The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
9
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sequence length |
59
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structure length |
59
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Chain Sequence |
STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Transferase
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| total genus |
9
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| structure length |
59
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| sequence length |
59
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2012-02-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SHG A; 3VS0 A; 3EG0 A; 4K11 A; 4DEX A; 1GFD A; 3UAT A; 1KFZ A; 1AZG B; 1V1C A; 2JS0 A; 2YDL A; 4LNP A; 1J3T A; 4JZ4 A; 2MCN A; 4GBQ A; 4OMN A; 2V1Q A; 3VS3 A; 2YUP A; 2DYB A; 1T0J A; 2XMF A; 1RI9 A; 1X2K A; 3EG1 A; 3GBQ A; 2O9S A; 2O2O A; 2LJ0 A; 1UJY A; 4JZ3 A; 2GGR A; 4OMQ A; 1WA7 A; 1X43 A; 1YWP A; 2D8J A; 1WXT A; 1A0N B; 1S1N A; 2BZY A; 2FRW A; 2DBM A; 1XOV A; 2RQW A; 3M0Q A; 2GTJ A; 1QWE A; 2A08 A; 2CUD A; 1NYG A; 2MOX A; 1U06 A; 4J9H A; 3H0F A; 3VS2 A; 4FSS A; 4J9E A; 1ZBJ A; 2AZS A; 3CQT A; 2K3B A; 4CC3 A; 4F14 A; 2FRY A; 4HXJ A; 3NPF A; 1WXB A; 4Z8A A; 2J6K A; 2C0T A; 4LN2 A; 4LUD A; 4ESR A; 2AKK A; 2JTE A; 2HDA A; 2JT4 A; 3ULR B; 1N5Z A; 2DL7 A; 4Z89 A; 1B07 A; 2I0N A; 1OEB A; 3SHW A; 1NYF A; 1SEM A; 4D8D A; 5L23 A; 1U5S A; 3A98 A; 3UA7 A; 2V1R A; 2DRM A; 1WYX A; 1ZLM A; 1OPK A; 2DL3 A; 1GCQ C; 2KT8 A; 2K6D A; 2J7I A; 2LMJ A; 2YSQ A; 2ABL A; 2JMC A; 1QWF A; 1UUE A; 2CT4 A; 1M27 C; 3VS7 A; 2DL5 A; 2OAW A; 5IHK A; 1QKX A; 2HCK A; 1VYU A; 1K9A A; 2OJ2 A; 2YT6 A; 1WIE A; 2FPE A; 4RTX A; 1RLQ C; 1E6H A; 2NWM A; 3PE0 A; 2L0A A; 3VS1 A; 1BBZ A; 2EGC A; 1M8M A; 2YUQ A; 1YP5 A; 2D8H A; 1I1J A; 2BZ8 A; 2FO0 A; 2JW4 A; 4D8K A; 4JJB A; 2ROT A; 2O31 A; 2DF6 A; 1G2B A; 2H8H A; 1GRI A; 2DM1 A; 4A63 B; 4RUG A; 1M3C A; 2X3X D; 2EGE A; 1X69 A; 1X6G A; 