The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
67
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structure length |
67
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Chain Sequence |
GSMSTSELKKVVALYDYMPMNANDLQLRKGDEYFILEESNLPWWRARDKNGQEGYIPSNYVTEAEDS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the SH3 domain from Bruton's tyrosine kinase.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Transferase
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| molecule keywords |
BRUTON'S TYROSINE KINASE
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| total genus |
5
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1997-10-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2BZ8 A; 2DE0 X; 5IXB A; 2IIM A; 2GNC A; 2FO0 A; 2LX7 A; 4ESR A; 1AZE A; 2KRO A; 4RTY A; 1M30 A; 3RBB B; 1H8K A; 2GGR A; 2HBW A; 1OOT A; 2YUO A; 3VS4 A; 2DL8 A; 2GBQ A; 2DLP A; 5FWB A; 2LMJ A; 4FSS A; 1JXM A; 4LE9 A; 1WLP B; 1SRM A; 3SEM A; 1H3H A; 2OI3 A; 2J7I A; 4J9E A; 1QKX A; 2C0T A; 1NEG A; 1AWO A; 2YUP A; 3H0I A; 4RTT A; 2A37 A; 3EG1 A; 2LZ6 B; 1WYX A; 4Y92 A; 4OML A; 1MUZ A; 5IHN A; 1X43 A; 4RUG A; 1U06 A; 1ZLM A; 1NG2 A; 1UHF A; 2RN8 A; 1V1C A; 2CSI A; 2OAW A; 2DBM A; 4IIM A; 2DNU A; 2BTT A; 2NUZ A; 1MV3 A; 1TUC A; 1QWE A; 4RTV A; 1W1F A; 2J6O A; 1PWT A; 3THK A; 4DEX A; 2FPF A; 2X3W D; 3PE0 A; 1ZX6 A; 2AKL A; 4LUE A; 2GQI A; 2GTO A; 4GLM A; 2EKH A; 1AWW A; 1X6G A; 3TSW A; 3I5R A; 2YDL A; 1UJ0 A; 1FMK A; 1MV0 B; 2O31 A; 3U23 A; 4D8K A; 1KJW A; 2JM9 A; 2KYB A; 2ECZ A; 1IO6 A; 2ROL A; 1VYU A; 3C0C A; 3NGP A; 1X2K A; 1SEM A; 2KNB B; 1SPK A; 3VS1 A; 4KRT A; 2CDT A; 2JT4 A; 4F16 A; 2DIL A; 5HCK A; 5L23 A; 1K1Z A; 3I9Q A; 4QT7 A; 1I07 A; 1M8M A; 1PHT A; 2DMO A; 2KXC A; 2JS2 A; 1WXU A; 2KEA A; 2AZS A; 3EG2 A; 4CC3 A; 2GTJ A; 2LQN A; 2JW4 A; 4IIO A; 4Z8A A; 3TVT A; 1U3O A; 1K0S A; 1OEB A; 1YN8 A; 1GCQ C; 4JJB A; 1GFC A; 5FWC A; 2LQW A; 3QWX X; 2O9V A; 1WFW A; 2D1X A; 2RF0 A; 1KSW A; 2NWM A; 3PVQ A; 2JMC A; 