The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
GSSGSSGLEQYVVVSNYKKQENSELSLQAGEVVDVIEKNESGWWFVSTSEEQGWVPATYLEAQNSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain from human KIAA0418 protein
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
SH3 and PX domain-containing protein 2A
|
| total genus |
6
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZBJ A; 1KJW A; 4OMP A; 1U5S A; 1QKW A; 2KYB A; 1GFD A; 3ULR B; 1SPK A; 4J9H A; 3VRZ A; 1LCK A; 2AK5 A; 4X1V A; 3SHW A; 3EG3 A; 2FRY A; 2LX7 A; 2QDL A; 4RTV A; 1GCQ C; 4RTW A; 4JJD A; 1Z9Z A; 1YWP A; 2CT4 A; 2EQI A; 2EW3 A; 2D8J A; 2EVR A; 2CSQ A; 2V1R A; 1QWE A; 2H8H A; 2DYB A; 2K3B A; 3REA B; 3M0T A; 4Z88 A; 4KRT A; 1OV3 A; 2DLP A; 2KR3 A; 4QT7 A; 1BBZ A; 1RLQ C; 2EGC A; 2RPN A; 1AOJ A; 4ORZ A; 1GCP A; 2FG0 A; 5EC7 A; 3ZL7 C; 2VWF A; 1ZLM A; 2A36 A; 1G2B A; 2KNB B; 1H8K A; 2KBT A; 4JJB A; 2DX1 A; 1WA7 A; 2GTO A; 1WI7 A; 2X3W D; 3NPF A; 2NWM A; 1UTI A; 1HJD A; 2E5K A; 1TG0 A; 4J9E A; 1Z9Q A; 4AFQ C; 2LJ3 A; 1UFF A; 1GRI A; 3I9Q A; 3M0Q A; 2KEA A; 3NHN A; 3NMZ C; 1TUD A; 2KXC A; 1KSW A; 1AWW A; 1I07 A; 1CKA A; 4JZ3 A; 1G83 A; 2MIO A; 2EGE A; 4DEY A; 1JEG A; 1AEY A; 2KRM A; 5HCK A; 2L3P A; 2W0Z A; 1YP5 A; 2PZ1 A; 4AFU C; 2ROT A; 1WX6 A; 2FO0 A; 2LNH B; 1U06 A; 2BZY A; 1NYG A; 3U23 A; 2JMA A; 2EYW A; 2ENM A; 1UG1 A; 2LCS A; 1M27 C; 2LJ1 A; 2X3X D; 4Z8A A; 3REB B; 2YUO A; 3H41 A; 2KRO A; 4J9F A; 1K1Z A; 3PVL A; 1NM7 A; 2DIL A; 4F17 A; 2KE9 A; 2A28 A; 2RQV A; 1A0N B; 1EFN A; 2RQW A; 3EG1 A; 2DL4 A; 1QKX A; 2EBP A; 2DRM A; 4LN2 A; 1JQQ A; 2DE0 X; 2FPE A; 3CQT A; 1X2K A; 2FPF A; 1NLO C; 2G6F X; 4RTY A; 4OMO A; 3VS6 A; 1K4U S; 1NG2 A; 2CH4 A; 2LMJ A; 2CDT A; 4R0K A; 1X43 A; 1X69 A; 3SEM A; 1MUZ A; 1FYN A; 2V1Q A; 2NUZ A; 4Z89 A; 4IIO A; 1X6G A; 2A08 A; 1GCQ A; 1V1C A; 1JXO A; 4D8D A; 2BTT A; 2GGR A; 1YWO A; 3O5Z A; 4F14 A; 4HCK A; 1SRM A; 1QCF A; 2M0Y A; 1B07 A; 2FPD A; 2J05 A; 5L23 A; 2DNU A; 1X27 A; 1GBR A; 5IHN A; 1WLP B; 2GNC A; 4J9G A; 1ZSG A; 2JM9 A; 1AWJ A; 2MOX A; 2ECZ A; 4OMM A; 2DJQ A; 3LH5 A; 1VYU A; 2KRS A; 2YSQ A; 4GLM A; 4ESR A; 2P4R A; 1RUW A; 1CSK A; 1PRM C; 3EG0 