2EKH A; 2JXB A; 3VS5 A; 4AG1 C; 1Z9Q A; 2CSI A; 2LQN A; 3UF4 A; 3VS6 A; 4OMO A; 5IH2 A; 4HCK A; 2NUZ A; 2PTK A; 2QDL A; 2LQW A; 3UA6 A; 2J05 A; 4HVW A; 4X1V A; 2J06 A; 3U23 A; 1T3L A; 4GLM A; 1AZE A; 1FMK A; 2HEQ A; 2JMA A; 2K79 A; 2EYX A; 2ROL A; 1JXM A; 1EFN A; 2MIO A; 1WLP B; 3SEM A; 2CH4 W; 5FWC A; 2KYB A; 1H3H A; 1NEB A; 1RLP C; 2LP5 A; 1H92 A; 2RQR A; 1BU1 A; 1X6B A; 3EHR A; 4LUE A; 1BB9 A; 1KIK A; 1AOJ A; 2LJ1 A; 1OOT A; 3REA B; 2ED1 A; 2RQT A; 1AWX A; 1E6G A; 1RUW A; 1NG2 A; 1NLO C; 2EQI A; 2GQI A; 3EHQ A; 1K4U S; 5IXF A; 3ZL7 C; 3NMZ C; 2FPF A; 3IQL A; 1YN8 A; 1OPL A; 2JM9 A; 1HJD A; 2JM8 A; 2GBQ A; 1UJ0 A; 1HD3 A; 2DBK A; 1PKS A; 2KGT A; 4M4Z A; 1UE9 A; 3PVQ A; 2DRK A; 2O88 A; 1YNZ A; 2KRN A; 1K1Z A; 3R6N A; 2DA9 A; 1W70 A; 1MUZ A; 1W6X A; 4ZNX A; 1W1F A; 1Y0M A; 1OV3 A; 1HSQ A; 1YCS B; 5FWB A; 4RTY A; 4IIM A; 2RMO A; 1ZUU A; 3M0S A; 1WX6 A; 1GCQ A; 2M0Y A; 3NGP A; 1MV3 A; 3TSW A; 1UFF A; 1B3Q A; 1NEG A; 2FEI A; 4RTZ A; 2A28 A; 1M3A A; 1ZUY A; 2RQU A; 5IHN A; 2RPN A; 2BZX A; 4CC4 B; 1JU5 C; 2J6O A; 3EG2 A; 1AEY A; 2YUN A; 2HSP A; 2KRO A; 1JEG A; 1QLY A; 2KYM A; 1QCF A; 1UEC A; 1PRM C; 4JPB W; 2K7A A; 4OMM A; 1SSH A; 1AD5 A; 1ZSG A; 4RTT A; 2DIL A; 4IIO A; 2EGA A; 2K9G A; 3H41 A; 2KRM A; 1NLP C; 2F2V A; 2FG0 A; 2F2W A; 3I5R A; 1WXU A; 2E5K A; 5HCK A; 2KXC A; 3VRY A; 1WFW A; 1YWO A; 2FPD A; 1ZX6 A; 2A37 A; 2RN8 A; 3M0R A; 1K0X A; 1ZUK A; 1GFC A; 2KE9 A; 2GNC A; 1KSW A; 1NM7 A; 4Y92 A; 1I07 A; 3VRZ A; 2DX1 A; 2BTT A; 2ESW A; 2CT3 A; 1UG1 A; 2DE0 X; 4HVV A; 5I11 A; 5GJW B; 2L2P A; 2L3P A; 1UTI A; 3I5S A; 4WCI A; 3FJ5 A; 3RNJ A; 1BK2 A; 2L3Q A; 3C0C A; 4AFQ C; 4AFS C; 2LX7 A; 1MV0 B; 2DLP A; 1I0C A; 5FW9 A; 4JJC A; 2EW3 A; 2K2M A; 4R0K A; 4QT7 A; 1IO6 A; 2AKL A; 2HBW A; 4CC7 A; 1TUD A; 1T3S A; 2A36 A; 2O9V A; 2OI3 A; 2DNU A; 2KEA A; 1JXO A; 3QWY A; 2JS2 A; 4AG2 C; 1ABO A; 3TSZ A; 4AFU C; 1M30 A; 2G6F X; 1K0S A; 4HVU A; 5EC7 A; 4DEY A; 5I22 A; 5IXB A; 1WDX A; 5GJV B; 1UHC A; 1AVZ C; 2KRS A; 2GTO A; 1PRL C; 2KT1 