The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
57
|
structure length |
57
|
Chain Sequence |
PNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSAYITPV
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ABL1
|
| publication title |
Role of interfacial water molecules in proline-rich ligand recognition by the Src homology 3 domain of Abl.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
|
| structure length |
57
|
| sequence length |
57
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2008-09-11 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1X69 A; 2OI3 A; 2LNH B; 2DIL A; 1HD3 A; 1W6X A; 1CKA A; 3M0S A; 4RTX A; 2B86 A; 3UA7 A; 1K9A A; 2YUQ A; 1HSQ A; 1JO8 A; 2LMJ A; 1I1J A; 2GBQ A; 4LE9 A; 2CT4 A; 2HBW A; 1V1C A; 1G83 A; 2K9G A; 3U23 A; 5FWB A; 2W10 A; 2CRE A; 1NM7 A; 2BZY A; 1M3C A; 2RQR A; 2DRK A; 2YSQ A; 4J9D A; 2EGE A; 5IXF A; 2JMC A; 2XMF A; 2ECZ A; 1PHT A; 2EYZ A; 2DL7 A; 2JW4 A; 4OMM A; 1JQQ A; 1Z9Q A; 1QCF A; 4OMO A; 1QKW A; 2J6K A; 1QKX A; 2RF0 A; 2L3Q A; 2F2W A; 1ZUY A; 1UDL A; 2CSI A; 2P4R A; 4QT7 A; 3R6N A; 2AK5 A; 1TUD A; 2PTK A; 3M0R A; 1E6H A; 1M8M A; 1WXU A; 1YWO A; 5IXB A; 3IQL A; 3TSZ A; 2EGA A; 1FYN A; 4RTU A; 3M0T A; 1UGV A; 1GCQ C; 2A28 A; 4HXJ A; 2VWF A; 3EG0 A; 2YUN A; 5ECA A; 4D8D A; 2J6F A; 2ENM A; 2RQU A; 2K2M A; 4J9B A; 1TG0 A; 2LCS A; 1T3S A; 1K0S A; 1UEC A; 2HSP A; 1ZX6 A; 4IIO A; 2RN8 A; 2F2V A; 1UG1 A; 3JV3 A; 2L3S A; 2CSQ A; 1RI9 A; 2KNB B; 2LJ0 A; 3RBB B; 2LQW A; 1U5S A; 2LJ1 A; 2OJ2 A; 2KE9 A; 3I5R A; 2LX7 A; 1U06 A; 2DBM A; 1MV3 A; 1AEY A; 3REB B; 4Z88 A; 1GRI A; 1OPL A; 3H0H A; 1AZG B; 2C0T A; 2O88 A; 4RTW A; 2EGC A; 3VS5 A; 2EVR A; 1GBR A; 2ED0 A; 2DMO A; 3EHR A; 5IH2 A; 3NPF A; 1GCQ A; 1U3O A; 1OV3 A; 4J9G A; 1NEB A; 3NMZ C; 4JJD A; 2BTT A; 2BZX A; 1CKB A; 2J7I A; 2HDA A; 2EYY A; 4F17 A; 1AOJ A; 1NLP C; 1WA7 A; 1UUE A; 2FG0 A; 2A36 A; 2YT6 A; 2KEA A; 2VVK A; 2G6F X; 4AFU C; 1UJY A; 2DE0 X; 4E6R A; 2L0A A; 4HVV A; 1HJD A; 4GLM A; 2AZS A; 1SRL A; 2K3B A; 1WYX A; 2FPF A; 2FPE A; 2ED1 A; 2EYX A; 1X6B A; 2H8H A; 4JJB A; 3TVT A; 3VS0 A; 2DL3 A; 2D1X A; 2OAW A; 2KR3 A; 1AWW A; 1WLP B; 4F16 A; 4RTV A; 1UHC A; 1T0H A; 