The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
MDQPCCRGLYDFEPENQGELGFKEGDIITLTNQIDENWYEGMIHGESGFFPINYVEVIVP
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural Basis for the Binding Specificities of Huntingtin Proline-Rich Region with SH3 and WW Domains
rcsb |
| molecule keywords |
SH3-containing GRB2-like protein 3
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
10
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| structure length |
60
|
| sequence length |
60
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-11-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CRE A; 2O88 A; 2LCS A; 1PRM C; 1WA7 A; 1HD3 A; 4J9E A; 5IHN A; 2AZV A; 3I5S A; 2KRM A; 3SEM A; 5HCK A; 2O2O A; 1V1C A; 3ULR B; 2YUO A; 2ECZ A; 2YT6 A; 1U3O A; 2HBW A; 1GFD A; 1G83 A; 2KT8 A; 3QWY A; 1RUW A; 1KJW A; 2I0N A; 2ENM A; 1I07 A; 1UEC A; 4J9C A; 3EG0 A; 2CSI A; 1H3H A; 1E7O A; 4J9G A; 2KRN A; 4KRT A; 4EIK A; 3PE0 A; 4R0K A; 1UHF A; 1BK2 A; 4J9I A; 2BZX A; 2YUQ A; 3M0R A; 2BZ8 A; 5IH2 A; 1PWT A; 2VWF A; 1BBZ A; 1AOJ A; 3PVL A; 4RUG A; 2ED1 A; 3UF4 A; 1QCF A; 1VYT A; 2JM8 A; 2M51 A; 1AWW A; 4AFU C; 1B3Q A; 3I9Q A; 1GBQ A; 1UHC A; 2K2M A; 2LQN A; 1K9A A; 4GBQ A; 4RTZ A; 1OV3 A; 1UE9 A; 3R6N A; 2DL4 A; 2GTO A; 2FPD A; 2VKN A; 1N5Z A; 2V1Q A; 2J05 A; 1OPL A; 3M0Q A; 2JT4 A; 3VS7 A; 4AG2 C; 5L23 A; 1T3L A; 2YSQ A; 2FPF A; 1FMK A; 3H0I A; 1PKS A; 2L3Q A; 1HJD A; 1M27 C; 4GLM A; 2O9V A; 1ABQ A; 4J9F A; 2L2P A; 1SRL A; 1CSK A; 1G2B A; 4ORZ A; 2FRW A; 1YN8 A; 2XMF A; 2E5K A; 2EKH A; 1M3B A; 2DL7 A; 2CUD A; 1ZUU A; 1J3T A; 2CUB A; 1MV3 A; 2NWM A; 1AZE A; 4JJD A; 2ROT A; 3GBQ A; 3RBB B; 2K3B A; 2KT1 A; 2JMC A; 1GCQ A; 2SEM A; 1UUE A; 1Y0M A; 2FPE A; 2LJ3 A; 1WI7 A; 2KRS A; 2YDL A; 1S1N A; 2HSP A; 2BZY A; 2KXC A; 1AWX A; 1GCQ C; 1FYN A; 4AFZ C; 1BU1 