The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
TFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGQTGYIPSNYVAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Specific interactions outside the proline-rich core of two classes of Src homology 3 ligands.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
TYROSINE-PROTEIN KINASE TRANSFORMING PROTEIN SRC
|
| molecule tags |
Complex (signal transduction/peptide)
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| source organism |
Avian sarcoma virus
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| total genus |
8
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1995-11-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HJD A; 1X2K A; 2RQV A; 3EGU A; 2SRC A; 1TG0 A; 2LX7 A; 3LH5 A; 4GLM A; 1RLQ C; 1AZG B; 2PZ1 A; 3R6N A; 5I11 A; 1NLO C; 1YNZ A; 2CT4 A; 2CUB A; 2A36 A; 4ZNX A; 2LZ6 B; 2JMC A; 1YWP A; 2K9G A; 3EG1 A; 1WLP B; 2G6F X; 2KNB B; 2O2O A; 2DE0 X; 2FEI A; 1A0N B; 3IQL A; 2MOX A; 2RQU A; 1GCQ C; 4AG2 C; 1OPL A; 2AZS A; 2J7I A; 3H0I A; 2KBT A; 2GGR A; 1M3B A; 2EYZ A; 2YUQ A; 2V1R A; 4AG1 C; 1SRM A; 2O9V A; 2DL5 A; 4RTW A; 1MV3 A; 1WI7 A; 2AZV A; 1CKA A; 4J9H A; 2DJQ A; 4RTY A; 3EHQ A; 4RTZ A; 4LUD A; 2YDL A; 1UHC A; 2BZ8 A; 4RTU A; 1SRL A; 1PRL C; 2DL4 A; 1KSW A; 4FSS A; 3SEM A; 4D8D A; 1SSH A; 1AWO A; 3CQT A; 1VA7 A; 1WYX A; 1BK2 A; 2YUP A; 4J9D A; 2DBM A; 2FPE A; 3H0F A; 2EGE A; 2CRE A; 1ZX6 A; 4CC3 A; 2RF0 A; 1T0H A; 5I22 A; 1X6B A; 1NYG A; 3JV3 A; 1T3L A; 1BB9 A; 1K9A A; 2JM9 A; 1SEM A; 1U06 A; 2FG0 A; 2C0T A; 3M0P A; 2GTO A; 4OML A; 2FRY A; 1PKS A; 2JT4 A; 4LN2 A; 2LJ1 A; 1QKX A; 1HD3 A; 3A98 A; 5ECA A; 4HXJ A; 3UA7 A; 1PNJ A; 4JJD A; 4F17 A; 2CSQ A; 2K2M A; 3VS3 A; 1ZUU A; 3REA B; 2KRO A; 2JW4 A; 1AOJ A; 3I5R A; 2ESW A; 1U3O A; 5FWC A; 4CC2 A; 4J9B A; 1Z9Q A; 2AK5 