The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
b'STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLAPVD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
9
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| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-02-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2HCK A; 3H0F A; 2HDA A; 1GBQ A; 1RUW A; 1S1N A; 1T0J A; 4LUD A; 2DM1 A; 1ARK A; 1SPK A; 4HVV A; 4JJB A; 2AZS A; 2ED0 A; 2B86 A; 1M8M A; 2A37 A; 1RLQ C; 2YSQ A; 5L23 A; 3GBQ A; 1AOJ A; 2O9S A; 1U06 A; 1BK2 A; 4R0K A; 2DF6 A; 1GL5 A; 4F16 A; 2NUZ A; 3NGP A; 4RTW A; 1WA7 A; 2DJQ A; 2KT1 A; 4HVU A; 4ORZ A; 4D8K A; 4Z8A A; 1HSQ A; 2O9V A; 4Z89 A; 2VWF A; 1M3C A; 2EYX A; 1RLP C; 1UJY A; 2YDL A; 4RTZ A; 2F2X A; 2BZY A; 2J06 A; 1SSH A; 2JMC A; 1VYT A; 2EVR A; 3A98 A; 2AKK A; 1AZG B; 1IO6 A; 1NYG A; 2FRW A; 3TVT A; 4LUE A; 2O88 A; 1AZE A; 1K4U S; 1X2Q A; 3UAT A; 1E6H A; 2ESW A; 2PTK A; 3QWX X; 2K2M A; 1OPL A; 2I0N A; 2K6D A; 2EBP A; 2CH4 A; 2EGE A; 2DBK A; 2P4R A; 1YWO A; 1OV3 A; 2ABL A; 1M27 C; 2AZV A; 1UEC A; 1UGV A; 4J9F A; 1CKA A; 2V1Q A; 2JM8 A; 1UE9 A; 1T0H A; 1K76 A; 2K79 A; 4CC3 A; 1WXB A; 2ED1 A; 5GJV B; 1KFZ A; 2KYB A; 2YT6 A; 1WLP B; 1MUZ A; 2KRS A; 1TUD A; 1X43 A; 1ABO A; 4EIK A; 1J3T A; 4J9C A; 4J9H A; 2CT3 A; 4J9D A; 2MOX A; 2W0Z A; 4AFZ C; 3VS7 A; 2L0A A; 2NWM A; 1AWX A; 1QWF A; 2A28 A; 2DL7 A; 4Z88 A; 2LQW A; 2KEA A; 1GBR A; 2RMO A; 1UFF A; 2X3X D; 2JMA A; 2RQR A; 5I22 A; 2KRM A; 2MIO A; 1K9A A; 4AFS C; 2DRK A; 4HVW A; 2LJ0 A; 4J9B A; 2ROL A; 2SEM A; 1UJ0 A; 4RUG A; 5IXB A; 1JXM A; 2EYZ A; 2YUO A; 1WI7 A; 4RTV A; 2DL3 A; 2IIM A; 5IHN A; 1JU5 C; 2OAW A; 1FYN A; 3VRZ A; 1LCK A; 1U3O A; 2VKN A; 2CRE A; 2KE9 A; 2VVK A; 1UTI A; 1BBZ A; 2J6F A; 2DA9 A; 2LP5 A; 1NLO C; 5IHK A; 1I0C A; 2FPF A; 3JV3 A; 4OMN A; 1AEY A; 2RQV A; 4LE9 A; 3VS3 A; 1TUC A; 1V1C A; 1G83 A; 2OI3 A; 1K0S A; 3TSW A; 1A0N B; 4K11 A; 2LZ6 B; 1T3S A; 2DLP A; 3NPF A; 1KSW A; 1E7O A; 2BZ8 A; 2DL8 A; 1UHF A; 1M3A A; 2DX1 A; 1NG2 A; 3TSZ A; 4A63 B; 2JXB A; 3EHR A; 3UF4 A; 2RQT A; 3EHQ A; 3REB B; 1AD5 A; 2GTJ A; 1PKT A; 4OMQ A; 1AVZ C; 