The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MDQPCCRGLYDFEPENQGELGFKEGDIITLTNQIDENWYEGMIHGESGFFPINYVEVIVP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SH3-containing GRB2-like protein 3
|
| publication title |
Structural Basis for the Binding Specificities of Huntingtin Proline-Rich Region with SH3 and WW Domains
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
10
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J9F A; 1NYF A; 2EGC A; 4E6R A; 2EYW A; 3GBQ A; 1QKW A; 3LH5 A; 2RQW A; 2PNI A; 1K1Z A; 1OPL A; 1RLQ C; 2VWF A; 5IHK A; 1H92 A; 1X69 A; 2KYB A; 4D8K A; 2YDL A; 1SEM A; 2ROL A; 3H0F A; 2B86 A; 4RTU A; 2KE9 A; 1OOT A; 2X3X D; 2LJ0 A; 2EQI A; 2DE0 X; 5HCK A; 1X6G A; 2D8H A; 1Z9Z A; 1BB9 A; 3NPF A; 4OMM A; 3TVT A; 1AEY A; 2FPF A; 2GNC A; 4LE9 A; 3REB B; 2ED1 A; 2D8J A; 1ZUK A; 4J9D A; 5EC7 A; 2MCN A; 3VS6 A; 1W70 A; 2CT3 A; 2DL4 A; 1SRL A; 4JJB A; 1LCK A; 2W10 A; 1AWX A; 2FO0 A; 1UHF A; 3UA6 A; 2ESW A; 2V1R A; 1PWT A; 3M0R A; 4A63 B; 4IIO A; 1Y0M A; 1OEB A; 2FRY A; 2M51 A; 3VS2 A; 2K9G A; 1WLP B; 3R6N A; 2AK5 A; 1FMK A; 1WXU A; 4JZ4 A; 4R0K A; 4RUG A; 2DRK A; 2YUP A; 3EG0 A; 1GCQ A; 2J7I A; 1X2K A; 2HSP A; 4ZNX A; 2KGT A; 1BBZ A; 3VS1 A; 3M0P A; 2JTE A; 2DJQ A; 1T0H A; 3M0T A; 4RTV A; 4CC3 A; 3ZL7 C; 1K9A A; 2FG0 A; 2KNB B; 2NWM A; 2J6O A; 1ZUY A; 4AG2 C; 1MV0 B; 1QWE A; 3FJ5 A; 2A37 A; 4J9C A; 4F17 A; 1G2B A; 2K7A A; 2FPE A; 4DEY A; 1ZUU A; 2RQU A; 3H0I A; 2C0T A; 1X43 A; 2GQI A; 4OMQ A; 3I5R A; 2C0O A; 2KRM A; 1G83 A; 1WI7 A; 4AFQ C; 1NYG A; 2BTT A; 2LJ3 A; 2W0Z A; 2FPD A; 2SEM A; 1E7O A; 1YN8 A; 2KT8 A; 2K6D A; 2EGA A; 2M0Y A; 2V1Q A; 2L3Q A; 4DEX A; 1SRM A; 2QDL A; 2BZY A; 2H8H A; 2OI3 A; 1AWW A; 2X3W D; 1NG2 A; 4RTX A; 2EBP A; 5I22 A; 4J9I A; 1FYN A; 1RUW A; 2LQW A; 1JQQ A; 