The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
59
|
structure length |
59
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Chain Sequence |
b'STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLAPVD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
|
| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
9
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-02-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3SEM A; 2V1R A; 3EG3 A; 1M30 A; 1PKT A; 2E5K A; 2EVR A; 4RTX A; 1G2B A; 2W10 A; 1JO8 A; 2ECZ A; 2JMA A; 2YUP A; 2KRS A; 1ABQ A; 4RTZ A; 3CQT A; 1ZUY A; 3UA7 A; 4Z8A A; 2EYX A; 1ZSG A; 3EG2 A; 2ENM A; 1GCQ C; 3PVQ A; 3M0S A; 2QDL A; 3O5Z A; 1UEC A; 1MUZ A; 3QWX X; 2YT6 A; 1VYU A; 1IO6 A; 3H41 A; 2I0N A; 2O31 A; 2OJ2 A; 3M0P A; 4JJB A; 2CH4 A; 1J3T A; 2KEA A; 2LQN A; 1OEB A; 2P4R A; 2K3B A; 2KRN A; 4LN2 A; 2H8H A; 3M0Q A; 3NHN A; 5ECA A; 4D8K A; 3VS3 A; 2F2V A; 2VWF A; 2IIM A; 2AZV A; 2KGT A; 2JS2 A; 2YDL A; 3FJ5 A; 3VS4 A; 2V1Q A; 1UJY A; 1NM7 A; 2PTK A; 4A63 B; 2C0I A; 4J9G A; 3H0I A; 1T0J A; 1U5S A; 1GCP A; 2RPN A; 2J05 A; 2D1X A; 2ABL A; 3VS7 A; 4K11 A; 1PHT A; 4J9H A; 3NGP A; 4OML A; 2J7I A; 2O2O A; 4CC4 B; 4J9D A; 4AG1 C; 1NEB A; 3UAT A; 1X6G A; 2GGR A; 4QT7 A; 5HCK A; 1WX6 A; 2LX7 A; 4F16 A; 1ZUK A; 5FWB A; 1JXM A; 1T3L A; 2L3P A; 1TUD A; 3NMZ C; 3VS5 A; 4JJC A; 2DNU A; 2BZY A; 1I1J A; 2DL3 A; 3TSW A; 2X3X D; 1K9A A; 1WXU A; 1PKS A; 2EW3 A; 3RNJ A; 2CUB A; 1SRM A; 1AVZ C; 2FEI A; 2K79 A; 2LQW A; 2RQU A; 2YUO A; 4J9I A; 1AEY A; 1E6G A; 1VYT A; 2A37 A; 1K4U S; 1YN8 A; 2X3W D; 3C0C A; 1KJW A; 1NYF A; 1NEG A; 2DL5 A; 1YP5 A; 1BK2 A; 1ZBJ A; 1YWP A; 3PE0 A; 1WI7 A; 2JT4 A; 1EFN A; 2FO0 A; 1UHC A; 1FMK A; 4FSS A; 3UA6 A; 3M0R A; 2C0T A; 2O9S A; 1W6X A; 3M0T A; 2LCS A; 1GL5 A; 1M27 C; 1ZX6 A; 1KIK A; 2F2W A; 1AD5 A; 3KFV A; 1PRM C; 2J06 A; 1I07 A; 1JEG A; 1X43 A; 1YWO A; 5FWC A; 2L2P A; 2CH4 W; 3EHQ A; 2L3S A; 4ESR A; 1H3H A; 1K76 A; 1UGV A; 1YNZ A; 2C0O A; 1Z9Q A; 2KR3 A; 2W0Z A; 2GBQ A; 2DLP A; 4RUG A; 1GFD A; 2KNB B; 1E6H A; 4Y92 A; 3JV3 A; 1AWX A; 2ED1 A; 1SEM A; 2YUQ A; 2AKL A; 2BZ8 A; 3H0F A; 1NG2 A; 2DF6 A; 3IQL A; 