1WFW A; 3R6N A; 1JQQ A; 2DBM A; 3C0C A; 2DRM A; 4LNP A; 2L3S A; 2CH4 W; 2ROT A; 2K9G A; 2FPD A; 2EKH A; 1YCS B; 4AFU C; 4DEX A; 1HJD A; 3VS5 A; 2HBW A; 2HSP A; 4CC4 B; 3M0Q A; 1BB9 A; 1GCQ C; 2QDL A; 1OOT A; 2C0O A; 2A08 A; 1EFN A; 2PZ1 A; 2RPN A; 4JPB W; 2AKL A; 1WX6 A; 1QCF A; 2DIL A; 2CUD A; 1NEB A; 4ESR A; 1ABQ A; 1I1J A; 1PHT A; 4J9I A; 3UA7 A; 2FPE A; 2EYY A; 1H8K A; 2JW4 A; 2K7A A; 2ECZ A; 1PNJ A; 2F2V A; 1K1Z A; 1NLP C; 3NHN A; 4HCK A; 2LMJ A; 1WXT A; 1PRM C; 4WCI A; 1SRM A; 1HD3 A; 2KNB B; 4JZ3 A; 1AWW A; 2ENM A; 1K0X A; 1N5Z A; 4RTX A; 3RBB B; 1JEG A; 2HEQ A; 2FG0 A; 1UDL A; 1ZUY A; 1YN8 A; 1H3H A; 2CSI A; 3ZL7 C; 3PVQ A; 3SEM A; 1Z9Q A; 3SHW A; 1PKS A; 5HCK A; 3H41 A; 1W70 A; 4GLM A; 1RI9 A; 1PWT A; 5ECA A; 4F14 A; 2FEI A; 3THK A; 3VRY A; 2EPD A; 2KXD A; 4JZ4 A; 1FMK A; 3I5R A; 3FJ5 A; 4ZNX A; 2J7I A; 4J9E A; 1CSK A; 4HXJ A; 3RNJ A; 5FWB A; 5FWC A; 1WXU A; 4LN2 A; 2GTO A; 4M4Z A; 1VYV A; 2D8J A; 2CUB A; 1M3B A; 2RQW A; 2V1R A; 1AWJ A; 2CSQ A; 2G6F X; 1QLY A; 3I35 A; 4AFQ C; 1GFD A; 1WDX A; 2KGT A; 2LJ1 A; 2J6O A; 1X27 A; 4OML A; 2YUN A; 1NYF A; 3H0H A; 3EG0 A; 2LNH B; 2YUQ A; 1JO8 A; 1SHG A; 2DYB A; 2GBQ A; 2SRC A; 3PVL A; 2EW3 A; 4FSS A; 1YP5 A; 2D0N A; 2RNA A; 2YUP A; 3KFV A; 3VS6 A; 3M0R A; 3LH5 A; 1E6G A; 2AK5 A; 2W10 A; 5IH2 A; 3VS1 A; 1ZUK A; 2DMO A; 2JT4 A; 2RQU A; 1H92 A; 1I07 A; 2D8H A; 2EYW A; 3VS2 A; 1ZBJ A; 2K3B A; 4RTT A; 2DL4 A; 1B3Q A; 2BZX A; 2DE0 X; 1NM7 A; 1GCQ A; 2DVJ A; 1NEG A; 1QWE A; 2F2W A; 5IHI A; 3CQT A; 2KT8 A; 2JS0 A; 1X69 A; 3IQL A; 2MCN A; 1B07 A; 1MV0 B; 2KXC A; 4OMM A; 2O31 A; 4D8D A; 4RTU A; 4AG1 C; 2GQI A; 2JS2 A; 3EGU A; 3VS0 A; 2GGR A; 1JXO A; 3M0U A; 2PNI A; 3REA B; 3M0S A; 2A36 A; 1YNZ A; 3VS4 A; 2KRN A; 1ZUU A; 4OMP A; 1X6G A; 2EGC A; 2LX7 A; 2DL5 A; 2L3P A; 2KYM A; 2CT4 A; 1XOV A; 2FO0 A; 3U23 A; 2EQI A; 2LCS A; 2M0Y A; 3I5S A; 1W1F A; 2L2P A; 2XMF A; 3EG3 A; 2OJ2 A; 2FRY A; 2CDT A; 1Y57 A; 1ZSG A; 1WYX A; 2C0I A; 2JTE A; 3PE0 A; 4OMO A; 3ULR B; 1OEB A; 2M51 A; 1CKB A; 3EG2 A; 4JJC A; 1VYU A; 1Z9Z A; 3NMZ C; 2EGA A; 2L3Q A; 4CC2 A; 5EC7 A; 1UG1 A; 1WIE A; 4DEY A; 1UHC A; 4IIO A; 1TG0 