1ZX6 A; 4CC2 A; 2K79 A; 1H8K A; 2L2P A; 1ABO A; 2DRM A; 2ENM A; 2BZX A; 2DVJ A; 1E6G A; 4KRT A; 2IIM A; 1X2Q A; 2DM1 A; 1UFF A; 2LQN A; 3H0H A; 4EIK A; 5IH2 A; 3RBB B; 2A08 A; 1GRI A; 1N5Z A; 2DL3 A; 1M30 A; 1Z9Q A; 2FEI A; 1HD3 A; 2JS2 A; 2KRN A; 1PKS A; 2FRW A; 2D0N A; 2KT1 A; 3IQL A; 5FWC A; 2XMF A; 2RQT A; 4IIM A; 1GFD A; 1Y57 A; 4Y92 A; 4LUD A; 2E5K A; 2L0A A; 3UF4 A; 3U23 A; 3EHQ A; 1GCQ C; 2K2M A; 2DA9 A; 5GJV B; 2EKH A; 2O88 A; 1CKA A; 4HVW A; 1M8M A; 4K11 A; 1MV3 A; 1YCS B; 2NUZ A; 1WA7 A; 2CH4 A; 2OJ2 A; 1SPK A; 1UG1 A; 2G6F X; 1WXB A; 1GCP A; 5FW9 A; 2YUO A; 3VRY A; 4D8D A; 1U5S A; 1UDL A; 1W1F A; 1X27 A; 2DIL A; 5IHN A; 2AZV A; 3ULR B; 1KIK A; 1K0X A; 2DL5 A; 1GL5 A; 1KJW A; 2SRC A; 1WXT A; 2JM8 A; 3VS5 A; 2I0N A; 2PZ1 A; 4RTZ A; 2RF0 A; 4ORZ A; 3EG1 A; 1U3O A; 2L3P A; 2F2W A; 4JPB W; 3I9Q A; 1JXO A; 1I1J A; 1AD5 A; 3EGU A; 1TG0 A; 1AVZ C; 5IXB A; 1ZBJ A; 2ROT A; 4J9H A; 2KRS A; 1E6H A; 2O31 A; 3PE0 A; 2LJ1 A; 1ABQ A; 1YNZ A; 1VYU A; 2RQR A; 2LP5 A; 4F14 A; 1HSQ A; 1JEG A; 2EW3 A; 1YP5 A; 1K4U S; 1RLP C; 4JJD A; 2AZS A; 3M0S A; 4Z88 A; 4LUE A; 2RPN A; 4HVU A; 2JM9 A; 1H3H A; 2VKN A; 4AFU C; 2CUB A; 1WIE A; 2EPD A; 3PVL A; 2CUD A; 1PRM C; 2GTJ A; 1GBR A; 4OMO A; 2L3S A; 2JMC A; 5FWB A; 2CSI A; 1B07 A; 1M3B A; 4HXJ A; 2LCS A; 1SSH A; 3PVQ A; 1B3Q A; 5GJW B; 1ARK A; 3EG2 A; 2O2O A; 2JW4 A; 2LNH B; 1WFW A; 2MOX A; 3KFV A; 1EFN A; 3VS0 A; 4AFZ C; 4JJC A; 1PHT A; 1S1N A; 5ECA A; 2EYY A; 4RTY A; 1M3C A; 1W6X A; 1I0C A; 4RTW A; 5L23 A; 1ZSG A; 1CKB A; 2RN8 A; 3UAT A; 2F2X A; 1XOV A; 2BZ8 A; 1ZLM A; 2EGE A; 2AKL A; 1VA7 A; 2CH4 W; 2P4R A; 1M3A A; 4QT7 A; 2RQV A; 4OML A; 4X1V A; 2K3B A; 2DNU A; 2EVR A; 4ESR A; 2GGR A; 1JO8 A; 2ABL A; 2EYZ A; 3CQT A; 4LN2 A; 2F2V A; 3QWX X; 2ECZ A; 2C0I A; 2KBT A; 3REA B; 3RNJ A; 4Z89 A; 1SHF A; 1VYV A; 3C0C A; 2CRE A; 2PTK A; 3TSW A; 1AOJ A; 1KSW A; 3SHW A; 2KXD A; 2JT4 A; 2YUQ A; 3M0Q A; 1WDX A; 1K76 A; 1UGV A; 2EYX A; 2J6F A; 2CT4 A; 1YWP A; 1NEG A; 4OMP A; 1BU1 A; 1NEB A; 1YWO A; 2DBM A; 1JXM A; 1QCF A; 2DLP A; 2DYB A; 2JS0 A; 4F16 A; 2J6K A; 2DX1 A; 4RTT A; 1RI9 A; 1BK2 A; 5IHI A; 3EG3 A; 1PKT A; 2DL7 A; 2J05 A; 4M4Z A; 3THK A; 1GBQ A; 4J9G A; 4LNP A; 2A36 A; 3H41 A; 3VRZ A; 2ED0 A; 4FSS A; 1U06 A; 2GTO A; 2LMJ A; 4OMN A; 1UUE A; 2LZ6 B; 1NLP C; 2DMO A; 4JZ3 A; 1OPK A; 1M27 C; 3JV3 A; 2JXB A; 2HCK A; 4Z8A A; 1UJY A; 2J06 A; 3QWY A; 3SEM A; 1T0J A; 1QLY A; 1UEC A; 1A0N B; 2DF6 A; 2KEA A; 1TUD A; 4WCI A; 1I07 A; 2D1X A; 1TUC A; 2HBW A; 2YT6 A; 1IO6 A; 1UHC A; 2KYM A; 1UTI A; 4J9B A; 3NGP A; 3TSZ A; 1CSK A; 1OV3 A; 1T3L A; 3M0U A; 1UJ0 A; 1QKX A; 2YSQ A; 5I11 A; 1UE9 A; 3O5Z A; 1NLO C; 3NHN A; 3I5S A; 2JMA A; 4AG1 C; 1AZG B; 2HEQ A; 1JU5 C; 3VS7 A; 2CSQ A; 4CC4 B; 2CDT A; 4AFS C; 1VYT A; 2MIO A; 2KR3 A; 3I35 A; 1V1C A; 2KRO A; 1AWO A; 1AZE A; 2O9S A; 4CC7 A; 5IXF A; 4HCK A; 2LX7 A; 2VVK A; 2GBQ A; 2KXC A; 2OAW A; 1QWF A; 1GFC A; 1SHG A; 2RNA A; 4GBQ A; 2DBK A; 2O9V A; 1J3T A; 4GLM A; 2DL8 A; 1X6B A; 1T3S A; 4HVV A; 1WX6 A; 1MUZ A; 1NM7 A; 3A98 A; 3EHR A; 4J9E A; 2AKK A; 2RMO A; 1WYX A; 3VS4 A; 1AWJ A; 3VS3 A; 2HDA A; 2YUN A; 3NMZ C; 3UA7 A; 1K0S A; 2A28 A; 1PRL C; 1HJD A; 1PNJ A; 1KFZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4J9F A; 4A54 A; 2EYQ A; 4ZTF A; 4E6R A; 2RO0 A; 4BDZ A; 1YI2 Q; 1K1Z A; 3WVD B; 1KD1 U; 3EFO A; 2COY A; 2D0Q B; 3QJY A; 3URG A; 1H92 A; 1G3T A; 1X69 A; 2KYB A; 4M7D F; 4FL6 A; 5GMK e; 2YDL A; 4J6W A; 3I55 T; 1PSE A; 2ROL A; 3H0F A; 4RTU A; 1IRE B; 4BI8 B; 1BIB A; 4QQG A; 1ZSZ B; 2DE0 X; 5HCK A; 3VV0 A; 1D3B A; 3CME A; 3N5B B; 4XTY A; 2JVV A; 1YJ9 T; 