The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
7
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
GPLGSPEETVVIALYDYQTNDPQELALRRNEEYCLLDSSEIHWWRVQDRNGHEGYVPSSYLVEKSP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
The SH3 domains of the Tec family kinase Itk and the Src family kinase Lck compete for adjacent sites on T-cell specific adapter protein
rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase ITK/TSK
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| total genus |
7
|
| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2011-12-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KT1 A; 2DM1 A; 3EGU A; 4HVU A; 3I5R A; 1WLP B; 1E6G A; 1JU5 C; 2MOX A; 3FJ5 A; 1EFN A; 2VVK A; 2L3P A; 1X2Q A; 1UGV A; 2GTJ A; 4KRT A; 4CC2 A; 1M3B A; 1SRM A; 1QLY A; 3SEM A; 4AFZ C; 4RTX A; 1X2K A; 2D8J A; 1M27 C; 2D1X A; 2GBQ A; 2RQW A; 2YUN A; 4M4Z A; 2DL3 A; 1PRL C; 2DL5 A; 2FEI A; 1NLP C; 1BK2 A; 2J06 A; 1RI9 A; 4OMN A; 1W1F A; 2W10 A; 1ABO A; 1WA7 A; 2LMJ A; 2BZY A; 4JJD A; 4CC4 B; 1SHF A; 2LQW A; 1WI7 A; 2LJ0 A; 2KR3 A; 1UTI A; 1QKX A; 1AWX A; 1Z9Z A; 4QT7 A; 2FPD A; 1NEB A; 2JS0 A; 5FWC A; 2DRM A; 2ED1 A; 2EQI A; 2DLP A; 1LCK A; 2CT3 A; 1YP5 A; 2V1Q A; 3H0I A; 1GCQ C; 2ROT A; 2O2O A; 2RQT A; 2KT8 A; 4GLM A; 2F2V A; 1ZSG A; 1UJY A; 3QWX X; 1TG0 A; 2CRE A; 1ZUK A; 3ULR B; 1U06 A; 1UE9 A; 1FMK A; 2J7I A; 1SSH A; 3M0P A; 1MV0 B; 2HCK A; 2K3B A; 1FYN A; 1MUZ A; 3VRZ A; 2BTT A; 1GRI A; 2FO0 A; 2C0T A; 1ZLM A; 2DIL A; 2L3S A; 2JMC A; 4HXJ A; 4ZNX A; 2LP5 A; 2ENM A; 2HSP A; 1I1J A; 1JO8 A; 1VYV A; 2EYY A; 5IHN A; 2JS2 A; 2DX1 A; 2LCS A; 1M30 A; 1J3T A; 1YWP A; 5IXF A; 1H3H A; 1IO6 A; 2ESW A; 3A98 A; 1BU1 A; 2DE0 X; 4OML A; 2NWM A; 1ZUU A; 2RMO A; 4Z88 A; 1T3L A; 3QWY A; 4D8D A; 2OAW A; 4OMO A; 1ZBJ A; 1TUC A; 4CC7 A; 1PKT A; 2DA9 