The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| total genus |
9
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| structure length |
59
|
| sequence length |
59
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-02-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DL7 A; 4Z88 A; 2J05 A; 1AVZ C; 2H8H A; 2J6K A; 1J3T A; 2O2O A; 1M3A A; 1X2K A; 2CUD A; 4CC7 A; 1OPL A; 3LH5 A; 2X3X D; 1SRM A; 1OPK A; 2QDL A; 4RTZ A; 2YSQ A; 2F2W A; 1M27 C; 4LN2 A; 1RLP C; 2JM8 A; 5IH2 A; 3H0F A; 2KXC A; 4EIK A; 1QCF A; 5IHK A; 2K6D A; 1SHF A; 1ZUK A; 2FEI A; 2MIO A; 1UHC A; 1PNJ A; 3M0S A; 1ZBJ A; 1AZE A; 1NLO C; 2JXB A; 2DL8 A; 2VKN A; 1WI7 A; 1YCS B; 2B86 A; 2HBW A; 3UF4 A; 2EVR A; 4D8D A; 2FPD A; 4RTV A; 2AK5 A; 5I22 A; 2NWM A; 3SHW A; 1RI9 A; 1MUZ A; 4CC2 A; 4LE9 A; 2G6F X; 3EHQ A; 3REB B; 2PTK A; 4Z8A A; 1WXT A; 2EPD A; 2L0A A; 1U3O A; 2LJ1 A; 1FMK A; 1AD5 A; 1PRM C; 1JU5 C; 1PRL C; 1JXM A; 3QWY A; 4M4Z A; 2KRN A; 5FWB A; 2CRE A; 3M0P A; 1WDX A; 2RN8 A; 1H3H A; 2LJ0 A; 5I11 A; 2GGR A; 1UUE A; 1QWE A; 5L23 A; 1BK2 A; 1JEG A; 1PKS A; 5GJV B; 1Y57 A; 2M0Y A; 2CT3 A; 2D8H A; 3VRZ A; 2O9S A; 3H0H A; 1GRI A; 2KRO A; 1Z9Q A; 4R0K A; 1GFD A; 2ECZ A; 4ZNX A; 1GCP A; 1WXB A; 2MCN A; 3EGU A; 2RQU A; 4F17 A; 1TUD A; 2M51 A; 1UHF A; 1W6X A; 2DVJ A; 2K2M A; 1NG2 A; 2YUQ A; 1T3S A; 2LQN A; 1X69 A; 2A08 A; 2DM1 A; 4AFS C; 2CT4 A; 2JTE A; 1YP5 A; 3A98 A; 1ARK A; 2JM9 A; 3SEM A; 1NYG A; 2HEQ A; 2DBM A; 1PKT A; 4IIO A; 2LNH B; 2EGE A; 1ZX6 A; 1M3C A; 1AOJ A; 2D1X A; 1KJW A; 2DL3 A; 4RTW A; 4AFQ C; 1K4U S; 4CC4 B; 5IXB A; 5IXF A; 3NGP A; 4Z89 A; 1QWF A; 2VVK A; 1T0H A; 2RNA A; 3C0C A; 3TVT A; 1WFW A; 4E6R A; 2O9V A; 2CSQ A; 3VS2 A; 2DE0 X; 1CSK A; 1T3L A; 1N5Z A; 2D0N A; 2LX7 A; 3RNJ A; 3EHR A; 4RTT A; 1WLP B; 4J9H A; 3UA6 A; 1JO8 A; 1S1N A; 2DL4 A; 2DLP A; 2KE9 A; 1H8K A; 1UFF A; 2F2X A; 1RLQ C; 2FPE A; 1EFN A; 2O88 A; 1BB9 A; 3PE0 A; 4F16 A; 2KYB