The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
66
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structure length |
66
|
Chain Sequence |
DNFIYKAKALYPYDADDDDAYEISFEQNEILQVSDIEGRWWKARRANGETGIIPSNYVQLIDGPEE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Genomics of Yeast SH3 Domains
rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN SSU81
|
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
13
|
| structure length |
66
|
| sequence length |
66
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-12-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4OMM A; 4IIO A; 1B07 A; 3NHN A; 1G83 A; 2FPE A; 1EFN A; 4A63 B; 4DEX A; 1FMK A; 1OOT A; 2HCK A; 2FO0 A; 4J9C A; 4RTV A; 3QWY A; 1AZE A; 1HSQ A; 1W6X A; 1K4U S; 2P4R A; 3EG2 A; 2EYX A; 4K11 A; 2DBK A; 1ZUK A; 2JS0 A; 1AWO A; 1RUW A; 2PZ1 A; 3KFV A; 3ULR B; 1TUC A; 4LNP A; 2D8J A; 1CKA A; 2RQV A; 1MUZ A; 5FWB A; 2RQT A; 4D8D A; 3U23 A; 2JM8 A; 2J7I A; 2JW4 A; 1VYT A; 3TSW A; 2KNB B; 2ENM A; 1OPL A; 1I07 A; 1XOV A; 4JJD A; 5EC7 A; 1X2Q A; 2W0Z A; 2RNA A; 1ABQ A; 2NUZ A; 2D8H A; 2K6D A; 4OML A; 1W1F A; 2OJ2 A; 1Y0M A; 2SRC A; 3VS4 A; 1UJ0 A; 4AFU C; 4JZ4 A; 2DL7 A; 2L2P A; 2J06 A; 1VYU A; 2KT1 A; 4F17 A; 2JMC A; 2EQI A; 4LUD A; 1AD5 A; 2DRM A; 3H41 A; 3VS5 A; 1YWO A; 2BTT A; 2DNU A; 1SHF A; 1BB9 A; 1QKX A; 2HSP A; 1QKW A; 2X3W D; 1KJW A; 4E6R A; 3C0C A; 4AG2 C; 2DL3 A; 1YN8 A; 2EPD A; 2MIO A; 4OMP A; 3PVL A; 1K1Z A; 2E5K A; 2CUD A; 1NG2 A; 1WI7 A; 3I5R A; 2F2X A; 1UJY A; 1N5Z A; 2RQW A; 3VS3 A; 5IHK A; 1ZSG A; 2DA9 A; 2K9G A; 2MOX A; 2KXC A; 2RMO A; 1IO6 A; 1ZUU A; 1VYV A; 3QWX X; 3REA B; 2C0T A; 1G2B A; 1SEM A; 2KRS A; 2AZS A; 4JJC A; 4JJB A; 4F14 A; 2EGE A; 4OMN A; 2M0Y A; 2DL4 A; 1WIE A; 3M0Q A; 1MV0 B; 2A28 A; 2EYZ A; 2J6F A; 2DMO A; 2VWF A; 2L3S A; 1AZG B; 1WX6 