The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
DNFIYKAKALYPYDADDDDAYEISFEQNEILQVSDIEGRWWKARRANGETGIIPSNYVQLIDGPEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Membrane protein
|
| molecule keywords |
PROTEIN SSU81
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| publication title |
Structural Genomics of Yeast SH3 Domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| total genus |
13
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-12-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DF6 A; 4IIM A; 5FWC A; 2JXB A; 2K2M A; 1YCS B; 3A98 A; 1PRL C; 1YN8 A; 3I35 A; 2XMF A; 1NLP C; 4AFU C; 2FRY A; 2RPN A; 2DA9 A; 1UTI A; 1SEM A; 2JS0 A; 1AEY A; 2VKN A; 1SHG A; 2CRE A; 1M27 C; 4JJB A; 1B3Q A; 2CDT A; 2ED1 A; 4JJD A; 2EBP A; 2DYB A; 1UE9 A; 1LCK A; 1X6G A; 4RTY A; 4HCK A; 1U06 A; 5IXF A; 4R0K A; 3TVT A; 3JV3 A; 2JTE A; 2LX7 A; 2OAW A; 4GLM A; 3TSZ A; 1VYU A; 4DEY A; 1QWF A; 1ZX6 A; 2CSI A; 1UUE A; 2O2O A; 1JU5 C; 1W6X A; 2JMC A; 3M0T A; 1NYF A; 2CUB A; 5GJW B; 5EC7 A; 1NLO C; 5IHI A; 1HJD A; 2GTO A; 1KJW A; 4AFQ C; 4AFS C; 2K7A A; 1OOT A; 2FPF A; 1OPL A; 1MUZ A; 4F16 A; 2HBW A; 1AWW A; 1WX6 A; 3M0R A; 1QLY A; 4RTZ A; 2DE0 X; 1GBR A; 4J9G A; 1I1J A; 3LH5 A; 1RUW A; 4OMO A; 1GFD A; 1VYV A; 2DRK A; 2JM9 A; 1U3O A; 3M0U A; 2YUQ A; 3H0F A; 2D8H A; 1JQQ A; 2EW3 A; 1WIE A; 1CKB A; 1UEC A; 1EFN A; 4JZ4 A; 1WLP B; 4ZNX A; 2FPD A; 2V1Q A; 1I0C A; 1RLP C; 3QWY A; 3RBB B; 2J06 A; 2BZY A; 3M0S A; 2LCS A; 1CKA A; 2KYB A; 2CH4 A; 2W10 A; 3KFV A; 3THK A; 1UDL A; 5IHN A; 3EHR A; 2A28 A; 1UG1 A; 3EG0 A; 1J3T A; 1M30 A; 4OMQ A; 2M0Y A; 3FJ5 A; 2IIM A; 4AG1 C; 2RN8 A; 2CT4 A; 2D8J A; 1X69 A; 2ABL A; 3VS6 A; 2O9S A; 3EG3 A; 3I9Q A; 2RQT A; 2JMA A; 2BTT A; 2EPD A; 2NUZ A; 1UFF A; 1SRL A; 3I5R A; 2F2X A; 4OML A; 3NHN A; 