2RNA A; 5FWC A; 2DA9 A; 2KYB A; 1I0C A; 2PNI A; 2DF6 A; 3KFV A; 2DJQ A; 1BBZ A; 1X27 A; 2A37 A; 1PRM C; 1GFD A; 1WIE A; 1JEG A; 2X3X D; 4CC2 A; 2KRO A; 4RTZ A; 1GCP A; 3EG2 A; 2RQV A; 3VS4 A; 4JJC A; 1G2B A; 2CUB A; 5IHK A; 4R0K A; 4AG2 C; 3QWX X; 3RNJ A; 1ARK A; 2LZ6 B; 1N5Z A; 1UFF A; 4J9I A; 3ZL7 C; 1YN8 A; 2W0Z A; 2DNU A; 1YCS B; 1VYU A; 2D8J A; 1BB9 A; 3H41 A; 1WFW A; 2JT4 A; 1SEM A; 4CC7 A; 2O2O A; 2EBP A; 3H0F A; 2EPD A; 1BU1 A; 2NUZ A; 2PZ1 A; 2YUO A; 2DM1 A; 2KBT A; 2YUP A; 2ROL A; 2MOX A; 2M51 A; 1BK2 A; 3NGP A; 2LJ3 A; 3C0C A; 1JU5 C; 3PE0 A; 2JM8 A; 2EKH A; 3I35 A; 2KRM A; 2CUD A; 1PKT A; 2JXB A; 4F14 A; 4WCI A; 4HVU A; 3I9Q A; 4OMP A; 3M0Q A; 1RUW A; 1IO6 A; 1OOT A; 1VYV A; 2CT3 A; 2MCN A; 1UHF A; 2D0N A; 1SSH A; 2DL5 A; 1PKS A; 4DEY A; 4AG1 C; 1KFZ A; 1QLY A; 2X3W D; 1X43 A; 1T3L A; 2AKL A; 2AKK A; 1M27 C; 1RLQ C; 2HCK A; 2MIO A; 2ESW A; 2KT1 A; 4LUE A; 4J9E A; 4KRT A; 1B3Q A; 2YDL A; 2O9S A; 3VS7 A; 1ZSG A; 2M0Y A; 2KRN A; 4A63 B; 2ABL A; 1KJW A; 2I0N A; 1ZUK A; 1E6G A; 4EIK A; 3H0I A; 2HEQ A; 2E5K A; 3O5Z A; 5L23 A; 2FEI A; 4IIM A; 2KYM A; 2JMA A; 3VS2 A; 2DRM A; 1Y0M A; 3PVQ A; 5HCK A; 2NWM A; 1QWE A; 3I5S A; 2F2X A; 2K6D A; 2KXD A; 4LNP A; 2DLP A; 4ZNX A; 1M3B A; 4RTT A; 1ZLM A; 1AWO A; 2RQW A; 4AFQ C; 1SHG A; 4JZ4 A; 1XOV A; 3EGU A; 1X6G A; 1AD5 A; 3GBQ A; 4CC3 A; 2GQI A; 4D8K A; 4RTY A; 2L2P A; 2BZ8 A; 1H8K A; 4JPB W; 4OMQ A; 2JS2 A; 1NG2 A; 1K1Z A; 1E7O A; 2C0I A; 1MV0 B; 3VS3 A; 2CH4 A; 5EC7 A; 4HVW A; 1MUZ A; 4LN2 A; 2IIM A; 1X2Q A; 1KSW A; 2GTO A; 4FSS A; 2FRY A; 2RQT A; 3EHQ A; 1SRM A; 1H3H A; 1UJ0 A; 1I07 A; 5I11 A; 4M4Z A; 2VKN A; 5FW9 A; 4OML A; 3VS6 A; 1UTI A; 3EG3 A; 2GGR A; 2O9V A; 2KT8 A; 2DVJ A; 3VS1 A; 1ZUU A; 1NLO C; 1W1F A; 2LQN A; 1K4U S; 2KXC A; 3FJ5 A; 2J05 A; 3VRZ A; 2EW3 A; 4J9H A; 1K76 A; 2V1R A; 1ZBJ A; 1YWP A; 3A98 A; 2J06 A; 2ROT A; 4K11 A; 3QWY A; 1ABQ A; 1W70 A; 3SEM A; 3VRY A; 1WDX A; 1J3T A; 1NYG A; 3REA B; 1GBQ A; 1JXO A; 3LH5 A; 5GJW B; 1K0X A; 1NYF A; 2KGT A; 1CSK A; 2JS0 A; 3UF4 A; 1S1N A; 2SEM A; 1M3A A; 2DBK A; 2A08 A; 1VYT A; 2CH4 W; 4Y92 A; 3TSW A; 1H92 A; 2RPN A; 1SHF A; 1WI7 A; 5IHI A; 2O31 A; 3PVL A; 1AWJ A; 2K7A A; 2LP5 