A; 1S1N A; 5IHI A; 1JO8 A; 3VS6 A; 3FJ5 A; 2PTK A; 2YDL A; 1AVZ C; 1QWF A; 1PRL C; 1M3A A; 5ECA A; 4ESR A; 4J9G A; 1M3C A; 2OI3 A; 1LCK A; 2EBP A; 4RTU A; 1E6G A; 1PRM C; 1X43 A; 1JQQ A; 2H8H A; 2X3X D; 3TVT A; 2K3B A; 2DVJ A; 2O9S A; 1AEY A; 1WXT A; 2FPD A; 5IXB A; 2OAW A; 2AZV A; 2A36 A; 2DJQ A; 1UE9 A; 3EG0 A; 1K0X A; 1FYN A; 4RTY A; 2JT4 A; 1NYF A; 3H0I A; 3VS0 A; 1T3L A; 2KRM A; 4J9E A; 4AFS C; 4J9B A; 2FEI A; 2IIM A; 1ABO A; 2GBQ A; 4GLM A; 4Z8A A; 5IH2 A; 4HVV A; 1NLO C; 4CC4 B; 2SEM A; 2VVK A; 1W70 A; 3I9Q A; 4AFZ C; 1NYG A; 1E6H A; 3R6N A; 3M0S A; 1MV3 A; 2YT6 A; 3I5S A; 2LJ1 A; 1M8M A; 2RQU A; 2K2M A; 1BK2 A; 4RTZ A; 1U5S A; 1I0C A; 4ORZ A; 2KXD A; 1AOJ A; 2G6F X; 2CSI A; 3UF4 A; 2EGC A; 3EG1 A; 1WXB A; 2EYY A; 4LN2 A; 3REB B; 3EHQ A; 3VS1 A; 5L23 A; 2DL8 A; 1OV3 A; 2CH4 W; 2QDL A; 3UA7 A; 4AFQ C; 4RTX A; 1KFZ A; 2GNC A; 1X6B A; 2JS2 A; 1ARK A; 1TG0 A; 2AKL A; 1M3B A; 2YUP A; 2J05 A; 4HCK A; 3VS7 A; 2ED0 A; 2ROL A; 1H92 A; 1UGV A; 3IQL A; 1PHT A; 1U06 A; 2LQW A; 2EW3 A; 2ROT A; 2B86 A; 4RUG A; 2DRK A; 3UAT A; 2KT8 A; 2DBM A; 2K7A A; 2FPF A; 1KIK A; 2LJ0 A; 1Y57 A; 2LCS A; 4RTT A; 1NEG A; 2GGR A; 4D8K A; 2L3P A; 1GBR A; 1V1C A; 4Z89 A; 1J3T A; 1YCS B; 2KYB A; 4KRT A; 1SPK A; 3RBB B; 2EGA A; 3CQT A; 4RTW A; 1JXO A; 2DYB A; 2GTJ A; 2C0O A; 2LNH B; 5GJW B; 5FW9 A; 1UG1 A; 1HD3 A; 2LQN A; 3LH5 A; 1SRM A; 1UDL A; 1KSW A; 2DF6 A; 1QLY A; 4JPB W; 2W10 A; 3H0F A; 1M30 A; 1X6G A; 1RI9 A; 3H0H A; 4IIM A; 1QWE A; 4FSS A; 5FWC A; 2I0N A; 4WCI A; 4LUE A; 4CC7 A; 2O2O A; 3I35 A; 2LX7 A; 4OMQ A; 2L3Q A; 1PKT A; 3ZL7 C; 2PNI A; 1WXU A; 1T0H A; 3M0T A; 4J9I A; 2D0N A; 3GBQ A; 5GJV B; 2FRY A; 3PE0 A; 2KBT A; 1RLP C; 1UTI A; 2CRE A; 2C0I A; 2O31 A; 2BZ8 A; 1PKS A; 1GL5 A; 1T3S A; 1HJD A; 2JM9 A; 1GCQ C; 4AG1 C; 1WA7 A; 3PVQ A; 1K76 A; 1Z9Q A; 