2CDT A; 2KXD A; 1NLP C; 1RLQ C; 2JM9 A; 2AKK A; 3I9Q A; 4J9C A; 1XOV A; 3EHR A; 4IIM A; 1PWT A; 1V1C A; 2HBW A; 1Y0M A; 2RQT A; 2DYB A; 1B07 A; 2KT8 A; 1QCF A; 2NUZ A; 2CSQ A; 1CSK A; 1UFF A; 2DJQ A; 4LUE A; 2LMJ A; 1QKX A; 4JJD A; 1JXO A; 2EYZ A; 4HCK A; 1MV0 B; 1AWO A; 4LUD A; 1H92 A; 4JZ3 A; 2EGE A; 3LH5 A; 1GBQ A; 1JU5 C; 1WXB A; 2K2M A; 1Y57 A; 1BB9 A; 1QWF A; 2LNH B; 2NWM A; 2RN8 A; 1KFZ A; 1UUE A; 4RTY A; 1G83 A; 1X6B A; 4J9E A; 5GJW B; 1GCQ A; 3NPF A; 1X69 A; 2F2X A; 5EC7 A; 4D8D A; 2EKH A; 2DRM A; 1QKW A; 2SRC A; 2EGC A; 3RBB B; 2O88 A; 2D8H A; 1OOT A; 2L0A A; 2EGA A; 3EGU A; 2DA9 A; 4IIO A; 2KYM A; 1AWJ A; 1RI9 A; 2J6F A; 1W1F A; 2XMF A; 2KBT A; 2JM8 A; 1RUW A; 1JQQ A; 1YCS B; 3ZL7 C; 1BU1 A; 2RF0 A; 4CC3 A; 2KT1 A; 1QLY A; 1WDX A; 2DX1 A; 4F17 A; 1S1N A; 2MCN A; 4JPB W; 1K1Z A; 1VYV A; 2MOX A; 2JMC A; 2ROT A; 1E7O A; 3R6N A; 3PVL A; 4CC7 A; 1N5Z A; 3VS2 A; 4M4Z A; 4HVU A; 4ZNX A; 2B86 A; 2EYY A; 2EQI A; 1K0X A; 2RQW A; 3I35 A; 1BBZ A; 1WXT A; 1M8M A; 2KYB A; 1HD3 A; 1SHG A; 3A98 A; 2JW4 A; 2OI3 A; 4OMQ A; 5IXF A; 4J9B A; 2RQR A; 2CUD A; 5GJV B; 1AOJ A; 4R0K A; 5IXB A; 2SEM A; 2VVK A; 2BZX A; 2GNC A; 2K6D A; 2RQV A; 4DEX A; 2DL4 A; 1AZG B; 1X2K A; 2FPF A; 1UTI A; 4Z89 A; 1CKA A; 2GQI A; 1T3S A; 1H8K A; 4RTW A; 2J6O A; 1LCK A; 1RLP C; 4OMN A; 1Z9Z A; 2MIO A; 2RMO A; 4J9F A; 1SHF A; 1K0S A; 1GRI A; 3ULR B; 3EG0 A; 3H0H A; 2DMO A; 1GBR A; 1M3A A; 2DBM A; 2GTJ A; 1U06 A; 1T0H A; 1TUC A; 1UHF A; 2K9G A; 1OV3 A; 2O9V A; 3THK A; 2CT3 A; 2ESW A; 3M0U A; 1VA7 A; 1PNJ A; 2ROL A; 4GBQ A; 4KRT A; 1M3B A; 2FRY A; 1FYN A; 4CC2 A; 2LJ1 A; 5IH2 A; 2A08 A; 1UJ0 A; 2M0Y A; 1SRL A; 1CKB A; 1X27 A; 2DL7 A; 1WIE A; 5L23 A; 2CT4 A; 4AFU C; 2YUN A; 3UF4 A; 4RTT A; 2DM1 A; 3VS0 A; 2KXC A; 2CRE A; 2DIL A; 2PZ1 A; 2AK5 A; 1PRL C; 1UE9 A; 1M3C A; 5I22 A; 2PNI A; 2BTT A; 2DE0 X; 2AZS A; 2KRO A; 4OMM A; 4Z88 A; 4F14 A; 2DRK A; 1UDL A; 4OMO A; 2JTE A; 2EBP A; 4JZ4 A; 4E6R A; 1WYX A; 2KE9 A; 2FRW A; 2YSQ A; 1X2Q A; 3I5S A; 5IHN A; 1AWW A; 2KRM A; 2D0N A; 1NYG A; 1SSH A; 4RTU A; 2HSP A; 3U23 A; 2ED0 A; 2DVJ A; 2LP5 A; 4X1V A; 3SHW A; 1AZE A; 2DBK A; 2FPD A; 1I0C A; 1QWE A; 