The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
75
|
structure length |
75
|
Chain Sequence |
GSSGSSGNLKDVYVSIADYEGDEETAGFQEGVSMEVLERNPNGWWYCQILDGVKPFKGWVPSNYLEKKNSGPSSG
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
SH3 and PX domain-containing protein 2A
|
| publication title |
Solution structure of the fifth SH3 domain from human KIAA0418 protein
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
6
|
| structure length |
75
|
| sequence length |
75
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-02-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 5IH2 A; 5EC7 A; 2EKH A; 5I11 A; 2KBT A; 4J9H A; 1OEB A; 2KE9 A; 1AOJ A; 4IIM A; 1PKS A; 5IHK A; 2ESW A; 1VYU A; 2J6K A; 1Y57 A; 3VS2 A; 5FW9 A; 2MOX A; 1AWX A; 1OPK A; 2B86 A; 3EG3 A; 1OV3 A; 2FO0 A; 1H8K A; 3RNJ A; 1WI7 A; 4AFU C; 1WYX A; 1ZUU A; 2E5K A; 1XOV A; 3RBB B; 1W1F A; 2EYZ A; 2PZ1 A; 1T0J A; 2FPD A; 3GBQ A; 2J6O A; 2YDL A; 2FEI A; 4GBQ A; 1BB9 A; 1FMK A; 1GL5 A; 2O88 A; 2LZ6 B; 1PRL C; 4FSS A; 2RF0 A; 3EHR A; 4Z88 A; 2DRM A; 3C0C A; 4OMO A; 1AWW A; 4RTW A; 1UEC A; 4Z8A A; 1TUC A; 2F2W A; 1VYV A; 1K4U S; 2KT8 A; 2HSP A; 2YSQ A; 1Z9Q A; 2DL8 A; 2P4R A; 3NPF A; 2YUN A; 2JTE A; 4RTZ A; 2VKN A; 4HVW A; 4DEY A; 2GTO A; 4OMP A; 2YUO A; 1PNJ A; 2HDA A; 4F16 A; 2DE0 X; 1UHC A; 2K2M A; 2L3S A; 3VRZ A; 2O31 A; 2FRY A; 2YT6 A; 4R0K A; 2GQI A; 1TUD A; 1X69 A; 2J6F A; 4J9E A; 1H3H A; 1GFC A; 1MV0 B; 1ZUY A; 1ZX6 A; 2K7A A; 1HD3 A; 5ECA A; 5FWC A; 3A98 A; 2L2P A; 2KRS A; 3ULR B; 1YNZ A; 3REA B; 3EG2 A; 1UFF A; 3EG0 A; 3VS7 A; 1V1C A; 2AK5 A; 2J05 A; 3TSW A; 2LNH B; 1U5S A; 3UA6 A; 1T3S A; 2F2X A; 2HCK A; 1LCK A; 1BU1 A; 2JS0 A; 3NMZ C; 1SPK A; 4DEX A; 1AWO A; 1KSW A; 2DX1 A; 1ZSG A; 2RQT A; 1GFD A; 1E6G A; 3UF4 A; 2C0O A; 2W10 A; 4AFZ C; 1QLY A; 5L23 A; 1CSK A; 