The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
QGHMDLICMYVFKGEESFGESIDVYGDYLIVKVGTEFLAVPKKSIKSVEDGRIVIGEFDEEEARELGRKWLEEKSKPVTLEELKSYGFGEEGEGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution NMR structure of proterin AF2094 from Archaeoglobus fulgidus
rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized protein AF_2094
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Archaeoglobus fulgidus
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| total genus |
18
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KK4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KVQ G; 4A4F A; 1Y57 A; 2DF6 A; 4KUD K; 1I07 A; 1XTD A; 1KIK A; 1I81 A; 1YN8 A; 4X34 A; 5CQX A; 1WHK A; 1AWW A; 3V8L A; 4M7D B; 1LCK A; 1YJ9 A; 2G3R A; 2NUP B; 4KGV B; 4AMC A; 1CKA A; 5HY6 A; 4O5V A; 2HQH A; 2R5A A; 3CCV T; 2COY A; 1MMN A; 4ZNX A; 3DKM A; 4N4G A; 2JTE A; 4LD9 K; 2DEU A; 1QVF A; 1WPY A; 2YRD A; 1V76 A; 5KH6 A; 4F7U E; 1UUE A; 3Q1J A; 4KH0 B; 5GAO m; 1U06 A; 2HAX A; 1KHC A; 1YFN A; 2RHY A; 3JV3 A; 1VQ9 Q; 4XTU A; 3CPW P; 5I2M A; 5KYU A; 2EKO A; 2EYW A; 2QQ9 A; 2D8J A; 2M02 A; 3MET A; 5FLX E; 4PJO E; 1Y71 A; 1KFZ A; 3OYD A; 1PSF A; 2HKQ B; 2Y4Y A; 1YNZ A; 3FEO A; 1OV3 A; 2ZPG B; 3OYL A; 1RAI B; 2W0Z A; 3E9F A; 4M7A A; 1VQN Q; 4RG2 A; 3G4S A; 2EQU A; 2RQT A; 2XI9 A; 3KBG A; 1R77 A; 2WSF E; 3CCL Q; 5CCA A; 1UGS B; 3HRU A; 4C5G A; 3RMS A; 5GAM j; 4F7U F; 2EBP A; 1IHW A; 1IRX A; 1WGS A; 3OYH A; 2CP2 A; 3OYJ A; 5J39 A; 2MK5 A; 4M78 B; 2YUO A; 1W1F A; 1YIT T; 2KQW A; 3HRS A; 2XKO C; 2K2V A; 1WYX A; 1VQN T; 3QG1 A; 1WLP B; 2H8H A; 2RO0 A; 3LWI A; 2OTJ Q; 2OTL A; 1M4Z A; 3PVQ A; 1VQ6 T; 3OS5 A; 4JZ4 A; 4RMO A; 2OAU A; 1PKS A; 4FM4 B; 1Q81 U; 1LPL A; 1BCM A; 2VGM A; 3L2R A; 2L2P A; 1GBR A; 1CKB A; 1P92 A; 3I55 T; 4EPC A; 4J8O A; 2D9T A; 1HD3 A; 2MCN A; 4K11 A; 5KYX A; 1KC8 R; 4KGZ B; 4QQ6 A; 1C1A A; 1UJ0 A; 2GFA A; 1AD5 A; 2FG0 A; 3OYF A; 4PJM A; 1BYM A; 3I35 A; 1BIB A; 4X9D A; 2CSQ A; 1BK2 A; 3OYY A; 5IT9 E; 4CC2 A; 2DZ9 A; 3ZFJ A; 3EGU A; 1PM3 A; 1W4S A; 3JCM g; 4DEY A; 4XTX A; 1Q86 U; 2KNB B; 4XU3 A; 3ZBD A; 4ZN3 A; 5KYN A; 1VQ5 A; 1WJR A; 3EH1 A; 3M9Q A; 2EQM A; 3CBP A; 1GL5 A; 4E2F B; 3OW2 S; 4OB0 