4GBQ A; 1UUE A; 2AKK A; 4ZNX A; 3JV3 A; 3VS2 A; 1WDX A; 3M0U A; 3EGU A; 4R0K A; 4X1V A; 2O88 A; 2HBW A; 2DM1 A; 1ZX6 A; 2MCN A; 1NM7 A; 2CT3 A; 4J9H A; 4EIK A; 2LZ6 B; 2LMJ A; 2J6K A; 5IXF A; 2CT4 A; 1NEB A; 2RN8 A; 2JMA A; 2RQR A; 1NLP C; 1Z9Z A; 2GQI A; 3M0R A; 4HXJ A; 2DE0 X; 2CDT A; 2RF0 A; 4HVU A; 1AWX A; 2KYM A; 1K0S A; 5IHN A; 2BZX A; 2BZY A; 2V1R A; 2DLP A; 2ED1 A; 3EHR A; 2KEA A; 3M0P A; 2F2V A; 1PWT A; 2CUB A; 2KGT A; 1GCQ A; 2EYW A; 1BU1 A; 2ESW A; 2A37 A; 3SEM A; 2HEQ A; 1GFD A; 2GTO A; 2CSQ A; 1WFW A; 3NMZ C; 2NWM A; 4F16 A; 1JU5 C; 2DIL A; 2FG0 A; 2O9V A; 3RNJ A; 2EKH A; 1SSH A; 4CC3 A; 1X27 A; 4JZ3 A; 1CKB A; 5HCK A; 2RPN A; 3NPF A; 2XMF A; 2YSQ A; 3A98 A; 4M4Z A; 1UFF A; 5I22 A; 1T0J A; 2KR3 A; 1H8K A; 1OPK A; 2L0A A; 1WYX A; 1YNZ A; 1A0N B; 2JXB A; 4J9F A; 4Y92 A; 1ZLM A; 2K79 A; 2V1Q A; 3TSZ A; 1I1J A; 2YUQ A; 1K9A A; 1JEG A; 2J6O A; 5I11 A; 4LE9 A; 1B3Q A; 4QT7 A; 4OMO A; 2CH4 A; 1AWW A; 2F2W A; 1QCF A; 2KRN A; 2JTE A; 2ABL A; 2YUO A; 1UEC A; 4Z88 A; 1X2K A; 1H3H A; 1JXM A; 1U3O A; 1PNJ A; 1X69 A; 1ZBJ A; 3SHW A; 2DL5 A; 3VRY A; 4CC2 A; 1ZUY A; 3VRZ A; 2LJ3 A; 2A08 A; 1UHC A; 4HVW A; 1CSK A; 2FRW A; 2VKN A; 1TUD A; 3O5Z A; 1OEB A; 2EVR A; 1YP5 A; 4J9D A; 3UA6 A; 2KE9 A; 1YWP A; 1M27 C; 1GBQ A; 2AK5 A; 3NGP A; 3EG3 A; 2KRO A; 1SRL A; 2M51 A; 2ECZ A; 1SHG A; 3THK A; 2LP5 A; 1GCP A; 1WLP B; 2HDA A; 1VA7 A; 1GRI A; 1UHF A; 2DX1 A; 1BBZ A; 1E7O A; 2D1X A; 1AWJ A; 1GFC A; 2YUN A; 1RLQ C; 4DEY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4OMM A; 4LDW A; 4ELZ C; 3NHN A; 2XIC A; 3OYN A; 1VQN A; 4OB1 B; 1KQ1 A; 2PUK B; 4M7D G; 3VUB A; 1OOT A; 4N0A A; 2P4R A; 4M7A B; 4C8Q F; 3PFS A; 4M78 A; 4OP0 A; 3JCM J; 2EYX A; 3CC4 T; 1PM3 A; 2YLB A; 3RKX A; 2HQE A; 3QJY A; 3ULR B; 4KGX B; 4LNP A; 1CKA A; 4M78 D; 4D8D A; 2J7I A; 