The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
95
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structure length |
95
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Chain Sequence |
QGHMDLICMYVFKGEESFGESIDVYGDYLIVKVGTEFLAVPKKSIKSVEDGRIVIGEFDEEEARELGRKWLEEKSKPVTLEELKSYGFGEEGEGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution NMR structure of proterin AF2094 from Archaeoglobus fulgidus
rcsb |
| molecule keywords |
Uncharacterized protein AF_2094
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| source organism |
Archaeoglobus fulgidus
|
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| total genus |
18
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| structure length |
95
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| sequence length |
95
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-06-15 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KK4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4HVU A; 1Q7Y U; 4NS5 A; 3GLX A; 1JXM A; 3HRS A; 1YCS B; 5IT9 E; 4EIK A; 3NPF A; 4KH0 B; 2KR3 A; 5GMK e; 3GIB A; 4PJN A; 1QCO A; 4EMK C; 3OS0 A; 4C0G A; 4BE0 A; 5KE3 A; 2VWF A; 1UB4 A; 5GAM j; 1U3O A; 3VUZ A; 2KT8 A; 1UGQ B; 3CMA Q; 2PTK A; 2ZPE B; 1RAH B; 2FPD A; 3JCM h; 3CCJ Q; 3CC2 Q; 3CCS Q; 3JB9 F; 4FYX B; 2HSE B; 1PKT A; 5LJ3 h; 5GAN 4; 3REB B; 3LH0 A; 3MEU A; 1QWF A; 2X9H A; 4LDX A; 1MUZ A; 1TSF A; 1N8R C; 4FYY B; 1OEB A; 2RJE A; 2ABL A; 2DBM A; 1VQP A; 2DRK A; 4DBR A; 2XDB A; 1RAI B; 2JM8 A; 3QBY A; 2O9V A; 3CCR Q; 1QP2 A; 3JCM J; 1WNL A; 1IHW A; 5CQX A; 4ELZ C; 5DY9 A; 3I35 A; 3V7S A; 4QVC A; 3CC7 T; 3I55 Q; 2DEU A; 2KNB B; 4M75 G; 2OTL A; 2LCC A; 4LUE A; 3SDZ A; 4GLM A; 2P4T A; 4HCC A; 4C92 A; 4BUG A; 3BE3 A; 2JNG A; 2RJD A; 3OW2 A; 1YHQ A; 4EMG A; 1LVK A; 2K57 A; 1M90 U; 1M8V A; 1S1N A; 4RKU E; 2DMO A; 1KIK A; 4DEX A; 4M7D F; 3OYL A; 1QVG A; 1VQM A; 5KYN A; 1ARK A; 2CKK A; 4KBM B; 4J6X A; 3V8K A; 4M77 D; 1MGQ A; 1MNE A; 2K3X A; 3NTI A; 1FWZ A; 1SSH A; 1NPP A; 2D1X A; 2F1L A; 3D7S B; 5J26 A; 3CXC