The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
94
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structure length |
94
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Chain Sequence |
GSSGSSGSRDIRFANHETLQVIYPYTPQNDDELELVPGDFIFMSPMEQTSTSEGWIYGTSLTTGCSGLLPENYITKADECSTWIFHGSSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of SH3 domain in Suppressor of T-cell receptor signaling 1
rcsb |
| molecule keywords |
Suppressor of T-cell receptor signaling 1
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| molecule tags |
Protein binding
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
7
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| structure length |
94
|
| sequence length |
94
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| ec nomenclature |
ec
3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase. |
| pdb deposition date | 2006-12-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4RTX A; 2HDA A; 1GRI A; 4IIO A; 2LCS A; 2FPF A; 3VRY A; 4A63 B; 2EGE A; 5I11 A; 1OV3 A; 4AG1 C; 2CUD A; 1X6B A; 2O9S A; 1BK2 A; 2KEA A; 2LNH B; 3M0P A; 1TUD A; 4CC3 A; 5HCK A; 2BZX A; 1WIE A; 2FPD A; 3NMZ C; 1X2Q A; 4HVW A; 1WLP B; 2C0T A; 4F16 A; 2CSQ A; 3C0C A; 3R6N A; 3H0F A; 1WI7 A; 1X43 A; 1Y57 A; 4ESR A; 4X1V A; 2EPD A; 5IXF A; 1K0X A; 2GQI A; 1H92 A; 4QT7 A; 3PE0 A; 2DL7 A; 2LQN A; 1HD3 A; 1VA7 A; 1ZUY A; 4OMM A; 2KBT A; 1WX6 A; 1M27 C; 1SRM A; 2VKN A; 1T0J A; 2EQI A; 1IO6 A; 2DNU A; 2CDT A; 1I1J A; 1UGV A; 1GL5 A; 1BBZ A; 1YWO A; 1YP5 A; 2AZS A; 2OAW A; 4HVV A; 1YWP A; 1NYG A; 2RQV A; 1M3A A; 1GBR A; 1FMK A; 3VS7 A; 2D8J A; 1NYF A; 4GBQ A; 1CKB A; 1NG2 A; 2CT4 A; 3QWX X; 2DRK A; 2A08 A; 1M30 A; 5IH2 A; 1KSW A; 1UUE A; 4K11 A; 2KE9 A; 1AOJ A; 1PKT A; 3VS4 A; 2A37 A; 4F17 A; 3RNJ A; 1OPL A; 2B86 A; 1VYU A; 1ZX6 A; 2LZ6 B; 3UAT A; 2EBP A; 4F14 A; 2GBQ A; 2LJ1 A; 3CQT A; 3NHN A; 2KT1 A; 2DYB A; 2ECZ A; 2W10 A; 4CC7 A; 1BB9 A; 2EYW A; 4CC2 A; 2ROT A; 2DF6 A; 1BU1 A; 1QKW A; 3UA7 A; 1RLP C; 1AD5 A; 2J06 A; 2KT8 A; 2DLP A; 2OJ2 