The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
63
|
structure length |
63
|
Chain Sequence |
GMAQGALLKAQALCSWTAKKDNHLNFSKHDIITVLEQQENWWFGEVHGGRGWFPKSYVKIIPA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of the Second SH3 Domain of ITSN2 Bound with a Synthetic Peptide
rcsb |
| molecule tags |
Endocytosis
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
Intersectin-2
|
| total genus |
13
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| structure length |
63
|
| sequence length |
63
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-12-20 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF07653 | SH3_2 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2AKK A; 1GFD A; 1K0S A; 1T0H A; 2OJ2 A; 1PWT A; 2KYB A; 3REB B; 4AFU C; 1M30 A; 2FPD A; 2J6O A; 1QKW A; 4ZNX A; 1I07 A; 1YNZ A; 2KYM A; 3I35 A; 3KFV A; 2D0N A; 3R6N A; 2LJ0 A; 2EYX A; 4IIM A; 1CSK A; 2K3B A; 1AWJ A; 4HVV A; 1GL5 A; 1JU5 C; 1YWO A; 2K79 A; 2LX7 A; 1UFF A; 2FPF A; 2RQV A; 1MUZ A; 2YUP A; 4CC4 B; 1X2K A; 2A08 A; 2JT4 A; 2YUO A; 2FRY A; 2DL7 A; 1UG1 A; 1SHG A; 2VVK A; 2C0I A; 1HSQ A; 2F2V A; 2K7A A; 2KRN A; 4X1V A; 1YWP A; 5FW9 A; 1SEM A; 2C0O A; 1M27 C; 4J9G A; 2CT3 A; 3I5R A; 2DF6 A; 1PKT A; 2LQN A; 4AFS C; 1K1Z A; 3IQL A; 4IIO A; 5IXB A; 3PVL A; 4ESR A; 2RQW A; 2J06 A; 2RQU A; 3JV3 A; 4RTT A; 2JM9 A; 2LCS A; 1RLP C; 1U3O A; 2DRK A; 4LNP A; 4RTV A; 5IH2 A; 1AWX A; 5I11 A; 2CSQ A; 2LJ3 A; 2AZV A; 4Z8A A; 1AZE A; 2JXB A; 2L0A A; 1YCS B; 2O2O A; 4Z88 A; 2W0Z A; 4OMM A; 2CUB A; 1UGV A; 2NWM A; 4CC3 A; 1B3Q A; 2DL8 A; 2L3P A; 1AD5 A; 1QWF A; 1W6X A; 1U06 A; 1UEC A; 2EBP A; 1ZSG A; 2JW4 A; 4DEY A; 1CKA A; 2BTT A; 1FMK A; 1WXB A; 2YSQ A; 2W10 A; 1TUD A; 4CC7 A; 4OMN A; 4J9E A; 1JXM A; 3VS0 A; 3H0F A; 1WFW A; 1AVZ C; 1WXU A; 2VWF A; 4AFZ C; 2PTK A; 1I1J A; 4J9C A; 