The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
67
|
structure length |
67
|
Chain Sequence |
b'GSMSTSELKKVVALYDYMPMNANDLQLRKGDEYFILEESNLPWWRARDKNGQEGYIPSNYVTEAEDS'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
BRUTON'S TYROSINE KINASE
|
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain from Bruton's tyrosine kinase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
|
| total genus |
5
|
| structure length |
67
|
| sequence length |
67
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1997-10-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1BBZ A; 4Z8A A; 3QWX X; 3VS2 A; 2DNU A; 2KGT A; 3M0R A; 2NWM A; 2KRS A; 2IIM A; 1BK2 A; 4J9C A; 2ROL A; 3I5S A; 2BZY A; 3UAT A; 1NEG A; 2HDA A; 1V1C A; 3THK A; 4J9D A; 2RMO A; 4ESR A; 2DL4 A; 1G2B A; 3VRZ A; 4IIM A; 2RNA A; 1GFC A; 2D8H A; 1FYN A; 2HCK A; 1MV3 A; 3RNJ A; 1AWX A; 1WIE A; 1QWF A; 1NLO C; 2VVK A; 4RTZ A; 1K0S A; 1ZX6 A; 1X43 A; 2OI3 A; 5GJW B; 1UGV A; 2KYB A; 3PE0 A; 5IHI A; 2EKH A; 2PNI A; 1ZSG A; 2AKK A; 2DRM A; 4KRT A; 2YUO A; 3H41 A; 1MUZ A; 3I35 A; 4LE9 A; 4JPB W; 4Z88 A; 1W1F A; 3JV3 A; 4QT7 A; 4F16 A; 2FPD A; 4GLM A; 2DF6 A; 2NUZ A; 1NEB A; 1QLY A; 2F2V A; 4J9H A; 2DX1 A; 2MOX A; 1B3Q A; 2DL3 A; 2LQN A; 3CQT A; 1N5Z A; 2P4R A; 2KRM A; 4J9I A; 3VS1 A; 2LQW A; 1NG2 A; 1JQQ A; 1YWO A; 2ED1 A; 3VS4 A; 4LUD A; 1NYF A; 2KXC A; 4E6R A; 1T3S A; 3M0T A; 1SHG A; 2GNC A; 1Z9Q A; 1PHT A; 2JW4 A; 1HSQ A; 3TSW A; 2RPN A; 2X3W D; 2GGR A; 3VS5 A; 1WX6 A; 2J6F A; 2D0N A; 3QWY A; 1WXT A; 4OMN A; 3SHW A; 2CT3 A; 1Z9Z A; 1X27 A; 4IIO A; 3NGP A; 1AWW A; 2AK5 A; 2CSI A; 1NLP C; 1TG0 A; 3PVQ A; 3I5R A; 2W0Z A; 4FSS A; 1JXO A; 3EG2 A; 1KJW A; 2LZ6 B; 1NM7 A; 1ZBJ A; 2KT8 A; 4HVU A; 3M0Q A; 2YT6 A; 1GBQ A; 2BZ8 A; 2GTO A; 1GL5 A; 2ESW A; 4AFU C; 1RI9 A; 2E5K A; 2AKL A; 