1VYT A; 3TSW A; 2BE9 B; 3JB9 J; 2ENM A; 2RB6 A; 3CME Q; 1IGQ A; 1X2Q A; 2W0Z A; 1ABQ A; 3JCM g; 1JJ2 A; 1BCM A; 1Y0M A; 3V8K A; 3BE3 A; 1M90 U; 2R58 A; 5J26 A; 4JJN K; 2DXT A; 2RHZ A; 2EJG A; 1LJO A; 2OTJ Q; 2L89 A; 3MKD A; 1VYU A; 1D1C A; 3OYI A; 2XI9 A; 4LUD A; 1I8F A; 2DRM A; 1HYO A; 3V7C A; 2JOY A; 1U1T A; 2XK0 A; 2DXB A; 4BDZ A; 1QKX A; 1QKW A; 4XTZ A; 5CKB A; 2K2V A; 4M77 B; 5FRO A; 2HQH A; 2HSE B; 1U8R A; 2MIO A; 4OMP A; 3OW2 P; 3PVL A; 1BKB A; 3UWN A; 2E5K A; 4F7U G; 1WHJ A; 1WI7 A; 1UJY A; 4ZN3 A; 4C0D C; 3VS3 A; 2QTV A; 4IUV A; 2DA9 A; 3L2V A; 2A3L A; 2RMO A; 3F70 A; 3M53 A; 3QDF A; 1ZUU A; 1YJN T; 2DAQ A; 5I21 A; 2B8A A; 5CR2 A; 2E65 A; 2HL5 C; 1YJW A; 1WNL A; 2AZS A; 4JJC A; 4JJB A; 2EGE A; 3URG A; 3ASK A; 1KQS P; 2PVO B; 4N4I A; 2J6F A; 2EYZ A; 1YIJ T; 2PVG B; 2DYI A; 4PL6 A; 1D1A A; 2L3S A; 3TU4 K; 1HXD A; 4J8O A; 5IAY A; 1S1N A; 4AT1 B; 1MHN A; 5J39 A; 3AT1 B; 1S72 T; 1JBM A; 4DBF A; 2EAY A; 5KYU B; 1RAH B; 2H8H A; 2QG9 B; 2X3X D; 3O8V A; 3CME A; 4B9X A; 2DVJ A; 4C5H A; 3CD6 A; 2OAW A; 1OUL A; 3EG0 A; 1K8A C; 2RJE A; 1Y71 A; 1WPY A; 2JT4 A; 1NYF A; 3FIF A; 2ZPE B; 1M90 R; 5GAN 3; 2RHI A; 3VKI A; 2OTJ A; 5KYY A; 1K73 U; 1VQK Q; 4BE0 A; 1KHI A; 2DXC A; 4CC4 B; 1SKU B; 5LJ3 d; 1W70 A; 3VYH B; 4AFZ C; 4M78 F; 1ZSZ C; 3GP8 A; 1M1K U; 2JZ2 A; 3CCM A; 3M0S A; 1B34 B; 4C92 C; 1OU8 A; 2LJ1 A; 3CC2 Q; 1QCN A; 2ZPB B; 4PJO C; 3JCM e; 1PSF A; 3JCM h; 2LX9 A; 4LN2 A; 3REB B; 1D0Y A; 3VS1 A; 1TU0 B; 5CQX A; 1MMG A; 4J83 A; 4RTX A; 3NFC A; 2GNC A; 2QYZ A; 2NUT A; 3OBY A; 2DEQ A; 5KE2 A; 3PIP A; 4KH1 B; 1YJ9 Q; 1M3B A; 5CIU A; 1ZSZ A; 4RG2 A; 1KD1 U; 1UGV A; 2F5T X; 2CZ6 B; 5GAN 5; 3SB2 A; 2Y4X A; 5GMK l; 3J81 E; 4PJO A; 2DBM A; 4C92 D; 5CCA A; 3I55 T; 2DPP B; 2F5K A; 4D8K A; 2GGR A; 4PJO D; 1RL2 A; 3BDL A; 2KVQ G; 2IPO B; 4N4H A; 2KYB