3SHW A; 3H0H A; 2HSP A; 2EGE A; 1GRI A; 1NM7 A; 2DJQ A; 2KRN A; 4WCI A; 3NMZ C; 1GFD A; 2EBP A; 3I35 A; 1QLY A; 2RQU A; 1W70 A; 2X3X D; 2DL3 A; 2CUB A; 2ED0 A; 3UAT A; 2RQW A; 2RQR A; 3VS0 A; 4RTX A; 2O9S A; 2O2O A; 3VS3 A; 4E6R A; 2M0Y A; 4GBQ A; 2DF6 A; 1NLO C; 2DM1 A; 2KYM A; 2K6D A; 2YSQ A; 4LUD A; 5IHI A; 2SEM A; 3VS5 A; 1ARK A; 1M27 C; 1J3T A; 1GL5 A; 4J9H A; 3GBQ A; 2KT8 A; 1UUE A; 1AWX A; 1UJY A; 4AFQ C; 2CRE A; 1JXO A; 4OMM A; 1KIK A; 2DX1 A; 1BB9 A; 1K76 A; 1WA7 A; 1QKW A; 3UF4 A; 1WDX A; 3VS2 A; 1B07 A; 2FEI A; 2J6F A; 2L2P A; 3EHQ A; 4HVW A; 1NLP C; 1M3A A; 2CT3 A; 2A36 A; 2DL4 A; 2ESW A; 1ZUU A; 3REB B; 2G6F X; 3VRZ A; 2AZV A; 2H8H A; 2W0Z A; 4K11 A; 1ZUY A; 2FPD A; 2KXD A; 3M0S A; 4M4Z A; 1HD3 A; 2EPD A; 2LP5 A; 2HDA A; 1HJD A; 4Z89 A; 1EFN A; 1PKT A; 2QDL A; 2KRS A; 1GBQ A; 3QWY A; 1NYG A; 3FJ5 A; 5GJW B; 3TSZ A; 5EC7 A; 5ECA A; 2VWF A; 2FPE A; 3I5S A; 1AOJ A; 3UA7 A; 3VS6 A; 1T3L A; 2YUQ A; 1T3S A; 4JJC A; 1YWO A; 1PRL C; 2JXB A; 2DYB A; 1ZUK A; 5GJV B; 1E6H A; 2B86 A; 2KT1 A; 1WXB A; 4J9C A; 2D8H A; 4JZ4 A; 3VRY A; 2W10 A; 2XMF A; 1X2Q A; 1RLQ C; 1M3B A; 3R6N A; 3O5Z A; 4OMN A; 1T0H A; 2BZX A; 1AVZ C; 2C0O A; 2RMO A; 2L0A A; 1SHG A; 3ZL7 C; 4F17 A; 4JJD A; 3EG0 A; 3REA B; 1YCS B; 2I0N A; 1H92 A; 1JQQ A; 2HCK A; 2KR3 A; 2K7A A; 5IH2 A; 2V1Q A; 2FG0 A; 1VYT A; 2A28 A; 1HSQ A; 4A63 B; 1K4U S; 2EYW A; 2M51 A; 2RQV A; 4OMO A; 4AFU C; 2EGA A; 2JM8 A; 1E6G A; 3M0U A; 3UA6 A; 4CC4 B; 5IXF A; 1Z9Z A; 4ZNX A; 1CKB A; 1G2B A; 1ABO A; 1LCK A; 2V1R A; 1BBZ A; 1QWF A; 2YT6 A; 4HCK A; 1UE9 A; 2F2W A; 1VYV A; 4J9I A; 2D8J A; 1I0C A; 2K2M A; 4J9B A; 2P4R A; 1UEC A; 2VKN A; 2PZ1 A; 5I11 A; 3M0R A; 1BK2 A; 4LN2 A; 1QCF A; 2CUD A; 2PTK A; 1RUW A; 2CH4 A; 2DL7 A; 1X6B A; 1YWP A; 1SRL A; 1OPK A; 2L3P A; 2EYX A; 3EGU A; 2CH4 W; 2L3S A; 2BZY A; 1JU5 C; 2ED1 A; 4AG1 C; 1Z9Q A; 4R0K A; 2LJ0 A; 1N5Z A; 4OMQ A; 1PKS A; 1UG1 A; 2ENM A; 3EHR A; 4JZ3 A; 2LNH B; 4J9G A; 1CKA A; 1UGV A; 4EIK A; 1I1J A; 4DEY A; 2EQI A; 3EG3 A; 