4OML A; 5IHI A; 1ZLM A; 3O5Z A; 2SRC A; 2NUZ A; 2EKH A; 1GCP A; 2RN8 A; 4E6R A; 2K6D A; 1Z9Q A; 2FO0 A; 3I5S A; 4QT7 A; 3VS4 A; 1RUW A; 2FPE A; 1BK2 A; 1Y0M A; 1QLY A; 2FEI A; 2JS0 A; 3M0T A; 3UAT A; 2KE9 A; 1H3H A; 2BZY A; 4ORZ A; 3PVQ A; 2L2P A; 1GRI A; 4F14 A; 5HCK A; 3VS7 A; 2FG0 A; 4GLM A; 1PNJ A; 4F17 A; 2KRM A; 2AK5 A; 1NEG A; 2KXC A; 1T3S A; 4RUG A; 2O88 A; 1A0N B; 2LMJ A; 2EPD A; 1NG2 A; 2J05 A; 2A36 A; 3TSZ A; 1B07 A; 1UHF A; 1SHF A; 1M8M A; 2FRW A; 1M3B A; 2H8H A; 2YDL A; 1JQQ A; 1QKX A; 1U5S A; 2M0Y A; 5IXF A; 3EG2 A; 1JEG A; 4Y92 A; 1NLO C; 2KGT A; 2RQT A; 1GCQ A; 1SPK A; 1J3T A; 3LH5 A; 2J7I A; 3VS1 A; 1E6G A; 4D8K A; 2EYZ A; 2QDL A; 1XOV A; 3TSW A; 4K11 A; 1AEY A; 4R0K A; 4Z89 A; 1TUC A; 2EGE A; 2CUD A; 1S1N A; 3VRY A; 1K9A A; 1RI9 A; 3C0C A; 1UTI A; 4JZ4 A; 2GGR A; 2DMO A; 2KR3 A; 3UA6 A; 4FSS A; 1MV0 B; 4M4Z A; 1VYT A; 2LP5 A; 3VS3 A; 1ZUU A; 4AG1 C; 1Z9Z A; 2KRO A; 1UE9 A; 1ZX6 A; 3ZL7 C; 1OV3 A; 4RTW A; 2DLP A; 2EGC A; 1M3C A; 2EQI A; 2RPN A; 1UHC A; 2EVR A; 3NMZ C; 1NYG A; 2KEA A; 5L23 A; 1OOT A; 3RNJ A; 2AKL A; 2J6K A; 2F2X A; 1UDL A; 3EHR A; 4RTU A; 1G83 A; 1K4U S; 3QWY A; 3UF4 A; 1WIE A; 2ED1 A; 1WLP B; 3EGU A; 2DJQ A; 4WCI A; 2K2M A; 2HBW A; 4OMQ A; 1PRL C; 2A37 A; 2ROT A; 4HVW A; 2D1X A; 2DBK A; 2LZ6 B; 1X2Q A; 1SSH A; 2DL4 A; 4JJD A; 3RBB B; 2MOX A; 2L3S A; 2YT6 A; 4OMO A; 1G2B A; 1NLP C; 2CT4 A; 5EC7 A; 5IHK A; 1X6B A; 2SEM A; 3VS2 A; 2G6F X; 2HEQ A; 5IHN A; 2DBM A; 2KNB B; 1FYN A; 1GCQ C; 1BB9 A; 4HVU A; 1W70 A; 3M0U A; 1VA7 A; 2DM1 A; 2V1R A; 2XMF A; 1BBZ A; 2K9G A; 1KFZ A; 4RTZ A; 4J9H A; 2GNC A; 2RQR A; 2YUN A; 2ENM A; 2YUQ A; 3ULR B; 1GBR A; 1PRM C; 4CC2 A; 2E5K A; 3VS5 A; 4KRT A; 4JJC A; 3H41 A; 1VYU A; 2KXD A; 2JM8 A; 1WDX A; 1N5Z A; 1YP5 A; 1M3A A; 2JMC A; 1OPK A; 2GTO A; 2DL3 A; 2ABL A; 2RNA A; 4AG2 C; 2X3W D; 1NEB A; 