The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
SPKAVALYSFAGEESGDLPFRKGDVITILKKSDSQNDWWTGRVNGREGIFPANYVELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Hypothetical 40.4 kDa protein in PES4-HIS2 intergenic region
|
| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from a S. cerevisiae hypothetical 40.4 kDa protein at 1.39 A resolution
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Structural genomics
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| total genus |
12
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| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-03-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AK5 A; 2CH4 A; 1YWP A; 1G83 A; 1YP5 A; 4DEX A; 2YUQ A; 1B3Q A; 3VS0 A; 3PVL A; 2X3W D; 2JMC A; 2KXD A; 5IHK A; 1UGV A; 2K6D A; 1PKS A; 2LZ6 B; 3VS7 A; 1GCP A; 2RN8 A; 2ESW A; 2NUZ A; 2KBT A; 3IQL A; 1SPK A; 2DYB A; 1UEC A; 2V1R A; 2GGR A; 2KEA A; 1H92 A; 2OAW A; 2ED0 A; 1M3B A; 1HD3 A; 3EHQ A; 2KNB B; 2RF0 A; 1YN8 A; 2J6K A; 3EG3 A; 2LX7 A; 2O9V A; 1AEY A; 1UFF A; 1WLP B; 2CT3 A; 4ORZ A; 1K0S A; 2J7I A; 2J05 A; 4LN2 A; 1RUW A; 2VVK A; 2JW4 A; 2GBQ A; 2LP5 A; 3QWY A; 2RQV A; 3M0T A; 2BZX A; 4HCK A; 1ABO A; 2O2O A; 3VS4 A; 2CH4 W; 1NYG A; 1QKX A; 4LE9 A; 1NLO C; 2P4R A; 4D8K A; 1X27 A; 1AZG B; 5GJW B; 2KR3 A; 1ZX6 A; 3REB B; 2A28 A; 2W0Z A; 2PZ1 A; 1GFC A; 2KT1 A; 4HXJ A; 1T3S A; 4K11 A; 3I9Q A; 1WFW A; 5IXB A; 2YUN A; 4RTT A; 1YCS B; 1NEG A; 1PKT A; 2DRM A; 5EC7 A; 3EG1 A; 2RQT A; 2SEM A; 1K9A A; 3FJ5 A; 1A0N B; 1PRM C; 1X6G A; 1W70 A; 1AD5 A; 3CQT A; 4J9I A; 1SHF A; 2DE0 X; 2DL7 A; 1PRL C; 2EYY A; 1SRM A; 4OMM A; 4AFS C; 1T0J A; 1TUD A; 1UG1 A; 2KGT A; 3JV3 A; 4LUD A; 4OML A; 2FEI A; 5FWC A; 2DNU A; 3H0F A; 2CUD A; 2M0Y A; 2C0T A; 2FRW A; 2D0N A; 1NYF A; 1UTI A; 1KSW A; 3REA B; 4F17 A; 4J9B A; 