QKX A; 1YN8 A; 2KRO A; 4HXJ A; 2DBM A; 2JS2 A; 2DA9 A; 2K3B A; 2EPD A; 2YUQ A; 2AK5 A; 1ZSG A; 2O9S A; 2J6K A; 1GCP A; 2V1R A; 2VVK A; 1K0X A; 4J9F A; 4LUD A; 2C0O A; 4WCI A; 1ZUK A; 2P4R A; 2E5K A; 4RTV A; 4J9E A; 2NWM A; 4CC2 A; 3REA B; 1GL5 A; 2AZV A; 1X2K A; 2W0Z A; 3VRZ A; 5FWC A; 2RQR A; 3VS3 A; 2L3Q A; 3R6N A; 2BZY A; 1UJY A; 2ESW A; 1ZUY A; 2DLP A; 2JS0 A; 1YP5 A; 2DJQ A; 2OJ2 A; 1WLP B; 2HEQ A; 2KRM A; 1WA7 A; 2ENM A; 2HDA A; 3EG3 A; 1X43 A; 1M30 A; 3I5R A; 2GBQ A; 1N5Z A; 3TVT A; 3VS7 A; 2CSI A; 1M27 C; 2RQT A; 4A63 B; 2EGA A; 2I0N A; 3UF4 A; 1AEY A; 2JM9 A; 3UAT A; 2PZ1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1D1B A; 1BU1 A; 3H8Z A; 2A08 A; 2BZX A; 2CKK A; 2BKD N; 4E2F B; 1VQ6 Q; 3DB3 A; 1RI9 A; 1OOT A; 2QEX T; 4OMQ A; 3HSB A; 5IXF A; 3GF5 A; 2AZS A; 3V7S A; 3CCM T; 2P84 A; 2YDL A; 2DET A; 2YUO A; 4KBM B; 4E7Z A; 4LDW A; 1ABQ A; 2E41 A; 2KBT A; 5KYY B; 1MND A; 3CCS T; 2R58 A; 3JB9 F; 1OUL A; 2CP5 A; 2MIO A; 1LPL A; 1YI2 A; 3SWN A; 3X28 B; 3OYI A; 1G3W A; 5GJW B; 2GFA A; 2V1Q A; 1QVG A; 1B7T A; 2YRV A; 3CC7 Q; 4D6W A; 1NYG A; 3OW2 S; 2BTT A; 2CP6 A; 2QEX A; 2LCS A; 3JCM b; 3VS4 A; 2D1X A; 4OMF B; 4EMK C; 1K73 C; 4A4H A; 2RI2 A; 2C06 A; 1SRL A; 1TG0 A; 2JZ2 A; 1PD0 A; 4Y28 E; 5GMK j; 1K76 A; 1AZE A; 3CCM A; 2K4Y A; 3UA7 A; 4OB0 B; 2BZ8 A; 3OSV A; 3VKI A; 2ZZD A; 1FX7 A; 4R0K A; 1KQS P; 2L5Q A; 1KK7 A; 1WI7 A; 2RF0 A; 1KC8 C; 3NTI A; 2LRQ A; 4C92 E; 2CP0 A; 4C8Q E; 3VV0 A; 2E10 A; 2R5A A; 2NYS A; 2RK2 A; 3EGX B; 3JCM c; 1QCN A; 2DYB A; 1MGQ A; 2DIQ A; 5GAO l; 3VRY A; 1UUE A; 2EJF A; 3LWI A; 2B8A A; 1NBE B; 2ZPI B; 4JDS A; 2VYT A; 4BDY A; 5GAM h; 3C94 A; 1AWO A; 1W1F A; 1GCQ A; 2EJG A; 3EHR A; 4M7A A; 2E3I A; 1DJ7 B; 2EQK A; 1VQM T; 2EFI A; 3A98 A; 1B07 A; 2OTL T; 1Y96 B; 1W2B P; 3MPU B; 2LQK A; 3GNG A; 4IIM A; 1I5O B; 4MMK A; 4A4F A; 3L1A A; 3VS6 A; 2AIR B; 3JCM d; 5HCK A; 1ZBX A; 5GAN 7; 5DLO A; 5IHN A; 3HP9 A; 1B3Q A; 4JJD A; 2LQN A; 2PU9 B; 1RUW A; 2M51 A; 2FB7 A; 2ATC B; 2KI7 A; 2EBP A; 1U1T A; 1Y07 A; 2FPF A; 3OW2 P; 4WTO B; 8ATC B; 4M7D E; 1KQ2 A; 1ARK A; 2QGF B; 1VQM A; 2E4H A; 4IKF A; 4J9I A; 1QVF S; 4HA8 A; 