4AG2 C; 3FJ5 A; 4OMQ A; 3SEM A; 1PHT A; 4AG1 C; 1ABO A; 3M0R A; 4HCK A; 4M4Z A; 2KT1 A; 1OPL A; 2I0N A; 2C0I A; 1SHF A; 1YWP A; 1JEG A; 2DF6 A; 3VS6 A; 1ZUK A; 1M3C A; 4E6R A; 1X2Q A; 4OMN A; 2CH4 A; 4KRT A; 1RLP C; 1K76 A; 2EW3 A; 2MCN A; 3LH5 A; 3IQL A; 4OML A; 2DL4 A; 2ECZ A; 2M0Y A; 3I5R A; 1BBZ A; 2DM1 A; 2ED0 A; 1UE9 A; 2LJ3 A; 1W6X A; 2ED1 A; 3O5Z A; 2VVK A; 3M0T A; 1UGV A; 2AKK A; 4LE9 A; 1NLP C; 1RLQ C; 1H92 A; 1G83 A; 3TSZ A; 1WXT A; 2LP5 A; 1SHG A; 2SEM A; 1I0C A; 1M30 A; 1IO6 A; 2RQV A; 5IHN A; 2LX7 A; 1E7O A; 2A36 A; 1K9A A; 2LMJ A; 4EIK A; 1CKA A; 2LQN A; 3PVQ A; 1K1Z A; 4X1V A; 3PVL A; 1UUE A; 3UAT A; 2VWF A; 1B07 A; 1AZG B; 2K9G A; 1JQQ A; 2GNC A; 1GBR A; 2OAW A; 1WX6 A; 2DL3 A; 4RUG A; 1E6H A; 2KR3 A; 4J9F A; 2KEA A; 2FPF A; 3M0P A; 1QKW A; 4JZ3 A; 2DL7 A; 5IHI A; 3I5S A; 1YP5 A; 1JO8 A; 1X6B A; 2ENM A; 2RQW A; 1NYG A; 2LJ0 A; 1GCQ A; 3JV3 A; 1BK2 A; 4JJD A; 1UG1 A; 4Y92 A; 2JXB A; 4JPB W; 1NG2 A; 1M8M A; 4D8K A; 4QT7 A; 3VS1 A; 2BZ8 A; 1M3B A; 2MIO A; 3VS5 A; 3NGP A; 4LUD A; 2M51 A; 1GRI A; 2RPN A; 1A0N B; 2W0Z A; 2C0T A; 2O9V A; 1NEG A; 1U3O A; 4ZNX A; 1AZE A; 1ZLM A; 2CSQ A; 1WFW A; 1QKX A; 2KRN A; 2O9S A; 1PRM C; 2KNB B; 4LNP A; 2X3W D; 2KXD A; 2DJQ A; 1HJD A; 1RI9 A; 2AZS A; 4LUE A; 2JMC A; 3CQT A; 2NUZ A; 4IIO A; 3UA7 A; 2ABL A; 2K79 A; 1X27 A; 1GBQ A; 3H0H A; 3ZL7 C; 2FRW A; 1W70 A; 2O2O A; 5I22 A; 2CRE A; 2DLP A; 2DMO A; 1AEY A; 3VS3 A; 2K6D A; 2A37 A; 2CUD A; 5HCK A; 4LN2 A; 1S1N A; 4CC4 B; 3PE0 A; 5GJW B; 1ABQ A; 2DNU A; 1UJY A; 1SSH A; 1T0H A; 5FWB A; 2EVR A; 2RNA A; 2V1R A; 1HSQ A; 2YUP A; 3REB B; 1JXO A; 3THK A; 1T3L A; 4RTU A; 1WIE A; 2ROL A; 1FYN A; 2HEQ A; 2A28 A; 2CT4 A; 1RUW A; 2RQU A; 1EFN A; 3VS4 A; 2KXC A; 1JU5 C; 1WLP B; 4J9I A; 2IIM A; 1X6G A; 3M0U A; 4AFS C; 1X2K A; 2NWM A; 2F2V A; 1U06 A; 4JZ4 A; 