A; 3NMZ C; 1XOV A; 1B3Q A; 2JM8 A; 1BBZ A; 3M0S A; 4R0K A; 1VYU A; 2LMJ A; 2VVK A; 3I35 A; 2DA9 A; 2ROT A; 1UEC A; 3SHW A; 4AFS C; 1G83 A; 3M0R A; 2EQI A; 3VRZ A; 2EVR A; 2CH4 W; 1T3S A; 2CH4 A; 2K7A A; 2A37 A; 2EKH A; 1KFZ A; 2MIO A; 2J6F A; 2LJ0 A; 1UFF A; 1UDL A; 1JXM A; 2LQN A; 2PTK A; 1W70 A; 1UE9 A; 1QKW A; 2OI3 A; 2VWF A; 2YSQ A; 3EHR A; 1PWT A; 1GFD A; 3TSZ A; 2O31 A; 2W10 A; 1NM7 A; 2LCS A; 2CSI A; 4AFU C; 4F16 A; 1RI9 A; 3U23 A; 1JEG A; 1K0X A; 1E6G A; 4HCK A; 2JTE A; 1E7O A; 2DL7 A; 2F2W A; 4J9F A; 1AEY A; 1GRI A; 1AZE A; 1M27 C; 2C0I A; 3ZL7 C; 2B86 A; 2YUO A; 1AVZ C; 1NYF A; 4RUG A; 3VS1 A; 2DL3 A; 3M0Q A; 1MV0 B; 4X1V A; 1UJY A; 2K6D A; 3UF4 A; 1T0J A; 5L23 A; 2K3B A; 1QWE A; 1PRM C; 1E6H A; 2KR3 A; 2RQT A; 1YP5 A; 2KT1 A; 2L2P A; 1GCQ A; 2DNU A; 2EYX A; 1GBQ A; 4OMM A; 4DEX A; 1M3A A; 2GBQ A; 2HDA A; 1M3C A; 1H3H A; 2DIL A; 1HSQ A; 4OMO A; 1X27 A; 3UA6 A; 4HVU A; 1YCS B; 1ARK A; 4J9G A; 4DEY A; 2F2V A; 3NGP A; 3VS4 A; 2DLP A; 2RPN A; 1H8K A; 3TSW A; 2HSP A; 1X69 A; 1ZBJ A; 1M30 A; 4J9I A; 2BZX A; 1NLP C; 1K1Z A; 3NPF A; 1PHT A; 1WDX A; 2J05 A; 1K76 A; 2JMA A; 3UAT A; 1TUC A; 1UJ0 A; 4OMP A; 2DVJ A; 1VYV A; 2RNA A; 4HVV A; 1QCF A; 1H92 A; 1S1N A; 1K0S A; 5HCK A; 3THK A; 1UTI A; 2LQW A; 2ECZ A; 1SPK A; 2CDT A; 2EYY A; 3NHN A; 1GL5 A; 3EG2 A; 3I5S A; 2HCK A; 2FPD A; 3PVQ A; 5GJV B; 4D8K A; 1NG2 A; 1QLY A; 2LNH B; 4IIM A; 3C0C A; 1WXU A; 1ZUY A; 2A08 A; 3M0U A; 1NEB A; 4E6R A; 3H41 A; 2YUN A; 2D8H A; 5IHI A; 4WCI A; 3H0H A; 1ZLM A; 1YWO A; 3O5Z A; 1GCP A; 2F2X A; 1UGV A; 1JXO A; 1W1F A; 2FRW A; 2L3S A; 2O9S A; 3ULR B; 2HBW A; 2LJ3 A; 3PVL A; 1I07 A; 1RLP C; 1LCK A; 4JJC A; 2ED0 A; 2I0N A; 4A63 B; 1WA7 A; 3FJ5 A; 2JXB A; 2EYW A; 1W6X A; 2C0O A; 1TUD A; 5FW9 A; 2J6O A; 2O88 A; 1WXT A; 2BZY A; 2DBK A; 4HVW A; 1AWX A; 4EIK A; 1QWF A; 4RTV A; 2DRM