4RTU A; 1UHC A; 2DM1 A; 3CQT A; 2PTK A; 3ZL7 C; 4RTV A; 3M0Q A; 5I22 A; 2EYZ A; 5IH2 A; 2BZ8 A; 2DIL A; 2AKL A; 2HSP A; 5I11 A; 1XOV A; 1GBQ A; 4GBQ A; 2VVK A; 1TUD A; 2G6F X; 2DL8 A; 4JPB W; 2FPE A; 2F2V A; 4K11 A; 1AD5 A; 1AZG B; 4FSS A; 3H41 A; 4RTW A; 2KRN A; 1YWP A; 2ENM A; 1AVZ C; 4LE9 A; 2J05 A; 2OI3 A; 4RUG A; 1E7O A; 1I07 A; 1FMK A; 2KEA A; 5L23 A; 1ZUU A; 2KGT A; 2KRS A; 2D1X A; 4DEX A; 5HCK A; 5ECA A; 3TSW A; 3H0H A; 1N5Z A; 1ZSG A; 3UA7 A; 1KFZ A; 1GCP A; 3EG1 A; 1X43 A; 1SHF A; 2ROT A; 1T0H A; 2MOX A; 5FW9 A; 4AG2 C; 4OMM A; 3R6N A; 1U5S A; 1WFW A; 1PWT A; 2AZS A; 2H8H A; 1B07 A; 2V1R A; 2YUN A; 2EKH A; 1SSH A; 3VS7 A; 1ZBJ A; 2AK5 A; 2QDL A; 2HCK A; 1K0X A; 3U23 A; 2D0N A; 3UA6 A; 1FYN A; 1K1Z A; 2DL3 A; 2LJ0 A; 4Z88 A; 2L2P A; 1ABO A; 2EYW A; 2GBQ A; 2LZ6 B; 1QKW A; 2RQV A; 2A36 A; 4CC2 A; 1NEB A; 4HVV A; 1WA7 A; 2NWM A; 4M4Z A; 2AZV A; 3VS5 A; 2DJQ A; 1GL5 A; 1JXM A; 1WDX A; 1W1F A; 4HXJ A; 2EGA A; 2EGC A; 1UJY A; 4X1V A; 2BZX A; 1QWE A; 1NG2 A; 2LP5 A; 2A37 A; 1OPK A; 1X2K A; 1OV3 A; 1K9A A; 1VA7 A; 2DMO A; 1TG0 A; 3VS0 A; 3VS1 A; 4A63 B; 1ZUY A; 2L3S A; 1AWJ A; 2FG0 A; 2X3X D; 4ESR A; 2L0A A; 1M3A A; 3SEM A; 1BU1 A; 1MV3 A; 1ZLM A; 2J7I A; 2KYM A; 2J6F A; 2YUO A; 3RNJ A; 3PVL A; 3M0P A; 4Z89 A; 3VRZ A; 2ED0 A; 2LJ3 A; 4F14 A; 2LQN A; 4IIO A; 2DBK A; 2KNB B; 3O5Z A; 2LQW A; 4Y92 A; 3C0C A; 4J9F A; 2F2W A; 2L3Q A; 4JZ3 A; 4Z8A A; 1SRM A; 4RTX A; 1QKX A; 2KBT A; 3REB B; 2PNI A; 1S1N A; 4CC7 A; 1RI9 A; 3SHW A; 1BK2 A; 4CC3 A; 2EQI A; 1Z9Q A; 2X3W D; 1H8K A; 4J9B A; 2MIO A; 4LUE A; 4KRT A; 2DL5 A; 2GNC A; 2YT6 A; 4J9D A; 4JJC A; 2L3P A; 2DNU A; 1W70 A; 1K76 A; 1MV0 B; 1E6G A; 2PZ1 A; 1E6H A; 5IXB A; 2KRM A; 2P4R A; 1PRM C; 1K4U S; 2KXD A; 2JS2 A; 1AZE A; 1Y0M A; 2MCN A; 4LNP A; 2AKK A; 2LMJ A; 2DL4 A; 2J6K A; 