1X43 A; 3M0S A; 2GTJ A; 2PNI A; 2ROL A; 2LQW A; 4JPB W; 4LUD A; 2JTE A; 1V1C A; 4J9F A; 2DRM A; 1CKB A; 3NHN A; 3REA B; 1ZBJ A; 2IIM A; 2V1Q A; 3CQT A; 2HSP A; 4LUE A; 1OEB A; 1KIK A; 1GFC A; 4J9B A; 1Y57 A; 2ECZ A; 1BU1 A; 1LCK A; 4D8D A; 1YN8 A; 5FWB A; 3VRZ A; 2CDT A; 2ED0 A; 1PHT A; 2DVJ A; 1TG0 A; 2CH4 A; 2OI3 A; 3EG1 A; 4HCK A; 2J6F A; 1KSW A; 3EG0 A; 4HXJ A; 2BZX A; 4RTX A; 1HJD A; 2RMO A; 2EW3 A; 2CSI A; 2F2W A; 2KRS A; 1AWW A; 2BZ8 A; 2ESW A; 2EGA A; 2O31 A; 1H8K A; 1ZUK A; 2C0T A; 3GBQ A; 1X69 A; 1UUE A; 4DEX A; 1ABO A; 2CRE A; 2O9S A; 4RTY A; 2HCK A; 1NYF A; 5ECA A; 1WX6 A; 2CH4 W; 2RF0 A; 5I22 A; 1K0X A; 1KJW A; 1WYX A; 1JXO A; 2D8H A; 2KT1 A; 2DE0 X; 3M0P A; 1ARK A; 2O9V A; 3QWX X; 2EYY A; 3NPF A; 4F16 A; 1GBQ A; 3TVT A; 1OPL A; 2DA9 A; 2I0N A; 4JJB A; 2DX1 A; 1VYV A; 2KBT A; 1HD3 A; 2A28 A; 3FJ5 A; 1K76 A; 1W1F A; 1ABQ A; 3M0R A; 3SEM A; 1X6G A; 2PZ1 A; 4GBQ A; 4AFQ C; 1AOJ A; 2B86 A; 2JMA A; 3NGP A; 4EIK A; 1UJY A; 2GQI A; 3VS6 A; 2VKN A; 4LE9 A; 5GJV B; 4JZ3 A; 1ZUY A; 1SRM A; 2AZS A; 2EYW A; 2MCN A; 1IO6 A; 2LNH B; 2X3X D; 3H0I A; 2DL5 A; 4LN2 A; 2P4R A; 1QWE A; 1I0C A; 3U23 A; 3PE0 A; 1AZG B; 3A98 A; 3I9Q A; 5GJW B; 4A63 B; 2DNU A; 2D8J A; 1MV3 A; 3THK A; 2GBQ A; 1PKS A; 2MIO A; 1WXT A; 1H92 A; 1WI7 A; 4OMP A; 1RLQ C; 1T0J A; 3SHW A; 1E7O A; 3UA7 A; 2HDA A; 2M51 A; 1NM7 A; 1JO8 A; 1E6H A; 5FWC A; 3EHQ A; 2DYB A; 4J9D A; 3EG3 A; 1WA7 A; 4J9I A; 3M0Q A; 2LJ1 A; 3H0H A; 1X27 A; 2L3Q A; 2OAW A; 1SRL A; 2DIL A; 1UJ0 A; 1T3L A; 1AWO A; 1QCF A; 1EFN A; 2KT8 A; 2JS2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4KUI A; 2AKK A; 4M75 G; 5CO7 A; 2XD0 A; 4X9C A; 2OTJ T; 1T0H A; 1PWT A; 3X24 B; 3REB B; 3OYG A; 3G6E Q; 4ZNX A; 2KYM A; 1YNZ A; 3I35 A; 2D0N A; 5LJ3 d; 5GMK i; 1AWJ A; 4HVV A; 4R55 A; 4C0G A; 1GL5 A; 1YWO A; 4A54 A; 4QW2 A; 1BIA