A; 3CQT A; 4OMN A; 1PRL C; 3EG1 A; 2J6O A; 3UAT A; 1Y57 A; 2DYB A; 1WXT A; 1OPK A; 4AFZ C; 2DX1 A; 1WX6 A; 1NEG A; 2V1Q A; 5GJV B; 1A0N B; 4J9F A; 1AVZ C; 4JZ3 A; 4Z89 A; 3ULR B; 1FMK A; 2CDT A; 4Z8A A; 1AWX A; 1B07 A; 2JM9 A; 1VA7 A; 2EQI A; 3SHW A; 1WXB A; 4CC4 B; 1YP5 A; 1GFC A; 3THK A; 2FPD A; 2DL4 A; 2AZV A; 2EYW A; 2GTJ A; 4LUD A; 4ORZ A; 1X2K A; 2C0O A; 1TUC A; 4X1V A; 1YNZ A; 2K79 A; 1AZE A; 1T0J A; 1RLP C; 1OEB A; 1PWT A; 4GBQ A; 4RUG A; 2QDL A; 2SRC A; 1QWF A; 1GL5 A; 2RMO A; 3M0P A; 1LCK A; 1Z9Z A; 5IHN A; 1PNJ A; 2L3P A; 4ESR A; 2DL8 A; 1JXM A; 5I22 A; 4DEX A; 1UE9 A; 2GNC A; 3M0U A; 2D8H A; 4AFS C; 1KIK A; 1SPK A; 1M30 A; 1EFN A; 2FO0 A; 3UA6 A; 2JTE A; 2FRW A; 4HCK A; 2KRS A; 4J9C A; 1ABO A; 3NHN A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DD4 A; 2DIL A; 3M0S A; 4LDX A; 3NFC A; 4MML A; 2HAX A; 1JJ2 S; 4C5E A; 1OX8 A; 2L3R A; 5GMK j; 1QQJ A; 1I1J A; 4LE9 A; 3X20 B; 1KHI A; 2EFI A; 1G83 A; 3U23 A; 1M90 R; 5FWB A; 1M3C A; 2YSQ A; 3BDL A; 2EGE A; 3A8G B; 1YIT Q; 1M9S A; 1U1T A; 2XMF A; 1XNI A; 2ECZ A; 2CP6 A; 2R58 A; 2DL7 A; 3CCM Q; 4PLI A; 1LOJ A; 1WQ7 A; 1UEB A; 2J6K A; 5FU6 B; 4XTU A; 1QKX A; 3OQ5 A; 2L3Q A; 2F2W A; 2CZ0 B; 1ZUY A; 1H64 1; 5I2M A; 4QVD A; 3CCJ T; 2PTK A; 1VQ5 Q; 3RER A; 1VUB A; 5KYX B; 4M77 C; 1YWO A; 1D0Y A; 3QUI A; 2ZPI B; 2HNI A; 2EGA A; 1FYN A; 1BI3 A; 2RJF A; 3M0T A; 2R5A A; 4LD6 A; 2JUF A; 2VWF A; 4WTO B; 3T9N A; 4C8Q E; 3CBM A; 2ENM A; 3QDF A; 1TXQ A; 4LXC A; 3G6E A; 1ZQ1 A; 3HFN A; 5GAM h; 2DTH A; 1HXD A; 1TG0 A; 4M78 D; 2PUK B; 2LCS A; 1T3S A; 1K0S A; 4OGE A; 4BAC A; 1VQ4 A; 3CME A; 3OYL A; 1KQ2 A; 4ZTF A; 2ZPH B; 3RBB B; 3CPW P; 1WHG A; 3I5R A; 2DBM A; 4BDY A; 3REB B; 4JLG A; 2CGH A; 1WJS A; 2IVW A; 2XKO C; 1AZG B; 1FXX A; 2E1H A; 2EGC A; 1D0X A; 2VYT A; 1VQN Q; 3VJP A; 2RO0 A; 3EHR A; 2X35 A; 3A8L B; 5IH2 A; 1KQ1 A; 1YJW Q; 4II1 A; 4E7J A; 3CCL T; 1QVF A; 1NEB A; 3UPU A; 4JJN K; 2BZX A; 3OYJ A; 2HDA A; 4F17 A; 5DLO A; 2OTL T; 4HA8 A; 4PJO D; 1JBM A; 1ZHI A; 2HSE B; 5GAM f; 2PVD B; 1F1B B; 1HK9 A; 3GP8 A; 2HQX A; 2VVK A; 5DLQ E; 2DE0 X; 2L0A A; 4FU6 A; 1HJD A; 2AZS A; 1BI2 A; 3QYH B; 3CXC A; 3AT1 B; 3H6Z A; 1WYX A; 2FPF A; 2FPE A; 