2EGA A; 3VS0 A; 3NHN A; 4RTY A; 3U23 A; 1CKB A; 1Z9Z A; 5GJV B; 1WA7 A; 2AKL A; 2KRO A; 1WXB A; 4JJC A; 3TVT A; 1I07 A; 1WDX A; 3QWY A; 1NYF A; 1YWO A; 4ORZ A; 1VYT A; 1ZBJ A; 4J9G A; 2L0A A; 1KFZ A; 1MV3 A; 4RTT A; 2LCS A; 2YUQ A; 1YCS B; 2PNI A; 1GCP A; 2DIL A; 2AZV A; 3I9Q A; 1KJW A; 4WCI A; 1YN8 A; 1UHF A; 1TG0 A; 2DBM A; 2JS2 A; 2KYM A; 2JM9 A; 2D8H A; 2CUB A; 1I1J A; 3H0I A; 4K11 A; 2JW4 A; 2LQW A; 1JXM A; 4A63 B; 1UTI A; 4J9D A; 4Z89 A; 2RMO A; 4HXJ A; 2H8H A; 3H41 A; 1K0S A; 4D8D A; 1KIK A; 2DVJ A; 2V1Q A; 2D0N A; 1ARK A; 4JJB A; 2D1X A; 4HVV A; 2LJ1 A; 1UDL A; 1PKT A; 2GTJ A; 3EGU A; 3M0S A; 3H0F A; 2A08 A; 2EYX A; 1QWE A; 2L3P A; 1UJ0 A; 2BZX A; 2CSI A; 4ESR A; 2K3B A; 1QCF A; 2SRC A; 4J9C A; 2D8J A; 2DYB A; 2EBP A; 2EYW A; 1SEM A; 4RTX A; 1GCQ C; 1Y0M A; 1NLO C; 2JT4 A; 2EPD A; 2KGT A; 4F17 A; 2FPE A; 2DL5 A; 2GGR A; 4GLM A; 3M0Q A; 2JMA A; 2OI3 A; 2G6F X; 1MUZ A; 4OMM A; 2HBW A; 2BZY A; 2DA9 A; 1SRM A; 2EQI A; 2JM8 A; 2CDT A; 2OJ2 A; 4HVU A; 1G2B A; 2RQR A; 5IXF A; 2L3Q A; 1N5Z A; 3EG1 A; 4F14 A; 2DBK A; 1SRL A; 1M27 C; 4RTV A; 3QWX X; 2DRK A; 1J3T A; 3KFV A; 2EGE A; 3VRY A; 1M3A A; 1VA7 A; 4CC3 A; 1X43 A; 2KYB A; 4AFQ C; 2J06 A; 2RN8 A; 2XMF A; 1AWJ A; 1OOT A; 1K0X A; 2BTT A; 5IXB A; 1B3Q A; 3EHQ A; 1PWT A; 3SHW A; 2ROT A; 1QWF A; 1WXU A; 4J9B A; 1NM7 A; 1AD5 A; 4CC7 A; 2FG0 A; 3R6N A; 1NEB A; 2KRM A; 3I35 A; 2EYY A; 1AVZ C; 2PTK A; 2CT3 A; 2X3X D; 2EGC A; 4CC2 A; 2GBQ A; 2QDL A; 2CH4 W; 2J7I A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5EC7 A; 3OYY A; 1OEB A; 1AOJ A; 5IHK A; 4J6W A; 3M56 A; 2ESW A; 3CCJ Q; 1VYU A; 2J6K A; 1Y57 A; 5FW9 A; 2MOX A; 1AWX A; 2B86 A; 2K5I A; 1QW1 A; 4EMK A; 4AFU C; 1WYX A; 1SF9 A; 4EMH A; 5LJ3 g; 4C92 F; 4XAX B; 2LDM A; 2EQM A; 3GBQ A; 3JAM E; 5CKE A; 2B8A A; 1BB9 A; 3JCM h; 1LJO A; 