3UAT A; 1LCK A; 4QT7 A; 4JZ3 A; 1Z9Q A; 2OI3 A; 3KFV A; 4J9D A; 4GBQ A; 4RTW A; 4Z8A A; 3ULR B; 1X2Q A; 2L3S A; 2CDT A; 1M27 C; 1PHT A; 3I5S A; 1QCF A; 4JJD A; 1ABQ A; 2ECZ A; 3LH5 A; 2EW3 A; 2PNI A; 3I5R A; 1CKB A; 1GBQ A; 2RMO A; 2KYB A; 2FRY A; 1ZSG A; 2HCK A; 1PWT A; 1GCQ C; 4JJB A; 2LCS A; 1I0C A; 4OMO A; 1UDL A; 1NM7 A; 2K2M A; 1UE9 A; 2O88 A; 4ESR A; 2YDL A; 2K9G A; 3TSW A; 2KRN A; 1RLQ C; 1AOJ A; 1SHG A; 2EVR A; 1FMK A; 5FW9 A; 2L3Q A; 1XOV A; 2JM8 A; 4WCI A; 2DBM A; 2ED1 A; 1YWO A; 2DL4 A; 3O5Z A; 3PVQ A; 4Z89 A; 5HCK A; 1MV0 B; 4M4Z A; 3M0Q A; 2EYX A; 1VYU A; 3PE0 A; 4AFZ C; 1QKW A; 2LQW A; 2DMO A; 1KIK A; 3UA7 A; 2DRK A; 3UA6 A; 4JJC A; 2EPD A; 1J3T A; 2KE9 A; 4JPB W; 2LMJ A; 4CC4 B; 2NWM A; 3VS2 A; 1X6B A; 2ROT A; 1AWO A; 1X2K A; 1WDX A; 5ECA A; 1OPK A; 2JXB A; 1M8M A; 2D8H A; 3VS6 A; 2F2W A; 1WXT A; 1K0X A; 4OMQ A; 3H0H A; 1M3C A; 2K79 A; 2I0N A; 4F14 A; 2V1Q A; 4J9F A; 1HJD A; 3GBQ A; 4AG2 C; 1BK2 A; 1AWJ A; 2RQU A; 4AG1 C; 2HBW A; 2VWF A; 1WXB A; 5GJV B; 2FPD A; 2XMF A; 1WIE A; 5FWB A; 1FYN A; 1NEB A; 1N5Z A; 2H8H A; 1UJ0 A; 1UHC A; 2A08 A; 2JS0 A; 1U3O A; 1X43 A; 1M3A A; 2C0I A; 2LQN A; 2YUP A; 4HVW A; 4RTZ A; 4LNP A; 2RPN A; 5IH2 A; 2KXC A; 1K4U S; 1BB9 A; 2EBP A; 2J6F A; 2CSI A; 2BZY A; 2MCN A; 2YSQ A; 1IO6 A; 1U5S A; 4J9H A; 2KRO A; 1VA7 A; 2SRC A; 2X3X D; 3TSZ A; 2CT4 A; 1RI9 A; 1ZLM A; 3U23 A; 2EGC A; 2JMA A; 1I1J A; 2OJ2 A; 3R6N A; 2DM1 A; 4RUG A; 2AKK A; 2LJ1 A; 3NMZ C; 1ZUK A; 2YT6 A; 2DLP A; 2DL8 A; 1AZE A; 3NPF A; 5IHN A; 3A98 A; 1JXM A; 2GTJ A; 1W6X A; 2ABL A; 4HVV A; 2GNC A; 1EFN A; 4F16 A; 1AWX A; 3C0C A; 3H0I A; 4CC7 A; 4Z88 A; 1X69 A; 2W10 A; 4CC3 A; 1TUC A; 4X1V A; 1U06 A; 1Z9Z A; 4OMN A; 3UF4 A; 1V1C A; 3M0S A; 1VYV A; 3VS3 A; 1UJY A; 2KRM A; 1G2B A; 1SRL A; 2FG0 A; 3VS1 A; 5IHI A; 1AWW A; 2G6F X; 2QDL A; 4AFU C; 