A; 1UEC A; 4OML A; 4HVV A; 2XMF A; 2K9G A; 1FMK A; 3VS1 A; 3THK A; 1M3A A; 5FWB A; 3EG2 A; 2KXD A; 2PTK A; 1AD5 A; 1OPK A; 2C0O A; 2YT6 A; 4Y92 A; 1UJ0 A; 1YNZ A; 1VYV A; 1AWO A; 1B3Q A; 1SHG A; 2FEI A; 1X6B A; 2CSI A; 5I22 A; 2D0N A; 1AWX A; 5IXB A; 2JS2 A; 1ZUK A; 4OMQ A; 2CUB A; 1PHT A; 3TSW A; 1J3T A; 2CH4 W; 3EHQ A; 1RI9 A; 1JO8 A; 2KGT A; 4WCI A; 1ZUY A; 2KYM A; 3NGP A; 2HBW A; 2RQR A; 2DVJ A; 3I5S A; 5IXF A; 2GQI A; 5IHK A; 4JPB W; 2BZ8 A; 1UJY A; 2AKL A; 3VS0 A; 3GBQ A; 4J9C A; 2DMO A; 1W6X A; 4J9I A; 2RNA A; 1N5Z A; 1RLP C; 1SHF A; 1MV3 A; 5IH2 A; 1BK2 A; 1T3L A; 2AKK A; 1GFC A; 2EYY A; 2RN8 A; 1K9A A; 4CC2 A; 3M0P A; 1IO6 A; 1ARK A; 1PWT A; 2C0T A; 2RMO A; 5GJV B; 2JW4 A; 3PE0 A; 1ABO A; 2J7I A; 3A98 A; 4DEX A; 1JU5 C; 5FWC A; 3VS4 A; 1NEB A; 2K6D A; 2RQU A; 1H92 A; 1AZE A; 2J6F A; 2DF6 A; 4AFS C; 1ZX6 A; 2YUN A; 1HSQ A; 2HSP A; 3M0U A; 3VS7 A; 2C0I A; 4LE9 A; 2O88 A; 3R6N A; 2KT1 A; 3UF4 A; 2EPD A; 3C0C A; 2CUD A; 3VS3 A; 2HDA A; 2YUP A; 1T0H A; 1KIK A; 2AZV A; 2JT4 A; 2JM8 A; 4IIM A; 3QWY A; 1PNJ A; 1E6G A; 4RTX A; 4CC7 A; 4AG1 C; 1OEB A; 3UA7 A; 1UHC A; 3FJ5 A; 2YUQ A; 4AG2 C; 4GBQ A; 5ECA A; 1Y0M A; 4LUD A; 1NYF A; 3PVQ A; 2K2M A; 2LQN A; 3UA6 A; 1M3B A; 1I1J A; 3VS2 A; 3M0R A; 2O9V A; 2OAW A; 3KFV A; 1WIE A; 3I5R A; 2CT3 A; 4OMN A; 1SSH A; 1XOV A; 1WXU A; 2RQT A; 3EHR A; 1AZG B; 1UGV A; 3JV3 A; 1K0X A; 1QLY A; 2HCK A; 4D8K A; 2ED0 A; 4CC3 A; 1UHF A; 2EYX A; 1K0S A; 2VVK A; 2DBK A; 4RTT A; 1PRL C; 2F2W A; 2K7A A; 2B86 A; 2ED1 A; 4J9D A; 4CC4 B; 3H0H A; 4EIK A; 4RUG A; 3QWX X; 1ABQ A; 1Y57 A; 1GBQ A; 2KT8 A; 1M30 A; 2JTE A; 2CRE A; 2BZX A; 2O31 A; 1NEG A; 2ABL A; 2SRC A; 2D8H A; 3TVT A; 3VRY A; 2O2O A; 1QWF A; 2DL3 A; 2LQW A; 2DA9 A; 2EYZ A; 4E6R A; 3IQL A; 2LZ6 B; 1SEM A; 3RNJ A; 2J06 A; 1YCS B; 2W10 A; 1VYT A; 2A37 A; 4HXJ A; 1VA7 A; 1WXB A; 2JMC A; 2OI3 A; 2DRK A; 1E6H A; 1BU1 A; 1GL5 A; 2I0N A; 1K76 A; 1M8M A; 1X2Q A; 3H0F A; 2HEQ A; 2DL5 A; 4LNP A; 2IIM A; 2J6K A; 1I0C A; 4ZNX A; 3H0I A; 1S1N A; 2L3Q A; 1WDX A; 4RTU A; 4AFZ C; 1M3C A; 2GTJ A; 4F16 A; 4JZ4 A; 2DL7 A; 5I11 A; 2JS0 A; 2D1X A; 4A63 B; 3TSZ A; 1SRL A; 2KRN A; 