4HVU A; 5FWB A; 1BBZ A; 4D8K A; 2KXC A; 3H0I A; 2I0N A; 1A0N B; 1WI7 A; 1GCQ A; 4LN2 A; 1NYG A; 2EVR A; 2CH4 W; 1WXU A; 1VYT A; 4ORZ A; 1PKT A; 1Y57 A; 3VRY A; 1PNJ A; 4AFZ C; 1K0S A; 2K3B A; 1T3S A; 2FRW A; 2FEI A; 3EGU A; 2M51 A; 1ARK A; 1IO6 A; 1GCQ C; 1CSK A; 2SEM A; 1TUC A; 2W0Z A; 4J9I A; 2O9V A; 2KRO A; 2RQW A; 1T3L A; 4LUD A; 1NM7 A; 2YUP A; 4HVW A; 2C0I A; 2CUD A; 1ABQ A; 1AWX A; 4J9C A; 1M8M A; 2EYY A; 2HEQ A; 1HD3 A; 3GBQ A; 1JO8 A; 2LNH B; 2OJ2 A; 1PKS A; 2DX1 A; 1Z9Z A; 3QWX X; 2RQR A; 1NEG A; 1ZUK A; 4RTT A; 2RMO A; 3NMZ C; 1G2B A; 1YP5 A; 5GJV B; 4D8D A; 1YWO A; 1QCF A; 4J9E A; 3NPF A; 2ESW A; 2HDA A; 2K9G A; 1M3C A; 2EGE A; 3VS4 A; 2YDL A; 2DBM A; 2JW4 A; 1UJ0 A; 4OMN A; 2KT8 A; 1H92 A; 2FO0 A; 1WXB A; 1UHF A; 1PHT A; 2O31 A; 1JEG A; 1RLQ C; 1X6B A; 2DL7 A; 2RF0 A; 2KT1 A; 3EG2 A; 2C0T A; 1H3H A; 2SRC A; 2GQI A; 2JM8 A; 3ULR B; 2DRM A; 3VS2 A; 3PVQ A; 4E6R A; 2CSQ A; 2CT3 A; 2A08 A; 2C0O A; 1HSQ A; 2KR3 A; 2JT4 A; 2EYX A; 2VWF A; 3PE0 A; 2K79 A; 1KSW A; 1SPK A; 4J9H A; 2O88 A; 2DLP A; 3UF4 A; 2GGR A; 2YSQ A; 1YNZ A; 3EHQ A; 1GFC A; 3I5S A; 1AOJ A; 2B86 A; 1JXO A; 4CC4 B; 1X27 A; 2GTJ A; 2ECZ A; 2ROL A; 2RQU A; 1KIK A; 2J6O A; 4WCI A; 2DVJ A; 2E5K A; 2KE9 A; 2LJ1 A; 3UAT A; 3VS3 A; 5IHK A; 1X2Q A; 3REA B; 1OEB A; 4OMP A; 2RNA A; 1T0J A; 1M3B A; 1AWO A; 1V1C A; 1BB9 A; 3IQL A; 3NGP A; 1G83 A; 4EIK A; 4F17 A; 1WXT A; 1UGV A; 2K6D A; 1GRI A; 4QT7 A; 1WYX A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3ZBD A; 5KYU B; 5KYY B; 1Q7Y R; 5AYF A; 2JXB A; 3OW2 S; 3JB9 D; 3QYH B; 2K2M A; 2HQE A; 2XMF A; 5LJ3 f; 4AFU C; 2M16 A; 1PCX A; 1TXQ A; 5GAN j; 4Z02 A; 1N8R C; 3V8L A; 2DA9 A; 1K73 R; 1Y07 A; 2JS0 A; 2VKN A; 5CKF A; 4JJB A; 3CC2 Q; 4M7D G; 5D6X A; 4C8Q C; 3G7Z A; 3BE3 A; 1EZZ B; 2AT1 B; 2DYB A; 1YIT A; 1VQN A; 