3NTH A; 3CEY A; 4HCZ A; 4AT1 B; 1AT1 B; 2DL3 A; 2OAW A; 4D6W A; 1VQL A; 1WLP B; 1BCO A; 1JRI A; 1T0H A; 5FWC A; 3MP6 A; 4J7I A; 4PJM A; 1I0C A; 5M9O A; 2DJQ A; 1BBZ A; 2Y90 A; 1PRM C; 2WSC E; 3OYY A; 1JEG A; 3H9N A; 3RMS A; 3FC3 A; 1GCP A; 3EG2 A; 2RQV A; 3VS4 A; 4JJC A; 4MDW A; 2G3R A; 1TH7 A; 5IHK A; 4R0K A; 4E2F B; 3QWX X; 1X01 A; 5D6W A; 3RNJ A; 1UFF A; 2KSS A; 2QGG A; 1YCS B; 4XK8 E; 2JT4 A; 4HCB A; 3DB3 A; 1BU1 A; 2NUZ A; 5CAI A; 1VQ6 T; 5AYF A; 2ROL A; 1VQK Q; 1BK2 A; 2LJ3 A; 2GFA A; 3LW5 E; 3I55 T; 5GAN g; 1YJN Q; 3OBW A; 3C4S A; 2OTJ T; 2QQR A; 3I35 A; 4M75 F; 1TTH B; 2VGN A; 2JXB A; 2FZC B; 2LX9 A; 2HBP A; 4F14 A; 4WCI A; 5IAY A; 4OMP A; 4E7H A; 4PNO A; 2D9T A; 2QTX A; 2JTF A; 4V2S A; 3CCV A; 5LJ3 h; 1I81 A; 2FZK B; 3MPU B; 2MCN A; 5D6Y A; 4DEY A; 1EX4 A; 1T3L A; 1QVG S; 2AKL A; 2OX7 A; 4FIB A; 2DYI A; 1Q7Y R; 2ESW A; 4JS5 A; 4LUE A; 4KRT A; 4PFO A; 5GMK h; 4M75 D; 3I56 T; 1W4S A; 1B3Q A; 2YDL A; 2E70 A; 1ZSG A; 2M0Y A; 3JCM f; 2ABL A; 2DEQ A; 2I0N A; 1QW1 A; 5GAN e; 3H0I A; 2ATC B; 2PVG B; 5GAO r; 5LJ5 g; 3OBY A; 2RJD A; 2DRM A; 3PVQ A; 5HCK A; 2NWM A; 5GAN d; 3I5S A; 3QSU A; 1M5Q 1; 2K6D A; 1GXI E; 3RIR A; 1Q86 U; 2QA4 Q; 4LNP A; 2DLP A; 2XU8 A; 1M8V A; 1M3B A; 1ZLM A; 3JCM b; 5KYY A; 9ATC B; 2EWN A; 2K5L A; 4ATO A; 1AWO A; 1B34 A; 2HD0 A; 3RKY A; 2FB7 A; 2JVV A; 4AFQ C; 3CCR Q; 3PIP A; 3P8H A; 1KQS P; 3CC4 Q; 4ZN1 A; 5KE3 A; 1Q86 C; 4X9D A; 2GQV A; 3CCE A; 1AD5 A; 2MAM A; 4KGZ B; 4BY6 B; 4JPB W; 1UB4 A; 2X51 A; 3QO3 A; 3EAE A; 1K73 R; 1QMC A; 3CC7 T; 2CH4 A; 4KUL A; 4HVW A; 1VIF A; 1X75 C; 1KSW A; 4IUQ A; 3FRN A; 4ZGJ B; 5FU7 C; 1I07 A; 5I11 A; 3JCM J; 2VKN A; 5LJ5 d; 1JJ2 A; 5CKF A; 2FZG B; 2P0K A; 2GF7 A; 3JRZ A; 1W1F A; 2O01 E; 4IUR A; 2KXC A; 3V8K A; 2J05 A; 3G71 A; 3VRZ A; 3LWH A; 1K76 A; 2HL3 A; 2J06 A; 3PMI A; 2ROT A; 1YI2 A; 1RAG B; 2COW A; 3QWY A; 4BI3 A; 4M7D F; 2ZGW A; 1RAF B; 3L1A A; 4ZGD B; 3V8L A; 2DET A; 5GJW B; 2E65 A; 1K0X A; 2DAQ A; 2PVO B; 2JS0 A; 1S1N A; 1YIJ A; 3PGG A; 1VQO Q; 2E6N A; 2CH4 W; 1ZA1 B; 1LJO A; 3PVL A; 1AWJ A; 2K7A A; 3CD6 A; 3CQT A; 3EG1 A; 4M7D D; 3HRU A; 1OPK A; 4FYX B; 4XTZ A; 3X28 B; 5GJV B; 3INZ A; 1YHQ T; 4Z89 A; 4M7A A; 