4C0D B; 3RDV A; 3OYC A; 1BI2 A; 2F2X A; 3CC4 A; 3LW5 E; 4Z02 A; 3OSS C; 1RAH B; 4OMP A; 4KGZ B; 2KVQ G; 2PVG B; 3C95 A; 1CKB A; 2YWW A; 5FRO A; 3FDR A; 1YWP A; 1WGS A; 4MML A; 1QVP A; 4BB7 A; 3RKW A; 2O4X B; 4Z89 A; 4FU6 A; 4EDU A; 2PVO B; 1YJ9 T; 3QDF A; 1NJI R; 1I1J A; 4FW2 A; 5GAM e; 9ATC B; 5GAM g; 2ABL A; 4JS5 A; 2R5M A; 2RM4 A; 2SEM A; 2PVD B; 4ZN1 A; 2EW3 A; 1M1K R; 2Y4Y A; 4J6W A; 1PG5 B; 3CCL Q; 3OYK A; 1ZLM A; 2JXB A; 2CUD A; 2NLU A; 3H41 A; 2QI2 A; 2RK1 A; 2KY9 A; 4JZ4 A; 2DD5 A; 1EZZ B; 4FYW B; 1QCO A; 2JTM A; 5FLX E; 3F70 A; 1YCY A; 1OU8 A; 3CCQ T; 3WVD B; 4C0F A; 2KQW A; 4BUG A; 3ZBD A; 3EGD B; 3M0U A; 4EMK A; 1WIE A; 2ROT A; 1YJ9 A; 3OW2 A; 3U23 A; 5DM7 R; 3NHN A; 4X9D A; 3P8B B; 1PD1 A; 2HKQ B; 1S72 T; 2X3X D; 1KSW A; 3QSU A; 1UTI A; 4M77 E; 5KYW A; 4ZTJ A; 3OQ5 A; 2MOX A; 4PL6 A; 1T0J A; 4XU2 A; 2KK4 A; 4ME7 A; 3MEU A; 2LDM A; 4PJO G; 5I11 A; 3OB9 A; 4BAC A; 1E7O A; 1IGQ A; 2LZ6 B; 2KRS A; 2CUB A; 4B6M A; 4BY6 C; 4QQD A; 4RTZ A; 3CCQ A; 3M59 A; 4TVR A; 3LWH A; 1BKB A; 2COW A; 2FL7 A; 2OAW A; 1T3L A; 1LCK A; 2LTO A; 2DAQ A; 3I9Q A; 5GAM f; 4F04 B; 2WSC E; 1Q82 U; 4XTX A; 3NGP A; 2KGT A; 1FMK A; 3ULR B; 2DIL A; 1SRM A; 2E12 A; 3CXC P; 4ZN3 A; 4PFP A; 5C6S A; 1WHJ A; 3CCM Q; 2LX7 A; 3UPU A; 2KR3 A; 4GY5 A; 1WHG A; 2GFU A; 5D7U A; 4C92 G; 2QYZ A; 4FYY B; 2XG8 D; 4JJC A; 3CCS Q; 4XAX B; 4N4H A; 1ZSZ C; 1AVZ C; 2E64 A; 1Q81 R; 1RAD B; 4RG8 A; 2HNI A; 4QQ6 A; 4J83 A; 4X9C A; 2FO0 A; 4D8D A; 2PTK A; 1SF9 A; 5FU6 C; 3RR6 A; 5CO7 A; 3EFS A; 2XI9 A; 4BI4 A; 1PM3 A; 3OMG A; 4O6J A; 3TSZ A; 4LDY A; 3VYH B; 3MJX A; 4E7J A; 3PIO A; 5C0M A; 1BK2 A; 2MCN A; 3R6O A; 1M90 U; 1QVF A; 2RJD A; 4KUD K; 1V76 A; 2RH2 A; 4EPC A; 4JRP A; 1VYT A; 3FEO A; 3EH2 A; 4KRT A; 1RAB B; 7AT1 B; 2YT6 A; 5CKB A; 1Q86 R; 1AD5 A; 4FIB A; 3QWX X; 4XTZ A; 2DE0 X; 4M78 D; 4LD6 A; 2XD0 A; 2PUK B; 4PNO A; 4PFO A; 4L6V 5; 1UHF A; 3QG1 A; 2HQE A; 5LJ3 h; 4C92 F; 2KT8 A; 4PJM A; 4C8Q F; 2LJ1 A; 3I35 A; 4MDW A; 1YJN T; 4M7D G; 3HL8 A; 2CH4 W; 4HXJ A; 1VQM Q; 2QK0 A; 4ZGE B; 1TXQ A; 2RJC A; 1EX4 A; 2OTL Q; 2EPD A; 1D3B A; 2AK5 A; 5CKH A; 2O9S A; 4EMH A; 4NOY A; 4M7A