A; 1Y0M A; 1GRI A; 2RF0 A; 4QT7 A; 5IXF A; 1AWO A; 4KRT A; 4CC7 A; 1PRL C; 1QKW A; 5FW9 A; 3M0T A; 2J05 A; 4RTY A; 4X1V A; 1OPK A; 1KJW A; 5I11 A; 1SEM A; 4AG2 C; 1X6B A; 5GJW B; 1SHF A; 1G2B A; 1W6X A; 2C0T A; 1UUE A; 2H8H A; 1ZLM A; 1M30 A; 2KRO A; 2D1X A; 1U5S A; 2X3W D; 4E6R A; 3M0P A; 3QWY A; 3O5Z A; 2JM9 A; 2KR3 A; 1GFC A; 1T3L A; 1MV3 A; 1QKX A; 1X2K A; 4F17 A; 2E5K A; 2J6K A; 2LQN A; 2O2O A; 1ZX6 A; 1YWP A; 1KIK A; 3H0I A; 2DNU A; 3I9Q A; 4JJD A; 2RN8 A; 2KBT A; 4GBQ A; 4Y92 A; 4IIM A; 2GNC A; 1BU1 A; 3EG1 A; 3UA6 A; 1SRL A; 2BTT A; 4J9G A; 1GCP A; 1VA7 A; 2LJ3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3CXC A; 3M57 A; 2HCK A; 1KQS P; 4LDY A; 4PJO B; 3C95 A; 4OB0 B; 3ZBD A; 1FWZ A; 1ARK A; 1BIB A; 3HRT A; 2B86 A; 3KUF A; 1YIJ A; 5HY6 A; 1YJW T; 1AOJ A; 1AHJ B; 3MO8 A; 4M77 A; 1NBE B; 3CCV Q; 2NUZ A; 1C1A A; 5CKH A; 2RB6 A; 3M5A A; 5LJ3 f; 3INZ A; 4ORZ A; 1D09 B; 1Q86 R; 2O9V A; 4A4G A; 1XJW B; 1M3C A; 1YIT A; 2JTM A; 1VQK T; 1K73 U; 2WSF E; 4C5G A; 3TVT A; 5GMK l; 1Q82 C; 4PFO A; 2OTL T; 3EGD B; 1OQK A; 2RI3 A; 3UAT A; 4N4I A; 4CRI A; 1WNL A; 2EBP A; 2CH4 A; 2ABL A; 2X4J A; 2ZCF B; 3OYG A; 1M27 C; 1KK7 A; 1UGV A; 5GAO p; 3LWH A; 2V1Q A; 2DIG A; 5KYW A; 3HL8 A; 2E1H A; 1K76 A; 4FW1 A; 4CC3 A; 4HT8 A; 4M78 C; 4JRI A; 5I2S A; 4BDY A; 5GJV B; 2ZPE B; 2KYB A; 3LWI A; 1MUZ A; 2IVW A; 1VQM Q; 5GMK i; 4M7D C; 4DQ2 A; 2DET A; 2DIQ A; 4J9H A; 1OZ2 A; 2CT3 A; 4M77 B; 4X9D A; 2WAC A; 2MOX A; 3DLL A; 2EIF A; 4A4F A; 2W0Z A; 2Y4X A; 5LL6 S; 1SF9 A; 1V29 B; 1QWF A; 2DL7 A; 2JOY A; 1GBR A; 2CKK A; 2MIO A; 4MZT A; 5CCA A; 5KYN A; 2MK5 A; 1YHQ A; 3G4S T; 2CZ7 B; 3VYH B; 3ZFJ A; 2K3X A; 2ROL A; 1VQM A; 1PC0 A; 4GLK A; 2YUO A; 1KD1 C; 3EGX A; 2DL3 A; 4FYX B; 2IIM A; 5IHN A; 1JU5 C; 5KYU B; 3VRZ A; 1U3O A; 4O5V A; 4QW2 A; 4C0G A; 2KE9 A; 2VVK A; 2VGM A; 3HRU A; 3PIP A; 1O75 A; 1BBZ A; 2J6F A; 2DA9 A; 4OMN A; 3L42 A; 2O4X B; 1TUC A; 4C0D C; 1WHG A; 1YI2 Q; 2MPX C; 3MPU B; 3NPF A; 1JB0 E; 1KSW A; 3M55 A; 2BZ8 A; 1M3A A; 1UGQ B; 4E7H A; 2HBP A; 4HCB A; 4A63 B; 3CD6 Q; 1JJ2 S; 3EHR A; 3UF4 A; 3REB B; 1AD5 A; 2GTJ A; 1D0X A; 4II1 A; 1K9M