A; 5I22 A; 2PZ1 A; 1ZUU A; 2JT4 A; 2L2P A; 4AG2 C; 2KXC A; 1CKA A; 4CC4 B; 1E6G A; 4LE9 A; 2NWM A; 1E7O A; 2KNB B; 1H3H A; 1JU5 C; 2CSI A; 1XOV A; 2RF0 A; 4JJD A; 1J3T A; 2H8H A; 4JPB W; 3I5R A; 2CH4 A; 3SEM A; 2EW3 A; 1GFD A; 4OMN A; 2D8H A; 2ENM A; 3EGU A; 3TSZ A; 2FPE A; 2DIL A; 2K79 A; 2ESW A; 2M51 A; 2K9G A; 3VS1 A; 1KJW A; 1T3S A; 3M0S A; 4JJB A; 2KGT A; 4OMO A; 3U23 A; 5FWB A; 3RBB B; 2C0I A; 3UA6 A; 1UEC A; 1AWX A; 1ARK A; 1AWW A; 1T3L A; 2YUP A; 1PRM C; 2J6O A; 4LUE A; 5IHK A; 4J9E A; 1W70 A; 1K4U S; 2CH4 W; 4E6R A; 4WCI A; 2NUZ A; 1TG0 A; 1Z9Q A; 4GLM A; 1X69 A; 2K6D A; 2KRS A; 2L3S A; 4IIM A; 3KFV A; 1B07 A; 2FEI A; 2RQW A; 2LMJ A; 2JS0 A; 1LCK A; 2P4R A; 3M0Q A; 2IIM A; 2QDL A; 4AFS C; 1N5Z A; 3H0H A; 1RI9 A; 2DL8 A; 1CSK A; 2J6K A; 2GTO A; 2D1X A; 3PVL A; 1OEB A; 4KRT A; 1PNJ A; 2LQW A; 2DJQ A; 2D0N A; 2DE0 X; 1WXT A; 1GFC A; 2DBK A; 3EHQ A; 1PHT A; 2JM9 A; 4JZ4 A; 2O31 A; 4M4Z A; 4LNP A; 2VVK A; 1AEY A; 2I0N A; 4OML A; 2HEQ A; 2MCN A; 1UDL A; 3TSW A; 1K76 A; 1S1N A; 1NLP C; 1UG1 A; 3VRZ A; 2YT6 A; 2V1R A; 3EG2 A; 5IXB A; 3PVQ A; 2AKK A; 2YUO A; 2JW4 A; 2JS2 A; 1PKS A; 1W6X A; 2YSQ A; 2DX1 A; 1GCQ C; 1MV0 B; 2L3P A; 2DRM A; 4OMP A; 2EYY A; 2KYB A; 5GJV B; 1UHC A; 4J9H A; 2L0A A; 2K7A A; 2LJ0 A; 5IHI A; 2CUB A; 3I5S A; 2PNI A; 2CRE A; 1YNZ A; 3FJ5 A; 4DEY A; 1GBQ A; 1U3O A; 1ZBJ A; 2BZY A; 2EGC A; 2KRM A; 2SRC A; 1K9A A; 3H0I A; 4J9F A; 1W1F A; 2O2O A; 3EG3 A; 2ABL A; 4RTU A; 1G2B A; 3VS2 A; 1V1C A; 2JMC A; 4RTZ A; 2LJ3 A; 4RUG A; 4Z88 A; 4AFQ C; 2EGA A; 2DM1 A; 1T0H A; 1VYV A; 3QWY A; 1X2K A; 5EC7 A; 4J9B A; 1UE9 A; 4RTW A; 1ZSG A; 2ED1 A; 4JZ3 A; 3VS0 A; 2RQR A; 1WA7 A; 4HVU A; 5FW9 A; 4RTT A; 4D8D A; 2L3Q A; 1A0N B; 1WXB A; 1KIK A; 3H41 A; 1QWE A; 4DEX A; 1E6H A; 2DL3 A; 1M3B A; 3NPF A; 1NLO C; 2DL5 A; 2HBW A; 1WYX A; 5GJW B; 2O9V A; 2RPN A; 1QCF A; 2G6F X; 1JQQ A; 1ABQ A; 4JJC A; 2OI3 A; 3TVT A; 1ABO A; 1VYT A; 1RLQ C; 1UJ0 A; 2FG0 A; 1AVZ C; 1UFF A; 2PTK A; 1FYN A; 1ZLM A; 2JTE A; 2DL4 A; 2RN8 A; 1MV3 A; 4Z8A A; 2X3W D; 1PRL C; 2RNA A; 