A; 1SPK A; 2MK5 A; 2V8K A; 2RHX A; 2EGA A; 4Y91 A; 1QVP A; 2H3E B; 1JXO A; 4DBQ A; 2QAS A; 2VXF A; 5D6W A; 1UG1 A; 3HTR A; 1HD3 A; 2D6F A; 3RIR A; 3LH5 A; 4PNO A; 5GAN d; 1TSF A; 3JAM E; 2DER A; 1KSW A; 1SG5 A; 4M7D E; 2XG8 D; 3ME9 A; 3H8Z A; 3M9Q A; 4M78 B; 3HFO A; 3H0H A; 3V8L A; 5FWC A; 5LJ5 f; 4CC7 A; 2O2O A; 1K73 R; 2ZPH B; 1NBE B; 3A1P A; 3M55 A; 3MET A; 2XD0 A; 2X4J A; 3GF5 A; 4Q5W A; 3CC7 A; 3CBM A; 2QGG A; 4JRI A; 5FU7 C; 4JS5 A; 4QVD A; 1M1K R; 4EMK C; 8ATC B; 4J9I A; 2D0N A; 3FLG A; 1QVG A; 3CCV T; 4GY5 A; 1D0X A; 4BD3 A; 5C6S A; 1RLP C; 1UTI A; 2DO3 A; 2QA4 T; 5GAN g; 3MO8 A; 4M7A G; 2GCX A; 2O31 A; 5AYF A; 4KUD K; 4ELY C; 1T3S A; 1HJD A; 1WA7 A; 1YJW T; 2CZ7 B; 1VQ7 A; 3RR6 A; 1UUE A; 3QZ9 B; 2C06 A; 1N6A A; 5CAI A; 1BI3 A; 3GNF B; 2X35 A; 5A0L A; 1NM7 A; 2CT3 A; 4J9H A; 3OYY A; 3DLL A; 2YXY A; 4V2S A; 2L5Q A; 2LMJ A; 4AMC A; 3FDR A; 3H6Z A; 1NEB A; 1OZ2 A; 2RN8 A; 3VYG A; 3JCM W; 4IKF A; 2CDT A; 1ZBX A; 2KYM A; 2PU9 B; 2O01 E; 3A5Z B; 4F7U E; 2V1R A; 4A54 A; 2KEA A; 1BIA A; 3RMQ A; 1QP3 A; 2F2V A; 3G4S A; 1RAF B; 5FU6 B; 2ESW A; 4XTW A; 3C95 A; 5KYW B; 3JCM X; 2M02 A; 3M56 A; 3NMZ C; 2ZPI B; 1FWZ A; 2FG0 A; 5LJ3 e; 3RNJ A; 5LJ3 h; 1UGR B; 2EKH A; 3QDR B; 3G6E T; 5EG2 A; 2OTJ T; 4M4Z A; 4BE1 A; 3OYF A; 3QO3 A; 2LRQ A; 4C92 F; 1TOV A; 1H8K A; 1V29 B; 2EQU A; 3OYM A; 4MMK A; 4BDY A; 3C4S A; 2OTL A; 4PJN A; 1ZLM A; 1I5L A; 2V1Q A; 4JLG A; 3TSZ A; 1I1J A; 4OF1 A; 1VQM Q; 4O5V A; 3HP9 A; 1K9A A; 3DB3 A; 2DTO A; 2YRC A; 1WHK A; 4PLI A; 2MPX C; 4HCZ A; 2J6O A; 1XTD A; 2F2W A; 1QCF A; 3CC4 A; 2WSF E; 3GOX A; 2E12 A; 3SHW A; 4C8Q C; 5KYY B; 1IXD A; 2XDD A; 4ZGJ B; 3KXT A; 1QVF S; 2EVR A; 2K4Y A; 4IUU A; 3RKW A; 3UA6 A; 2M51 A; 1JJ2 S; 4N4G A; 1SHG A; 2G3R A; 2LP5 A; 1GCP A; 2CP6 A; 2HDA A; 3ER0 A; 1K73 C; 1WHM A; 4BB7 A; 1UHF A; 