4HCK A; 5IXF A; 3QHS A; 3E9F A; 3CC7 A; 1Q81 U; 1OU8 A; 2JTE A; 2LX7 A; 3RMS A; 2OAW A; 1VQK A; 2OTJ Q; 2F69 A; 4JRI A; 2CSI A; 1BI0 A; 2O2O A; 4E7Z A; 4E2F B; 2JMC A; 3MKD A; 1VQ6 A; 3CCL T; 1Q82 U; 1FX7 A; 1K9M C; 3VKI A; 3WVD B; 3CCM Q; 5KYN A; 3QZ5 B; 1ZQ1 A; 4AFS C; 5KYU A; 1OOT A; 4TVR A; 5KYY A; 1MUZ A; 4JLG A; 2LVM A; 2E1H A; 3G4S Q; 2DE0 X; 3GPL A; 2KDS A; 3X28 B; 4EMH A; 4OGE A; 3JB9 F; 5A0G A; 2XK0 A; 4R55 A; 1N27 A; 2RJC A; 2COY A; 2JM9 A; 1U3O A; 1VQP Q; 2YUQ A; 3H0F A; 1WZO A; 1IGQ A; 1H3Z A; 1WIE A; 3OBW A; 3MEW A; 3LGL A; 1WLP B; 5GAO n; 2QEX A; 1I0C A; 1NBE B; 2FZK B; 3M0S A; 3CMA T; 2KYB A; 4B9X A; 1M1F A; 3CPW S; 2E65 A; 3MEA A; 3MET A; 1UDL A; 1UG1 A; 1M30 A; 1ZA2 B; 2YRC A; 1PSE A; 2IIM A; 3DLM A; 4ME7 A; 4AG1 C; 1SSF A; 4QW2 A; 5C0M A; 2O9S A; 5GAO l; 3CC4 A; 3V7R A; 1UGS B; 2CP5 A; 4ZTJ A; 4M78 F; 1Q7Y U; 1MMG A; 3OA6 A; 3M9Q A; 4C5I A; 4FT4 A; 2RJF A; 5GMK h; 4PJO F; 3ZL7 C; 1KQS S; 4M77 G; 3RUX A; 3TU4 K; 3RIR A; 1K73 U; 2AKL A; 4C0Z A; 2JVV A; 1YIT T; 2DL8 A; 3JCM c; 4ZGJ B; 4XU0 A; 4K11 A; 1VQ4 Q; 4M75 C; 3TQ7 P; 2NLU A; 3BFM A; 2ENM A; 1UGQ B; 4LD9 K; 1AVZ C; 4XQ3 A; 2RO0 A; 1E7O A; 1VQ6 T; 1ZUU A; 4M7A E; 2FZG B; 1SKU B; 5FRN A; 4DEX A; 4C92 B; 2YWW A; 3PNW C; 1S72 A; 1ZBX A; 1BI1 A; 2HBP A; 1GXI E; 4P5N A; 1N5Z A; 4XAX B; 1KFZ A; 1GCP A; 4XTZ A; 5HK0 A; 4PNO A; 5CKD A; 1YI2 Q; 4EDU A; 1T0H A; 4F7U E; 3J7A F; 3L2Q A; 2AZS A; 1WFW A; 1SSH A; 3HP9 A; 1PD0 A; 3JCM g; 2QEX T; 1D1A A; 4X9D A; 1VQ9 Q; 1FYN A; 2ZPE B; 3V7S A; 4MML A; 1D1B A; 2EYW A; 2GBQ A; 4PL6 A; 2LZ6 B; 4FT2 A; 5DLQ E; 2RD1 A; 4LDV A; 5KE2 A; 3FDR A; 1WA7 A; 3CC7 Q; 4M7A C; 3A8L B; 3CC4 T; 4KUD K; 1VQK Q; 1WDX A; 4QVC A; 2BZX A; 2LP5 A; 4C92 A; 1BCM A; 1WHM A; 8ATC B; 2QI2 A; 1NZ9 A; 4HCZ A; 3PIP A; 1EIF A; 1SG5 A; 4PFP A; 4A63 B; 