1OOT A; 1HD3 A; 2F2X A; 1U3O A; 5FW9 A; 5IHI A; 4M4Z A; 2LJ0 A; 4J9B A; 1UE9 A; 1ZUU A; 1PKT A; 4JJC A; 3UAT A; 4HVW A; 4FSS A; 2DBM A; 3RBB B; 2JXB A; 1NLP C; 1W70 A; 2M51 A; 1TUC A; 1WXT A; 2L3S A; 1UDL A; 2AZS A; 3M0S A; 4LUE A; 4K11 A; 4HVU A; 2F2V A; 3EGU A; 1E7O A; 1OPL A; 2DL8 A; 1T0J A; 2VKN A; 2RF0 A; 1BB9 A; 4RTZ A; 2EGA A; 2K79 A; 2MCN A; 2LP5 A; 2GBQ A; 2O9S A; 1H3H A; 2FRW A; 1JXM A; 2YDL A; 1AVZ C; 1WFW A; 1YN8 A; 2SEM A; 2OJ2 A; 5GJW B; 2L0A A; 2ROL A; 1UUE A; 1MV0 B; 1W1F A; 1WYX A; 1PKS A; 1CKB A; 2J6O A; 2ESW A; 3VS5 A; 1T3S A; 2EKH A; 3I35 A; 2L2P A; 2DM1 A; 1KFZ A; 2PNI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1DJ7 B; 3OMC A; 4DQ2 A; 1U5S A; 4J8O A; 2CP2 A; 2CP5 A; 4J9H A; 3CCR A; 4JS5 A; 5HKC A; 3SHW A; 4II1 A; 3JCM P; 3X24 B; 2QDL A; 4E7I A; 1I8F A; 4C5E A; 2YRD A; 1M90 U; 4JJD A; 1Z9Z A; 1HK9 A; 3JCM X; 1YWP A; 1N8R U; 1VQ5 A; 4ZGD B; 2D8J A; 2EVR A; 3OBY A; 2CSQ A; 1QWE A; 3REA B; 3VYG A; 4Z88 A; 1LJO A; 4KRT A; 1RI0 A; 2AIR B; 2DLP A; 2KR3 A; 2KSS A; 4FIB A; 2BUD A; 4E7H A; 2EGC A; 2RPN A; 5A0G A; 2DEU A; 3OS2 A; 2VWF A; 4CI0 C; 1D09 B; 2O01 E; 2M9U A; 2GTO A; 2RHY A; 3OYC A; 1M2V B; 2X3W D; 3G71 A; 1PD1 A; 3G1J A; 1HJD A; 3JB9 H; 2E5K A; 1TG0 A; 4J5Y A; 5LJ5 e; 3I9Q A; 1PD0 A; 4X34 A; 1Y07 A; 3M0Q A; 2KEA A; 3PTA A; 1QVG P; 3LLR A; 4M78 E; 4F7U A; 1CKA A; 4JZ3 A; 2EGE A; 4DEY A; 1JEG A; 1AEY A; 2RO0 A; 2KRM A; 4PJO E; 3I56 A; 4AT1 B; 4AFU C; 3J80 E; 2ROT A; 2E3I A; 2RI3 A; 2K5F A; 3U23 A; 2HKQ B; 5KYW A; 4E7Z A; 5CK9 A; 4C92 E; 4HT8 A; 2PVG B; 2EQM A; 4Z8A A; 5J39 A; 2C06 A; 3PVL A; 2X9H A; 1IZ6 A; 5GAN h; 3FIF A; 2HQE A; 3VYH B; 3E9G A; 3DB4 A; 4M7D G; 2A28 A; 4HA8 A; 3JCM h; 1EFN A; 2CZ6 B; 2RQW A; 1M2V A; 3QDR B; 1QKX A; 2A7Y A; 4IKF A; 5FLX E; 4E7L A; 8ATC B; 1VIE A; 2FPE A; 3L2Z A; 1JJ2 S; 1YIJ Q; 3HRS A; 1YJN T; 1S72 T; 1VQO Q; 5GMK j; 2LMJ A; 2CDT A; 1SF9 A; 3CCJ A; 4R0K A; 5KH6 A; 1X69 A; 2LTO A; 3SEM A; 2M1H A; 3KBG A; 2NUZ A; 3HHT B; 2QQS A; 4IIO A; 3GP8 A; 1X6G A; 1JBM A; 1O9S A; 2BTT A; 4HCK A; 2NUP A; 1QCF A; 1R8O B; 2J05 A; 3OYK A; 2DNU A; 1X27 A; 2HQH A; 3A8L B; 1GBR A; 2FZC B; 4C0D C; 