2FG0 A; 2VKN A; 1KSW A; 1OPK A; 1ARK A; 4DEY A; 2GTO A; 4LE9 A; 2K7A A; 2A36 A; 2LZ6 B; 1U3O A; 4HVV A; 3REB B; 2HEQ A; 1B3Q A; 3TVT A; 4ORZ A; 2L3Q A; 3VS1 A; 2DL8 A; 3GBQ A; 3EG1 A; 2D8J A; 4HXJ A; 1MV3 A; 4OMP A; 1HSQ A; 4AG2 C; 3VS6 A; 4LNP A; 1ABO A; 2EPD A; 2G6F X; 3QWY A; 4RTV A; 4AFQ C; 3I5R A; 5FW9 A; 3REA B; 1ZUU A; 4GLM A; 4AFZ C; 1HJD A; 2LJ0 A; 2JXB A; 1GFC A; 1A0N B; 5IHI A; 2HCK A; 1WA7 A; 4WCI A; 1UG1 A; 2CSI A; 2HDA A; 3VRZ A; 4EIK A; 1NLO C; 5IHK A; 3VRY A; 2FPE A; 2OAW A; 1ZLM A; 1OPL A; 1W70 A; 1WFW A; 1SPK A; 5I11 A; 2J6K A; 2JS0 A; 4AFS C; 4HVW A; 2RNA A; 2A28 A; 2EYW A; 2LJ3 A; 3TSZ A; 1WLP B; 2M51 A; 1TG0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EG3 A; 3P8D A; 5I2S A; 3PT9 A; 5GAM e; 1XQH A; 1YBY A; 4J6X A; 2ECZ A; 4XAX B; 4BI3 A; 3S3O A; 4EMK B; 4RTZ A; 3PIO A; 1D0Y A; 3RDV A; 3UA7 A; 5GAN 3; 1HXD A; 1ZSG A; 2ENM A; 1GCQ C; 3O5Z A; 1MUZ A; 2M1H A; 3M4Y A; 4C5E A; 5LJ3 j; 4C0Z A; 2YT6 A; 1VYU A; 2QYZ A; 2I0N A; 3H41 A; 2MYS A; 3JCM X; 4HCC A; 2CH4 A; 3CC4 A; 2QTX A; 3CPW P; 3CCV T; 2P4R A; 3SWN A; 2NUT B; 3OSS C; 2H3E B; 3NHN A; 1MGQ A; 1VOM A; 1KC8 R; 1Q86 U; 1RAD B; 4MDW A; 3S3N A; 2RHY A; 6AT1 B; 2YLC A; 5GAN e; 2E4H A; 2PQW A; 3H0I A; 3OYC A; 1T0J A; 2OTJ Q; 8ATC B; 1GCP A; 3QG1 A; 5HY6 A; 3F70 A; 2ABL A; 2IVW A; 4J7F A; 2DFU A; 4K11 A; 2F5K A; 5CQY A; 3ZFJ A; 4X9D A; 2HL3 A; 5LJ3 e; 2O2O A; 2KY9 A; 3UAT A; 5HCK A; 1VQ7 T; 1WX6 A; 2WSC E; 3QDF A; 2IPO B; 4C92 G; 3L2Z A; 3EG9 A; 1VQ6 A; 4PJO G; 3RMQ A; 3CC7 T; 1TUD A; 2KAF A; 4JJC A; 3QUI A; 5GAM d; 4II1 A; 3CPW A; 4DOV A; 3CCJ A; 3RKX A; 1LOJ A; 1JJ2 A; 1VQ5 A; 4DA4 A; 2K3Y A; 4J7I A; 1YIT A; 2CUB A; 2FEI A; 2EQK A; 2YUO A; 2X35 A; 1E6G A; 4KH0 B; 1VQ4 T; 1KJW A; 2EFI A; 4J6W A; 1NYF A; 1NEG A; 3EFO B; 1YP5 A; 4YTL A; 3PE0 A; 4Q5W A; 3WVD B; 2JT4 A; 1EFN A; 1UHC A; 4IUQ A; 2OTL A; 2FL7 A; 2O01 E; 1KIK A; 1AD5 A; 3MEU A; 1VIF A; 1V29 B; 5FWC A; 3JCM V; 3CCL Q; 4M7D D; 5GAN d; 1KHC A; 3Q1J A; 2QQA A; 3CCS T; 1Z9Q A; 4WF2 A; 1PSE A; 2GBQ A; 5LJ5 d; 4FW1 A; 4JJN K; 2VB6 A; 2QK0 A; 2KNB B; 1E6H A; 2BE9 B; 4ELY C; 5CKD A; 5LJ3 d; 4Y92 A; 4M7A D; 3CXC S; 4BE2 A; 5GAO m; 