A; 1RAB B; 4CC2 A; 3EGD A; 5FWB A; 3SHW A; 2K5I A; 3H41 A; 5LJ5 g; 4ZTF A; 2DYB A; 2LJ1 A; 1M2O A; 1KD1 U; 2VYT A; 3KUF A; 4R55 A; 4EDU A; 4EPC A; 2CZ1 B; 3OSV A; 1TWB A; 2KYM A; 2LMJ A; 2KSS A; 4M4Z A; 2DVE A; 4A54 A; 2BUD A; 4E7Z A; 5GAN j; 2LRQ A; 1KG1 A; 3J81 E; 2G3R A; 1WI7 A; 4JPB W; 5FW9 A; 4J9G A; 4EMK A; 5LJ5 f; 1EZZ B; 5EC7 A; 4BI8 B; 4DBF A; 1QP3 A; 2Y4X A; 4FW2 A; 1AD5 A; 2FPE A; 2NLU A; 3JB9 G; 3M9Q A; 5KYU B; 2DA9 A; 1QVG P; 3C12 A; 4A4E A; 2L5Q A; 4M7D A; 4B6M A; 1PD1 A; 4F7U B; 2ROL A; 2DL5 A; 1YI2 T; 3EG9 A; 1RUW A; 3RKX A; 1VQK T; 4HT9 A; 3GPL A; 1NJI C; 3CCV Q; 1VYT A; 2FRY A; 2K6D A; 3QII A; 3G71 T; 3S3M A; 2LQW A; 1AWX A; 3T9N A; 3CCL A; 4AFU C; 2VUB A; 4BDZ A; 2JOY A; 1YJN A; 2CZ6 B; 2K5L A; 2KI7 A; 3H0F A; 4M78 D; 1ZBX A; 2FL7 A; 1D1C A; 1O9S A; 2R5M A; 4J8O A; 1WX6 A; 1B3Q A; 4C0Z A; 2DL3 A; 1UDL A; 2VAS A; 3QZ9 B; 1BIA A; 3L2V A; 3EG0 A; 4CC4 B; 2RN8 A; 2DM1 A; 5CKE A; 1I8F A; 3OBW A; 2D0Q B; 2D8H A; 5C0M A; 4RUG A; 1I5L A; 2LCS A; 2M0Y A; 2FO0 A; 3KBG A; 2ZPH B; 1IO6 A; 2ZPG B; 1EFN A; 3FJP A; 1I5O B; 3QWY A; 1VQ5 T; 4WTO B; 1B7T A; 1UEC A; 1BI3 A; 2KRO A; 4EMH A; 4Y91 A; 2D8J A; 1VOM A; 4OP0 A; 3M0R A; 2KXC A; 2HL3 A; 3QO3 A; 4L59 A; 4J9I A; 1VQO A; 5CCA A; 4PJO F; 4FYW B; 2RJC A; 4QW2 A; 8ATC B; 1XNI A; 3JCM V; 2V1Q A; 1Q86 C; 4IUQ A; 2ENM A; 3MEA A; 3URG A; 3OYH A; 2E65 A; 4XU2 A; 7AT1 B; 1K8A U; 1UUE A; 1M1F A; 2QDY B; 4J6Y A; 5ECA A; 2FG0 A; 3DB3 A; 1GFC A; 2KDS A; 5EG2 A; 2DF6 A; 2P84 A; 2CGH A; 2L2P A; 3E9F A; 2QQ9 A; 5LJ5 e; 4XQ3 A; 3PMT A; 3S6W A; 1G83 A; 2CT4 A; 5D6Y A; 3OYF A; 3CCM A; 4ATO A; 2O2O A; 2JTM A; 1IHV A; 3M57 A; 2E6N A; 2XIC A; 2M51 A; 4UC4 A; 2LQN A; 3SD4 A; 4CRI A; 3CC4 T; 1WXT A; 2RHZ A; 4E7K A; 1I4K 1; 4BI3 A; 2J05 A; 5KCH A; 1H92 A; 1M3C A; 2J06 A; 2GQI A; 5IHK A; 2HQH A; 1GBQ A; 2E6Z A; 4XTX A; 4C5I A; 2EGE A; 1JXO A; 4OMM A; 2DNU A; 5IXF A; 2NWM A; 5KH6 A; 2RQW A; 1K73 U; 1G8X A; 2LC4 A; 3RNJ A; 1WXB A; 5KYU A; 1V76 A; 4RTV A; 1WXU A; 2LNV A; 4RCC A; 4F7U A; 3O8V A; 2RI3 A; 1VQ9 T; 2ESW A; 2VGN A; 3JCM