D; 2E5K A; 4C92 B; 1OI1 A; 2X35 A; 4C8Q B; 2AZV A; 2RQR A; 4FW1 A; 1UJY A; 3L2U A; 2JS0 A; 1YP5 A; 2PQW A; 2OJ2 A; 5LJ5 d; 4F7U E; 5CK9 A; 4QKU A; 1X75 C; 2Y90 A; 3BFM A; 2COY A; 3VS7 A; 3ME9 A; 2COZ A; 4A63 B; 1K73 U; 1AEY A; 1RAG B; 1WHK A; 4E7H A; 1KHC A; 4FSS A; 1UEC A; 2ROL A; 1QWE A; 5CVI A; 1VQK A; 3JCM V; 5GAM j; 1K9M R; 4C0Z A; 4M7D F; 4J9C A; 2IIM A; 1QVG S; 2QA4 T; 1TSF A; 5LJ3 e; 1YFN A; 5LJ3 g; 1YJW T; 1JBM A; 1MV0 B; 4OVA A; 3SWN C; 2EYX A; 2QAZ A; 2GTJ A; 2PUO B; 4BD3 A; 1NM7 A; 3JB9 J; 1BB9 A; 5KYX A; 5KYN A; 2ZCF B; 1PNJ A; 3CCU A; 4RCC A; 1NPR A; 4J9G A; 1VIF A; 3JV3 A; 2ZGW A; 3THK A; 4OP0 A; 4M7D B; 4RG2 A; 4CC4 B; 3OY9 A; 1VA7 A; 2LP5 A; 3M0P A; 1NZ9 A; 1ZBJ A; 1VYV A; 2X4X A; 1PHT A; 3EFR A; 3ZEH A; 5I21 A; 1D0X A; 3CCQ Q; 1R0B G; 4M75 A; 4KUI A; 3A8M B; 4M78 C; 1RAC B; 6AT1 B; 3G6E Q; 2QA4 A; 1XOV A; 2QDY B; 3LYI A; 2EKH A; 4MZT A; 3EG1 A; 3KUF A; 1YJW A; 1Z9Q A; 4LD9 K; 1S72 Q; 5KE3 A; 2HL5 C; 1MMG A; 3QYG B; 3MHX A; 3GPL A; 3KFV A; 1VQL T; 1RAI B; 3V7C A; 4QQG A; 1QP3 A; 1VQ4 Q; 1AWJ A; 4OMO A; 1V1C A; 2H8H A; 4JS4 A; 4E7I A; 4N4I A; 3SHW A; 3PMI A; 4AFQ C; 2C0I A; 2K7A A; 1GCQ C; 4M7A C; 1VQ7 T; 4FYV B; 3BDU A; 2RQW A; 1TH7 A; 3A8G B; 3JCM P; 1RAE B; 3H0I A; 5LJ3 f; 3JCM X; 1SHG A; 3CPW S; 1VOM A; 4PJJ A; 1WQ7 A; 1BIB A; 4JLI A; 1JXO A; 3OS5 A; 2DNU A; 2HQH A; 3D7S B; 1M90 C; 4RTX A; 3EFO A; 3H0F A; 1QKW A; 1QVG P; 2H3J A; 1JQQ A; 2O31 A; 1AWW A; 4M77 B; 5LJ5 h; 1OPL A; 1M4Z A; 3QZ9 B; 2JM8 A; 2Y4X A; 2E5Q A; 4IUQ A; 1WHL A; 3S6W A; 2GQI A; 4AMC A; 1KJW A; 1K0S A; 2K3Y A; 2DVJ A; 4J9B A; 1VQ7 A; 2FHD A; 4E7L A; 2GTO A; 4J5Y A; 3HRS A; 1OV3 A; 1K9M C; 4GLM A; 1BIA A; 4XK8 E; 4PLI A; 1YI2 T; 2J06 A; 1ZA2 B; 2DO3 A; 4JPB W; 5LL6 S; 4JRI A; 4MDX A; 3OYE A; 1UDL A; 1UGV A; 2EQM A; 4EIK A; 1D09 B; 4C5G A; 3FIF A; 2XDD A; 1KHI A; 3M9Q A; 4PJO E; 2D0N A; 1BBZ A; 1PCX A; 5GJV B; 1YIJ T; 3E19 A; 2QGG A; 1MMN A; 4IIO A; 3MO8 A; 3RNJ A; 2XDB A; 2NUP B; 1OU9 A; 3QXE B; 3G71 T; 3EG9 A; 4JJB A; 1D0Y A; 3H0H A; 1OPK A; 2DZ9 A; 2JTE A; 2QTV A; 4F7U G; 1AWX A; 3CPW P; 3CCJ T; 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