2GFU A; 3LWH A; 2L3S A; 1VQ8 A; 2DIG A; 4J83 A; 2FG0 A; 2VGM A; 2BE9 B; 2DTI A; 4ELZ C; 4DA4 A; 2F1L A; 4M7D B; 2R58 A; 2KYM A; 5FLX E; 3RNJ A; 5LJ3 g; 3GOX A; 5DLO A; 5GAN g; 2KSS A; 2LJ3 A; 1I5O B; 4A53 A; 2QYZ A; 4IIO A; 2LQW A; 4J9F A; 3JRZ A; 2F2W A; 5GAM h; 1VIF A; 2HMA A; 1QKX A; 3CCR A; 3CCQ A; 4KH0 B; 3CCS Q; 5I21 A; 3JB9 J; 1YBY A; 4IUT A; 3VUZ A; 4LUE A; 2YT6 A; 1O75 A; 4J9D A; 1S72 T; 3WVE B; 4EMK B; 2CP3 A; 5KE3 A; 1VQO Q; 2PZ1 A; 3OYC A; 2DIQ A; 5CIU A; 1K4U S; 3OSS C; 3L2R A; 4BDY A; 1NJI R; 3CD6 Q; 2DL4 A; 4HVU A; 2YRD A; 1KC8 R; 1BBZ A; 1UGR B; 5GAN 4; 3OSV A; 1A0N B; 1QP2 A; 3L2U A; 1M2O A; 1NYG A; 3TRE A; 4M7D A; 4OGC A; 1UEB A; 3G71 Q; 1JBM A; 2HL5 C; 4C92 D; 1VYT A; 3M5A A; 4E7S A; 4ORZ A; 3OY9 A; 2LDM A; 1Y57 A; 3AT1 B; 3EFO B; 1B7T A; 3EGD B; 3VRY A; 4AFZ C; 1K0S A; 1OUL A; 1T3S A; 4A4E A; 2QDY B; 2HNI A; 3EGU A; 1Q95 G; 2X4Y A; 1IO6 A; 5HK3 A; 1JB0 E; 2F5T X; 2RQW A; 2KRO A; 5CK9 A; 4Y28 E; 4FU6 A; 1Q86 R; 4HVW A; 1K8A C; 3OYA A; 2MYS A; 1AWX A; 3HRS A; 5L8R E; 2CP0 A; 4FYW B; 2HEQ A; 3GBQ A; 1JO8 A; 3MP1 A; 4LDY A; 3VYH B; 2L89 A; 1Z9Z A; 2LRQ A; 2KY9 A; 2DZC A; 1VQ8 T; 3EAE A; 1DJ7 B; 3O8V A; 4EMK A; 1IXD A; 1XNI A; 4M77 B; 1YP5 A; 4IUV A; 3OMC A; 1YJN A; 3NPF A; 2ESW A; 2HDA A; 1V29 B; 5GAN 7; 4NL3 A; 1BYM A; 2YDL A; 1QVF S; 4M78 E; 4OMN A; 2LC4 A; 1UHF A; 2DKG A; 1PHT A; 2O31 A; 3MP6 A; 4PJO E; 2VB6 A; 3CCQ T; 1TS9 A; 4LDX A; 2GQI A; 2XG8 D; 4E7I A; 3EGD A; 3EFO A; 3VS2 A; 2CSQ A; 2CT3 A; 2COW A; 2QAZ A; 4KUL A; 1HSQ A; 2KR3 A; 2EYX A; 3PE0 A; 1OQK A; 1X75 C; 1SPK A; 4J9H A; 3I55 T; 3LW5 E; 4M7D D; 2DLP A; 2HKQ B; 3BDU A; 4IUR A; 5CAI A; 2IVW A; 3CBP A; 1RL2 A; 2WSC E; 2CYZ B; 3CXC P; 3L2V A; 2FYK A; 2EJ9 A; 2RQU A; 2J6O A; 1M4Z A; 1G3T A; 2DVJ A; 2E5K A; 7AT1 B; 2LJ1 A; 1NJI U; 1X2Q A; 3REA B; 4M77 