Q; 1OX9 A; 2OTL Q; 2MAM A; 1EX4 A; 3GF5 A; 3JV3 A; 3U23 A; 1M5Q 1; 4DQ2 A; 3MEW A; 3V8J A; 4QKU A; 3HRU A; 4O6J A; 1YHQ Q; 2DTH A; 2D9T A; 1WHJ A; 3E2U A; 3RMQ A; 2P0K A; 4C8Q B; 2CDT A; 2ZZD A; 4MML A; 1WQW A; 4J9D A; 1R0B G; 3OYN A; 2LT4 A; 3CCJ A; 1VQL T; 5I21 A; 2C06 A; 3P8H A; 1M1G A; 2QTV A; 3QKJ A; 1T3S A; 1W2B S; 1SHF A; 2KRM A; 5DLO A; 5FRN A; 1ZA1 B; 4PJO G; 3VS2 A; 1VYU A; 1FMK A; 2VB6 A; 2DE0 X; 1QWE A; 2VVK A; 1X6O A; 2QYZ A; 2YUP A; 3SB2 A; 4OMO A; 9ATC B; 4LD6 A; 3CCR A; 5GMK m; 2HZY A; 3E1S A; 1PNJ A; 2IG0 A; 2FVU A; 1PWT A; 3R6N A; 1RL2 A; 4C92 D; 3NTK A; 2FZK B; 1WFW A; 4C8Q C; 3M4G A; 4PKC C; 2RJF A; 4IUR A; 3RDV A; 1RAD B; 1H64 1; 5A0L A; 1OI1 A; 2CP5 A; 5GAN 8; 2QA4 T; 3TEE A; 3I55 A; 1YIJ T; 1Q86 R; 4V2S A; 3FEO A; 1YJ9 T; 2YHT A; 3MP1 A; 2F5K A; 1G2B A; 2HD0 A; 3V8L A; 2LQ8 A; 2RI5 A; 1M27 C; 1BIB A; 1ZUY A; 5GMK j; 1KQS P; 4M7A E; 2X51 A; 3QPH A; 3REA B; 1WIE A; 4JLI A; 1H3Z A; 3HP9 A; 2XDP A; 2GTO A; 3UAT A; 3CCU A; 4M78 E; 4M75 B; 3CEY A; 3I56 T; 5GJV B; 1D0Z A; 1QCN A; 3CCL Q; 4OB3 B; 1YJN Q; 1WDX A; 3M59 A; 4DA4 A; 4ZGE B; 2J7I A; 4AFZ C; 4IUP A; 1VQ4 T; 5KYY B; 1B34 B; 3Q1J A; 3L2R A; 1K1Z A; 2ED0 A; 5GAN 2; 4D8K A; 2HQX A; 2CP6 A; 2L89 A; 1AWO A; 1Q82 C; 4M7D D; 1FMV A; 4LDV A; 2ZAE A; 1YFN A; 5HKC A; 1TG0 A; 4M75 C; 1UFF A; 1IRX A; 2CT3 A; 1R8O B; 3VS3 A; 1JB0 E; 4FL6 A; 5CIU A; 3JCM g; 3CD6 A; 4PLI A; 3HHT B; 5FU7 B; 5AT1 B; 5LJ3 g; 2A7Y A; 5GAN 6; 2BZ8 A; 4OF1 A; 2P0P A; 2M16 A; 2LJ3 A; 2VXE A; 5KYX B; 3CCV A; 2RH2 A; 4LDW A; 5LJ5 d; 1VQ8 A; 3PVL A; 4DBH A; 2EQI A; 3I5R A; 2EJF A; 4DOV A; 3M0P A; 1ACM B; 4ZGJ B; 5I11 A; 3JCM f; 2YLC A; 1KQ1 A; 1GBR A; 1JEG A; 5LJ3 f; 4C8Q A; 4WF2 A; 1PKS A; 2RA2 A; 2EQK A; 4D6W A; 1ABO A; 4YTL A; 2PUO B; 3QUI A; 1WPY A; 2CP2 A; 3JRZ A; 5FU7 C; 1W70 A; 1Q81 U; 2EVR A; 1QVP A; 4DBQ A; 2EBP A; 4M7A G; 1SEM A; 1AOJ A; 1Y96 B; 5CQY A; 1K9M U; 3H6Z A; 1YBY A; 1M1K C; 3CCE T; 3G4S T; 4BDY A; 2YLB A; 2COW A; 1OPK A; 3O5Z A; 3CCM Q; 4PFO A; 3I5S A; 3WXM B; 5CKB A; 3PMI A; 2DXU A; 4R0K A; 4JRP A; 4LDY A; 