A; 2GGR A; 3KFV A; 1GRI A; 3EG3 A; 1E6G A; 4Z88 A; 1UTI A; 2O31 A; 4LN2 A; 2RQU A; 2SRC A; 2LMJ A; 4RTX A; 4RTW A; 1OOT A; 2CDT A; 1X2K A; 2DYB A; 2GNC A; 2HEQ A; 2DL5 A; 1YP5 A; 1Z9Z A; 4RTV A; 3I35 A; 2RF0 A; 1GFC A; 1JQQ A; 1M3C A; 2DBM A; 4JJC A; 1Z9Q A; 2D8J A; 1WLP B; 1UFF A; 3REB B; 4OMO A; 1JU5 C; 2JS0 A; 1H92 A; 1VYU A; 1X27 A; 2L0A A; 2ED0 A; 2EGA A; 1B07 A; 2EW3 A; 4Z89 A; 4OMQ A; 4JZ3 A; 4HCK A; 1UJY A; 1QWE A; 2CH4 W; 2MCN A; 1NM7 A; 1JXM A; 4IIM A; 4CC7 A; 3VS0 A; 3EHR A; 2J6K A; 3U23 A; 2W10 A; 4RTU A; 1ZUY A; 3UA6 A; 3C0C A; 1BB9 A; 1MV0 B; 4JPB W; 3ZL7 C; 3M0S A; 4AG1 C; 1PRL C; 2DRM A; 2EGC A; 2QDL A; 5GJV B; 2EYY A; 2OI3 A; 2O9S A; 3TSZ A; 1TUC A; 2A08 A; 2V1R A; 3REA B; 3UAT A; 2DE0 X; 2DBK A; 1SPK A; 1Y57 A; 1ZX6 A; 2DM1 A; 2EYX A; 1JXO A; 1ZBJ A; 5I11 A; 2ESW A; 2FRY A; 2EYW A; 2RN8 A; 3VRZ A; 2VVK A; 2GTJ A; 4LE9 A; 3VS2 A; 1PNJ A; 1T0J A; 2AKK A; 4QT7 A; 2CSQ A; 1M8M A; 4JJB A; 2PTK A; 5FW9 A; 1MUZ A; 2EBP A; 4OMN A; 3LH5 A; 2PZ1 A; 2OAW A; 3VS6 A; 1KFZ A; 2KNB B; 1NYF A; 1CKB A; 2KE9 A; 1UDL A; 2KEA A; 1UJ0 A; 2RQV A; 1AD5 A; 1NLP C; 1NLO C; 3M0P A; 1GCP A; 5EC7 A; 1PKT A; 3EG2 A; 1H8K A; 2RQT A; 4Z8A A; 2L3S A; 2C0O A; 1ZSG A; 1M30 A; 2EVR A; 1A0N B; 2G6F X; 2K79 A; 1SSH A; 2DL8 A; 1T0H A; 1TG0 A; 1YCS B; 3TSW A; 1RLP C; 1EFN A; 2C0I A; 1QKW A; 4DEX A; 1W6X A; 1WDX A; 1AEY A; 1YWO A; 1W70 A; 2GQI A; 2LP5 A; 2JXB A; 3H0H A; 3VS3 A; 1KIK A; 2EPD A; 1T3S A; 2YUP A; 3A98 A; 1K0X A; 1IO6 A; 2DRK A; 2FO0 A; 2LNH B; 3O5Z A; 4X1V A; 3NMZ C; 2K7A A; 1JO8 A; 2LJ0 A; 3QWX X; 4AFS C; 1W1F A; 1K0S A; 2AKL A; 3NPF A; 2D0N A; 1U5S A; 4HXJ A; 1RLQ C; 4J9B A; 4LUE A; 2RQW A; 1NEG A; 1RI9 A; 2AZS A; 4Y92 A; 1VYV A; 1X6G A; 3FJ5 A; 2DLP A; 4J9D A; 2JMA A; 2JS2 A; 2FEI A; 1NEB A; 4F16 A; 1OEB A; 2F2V A; 3I5R A; 1AZG B; 1ZUK A; 4IIO