2LJ0 A; 4CC3 A; 1J3T A; 2A08 A; 2K79 A; 1PRM C; 1YNZ A; 3VS6 A; 1B07 A; 1HD3 A; 2KRO A; 3O5Z A; 4HCK A; 2AZS A; 2EGC A; 2G6F X; 4OMO A; 2JT4 A; 1UFF A; 1TUC A; 2D8J A; 1SEM A; 2RQR A; 3ZL7 C; 1AZE A; 4OMQ A; 2L0A A; 3EGU A; 1VYV A; 1I0C A; 2DL8 A; 1UJY A; 1JO8 A; 2FEI A; 2W10 A; 1WLP B; 4RTU A; 2SRC A; 5IXB A; 4D8K A; 2JM8 A; 4ORZ A; 3A98 A; 2YUQ A; 2J6K A; 4J9B A; 1WI7 A; 1QKW A; 4EIK A; 2ED0 A; 2BTT A; 1QKX A; 2RQV A; 1JU5 C; 1ZUK A; 1IO6 A; 2KYM A; 4AG2 C; 1S1N A; 2OAW A; 1BB9 A; 2JM9 A; 4JZ4 A; 5EC7 A; 5HCK A; 2LJ3 A; 2O88 A; 4AG1 C; 4ZNX A; 4RTY A; 2K2M A; 1U3O A; 2CRE A; 2RF0 A; 4DEY A; 2KNB B; 5L23 A; 3RBB B; 2DL7 A; 3EG0 A; 1E6H A; 1OEB A; 4JZ3 A; 1A0N B; 1SPK A; 2RQT A; 3VRY A; 3GBQ A; 3NPF A; 2O9V A; 1K4U S; 1WDX A; 2VKN A; 4CC4 B; 2MIO A; 1SHF A; 1UG1 A; 2GQI A; 2L3P A; 3PVL A; 1OV3 A; 1LCK A; 1VYU A; 2YDL A; 3VS7 A; 2FO0 A; 1EFN A; 3KFV A; 2M51 A; 2XMF A; 2I0N A; 2DA9 A; 2V1Q A; 1AD5 A; 2CH4 W; 4R0K A; 4J9G A; 1WXU A; 2EYX A; 4D8D A; 1AOJ A; 1QCF A; 4RTW A; 2KE9 A; 4CC7 A; 1M3C A; 2HEQ A; 2GTJ A; 2BZX A; 4RTV A; 1HJD A; 2ECZ A; 1K9A A; 4HXJ A; 1CKB A; 1YCS B; 2DBK A; 3UA6 A; 2DLP A; 2LJ1 A; 1RLQ C; 5FWB A; 5IXF A; 1TUD A; 1AWO A; 1ABO A; 2O2O A; 4JJD A; 2GBQ A; 3REB B; 4HVW A; 2JXB A; 2O9S A; 1E7O A; 2J6O A; 1M3B A; 1U06 A; 2PZ1 A; 2J7I A; 3H0H A; 3C0C A; 1Y57 A; 4AFQ C; 2EQI A; 1RUW A; 3NHN A; 1U5S A; 1VA7 A; 2DE0 X; 1UTI A; 1FMK A; 1UJ0 A; 1ZUU A; 2J06 A; 4CC2 A; 1NYG A; 4Z89 A; 3R6N A; 1AEY A; 3UA7 A; 1OOT A; 3ULR B; 2CT4 A; 4F17 A; 4OMP A; 1UDL A; 4M4Z A; 3U23 A; 1KSW A; 2FG0 A; 1WYX A; 5IHN A; 1QWE A; 1WFW A; 2EVR A; 1KIK A; 2O31 A; 2EYZ A; 3UF4 A; 2DIL A; 2A37 A; 1ABQ A; 2SEM A; 3REA B; 2RQW A; 2K7A A; 2YUP A; 3EG1 A; 1ZUY A; 1AVZ C; 1AWJ A; 3H0F A; 3LH5 A; 2K9G A; 3H0I A; 1X69 A; 2KT1 A; 1JXM A; 4JJB A; 3IQL A; 2K3B