2J05 A; 1GBR A; 2MCN A; 1TUD A; 4F14 A; 1TG0 A; 2SRC A; 4RTW A; 4X1V A; 3LH5 A; 2EYY A; 2DRK A; 3JV3 A; 1B3Q A; 2E5K A; 1AZG B; 4LNP A; 1ABQ A; 4Z88 A; 3IQL A; 2CSQ A; 1UTI A; 4ORZ A; 2JS0 A; 1JO8 A; 1UFF A; 3CQT A; 1FYN A; 1KFZ A; 1SSH A; 1YP5 A; 2ABL A; 2MIO A; 2RNA A; 2F2V A; 1NYF A; 4RTU A; 1U5S A; 2LJ1 A; 3H41 A; 2F2X A; 2JTE A; 1AEY A; 1RLP C; 1W6X A; 1WX6 A; 4JPB W; 2KE9 A; 3VS7 A; 1GCQ A; 2DA9 A; 2DRM A; 3KFV A; 3H0F A; 1ZSG A; 2EVR A; 2JMA A; 4D8D A; 3PVL A; 4RTZ A; 1UHC A; 2A08 A; 1K0X A; 2K9G A; 2J06 A; 2DBK A; 1UDL A; 2FRW A; 4CC7 A; 2KRM A; 1X69 A; 2RQT A; 2OJ2 A; 1JEG A; 4CC2 A; 1NEB A; 1S1N A; 2L3Q A; 4HXJ A; 1K9A A; 2KBT A; 2AKK A; 2C0I A; 1SHF A; 2VVK A; 1RI9 A; 1M3C A; 2MOX A; 2CT4 A; 1PRM C; 3ULR B; 3M0T A; 5I22 A; 1AWJ A; 2EW3 A; 2ROT A; 2KGT A; 4HVV A; 1T0J A; 1AD5 A; 3M0P A; 3NHN A; 4OMP A; 2LJ3 A; 2LCS A; 1PNJ A; 1GCP A; 1BU1 A; 4HVU A; 5FW9 A; 2EGC A; 5IHK A; 2AK5 A; 4AFZ C; 2FRY A; 2YUN A; 4AFS C; 1CSK A; 2K3B A; 3A98 A; 4AG2 C; 1WI7 A; 1WIE A; 1WXT A; 1Y0M A; 1YNZ A; 2DL5 A; 2D0N A; 3RNJ A; 1G83 A; 1Y57 A; 2DVJ A; 1A0N B; 3M0Q A; 1X27 A; 1ZBJ A; 4J9F A; 2J6K A; 1XOV A; 3NPF A; 2O88 A; 1E7O A; 1OV3 A; 1OPL A; 2K79 A; 2PNI A; 2HEQ A; 2RPN A; 2EYZ A; 4J9D A; 1VA7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DE0 X; 5IXB A; 1D1C A; 3L2R A; 2A0F B; 2IIM A; 3EFR A; 2FO0 A; 2RK1 A; 4M7A G; 2K5F A; 4KUD K; 1AZE A; 1X01 A; 1M30 A; 5J26 A; 2HBW A; 3E9F A; 3I56 T; 3PFS A; 3C12 A; 3P8B B; 3CD6 T; 2CP3 A; 1QVP A; 3HTR A; 5GAO q; 4FSS A; 1TH7 A; 4M78 G; 2J7I A; 1NJI R; 3GIB A; 1OYX A; 2EQJ A; 2NUT B; 1H64 1; 4QKU A; 2C0T A; 2M1H A; 5D6Y A; 3OYH A; 3VYG A; 3H0I A; 2A37 A; 2HD0 A; 4MZT A; 1M1F A; 2LVM A; 4JLG A; 1UHF A; 2RN8 A; 1YJW Q; 4A4K A; 3CMA A; 1MMA A; 2OAW A; 2DBM A; 2V26 A; 2J6O A; 3THK A; 2FPF A; 3PE0 A; 2OTL A; 1VQ9 Q; 2CKK A; 2GTO A; 2K4Y A; 2E65 A; 3MEW A; 1AWW A; 1X6G A; 2KAF A; 3CPF A; 4BY6 C; 3G6E A; 3E1S A; 2LT1 A; 3HRT A; 1MMD A; 3U23 A; 1KJW A; 4HCC A; 2X4J A; 5KYU A; 4RG8 