3X24 B; 4R56 A; 1GL5 A; 3EGU A; 1T0H A; 2JS0 A; 3OS2 A; 2EYX A; 4C5H A; 2NUP B; 4IKF A; 1QLY A; 1SHG A; 2DEQ A; 2KE9 A; 3QWX X; 4X34 A; 2B86 A; 2CRE A; 1JU5 C; 3A5Z B; 1NBE B; 1Z9Z A; 4M7D B; 2EYZ A; 3TSW A; 4E6R A; 2GQV A; 5GAO r; 3JCM b; 3L42 A; 3JCM W; 3VJP A; 1UGV A; 1PSF A; 2M1H A; 2DYI A; 5CK9 A; 4J9E A; 4LNP A; 1D09 B; 2E3H A; 2XDD A; 4M75 A; 3JCM c; 1Y0M A; 3G6E Q; 2QGG A; 3QZ5 B; 1T0J A; 2LX7 A; 1AZE A; 1Q82 R; 1M9S A; 1E6H A; 2RHX A; 2DTI A; 3J80 E; 1OUL A; 4M7D C; 2MK5 A; 5KYY A; 1ZSG A; 1B34 A; 1RAC B; 3QDR B; 4JUV A; 4FM4 B; 3RKW A; 2X4Y A; 1M30 A; 4FSS A; 4X9C A; 3S3N A; 2J6K A; 4C92 E; 2JMA A; 2C0I A; 2A28 A; 4CI0 C; 2AKL A; 3JCM e; 2RO0 A; 2L0A A; 2HBW A; 5LJ3 e; 3ASK A; 1OYX A; 4HVV A; 1WA7 A; 3VUB A; 1BCO A; 4JS5 A; 1YJW T; 1HJD A; 4RCB A; 3EG2 A; 2CYZ B; 3JB9 J; 4QT7 A; 2RHU A; 3C0C A; 5KYX A; 2BIV A; 3L2Q A; 1FX7 A; 4RTZ A; 2KEA A; 1VQP T; 1ZUK A; 4MZP A; 4L5G A; 2LT1 A; 2H3J A; 2KYB A; 1VQ7 T; 2LX9 A; 4FIB A; 1M3B A; 3MET A; 5LJ5 j; 4MDX A; 1R77 A; 4NOY A; 4OGE A; 2V8K A; 1Q95 G; 1M1K R; 1AEY A; 2KVQ G; 3EGX B; 2OX7 A; 4KGX B; 2A3L A; 5GAN 7; 3CCU Q; 1JQQ A; 2E4H A; 1SSF A; 1M3A A; 1Q7Y C; 4ZN3 A; 1W6X A; 1Y96 A; 2HQE A; 2JN0 A; 3M0S A; 2O31 A; 4E7L A; 2YUQ A; 3CPF A; 2F2V A; 2EYW A; 1EIF A; 3JCM P; 2BZY A; 4J83 A; 2DXC A; 2KAF A; 1MMG A; 2CZ0 B; 1VQM T; 3OW2 P; 4JJN K; 4PJO B; 1YI2 A; 2NUP A; 3QDF A; 1GCP A; 2PU9 B; 4QVZ A; 2HNI A; 4RG8 A; 1PD0 A; 4QVD A; 4J7F A; 1CKB A; 2K3B A; 3CD6 Q; 3OW2 S; 4FCY A; 1AVZ C; 4J5Y A; 3X25 B; 2YRC A; 4F04 B; 1MMN A; 2HMA A; 2JW4 A; 5GJW B; 4C0D B; 5AYF A; 1QVG S; 3CCQ A; 4BI4 A; 2LTO A; 1NEB A; 2KXD A; 3CXC P; 3EHR A; 1VQ8 Q; 1HYO A; 2K3Y A; 1TH7 A; 5CKH A; 2JT4 A; 2R57 A; 4BAC A; 1QQJ A; 2CUB A; 4PJO C; 4RTU A; 1N8R R; 1S72 Q; 2CS7 A; 1KK7 A; 2CSI A; 3FIF A; 3INZ A; 2ZPB B; 1QKX A; 2ATC B; 1KC8 U; 3M55 A; 2OJ2 A; 3CXC S; 1M90 C; 4JJC A; 4MZT A; 5IAY A; 3VRZ A; 4JRQ A; 3HPW A; 1NPR A; 4RTX A; 1CSK A; 4OMQ A; 5GAM h; 4CC7 A; 2MCN A; 1VQ5 A; 4C0D C; 1ZUU A; 5CKF A; 3HL8 A; 3QG1 A; 1H3H A; 2DLP A; 1YWO A; 