A; 1SRL A; 1T0J A; 2A36 A; 3EHQ A; 2EBP A; 5FWC A; 4OMM A; 2EGA A; 2B86 A; 1WXB A; 4Y92 A; 2YUN A; 2EGE A; 2LMJ A; 1Y0M A; 3FJ5 A; 3M0P A; 2EPD A; 4HVV A; 2CH4 A; 1X6G A; 1T0H A; 2C0T A; 2DYB A; 1CSK A; 2EW3 A; 4OML A; 1K1Z A; 2KXD A; 1M3A A; 2DVJ A; 1ARK A; 2F2W A; 1W6X A; 1UHF A; 4LN2 A; 1JEG A; 2JMA A; 3VS3 A; 4J9F A; 1YWP A; 2LCS A; 2L2P A; 2DMO A; 4A63 B; 3M0U A; 2DRK A; 1GBR A; 1T3L A; 3VS0 A; 1H8K A; 5GJV B; 2RQU A; 1WA7 A; 2QDL A; 4RUG A; 1X6B A; 2D1X A; 1X2K A; 1W70 A; 2HBW A; 2YSQ A; 1BU1 A; 4RTT A; 1CKA A; 2CUB A; 1M27 C; 2DJQ A; 2DM1 A; 1UEC A; 2JTE A; 1MV0 B; 2X3X D; 3EG3 A; 2AZV A; 4DEX A; 5I11 A; 4K11 A; 5IHK A; 1OPK A; 4LUE A; 1VYT A; 2JMC A; 2MCN A; 4AFS C; 1YP5 A; 1I07 A; 1RLP C; 1GRI A; 2C0I A; 1UHC A; 2CSQ A; 2KBT A; 2V1R A; 5IH2 A; 2ROT A; 2ENM A; 1GCP A; 1M8M A; 4AFZ C; 1SSH A; 2J05 A; 4X1V A; 1GFD A; 4JJC A; 2LNH B; 2FRW A; 1SRM A; 2DL5 A; 3M0S A; 4WCI A; 1PRL C; 2HSP A; 3EHR A; 3TSZ A; 1K0X A; 1YN8 A; 2LP5 A; 2C0O A; 2K6D A; 4GBQ A; 2CDT A; 1ZLM A; 1PWT A; 2KRN A; 1UUE A; 1GCQ A; 2F2X A; 1K76 A; 2ABL A; 1GCQ C; 2DBM A; 2LX7 A; 5ECA A; 1AZG B; 5FW9 A; 1I1J A; 4F14 A; 1PNJ A; 2FPE A; 1H3H A; 4J9E A; 1PKS A; 2JS2 A; 2OJ2 A; 2CUD A; 2A28 A; 1UE9 A; 2EYW A; 1E6G A; 2RN8 A; 2PTK A; 2KR3 A; 1X2Q A; 2FRY A; 4LNP A; 3I9Q A; 3SEM A; 2M0Y A; 2EYY A; 4RTX A; 2KEA A; 3TVT A; 1H92 A; 1G83 A; 2L3Q A; 1XOV A; 2H8H A; 1M30 A; 2VWF A; 1KFZ A; 5I22 A; 1OPL A; 1PKT A; 2L3S A; 3NMZ C; 2FPF A; 2JS0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1BBZ A; 2RI2 A; 2DNU A; 2FL7 A; 4OMF B; 5A0G A; 2NWM A; 4M75 A; 1BK2 A; 4J9C A; 3I5S A; 1NEG A; 2E12 A; 1V1C A; 1R8O B; 4Y28 E; 5LJ3 h; 4J9D A; 1Q81 R; 2K3X A; 4JRP A; 2DL4 A; 4F7U A; 4ANJ A; 3C95 A; 2MWP A; 4OF1 A; 2AIR B; 2DD5 A; 4IIM A; 4TVR A; 1BIA A; 4X34 A; 2RNA A; 5LJ5 e; 2EQK