2FO0 A; 2DL3 A; 1PNJ A; 1ZUU A; 4J9E A; 2LNH B; 2HEQ A; 4HVU A; 2GQI A; 2JS2 A; 3VS5 A; 4A63 B; 2J6O A; 2DX1 A; 2F2X A; 2AZV A; 2RQR A; 1OOT A; 2L0A A; 3EG2 A; 1UUE A; 2MIO A; 2CUB A; 1BBZ A; 4J9G A; 1QWE A; 3VRY A; 1OV3 A; 1SSH A; 1TG0 A; 2YUO A; 2EYZ A; 2EKH A; 4LUE A; 3QWX X; 1E7O A; 1K1Z A; 1KJW A; 1B07 A; 2DL5 A; 2EQI A; 4RTU A; 4FSS A; 1ZBJ A; 2ENM A; 1JO8 A; 1Y57 A; 4JZ4 A; 1GCQ A; 1GRI A; 1UHF A; 2IIM A; 2J06 A; 2L3P A; 2JT4 A; 1K76 A; 3M0U A; 2DIL A; 1WXU A; 2KRS A; 2LJ3 A; 1AVZ C; 2EGA A; 2DJQ A; 2O9S A; 2JTE A; 2A36 A; 3TVT A; 1WX6 A; 2CRE A; 1YNZ A; 2A37 A; 3M0P A; 2KYM A; 4Y92 A; 2O31 A; 3H41 A; 1NLP C; 3VRZ A; 3EG0 A; 2E5K A; 4GLM A; 1KFZ A; 2ROL A; 3NGP A; 1M30 A; 2VKN A; 4IIO A; 4R0K A; 4J9C A; 1JXO A; 2BTT A; 1H8K A; 2DBK A; 1GFD A; 2AKL A; 5I11 A; 1OPL A; 3M0R A; 1JEG A; 4AFQ C; 1QLY A; 1ARK A; 1W1F A; 4KRT A; 4EIK A; 5L23 A; 2DF6 A; 1OEB A; 3EGU A; 4ZNX A; 4DEY A; 1RLP C; 1S1N A; 4D8D A; 3THK A; 2FPE A; 2LJ0 A; 2D8J A; 1BU1 A; 2EGE A; 2BZ8 A; 2M51 A; 4RTY A; 4OMP A; 2F2V A; 4E6R A; 1Y0M A; 4IIM A; 3NHN A; 2HSP A; 1CSK A; 2K7A A; 2DVJ A; 2EYW A; 1H3H A; 2K3B A; 2D1X A; 2B86 A; 3SHW A; 1MV3 A; 1T0H A; 1T3L A; 3I35 A; 1HSQ A; 1QWF A; 2KT8 A; 4CC2 A; 2MOX A; 1WA7 A; 2AZS A; 2HDA A; 1MUZ A; 3EHR A; 2CSQ A; 1ZUY A; 1WYX A; 2FPF A; 2RNA A; 1JU5 C; 2C0O A; 3RNJ A; 1WI7 A; 1I07 A; 1JQQ A; 2DA9 A; 3ZL7 C; 1E6G A; 1SEM A; 1NG2 A; 5IXF A; 1VYT A; 2PTK A; 4RTV A; 4RTX A; 3SEM A; 2L2P A; 1E6H A; 2RQW A; 2JM9 A; 3RBB B; 1CKA A; 5I22 A; 1GBR A; 2GTO A; 1GL5 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2AK5 A; 4C5E A; 4BAC A; 2CH4 A; 2IVW A; 1YP5 A; 4DEX A; 2YUQ A; 2JZ2 A; 2ATC B; 3VS0 A; 3PVL A; 1WGS A; 3RMQ A; 4PJM A; 5GAN 3; 2LZ6 B; 2CYZ B; 2NUZ A; 2RHX A; 3OYA A; 5FU6 C; 4F04 B; 3LX7 A; 3JCM J; 2CKK A; 4C5G A; 4C92 D; 4M7A E; 2BUD A; 