A; 4J9B A; 2YDL A; 3UAT A; 2C0T A; 2PNI A; 2DJQ A; 2OJ2 A; 4D8K A; 1B07 A; 2X3W D; 4JJB A; 1GCQ C; 3H0I A; 3M0U A; 2K3B A; 2A37 A; 1NEG A; 2SRC A; 1NYF A; 3EG0 A; 3VS5 A; 1KIK A; 1GCQ A; 1U5S A; 1OOT A; 3EG2 A; 1T0J A; 5ECA A; 1I07 A; 1SRL A; 3NHN A; 1MV3 A; 4RTX A; 2SEM A; 1PHT A; 2LJ3 A; 2L3P A; 2RF0 A; 2KEA A; 4J9G A; 1AWO A; 2DBK A; 2EGA A; 2L2P A; 2EQI A; 1X43 A; 5GJW B; 1M3B A; 1M30 A; 2RQW A; 1NLP C; 4J9C A; 4DEY A; 1YWP A; 2RQT A; 2LP5 A; 3VRY A; 1YNZ A; 2IIM A; 4AFZ C; 3FJ5 A; 1K9A A; 2FRW A; 4WCI A; 2VWF A; 4Y92 A; 3I5R A; 1FYN A; 4LNP A; 4JZ3 A; 1MV0 B; 2XMF A; 5IHN A; 1SSH A; 2AKL A; 3VS0 A; 2AZV A; 2L3Q A; 4AG1 C; 1YWO A; 2DIL A; 1NEB A; 2FRY A; 4RUG A; 2JS2 A; 2AKK A; 4J9F A; 2JMA A; 1HJD A; 1W1F A; 2J6F A; 2LCS A; 1HSQ A; 2OAW A; 4ORZ A; 1ZLM A; 4LUD A; 1AEY A; 3NMZ C; 3NPF A; 1UE9 A; 1WYX A; 4HCK A; 1X2Q A; 2MOX A; 1UDL A; 3I5S A; 2KBT A; 3ZL7 C; 4JZ4 A; 4OML A; 2EYX A; 4J9E A; 2DL5 A; 4OMN A; 2KXD A; 1UJY A; 1WIE A; 1E6H A; 1BBZ A; 1VYV A; 2KR3 A; 2CSI A; 2DX1 A; 2YUP A; 1RUW A; 2V1Q A; 4IIM A; 2C0O A; 1ABQ A; 1ZUU A; 1WX6 A; 2EYY A; 1KSW A; 1WXU A; 4GBQ A; 2E5K A; 4HVW A; 4JPB W; 3H41 A; 1KFZ A; 1AZG B; 1B3Q A; 2JMC A; 4CC3 A; 2L3S A; 2AZS A; 2EW3 A; 5EC7 A; 2EBP A; 2KRS A; 1JQQ A; 1E6G A; 2ED0 A; 2W0Z A; 2FPF A; 2DA9 A; 1ZSG A; 4AFU C; 1PWT A; 3ULR B; 2BTT A; 2KGT A; 2HCK A; 1CKB A; 2YUO A; 2NUZ A; 1OV3 A; 1G2B A; 2RQR A; 2EKH A; 4QT7 A; 2GNC A; 2J06 A; 4HVU A; 2GTO A; 2PZ1 A; 1A0N B; 2BZX A; 5HCK A; 1OEB A; 1X27 A; 2JT4 A; 2O31 A; 2ESW A; 3EG1 A; 1IO6 A; 2RMO A; 4A63 B; 3VS1 A; 4JJD A; 2JS0 A; 1Z9Z A; 4J9I A; 3CQT A; 4GLM A; 3M0Q A; 1GBQ A; 4F14 A; 3IQL A; 2J7I A; 2FG0 A; 2YT6 A; 1UGV A; 1AWJ A; 2P4R A; 1TG0 A; 1K0X A; 1AWX A; 1ZUY A; 3VS4 A; 1AWW A; 2ABL A; 1TUC A; 1UEC A; 2DYB A; 1UJ0 A; 4ESR A; 1GBR A; 2HDA A; 2GTJ A; 4RTU A; 1U06 A; 1VYU A; 3I9Q A; 1H92 A; 2KT8 A; 2RPN A; 1GL5 A; 4KRT A; 2CDT A; 1SPK A; 2C0I A; 