A; 1X43 A; 2ROL A; 1IO6 A; 1FYN A; 2OAW A; 2KRM A; 3EG3 A; 3I9Q A; 1UG1 A; 1MUZ A; 2KRN A; 3TVT A; 2DX1 A; 3VS6 A; 4AFZ C; 2PNI A; 4Z89 A; 1J3T A; 2H8H A; 2KYM A; 2GQI A; 1Y0M A; 4KRT A; 2L3Q A; 2E5K A; 1FMK A; 2DRK A; 1B07 A; 1KJW A; 2MCN A; 2EW3 A; 1N5Z A; 2DM1 A; 3M0T A; 1JQQ A; 1ZSG A; 2CUD A; 2XMF A; 1KIK A; 4LNP A; 3RNJ A; 1VYT A; 2ED1 A; 2YT6 A; 4RTX A; 2RQW A; 2W0Z A; 1CKB A; 2M0Y A; 2CT3 A; 4ESR A; 5IH2 A; 1X2Q A; 1G2B A; 2M51 A; 4QT7 A; 2RMO A; 2DYB A; 4Z88 A; 2RQR A; 2X3X D; 1WXB A; 2V1Q A; 2RN8 A; 2J06 A; 3VRY A; 2L0A A; 2JS0 A; 1EFN A; 1PKT A; 2D0N A; 4AFQ C; 2EBP A; 1M8M A; 3GBQ A; 2ENM A; 1UUE A; 4GBQ A; 1JO8 A; 4LUE A; 2KXC A; 2DL8 A; 5EC7 A; 2EGC A; 2VKN A; 2DF6 A; 2KE9 A; 4CC7 A; 1YN8 A; 4JZ3 A; 4OMQ A; 2ABL A; 2KRS A; 2KEA A; 5GJW B; 5IHN A; 3VS7 A; 1SHF A; 1AWJ A; 2SEM A; 2JS2 A; 2AKK A; 4F14 A; 1Y57 A; 3VS2 A; 1ABQ A; 1V1C A; 1WFW A; 2NUZ A; 2KYB A; 2IIM A; 1JU5 C; 2KGT A; 2FO0 A; 2K79 A; 2KT8 A; 4JJB A; 2X3W D; 5IXF A; 3QWX X; 1CSK A; 1GFC A; 2L3P A; 4J9C A; 4CC4 B; 2HEQ A; 4Z8A A; 1UHF A; 3REB B; 4J9E A; 4K11 A; 2OJ2 A; 1I0C A; 2QDL A; 1I1J A; 3VS5 A; 3VS0 A; 1WX6 A; 1X6G A; 2GTJ A; 5IXB A; 2A28 A; 1SHG A; 2EPD A; 2P4R A; 2DMO A; 4JZ4 A; 4LE9 A; 3KFV A; 2KXD A; 2LP5 A; 1BU1 A; 1K4U S; 2J6K A; 1ABO A; 1ZUK A; 3QWY A; 1OEB A; 2GNC A; 1Z9Z A; 2BTT A; 1RUW A; 5FWB A; 4M4Z A; 5IHK A; 2AKL A; 4Y92 A; 1AWW A; 4ORZ A; 2EGA A; 4IIO A; 1WIE A; 1OV3 A; 3PE0 A; 3EG0 A; 4OMN A; 4JPB W; 1GBR A; 1NEG A; 1OOT A; 2NWM A; 1U5S A; 2FPF A; 2D8J A; 1AD5 A; 2D1X A; 1OPK A; 4RTT A; 3RBB B; #chains in the Genus database with same CATH topology 5KYX B; 1BKB A; 1MNE A; 2FZC B; 1TS9 A; 1AZG B; 2QTX A; 3RES A; 5I11 A; 4PKC C; 3G4S Q; 2A36 A; 2JUF A; 2JMC A; 3EG1 A; 2O2O A; 3MEW A; 1VQ7 A; 4XAX B; 1VOM A; 1KD1 C; 2GGR A; 1M2V B; 2EFI A; 2M16 A; 2QQB A; 4L6V 5; 