A; 2RQV A; 1MUZ A; 1KQ1 A; 1X2K A; 1VQ7 A; 2YUO A; 3FIF A; 1YJ9 Q; 2DL7 A; 2HQX A; 2Z0W A; 3SWN A; 3JCM V; 3JCM X; 1QVF P; 3OSV A; 4DOW A; 2MMP A; 5FW9 A; 4MDW A; 3C95 A; 3EFR A; 5GAN d; 4M7A F; 2C0O A; 1M27 C; 2FHD A; 3CD6 A; 1PKT A; 4AFS C; 2HKN A; 2OX7 A; 4M77 A; 5J3B A; 2RHI A; 2O01 E; 3OS2 A; 1G3W A; 2XKO C; 3HRU A; 3JCM J; 3PVL A; 4OB3 B; 5CKD A; 2J06 A; 2LCS A; 4EPC A; 2IG0 A; 1RLP C; 3CCL A; 4LNP A; 2MK5 A; 4C0D B; 5LJ5 h; 5I11 A; 1F1B B; 3QJ6 A; 3MKD A; 1D0X A; 3VYG A; 4Z8A A; 4Z02 A; 2DEU A; 1YCS B; 3LWI A; 3OSS C; 2L5Q A; 2NWM A; 4CC3 A; 2YRD A; 2L3P A; 3CC4 T; 2EBP A; 1JB0 E; 1NE8 A; 4JRQ A; 1CKA A; 2JTM A; 1VQM Q; 1WXB A; 3CME A; 3JCM b; 1FMW A; 4J9E A; 3JB9 F; 2L8D A; 1Q82 U; 4E7H A; 1WXU A; 3MPU B; 3FRN A; 4PJM A; 2PTK A; 2FZC B; 1M4Z A; 3NTI A; 2CP5 A; 3HKS A; 1YI2 T; 3PIO A; 2RN8 A; 3X20 B; 1YIT A; 1Z9Q A; 3OYI A; 4M75 E; 3CC2 T; 4XK8 E; 2FPE A; 1BK2 A; 1Y0M A; 1QLY A; 4PJO B; 2E41 A; 5IAY A; 2MF2 A; 4FIB A; 2PU9 B; 4M7D B; 4GLM A; 4XTU A; 4F7U B; 2B8A A; 1PNJ A; 4XU3 A; 4M78 B; 3OYC A; 2HL3 A; 4M77 D; 4RUG A; 2LMJ A; 5J26 A; 1UHF A; 3EGD A; 2DIG A; 4FU6 A; 2FRW A; 1N9R A; 1VOM A; 5HK3 A; 2E12 A; 1JQQ A; 1VQ5 T; 2EQU A; 1U5S A; 5IXF A; 2RQT A; 4HKE A; 1GCQ A; 3CC7 A; 4AMC A; 4V2S A; 3TSW A; 5GAN 8; 3E19 A; 1S1N A; 1TU0 B; 5A0G A; 5KCH A; 1UTI A; 2GGR A; 2EQJ A; 1KG1 A; 2DMO A; 2HKQ B; 4FSS A; 3JSC A; 4NL3 A; 5GMK m; 2K3Y A; 3G4S Q; 3VS3 A; 1VQ7 T; 1N6A A; 1OUL A; 5GMK l; 3LX7 A; 2QEX Q; 4C0D C; 2CP3 A; 4KBM B; 2GCX A; 2EGC A; 2NUP A; 3CD6 T; 2LCC A; 3UDC A; 3C12 A; 1OOT A; 3S6W A; 3G71 A; 2VV5 A; 1UGP B; 1G83 A; 4J6Y A; 5D6W A; 1WIE A; 2ED1 A; 3RKX A; 3HTR A; 3MEU A; 1D0Z A; 1YHQ T; 1QVF S; 2DBK A; 2P84 A; 5GAO n; 3RDV A; 5GAO p; 4LXC A; 1RAG B; 4JJD A; 3WVE B; 1ZSZ B; 3A8M B; 2MOX A; 2L3S A; 2YT6 A; 1G2B A; 2LVM A; 2DO3 A; 3INZ A; 