1M8V A; 2ED1 A; 1U8R A; 4FYX B; 2YUQ A; 1YJW T; 2BZ8 A; 1M90 U; 3JCM P; 3CBM A; 4XTZ A; 2PVO B; 3LYI A; 1RLQ C; 2JM9 A; 3I9Q A; 1QVG S; 1MMN A; 4KUL A; 2RK1 A; 3PIP A; 2DK3 A; 1N6A A; 3QZ9 B; 2KT8 A; 2L5Q A; 2YWW A; 3HRT A; 4MZT A; 1QMC A; 1QKX A; 4JJD A; 4BI8 B; 1YI2 Q; 2CKK A; 1KG1 A; 2LTO A; 2DXB A; 3HFO A; 2KMT A; 3LH5 A; 1JU5 C; 3E2U A; 2K2M A; 1Y57 A; 2HQE A; 1VQL A; 5KYN A; 4M75 C; 4RTY A; 3DB3 A; 2XHC A; 3G4S A; 2QQ9 A; 3NPF A; 2F2X A; 2DEQ A; 2EKH A; 1QKW A; 4M77 A; 3OW2 P; 1Q81 C; 5GMK h; 4C8Q D; 5A0D A; 3A8M B; 2DD5 A; 3QYG B; 1LVK A; 1OOT A; 5FU6 C; 2QEX A; 4M7D F; 1M1G A; 4IUR A; 5FRM A; 1YHQ A; 4IUP A; 4FW2 A; 2XDP A; 3SWN B; 1WHG A; 5IN1 A; 1RUW A; 4AMC A; 1FMW A; 4C0D B; 3S3M A; 3BE3 A; 3VU3 C; 1D0X A; 2GCX A; 1BIA A; 1YCY A; 4CC3 A; 2KT1 A; 4M7A F; 2F5T X; 4JPB W; 2ZCF B; 4N0A A; 1QVF P; 4BUG A; 1VQK A; 2ROT A; 4XU2 A; 3CCE T; 1OUL A; 4D6W A; 3CMA A; 1NPP A; 4RCB A; 2JN0 A; 4KBM B; 3D7S B; 2EQI A; 2RQW A; 1BBZ A; 3QDR B; 4M78 A; 1AHJ B; 2KYB A; 3WVE B; 2Z0W A; 2IG0 A; 5IXF A; 3V8L A; 5CCA A; 4XTX A; 1N9R A; 4R0K A; 5IXB A; 1TSF A; 3L2Q A; 2HKQ B; 1QQJ A; 2DL4 A; 2QQB A; 2HZY A; 4XQ3 A; 4M7D G; 1FXX A; 1PC0 A; 2DJZ A; 1PSF A; 4J83 A; 4PJL A; 4M75 E; 2LQK A; 5A0L A; 3CC2 Q; 5AYF A; 1VQM T; 1VQ9 T; 3OYK A; 1H8K A; 2J6O A; 1LCK A; 2RMO A; 4M7D B; 1N27 A; 3VJP A; 1GRI A; 1S72 T; 4C8Q F; 3JAM E; 1WGS A; 2NUP B; 4ANJ A; 2V26 A; 1TUC A; 4ZGD B; 2ROL A; 4FYW B; 4GBQ A; 4M7A B; 3OYD A; 3LH0 A; 5IH2 A; 4BDZ A; 2B8A A; 3RES A; 2M0Y A; 1X27 A; 1RAE B; 2DL7 A; 4A54 A; 4DBR A; 3QZ5 B; 4RTT A; 3H6Z A; 2DIL A; 2LX9 A; 1PRL C; 4KT0 E; 2BTT A; 2AZS A; 2KRO A; 2DRK A; 1UDL A; 5D6X A; 2COW A; 2MI6 A; 3QJY A; 1VQM Q; 2EBP A; 1VQ9 Q; 4JZ4 A; 5KH6 A; 1JBM A; 3RUX A; 2FRW A; 3I5S A; 2JVV A; 1WHJ A; 4QW2 A; 2D0N A; 3H8Z A; 4MZM A; 3I56 A; 2DVJ A; 4X1V A; 1AZE A; 4JRQ A; 2FPD A; 1QWE A; 4E7S A; 2ZPF B; 5KYW B; 2QA4 A; 1JJ2 S; 4C8Q B; 1B34 A; 4DEY A; 1K9M R; 4EMK C; 2LZ6 B; 1U3O A; 2QG9 B; 2QAZ A; 4LDW A; 1B3Q A; 4JRI A; 1MMA A; 3G4S Q; 2Y4Y A; 4N4G A; 1OX8 A; 3EG1 A; 4E7H A; 2ZZD A; 2A0F B; 3PTA A; 1HSQ A; 3J80 E; 3HL8 A; 2RI2 A; 4OMF B; 2EQJ A; 4RTV A; 3CXC