2YUQ A; 3OYI A; 2KVQ G; 1RAC B; 1SRM A; 3OBW A; 1WI7 A; 2E12 A; 2DJQ A; 1WHM A; 2I2L A; 3CCS Q; 2OTL Q; 3CC7 T; 1Q82 C; 2V8J A; 1SRL A; 2EJ9 A; 2F1L A; 1SSH A; 1WYX A; 4BI3 A; 4M7A C; 1MMG A; 2CRE A; 1NPP A; 1U1T A; 4KUL A; 5GMK m; 3QUI A; 1T0H A; 3OYJ A; 2Y90 A; 2LRQ A; 4RMO A; 1VQ8 Q; 3CCU Q; 1MMA A; 2DEU A; 1LJO A; 3OQ5 A; 2C0T A; 4GY5 A; 1VQ5 Q; 2FRY A; 4BUG A; 2CYZ B; 3CXC A; 3LH0 A; 1PKS A; 3H6Z A; 2FHD A; 1N6A A; 5ECA A; 1Q7Y C; 1WQW A; 1UGS B; 2CSQ A; 3REA B; 1YJ9 T; 2KDS A; 2ESW A; 4PJO G; 5GMK e; 4CC2 A; 3MEA A; 4J9B A; 5A0L A; 2JJ9 A; 3NMZ C; 1M9S A; 4HCB A; 3PMI A; 1B3Q A; 2JM8 A; 4R0K A; 4C8Q G; 1VYU A; 2LMJ A; 3I35 A; 2DA9 A; 2ROT A; 5KYN A; 1Q81 U; 4J7I A; 3EH2 A; 1MGQ A; 5GAN g; 3QKJ A; 2HD0 A; 4M75 E; 3QZ5 B; 3OMG A; 1WHG A; 3M9Q A; 2WSC E; 4PNO A; 2B8A A; 2RHU A; 3OYK A; 2HKN A; 2A37 A; 1VQO T; 2K57 A; 2MIO A; 3OBY A; 1UFF A; 5GAN j; 1JB0 E; 3OB9 A; 2QDY B; 4Y28 E; 1PSF A; 2VWF A; 3HFN A; 1PWT A; 2XI9 A; 5CQY A; 2GQV A; 1NM7 A; 4PJJ A; 3M58 A; 4F16 A; 1ZHI A; 2ZCF B; 3JCM e; 1K0X A; 4L59 A; 4HCK A; 2L8D A; 3CMA A; 1OZ3 A; 1PSE A; 5LJ5 g; 1GRI A; 3TQ7 P; 3CBM A; 3KBG A; 1RL2 A; 2DIG A; 1AVZ C; 4M77 G; 4RUG A; 2DL3 A; 4X1V A; 1UJY A; 2ZPH B; 1VQK Q; 4OB2 B; 1E6H A; 2R58 A; 2RJE A; 1GXI E; 4E47 A; 1GCQ A; 3GF5 A; 3QXE B; 4HKE A; 5CKH A; 1KQS A; 5CAI A; 1D1A A; 2GF7 A; 2DIL A; 4OMO A; 1HSQ A; 1JBM A; 4JUV A; 5KYY B; 2DAQ A; 2XID A; 2VGN A; 3VV0 A; 5HK3 A; 1O75 A; 2BUD A; 1QVF P; 1RAD B; 3JCM V; 2FB7 A; 3OW2 S; 1KHI A; 3TSW A; 1VQP T; 2RHY A; 1X69 A; 4KUI A; 3CCE T; 1Q81 R; 1ZBJ A; 4PJM A; 1VQ4 T; 3N5B B; 4L5G A; 3NPF A; 1PHT A; 5C6S A; 3ME9 A; 4BD3 A; 1WDX A; 1EIF A; 1UEB A; 1K76 A; 3CPW A; 1VYV A; 4HVV A; 4F7U F; 1QCF A; 1S1N A; 1ACM B; 3MJX A; 4M7A E; 2CP7 A; 5HCK A; 2K2V A; 3THK A; 1TSF A; 3PIO A; 1D1C A; 2YLC A; 5I21 A; 1VQ7 Q; 2EYY A; 1RAA