2O88 A; 3CC4 Q; 3EHR A; 2DZC A; 4M77 B; 1QVG A; 2KAF A; 3EGX A; 4PFO A; 1AWW A; 4RTW A; 4C92 A; 1N6A A; 4Z8A A; 1TUC A; 4R55 A; 1K4U S; 3H8Z A; 2KT8 A; 2YSQ A; 3NPF A; 4XK8 E; 1N8R U; 3CD6 A; 5A0G A; 3TU4 K; 2OAU A; 4XU3 A; 1VQ8 A; 4RTZ A; 4DEY A; 3TRE A; 4LD6 A; 1YJW Q; 3VU3 C; 1U8R A; 1D09 B; 4F16 A; 4OMF B; 1MHN A; 2L3S A; 2CZ1 B; 1S72 Q; 5GAM d; 3VRZ A; 3OS5 A; 2O31 A; 4MDW A; 3EG9 B; 3MEV A; 1Q95 G; 4LDX A; 4ZGE B; 3G71 A; 1WHH A; 2GQI A; 1FWZ A; 4E7L A; 3CBM A; 4J9E A; 1H3H A; 1ZUY A; 1MV0 B; 3CXC P; 1Q7Y C; 5KYY A; 4M78 G; 2DYI A; 3ULR B; 2XDD A; 2AK5 A; 2VGN A; 2ZPG B; 1RAI B; 1T3S A; 2HCK A; 3URG A; 1HK9 A; 1IB8 A; 3UWN A; 3OQ5 A; 3RKW A; 1G5V A; 1YI2 Q; 4DEX A; 1AWO A; 1VQK Q; 3FEO A; 4M77 G; 1E6G A; 3UF4 A; 2C0O A; 4XTU A; 1QLY A; 1QVF P; 2DPP B; 1JRI A; 4JRP A; 1CSK A; 3SEM A; 2LRQ A; 1WNL A; 4KGZ B; 5CIU A; 3OY9 A; 3M0R A; 4HCK A; 3N5B B; 1Q82 C; 1ACM B; 5GAM h; 1SHF A; 1YWP A; 1JEG A; 3ZEH A; 1B34 B; 3PMI A; 4HA8 A; 2X4X A; 3VYG A; 4PJO D; 1QP3 A; 1YJN Q; 4N4G A; 2M0Y A; 4B9X A; 1VQ7 Q; 3M59 A; 3L2V A; 1UE9 A; 2DER A; 4F7U F; 4RCC A; 4XTY A; 1WJS A; 2EYQ A; 2X9H A; 2C06 A; 4QQ6 A; 5DM7 R; 1UB4 A; 2E1H A; 3TSZ A; 4ME7 A; 3V8K A; 1WXT A; 3GIB A; 2LP5 A; 5GMK e; 2SEM A; 4KUD K; 5KCH A; 5D6X A; 2LQ8 A; 2QA4 Q; 8ATC B; 2VXE A; 5IHN A; 2DD4 A; 3CCV A; 2A36 A; 1K9A A; 3MCA B; 1DJ7 B; 3PVQ A; 5KE3 A; 1K1Z A; 1X75 C; 1Y71 A; 4XTZ A; 1WQ7 A; 3PVL A; 4O6J A; 4L59 A; 5HK3 A; 1B07 A; 1AZG B; 2XIC A; 2O01 E; 1M1K C; 1G8X A; 1KHI A; 2M1H A; 2QAZ A; 1M1F A; 4RUG A; 4E2F B; 5GAN d; 1Q7Y R; 2KR3 A; 4M78 D; 3I55 Q; 4JZ3 A; 1ZSZ B; 3CCQ T; 4C5H A; 2HZY A; 5LJ5 g; 4N0A C; 3AHU A; 1PC0 A; 1X6B A; 3RKX A; 2HL5 C; 4PKC C; 2LJ0 A; 2HD0 A; 1MMG A; 2XU8 A; 2YLB A; 4M78 C; 1TU0 B; 5CK9 A; 2JVV A; 4J7I A; 3MEU A; 2MIO A; 3M55 A; 4M77 D; 2OTL T; 2A0F