A; 3RNJ A; 4A54 A; 4DA4 A; 1P92 A; 2D9T A; 1X43 A; 4C5H A; 2OTL A; 1IB8 A; 2EKH A; 3OMC A; 4PLL A; 1VQO T; 2HBP A; 3Q1J A; 2YRV A; 2ZCF B; 2DRM A; 2JN0 A; 4KRT A; 3SFM A; 2MMP A; 2P0Q A; 2L89 A; 3CC2 A; 4LE9 A; 4F16 A; 4MML A; 3OYB A; 2ZGW A; 3OQ5 A; 1QVG S; 2DX1 A; 2MOX A; 2LRQ A; 5LJ3 f; 2LQN A; 1VQ7 Q; 2OTJ T; 2JNG A; 3MCA B; 3VS1 A; 2LQW A; 1NG2 A; 3UDC A; 2QK0 A; 4M78 B; 3C94 A; 4IKF A; 2F69 A; 2RHX A; 3CCU A; 2X3W D; 3CCQ T; 3VS5 A; 1YIT A; 2J6F A; 4O6J A; 1MHN A; 1Z9Z A; 2QG9 B; 1W2B P; 2E70 A; 2XDD A; 1S72 T; 1KHI A; 4Z02 A; 2CGH A; 2PU9 B; 2HL3 A; 1M90 R; 1JXO A; 3EG2 A; 2EJ9 A; 4PJO B; 1KJW A; 2LZ6 B; 3CCS T; 2HD0 A; 4HVU A; 3M0Q A; 1GBQ A; 2GTO A; 1GL5 A; 4N4G A; 3VYH B; 2AKL A; 3CCV Q; 2MI6 A; 3M9Q A; 4M7D A; 1N8R U; 4BB7 A; 1YNZ A; 2MPX C; 1B07 A; 3O5Z A; 3RUX A; 2AT1 B; 1VQP T; 2EGC A; 4OMO A; 2L0A A; 5KCH A; 4N4H A; 3G71 T; 3EGU A; 2DL8 A; 1YJW Q; 2RJF A; 1VQM Q; 4QW2 A; 3M57 A; 3INZ A; 3CEY A; 5J26 A; 5GAN 2; 1YIJ A; 2IPO B; 3CCR A; 3S6W A; 2ED0 A; 1QKX A; 2WAC A; 5C6S A; 1Q82 U; 3QDR B; 2COW A; 1IO6 A; 2H3J A; 3JB9 H; 2KYM A; 4FYX B; 4AG2 C; 2QYZ A; 4M78 F; 1XJW B; 4A4F A; 4AG1 C; 1NJI U; 4ZNX A; 2CRE A; 4M77 G; 4DEY A; 3L2V A; 3CC4 T; 1QCN A; 3EG0 A; 2V8I A; 1E6H A; 3X20 B; 1ZBX A; 5CAI A; 1OEB A; 4RCB A; 1SPK A; 2WSE E; 3VRY A; 4X9D A; 1VQK A; 2O9V A; 1K4U S; 5AYF A; 2HSE B; 5DY9 A; 2MIO A; 4PJO D; 1UG1 A; 3BE3 A; 1QVG A; 1I5L A; 1KQS A; 2BIV A; 2YDL A; 4PJO F; 4C0F A; 2RI5 A; 2FO0 A; 5HK3 A; 3KFV A; 2NUT B; 2XMF A; 4C8Q G; 3OYM A; 4XU3 A; 1VQ8 T; 4FSX A; 3AT1 B; 2V1Q A; 3OYN A; 1RAG B; 4J9G A; 4M77 D; 4RTW A; 5GAM h; 5GAN h; 3JB9 G; 1M3C A; 3MP8 A; 4FU6 A; 2M02 A; 2BZX A; 2XIC A; 4BI4 A; 3SWN B; 4HXJ A; 1I8F A; 2VC8 A; 1RAB B; 2V8J A; 3LLR A; 1KHC A; 2DLP A; 2XU8 A; 3M4G A; 3BFM A; 2IG0 A; 4BDY A; 2X51 A; 3SDZ A; 