B; 4FSX A; 3I5S A; 3JB9 F; 2AT1 B; 2R57 A; 3PVQ A; 4D8K A; 3OSS C; 3FRN A; 2DD4 A; 1QLY A; 4O6J A; 2OTJ A; 1WXU A; 3CC4 A; 3QJY A; 3H41 A; 3GNF B; 2YUN A; 4WCI A; 1X01 A; 2DER A; 2ZPI B; 3O5Z A; 4ELZ C; 5DY9 A; 3CCV T; 4F7U B; 4C92 F; 2E6N A; 4EMG A; 3LWI A; 3G7Z A; 3LWH A; 2RM4 A; 4A53 A; 4N0A A; 3EGX B; 2WSF E; 2BE7 D; 4MZP A; 2DK3 A; 4JJC A; 2ED0 A; 4ELY C; 4N4I A; 2LNV A; 3TRE A; 4A63 B; 3OS2 A; 2EYW A; 3VYH B; 1IHV A; 1TUD A; 1WHL A; 2J6O A; 5FW9 A; 4R56 A; 5KYU B; 2DBK A; 4MMK A; 1G8X A; 4DOW A; 1FYN A; 4UC4 A; 1TXQ A; 1BCM A; 4PFP A; 1B34 B; 1YJN Q; 4XTU A; 3TVT A; 2O4X B; 2H8H A; 2KYM A; 4C92 B; 1YJW T; 3SFM A; 1Y0M A; 3CCL A; 2E5K A; 3LLR A; 1VQL A; 1KJW A; 3LGF A; 3CCJ Q; 2P0P A; 4A4K A; 5GAM h; 1NE8 A; 3M0T A; 4Q5W A; 2EIF A; 2ED1 A; 4RTX A; 2XU8 A; 4P5N A; 4ESR A; 1X2Q A; 5J26 A; 1S72 A; 1R77 A; 3M55 A; 2LC4 A; 3BY7 A; 3CME A; 3SWN C; 2RMO A; 2DO3 A; 2DYB A; 3RMQ A; 1WXB A; 4E7Z A; 4TVR A; 2RN8 A; 1M1K U; 2J06 A; 1AT1 B; 2JS0 A; 5LJ5 f; 5FU6 C; 3I56 T; 3EG9 B; 2P0Q A; 2D0N A; 4JJN K; 1M8M A; 2ENM A; 3QJ6 A; 3JCM X; 2KXC A; 2RI5 A; 4VUB A; 2VB6 A; 5FRN A; 1Q81 C; 2P4T A; 3CCQ T; 3J80 E; 2ABL A; 5LJ3 h; 5IHN A; 1SHF A; 3Q1J A; 2DXC A; 2SEM A; 3QZ9 B; 1TTH B; 4E7K A; 3C95 A; 1P92 A; 1V1C A; 5CKF A; 5FU6 B; 1JU5 C; 4EMH A; 3O8V A; 4AT1 B; 2RH2 A; 3M4G A; 3HP9 A; 5IXF A; 1KQ2 A; 1LNX A; 4J9C A; 4C5H A; 2HEQ A; 1WJR A; 4HA8 A; 4LDU A; 3GOX A; 4QQD A; 3H8Z A; 4F7U E; 2COZ A; 1Y96 B; 2QDL A; 3HSB A; 3VS5 A; 3L2R A; 1X6G A; 2QA4 Q; 3JB9 D; 5FU7 C; 3QO3 A; 2RD1 A; 3CD6 A; 2J6K A; 4KBM B; 3QWY A; 2YXY A; 1LPL A; 5CVI A; 1JJ2 A; 2YWW A; 2OTL A; 3S6W A; 1N8R R; 4Y92 A; 4M7D F; 2EGA A; 2DYI A; 1QVP A; 4IIO A; 1PD0 A; 3GNG A; 4XK8 E; 4JPB W; 1M1K R; 1NEG A; 3H9N A; 4C92 D; 5FU7 B; 5I2S A; 4M7D C; 3A8M B; 3RBB B; 1HJD A; 1IRX A; 4C92 E; 3ER0 A; 3L1A A; 2NUP