A; 2KE9 A; 1M3A A; 1E6H A; 4ORZ A; 2VWF A; 2J6O A; 1CSK A; 2AKK A; 2E5K A; 2V1R A; 1ABQ A; 2DL4 A; 2KYM A; 2LNH B; 2L3Q A; 2MIO A; 1GCQ A; 1SHG A; 3H41 A; 3VS7 A; 2KNB B; 2BZ8 A; 2RNA A; 5FWB A; 3TSW A; 2X3W D; 3VRY A; 1KIK A; 5IH2 A; 1OOT A; 4LNP A; 4GBQ A; 3VS5 A; 4JJB A; 2ED0 A; 2OJ2 A; 1UG1 A; 1ZUY A; 2GQI A; 3THK A; 1BBZ A; 2W0Z A; 1B07 A; 1RLP C; 3NHN A; 3VS4 A; 1X6G A; 4HVV A; 4X1V A; 2F2W A; 4FSS A; 4IIM A; 3RBB B; 3EG3 A; 2A08 A; 3REB B; 2LQN A; 3VS0 A; 2PTK A; 2YT6 A; 2PNI A; 2LZ6 B; 4F14 A; 2HDA A; 3VS6 A; 2ABL A; 1M8M A; 3VS1 A; 1N5Z A; 2DF6 A; 1UEC A; 2SEM A; 3UF4 A; 1KJW A; 1PHT A; 3VS2 A; 1K76 A; 2LJ3 A; 1T0H A; 3LH5 A; 3TSZ A; 4Z8A A; 1UDL A; 1AEY A; 2LX7 A; 4AFU C; 2GTO A; 2KRM A; 2EYX A; 2YUO A; 1U5S A; 1V1C A; 2DBM A; 3EHQ A; 3M0R A; 2OI3 A; 4J9F A; 1T3S A; 2EYW A; 2ROL A; 4AFS C; 1QWF A; 2HBW A; 2CH4 A; 3EG1 A; 2EPD A; 3I5S A; 4HVW A; 1A0N B; 2CH4 W; 3PVQ A; 1UHC A; 1JXM A; 2IIM A; 2KGT A; 4RTT A; 2J6K A; 5IHI A; 2EW3 A; 2DJQ A; 2GGR A; 4OMM A; 2KXC A; 2CSQ A; 3KFV A; 2CSI A; 2JXB A; 1VA7 A; 2CDT A; 2KRO A; 4J9H A; 1ZX6 A; 2CUD A; 2AKL A; 2EYZ A; 1G83 A; 1HJD A; 1OPL A; 1X27 A; 2KEA A; 1B3Q A; 1I07 A; 1BB9 A; 1X6B A; 2ECZ A; 1PNJ A; 1WYX A; 5EC7 A; 4WCI A; 2K7A A; 3SHW A; 2L2P A; 4Y92 A; 4F17 A; 2A36 A; 1GL5 A; 1W70 A; 4J9I A; 1AD5 A; 1OEB A; 1KFZ A; 1CKB A; 3UA6 A; 2A28 A; 4RTZ A; 2DNU A; 1E7O A; 1VYU A; 2JM8 A; 2P4R A; 4AG1 C; 2YUP A; 2PZ1 A; 1OV3 A; 2GNC A; 3NPF A; 1WFW A; 1UJ0 A; 2G6F X; 2KBT A; 2FG0 A; 1AWO A; 1JXO A; 1JQQ A; 5I22 A; 5GJW B; 3RNJ A; 1K1Z A; 1Y0M A; 3NMZ C; 2VKN A; 5IXB A; 5FW9 A; 2QDL A; 1T0J A; 4JZ4 A; 1SPK A; 3PE0 A; 2DYB A; 5GJV B; 2DMO A; 2FPF A; 2KRS A; 2SRC A; 1M3C A; 1TUD A; 2RN8 A; 2H8H A; 1WXB A; 1OPK A; 1H92 A; 4RTY A; 1WX6 A; 2HEQ A; 2EGE A; 4DEY A; 1W6X A; 4OMQ A; 3JV3 A; 1NM7 A; 1WXT