2JXB A; 4HXJ A; 3M0T A; 1SSH A; 1HJD A; 1SHG A; 1NEG A; 2X3X D; 2A36 A; 3EG1 A; 2VWF A; 1I0C A; 1OOT A; 4J9D A; 2DBM A; 1Z9Z A; 4J9G A; 2F2V A; 1WFW A; 2KR3 A; 2XMF A; 3VS6 A; 2BZ8 A; 2RQU A; 1GCP A; 1K1Z A; 1WXU A; 1NEB A; 1K0S A; 2RQT A; 5IHN A; 4ZNX A; 4EIK A; 4LUD A; 2JM8 A; 2KYM A; 1AWJ A; 1Y0M A; 2DA9 A; 1G83 A; 2RMO A; 1U5S A; 3LH5 A; 2ROL A; 4ORZ A; 3VS5 A; 4J9I A; 1JEG A; 2M0Y A; 2J7I A; 1X6G A; 2KXD A; 2AKL A; 2JMA A; 2GGR A; 1QLY A; 4RTV A; 2FRY A; 2YUQ A; 4Z89 A; 4LN2 A; 2YUN A; 3SHW A; 1AWO A; 2EYZ A; 2F2W A; 2DMO A; 1H8K A; 1QKX A; 1JO8 A; 2LP5 A; 3EHR A; 1MUZ A; 4HCK A; 1JXO A; 1M3C A; 1YCS B; 2DVJ A; 4RTY A; 3IQL A; 4AFZ C; 3O5Z A; 2HCK A; 4AFU C; 1AZE A; 1YN8 A; 2KRN A; 2SEM A; 5FWC A; 2O88 A; 1SEM A; 1AZG B; 1UTI A; 1X27 A; 2ED0 A; 2EKH A; 3THK A; 1UJY A; 1OPK A; 3I35 A; 2AZV A; 3REB B; 3REA B; 2K3B A; 1ZUK A; 1B3Q A; 2EYX A; 1RUW A; 2C0O A; 2E5K A; 2F2X A; 3A98 A; 2W0Z A; 3JV3 A; 2KRO A; 2MOX A; 4R0K A; 3UF4 A; 2J05 A; 1SHF A; 2YDL A; 4D8K A; 2AK5 A; 2GTJ A; 1WDX A; 2K2M A; 1U06 A; 1TUC A; 2FO0 A; 1JXM A; 1SPK A; 2EVR A; 2FRW A; 3NGP A; 2V1Q A; 3VS3 A; 2CT3 A; 1M8M A; 1I07 A; 3I9Q A; 3M0R A; 2BTT A; 3ZL7 C; 1GCQ A; 3M0U A; 4OMQ A; 2GNC A; 2MIO A; 2HSP A; 1NM7 A; 3ULR B; 1HSQ A; 1SRL A; 4J9C A; 4Y92 A; 1KFZ A; 1QWF A; 1EFN A; 1UHF A; 4FSS A; 1PWT A; 3GBQ A; 3EG0 A; 5ECA A; 2J6F A; 5L23 A; 2A28 A; 2LX7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2ZCF B; 2GFA A; 1JJ2 P; 4IIO A; 2ZPI B; 5I21 A; 2VUB A; 2EGE A; 2EFI A; 2QGG A; 2LT4 A; 2H3E B; 2O9S A; 1KQS S; 3M0P A; 5HCK A; 2K3Y A; 1NPP A; 2FPD A; 1UGP B; 3NMZ C; 4HVW A; 4M7D D; 3C4S A; 2C0T A; 4PKC C; 3M57 A; 3CC2 A; 4M78 C; 1YJN T; 3VJP A; 4M75 E; 3CPW A; 3CCS A; 5GAO q; 1K0X A; 3OW2 P; 2GQI A; 4DA4 A; 3EGD A; 4BY6 B; 4M75 C; 3OSS C; 4TVR A; 2FZC B; 2LQN A; 1ZUY A; 1RAG B; 3A8G B; 3M9Q A; 1M27 C; 3M54 A; 3NTI A; 4CRI A; 1M9S A; 2DTI A; 2XU8 A; 1BBZ A; 3G4S A; 4LDU A; 3CC7 A; 1NYG A; 3CME Q; 2BUD A; 4MZT A; 2X4X A; 4QQ6 A; 4M7D G; 3OBY A; 1KSW A; 4B9W A; 5CKB A; 1OX8 A; 3L2W A; 3CXC