A; 2LZ6 B; 1ZLM A; 2LQW A; 1ARK A; 2KXD A; 4HVV A; 2B86 A; 3VS1 A; 1K1Z A; 3H0F A; 1GBR A; 4CC4 B; 3CQT A; 1QWF A; 1WIE A; 2CT3 A; 3UA7 A; 2L3P A; 1SEM A; 4K11 A; 2M0Y A; 1YNZ A; 2D8H A; 2KRO A; 2FG0 A; 1JEG A; 4RTT A; 1WXB A; 4OMM A; 1YWP A; 2LJ1 A; 4E6R A; 4ZNX A; 2DIL A; 1I1J A; 1PHT A; 1HSQ A; 1SHF A; 2H8H A; 5IHI A; 1E6H A; 1OPK A; 1UG1 A; 2BTT A; 2CH4 A; 4A63 B; 4F17 A; 2DNU A; 2X3X D; 1AWO A; 2AK5 A; 2JW4 A; 1QKX A; 3VS4 A; 2NUZ A; 2P4R A; 4JZ4 A; 3IQL A; 1GL5 A; 3NHN A; 2A37 A; 1K76 A; 2D1X A; 2GBQ A; 2JM9 A; 3VRY A; 2ROL A; 2ABL A; 2KYM A; 2RNA A; 4ESR A; 5IXB A; 2A36 A; 1X69 A; 5GJW B; 1AWJ A; 4D8K A; 3EHQ A; 3EG1 A; 4WCI A; 2KYB A; 1CKA A; 3PVQ A; 3JV3 A; 2YUN A; 2HDA A; 2HCK A; 2K9G A; 2X3W D; 2MOX A; 1X43 A; 4HVU A; 1U06 A; 4OMP A; 3THK A; 4FSS A; 5FWB A; 2RPN A; 1WYX A; 3TVT A; 1XOV A; 1WXT A; 1NG2 A; 2PNI A; 2W0Z A; 4HVW A; 4AFQ C; 2A28 A; 1SHG A; 3EGU A; 4D8D A; 2DL3 A; 2DX1 A; 4CC2 A; 4F14 A; 3RNJ A; 2RQR A; 1QLY A; 2EQI A; 2F2X A; 1TUD A; 2EGE A; 1X6B A; 1LCK A; 4J9H A; 2DMO A; 4DEY A; 5ECA A; 2DJQ A; 2DVJ A; 4LUD A; 3VS5 A; 1M3A A; 1K4U S; 5FWC A; 2KR3 A; 1ABO A; 3SHW A; 2K6D A; 2RMO A; 4RTY A; 5I22 A; 1NYG A; 1X2Q A; 2MIO A; 3H41 A; 1SRM A; 2C0T A; 1WXU A; 3M0T A; 2KGT A; 1WFW A; 1VA7 A; 2OJ2 A; 2DF6 A; 3NGP A; 2J6F A; 4LNP A; 4CC3 A; 1UGV A; 4OML A; 2JTE A; 2J06 A; 1KSW A; 4M4Z A; 1AVZ C; 2DA9 A; 2F2W A; 5IHK A; 2IIM A; 2EYZ A; 2J6O A; 1I0C A; 3M0U A; 1WX6 A; 2J7I A; 2KBT A; 5IXF A; 2CT4 A; 2LX7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1PRM C; 1WA7 A; 1HD3 A; 2JVV A; 2COY A; 2H3J A; 1Y96 B; 4Y91 A; 4OB0 B; 3SEM A; 3ULR B; 1V1C A; 4FT4 A; 4ZN1 A; 3CCU Q; 2ZAE A; 3LX7 A; 3EFO B; 1U3O A; 2K5F A; 2E12 A; 2KT8 A; 3MEW A; 3QWY A; 4J9C A; 1H3H A; 1DJ7 B; 1LNX A; 4XTZ A; 2PQW A; 3P8D A; 1VQP A; 1M1K U; 1FXX A; 