4Q5W A; 1H92 A; 3JSC A; 4X9C A; 2K2V A; 1YN8 A; 3OS2 A; 2J6K A; 2LX7 A; 4FIB A; 2DXU A; 1TOV A; 2JW4 A; 2V8I A; 4FYV B; 1EX4 A; 3CPW A; 2BZX A; 2EJG A; 3J7A F; 4AT1 B; 4LDY A; 3JCM X; 4M7A G; 1XQH A; 2MPX C; 1NYG A; 3MJX A; 1RAI B; 1RAD B; 2P4T A; 1AZG B; 2KR3 A; 1ZX6 A; 3OYI A; 1VQ9 Q; 3FB9 A; 5CKD A; 4XU2 A; 1VQM T; 1K73 C; 4HXJ A; 1T3S A; 2DTH A; 4N0A C; 4M75 C; 3CPW S; 4P5N A; 1FMV A; 1EIF A; 1ACM B; 2XI9 A; 2RHI A; 3EG1 A; 4C92 F; 2HKQ B; 4M7A A; 5KYU B; 1D0Z A; 4R56 A; 2CP0 A; 3SB2 A; 1VQM Q; 4AFS C; 1PRL C; 1EZZ B; 1MNE A; 1QVF A; 1T0J A; 1UG1 A; 3D7S B; 2QEX T; 1BI0 A; 2QGF B; 2CP7 A; 4FU6 A; 1HYO A; 2COY A; 4KH0 B; 1K9M R; 5FLX E; 3OYG A; 4M7D E; 4KGV B; 2QEX Q; 3SWN C; 2DTI A; 3OYN A; 2RO0 A; 4C0G A; 2DEQ A; 4OB2 B; 2CP3 A; 1QVF S; 2BE9 B; 5I21 A; 3GLX A; 1YJ9 T; 2A0F B; 1WHG A; 1U1S A; 2O01 E; 1QCO A; 3MCA B; 3MEA A; 2RHY A; 3H8Z A; 3V8K A; 5CR2 A; 1YJ9 Q; 2M0O A; 3EGX B; 4M7D G; 1C1A A; 5KYN A; 1W2B A; 2LCS A; 1PC0 A; 1NM7 A; 2K2M A; 2LCL A; 2O88 A; 4E2F B; 2K9G A; 3FC3 A; 3M53 A; 1KQS S; 3A8G B; 3GPL A; 4KUD K; 1IRE B; 4JLI A; 1W2B P; 1YWO A; 3PVQ A; 1VQP A; 4M7D A; 2P0K A; 3A1P A; 2PVO B; 1MV0 B; 4M4Z A; 3PE0 A; 3E1S A; 4XTV A; 3DLL A; 1QKW A; 2LQW A; 2DMO A; 8ATC B; 5KE3 A; 1KIK A; 3JCM f; 1QP2 A; 3UA6 A; 4JJN K; 4FCY A; 4XU0 A; 2LCC A; 1AWO A; 4C8Q C; 2HZY A; 5ECA A; 4IUP A; 2JXB A; 2FYK A; 2D8H A; 1WXT A; 2CP2 A; 1Q82 R; 3NTH A; 1M3C A; 2D6F A; 1MMD A; 2K79 A; 4F14 A; 3CMA T; 1YIT A; 4J9F A; 1QMC A; 3EH1 A; 5D7U A; 5C0M A; 3EFR A; 3OYD A; 3JAM E; 2LVM A; 3X25 B; 3JCM Q; 1WXB A; 2M16 A; 4OB1 B; 2VXF A; 5GJV B; 5GAO l; 2JTF A; 1Q86 R; 1XJW B; 1VQ8 T; 3CMA Q; 2Y4X A; 2OTJ Q; 2A08 A; 1U3O A; 4NS5 A; 3CEY A; 3EH2 A; 4BY6 C; 1TWB A; 1VQ8 Q; 4RTZ A; 2RPN A; 3JCM e; 1AT1 B; 2RK1 A; 1KC8 C; 2CSI A; 2BZY A; 2YSQ A; 4J9H A; 4PLI A; 5M9O A; 2DXB