4C5I A; 2SEM A; 3VS2 A; 1IB8 A; 2HEQ A; 1EX4 A; 2OTL A; 2DBM A; 2KNB B; 2V8K A; 3EFO A; 4HCZ A; 2DM1 A; 1KQ2 A; 4A53 A; 2PUO B; 2BE7 D; 2FVU A; 4PJO C; 2MPX C; 8AT1 B; 2EJ9 A; 2V8J A; 4M78 F; 3GLX A; 2DIQ A; 4M7D C; 3M55 A; 5KYW B; 5IT9 E; 4M77 F; 1U8R A; 4M78 C; 1VYU A; 1ZQ1 A; 2X4J A; 3JB9 I; 1YIT T; 2E6N A; 3JCM Q; 2X9H A; 2HL5 C; 2ZPH B; 3V7C A; 1D3B A; 2X4X A; 1X43 A; 3M0S A; 3GIB A; 2PNI A; 4DA4 A; 1M1F A; 4RG2 A; 4LUD A; 5GAN 3; 2WSC E; 1V1C A; 1VQP A; 4J9F A; 3HPW A; 3PMT A; 3NHN A; 3REA B; 2P0P A; 2NUT A; 5LJ5 d; 5C0M A; 5GAM j; 3A8O B; 4E7J A; 2VAS A; 3EAE A; 2HSP A; 4RMO A; 1VQ8 Q; 3ZEH A; 5GAN 5; 1D1C A; 4GY5 A; 1Q7Y C; 1BU1 A; 3MEW A; 4C5H A; 2CP0 A; 5CIU A; 3L42 A; 5A0L A; 2JUF A; 2R58 A; 1PHT A; 2RHY A; 4WTO B; 1IRE B; 4PJJ A; 1EZZ B; 2QA4 A; 2LDM A; 4M75 B; 2RMO A; 2BUD A; 2KRS A; 4MML A; 1OQK A; 3I56 T; 1RAD B; 2O31 A; 2ZPF B; 2C0T A; 3GBQ A; 5J39 A; 4E7K A; 1TH7 A; 1TS9 A; 2DPP B; 2CRE A; 4RTY A; 2HCK A; 5GAO r; 1WX6 A; 1W4S A; 3OYK A; 2COW A; 3OS5 A; 4A4G A; 4BE2 A; 2KT1 A; 3CCS A; 4E47 A; 4HT9 A; 3M4G A; 2YLC A; 2X4Y A; 3RIR A; 4E7Z A; 3NPF A; 2DA9 A; 1VUB A; 2DX1 A; 1VYV A; 3OYF A; 2MWO A; 1K76 A; 1ABQ A; 3M0R A; 4DBR A; 5AYF A; 3QZ9 B; 4GBQ A; 2B86 A; 1UJY A; 2Y90 A; 3QJY A; 4PJO G; 5CKF A; 1ZHI A; 4OB1 B; 1PSF A; 4HCC A; 2AZS A; 4M7D G; 4F7U G; 5A2Q E; 3CCU Q; 2LNH B; 1VIE A; 4KH0 B; 4FYY B; 4KH1 B; 3CBM A; 3BDL A; 1AZG B; 3A98 A; 4O6J A; 2OTL T; 1BCO A; 3CCE Q; 2D8J A; 2DYI A; 1N9S A; 3BW1 A; 1MV3 A; 1YHQ Q; 3RUX A; 2FZK B; 1RI0 A; 1WXT A; 2A7Y A; 1WI7 A; 3MP8 A; 4OMP A; 2JZ2 A; 3CCJ Q; 3SHW A; 1HXD A; 3V7R A; 3CCQ T; 1JO8 A; 3AHU A; 3A8G B; 1R77 A; 2DTO A; 2DXT A; 3EG3 A; 3PT9 A; 2LJ1 A; 3X25 B; 1X27 A; 1JJ2 A; 4B6M A; 3PTA A; 2DIL A; 3F70 A; 1AWO A; 1QCF A; 3CMA A; 2JS2 A; 4BI4 A; 3GP8 A; 2E64 A; 3LGF A; 1GFD A; 1VQP T; 1YJW T; 