3ULR B; 4Z8A A; 1YJ9 A; 1B07 A; 3M59 A; 4J83 A; 1OZ2 A; 5HK0 A; 2QEX A; 1BI0 A; 3F70 A; 5FU7 B; 5KYU A; 3CCU Q; 4F04 B; 1YP5 A; 4F7U A; 5CR2 A; 3A8H B; 4BI4 A; 8ATC B; 2JOY A; 2GTJ A; 1JB0 E; 4M78 E; 4LUD A; 4C5G A; 2QQA A; 3QJY A; 4XAX B; 1YNZ A; 3MJX A; 1K8A R; 2RI5 A; 2XHC A; 1N8R R; 2SRC A; 4OB1 B; 1K9M R; 1LCK A; 2DTO A; 2IG0 A; 2LQK A; 2DXC A; 2JTM A; 2L3P A; 3ME9 A; 4ESR A; 2RD1 A; 5I22 A; 1I4K 1; 4XTW A; 3CMA A; 1KK7 A; 2GNC A; 4NL3 A; 4OB0 B; 1SPK A; 2CZ7 B; 1M30 A; 2FRW A; 4JDS A; 2E41 A; 4HCK A; 2KRS A; 3QBY A; 3NHN A; 3RES A; 1CKA A; 5KYY B; 1B34 B; 1JO8 A; 4FCY A; 5FRM A; 4PJO E; 2F69 A; 2K9G A; 2NUT A; 2P84 A; 3CCS A; 1QCN A; 2CRE A; 2CS7 A; 2BZY A; 1IRX A; 4QVC A; 2DD5 A; 4PK4 A; 1O9S A; 4ZN3 A; 5GAN 2; 2JMC A; 1VQP A; 1N27 A; 4M78 A; 1IRE B; 2AIR B; 2YLB A; 1JQQ A; 2KQW A; 1Z9Q A; 2XD0 A; 2EQM A; 4OMO A; 2LC4 A; 3G7Z A; 4FYW B; 3CCQ T; 2M9U A; 1VQ8 T; 1UDL A; 5CVI A; 1OUL A; 3WVD B; 2RJE A; 1M8M A; 3LLR A; 1WXU A; 3IQL A; 3G6E Q; 3EG0 A; 4PJL A; 2ZAE A; 2LCL A; 3G1J A; 3CC2 A; 4DOV A; 5CKH A; 3G4S A; 4ANJ A; 4C0Z A; 1RAA B; 4PJO A; 1UEC A; 1VQ4 Q; 2HQH A; 3FIF A; 4C5I A; 3CME Q; 2F2V A; 3JV3 A; 1IZ6 A; 3UWN A; 1RI9 A; 4FM4 B; 2M1H A; 2LJ0 A; 3VKI A; 2FVU A; 1IGQ A; 1U06 A; 4O6J A; 1AEY A; 4C0F A; 4OB2 B; 3H0H A; 2L89 A; 4E7S A; 4RTW A; 2O88 A; 2RK2 A; 4M7A B; 4OB3 B; 3VS5 A; 1O75 A; 2D6F A; 4M77 A; 1S72 A; 4M78 C; 3URG A; 5KYU B; 5GAM g; 4F7U B; 5KCH A; 3DLM A; 5CKD A; 3NMZ C; 1MMA A; 2RB6 A; 3LGF A; 4LDV A; 2GCX A; 1W2B P; 1QVG A; 2EYY A; 2H3J A; 3EH1 A; 2FYK A; 4VUB A; 3EGD A; 2YT6 A; 3OS2 A; 4M75 E; 1PSE A; 3GNG A; 4DA4 A; 2XIC A; 2DFU A; 2A3L A; 1VQL Q; 1KD1 R; 3OW2 S; 1VQM A; 2H8H A; 3TVT A; 3OSV A; 1FMV A; 2D1X A; 1B7T A; 4OP0 A; 1Q82 R; 4F16 A; 1UHC A; 2RNA A; 1YIT T; 4PJO C; 1FX7 A; 3FLG A; 4E7I A; 3CCM T; 1UGQ B; 3EFO A; 2KRO A; 3MP8 A; 4CRI A; 4DBF A; 1ZSZ C; 2HQE A; 3SWN C; 1VQ9 A; 2NUT B; 2P0Q A; 5GAM d; 4AG2 C; 1Q81 R; 4XQ3 A; 2MPX C; 4QQ6 A; 1ARK A; 1N5Z A; 1VQ5 T; 1YN8 A; 2W0Z A; 3SB2 A; 3RDV A; 1VYU A; 4RG2 A; 3BE3 A; 2DXT A; 3H41 A; 3M58 A; 4C92 A; 3M4Y A; 2E64 A; 4X9C A; 2EPD A; 3JB9 I; 4XU3 A; 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