3CCL T; 4MDX A; 2GNC A; 4KUD K; 1K73 C; 2RJE A; 4RMO A; 1VQ5 A; 4J9D A; 3VS6 A; 2AIR B; 2ZPI B; 2CT3 A; 5KYX A; 2E4H A; 3JCM c; 3JCM b; 3PIP A; 1LCK A; 2W10 A; 1VQ5 Q; 2FO0 A; 2V1R A; 4J7I A; 1YHQ T; 4A63 B; 2ZPB B; 3LW5 E; 3GOX A; 2K5L A; 2RI5 A; 2V8J A; 3VS2 A; 1I8F A; 2D6F A; 1XJW B; 1VQK Q; 1FMK A; 1MMG A; 2DRK A; 2L8D A; 5IN1 A; 4LD9 K; 1GCQ A; 2J7I A; 3V8J A; 3QKJ A; 4KGX B; 3VS1 A; 2DJQ A; 1T0H A; 4RTV A; 3ZL7 C; 2OTL A; 2FG0 A; 2JN0 A; 3VUZ A; 4M7A C; 4BD3 A; 3HHT B; 1RAB B; 2OTL Q; 1MV0 B; 3EG9 A; 1VIE A; 4J9C A; 1IGQ A; 4MML A; 2K7A A; 3CCQ A; 3S3M A; 2PVO B; 1RL2 A; 4DEY A; 1X43 A; 3MEV A; 2KRM A; 3CCQ Q; 1G83 A; 1NYG A; 1RAF B; 2QA4 T; 4E2F B; 2CZ1 B; 2K3X A; 5CO7 A; 1E7O A; 3JAM E; 2JUF A; 3KUF A; 2RJD A; 4C8Q C; 2L5Q A; 5CVI A; 1SRM A; 2H8H A; 4M75 G; 2DD4 A; 2MI6 A; 2PUO B; 4C0F A; 1C6V X; 2BUD A; 4MZT A; 1JQQ A; 1VUB A; 4CC2 A; 2QK0 A; 2GFU A; 3QII A; 5GAM j; 2DRM A; 2ENM A; 1VQ8 A; 1FMW A; 4KRT A; 2OTJ A; 3SFM A; 2DPP B; 1X2Q A; 4C92 C; 5IH2 A; 3RBB B; 1VQ8 Q; 2OTJ Q; 1N5Z A; 3WXM B; 3P8B B; 1M1K C; 2XIC A; 2FZK B; 1TUG B; 5GAN 4; 1MMN A; 2FRW A; 4JRP A; 4M78 E; 2KVQ G; 1Y57 A; 4E7L A; 3OS2 A; 3G4S A; 2RB6 A; 4LUD A; 4X9D A; 2E5K A; 1BI2 A; 3A1P A; 3GIB A; 4PL6 A; 2K2M A; 1Q81 U; 5GJV B; 2FZG B; 1M8M A; 3DLM A; 1WA7 A; 1SPK A; 3ZEH A; 1UG1 A; 1FMV A; 1GCP A; 5FW9 A; 2YUO A; 4P5N A; 2MAM A; 2EQM A; 1QVP A; 4M7A F; 3LGF A; 2AZV A; 3ULR B; 2CP6 A; 1K0X A; 1WXT A; 2JM8 A; 2MMP A; 2A0F B; 3VS5 A; 4DBH A; 3X24 B; 3CCE T; 4ORZ A; 4C5H A; 2X4Y A; 3H8Z A; 2F2W A; 4M78 G; 2QTV A; 2ZPG B; 1I1J A; 2PU9 B; 1AVZ C; 2M9U A; 3ZBD A; 4OMF B; 1WNL A; 2RHX A; 4M77 A; 3GP8 A; 2CGH A; 2KRS A; 3S6W A; 3OS0 A; 4C8Q F; 3PE0 A; 2LJ1 A; 1D1B A; 3MP8 A; 4QQD A; 4BI4 A; 4PLL A; 1K4U S; 1RLP C; 4JJD A; 1I5L A; 4M75 C; 4LDX