A; 2X3W D; 2C0O A; 1SRL A; 1T0H A; 3RBB B; 2CDT A; 2W0Z A; 2KNB B; 2ENM A; 1SRM A; 2LNH B; 1CKA A; 4CC2 A; 4RTV A; 1PHT A; 3H0I A; 2L3S A; 2D1X A; 2CUB A; 3LH5 A; 1K76 A; 2DL8 A; 2W10 A; 3I35 A; 1WI7 A; 4J9I A; 2B86 A; 2DL4 A; 2EYZ A; 2VVK A; 3REB B; 2AK5 A; 4RTW A; 4J9G A; 3NHN A; 2RQV A; 1M3B A; 3EGU A; 1JQQ A; 1G83 A; 4AFZ C; 2F2X A; 3PVL A; 2PNI A; 4JJD A; 2CRE A; 2KBT A; 1SHF A; 1PKT A; 3O5Z A; 4RTU A; 4OMP A; 4J9D A; 2LCS A; 2ECZ A; 5ECA A; 2VWF A; 1TUC A; 4KRT A; 1UDL A; 2SRC A; 2EPD A; 2LJ3 A; 1KJW A; 4E6R A; 2DMO A; 2EVR A; 2D0N A; 3VS4 A; 5IHI A; 2VKN A; 1CSK A; 4J9F A; 1ARK A; 4J9C A; 1E7O A; 1H8K A; 1QKW A; 1VYV A; 2P4R A; 3JV3 A; 4J9B A; 3THK A; 2DVJ A; 2J6F A; 1PWT A; 2ED0 A; 2IIM A; 1UHF A; 1UGV A; 1GL5 A; 2C0I A; 2PZ1 A; 2KR3 A; 2YUO A; 3TVT A; 1X27 A; 2CH4 A; 4OML A; 3KFV A; 1AWO A; 4Z88 A; 2SEM A; 3QWX X; 2RNA A; 2AZV A; 3M0U A; 1Z9Z A; 4ORZ A; 1JO8 A; 2LZ6 B; 3H0H A; 1TG0 A; 3M0T A; 1PNJ A; 1SPK A; 2EBP A; 2EYY A; 4EIK A; 1U3O A; 1ABQ A; 1FYN A; 4F17 A; 1GCP A; 2KXD A; 3M0P A; 1GBR A; 3EG3 A; 1Y57 A; 1X2Q A; 2EYW A; 2CSQ A; 1CKB A; 4LE9 A; 1LCK A; 1VA7 A; 1AWW A; 3I9Q A; 2RF0 A; 1GBQ A; 1AWJ A; 1VYT A; 2DJQ A; 4F16 A; 2M51 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2BUD A; 4V2S A; 4K11 A; 5CO7 A; 4DEX A; 1GFD A; 5HY6 A; 2DER A; 4JS4 A; 1YJ9 T; 2MF2 A; 2Y4X A; 2YDL A; 3LYI A; 2XMF A; 1X2K A; 3JCM f; 4C8Q D; 1UJY A; 1VQ9 T; 4L5G A; 3CCU Q; 1VQN T; 3GIB A; 2RI3 A; 1M9S A; 5GAM g; 2X4W A; 2BZY A; 2DBM A; 1XOV A; 5LJ3 g; 3M0Q A; 2EQJ A; 1QWE A; 4LDV A; 5CAI A; 1QVG P; 2A08 A; 5KYY A; 2EJG A; 1IGU A; 1NYG A; 1U06 A; 4E7I A; 1IXD A; 3RUX A; 2K3B A; 4RCB A; 4F14 A; 3CCR Q; 4M7A C; 2FRY A; 2KI7 A; 5HK0 A; 1KG1 A; 1ZA1 B; 3CC2 A; 1G3S A; 3LW5 E; 3L42 A; 3AT1 B; 3JCM P; 2HDA A; 4PJL A; 3CC7 A; 3S3M A; 3ULR B; 1VQL Q; 4FYV B; 1PG5 B; 2QGF B; 4XK8 E; 4M7D F; 2HL5 C; 2O01 E; 3SHW A; 1VQ4 A; 1Q7Y R; 3NTK A; 1SEM A; 3CCR T; 2DPP B; 4RCC A; 1XJW B; 1U5S A; 4JDS A; 4F7U E; 3MEV A; 2LCL A; 1OPK A; 2D9T A; 4IUT A; 3SDZ A; 5KYU B; 4OB2 B; 2A3L A; 1ACM B; 3MHX A; 1K8A U; 2ABL A; 1VQL T; 4PJO D; 3RKW A; 5GMK e; 1M27 C; 1K73 R; 3G4S A; 5IHK A; 2KK4 A; 5I2M A; 4E7L A; 2OJ2 A; 4OP0 A; 3VU3 C; 2CZ6 B; 3S3O A; 1KHC A; 2L0A A; 3VS1 A; 2EGC A; 2MAM A; 1M8M A; 1R0B G; 1WJS A; 8ATC B; 2RJD A; 5GAN d; 1EX4 A; 4D8K A; 5GMK m; 2RA2 A; 4PJN A; 4J5Y A; 4M77 G; 5KCH A; 4HT8 A; 4FT2 A; 2P0K A; 4R56 A; 2R5A A; 3CCV A; 4LDX A; 2O4X B; 2CSI A; 5I2S A; 1MMG A; 3OYY A; 3CXC A; 4M7D B; 1PSF A; 3PIP A; 2PTK A; 2QDL A; 3HFO A; 3UA6 A; 2IPO B; 2J05 A; 2J06 A; 2EIF A; 5CKH A; 1AZE A; 2NUT A; 1VIF A; 2K79 A; 2EYX A; 3JB9 D; 2ROL A; 1VQO A; 1FMW A; 1ZSZ A; 4XQ3 A; 4EDU A; 1EFN A; 3SEM A; 5GAN j; 2G3R A; 2HSE B; 5FWC A; 3CPW S; 2LP5 A; 3HP9 A; 3QO3 A; 7AT1 B; 1BU1 A; 4C0D C; 3A8G B; 1LOJ A; 4E47 A; 4BY6 B; 3PMT A; 1X6O A; 1K8A C; 1F1B B; 3RKY A; 2GQI A; 3CD6 A; 1YIT A; 1YN8 A; 1OPL A; 3FEO A; 1HJD A; 4OB0 B; 1UJ0 A; 2YLC A; 1PKS A; 3G6E A; 4M7A D; 1TXQ A; 2KRN A; 3R6N A; 5EG2 A; 1MUZ A; 1YIT T; 2ZPI B; 4C8Q G; 3L2R A; 5FWB A; 4IIM A; 2WSE E; 1N9S A; 2QAS A; 1K8A R; 1MV3 A; 1UFF A; 1B3Q A; 1NEG A; 1QMC A; 4RTZ A; 3JCM W; 3OBW A; 3X26 B; 4M75 A; 2DKG A; 2RQU A; 3CCQ A; 4IUU A; 4XU0 A; 1JU5 C; 3EG2 A; 2FZG B; 1WJQ A; 3GF5 A; 1JEG A; 2M0O A; 2YRC A; 3EH2 A; 1QCF A; 1JJ2 S; 4XTY A; 2JN0 A; 4JPB W; 1SSF A; 2XK0 A; 2HZY A; 1SSH A; 1AD5 A; 3HL8 A; 2KRM A; 1UGS B; 3I5R A; 1Y96 A; 4AMC A; 5A0L A; 1YWO A; 2DTO A; 3JB9 J; 1GFC A; 1KSW A; 3QDR B; 1NM7 A; 4F7U A; 4QKU A; 2P0P A; 1YI2 A; 3A1P A; 3VRZ A; 2DX1 A; 2BTT A; 2KQW A; 2C06 A; 3FJP A; 4HVV A; 4PJO G; 2VGN A; 3X28 B; 2DXU A; 2LT4 A; 5GAM j; 3EGD A; 4CI0 C; 2B8A A; 5LJ3 j; 2XID A; 2DLP A; 1IRX A; 4MZT A; 4JJC A; 5IT9 E; 3CC4 A; 2MWP A; 2E3H A; 1U1T A; 2DZC A; 2E6Z A; 3QHS A; 1AHJ B; 1Q82 R; 1BIB A; 4X9C A; 4M75 F; 2JS2 A; 1ZSZ B; 4AG2 C; 3NTI A; 2EKO A; 2G6F X; 2FYK A; 2GQV A; 1K0S A; 4II1 A; 1WDX A; 1OZ3 A; 4X9D A; 2KRS A; 4TVR A; 2PUK B; 2JJ9 A; 1SRL A; 3G71 A; 2AHJ B; 2JOY A; 4UC4 A; 1OQK A; 2CDT A; 