U; 3R6N A; 3C0C A; 3V8K A; 2DRM A; 4A53 A; 2QGG A; 3DB3 A; 1I8F A; 2FZC B; 1KD1 U; 2L3S A; 5FU7 C; 3SWN C; 2K9G A; 3QUI A; 4RKU E; 4FSX A; 4J6W A; 2CZ1 B; 2EKH A; 4ME7 A; 4A54 A; 4M75 F; 4DEX A; 1TSF A; 1M9S A; 2EFI A; 4M7A G; 1BB9 A; 3G4S Q; 2K5I A; 4JS5 A; 1OOT A; 1G3T A; 2A08 A; 4V2S A; 3A8M B; 1R77 A; 2P84 A; 2RPN A; 4FL6 A; 4JPB W; 4C92 D; 1BIA A; 4PJO G; 4HCZ A; 2DER A; 2H3J A; 3UDC A; 3QJY A; 3CCL T; 2FPE A; 1PD1 A; 2RH2 A; 4M7D B; 2JW4 A; 2VXE A; 4C5H A; 3E9G A; 1YJ9 Q; 1YJN A; 3SB2 A; 1IRE B; 1HYO A; 2X9H A; 3JRZ A; 3JCM X; 1VQL Q; 2QTX A; 2LMJ A; 1WXT A; 2R5A A; 2LQ8 A; 4WCI A; 2MWP A; 3SDZ A; 5DM7 R; 4F7U G; 1IGU A; 2CP6 A; 2MMP A; 2EJ9 A; 5CAI A; 4Y91 A; 4QQ6 A; 2FG0 A; 1ZUY A; 2HKN A; 4M7A C; 4BAC A; 4O6J A; 1KQ1 A; 3SHW A; 3V8J A; 2QK0 A; 2ATC B; 1RI9 A; 1PWT A; 1M5Q 1; 2M9U A; 3ER0 A; 3VRY A; 4JZ4 A; 1G8X A; 4OB2 B; 1XTD A; 3FJ5 A; 5CK9 A; 3QSU A; 2L5Q A; 3OSS C; 5FWB A; 3M59 A; 3F70 A; 3PT9 A; 3OYF A; 1VYV A; 2YLB A; 3CCU Q; 3HHT B; 2DJZ A; 4J7I A; 1GFD A; 3OYC A; 4PJO C; 4GY5 A; 3UPU A; 4QKU A; 3EG0 A; 2LNH B; 3A1P A; 2HD0 A; 4FSS A; 2JJ9 A; 2YUP A; 3KFV A; 1BI1 A; 2AK5 A; 2JT4 A; 2D8H A; 5CKF A; 3CXC P; 5FLX E; 1RAI B; 2DL4 A; 1YI2 T; 3V8L A; 3QHS A; 4EMK C; 5IN1 A; 3JSC A; 3JCM d; 5A0G A; 2DVJ A; 1VQ9 A; 2FZK B; 3G6E Q; 2H3E B; 1MGQ A; 2JS0 A; 1JJ2 P; 3HFN A; 4PJO E; 3OYH A; 1B07 A; 1NZ9 A; 1BYM A; 2O31 A; 2RHI A; 2YXY A; 1U8R A; 3EGU A; 3VS0 A; 3CC2 A; 2FYK A; 2GGR A; 1QP2 A; 4FYY B; 1YBY A; 2PNI A; 5LJ5 e; 3HP9 A; 2RD1 A; 5D7U A; 6AT1 B; 4RCB A; 3PIO A; 4M7D E; 1LPL A; 4KUL A; 1M4Z A; 2DL5 A; 2L3P A; 3BE3 A; 1VQ5 T; 3MP8 A; 2LT4 A; 2KI7 A; 1QVG P; 2KYM A; 1XOV A; 1OX8 A; 2FO0 A; 3EH2 A; 4NOY A; 1RAE B; 3BDU A; 2CP5 A; 1ZA1 B; 3TEE A; 2L2P A; 1MND A; 2XMF A; 1PSF A; 4EMH A; 1C0M A; 2B8A A; 1WYX A; 3PE0 A; 3ULR B; 2BIV A; 3EGX B; 3CME A; 2COY A; 1Z9Z A; 3NMZ C; 4IUV A; 2EGA A; 1SG5 A; 5GAM j; 4CC2 A; 5EC7 A; 1UG1 A; 4E2F B; 2RHZ A; 1I5L A; 1Q7Y C; 2RHU A; 4D6W A; 3LLR A; 2P0K A; 3QYG B; 2YHT A; 4QT7 A; 1VQN A; 5CO7 A; 1AWO A; 1K8A R; 1NJI R; 2DYI A; 2EAY A; 1Q82 R; 3G6E T; 1MNE A; 2XK0 A; 4M78 G; 2RK2 A; 1OI1 A; 