5AT1 B; 1HK9 A; 2E3H A; 4HVW A; 4C5I A; 4KT0 E; 4J83 A; 3MEV A; 5IN1 A; 1YJ9 Q; 2EIF A; 2AHJ B; 2FHD A; 5IAY A; 3JB9 D; 2J7I A; 1VQN Q; 3CPF A; 3CXC S; 2QA4 Q; 2VYT A; 2DTH A; 2DJZ A; 4DBF A; 3A8O B; 2PUO B; 1VA7 A; 1UTI A; 2FYK A; 2M9U A; 4BI3 A; 2J06 A; 2COY A; 4Z89 A; 5GAM f; 3PGG A; 5GAN f; 1YI2 T; 1R0C B; 4M7D C; 3ULR B; 2CT4 A; 4OMP A; 3M55 A; 4EDU A; 2JZ2 A; 2NUP A; 2YXY A; 3MEU A; 4PK4 A; 5IHN A; 4BI8 B; 3A5Z B; 4XAX B; 4Y91 A; 3G4S Q; 2XDB A; 2EVR A; 1WJS A; 2EYZ A; 1Y96 B; 3ZFJ A; 1H64 1; 1AT1 B; 1W2B S; 3REA B; 2YUP A; 4C92 B; 1G3Y A; 2QQB A; 1JXM A; 2KAF A; 1VQ5 A; 5LJ5 h; 1VQ4 T; 5KYN A; 2K4Y A; 3FIF A; 1WXB A; 4JRQ A; 4M7A B; 5L8R E; 2YUN A; 5GMK m; 3FJ5 A; 3FB9 A; 2X4Y A; 4LXC A; 1KD1 C; 2CH4 A; 2EW3 A; 2D6F A; 2CZ6 B; 5I2S A; 2KXD A; 2BUD A; 1M3A A; 1C1A A; 4LN2 A; 1BI1 A; 3HL8 A; 1K8A U; 2ZPI B; 5DLQ E; 4N0A C; 1KQ1 A; 3QDF A; 1C6V X; 1IGQ A; 2RI3 A; 2LCS A; 3CMA Q; 2OTJ Q; 2DRK A; 5KH6 A; 3T9N A; 2LT4 A; 2QEX T; 1D1B A; 5GJV B; 4E47 A; 4KUI A; 3CCE T; 1UGR B; 2D1X A; 4LDV A; 4BD3 A; 3JAM E; 3V8K A; 3TEE A; 4HKE A; 2CUB A; 1H3Z A; 2DJQ A; 1S72 Q; 3EG3 A; 2AZV A; 5I11 A; 4K11 A; 4FT2 A; 3M5A A; 2CP6 A; 2KVQ G; 2MCN A; 5FLX E; 3I55 T; 3PT9 A; 2A7Y A; 1K9M C; 4FYW B; 4C92 D; 3OSV A; 4C5E A; 1UHC A; 1M2V B; 3E9F A; 4XTU A; 1QP3 A; 3TU4 K; 4C92 F; 2L3R A; 2E4H A; 4M7A D; 1SSH A; 4PJO A; 4NL2 A; 1GFD A; 3EGD B; 3MJX A; 2PQW A; 4M7A F; 2DL5 A; 2MWO A; 1Q86 R; 2HSP A; 4E7J A; 2LCL A; 4PJM A; 1M1K C; 3OA6 A; 1RAF B; 3FLG A; 1K76 A; 2MAM A; 2ABL A; 2LT1 A; 5DM7 R; 3PIO A; 3FRN A; 5ECA A; 4J5Y A; 2JVV A; 4F14 A; 5KYX B; 1W2B A; 4FYV B; 1QP2 A; 3WVE B; 3OYK A; 3JCM e; 4J9E A; 5LJ3 g; 1OU9 A; 2DO3 A; 1G3T A; 4CRI A; 2OJ2 A; 4FCY A; 1Q81 U; 4IUV A; 2A0F B; 2EYW A; 3I9Q A; 3SEM A; 1U1S A; 2DAQ A; 2XDP A; 2HNI A; 1Y07 A; 2H8H A; 