3OB9 A; 2ENM A; 2EFI A; 3OBY A; 1CKA A; 1YHQ Q; 4KGX B; 4IUP A; 1XQH A; 1TH7 A; 3JB9 G; 3OS1 A; 2VVK A; 1IGQ A; 4KGZ B; 2XDB A; 3E2U A; 3LGL A; 4F7U F; 4C5H A; 4OGC A; 4C5G A; 3URG A; 4ZGD B; 4BDY A; 4JJD A; 2CRE A; 4A54 A; 5DY9 A; 1YHQ T; 2X4X A; 4MZP A; 4M77 B; 1WQ7 A; 2E1H A; 1UEB A; 4DBQ A; 1BYM A; 3QXE B; 4M7D E; 2VWF A; 4KRT A; 2LQ8 A; 2LVM A; 3OYC A; 4OGE A; 2EPD A; 5AYF A; 3MPU B; 2LJ3 A; 4E6R A; 2DMO A; 1H64 1; 4M78 D; 5FU6 B; 3X20 B; 2K5L A; 4ANJ A; 4J9F A; 3G1J A; 3OY9 A; 4M75 B; 4QVC A; 1MNE A; 2DVJ A; 2IIM A; 1UHF A; 4M7A G; 1WHL A; 3CEY A; 3L2U A; 1X27 A; 3EAE A; 1AWO A; 1PD0 A; 1M1F A; 1Z9Z A; 4ORZ A; 1BI0 A; 3MP6 A; 3I55 A; 4IKF A; 2EBP A; 1LVK A; 1FYN A; 4F17 A; 1Y96 B; 4O6J A; 1GCP A; 4PJM A; 4EPC A; 1Y57 A; 4J6X A; 1Y07 A; 1X2Q A; 2EYW A; 1CKB A; 1LCK A; 4PL6 A; 3CBO A; 1HXD A; 2BIV A; 4C92 C; 1AWJ A; 1OUL A; 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2XKO C; 1VQP Q; 1K9A A; 1QVP A; 2F5K A; 1VQ8 A; 2V8K A; 2DD5 A; 2YT6 A; 4R55 A; 3HSB A; 2QEX Q; 1MGQ A; 4E7S A; 4FU6 A; 2FPE A; 2E10 A; 1YJW A; 3HRT A; 5LJ5 f; 1YIJ A; 1VQ7 T; 4QVZ A; 1YP5 A; 2D8H A; 2O4X A; 1B7T A; 2DF6 A; 2H8H A; 5D6Y A; 3T9N A; 2XDP A; 1VQP T; 3QZ5 B; 2EGE A; 1X69 A; 3NFC A; 1X6G A; 2QEX T; 1U8R A; 4M78 G; 3CMA A; 1M2V B; 3UF4 A; 1WPY A; 3QKJ A; 4HCK A; 3EFO A; 2PQW A; 4C92 D; 2K4Y A; 3V7R A; 3DKM A; 3QPH A; 4GLM A; 1KHI A; 1FMK A; 2QI2 A; 1KQS A; 2LRQ A; 4M77 E; 4KH0 B; 1D0X A; 1H3H A; 1NEB A; 2RQR A; 2PVD B; 1X6B A; 3EHR A; 4C0F A; 4B9X A; 5GAO r; 1AOJ A; 1OOT A; 3WVE B; 2VC8 A; 1Q81 C; 1E6G A; 2RB6 A; 4M75 E; 1MND A; 4PLL A; 1RUW A; 3ASK A; 5IAY A; 3OW2 S; 5KYX B; 5D6W A; 3CC2 Q; 2EQI A; 1K4U S; 4OF1 A; 3IQL A; 4DBH A; 3ME9 A; 3CC7 Q; 4KUL A; 2M9U A; 1K9M U; 3CCM A; 4M7A B; 4EMH A; 1UE9 A; 2O88 A; 1YNZ A; 4EMK C; 1VQ4 Q; 5GAM h; 3OYD A; 9ATC B; 3EGX A; 1GXI E; 1W70 A; 4ZNX A; 1Y0M A; 5LJ3 h; 1OV3 A; 3L1A A; 3CC2 T; 1YCS B; 4J6W A; 1TOV A; 2RK1 A; 3M0S A; 1WX6 A; 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