B; 4DBH A; 5J26 A; 2RPN A; 3CEY A; 2DK3 A; 1OU8 A; 2HQH A; 4KT0 E; 4ZTJ A; 9ATC B; 2O9V A; 1NEG A; 2HSE B; 1MMD A; 3C12 A; 1ZLM A; 1VQN T; 4C5E A; 1QKX A; 2QTV A; 4M77 C; 1IZ6 A; 4HCC A; 1KC8 C; 2R5A A; 1VQ5 Q; 1Q82 R; 2MK5 A; 4C5I A; 2DJQ A; 2GFU A; 2RM4 A; 1Q7Y U; 4QKU A; 3G4S Q; 2MAM A; 3CCL A; 4IIO A; 3UA7 A; 3LWH A; 4HT8 A; 1BI2 A; 2E10 A; 2EQK A; 5GAN h; 3OMG A; 5FU6 B; 1MMN A; 2DMO A; 1AEY A; 3VS3 A; 3CME A; 3JCM e; 3PIO A; 4PJO F; 1IGQ A; 4CC4 B; 2QQR A; 4NL3 A; 1VQL T; 4LDU A; 4DBQ A; 1VQ6 T; 3G1J A; 4TVR A; 2M9U A; 3C95 A; 3EGD B; 1T0H A; 2EWN A; 1VQO A; 3JB9 J; 2RNA A; 1PM3 A; 2K57 A; 1N9R A; 1JXO A; 4M78 E; 1QQJ A; 4RTU A; 1VQ4 A; 3LWI A; 4N4H A; 1MNE A; 5CQY A; 3CC2 T; 4PJO A; 3VS4 A; 1JU5 C; 1WLP B; 1MGQ A; 1X2K A; 1Q82 U; 3A8M B; 2KDS A; 1WHG A; 2XHC A; 1M1K R; 4J5Y A; 3QKJ A; 1PSE A; 1M8V A; 4M77 E; 3LYI A; 4QQG A; 4C0F A; 4C8Q B; 1Z9Z A; 2WSE E; 3JB9 H; 2BE7 D; 2NUT B; 1U1T A; 2XK0 A; 3QWY A; 1IRE B; 3D7S B; 3L1A A; 3HKS A; 2L0A A; 3MP1 A; 4RTT A; 1YHQ T; 5D7U A; 1KQS A; 2DIL A; 2AZV A; 1KJW A; 3V7S A; 3ME9 A; 1TG0 A; 2KYM A; 4J8O A; 3CCE Q; 3CC7 T; 3X25 B; 1I1J A; 2DXC A; 5GAN 4; 3CXC S; 1JXM A; 4A63 B; 3ER0 A; 4L6V 5; 2RMO A; 4A4H A; 3H41 A; 1M1K U; 3HPW A; 4D8D A; 1KIK A; 1KC8 R; 3V8L A; 2QAS A; 1UDL A; 5DY9 A; 1TOV A; 5GAM e; 5LJ3 j; 3FC3 A; 2EYX A; 5FRO A; 1QWE A; 1VQP T; 4ESR A; 1QCF A; 2FYK A; 2JNG A; 1XQH A; 4J9C A; 2DYB A; 3CC4 T; 3CCU T; 3MPU B; 1GCQ C; 4X34 A; 4EMG A; 2JT4 A; 2LCC A; 3C4S A; 1ZA2 B; 2GGR A; 4XTX A; 1QVF S; 3ZBD A; 4ELZ C; 2JMA A; 2D0Q B; 2DEQ A; 2KMT A; 3OW2 A; 1M2V B; 4OF1 A; 4R56 A; 4E7J A; 1WJQ A; 2HBW A; 2BZY A; 2DA9 A; 1R0B G; 4IKF A; 4IUQ A; 4HVU A; 1N5Z A; 1IHW A; 4JUV A; 3L2Q A; 3EG9 A; 1YJW T; 2X4J A; 1ZSZ C; 3PIP A; 1KC8 U; 3QDF A; 1S72 T; 5GAO p; 3OS2 A; 2O4X B; 3BDL A; 2DIG A; 