A; 1CKA A; 1YNZ A; 2X3X D; 4LE9 A; 3M0Q A; 1YWO A; 4LUE A; 1NLO C; 2O31 A; 1AWW A; 3IQL A; 1G2B A; 5I11 A; 4LN2 A; 1NYG A; 1NYF A; 3TVT A; 4IIO A; 2BZX A; 1H8K A; 2RQU A; 1KSW A; 1WXU A; 1UFF A; 4EIK A; 2O9V A; 2J6F A; 4RTU A; 2AZS A; 4DEX A; 2YSQ A; 1RUW A; 1MV3 A; 1XOV A; 3NGP A; 2O88 A; 3ZL7 C; 2EGC A; 1AWJ A; 2FPE A; 4J9E A; 2DL8 A; 4AG2 C; 2F2X A; 1YN8 A; 2DBK A; 2FRW A; 2XMF A; 1NEG A; 2YDL A; 1S1N A; 4J9D A; 4J9G A; 4HCK A; 2JW4 A; 2K9G A; 3EG0 A; 3VS3 A; 1Z9Q A; 2B86 A; 3U23 A; 4LUD A; 2A37 A; 2EVR A; 1UHF A; 3C0C A; 4RUG A; 5HCK A; 2JMA A; 2EBP A; 1PKS A; 4J9B A; 4ESR A; 4CC3 A; 3EHR A; 2AZV A; 4JPB W; 1AVZ C; 1X43 A; 3REA B; 2RQV A; 1X69 A; 2FRY A; 3CQT A; 2KRN A; 2AK5 A; 2M0Y A; 1WDX A; 3UAT A; 2C0I A; 2D8H A; 1QKW A; 2M51 A; 3GBQ A; 3O5Z A; 4J9C A; 1QCF A; 4E6R A; 3I35 A; 2DRK A; 2EGA A; 2NUZ A; 2YUQ A; 1I0C A; 2J05 A; 3EG2 A; 4A63 B; 2JTE A; 1ARK A; 1K9A A; 4OMP A; 1VYT A; 5IHK A; 1WIE A; 1GFD A; 1NG2 A; 5L23 A; 1GFC A; 1HSQ A; 2CUB A; 1PWT A; 2K6D A; 2RPN A; 1QWE A; 3M0U A; 1RLQ C; 1K0X A; 4JZ3 A; 1SRL A; 5ECA A; 2EKH A; 4K11 A; 2D0N A; 2RF0 A; 2K79 A; 1K4U S; 2LJ1 A; 1PRM C; 2K2M A; 1GBR A; 1UUE A; 1U3O A; 1AZE A; 4F16 A; 3PVL A; 4RTW A; 1GCP A; 2MCN A; 3H0F A; 3M0T A; 1YCS B; 2L0A A; 3H0H A; 4AFQ C; 4RTV A; 2I0N A; 4R0K A; 3M0S A; 2KYB A; 4Z89 A; 1Y57 A; 1AOJ A; 1SEM A; 4D8K A; 1HD3 A; 1K0S A; 2JM9 A; 2DVJ A; 1AZG B; 2JT4 A; 3UA7 A; 4JJC A; 2DL7 A; 1JEG A; 2RQR A; 2KXD A; 3R6N A; 2CT4 A; 1GBQ A; 3I9Q A; 2O9S A; 2C0O A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2CZ1 B; 1K8A R; 1OI1 A; 2MOX A; 4PLI A; 3BE3 A; 2L3P A; 1X2Q A; 3DB3 A; 2HKN A; 4KRT A; 1U8R A; 2GFU A; 2XD0 A; 4CC2 A; 5CKD A; 1M3B A; 1QLY A; 5LJ3 g; 3SEM A; 2LX9 A; 2DER A; 3CC4 T; 3OMG A; 1VQK A; 1X2K A; 3A8O B; 3VUZ A; 1M27 C; 1NLP C; 2YLC A; 2W10 A; 3JCM