1WLP B; 2GNC A; 1ZSG A; 4N4I A; 1AWJ A; 2ECZ A; 1WHK A; 2VUB A; 3MEA A; 2L89 A; 3LH5 A; 3P8B B; 1X75 C; 2P84 A; 4GLM A; 5I2S A; 4QQG A; 2P4R A; 3MEW A; 1TH7 A; 3QKJ A; 3J7A F; 1UEC A; 2YRC A; 4HVV A; 2DTI A; 1EZZ B; 1M5Q 1; 2F5K A; 4E47 A; 4RCC A; 1D0Y A; 1BIA A; 3MP6 A; 4GLK A; 3G4S A; 1AD5 A; 1OPK A; 2DEQ A; 3TQ7 P; 3OY9 A; 1B3Q A; 5GAN 6; 1N9R A; 2XIC A; 4FSX A; 4M7A F; 3CCQ T; 4WF2 A; 4ELZ C; 4M75 D; 2RHU A; 1BI2 A; 4IUU A; 3CCM T; 3EHQ A; 4MMK A; 4DBH A; 2DXC A; 2KGT A; 1BCO A; 1OU8 A; 5D6W A; 2DVJ A; 2GQI A; 1G3S A; 4JPB W; 4KUI A; 3LX7 A; 2OAU A; 2ZCF B; 3M4Y A; 2QGF B; 4M78 G; 2YLC A; 3OYY A; 1VQ4 T; 1UGP B; 4OVA A; 1BK2 A; 2AKK A; 3ER0 A; 3H6Z A; 2EYY A; 3CD6 Q; 3LYI A; 1K9A A; 4PK4 A; 1WHM A; 3S3O A; 2P0P A; 1ARK A; 2RMO A; 3QJY A; 3A8H B; 3PE0 A; 4BDZ A; 2QQB A; 4DOV A; 4A53 A; 1KD1 R; 1B34 B; 2J7I A; 4JRP A; 2GCX A; 3SWN A; 3ASK A; 3HP9 A; 4C8Q F; 2Y90 A; 2KK4 A; 3MET A; 4OB2 B; 2YUN A; 1HSQ A; 3VS7 A; 4PFZ A; 4HCB A; 3UF4 A; 3VS3 A; 2HDA A; 1T0H A; 4LDX A; 4Y91 A; 2JT4 A; 1K9M R; 3INZ A; 3QWY A; 4M7D D; 4KGV B; 4AG1 C; 2KDS A; 3VUB A; 4PL6 A; 4MZT A; 2YUQ A; 2EQK A; 4M7A B; 2HL5 C; 4LUD A; 2LQN A; 3WVD B; 1TS9 A; 5KE3 A; 2LT4 A; 3M56 A; 1MMD A; 2OTJ T; 3KFV A; 1VQ5 Q; 4M77 D; 2L5Q A; 1I81 A; 3OS5 A; 1XOV A; 2RQT A; 2JTM A; 1UGV A; 2QG9 B; 2HCK A; 4CC3 A; 4FW1 A; 3SFM A; 1B34 A; 2VVK A; 1PRL C; 5LJ5 g; 2K7A A; 2E5Q A; 1X01 A; 2JNG A; 2RHZ A; 3RKX A; 4J9D A; 3H0H A; 4QVC A; 3RMQ A; 4EIK A; 2QEX T; 1WHH A; 1AHJ B; 2DFU A; 3JB9 D; 4C8Q B; 2RJF A; 2BZX A; 4C5H A; 4RG8 A; 5CKH A; 3VRY A; 2D8H A; 3TVT A; 5GAM f; 1QMC A; 1PSE A; 2LQW A; 5AYF A; 2KVQ G; 3LW5 E; 2EYZ A; 3I56 Q; 4E6R A; 4OP0 A; 2XG8 D; 5KCH A; 3FEO A; 3RNJ A; 3A8G B; 5LJ3 j; 2E64 A; 4Q5W A; 5DLQ E; 1IRE B; 1NJI R; 3FC3 A; 1ZHI A; 2OTL A; 4D6W A; 1YJ9 A; 2PUO B; 4N4G A; 5GAM j; 1Q95 G; 4ZNX A; 5GMK e; 1JJ2 P; 1PG5 B; 4XK8 E; 1VQK A; 3QZ5 B; 4JZ4 A; 1UGS B; 2JS0 A; 1SRL A; 3CMA T; 1YI2 A; 2M0O A; 5IHI A; 1VUB A; 1VQ7 A; 5GMK i; 4M78 D; 4ZGJ B; 3HKS A; 3V7R A; 2DBM A; 2EFI A; 2MPX C; 1KC8 C; 4KUL A; 2DJZ A; 2M51 A; 4MDW A; 4PJO D; 2L3S A; 3HPW A; 3CCJ Q; 5HK3 A; 2XDP A; 2F2V