4J9B A; 1NM7 A; 3RER A; 3DB4 A; 2X3X D; 3OYK A; 2P0K A; 3J81 E; 1YJ9 Q; 5I2S A; 3DLM A; 2J7I A; 3A8H B; 2YRD A; 1NE8 A; 5IH2 A; 2RHX A; 5I11 A; 2EKH A; 3EFO A; 3M4G A; 1YI2 T; 2RK1 A; 1RAC B; 2KE9 A; 1HXD A; 4IIM A; 1VQK T; 3HFN A; 2FHD A; 3L2Z A; 2FO0 A; 2RHZ A; 1SSF A; 1M9S A; 4OGE A; 3CCS T; 3VUB A; 2E5K A; 2NUP B; 1XOV A; 4M75 F; 3RBB B; 2FPD A; 2P0Q A; 5FU6 C; 1VIE A; 2FEI A; 1W4S A; 4C0Z A; 1U1S A; 4KBM B; 1M4Z A; 5FLX E; 4FSS A; 2FZG B; 4Z88 A; 2CP6 A; 2EQJ A; 3CBO A; 3RUX A; 5LJ5 d; 4M75 A; 4DA4 A; 1VYV A; 3RKY A; 1YJN T; 2HSP A; 1OI1 A; 3UDC A; 5GAM f; 2P4R A; 1VQ7 T; 5CO7 A; 4C8Q D; 5GAN e; 2YUN A; 1SG5 A; 2JTE A; 2VKN A; 4HVW A; 3DKM A; 2GTO A; 2COW A; 2QGF B; 2HDA A; 5A2Q E; 1YIT A; 2DE0 X; 5I21 A; 4BDZ A; 5CCA A; 1M90 C; 4C0G A; 3CD6 Q; 1UGR B; 2ZPB B; 2E6N A; 4C8Q C; 1VQ8 Q; 2LT4 A; 3OYE A; 2E5Q A; 1TUD A; 1X69 A; 2K5L A; 2RA2 A; 2QEX T; 1UEB A; 1C1A A; 1HD3 A; 1XTD A; 4PJM A; 4DOV A; 5FWC A; 3A98 A; 2KRS A; 2EKO A; 4M7D B; 2CP0 A; 3PMT A; 3TSW A; 5GAN 5; 2LNH B; 2ZPH B; 3G71 Q; 1ZSZ A; 1Q86 C; 3NMZ C; 1EZZ B; 1SPK A; 4MZT A; 4BE0 A; 1KSW A; 5LJ5 h; 2YRC A; 3CCM T; 3I55 T; 3QO3 A; 1JJ2 A; 1PCX A; 3LGF A; 2R5M A; 2W10 A; 1O75 A; 4ZGD B; 2DO3 A; 2DTI A; 3GP8 A; 5L23 A; 2XDP A; 1RL2 A; 3L42 A; 3FJ5 A; 4OMQ A; 2BE9 B; 3HSB A; 1PHT A; 1JBM A; 4M4Z A; 2YLC A; 2KT1 A; 2C0I A; 5GAN 7; 5FRM A; 4A54 A; 1UGS B; 5HY6 A; 3WXM B; 2DF6 A; 3VS6 A; 2DET A; 4FM4 B; 1M3C A; 4ATO A; 1X2Q A; 2RHY A; 1RLP C; 2RK2 A; 3OYL A; 5CAI A; 1K76 A; 2E41 A; 2E70 A; 3GOX A; 3DB3 A; 3QZ5 B; 1VQ5 T; 2ED1 A; 4M78 B; 3O5Z A; 4M7A F; 3M0T A; 2AKK A; 4LE9 A; 4M7D G; 2DTH A; 3G4S T; 3M54 A; 4BUG A; 4A4F A; 3J7A F; 2WSF E; 3CPF A; 4Z02 A; 3EGD A; 1M30 A; 3FJP A; 1VQN A; 4M7A A; 3E9G A; 5GAN f; 3MO8 A; 3JB9 F; 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