3PE0 A; 1M1F A; 1YJ9 A; 3NTK A; 2ZPF B; 2LDM A; 4E7Z A; 1BK2 A; 2Y4Y A; 4C5E A; 5IH2 A; 1BBZ A; 3G71 A; 1R0C B; 5LJ5 d; 1ZA2 B; 3M59 A; 4UC4 A; 4M75 B; 4ZGE B; 2MI6 A; 1VQ4 T; 2M51 A; 3I9Q A; 1UHC A; 2K2M A; 1K9A A; 2DPP B; 5CO7 A; 2OTJ A; 4GBQ A; 2CGH A; 2X9H A; 3E2U A; 1VQ4 Q; 3RKY A; 3FC3 A; 2FPD A; 3T9N A; 2J05 A; 4AG2 C; 1NE8 A; 1VQN A; 3PIP A; 2DD5 A; 3H0I A; 1PKS A; 1M27 C; 3C4S A; 3M57 A; 2O9V A; 3PTA A; 1BCM A; 1ABQ A; 4J9F A; 5C6S A; 5J39 A; 1CSK A; 4VUB A; 1R8O B; 4ORZ A; 2NUP A; 1VQP T; 3ZEH A; 2FRW A; 2RHI A; 2QQA A; 1YJ9 T; 1M3B A; 2DL7 A; 2NUT A; 5IAY A; 2CUB A; 2RJE A; 1AZE A; 2E6Z A; 1YJ9 Q; 3G71 T; 1UGP B; 2Y90 A; 2KT1 A; 3BDU A; 2YXY A; 2LJ3 A; 2ZZD A; 2VAS A; 2LQ8 A; 2HQX A; 4OF1 A; 1OZ2 A; 3G71 Q; 2HSP A; 3V7C A; 1W2B S; 4HKE A; 4C0D C; 3L2V A; 2OTJ T; 4BE1 A; 2DXC A; 4FYW B; 4M77 G; 1QVP A; 2PU9 B; 4NL2 A; 2M9U A; 2E41 A; 5FRO A; 1GRI A; 5D7U A; 1E6G A; 1ZA1 B; 4F7U A; 3QUI A; 3CXC S; 1VQN T; 2RQU A; 1QVF S; 5GAO l; 1WHM A; 4RTX A; 3VYG A; 2DXT A; 2CDT A; 4DBH A; 2F5T X; 3CME A; 4R55 A; 1YHQ A; 4KGV B; 1RI0 A; 2QK0 A; 2JN0 A; 1GFC A; 1JQQ A; 2GF7 A; 3FEO A; 2R5M A; 2D8J A; 3ME9 A; 1VIE A; 2DTH A; 2WSF E; 3URG A; 4OMO A; 2HKQ B; 2EQJ A; 1H92 A; 1VYU A; 2RI5 A; 2DTO A; 2ED0 A; 3M9Q A; 1B07 A; 2EW3 A; 2PUO B; 3JAM E; 2MPX C; 5CIU A; 2O4X A; 2VB6 A; 2CH4 W; 2COZ A; 1NM7 A; 2DVE A; 3D7S B; 4M7A G; 1TUG B; 2ZPH B; 4IIM A; 5KYN A; 4ATO A; 3U23 A; 4BB7 A; 3CCS A; 3MEU A; 1D1A A; 4EMG A; 1VQM A; 4N4G A; 4IKF A; 3C0C A; 2M16 A; 3M4Y A; 4JPB W; 3M0S A; 4AG1 C; 2K57 A; 2DEU A; 3OY9 A; 4C8Q A; 2DRM A; 2CP6 A; 2ZCF B; 1KQ1 A; 4J6W A; 3CC7 Q; 4PJO A; 4FM4 B; 1K8A R; 3CME T; 3LW5 E; 2RK2 A; 5LJ5 h; 1YHQ T; 3L2W A; 1D1B A; 1JBM A; 2YLB A; 4XTW A; 2KK4 A; 2FRY A; 4M7D A; 2F5K A; 1YHQ Q; 1YJN A; 5LJ3 h; 2ZGW A; 2CSQ A; 5FW9 A; 2FZG B; 