g; 2PU9 B; 4C8Q E; 3LX7 A; 1BI0 A; 4JRQ A; 1YJ9 Q; 1RAE B; 1WI7 A; 4OGC A; 1XTD A; 4BDZ A; 1AWX A; 1Z9Z A; 2FZC B; 4QT7 A; 1VQK Q; 1X75 C; 2FPD A; 1NEB A; 5FWC A; 2ED1 A; 3S3N A; 2DLP A; 3QHS A; 1LCK A; 4B9W A; 4EMG A; 4C0F A; 4C92 C; 1JJ2 A; 1GCQ C; 3FB9 A; 1VIF A; 4L6V 5; 4J83 A; 4GLM A; 4ELZ C; 1WHM A; 1FWZ A; 1UJY A; 2CRE A; 1ZUK A; 2ZZD A; 1KC8 U; 1Q86 R; 2CP0 A; 2QQR A; 2Y90 A; 1NZ9 A; 3VRZ A; 2BTT A; 2JVV A; 4EMK B; 2QQS A; 3QO3 A; 2JMC A; 3CC4 A; 5D6Y A; 2Y4X A; 1VQM T; 1I1J A; 1W2B S; 2VGN A; 1VYV A; 2P4T A; 4PFZ A; 2NUP A; 2DX1 A; 4C8Q A; 2LCS A; 5J39 A; 1K8A U; 4J7I A; 4PNO A; 1J3T A; 3L2W A; 5FU7 B; 3QSU A; 4OML A; 3OW2 S; 1C0M A; 1ZUU A; 3CPW P; 3CCQ T; 4FW1 A; 4Z88 A; 1D3B A; 1T3L A; 3PGG A; 2CZ6 B; 1BCM A; 3HPW A; 2DA9 A; 5CIU A; 2KE9 A; 1M3A A; 4X9D A; 2AKK A; 4B9X A; 1ABQ A; 2E10 A; 2KYM A; 4NS5 A; 2L3Q A; 4PJL A; 2DD4 A; 3URG A; 2KNB B; 1B34 B; 5DLO A; 1WJS A; 2RNA A; 5GAM f; 5I2M A; 4IUU A; 3WVE B; 2LDM A; 1YBY A; 3VRY A; 1TH7 A; 1KIK A; 3SB2 A; 4LNP A; 4GBQ A; 3VS5 A; 4JJB A; 5FU7 C; 5HY6 A; 5KYU A; 1MMG A; 2X9H A; 1VQM A; 3DKM A; 1BBZ A; 4FIB A; 3MP6 A; 1X6G A; 2DVE A; 1Q86 U; 4IIM A; 4IUR A; 3EG3 A; 2PNI A; 2LZ6 B; 5LJ3 e; 3I55 Q; 1UEC A; 2KI7 A; 3UF4 A; 3JCM J; 3H8Z A; 3CCJ T; 1PHT A; 3MP8 A; 5GAN 5; 3RDV A; 3TSZ A; 1AEY A; 2LX7 A; 3E1S A; 4M7A B; 5GAM g; 1WJR A; 3BY7 A; 3JB9 H; 1FX7 A; 1U5S A; 5KYX A; 1H64 1; 3EHQ A; 5GAN 3; 3JCM e; 2OI3 A; 3NTK A; 4M75 A; 4J9F A; 4MZT A; 3TCJ A; 1NPR A; 2CH4 A; 3EG1 A; 4ZGJ B; 3MEW A; 1A0N B; 2RHU A; 2CH4 W; 5GAN 6; 4C8Q G; 4N0A C; 1WHG A; 2CKK A; 2DK3 A; 4ZN3 A; 3CBM A; 3CCM T; 3PVQ A; 1UGP B; 3E9G A; 2IIM A; 2RA2 A; 5DLQ E; 2EW3 A; 2JUF A; 4XTY A; 4M77 E; 3CCS Q; 2IPO B; 3RR6 A; 4HCC A; 4HKE A; 5C0M A; 2CGH A; 5GMK h; 2KSS A; 1N8R U; 3JAM E; 3UPU A; 1B3Q A; 2CZ0 B; 1I07 A; 4ZTF A; 