P; 3OY9 A; 4M75 G; 4PK4 A; 4Y28 E; 2LJ0 A; 3AT1 B; 4BE0 A; 4OGC A; 1GFC A; 3WXM B; 5IHI A; 4L6V 5; 2KDS A; 2DXC A; 1UG1 A; 2CSI A; 3C4S A; 4QVD A; 3VRZ A; 4EIK A; 1QVG P; 3JCM c; 3OYN A; 3VRY A; 2FPE A; 5IAY A; 5GAM f; 1YJ9 T; 4ME7 A; 1SPK A; 3JSC A; 1M4Z A; 4RG8 A; 4LD9 K; 2DTH A; 2A28 A; 1MND A; 2EYW A; 1ZSZ A; 4OB0 B; 1UGS B; 1WLP B; 3L2W A; 1M30 A; 1PKT A; 2EVR A; 4RTX A; 3PMT A; 1TXQ A; 4WTO B; 3R6O A; 1JO8 A; 3G71 Q; 3LWI A; 1UGQ B; 1I81 A; 4KH1 B; 1Y07 A; 1ABQ A; 1R8O B; 2KRS A; 2OTJ A; 4BE1 A; 4Z8A A; 3JCM f; 3EG2 A; 2VV5 A; 2QDL A; 2K2V A; 1UEC A; 4RCC A; 1ZQ1 A; 3C94 A; 1IO6 A; 3VYH B; 2P84 A; 2DO3 A; 4JLI A; 1N9S A; 3RR6 A; 2KRN A; 4LN2 A; 3CME T; 4FU6 A; 4D8K A; 2VWF A; 2AZV A; 1YJ9 Q; 2K5F A; 3FJ5 A; 3L2R A; 2EWN A; 1O9S A; 3OS5 A; 1WQ7 A; 2HMA A; 3OYH A; 3HTR A; 4E7J A; 2LNV A; 4J9G A; 1WPY A; 1KD1 C; 1P92 A; 3A8L B; 1RAH B; 2D1X A; 3ASK A; 4C92 A; 4ZTJ A; 3VS7 A; 4PJO A; 1RAA B; 3CCU Q; 3V8J A; 2ZPE B; 3MO8 A; 2J7I A; 4DBQ A; 4DQ2 A; 1D09 B; 4OF1 A; 4J9D A; 5KCO A; 2XDD A; 3TCJ A; 1NEB A; 1X6G A; 3JRZ A; 2ATC B; 2LX7 A; 1ZUK A; 1T3L A; 3CCM T; 2E6Z A; 1N8R R; 3CCQ Q; 4GLK A; 3VS5 A; 1I5L A; 3TRE A; 2EIF A; 2P0K A; 3E9G A; 2DL3 A; 3TSW A; 3SFM A; 3CCL A; 1K9A A; 4PKC C; 2E1H A; 3CME Q; 3CCR Q; 2EW3 A; 3EH2 A; 1B7T A; 1AEY A; 1VYT A; 2CP3 A; 1K4U S; 2X3W D; 2BE7 D; 1VQN T; 3G6E T; 2DEU A; 4A4E A; 4A53 A; 8AT1 B; 5DLQ E; 1EIF A; 2DL5 A; 1BK2 A; 1YWP A; 1WI7 A; 2X4X A; 3EGD A; 1FMK A; 4A4K A; 3M0R A; 2NYS A; 3M0T A; 1GL5 A; 1ZX6 A; 4C5I A; 4F7U G; 1JEG A; 3VUB A; 3MP6 A; 3EHQ A; 1LNX A; 2L3S A; 4ESR A; 1H3H A; 4PLL A; 2C0O A; 3H9N A; 3OYA A; 2KR3 A; 3CCM Q; 2W0Z A; 4IKF A; 4IUV A; 2DLP A; 4RUG A; 2V8I A; 1GFD A; 1YI2 A; 4VUB A; 1NJI U; 2PVD B; 2QAS A; 1Y71 A; 3BFM A; 1C6V X; 3SWN C; 5GAN h; 5GAN g; 2RB6 A; 4FYV B; 1AWX A; 1SEM A; 3SB2 A; 1YIJ Q; 2AKL A; 3M4G A; 4KGX B; 3CPF A; 3HHT B; 4HA8 A; 2DF6 A; 4BI4 A; 2CDT A; 5LJ5 h; 4RMO A; 5LJ5 g; 2AKK A; 1RI0 A; 1BI3 A; 2R5A A; 3OSV A; 4O5V A; 4HCZ A; 1PWT A; 2HBW A; 5LJ3 h; 5DLO A; 1KQ1 A; 5LJ3 g; 4FT2 A; 2DYB A; 1QCF A; 4C0F A; 1JJ2 P; 1YJW A; 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