P; 3OSV A; 2ATC B; 1OPL A; 1IXD A; 1YIJ A; 3X26 B; 4B6M A; 4D6W A; 4E2F B; 2WSE E; 3OYH A; 4BDY A; 4F14 A; 2LJ1 A; 3JB9 J; 3HFO A; 2ZPG B; 5FRN A; 2DYB A; 3PT9 A; 1BB9 A; 5GMK j; 4LDV A; 4FCY A; 2ROT A; 2YLC A; 2DF6 A; 1VQO A; 3PMI A; 5LJ5 g; 2WSF E; 1QKW A; 3UA7 A; 3CCE T; 4L5G A; 1K9M C; 4A4K A; 1Q7Y R; 1ZUU A; 1VQ8 A; 2RHZ A; 4JLG A; 2KXC A; 2MMP A; 4LE9 A; 1K8A R; 2NWM A; 3FRN A; 2MWP A; 2K4Y A; 2PU9 B; 2E6N A; 1JU5 C; 2RF0 A; 4JJD A; 2YRD A; 3FDR A; 2CH4 A; 3SEM A; 3CCJ T; 4OMN A; 3L2Q A; 1R0B G; 1FWZ A; 3OYY A; 4X9D A; 2KK4 A; 2K9G A; 5GAN 3; 2CGH A; 3CD6 T; 4J7F A; 5KCH A; 3CCQ T; 1QVF P; 3M0S A; 4O6J A; 4OB0 B; 3UDC A; 1Q81 U; 4M7D B; 1WHJ A; 5J3B A; 3JCM b; 1AWX A; 1AWW A; 1MMG A; 2CP5 A; 2QTX A; 4PJL A; 1PRM C; 2J6O A; 1YFN A; 1AHJ B; 5IT9 E; 5I2S A; 1W70 A; 1ZBX A; 1K4U S; 1WPY A; 5GAN d; 2K6D A; 1YIT T; 5HKC A; 3VU3 C; 1WJS A; 5CK9 A; 2FEI A; 4J6Y A; 2IIM A; 3S3M A; 2QDL A; 1K73 U; 3L1A A; 4DOW A; 3OS2 A; 1CSK A; 2EJ9 A; 5J26 A; 2EQJ A; 2LQW A; 1NJI R; 4L6V 5; 2DE0 X; 4PJJ A; 1MGQ A; 1ZSZ B; 1WXT A; 2V8K A; 5GMK m; 5D7U A; 2NUT A; 1SKU B; 4O5V A; 1KK7 A; 2GF7 A; 4LNP A; 3KUF A; 1QVG A; 2E64 A; 3G6E T; 2Y4X A; 3FIF A; 4XTV A; 1VQ7 T; 2I0N A; 4IUU A; 1R8O B; 2HEQ A; 1VQM Q; 1QQJ A; 2RI5 A; 1UG1 A; 1UEB A; 3VRZ A; 4IUQ A; 3V7R A; 1I8F A; 2KI7 A; 2V1R A; 2E41 A; 2JW4 A; 1PKS A; 5GAN 7; 3LLR A; 4BY6 C; 4M78 F; 1MV0 B; 3JCM X; 2DRM A; 2JUF A; 2NUP A; 2EYY A; 3GOX A; 5KYU B; 1UHC A; 2LJ0 A; 3RKW A; 4N4I A; 1WHM A; 2RJF A; 3BFM A; 2QEX T; 1VQN T; 2K2V A; 4DEY A; 1ZBJ A; 4FYV B; 3G71 Q; 4M75 F; 4KUL A; 2KRM A; 1YI2 T; 5GAO l; 3H0I A; 4KGV B; 1W1F A; 3EG3 A; 2ABL A; 1VQ6 Q; 5GAN 6; 1RAE B; 3CMA T; 2DM1 A; 1VYV A; 4WF2 A; 1FMV A; 3MP1 A; 2Z0W A; 4JRP A; 2OTJ A; 1ZSG A; 1R77 A; 1G3S A; 4JZ3 A; 1O75 A; 3I56 Q; 5FW9 A; 1C1A A; 3QUI A; 4C8Q D; 4M7A A; 2L3Q A; 5I2M A; 3CPW P; 2XHC A; 1MMA A; 3OS0 A; 2QQA A; 3DB4 A; 1YHQ Q; 1E6H A; 2DL3 A; 4IUP A; 2NYS A; 2DL5 A; 2QA4 A; 3EGX A; 1TWB A; 3LGL A; 1TS9 A; 5LJ3 d; 5GMK i; 1ABO A; 1VYT A; 4IKF A; 4FSX A; 1UFF A; 