2D1X A; 2EWN A; 3CCS T; 3C12 A; 1RLQ C; 5GAN e; 1M1K C; 4IIO A; 5GAN h; 4JS4 A; 4C8Q A; 3CCR T; 2FPE A; 3G71 Q; 1WQW A; 2NUT B; 4RTV A; 2EJF A; 3QWY A; 4C8Q D; 3EG2 A; 3QKJ A; 5CK9 A; 2DBK A; 5GAM d; 1K8A U; 1M4Z A; 2ATC B; 4C92 B; 4M75 G; 1AWO A; 4CI0 C; 3FRN A; 1MUZ A; 1VQK T; 3UT1 A; 2R57 A; 2LTO A; 3OW2 A; 3U23 A; 4PJO B; 2X4Y A; 3LX7 A; 2KNB B; 4WF2 A; 3X24 B; 1XOV A; 4JJD A; 5EC7 A; 4MZM A; 4ZGD B; 2QAZ A; 2OJ2 A; 2RH2 A; 3JB9 G; 4FL6 A; 4J7I A; 3EH1 A; 2SRC A; 4OMF B; 2VGM A; 4AFU C; 2MYS A; 4JZ4 A; 3CC2 T; 2DL7 A; 2L2P A; 3OS2 A; 1YIJ A; 1V76 A; 4F17 A; 1IGU A; 5GAM g; 2RO0 A; 1X01 A; 3H41 A; 5GAN 7; 2DNU A; 1S72 A; 3CCQ T; 4MDW A; 1BB9 A; 2CKK A; 2X3W D; 4E6R A; 4LDV A; 3C0C A; 1YJ9 T; 1OX9 A; 2DL3 A; 2K5I A; 1YN8 A; 1K1Z A; 5CO7 A; 2LQ8 A; 1D09 B; 3QII A; 2CUD A; 5LJ3 j; 3CCU Q; 1VQ5 Q; 3SWN C; 4LXC A; 1K9M C; 1ZSG A; 2K9G A; 2QI2 A; 5D7U A; 1IO6 A; 2FVU A; 3OQ5 A; 3FC3 A; 1OU9 A; 2JNG A; 3OA6 A; 4M7A E; 2R5M A; 2Z0W A; 4OMN A; 5A0G A; 2M0Y A; 3PGG A; 3GIB A; 1WIE A; 3M0Q A; 1MV0 B; 3OS0 A; 2DMO A; 1D0Z A; 2K3X A; 2VWF A; 3V8J A; 3NTI A; 3VS6 A; 3FJ5 A; 2PTK A; 1QWF A; 2H3J A; 4XAX B; 3TEE A; 3CCL Q; 5FU7 B; 1VQ4 T; 1M3A A; 5ECA A; 3SWN A; 4ESR A; 2BIV A; 4PJM A; 1BYM A; 2EBP A; 4EMK B; 2WSC E; 1K8A R; 3QZ5 B; 1E6G A; 4EMH A; 1PRM C; 3HKS A; 3JCM d; 3L2Q A; 1VQL Q; 5GMK e; 3PIO A; 5GMK h; 1VQ8 Q; 2FPD A; 1IRX A; 2A36 A; 2DJQ A; 4HCC A; 2CS7 A; 3GPL A; 4BI3 A; 3MJX A; 1K0X A; 3VUZ A; 2EIF A; 4RCB A; 2RI2 A; 4F04 B; 3H0I A; 3VS0 A; 5CKH A; 3INZ A; 3JRZ A; 1QQJ A; 4J9B A; 2FEI A; 2IIM A; 4NS5 A; 4GLM A; 1NPP A; 3MP6 A; 5HK3 A; 1TWB A; 5C0M A; 3I55 A; 2VVK A; 3OYD A; 4E7Z A; 3WXM B; 4WTO B; 3LLR A; 5GAN j; 4HCB A; 3I5S A; 1QP2 A; 2K2M A; 4C0Z A; 1U5S A; 1I0C A; 2X4W A; 5GAO n; 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