A; 1N8R C; 3CPW S; 1WIE A; 1VQL Q; 1PRM C; 2HNI A; 4PFO A; 3EGX B; 4OMO A; 3TEE A; 1YJN T; 2V8K A; 4N4I A; 2HMA A; 1TWB A; 2O2O A; 1YIJ Q; 1SKU B; 2MOX A; 4QVC A; 1EFN A; 1D0Y A; 5LJ3 d; 4HCZ A; 5GAN 7; 1PHT A; 1KHI A; 2FHD A; 2EYY A; 3CCR A; 3OYY A; 1G8X A; 4RTW A; 1YFN A; 2MK5 A; 2ZPE B; 3UAT A; 1X75 C; 2E65 A; 1XOV A; 2BZ8 A; 2DYI A; 1ZQ1 A; 2EGE A; 3CME T; 5GMK m; 3L2Q A; 3DLL A; 1QCN A; 4EMG A; 2RQV A; 3S3N A; 3JCM f; 2XDP A; 1VQ5 T; 2ATC B; 1Q82 C; 5LJ3 g; 2NUP A; 2K57 A; 2QQS A; 3CC2 T; 1KK7 A; 3FJP A; 3E2U A; 4LN2 A; 4PJO B; 2ZGW A; 1WZO A; 3CXC A; 4IKF A; 5A0D A; 1W2B S; 4JDS A; 5KE2 A; 1BCM A; 6AT1 B; 2P84 A; 1R0C B; 3OYM A; 1PCX A; 4BAC A; 2XU8 A; 2PTK A; 2LT1 A; 2JT4 A; 1O9S A; 1YJW T; 4FYY B; 3M0Q A; 1MNE A; 4RKU E; 3L2U A; 4OMP A; 2YLC A; 2BE9 B; 1BU1 A; 2VAS A; 3KBG A; 2DBM A; 3JCM e; 3HL8 A; 2OTL T; 3CXC P; 4FIB A; 1OQK A; 1BK2 A; 1G3Y A; 4OB0 B; 2LRQ A; 4M75 F; 3THK A; 4J9G A; 1M90 R; 2LT4 A; 3CCQ T; 4FSS A; 1U06 A; 4PFP A; 3M58 A; 1VQN Q; 4OMN A; 3EGD A; 5A0G A; 1Q7Y R; 1NLP C; 3L2Z A; 5GAN 8; 4M7D E; 2DMO A; 4JZ3 A; 4DOW A; 2HCK A; 4XU3 A; 3HFO A; 4Z8A A; 1I4K 1; 1KQ2 A; 3SEM A; 2LC4 A; 4RCB A; 5KCO A; 5LJ3 h; 1A0N B; 4IUV A; 1O75 A; 3OSV A; 3UWN A; 2RK1 A; 1TUC A; 2YT6 A; 3I55 Q; 2PVG B; 2KAF A; 1C0M A; 2E64 A; 2PQW A; 4C92 B; 1K73 U; 5CKH A; 2OTJ T; 4M78 A; 2RA2 A; 2M0O A; 3JB9 J; 5A2Q E; 1YJ9 Q; 5KYU B; 3PFS A; 2JMA A; 2LTO A; 4AG1 C; 4LDY A; 1M4Z A; 3E9G A; 4WF2 A; 3G4S T; 3BFM A; 2K5F A; 1VYT A; 3LWH A; 1YHQ Q; 2LCC A; 2KR3 A; 2X35 A; 1WGS A; 3L1A A; 4JLG A; 2KRO A; 3C12 A; 1WJQ A; 2IG0 A; 3JB9 H; 4HCK A; 1UGS B; 1QWF A; 2LQK A; 1GFC A; 4RCC A; 4GBQ A; 2O9V A; 1ZHI A; 3MPU B; 1J3T A; 4GLM A; 3MP1 A; 1X6B A; 2MPX C; 1MUZ A; 3A98 A; 4XTX A; 4HCC A; 2A7Y A; 2AKK A; 1WYX A; 1AWJ A; 1U1T A; 