A; 2KYB A; 3CXC S; 2ECZ A; 1IO6 A; 4OB3 B; 1I4K 1; 3MP6 A; 1PD1 A; 1PC0 A; 4M7A B; 3ZBD A; 3VS1 A; 4C5H A; 1K9M U; 4KRT A; 2CDT A; 2JT4 A; 4JS5 A; 2LDM A; 1I07 A; 1M8M A; 4J5Y A; 4J8O A; 5DLQ E; 4MDW A; 1YI2 T; 1KQ1 A; 4GLK A; 3EG2 A; 2CP6 A; 1JB0 E; 2LQN A; 3V8J A; 1VQ6 Q; 2E6Z A; 4Z8A A; 3QZ9 B; 2IPO B; 1U3O A; 2QEX T; 1LPL A; 1YN8 A; 2ZPF B; 3JAM E; 4C8Q B; 3OYF A; 1N6A A; 3EG9 A; 3OYJ A; 2D1X A; 4Q5W A; 1M2O A; 2CP0 A; 1WJS A; 3OYM A; 2JMC A; 4OP0 A; 1OU9 A; 1XTD A; 4C92 G; 2KRN A; 4WCI A; 3NMZ C; 4M7D E; 1XNI A; 1BCO A; 2YHT A; 3UAT A; 2RHX A; 2O9S A; 4JDS A; 3MHX A; 4M75 G; 2M0Y A; 4M7D A; 1NLO C; 2DM1 A; 2YSQ A; 2DXT A; 4LUD A; 5IHI A; 1ARK A; 4FW1 A; 3RKY A; 1D0Y A; 1UJY A; 3CCU Q; 3L2Z A; 1OQK A; 1VQP T; 1WA7 A; 5GAO n; 3I55 T; 2QEX Q; 5LJ5 f; 1Q82 R; 1D3B A; 1WDX A; 2GCX A; 2JNG A; 4HVW A; 3S3M A; 4OB1 B; 1YHQ A; 2A36 A; 3VRZ A; 5GMK e; 2AZV A; 3MET A; 2ZCF B; 3G71 A; 2BKD N; 3FC3 A; 1EZZ B; 4MML A; 1HD3 A; 3JB9 G; 5GAO r; 2BE9 B; 2DZ9 A; 1QP3 A; 1WHG A; 5DLO A; 1HJD A; 3MP8 A; 1EFN A; 3CD6 Q; 2KRS A; 1HXD A; 2E10 A; 5ECA A; 2FPE A; 2HQH A; 3CPW A; 3UA7 A; 3BFM A; 1X6O A; 1T3L A; 3FRN A; 2YUQ A; 4M75 A; 2CZ1 B; 2IVW A; 2DXB A; 2XI9 A; 2RJD A; 1YWO A; 3A8O B; 1BCM A; 3RR6 A; 3EGX A; 3VJP A; 4EMK A; 4M78 E; 1M1K U; 4M75 E; 2B86 A; 4JRP A; 5IT9 E; 3M55 A; 4J9C A; 2QXF A; 1ZBX A; 2XMF A; 4XU3 A; 2BZX A; 1AVZ C; 2RMO A; 1K8A U; 1SHG A; 4F17 A; 1VQN Q; 1YCS B; 4DBQ A; 4E2F B; 2FB7 A; 2V1Q A; 1YJN Q; 2A28 A; 3JRZ A; 4A63 B; 2K2V A; 4KBM B; 4L6V 5; 1K4U S; 2GFA A; 2EGA A; 1QQJ A; 1ZSZ A; 5IXF A; 4M77 B; 1R0C B; 2WSE E; 4C8Q D; 1ABO A; 4B9W A; 4F7U B; 4LDU A; 4BDY A; 2YT6 A; 1M9S A; 1UE9 A; 1B34 A; 2F2W A; 1VYV A; 3MKD A; 3X20 B; 4II1 A; 4Y28 E; 1YIJ T; 1WNL A; 1UEC A; 3L42 A; 2I2L A; 1U8R A; 5I11 A; 3TU4 K; 3RMQ A; 2QQR A; 1S72 Q; 3JCM e; 1QVF S; 1RUW A; 3OYK A; 5CKF A; 1PG5 B; 1YIT A; 2RJC A; 1SRL A; 3HFO A; 2EYX A; 1YBY A; 3UPU A; 2X4W A; 3EGU A; 2L3S A; 2BZY A; 4BE1 A; 4C92 C; 5AYF A; 3H6Z A; 2JTM A; 5M9O