B; 5GAN 5; 1UG1 A; 1X75 C; 5GAN d; 1RAD B; 2EGC A; 2F5K A; 4BE0 A; 4C0G A; 2DL3 A; 4KUL A; 2ECZ A; 3HRT A; 1YP5 A; 5KE3 A; 2X4W A; 3JB9 H; 1RLP C; 3OMC A; 1AT1 B; 1B34 A; 3A1P A; 5GAO l; 3CC2 A; 2HDA A; 1VQ8 T; 2E5Q A; 1UGP B; 4BUG A; 1RAG B; 1AOJ A; 3EG9 A; 2O9S A; 1Q81 C; 3OW2 A; 2Y90 A; 3VRY A; 1FMV A; 1GCP A; 4BI3 A; 4M75 G; 4ZTJ A; 5HKC A; 1SF9 A; 1MHN A; 1VQ7 A; 2O31 A; 5FU6 C; 1OI1 A; 2GTO A; 1Q82 U; 4C5H A; 4AFQ C; 3OY9 A; 4J5Y A; 2VUB A; 2AKK A; 3A8H B; 4FT2 A; 2RHX A; 2H3E B; 2H3J A; 4PFO A; 2YDL A; 3J80 E; 1VA7 A; 3CD6 T; 3JCM V; 3JCM h; 1V1C A; 3EFS A; 5KYW B; 3CBM A; 5LJ5 h; 3CQT A; 1D09 B; 4JS5 A; 4L59 A; 2AK5 A; 3MCA B; 1PD1 A; 2CSI A; 2DEQ A; 3JCM Q; 2E64 A; 2WAC A; 2FYK A; 4C0Z A; 2J06 A; 1KQS S; 1GRI A; 2KT8 A; 4J6Y A; 2EQI A; 2VVK A; 2QQB A; 2LQK A; 3C0C A; 2MAM A; 3RES A; 2K5F A; 2K6D A; 2LCL A; 1PSE A; 3CCR T; 5CVI A; 2RQR A; 2CKK A; 1JJ2 P; 3VRZ A; 1OZ3 A; 1Y96 A; 2O2O A; 4RG8 A; 3VS1 A; 2JS0 A; 2M0O A; 5GAN 8; 1OPK A; 1BCO A; 5KE2 A; 1YIJ T; 1KQS A; 1YJ9 Q; 2VV5 A; 3RKW A; 3G6E T; 3X20 B; 4ZTF A; 2RPN A; 2DTH A; 3EFR A; 4M78 G; 3CCQ T; 2ROL A; 3PTA A; 3OYI A; 5CKF A; 3CCJ A; 1S1N A; 2RN8 A; 3OYN A; 2J7I A; 1YI2 A; 2HD0 A; 1U1S A; 4M75 A; 2BKD N; 3QUI A; 5KYU B; 3J7A F; 4IUV A; 3VS6 A; 4MZM A; 1WHJ A; 2EJF A; 2K3X A; 2NUP A; 1YHQ A; 3M0P A; 1V29 B; 2HZY A; 4AFU C; 4M7D E; 3MHX A; 1RI9 A; 5LJ3 d; 3I56 A; 4VUB A; 2V1R A; 1R8O B; 4ME7 A; 1OX9 A; 1MV0 B; 4M7A B; 2XDP A; 2BZY A; 3GOX A; 1SRM A; 3LYI A; 4HCC A; 3LGF A; 4E7J A; 3JCM W; 3L42 A; 4OB2 B; 5IAY A; 2COZ A; 2VXE A; 3C12 A; 4HVU A; 1ZUU A; 3QDF A; 4FL6 A; 4OB3 B; 4LUD A; 3UA7 A; 4M75 D; 3M53 A; 4AT1 B; 2FVU A; 2DET A; 3QO3 A; 3H0I A; 1R0C B; 2X9H A; 3QDR B; 1VQ4 A; 5DM7 R; 2P0Q A; 4JS4 A; 3LX7 A; 4NS5 A; 4MZT A; 1TG0 A; 3G7Z A; 2LT4 A; 1WZO A; 1KSW A; 1G8X A; 4OMQ A; 2KMT A; 2ZAE A; 2RHZ A; 3A8O B; 2OTL Q; 2ZZD A; 4FIB A; 5KYX B; 1FX7 A; 4RTV A; 2JN0 A; 2XK0 A; 2VKN A; 3PFS A; 2VB6 A; 3CCS T; 3ASK A; 2EGE A; 1QMC A; 2FHD A; 4M78 A; 1LNX A; 1G3T A; 1BB9 A; 2KDS A; 4C0D C; 1N8R U; 4QT7 A; 4C92 F; 1VQL A; 2HSE B; 2RQV A; 2JS2 A; 2EWN A; 1ZUK A; 4XAX B; 3WVD B; 1UTI A; 2D0N A; 5C6S A; 1VYT A; 2PTK A; 2Z0W A; 1T3L A; 3KXT A; 2QTX