2KRM A; 3TSW A; 2CH4 W; 2KT1 A; 2ROL A; 1BU1 A; 1X6G A; 4OMP A; 4X1V A; 2W10 A; 3R6N A; 1M8M A; 1V1C A; 2YUN A; 1I0C A; 2DMO A; 5FW9 A; 4DEX A; 2K7A A; 2GBQ A; 3REA B; 1ABO A; 4JJC A; 1G83 A; 2DNU A; 2ENM A; 4LUE A; 2V1R A; 1WA7 A; 1JXO A; 1QKW A; 3VS3 A; 3UA7 A; 1LCK A; 4FSS A; 2HSP A; 3VS7 A; 1K1Z A; 1NM7 A; 3O5Z A; 2GQI A; 1I1J A; 3M0T A; 2FO0 A; 2DRK A; 4HVV A; 1SEM A; 2K79 A; 3EG3 A; 1GFC A; 2KNB B; 1UG1 A; 2CH4 A; 2ROT A; 4J9D A; 1X6B A; 4OMQ A; 2DF6 A; 2D8J A; 3I35 A; 1K0S A; 2DRM A; 4RTY A; 4OMO A; 2J6O A; 3KFV A; 1VYT A; 5FWC A; 3QWX X; 3U23 A; 2LMJ A; 3THK A; 1Y0M A; 2I0N A; 2BZY A; 2K9G A; 3VS6 A; 2F2V A; 2EGC A; 2OI3 A; 2BZ8 A; 1HD3 A; 1W70 A; 2KYM A; 5IHI A; 2LQW A; 1CKA A; 4K11 A; 2LZ6 B; 3PVQ A; 3GBQ A; 2A36 A; 2A28 A; 2RQV A; 3PVL A; 4OMM A; 1K76 A; 2ED1 A; 4AG2 C; 1XOV A; 1E7O A; 1UTI A; 1QLY A; 4HXJ A; 3M0R A; 3RBB B; 3TSZ A; 1YN8 A; 1QKX A; 2JW4 A; 2CUB A; 2EYZ A; 2EYW A; 1VA7 A; 3JV3 A; 1SHG A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAO r; 1AVZ C; 2H8H A; 2J6K A; 1J3T A; 1M3A A; 1D1B A; 1MHN A; 3QDF A; 3LH5 A; 1LNX A; 1OPK A; 2MI6 A; 3JAM E; 1KD1 U; 1JJ2 P; 4LN2 A; 1HXD A; 2EFI A; 1G3S A; 5IH2 A; 5FRN A; 1ZSZ C; 1SHF A; 3EFO A; 4XK8 E; 1ZUK A; 3EH1 A; 1YIJ Q; 2MIO A; 4E7Z A; 2LQK A; 5DLO A; 4JLI A; 1Q7Y U; 1WI7 A; 1V76 A; 2HBW A; 4PLI A; 4XTU A; 3UF4 A; 3FB9 A; 1QQJ A; 2EVR A; 4WF2 A; 1G3T A; 2XKO C; 4TVR A; 4RTV A; 2X51 A; 2AK5 A; 3CD6 T; 1YJW Q; 3OS5 A; 3CPW S; 5GAN g; 2ZPB B; 2LNV A; 3LYI A; 2G6F X; 1U8R A; 3OMC A; 4MZP A; 2QA4 T; 3G7Z A; 2EPD A; 2DEU A; 3I56 A; 1G3Y A; 4PJO C; 3QWY A; 1ZHI A; 5FWB A; 3CCE A; 4PK4 A; 1Q86 C; 3L2V A; 1D3B A; 3TU4 K; 4JJN K; 2JVV A; 4J6X A; 3LX7 A; 1O75 A; 1H3H A; 5I11 A; 5D6X A; 1UUE A; 1K73 R; 1R0B G; 2CT3 A; 4QVZ A; 1KQS A; 4FCY A; 1NJI U; 4ZTJ A; 3H0H A; 3OSV A; 1R8O B; 4M78 E; 3L2Q A; 2KRO A; 2JJ9 A; 1EZZ B; 1GFD A; 4E7L A; 2Y4X A; 1GCP A; 2MCN A; 2PVO B; 2RI2 A; 3FLG