A; 1RAC B; 1TH7 A; 1AWO A; 1BIB A; 2KK4 A; 4M78 C; 3QPH A; 4AT1 B; 1OX8 A; 5CR2 A; 1UGV A; 4A4K A; 2K6D A; 4PJO C; 2DF6 A; 2CP6 A; 3FB9 A; 4IIM A; 5FWC A; 1H64 1; 1OX9 A; 2DTH A; 1M1K C; 4ZGE B; 1NLP C; 4C5H A; 5GAO p; 1VQM A; 4OB2 B; 2RPN A; 3HTR A; 2EQU A; 4ZN1 A; 1OZ3 A; 4BUG A; 1UTI A; 1SEM A; 4JRP A; 4E7H A; 3OQ5 A; 3G6E A; 3CCR Q; 3CCV A; 2MK5 A; 1YHQ Q; 3OYD A; 1Q86 U; 1P92 A; 3CCJ Q; 2RHX A; 4M7D F; 2FHD A; 4XTX A; 2DK3 A; 3OBY A; 1YJN T; 2QTV A; 3JV3 A; 1VYU A; 1QWF A; 5LJ5 j; 1ZX6 A; 4J5Y A; 1IB8 A; 1JU5 C; 2PU9 B; 3S6W A; 1YJ9 Q; 1IRE B; 2G3R A; 2JJ9 A; 2XKO C; 2RH2 A; 1NYF A; 5CQX A; 5GJW B; 1R0B G; 5EC7 A; 5IHI A; 2MAM A; 2BIV A; 4AFQ C; 5KCO A; 1OPL A; 1WHL A; 5FU6 B; 4FW1 A; 1M1G A; 4M77 D; 3OYB A; 1N8R R; 3CME T; 3HFN A; 4BE0 A; 2MI6 A; 2NUP B; 1I1J A; 1PSF A; 3VV0 A; 2DAQ A; 1RUW A; 4OMO A; 1GFD A; 1QMC A; 3J81 E; 1BIA A; 3M0U A; 3CCE Q; 2VGN A; 2M02 A; 1CKB A; 3TCJ A; 1N9S A; 2V1Q A; 1RLP C; 3QWY A; 3JCM f; 3RBB B; 4V2S A; 2J06 A; 2BZY A; 3ZFJ A; 2YHT A; 4QKU A; 2CH4 A; 4OB0 B; 2W10 A; 3INZ A; 4KT0 E; 4PJL A; 4ZTF A; 4MZM A; 4C8Q E; 3EG0 A; 3EG9 B; 1J3T A; 4OMQ A; 2CP2 A; 2M0Y A; 1R8O B; 2EQM A; 2D8J A; 2DXB A; 2ABL A; 3VS6 A; 1K9M R; 3KXT A; 3FLG A; 3V8K A; 2EIF A; 2YRV A; 2EQK A; 4VUB A; 3JCM h; 1SRL A; 3I5R A; 3NHN A; 3CCU A; 3G6E T; 3CCV T; 1QVG P; 3UPU A; 3M4G A; 3MEU A; 5IH2 A; 4XTU A; 3JCM V; 2NUP A; 3JCM P; 1XOV A; 1GBQ A; 3PFS A; 4GBQ A; 1X6O A; 2VVK A; 1TUD A; 2G6F X; 3M59 A; 1R0C B; 2FPE A; 1N6A A; 1AD5 A; 5GAN f; 1WPY A; 3H41 A; 4RG8 A; 1KD1 U; 4X9C A; 1TSF A; 3A8O B; 2X4W A; 4XTW A; 4DOW A; 3G4S T; 3PMT A; 1YWP A; 1FMV A; 4RUG A; 1IRX A; 1WHH A; 2E5Q A; 5GAN 2; 1I07 A; 1FMK A; 2KEA A; 5L23 A; 3CXC A; 2DZ9 A; 3E1S A; 3EG9 A; 4OVA A; 2KRS A; 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