A; 4E7S A; 4F04 B; 1VYU A; 1VQP T; 1ZA1 B; 4C8Q C; 1H3Z A; 1M30 A; 2G6F X; 2DXU A; 2QA4 Q; 1Y7X A; 3RDV A; 2YT6 A; 1JEG A; 2FRY A; 1HJD A; 2QEX T; 1VQ5 Q; 2M0Y A; 3L2Q A; 4E7Z A; 1T0H A; 3J81 E; 2FRW A; 2HMA A; 3M56 A; 4LDV A; 2EYQ A; 4OMM A; 1B34 B; 4M78 D; 2JM9 A; 1T0J A; 1FWZ A; 3CPF A; 2KXD A; 3OQ5 A; 2MOX A; 2E5K A; 4HVW A; 3EG9 B; 2ED0 A; 2QA4 T; 2L8D A; 4HCZ A; 3TSW A; 3HTR A; 2JTM A; 1Q7Y R; 2LT1 A; 5CKH A; 5GAO p; 1UGV A; 4C0D B; 3GF5 A; 3CC2 Q; 2K3Y A; 3VS7 A; 4IUQ A; 1UEB A; 2QAZ A; 5HK0 A; 2KSS A; 1N27 A; 3FDR A; 3VV0 A; 2DXC A; 1N8R C; 2AT1 B; 4JRI A; 1VQ7 Q; 1LOJ A; 3TRE A; 2I0N A; 1N9S A; 3HL8 A; 2PUK B; 1K73 U; 2GF7 A; 4JRK A; 1H64 1; 4XQ3 A; 2LJ1 A; 3P8H A; 4DBQ A; 2CZ0 B; 5KYY B; 4KH1 B; 4MML A; 3M59 A; 2R5M A; 2HL3 A; 5DLQ E; 2F2X A; 1PCX A; 2MPX C; 4F7U G; 2R58 A; 2ZPF B; 1AWJ A; 2HCK A; 2O4X A; 1H3H A; 4J9G A; 4M77 F; 3X28 B; 4A53 A; 2JJ9 A; 3CC4 A; 3CCE T; 5CO7 A; 3M5A A; 3CME A; 1D1C A; 2AIR B; 1KG1 A; 2CS7 A; 2ZPB B; 3L2Z A; 3I5R A; 1VQO A; 1WXU A; 5AT1 B; 2EGA A; 1Y96 B; 1X27 A; 2HL5 C; 3MKD A; 1YJW T; 2LQN A; 5GAN e; 3E1S A; 2R57 A; 2PQW A; 4BD3 A; 3TCJ A; 1VQM A; 3CMA A; 5KYW A; 2DTI A; 2EQK A; 2YUP A; 3MO8 A; 1ZA2 B; 3SFM A; 4RTX A; 1W6X A; 2RNA A; 5FU7 B; 1UJY A; 3G71 Q; 3CPW S; 3JCM P; 2FB7 A; 3VJP A; 4D6W A; 4M75 B; 2ATC B; 1WDX A; 2DL4 A; 1KD1 R; 1VOM A; 1NEB A; 1Q7Y C; 1IB8 A; 3QHS A; 2K5L A; 1AWO A; 1M2V A; 2XHC A; 1K73 C; 2C0I A; 5CQY A; 3CXC S; 3JB9 J; 2E70 A; 4KBM B; 4CC7 A; 4L6V 5; 2CP6 A; 3CCJ Q; 4B9W A; 4FYY B; 2E3H A; 1YI2 Q; 3HP9 A; 2Y4X A; 2FO0 A; 3G71 T; 4R0K A; 1S72 A; 4M78 C; 1RAE B; 2EW3 A; 2MMP A; 5KCH A; 4JJD A; 1D0X A; 2JUF A; 1KD1 U; 2CGH A; 6AT1 B; 3CCM A; 1K9M R; 3MP1 A; 2M16 A; 4A4E A; 5L23 A; 4JUV A; 5IHN A; 4PFZ A; 4ELY C; 2KT1 A; 1SHG A; 2KK4 A; 5GAM f; 1QVP A; 3M57 A; 2HNI A; 3D7S B; 4F7U A; 3CCJ T; 2E4H A; 5IHK A; 4PL6 A; 1X69 A; 2LMJ A; 1YI2 T; 3EFO B; 5J3B A; 3CXC A; 2BZ8 A; 1M3C A; 1ZBJ A; 4IIO A; 2X4J A; 1M3B A; 2MF2 A; 2J05 A; 2L5Q A; 4J6X A; 1AEY A; 3H41 A; 1K9M U; 1QVF P; 4PJJ A; 1U8R A; 4E7I A; 2VYT A; 3VYH B; 2HQE A; 4CRI A; 2IVW A; 2SRC A; 1VQ9 T; 2V8I A; 2W10 A; 2RJC A; 2RK1 A; 3HSB A; 1ZBX A; 4OP0 A; 3GLX A; 1BI3 A; 2ABL A; 1K0S