A; 4ZGD B; 1TUD A; 3G6E T; 5GMK j; 3QO3 A; 3A5Z B; 2CYZ B; 5LJ5 f; 1PSE A; 1NG2 A; 1T3S A; 2LQN A; 1VQ8 A; 2A08 A; 2DM1 A; 4JRI A; 2JTE A; 4LDW A; 1BKB A; 2HEQ A; 3AHU A; 2LNH B; 4C92 G; 1DJ7 B; 1W4S A; 1K4U S; 1KJW A; 1XJW B; 5GAN 3; 3RKY A; 2ZPF B; 4DQ2 A; 3MO8 A; 3NTK A; 2EJF A; 3NGP A; 4Z89 A; 2L3R A; 4M7A C; 3JB9 G; 3JB9 F; 1T0H A; 1WHM A; 4XU2 A; 2O9V A; 3CXC A; 5AT1 B; 2ZPH B; 3RNJ A; 3EHR A; 4RTT A; 4IUT A; 1WLP B; 2MWP A; 1JO8 A; 2DL4 A; 4XQ3 A; 1QP2 A; 3FJP A; 4OB1 B; 4P5N A; 2RI5 A; 1H8K A; 2DXC A; 1RAH B; 1QVF A; 1M4Z A; 1RLQ C; 2CP3 A; 3CCL A; 4V2S A; 3QG1 A; 1VQ5 A; 1LPL A; 4AT1 B; 1ZSZ A; 1EFN A; 1BCM A; 1BB9 A; 5A0D A; 5KYU B; 3PE0 A; 2EAY A; 4C8Q G; 4C8Q F; 4BE1 A; 3OYC A; 4J9B A; 1WZO A; 2YDL A; 2MF2 A; 3M58 A; 4D8K A; 3UT1 A; 2X3W D; 1GCQ C; 5KYX A; 2I2L A; 4QQ6 A; 1NEG A; 2OX7 A; 3S3O A; 4PLL A; 4C5H A; 1MV3 A; 2YRV A; 4PL6 A; 3CCR A; 2CGH A; 2HZY A; 4M77 D; 4II1 A; 4J9G A; 5GAM h; 3M9Q A; 4PJO A; 1HK9 A; 3CPW A; 1M3B A; 2RQT A; 3CCR T; 2JOY A; 5GAN j; 3DLM A; 3DB3 A; 3I55 A; 2K3X A; 2NUT B; 5GAM d; 3CME A; 2YRC A; 2LCL A; 3JCM e; 2WAC A; 2VWF A; 5GMK e; 1FYN A; 4PFP A; 4Z02 A; 3OYD A; 1OQK A; 3I56 Q; 2AKL A; 1P92 A; 1YWO A; 2DIL A; 4MML A; 2M9U A; 3OBW A; 3CCE Q; 5GAO p; 2EWN A; 5LJ3 d; 1K73 C; 5D6W A; 2E64 A; 2AKK A; 3GLX A; 1HJD A; 3CMA A; 1UB4 A; 5LJ5 g; 3CBP A; 2OTL Q; 1YHQ T; 1WYX A; 4F7U G; 4KGZ B; 4F7U F; 3VYH B; 2MOX A; 2HAX A; 1FMW A; 3CMA T; 3ASK A; 4OMN A; 2IG0 A; 2QQA A; 2R5M A; 1UJY A; 4DBF A; 2DYI A; 4J7I A; 2CZ6 B; 5A2Q E; 5EG2 A; 4LDX A; 2KR3 A; 2E1H A; 2YUP A; 4LD6 A; 5CO7 A; 1KSW A; 1VQ8 Q; 4GBQ A; 2X4J A; 4OP0 A; 3M4G A; 2L3S A; 2EW3 A; 2LTO A; 3OS1 A; 2EBP A; 2NUP A; 4DBH A; 1E6G A; 2XDP A; 3L2U A; 4A4K A; 4A53 A; 4E7J A; 3G4S T; 3C94 A; 2QQ9 A; 3CC4 T; 4Q5W A; 3EFO B; 4AFU C; 1TOV A; 2E12 A; 2KGT A; 4XAX B; 2HCK A; 2YUO A; 2BE7 D; 3SWN B; 4JS5 A; 2DKG A; 2LQ8 A; 3CPW P; 1A0N B; 2BZX A; 5HCK A; 