A; 3TCJ A; 1VQ7 Q; 4M78 B; 2LJ0 A; 2PUO B; 3H8Z A; 2O01 E; 2COW A; 4PK4 A; 3ZEH A; 3CME T; 3OYI A; 2EQI A; 4F14 A; 1VUB A; 4OB0 B; 3PT9 A; 3QSU A; 2L89 A; 1QVG A; 2DZC A; 1RAC B; 4M75 B; 1Q82 C; 4Z88 A; 3M59 A; 1VQ5 A; 1RAE B; 4HKE A; 3CCQ A; 2QTX A; 1IXD A; 2JS0 A; 1BI2 A; 3CQT A; 2XHC A; 1SSH A; 4PFO A; 2MIO A; 2F5K A; 4PNO A; 1U5S A; 3H41 A; 1JJ2 P; 1O9S A; 4DA4 A; 2EAY A; 1VQO A; 3OBW A; 5A0L A; 3FLG A; 1GCQ A; 3G71 T; 4XK8 E; 1VQP A; 3SB2 A; 2M02 A; 2A08 A; 1R77 A; 3OA6 A; 2XDB A; 2K9G A; 2C06 A; 1D3B B; 1VQ8 A; 2OJ2 A; 4PLI A; 5GAN g; 4M7D C; 3BW1 A; 2QTV A; 1K9A A; 2KBT A; 1HK9 A; 2C0I A; 1EX4 A; 2VVK A; 4JLI A; 1KD1 R; 2P84 A; 3CCR T; 2RHY A; 3E2U A; 5GAM d; 4N4I A; 2DYI A; 1YHQ Q; 4M7A C; 2NUP B; 4M78 A; 3CCQ Q; 1VQ5 Q; 3NHN A; 4OMP A; 3FJP A; 1IZ6 A; 2EGC A; 1UGQ B; 4KUI A; 1GXI E; 2OTJ T; 1BI3 A; 5KYY A; 1QW1 A; 3D7S B; 4X34 A; 2XIC A; 3JCM P; 3INZ A; 1YNZ A; 1Y0M A; 4AG2 C; 5HKC A; 4OMF B; 1MMG A; 2DVJ A; 4OF1 A; 4A4H A; 3M0Q A; 1F1B B; 1X27 A; 4N0A A; 2DER A; 3JCM X; 1MHN A; 3OYL A; 2EQU A; 2K79 A; 2QK0 A; 2OAU A; 5FU6 B; 2A3L A; 5C6S A; 5IAY A; 1VA7 A; 4PJO A; 2RJF A; 1KQS S; 3F70 A; 1C6V X; 3WXM B; 1G3T A; 3RBB B; 2GGR A; 2LCL A; 2DVE A; 2A7Y A; 2DL8 A; 4QQG A; 5FWB A; 4BY6 B; 1Q86 R; 5CAI A; 1WLP B; 1SRM A; 5CQY A; 1N8R C; 1H3H A; 4ZGE B; 1UGP B; 3A8M B; 4M77 E; 2AT1 B; 2CP2 A; 2PVO B; 1G3W A; 4KH1 B; 3CCV A; 3HHT B; 4J9E A; 1VQL Q; 4KGV B; 2OX7 A; 4XTW A; 2X35 A; 1AWO A; 1Q86 U; 2EQM A; 4R55 A; 2LZ6 B; 1WYX A; 2X4Y A; 4OML A; 2E3H A; 5GAN 2; 2E41 A; 2CSI A; 1NJI C; 3N5B B; 3VUB A; 5KE2 A; 5KYW B; 1TUC A; 1TXQ A; 1YCY A; 4RTV A; 1FXX A; 4J7F A; 1PWT A; 5GAN d; 5LJ3 d; 4MZM A; 1M1K C; 2H3J A; 1ZX6 A; 4J6W A; 2JOY A; 4LUE A; 4CI0 C; 1Q82 U; 1VQ6 A; 3I5R A; 1SF9 A; 2YDL A; 4CRI A; 4C92 A; 5GMK h; 2CZ0 B; 1UJ0 A; 1FMK A; 1MV0 B; 2RI2 A; 1IHV A; 4E7S A; 2ROL A; 4F7U E; 1VYU A; 2ZPI B; 2HNI A; 3C0C A; 3NGP A; 1SEM A; 5CIU A; 4JJN K; 2O4X B; 1JRI A; 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