1ZA1 B; 5GAN 5; 1FYN A; 4PFZ A; 1M5Q 1; 2VB6 A; 4PL6 A; 1SSF A; 3SFM A; 3OYI A; 8ATC B; 3M0T A; 5GAN f; 2R5M A; 1SSH A; 4BI3 A; 4M7D E; 2Y90 A; 4ELZ C; 3C94 A; 1OOT A; 3QSU A; 1Z9Z A; 1PSF A; 2F2V A; 4JRQ A; 3CCV A; 3OB9 A; 1N8R C; 2DXB A; 4A4G A; 2WAC A; 3H9N A; 4M7D C; 1M1K C; 2RQU A; 3ER0 A; 4N0A C; 2CZ7 B; 4FU6 A; 3RMS A; 3SDZ A; 1K0S A; 4OF1 A; 5IHN A; 5KYN A; 4ZNX A; 4J7I A; 3JRZ A; 1VQ4 A; 3EG9 B; 1OUL A; 3MKD A; 3OBW A; 2HSE B; 1Y0M A; 3HRS A; 1KC8 C; 3RMQ A; 1PD1 A; 4F7U G; 2X9H A; 1G83 A; 4EPC A; 4ORZ A; 4J9I A; 2QGF B; 4NL2 A; 2JTF A; 1KHI A; 2M0Y A; 3M56 A; 2J7I A; 2KXD A; 3ZFJ A; 4BE1 A; 2HKN A; 3CXC S; 2HBP A; 4LN2 A; 1S72 Q; 4M77 A; 3I55 T; 3CCR Q; 1ZSZ C; 3GF5 A; 1H8K A; 1QKX A; 1JO8 A; 3ZEH A; 2OTL T; 4MZP A; 1YJ9 Q; 2V26 A; 2DZC A; 1YCS B; 1VQ9 Q; 4C0F A; 3MET A; 2HZY A; 4AFU C; 2COY A; 5GMK h; 3CCM T; 2SEM A; 1SEM A; 3M55 A; 2LX9 A; 3THK A; 1VQ5 T; 3S3O A; 1OPK A; 3X24 B; 5IN1 A; 5KYX B; 2DER A; 1BKB A; 1Q86 U; 2MOX A; 2ZPB B; 4D8K A; 4C0D B; 1Q82 U; 2VXE A; 4GLK A; 2AK5 A; 4L59 A; 2XDP A; 1TUC A; 3CC4 T; 3TEE A; 4JS5 A; 2V1Q A; 3VS3 A; 5GAN g; 1M8M A; 1D3B A; 1H3Z A; 1AT1 B; 2EQM A; 4LDY A; 3M0R A; 2DVE A; 2GCX A; 2BTT A; 4F7U B; 2XG8 D; 3HRT A; 2MIO A; 1U1S A; 5LJ3 f; 2HD0 A; 1FX7 A; 2M1H A; 1YJN Q; 2E6Z A; 1QVG P; 5ECA A; 2RPN A; 4ZN1 A; 2LX7 A; 4RTX A; 3S3N A; 2JVV A; 3RDV A; 1GRI A; 1I4K 1; 2CYZ B; 5I11 A; 1OV3 A; 1EIF A; 2CUD A; 2LQK A; 3JCM Q; 1I5L A; 1BK2 A; 2LNH B; 4QW2 A; 3MHX A; 1WIE A; 4E47 A; 3OS1 A; 3PMT A; 1WLP B; 4KT0 E; 2CSQ A; 3QYG B; 1WI7 A; 3OYL A; 3NTH A; 4EMK B; 2EPD A; 1D1B A; 5IXF A; 2Y4Y A; 2XI9 A; 2A7Y A; 2KY9 A; 1H92 A; 4QT7 A; 5FU6 B; 1JB0 E; 3TQ7 P; 2FB7 A; 4C5E A; 2B8A A; 2KBT A; 5AYF A; 1SRM A; 2EQI A; 2DNU A; 2CDT A; 4HCC A; 1UGV A; 5LJ5 j; 3EFR A; 4RG8 A; 4HVV A; 1YWP A; 3MP8 A; 1FMK A; 2F1L A; 2RHY A; 1UGQ B; 5GAO n; 1W4S A; 1Q95 G; 2RJC A; 3VS7 A; 1NYF A; 2XDD A; 3ME9 A; 1M2O A; 4GBQ A; 1IZ6 A; 3DLL A; 3QWX X; 4M7D F; 5IH2 A; 1YJW T; 3CCE Q; 5HY6 A; 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