A; 5DM7 R; 1D1A A; 1VA7 A; 4B9W A; 1M2V A; 4C92 E; 2SRC A; 2X3X D; 1VQN Q; 3UWN A; 2F69 A; 2EGC A; 1BKB A; 2OJ2 A; 5GMK i; 4KGX B; 2EFI A; 4WF2 A; 4RUG A; 2HD0 A; 1S72 T; 5KYY B; 8AT1 B; 2EQM A; 1FXX A; 1VQ5 Q; 3A5Z B; 3NPF A; 1Q7Y C; 4HVV A; 2X4X A; 2GNC A; 4LDU A; 4F16 A; 3CCV A; 4A4F A; 3CC7 T; 1AWX A; 2KMT A; 1X69 A; 2W10 A; 2K5I A; 3HRS A; 4JUV A; 1G3W A; 1S72 Q; 2EJ9 A; 3M0S A; 1RAF B; 1TTH B; 3M54 A; 4XQ3 A; 2KRM A; 4C92 G; 2FG0 A; 3PMT A; 2FO0 A; 2DL3 A; 5GAN g; 3CC7 Q; 3EFS A; 2X4J A; 4NL2 A; 4JRP A; 4QVC A; 2GQI A; 2NLU A; 3EG9 A; 3VS5 A; 2DPP B; 1K8A C; 3JCM W; 1YJW T; 5CCA A; 2DX1 A; 2AZV A; 2MAM A; 4KUL A; 2L3R A; 2OTL A; 3QHS A; 1R8O B; 2L0A A; 4M78 B; 1NJI R; 2MIO A; 4OP0 A; 1BI3 A; 2CUB A; 4C92 A; 1WPY A; 1KK7 A; 1YJW Q; 3EFO A; 2LDM A; 4O6J A; 2VYT A; 3S6W A; 1MND A; 3LWI A; 2QTV A; 2EKH A; 2NYS A; 3G7Z A; 5GAN 7; 4GY5 A; 4FL6 A; 1K1Z A; 1B07 A; 2DL5 A; 1G3T A; 2HQX A; 1B34 A; 1D3B B; 2E6N A; 1LJO A; 1GRI A; 2IIM A; 2FHD A; 5GAN j; 3OS5 A; 1HXD A; 1K76 A; 1WXU A; 2KRS A; 5GMK m; 2P84 A; 2FZG B; 3QYH B; 2HSE B; 2EGA A; 4BDY A; 1WQ7 A; 1VUB A; 1KD1 R; 2DAQ A; 2A36 A; 3TVT A; 2JTM A; 3I55 A; 1VQL T; 1Y7X A; 2A37 A; 3EGX A; 4OGC A; 3CC2 A; 4Y92 A; 1SF9 A; 5HK3 A; 1NLP C; 4AMC A; 3M4G A; 3EG0 A; 2E5K A; 1KFZ A; 5GAO q; 4BDZ A; 2FZK B; 3HFN A; 2DBK A; 2YRV A; 1VOM A; 4JLG A; 1TSF A; 3I56 A; 3FEO A; 4HT8 A; 1QLY A; 4KUI A; 1N8R C; 1RAG B; 3EGU A; 4FYW B; 3PTA A; 1S1N A; 4D8D A; 5FRN A; 4PJO C; 2LNV A; 1ZA2 B; 2EGE A; 2BZ8 A; 4JRI A; 3RIR A; 3CXC P; 2A7Y A; 4IIM A; 3LWH A; 1WJQ A; 3ME9 A; 3OYE A; 4ELY C; 1WHJ A; 2HSP A; 1CSK A; 2K7A A; 3AHU A; 2FZC B; 2B86 A; 1T3L A; 1LNX A; 2CZ1 B; 1PSE A; 3S3N A; 4ZGD B; 3OYJ A; 2RI5 A; 2AZS A; 1YJN A; 4FYX B; 2CZ0 B; 1H3Z A; 3OY9 A; 5IN1 A; 1JU5 C; 2C0O A; 1M90 U; 1QP3 A; 4XTU A; 5J3B A; 4EMK C; 4M75 