2DK3 A; 4YTL A; 2OX7 A; 3UA7 A; 3OYD A; 1VQ6 A; 3KXT A; 3CCJ A; 2EAY A; 4J83 A; 2DEQ A; 1XTD A; 2QA4 A; 1OZ2 A; 3V7S A; 4PJO D; 1KD1 R; 1QQJ A; 3GBQ A; 2PNI A; 2QA4 Q; 3CCS A; 3CCV A; 3E19 A; 5FU6 B; 3OYH A; 1OOT A; 5I2M A; 4DA4 A; 2LJ0 A; 3CCS Q; 2D8H A; 3FEO A; 4J7F A; 2JTF A; 3NPF A; 4FT4 A; 3BDU A; 4MZP A; 4OMM A; 3CCV Q; 2X51 A; 4LE9 A; 3PT9 A; 1BI1 A; 1ZUK A; 2VV5 A; 5EC7 A; 2DAQ A; 1TTH B; 1M1K U; 1UHF A; 2YHT A; 2VC8 A; 3QXE B; 1PWT A; 3A8O B; 2Y4Y A; 3M0R A; 1Y0M A; 1OEB A; 1IGU A; 2M51 A; 3E1S A; 3CCR T; 2YXY A; 3L2V A; 1RAA B; 4PLI A; 5HKC A; 4N4H A; 2CYZ B; 4JZ4 A; 4R0K A; 2YUP A; 3RMS A; 2R5A A; 3SWN B; 2QTX A; 4M7A E; 2HD0 A; 1WHM A; 1Y07 A; 2IVW A; 4LDW A; 1X2K A; 1MHN A; 2HSP A; 4ZNX A; 2KGT A; 2JTE A; 1N27 A; 3M0T A; 4ME7 A; 1M9S A; 1K9A A; 3UT1 A; 2X4W A; 4OP0 A; 1D09 B; 1ZUY A; 2F69 A; 1KC8 C; 1QW1 A; 1W4S A; 1SG5 A; 2MWP A; 1G2B A; 4B6M A; 5GAO m; 2FPE A; 3H0I A; 2RQU A; 3G1J A; 2XD0 A; 2DIG A; 5A0L A; 3HTR A; 4C8Q E; 5KYW A; 3CCE Q; 2DZ9 A; 1WI7 A; 1K8A C; 4AFQ C; 2FPD A; 1RAG B; 2D9T A; 3JCM Q; 1NZ9 A; 5KYY A; 2EGA A; 2M0Y A; 2V1Q A; 4EMK A; 1G3S A; 4M7A G; 2QQA A; 4DEX A; 3P8D A; 3ZFJ A; 1X01 A; 2X3W D; 4RTX A; 4LXC A; 2RJC A; 2MWO A; 4M77 D; 1OX9 A; 1OUL A; 1RUW A; 3E9F A; 2KMT A; 3JB9 I; 4M7D A; 4EDU A; 2L2P A; 1ABO A; 1N8R U; 1BCO A; 1M8V A; 1FX7 A; 2DVJ A; 1S72 A; 2IIM A; 3JB9 D; 2DM1 A; 1UFF A; 4A4E A; 4EIK A; 4BUG A; 1LVK A; 2DJZ A; 1WHJ A; 2V8I A; 1M30 A; 4C8Q G; 3RER A; 1FXX A; 1IHV A; 1Z9Q A; 2FEI A; 3M55 A; 2M1H A; 1YJN Q; 1K9M C; 1PKS A; 1N9S A; 1AT1 B; 4KH0 B; 2D0N A; 2KT1 A; 3IQL A; 4C0D C; 2AT1 B; 3GLX A; 4Y92 A; 2DTI A; 3WVE B; 1Q81 R; 3QPH A; 2L0A A; 3U23 A; 3EHQ A; 1GCQ C; 4R56 A; 2EKH A; 2O88 A; 4C92 G; 4K11 A; 1Q86 C; 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