A; 3EGU A; 1OPL A; 3RMS A; 4XU2 A; 3L2U A; 1W2B S; 2NYS A; 2RF0 A; 4JJN K; 1VOM A; 1KG1 A; 1H3H A; 1BCM A; 2FRW A; 1QCO A; 2DTO A; 4E7K A; 3JCM V; 3PNW C; 5GJW B; 2NUT A; 4KH0 B; 2EQJ A; 3CCV T; 1D3B B; 1MV0 B; 1YJW A; 1WYX A; 2H3J A; 3M58 A; 4R56 A; 1KC8 U; 3VS5 A; 3CCU T; 1T3S A; 4M7D A; 2KQW A; 3CCL A; 4E2F B; 1KFZ A; 5CCA A; 1KJW A; 1RAE B; 3PIO A; 1QKW A; 2KYB A; 1GFD A; 2JTF A; 1FMW A; 3ULR B; 3A1P A; 4MZM A; 4DA4 A; 3EG3 A; 2EJG A; 2LX7 A; 1TUG B; 4RTV A; 4M77 A; 4DBR A; 4RTW A; 3KUF A; 3JRZ A; 3G4S Q; 3MP8 A; 5IN1 A; 4BE1 A; 5FU6 C; 2HAX A; 2A3L A; 2EQI A; 2EW3 A; 3MJX A; 3BFM A; 2V1R A; 2JZ2 A; 2H8H A; 3EGD B; 4XTV A; 3OW2 S; 3M0T A; 3NTI A; 5KYU A; 2VXF A; 2E6Z A; 1IHW A; 2ZZD A; 2MF2 A; 4QT7 A; 5KYY A; 4BAC A; 2LVM A; 2QXF A; 1K73 R; 3CC2 A; 1G3W A; 3EGX B; 2A36 A; 2E65 A; 4HT9 A; 2QQ9 A; 1WA7 A; 5KYN A; 4C8Q E; 2P0Q A; 3NPF A; 1UTI A; 5IT9 E; 2LJ3 A; 1UFF A; 1GRI A; 2D0Q B; 1BI1 A; 3CPW S; 3X28 B; 3MEV A; 1VQL A; 3QDF A; 2MIO A; 1B7T A; 3E9F A; 3CME T; 3UPU A; 5GAN j; 5HCK A; 3P8H A; 2DVE A; 4C0D B; 1WX6 A; 3CCS A; 1QVF A; 2BZY A; 3V7C A; 3DB3 A; 1M2O A; 4JUV A; 1UG1 A; 3CCE T; 2LCS A; 3C95 A; 3REB B; 3H41 A; 2WSE E; 3CBP A; 3L42 A; 3EGD A; 2D6F A; 4J9F A; 1K1Z A; 5GAM h; 4M75 C; 2DIL A; 5GAN 3; 4X9D A; 3EGX A; 3S6W A; 1WGS A; 2KE9 A; 2XI9 A; 1A0N B; 4M78 A; 2EJF A; 3EG1 A; 1D0X A; 3EFR A; 3L2V A; 1Q7Y R; 3I55 A; 2DRM A; 4LN2 A; 1KQS A; 1JQQ A; 1AT1 B; 3CQT A; 3OYD A; 1UGQ B; 2G6F X; 3I56 T; 4RTY A; 3VS6 A; 3V8L A; 3WVE B; 1D1B A; 1VQ6 A; 4Z02 A; 2QK0 A; 5FRM A; 2I2L A; 2A08 A; 1GCQ A; 3SDZ A; 1V1C A; 1JXO A; 4JRQ A; 1SRM A; 2HMA A; 4C5G A; 1BIB A; 2RJD A; 1YIT A; 5L23 A; 3MHX A; 2VYT A; 2EWN A; 5LJ3 e; 1WNL A; 2H3E B; 3UDC A; 3G6E T; 4M7A G; 2ZPB B; 2P0K A; 4PLI A; 1VYU A; 2DTH A; 2QA4 T; 2F1L A; 1Q86 C; 5GMK l; 2E4H A; 4ESR A; 1X6O A; 2PQW A; 3JCM W; 1PRM C; 3TEE A; 4NOY A; 2KI7 A; 2XMF A; 2K9G A; 3CC4 T; 2MAM A; 3N5B B; 1TXQ A; 2PVO B; 3THK A; 2PU9 B; 1M3A A; 4HCZ A; 1WZO A; 1JRI A; 5FWB A; 2E10 A; 3EG2 A; 5AT1 B; 2YT6 A; 1U8R A; 3HRU A; 2LDM A; 3ME9 A; 1ZA1 B; 1P92 A; 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