1PD0 A; 4C92 A; 1ZLM A; 1WHM A; 1VQN T; 1YHQ T; 2X3W D; 3O5Z A; 2A7Y A; 1MV3 A; 4PLL A; 1ACM B; 2O2O A; 1N8R R; 4BUG A; 3GP8 A; 4M7A E; 2YLC A; 4DBQ A; 3I9Q A; 3URG A; 3OYK A; 4GBQ A; 3X28 B; 2GNC A; 4XQ3 A; 3L1A A; 1YJW A; 4EDU A; 1TU0 B; 2HDA A; 1GBQ A; 3SD4 A; 1QP3 A; 4LUD A; 2DM1 A; 3JCM P; 3OS0 A; 3MCA B; 2ED0 A; 5GAN 5; 2XDB A; 1M8M A; 4BE0 A; 4N0A A; 4N4H A; 3GBQ A; 2DVE A; 4C92 B; 2DF6 A; 3OS5 A; 4E7Z A; 2F5T X; 4HCC A; 3JCM J; 4BE2 A; 1PSE A; 3NGP A; 3JB9 J; 1WA7 A; 4FYV B; 4M75 G; 1Y07 A; 3EG9 A; 5I2M A; 1RAD B; 4MZP A; 1G5V A; 2VWF A; 2EYX A; 5GAM d; 5IAY A; 4E7J A; 4RTZ A; 3CCM A; 1N8R U; 2BZY A; 2J06 A; 2JMC A; 2EVR A; 1TTH B; 2QAS A; 3JB9 G; 2O88 A; 1AZE A; 1K4U S; 3RES A; 5GAN j; 2K2M A; 3SWN A; 2K6D A; 3UT1 A; 3LGF A; 5GAO r; 2HZY A; 4Z02 A; 3H8Z A; 1CKA A; 3WVE B; 2P4T A; 2K5L A; 4KH1 B; 4PJL A; 3CCS T; 1D3B B; 2K3Y A; 2JM8 A; 5GAO q; 3G71 Q; 1YIJ Q; 1K73 R; 4FIB A; 2EQK A; 1WXB A; 1YCY A; 2YT6 A; 1N27 A; 5KYW B; 3HRS A; 3MET A; 2X4Y A; 2KQW A; 1TUD A; 4EIK A; 1J3T A; 1WHK A; 4DA4 A; 1VQP A; 3PTA A; 2AHJ B; 1WHJ A; 4AFZ C; 2LCC A; 2NWM A; 1AWX A; 2KEA A; 1UFF A; 2E70 A; 2X3X D; 3EGD A; 4C8Q B; 4ZGD B; 5DY9 A; 3CCE A; 4AFS C; 4JJN K; 2QA4 Q; 4HVW A; 4L6V 5; 4N4G A; 2D0Q B; 4J9B A; 3L2Z A; 2LDM A; 2MWO A; 4RUG A; 5IXB A; 4LD9 K; 8AT1 B; 1JXM A; 1NJI C; 4KGZ B; 4F7U A; 1B7T A; 2YRV A; 4RTV A; 4PFZ A; 3P8H A; 3OW2 S; 3CBM A; 3VYG A; 2Z0W A; 4KBM B; 1LCK A; 3DKM A; 2CRE A; 5DLQ E; 1IB8 A; 5IHK A; 3VS3 A; 2VC8 A; 2HNI A; 1K0S A; 4K11 A; 2FL7 A; 2LZ6 B; 1Q95 G; 1T3S A; 2DLP A; 5GAM g; 4PL6 A; 4BE1 A; 3E9F A; 3G71 T; 4PJO A; 3TSZ A; 3S3M A; 1Q86 U; 1VOM A; 1VQ8 Q; 2VB6 A; 4OMQ A; 3CCS A; 4ZN3 A; 1AVZ C; 2EQU A; 3BFM A; 3GIB A; 4LNP A; 5C6S A; 5GAO l; 1JJ2 A; 4C5I A; 2PUK B; 1YHQ Q; 1YCS B; 4QQD A; 4OB1 B; 3FRN A; 2HBW A; 2XIC A; 2XG8 D; 5GMK m; 1GCQ C; 1K8A C; 3GNF B; 3QO3 A; 4ZTJ A; 2CZ0 B; 1EFN A; 2PZ1 A; 4WF2 A; 1TUG B; 2AKL A; 1PG5 B; 3CMA Q; 2RK1 A; 5LJ5 f; 1I1J A; 1PHT A; 1RAF B; 4OVA A; 4J9I A; 4BB7 A; 3UA7 A; 2CP3 A; 4BI4 A; 2EYY A; 4KGV B; 5GAN 2; 5EG2 A; 3Q1J A; 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