2ECZ A; 3MO8 A; 1WYX A; 5LJ3 j; 5AT1 B; 4WCI A; 2XK0 A; 2X4J A; 2A0F B; 4XU2 A; 2GCX A; 3E19 A; 1EZZ B; 3PNW C; 1TU0 B; 2AT1 B; 2OTL T; 4OGE A; 4ZTJ A; 4M78 D; 3C95 A; 4RTZ A; 3L2Q A; 1VQO A; 3L42 A; 2DNU A; 2QEX T; 3CMA T; 4C0Z A; 3HHT B; 2G6F X; 3C94 A; 2EKO A; 2NUT A; 1JQQ A; 4BDY A; 3RNJ A; 2XDD A; 3NMZ C; 2BKD N; 2VKN A; 1VQ8 Q; 2QDL A; 4KGV B; 1KQ1 A; 2WAC A; 3PE0 A; 2DYB A; 4BE1 A; 1VQO Q; 3CCM A; 2QA4 T; 2FPF A; 1M3C A; 1JBM A; 1PSF A; 1QMC A; 4M77 A; 1WXB A; 1OPK A; 4M7D A; 1ZSZ B; 2DYI A; 1BI1 A; 4OMQ A; 1NM7 A; 1YNZ A; 2X3X D; 2K4Y A; 1G2B A; 3CCM Q; 3MET A; 3TRE A; 1NYF A; 2RQU A; 5J26 A; 3AHU A; 2F5K A; 3OYL A; 2J6F A; 3RMS A; 3VU3 C; 4R56 A; 1K73 R; 4M78 B; 2YSQ A; 1RUW A; 1VQP T; 1TS9 A; 5D6W A; 2QAZ A; 3ZFJ A; 2RHZ A; 1AWJ A; 2FPE A; 4DOW A; 2HNI A; 4AG2 C; 4JS4 A; 1MNE A; 2LT4 A; 3GOX A; 1M1K R; 4J9D A; 4XK8 E; 3SWN A; 4HCK A; 1ZSZ C; 2DTH A; 2JW4 A; 3OY9 A; 4IKF A; 3VJP A; 1YIT T; 2QA4 A; 3BDU A; 2JMA A; 5GAO m; 4ESR A; 1RAG B; 1ZQ1 A; 3CQT A; 1IHV A; 2KRN A; 1YIJ T; 1U1T A; 5KH6 A; 1HXD A; 5IAY A; 1O75 A; 3CXC A; 2D8H A; 3O5Z A; 2QA4 Q; 1UGQ B; 2ZPF B; 4N4G A; 1Y07 A; 4E6R A; 3I35 A; 1BIA A; 3TU4 K; 3HRS A; 3G7Z A; 3KUF A; 3EG2 A; 2JTE A; 4P5N A; 1K9M C; 1VQP A; 5IHK A; 1WIE A; 4A4F A; 3OQ5 A; 4BE0 A; 1M9S A; 1NG2 A; 1W2B P; 4Q5W A; 5L23 A; 4M77 G; 1GFC A; 2XIC A; 2K6D A; 4F7U B; 3G1J A; 2DKG A; 2R5M A; 3GNG A; 1KQS P; 2XKO C; 4K11 A; 3PIO A; 3FDR A; 2D0N A; 2EQM A; 1YIT A; 2HL5 C; 1K4U S; 2LJ1 A; 2PUK B; 3JCM c; 2CS7 A; 3CCU Q; 2XU8 A; 1K73 U; 1UUE A; 2OTJ A; 1U3O A; 1AZE A; 3UDC A; 1VQ7 Q; 2PVG B; 2DD5 A; 2MWO A; 1YCS B; 1H3Z A; 1Q7Y C; 4PJO A; 2KYB A; 3OS1 A; 1YIJ A; 1D1B A; 3RKW A; 1K0S A; 2JM9 A; 2DVJ A; 1VQ9 Q; 2OTJ Q; 3RIR A; 2RQR A; 4RMO A; 3R6N A; 1M1K U; 1RAB B; 2E6N A; 1XNI A; 2O9S A; 4KUL A; 1XQH A; 2H8H A; 