A; 1VQ4 Q; 2DBM A; 3MEW A; 1VYV A; 5IXB A; 4E47 A; 3JB9 F; 2NWM A; 4HA8 A; 1QP2 A; 4FCY A; 1K0X A; 4HT8 A; 1D0Y A; 2RJD A; 5CAI A; 1WJS A; 3BFM A; 3LH5 A; 1XNI A; 1QVG S; 1D1B A; 1WQ7 A; 2AHJ B; 3UAT A; 5GAO r; 1YJN A; 1RAA B; 4RTT A; 4KT0 E; 3HKS A; 2DIG A; 4CI0 C; 3CCL T; 4IUU A; 4OF1 A; 2E12 A; 2K9G A; 3MP6 A; 4FSS A; 4PJO F; 2FPF A; 2X35 A; 3VUZ A; 2V8J A; 1ZQ1 A; 5GAO n; 2K3B A; 4Y28 E; 1KD1 C; 4X1V A; 3GPL A; 3FLG A; 1RAC B; 4M7A D; 1VQL Q; 2JVV A; 4A4G A; 3PMT A; 4AFZ C; 5LJ3 e; 3OSV A; 5GAO q; 2OTJ T; 1PNJ A; 1NJI R; 3INZ A; 1QVG A; 2DXT A; 1NPP A; 2CT3 A; 2X3W D; 1GFD A; 3DLM A; 5GAN g; 2CZ7 B; 1UEC A; 3UDC A; 2IIM A; 4J9F A; 1K9M C; 2ZPE B; 3KUF A; 5GMK i; 3HHT B; 5I21 A; 1KC8 U; 2CDT A; 1NBE B; 1HXD A; 4J6W A; 1I1J A; 5I22 A; 2KY9 A; 1LVK A; 1D1A A; 1YBY A; 4PFP A; 4FSX A; 1AZE A; 1HYO A; 1TTH B; 3CC7 A; 3VS2 A; 2L0A A; 4MMK A; 3CBO A; 3RMQ A; 4C5E A; 1VQK Q; 2DTO A; 3LWH A; 2V26 A; 2KYM A; 4N0A A; 2RA2 A; 4PLI A; 2KAF A; 4PNO A; 2DNU A; 2BE7 D; 2KRO A; 2J6F A; 4PJL A; 1M1G A; 1E6G A; 4A4H A; 1B07 A; 5FW9 A; 4ANJ A; 5LJ5 d; 3CCU A; 1VQK T; 3MJX A; 4NOY A; 2NUT A; 1OU8 A; 1R0B G; 2ROT A; 2FZG B; 5L8R E; 2EIF A; 3OA6 A; 5EC7 A; 2O4X B; 3JCM X; 1FYN A; 2YWW A; 4GLK A; 1N6A A; 1IHV A; 4DOV A; 4C0F A; 2CZ6 B; 3SHW A; 1PRL C; 3M4G A; 2YHT A; 4GLM A; 2DXB A; 4RKU E; 1DJ7 B; 5GAN h; 2X51 A; 3OW2 P; 3JCM b; 3QPH A; 1AWX A; 1NPR A; 3CC4 Q; 1GXI E; 1UHF A; 5M9O A; 5KYY A; 1BI1 A; 1PHT A; 1KC8 C; 1WIE A; 3H0F A; 4C8Q E; 2DO3 A; 2RH2 A; 1VQO Q; 3TU4 K; 2F1L A; 1NJI C; 1SHF A; 4X9C A; 1U1T A; 2RJF A; 1QKX A; 1WXT A; 2E6N A; 1VQM Q; 2FPE A; 1JBM A; 4M7A C; 3REA B; 4C92 G; 1O75 A; 3UWN A; 2A37 A; 3R6O A; 1NYF A; 1WA7 A; 3RNJ A; 1ZSG A; 1M2V B; 2DYB A; 4XK8 E; 4FYX B; 1JB0 E; 2RQW A; 2RI5 A; 1TU0 B; 3LLR A; 3JAM E; 3OSS C; 1QKW A; 1MNE A; 1SEM A; 3EHQ A; 5IHI A; 4BI4 A; 3MEA A; 2NLU A; 1RAH B; 5D6Y A; 2L3P A; 3PNW C; 3R6N A; 1JRI A; 4IKF A; 2B8A A; 4C8Q F; 5LJ3 g; 3A8M B; 1C6V X; 4XTW A; 4LNP A; 4PLL A; 2QDY B; 2LNH B; 2O9V A; 4JZ3 A; 1KQ1 A; 4F7U B; 2DAQ A; 1S72 Q; 5CK9 A; 2I2L A; 4V2S A; 2DRM A; 1QCN A; 2RJE A; 2DIQ A; 3A8G B; 2JZ2 A; 1NE8 A; 1PWT A; 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