2JTE A; 1B07 A; 2Y4Y A; 1D1B A; 1KD1 C; 1BI1 A; 3HKS A; 3CPW A; 3OS5 A; 3X28 B; 1Y71 A; 2V8I A; 1YIT T; 4C8Q D; 3EFS A; 1IB8 A; 4QQ6 A; 1OZ3 A; 3M0U A; 1U1T A; 4FT2 A; 3DB4 A; 3EH1 A; 2MIO A; 4HT8 A; 2JMC A; 1BU1 A; 2DZC A; 1Q7Y R; 3VS5 A; 4F17 A; 1C0M A; 4XK8 E; 3UWN A; 1V1C A; 2YRV A; 2MOX A; 1GFD A; 2COZ A; 3EGX A; 1VQ6 T; 1MMD A; 2HSP A; 3CME T; 3TQ7 P; 2MWO A; 3RBB B; 2E3I A; 2DET A; 2KY9 A; 2IIM A; 4HA8 A; 5LJ5 h; 2K2V A; 1VQN T; 3RKY A; 4CC3 A; 1G3W A; 1TS9 A; 5LJ3 d; 4JRI A; 3CC4 A; 1WYX A; 2GBQ A; 1VQO T; 5DLQ E; 4A53 A; 5KCO A; 1NZ9 A; 2OTJ T; 1WHM A; 3CPW P; 4F7U E; 1UG1 A; 2K79 A; 1NYF A; 3BW1 A; 2XMF A; 3RMS A; 3UT1 A; 3GP8 A; 2SEM A; 2L3S A; 2E41 A; 2EJG A; 2AKK A; 3CC7 Q; 1IGQ A; 2QEX A; 4N4I A; 4M7A B; 4PJO A; 1VQ9 A; 1RI9 A; 2CH4 W; 1NJI R; 3NTH A; 3E9G A; 3SWN B; 4AFQ C; 4KUD K; 3A98 A; 4PNO A; 3A8O B; 3A8M B; 4M75 D; 5GAN h; 2GTJ A; 1WHG A; 1H8K A; 4A4H A; 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1JJ2 A; 1G3T A; 2LJ0 A; 5GAN 5; 1D1A A; 2QI2 A; 2CSQ A; 4JDS A; 4OML A; 2M9U A; 4A4K A; 3IQL A; 2RF0 A; 2W10 A; 1RI0 A; 3VV0 A; 4LDU A; 2MMP A; 2EFI A; 5HCK A; 1RLQ C; 1M4Z A; 3H0I A; 5LJ3 j; 4IUT A; 5IH2 A; 1WHH A; 4M77 G; 1VQ5 Q; 4L6V 5; 5J3B A; 2ECZ A; 1RAG B; 4MDW A; 4M7A A; 4HCK A; 2A0F B; 1KHI A; 2EKH A; 3QYH B; 2D6F A; 3SWN A; 4ZNX A; 3LGL A; 1UHC A; 2QQA A; 2GFA A; 3GNG A; 2E5Q A; 3UF4 A; 2DTO A; 1N6A A; 2RB6 A; 2B8A A; 4PK4 A; 2A37 A; 2JS2 A; 4JJB A; 5CR2 A; 4F16 A; 1PRL C; 1QVF A; 3OMG A; 2LCL A; 1K8A R; 1S72 A; 2E1H A; 4N0A C; 4Z8A A; 1HXD A; 5CAI A; 2DK3 A; 4XTY A; 3VS4 A; 1PM3 A; 1VA7 A; 3G4S A; 4PLL A; 2GFU A; 4E7H A; 2G6F X; 2EW3 A; 2DER A; 3M0Q A; 4KUL A; 3AHU A; 2C0T A; 4J9B A; 2HDA A; 1GRI A; 2EYQ A; 5I22 A; 4Z89 A; 2QK0 A; 1MV0 B; 3CCV T; 3CC4 Q; 1GXI E; 2HKN A; 1RAA B; 3HFN A; 3ZFJ A; 5FRM A; 1GCQ A; 2YDL A; 2K7A A; 4M78 G; 3ZEH A; 2LDM A; 4KGV B; 2F69 A; 4LN2 A; 4Y28 E; 5LL6 S; 5FU6 B; 1X2Q A; 3GNF B; 4AFS C; 2DAQ A; 1U1S A; 4RTW A; 3OSS C; 2SRC A; 5CO7 A; 3A8L B; 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