3LX7 A; 1QVF S; 3OYD A; 1OPL A; 5GAO p; 1PSF A; 4YTL A; 3CME A; 4XU0 A; 2CZ7 B; 2KGT A; 1MNE A; 3M0R A; 3HP9 A; 2KRS A; 2IIM A; 2CP5 A; 2DD4 A; 3HSB A; 3HRS A; 2GFU A; 4XTY A; 2DEU A; 2BZY A; 3UAT A; 2HDA A; 3THK A; 3JCM b; 4NOY A; 4ESR A; 3VRZ A; 5D6Y A; 2OTL T; 2HCK A; 1M1F A; 3CCL T; 2NLU A; 1JRI A; 1K73 C; 2E5Q A; 4RTZ A; 1K0S A; 3CC2 T; 3LGF A; 3LH0 A; 4OP0 A; 1N9R A; 2DXT A; 5GJW B; 1KD1 R; 1O9S A; 3A1P A; 3EAE A; 5IHI A; 3L42 A; 2BE9 B; 2VXE A; 2VXF A; 4EMG A; 3M56 A; 3VJP A; 3LW5 E; 1Y71 A; 2YUO A; 4PNO A; 1M90 U; 3I35 A; 3CBM A; 4QT7 A; 1D09 B; 3OYH A; 3GIB A; 3SWN A; 2DF6 A; 3MO8 A; 1WHG A; 2NUZ A; 1NEB A; 1YBY A; 3PTA A; 4J9H A; 3CCU T; 3CQT A; 2R57 A; 4J9I A; 1PD1 A; 1Q7Y C; 1TWB A; 2CP7 A; 1YWO A; 1YIT T; 3VS4 A; 3D7S B; 1NYF A; 2R5M A; 3QII A; 4E6R A; 4JLG A; 2GNC A; 2LDM A; 4MMK A; 1HSQ A; 2GGR A; 3PIP A; 3OYE A; 2CT3 A; 3HKS A; 1RAC B; 1W4S A; 4HA8 A; 3CCM Q; 1NLP C; 1TG0 A; 3I5R A; 3OW2 P; 4ATO A; 1NM7 A; 2G3R A; 4M77 C; 3JCM c; 1RI9 A; 2E5K A; 4MDX A; 2LJ0 A; 2A08 A; 4JUV A; 2EWN A; 1HD3 A; 2KRO A; 1Y96 A; 2DTO A; 1G8X A; 1VQL Q; 4J6W A; 4KH0 B; 2JT4 A; 4C92 A; 4C8Q C; 1SEM A; 1YIJ T; 1AZE A; 4M75 E; 1VQ6 T; 1RAD B; 4PL6 A; 3CCR T; 3OYG A; 9ATC B; 4M7A A; 3QO3 A; 1WLP B; 4D8K A; 4RG8 A; 1EIF A; 4OGE A; 4GY5 A; 3QG1 A; 4J7F A; 4IUT A; 4F7U E; 1MND A; 3H9N A; 4J9B A; 1QKW A; 5C0M A; 3CCE Q; 1KC8 C; 1DJ7 B; 4QQG A; 3WXM B; 1JU5 C; 3EGX B; 1D1A A; 5CKB A; 1ZUK A; 1VQ9 Q; 5GAM g; 1S1N A; 5GAN g; 4MDW A; 1BB9 A; 3I56 Q; 5HCK A; 1VQK T; 2O88 A; 1I81 A; 3HHT B; 3VKI A; 1Q95 G; 2K2M A; 1U3O A; 4EMK A; 1OX9 A; 3G1J A; 2DL7 A; 1M4Z A; 3L2U A; 3A8G B; 3CC7 Q; 3I55 Q; 2XHC A; 2GQI A; 2DET A; 3CXC P; 3H6Z A; 1VYU A; 3PMI A; 2MF2 A; 1EFN A; 4UC4 A; 1VUB A; 2NYS A; 2DA9 A; 3MKD A; 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