1MUZ A; 2LC4 A; 2K5L A; 2EBP A; 2E6N A; 2XIC A; 4OMN A; 2PZ1 A; 2BE9 B; 2OAW A; 3I56 A; 1G5V A; 2KE9 A; 1YIT Q; 1AD5 A; 3C94 A; 1NPP A; 4XU0 A; 1V29 B; 4KUD K; 3CCS T; 2KSS A; 1H8K A; 3EAE A; 1QP2 A; 3OYE A; 1VQM T; 1PCX A; 1VQK Q; 4LDX A; 2EVR A; 3BW1 A; 2K79 A; 5HY6 A; 4FU6 A; 1TOV A; 1QKW A; 2DZ9 A; 4DEX A; 1VQM Q; 1M1K C; 3G7Z A; 4E7H A; 1YWO A; 2EQK A; 1O9S A; 2R57 A; 3CC4 Q; 2D0Q B; 2GQI A; 2E5Q A; 2JXB A; 3H0H A; 3VS3 A; 1KIK A; 2X4J A; 2FZK B; 1T3S A; 1K0X A; 1M4Z A; 1IO6 A; 2DRK A; 2LNH B; 3OYJ A; 1I8F A; 2YRD A; 4OB1 B; 4X1V A; 3OYM A; 3CXC A; 1YJN T; 2LJ0 A; 3QWX X; 1EX4 A; 2JOY A; 3CCV A; 3OW2 P; 1W1F A; 4ANJ A; 3VUZ A; 4OGC A; 2RHX A; 2AKL A; 1RAH B; 2DO3 A; 3I56 T; 4PK4 A; 4J9B A; 4C92 A; 4QKU A; 2RQW A; 3OSV A; 2XK0 A; 1M8V A; 4FW2 A; 3RKX A; 4F7U F; 1Q86 U; 1Q81 R; 2FEI A; 4AT1 B; 3CPW P; 1U1T A; 1OEB A; 2F2V A; 2FYK A; 3FJP A; 1ZLM A; 1NJI U; 3VS1 A; 3E19 A; 1GBR A; 5GAN 5; 1IRE B; 3CBP A; 3WXM B; 1WIE A; 4X9C A; 2CT3 A; 2RK1 A; 3EH1 A; 3L2R A; 1QCN A; 2M0Y A; 1YNZ A; 5GAM j; 2D8H A; 1MND A; 3LWI A; 2FG0 A; 3L2Q A; 1ZSZ B; 5GAN g; 1F1B B; 3EGX A; 3NTI A; 2P0K A; 1I1J A; 5IT9 E; 4RCB A; 7AT1 B; 2BTT A; 2CH4 A; 3A8L B; 4A63 B; 4BI4 A; 4F17 A; 5CAI A; 4JRK A; 1VQO A; 3TEE A; 4QVZ A; 2P4R A; 2D6F A; 1GL5 A; 4PL6 A; 3A8O B; 3A8H B; 1BIA A; 2BUD A; 3VRY A; 2KYM A; 4XU2 A; 4F7U E; 4C8Q F; 5KYU B; 2R58 A; 5LJ3 j; 1X69 A; 3MHX A; 4FYV B; 1KQS P; 1AWJ A; 1PSE A; 4C0Z A; 3EG1 A; 1B34 A; 3JV3 A; 1JJ2 P; 2X3W D; 1ZHI A; 1U06 A; 3PT9 A; 1OX9 A; 5FWB A; 2RPN A; 1WYX A; 4M7D F; 4JRQ A; 1GXI E; 4M77 B; 1Q7Y U; 1P92 A; 4BY6 C; 2IPO B; 3AT1 B; 3QO3 A; 4C5H A; 4KBM B; 3EGU A; 1G8X A; 1V76 A; 2DX1 A; 2NLU A; 4XQ3 A; 4XK8 E; 4Q5W A; 4PLI A; 1X6B A; 3LGF A; 1VQO T; 2VGN A; 1M1G A; 4J9H A; 3X26 B; 3MPU B; 4DEY A; 1G3Y A; 3BDL A; 5ECA A; 1OZ3 