D; 3OBW A; 2MI6 A; 1SEM A; 1NG2 A; 3CD6 T; 5IXF A; 4LDW A; 4UC4 A; 1IZ6 A; 2JM9 A; 4JRK A; 5I22 A; 5IT9 E; 2MMP A; 1I5O B; 1VQP Q; 3CCQ T; 2FB7 A; 3CCL A; 1AHJ B; 2ZPI B; 1YWP A; 1G83 A; 1MMA A; 3QSU A; 3QPH A; 5GMK e; 1B3Q A; 2JMC A; 2RM4 A; 3P8D A; 4PJL A; 5GAN d; 1IHV A; 4M7A B; 3QYG B; 4E47 A; 2ESW A; 4M77 D; 3IQL A; 1UEC A; 2VC8 A; 1H64 1; 1U1T A; 2GGR A; 2E70 A; 2PU9 B; 3QDR B; 4BUG A; 3PT9 A; 5AYF A; 1HD3 A; 4ELZ C; 5KCO A; 4C0D B; 2RF0 A; 1YIT Q; 1WNL A; 3EG3 A; 1BCM A; 4ANJ A; 2HL3 A; 4M75 F; 5A0D A; 3OMC A; 3QZ9 B; 4GLK A; 2J05 A; 4LN2 A; 1YHQ T; 1RUW A; 2KI7 A; 2GBQ A; 2QQR A; 1QCN A; 1KHC A; 3KXT A; 5D6X A; 4HCK A; 2NUT A; 5LJ5 e; 2O2O A; 5GAO n; 2LC4 A; 4LE9 A; 1M1K C; 1OUL A; 1X27 A; 4ZTF A; 5LJ5 h; 1OI1 A; 2V8J A; 1ZHI A; 4K11 A; 2YXY A; 4Y91 A; 5J39 A; 1NEG A; 2EKO A; 2DRM A; 4IKF A; 2DER A; 2RQT A; 2SEM A; 1D3B A; 3FJ5 A; 5D6Y A; 1PRM C; 3E9G A; 1W70 A; 2L89 A; 2EYY A; 1SRM A; 3FRN A; 1TUD A; 2DIG A; 1ZQ1 A; 4HCB A; 4C8Q D; 3PFS A; 3CCV Q; 3WVE B; 2DNU A; 1K8A U; 4M7D B; 4ZGJ B; 1Y71 A; 3MP8 A; 2C0T A; 1IHW A; 2FRW A; 4XAX B; 1NYF A; 4OMF B; 2OTL T; 1XNI A; 4J9B A; 4LDX A; 4J6Y A; 4J83 A; 3OBY A; 4QT7 A; 3T9N A; 2E3H A; 4GBQ A; 2PUK B; 3ULR B; 4OGE A; 2CDT A; 1PHT A; 2OTL Q; 4BE2 A; 1QCF A; 1M1F A; 1D0Y A; 1KQ2 A; 2QTX A; 1PM3 A; 2EW3 A; 3GP8 A; 2PNI A; 3CME T; 3I5R A; 1CKB A; 3MP6 A; 5LJ3 e; 4JRQ A; 2HCK A; 4LD9 K; 5LJ3 h; 3CC7 A; 1U8R A; 4ESR A; 3CME Q; 3QJY A; 2KRN A; 4C8Q F; 4BE1 A; 3KUF A; 2E4H A; 3CCM A; 1RAH B; 1AOJ A; 4MDW A; 4ZN1 A; 4TVR A; 2JM8 A; 3I55 T; 2WSF E; 3NTK A; 2ED1 A; 3O5Z A; 3CC2 T; 4Z89 A; 1YJW A; 2DIQ A; 5LL6 S; 1VYU A; 1Y96 A; 1G5V A; 2R5M A; 1M2V B; 3I55 Q; 2QQS A; 2ZPE B; 1JBM A; 4EMG A; 1J3T A; 2JUF A; 1TUG B; 2R58 A; 3CC2 Q; 2D0Q B; 4CC4 B; 2K3X A; 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