3TRE A; 1X27 A; 1JJ2 S; 1MGQ A; 2RHX A; 2AT1 B; 4GY5 A; 4J6Y A; 3NTI A; 1IO6 A; 3MP6 A; 1S72 T; 1K9M U; 4A63 B; 3VS1 A; 4J9I A; 1UGQ B; 4M75 G; 4C0Z A; 3M0Q A; 4M75 F; 1N8R C; 1GBQ A; 1PC0 A; 2YT6 A; 5GAO n; 3RIR A; 1TG0 A; 5HK0 A; 1K0X A; 1YJN A; 1AWW A; 3CCL Q; 2ABL A; 2DYB A; 1VQ5 Q; 1UJ0 A; 4ESR A; 5GAN e; 2HDA A; 2RA2 A; 2FVU A; 1M90 C; 2VAS A; 1VYU A; 3I9Q A; 1ACM B; 2QQR A; 1H92 A; 1YJN T; 1H3Z A; 5I21 A; 3OYF A; 2KT8 A; 2RPN A; 3QZ5 B; 4N0A C; 4FYY B; 1SPK A; 2C0I A; 1RAG B; 3TSW A; 4OMP A; 2XHC A; 4X9C A; 2COZ A; 1V1C A; 2FZC B; 4XU3 A; 4DEX A; 1HYO A; 4PJO E; 4M78 C; 4QKU A; 3QYG B; 4RCC A; 1AHJ B; 3CCV A; 3KBG A; 2DET A; 1JXO A; 3VS3 A; 4FL6 A; 2HSP A; 5DY9 A; 1NM7 A; 3O5Z A; 1Y71 A; 3CCV T; 1K8A C; 3EG3 A; 3MHX A; 1VIE A; 2X9H A; 3I55 Q; 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2HMA A; 1Q81 C; 3A8M B; 2QI2 A; 3EAE A; 2LJ0 A; 2NUT A; 4EMG A; 3MPU B; 3EFR A; 5GJV B; 2QEX A; 1VQ7 A; 4RG8 A; 1VQL T; 2P0P A; 1NZ9 A; 8ATC B; 1GRI A; 2DTH A; 2HKN A; 3HP9 A; 1WJQ A; 4F7U A; 3FDR A; 3JCM d; 1IRE B; 2BKD N; 2RQU A; 2M51 A; 1UHF A; 2NLU A; 3EFS A; 1W6X A; 5J26 A; 2YUQ A; 1M1K R; 2ZPG B; 3CC2 Q; 2RHU A; 2DK3 A; 3WVD B; 2CP5 A; 4KUD K; 1VQP A; 4AFS C; 3MP8 A; 2CT4 A; 1YP5 A; 1ARK A; 4NL3 A; 5C0M A; 1NYG A; 5LJ5 e; 2KAF A; 3D7S B; 3MEA A; 2V26 A; 3JCM Q; 4AFQ C; 4HT8 A; 1FXX A; 4CC4 B; 5HKC A; 5A0L A; 2C06 A; 3JSC A; 3QDR B; 4IUP A; 4M77 C; 5IXB A; 3V8L A; 1QWF A; 2VVK A; 3QSU A; 2P84 A; 1QP3 A; 3C0C A; 5J39 A; 2NUP B; 3PNW C; 3CEY A; 2RHI A; 1CSK A; 3E2U A; 4QW2 A; 3JRZ A; 4B6M A; 1N5Z A; 3P8D A; 4O5V A; 2ZGW A; 1S1N A; 2KE9 A; 3DB4 A; 1VQ6 A; 4C8Q E; 2QGF B; 3DLL A; 3CD6 A; 2RJC A; 2O88 A; 1BI2 A; 1IZ6 A; 3SWN A; 1EX4 A; 1JB0 E; 2HL5 C; 1VQ6 T; 5CKD A; 1M9S A; 1YI2 T; 2QA4 A; 2DZ9 A; 2E10 A; 3CCS Q; 2C0T A; 1I5L A; 2OAU A; 5GAO l; 4FW2 A; 1X01 A; 3MEV A; 3GNG A; 2A37 A; 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