4RG8 A; 2KT1 A; 1BI2 A; 2PQW A; 2DM1 A; 1YIJ Q; 3MKD A; 4L59 A; 3OYI A; 3EFR A; 4LDY A; 1SRM A; 4OB2 B; 1Q95 G; 4RTX A; 1VOM A; 4M75 F; 2RI2 A; 2D1X A; 2K5I A; 2DL3 A; 1PRL C; 2FEI A; 1BK2 A; 2J06 A; 1RI9 A; 2E3I A; 5GAN d; 3S3O A; 3CD6 T; 1VQ5 T; 1VQ6 Q; 2LMJ A; 2P0P A; 4JJD A; 3VYH B; 1UTI A; 2DRM A; 2EQI A; 4QVC A; 1Y96 B; 2EJF A; 3H0I A; 2ROT A; 2O2O A; 5KE2 A; 2DTI A; 2DTO A; 5LJ5 d; 2MWP A; 5GAN 4; 4E7Z A; 2KT8 A; 5CAI A; 3QPH A; 5GAO p; 2COY A; 4FL6 A; 4BUG A; 4EMK A; 3C4S A; 3CPW A; 1WQW A; 2J7I A; 2WSE E; 4A4G A; 4UC4 A; 2K3B A; 1MUZ A; 4MDX A; 2FO0 A; 1ZLM A; 4BD3 A; 2L3S A; 2CP2 A; 1VIE A; 3OYE A; 2HAX A; 2KK4 A; 4FW2 A; 2EQU A; 1YJ9 T; 2MF2 A; 5DY9 A; 5IHN A; 1NPP A; 2RHY A; 1VQK T; 3V7C A; 3CD6 A; 1VQ5 A; 1M30 A; 2YXY A; 1QVF P; 1YWP A; 5LJ3 f; 5IXF A; 1QCO A; 5GAN h; 1H3H A; 1IO6 A; 5GMK l; 3INZ A; 4M7A E; 4DQ2 A; 4M7D F; 3MPU B; 1QQJ A; 4HT9 A; 3G6E A; 2OAW A; 4XU1 A; 2X4Y A; 3JB9 F; 3RER A; 1UB4 A; 2LQ8 A; 3VYG A; 3CD6 Q; 1VQ5 Q; 2QQ9 A; 3JCM f; 2VWF A; 2J6O A; 3EFO A; 2E5K A; 5CVI A; 2V1R A; 5LJ5 h; 3X28 B; 1SHG A; 3VS7 A; 4KGZ B; 2QQB A; 3M53 A; 3G6E Q; 3QKJ A; 1M90 R; 4XU3 A; 3FLG A; 2E1H A; 3TSW A; 1R8O B; 4C92 B; 2X3W D; 5IH2 A; 5D6X A; 1OOT A; 4DBH A; 2OJ2 A; 1IXD A; 1N9R A; 3QJY A; 1WHL A; 3THK A; 1YJ9 A; 2PVD B; 1B07 A; 2QGF B; 2MYS A; 2F2W A; 4L5G A; 3RBB B; 5KYN A; 1MMA A; 2A08 A; 3REB B; 4M7A A; 4F14 A; 2DXT A; 4ZN1 A; 1N5Z A; 2DF6 A; 2DPP B; 2SEM A; 4OF1 A; 3GIB A; 2M16 A; 2VYT A; 1KJW A; 4HCZ A; 2KY9 A; 3HFN A; 4AFU C; 2KRM A; 1M2O A; 2YUO A; 1ZBX A; 3QZ9 B; 4RG2 A; 1V1C A; 4FM4 B; 2DBM A; 3M0R A; 2HZY A; 2ROL A; 3J80 E; 2HBW A; 1V76 A; 5LL6 S; 1TTH B; 1PG5 B; 2VGM A; 2HD0 A; 2EAY A; 4IUT A; 2KGT A; 1WHK A; 4CI0 C; 2DEU A; 3UT1 A; 1X6O A; 3NTI A; 2D9T A; 2CP7 A; 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