1VQO A; 2A0F B; 5GAN j; 3VJP A; 1M30 A; 4ME7 A; 2FPD A; 2J6O A; 1I07 A; 3R6N A; 1K8A C; 4M75 C; 2EYX A; 4IIM A; 2XDB A; 1CSK A; 3CCM A; 2E65 A; 5KYU A; 3FDR A; 2MWP A; 2IPO B; 5GAM e; 2M1H A; 1UFF A; 1RAF B; 3JB9 H; 2A08 A; 3CPF A; 3OS0 A; 1I8F A; 2JT4 A; 3VUZ A; 2FRY A; 5CCA A; 1UG1 A; 2C0I A; 2QA4 T; 1HSQ A; 2K7A A; 3QG1 A; 2KRN A; 5L8R E; 3OY9 A; 2LTO A; 2P0Q A; 2CT3 A; 1KD1 C; 1PM3 A; 1K1Z A; 3IQL A; 5GAM f; 4KUL A; 3C94 A; 2RQU A; 3OYJ A; 2H3E B; 5GAO m; 2DZC A; 2DRK A; 3OBW A; 5D6X A; 3L2Z A; 1BCM A; 5GAO l; 4FM4 B; 1AZE A; 2YWW A; 3MJX A; 4R56 A; 3CCS T; 1VQ9 Q; 2CUB A; 3JCM h; 4PFZ A; 1QMC A; 2X4W A; 1YBY A; 1QWF A; 1W6X A; 1U06 A; 1UEC A; 3HFO A; 3VU3 C; 1Q7Y U; 5DM7 R; 3PMI A; 3C4S A; 2YSQ A; 1G3T A; 1TUD A; 1VQK Q; 2ZPI B; 3M57 A; 4CC7 A; 2ZCF B; 4ANJ A; 5CVI A; 4DOV A; 3G7Z A; 1QVF A; 1JXM A; 1WFW A; 3UT1 A; 4AFZ C; 1ZA2 B; 2RD1 A; 4J9C A; 3JB9 D; 2LQ8 A; 2XI9 A; 2KDS A; 4F04 B; 5IHI A; 3CCV Q; 4PLL A; 1ZLM A; 2QXF A; 3O5Z A; 2VB6 A; 2E5Q A; 2EKH A; 1BI1 A; 1Y07 A; 2NLU A; 1VIF A; 3I5S A; 2BKD N; 3UAT A; 3M0T A; 1H3H A; 2KE9 A; 2EQM A; 5FU6 B; 2L2P A; 1O9S A; 1VQN Q; 1C6V X; 2KRM A; 4RKU E; 2AK5 A; 1NEG A; 2RM4 A; 1T3S A; 2DK3 A; 3L1A A; 1I5O B; 2O88 A; 4HCB A; 4BAC A; 2EPD A; 5KYX B; 2EIF A; 3CPW S; 1NG2 A; 3QZ5 B; 1Q82 R; 2JNG A; 4JUV A; 3CMA T; 1EIF A; 2MYS A; 1M3B A; 1K8A R; 1S72 T; 1TUG B; 2YDL A; 2RJC A; 3EG2 A; 4J7F A; 4Y92 A; 2KGT A; 1SPK A; 1YJN A; 2YHT A; 2JTF A; 1VQO T; 5FRO A; 3EGX B; 1E6G A; 2EYZ A; 2QDL A; 2QDY B; 2MAM A; 4R0K A; 2QTX A; 4Z89 A; 2ZPB B; 4PJO A; 3CCM T; 3JCM P; 2RI5 A; 3VRY A; 3I55 Q; 1K9A A; 5GAN e; 1RI9 A; 3C0C A; 1G3Y A; 4M7D A; 4F7U A; 3L2Q A; 1M8V A; 4M78 A; 4LDY A; 2PVO B; 1KD1 R; 4M4Z A; 1YJW Q; 4AG1 C; 1VQL A; 1ZX6 A; 2DLP A; 3BE3 A; 3M56 A; 2KI7 A; 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