B; 3LH5 A; 2PZ1 A; 3BFM A; 3D7S B; 1YNZ A; 1OI1 A; 2MWO A; 3FIF A; 4C8Q A; 3LX7 A; 2CUB A; 2OTJ Q; 3CC4 Q; 3EFR A; 1YWP A; 3HPW A; 1WGS A; 5M9O A; 1TOV A; 2DE0 X; 5AT1 B; 1QVG A; 1A0N B; 1I4K 1; 2MOX A; 4RG8 A; 2XK0 A; 4FCY A; 1VQ9 A; 2WAC A; 2AZS A; 4M7D B; 2J7I A; 4E7H A; 2KBT A; 2EYZ A; 2P0K A; 4PFZ A; 5D6Y A; 4N4H A; 4B9W A; 2V1R A; 2DD5 A; 3QBY A; 4RTW A; 1MV3 A; 1VQM T; 2AZV A; 1UB4 A; 1YIT T; 5CKE A; 5GAM d; 1EZZ B; 1W2B A; 2NUT A; 4Y91 A; 2YDL A; 2QGF B; 1UHC A; 2BZ8 A; 5CO7 A; 4RTU A; 2Y4X A; 3SEM A; 5GAN 3; 5GAM e; 4OB1 B; 5KE3 A; 1BK2 A; 4J9D A; 3CC7 A; 5GAO r; 2RF0 A; 5HK0 A; 1WJS A; 3P8D A; 4ZN3 A; 1NYG A; 1PG5 B; 1WHJ A; 1YFN A; 4WTO B; 1BB9 A; 1K9A A; 2JM9 A; 4OVA A; 1QP3 A; 4M78 F; 1Q7Y R; 3GIB A; 5LL6 S; 3JB9 H; 2GTO A; 3CEY A; 5KYW B; 3MP1 A; 4OGC A; 5L8R E; 2K5F A; 1FMV A; 4MML A; 2LJ1 A; 1HD3 A; 2DJZ A; 4BB7 A; 3CCL Q; 4IUQ A; 3UPU A; 1VQL Q; 4DBH A; 4HXJ A; 2GCX A; 4WF2 A; 1PNJ A; 5LJ3 d; 4F17 A; 3VS3 A; 1TUG B; 5GMK j; 1G3Y A; 2KRO A; 3JCM b; 5FWC A; 1S72 Q; 5LJ3 e; 5A0D A; 3CME Q; 2RHI A; 4EMK A; 2Z0W A; 1ZSZ B; 3AHU A; 3QII A; 3G6E A; 4EDU A; 1BBZ A; 2FL7 A; 2VVK A; 1UEC A; 4FW1 A; 5CKD A; 3JCM P; 1BI0 A; 1G83 A; 3M0R A; 2ZPG B; 4M78 B; 3URG A; 3FLG A; 2CZ6 B; 3VRZ A; 2CH4 W; 2MYS A; 2L5Q A; 2CH4 A; 3JCM g; 4LXC A; 9ATC B; 2K7A A; 4KT0 E; 4PJO F; 2EKH A; 3OYB A; 3R6O A; 3EFO A; 4NS5 A; 2EQU A; 2QYZ A; 1QVF S; 2QEX T; 3C12 A; 5I2M A; 1Y71 A; 1VQO A; 1VQN A; 1M1K C; 1GFD A; 4PJO C; 3TSZ A; 1G5V A; 1SF9 A; 4M7D D; 4AFU C; 1RI9 A; 5HY6 A; 2LTO A; 4A4H A; 1E6G A; 1MMN A; 2BIV A; 1VQ8 T; 4NOY A; 2F2W A; 1NJI U; 3MO8 A; 4FM4 B; 3CC2 T; 4M7D E; 1VQ5 T; 2E3I A; 4J9F A; 3UWN A; 5GMK l; 1YIJ T; 3ZL7 C; 2B86 A; 2YUO A; 1BIA A; 4J8O A; 2K6D A; 3MET A; 4JS5 A; 2RQT A; 2KT1 A; 1D0X A; 2L2P A; 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