A; 1QP3 A; 2DVJ A; 5GAN e; 5D6X A; 1D3B A; 4KH1 B; 3QZ9 B; 2KR3 A; 2HD0 A; 4C8Q E; 4OVA A; 3OW2 A; 1ABO A; 4RTY A; 1YIJ A; 2E1H A; 1K9M U; 2HQH A; 1RAC B; 1WQW A; 2P0P A; 4M7A B; 3TQ7 P; 3DB3 A; 3WVD B; 3NGP A; 4LNP A; 4M7D E; 1UGV A; 4LDW A; 3E1S A; 2DFU A; 4QW2 A; 4PFZ A; 2JTE A; 2EFI A; 1KSW A; 4J6X A; 4J7F A; 2R5A A; 3G4S A; 5IHK A; 1KK7 A; 5GAM f; 2RM4 A; 2KBT A; 5A0D A; 4MML A; 2CT4 A; 2CRE A; 2DIQ A; 2MYS A; 4C92 F; 5CKB A; 3I5S A; 2KRM A; 3LWH A; 3A8G B; 2Y4X A; 1HYO A; 5GAN 8; 2YUO A; 3NTH A; 1LOJ A; 1PC0 A; 3CCR A; 2DYI A; 1RAF B; 1KJW A; 2I0N A; 2PUK B; 4O6J A; 1I07 A; 3QJ6 A; 3EG0 A; 2HL5 C; 4KGX B; 2EYQ A; 3CCM A; 1M2O A; 1YIJ T; 2KI7 A; 1TXQ A; 5L8R E; 3ER0 A; 4AMC A; 4J9I A; 2QQS A; 2BZX A; 3M0R A; 1RAB B; 3OA6 A; 2VWF A; 3PVL A; 3E9G A; 1VYT A; 2CP2 A; 2QA4 Q; 1AWW A; 4AFU C; 3G4S T; 4MZM A; 1GBQ A; 2LQN A; 1QVG P; 2P4T A; 4RTZ A; 3JCM J; 4C92 E; 2GTO A; 1NZ9 A; 2A3L A; 1VQ7 A; 2VKN A; 2JJ9 A; 1W4S A; 2K3X A; 1OPL A; 3VS7 A; 5L23 A; 1Q86 C; 2MF2 A; 1T3L A; 2YSQ A; 2ZPB B; 1YCY A; 2L3Q A; 3CPF A; 4GLM A; 3CCR T; 1KG1 A; 1JRI A; 1NJI C; 2BIV A; 2L2P A; 1SRL A; 3M54 A; 1G2B A; 3G1J A; 3PGG A; 3CCM T; 1AHJ B; 5D6Y A; 1YN8 A; 2XMF A; 3GNF B; 4C0D B; 3QSU A; 1J3T A; 2NWM A; 3SD4 A; 5HK3 A; 4EMK A; 1GCQ A; 4E7L A; 1Y0M A; 2FPE A; 1R77 A; 1WI7 A; 1TWB A; 4C8Q D; 2KXC A; 1N9R A; 4PJO D; 3UPU A; 1KC8 R; 1VQ7 T; 3X20 B; 2LTO A; 2FZC B; 4PKC C; 1UTI A; 3CMA A; 4M7D D; 3GIB A; 2MMP A; 2SRC A; 2HMA A; 1VQ7 Q; 4B9X A; 1O75 A; 4RTW A; 5CKD A; 1X2K A; 1Y71 A; 2HEQ A; 3OS5 A; 4ZGJ B; 1YP5 A; 2QQ9 A; 4RTV A; 3I35 A; 3CCE A; 3OS2 A; 3L2U A; 1M3C A; 3OYA A; 1Z9Q A; 3QZ5 B; 1UFF A; 3MP6 A; 4DBQ A; 1KD1 R; 1Q7Y C; 1JU5 C; 2DKG A; 2JS0 A; 4ME7 A; 3H8Z A; 2L0A A; 2M0O A; 4OMQ A; 1N8R R; 4HCK A; 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