The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
4
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sequence length |
78
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structure length |
78
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Chain Sequence |
GSSGSSGTLRNYPLTCKVVYSYKASQPDELTIEEHEVLEVIEDGDMEDWVKARNKVGQVGYVPEKYLQFPTSSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Solution structure of the first SH3 domain of human KIAA0769 protein
rcsb |
| molecule keywords |
KIAA0769 protein
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| total genus |
4
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2006-04-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UAT A; 4HCK A; 1WYX A; 4Z88 A; 5EC7 A; 1ZUK A; 2KE9 A; 1OPL A; 1T0H A; 2F2W A; 2LCS A; 1PHT A; 1PKS A; 1PKT A; 1E6G A; 2DA9 A; 2YUN A; 1I1J A; 1AWX A; 2H8H A; 4J9C A; 4RUG A; 1JO8 A; 1Y0M A; 1ZUY A; 1GCP A; 2CRE A; 2DBM A; 1WXU A; 3VS2 A; 3EG1 A; 4DEY A; 2EYZ A; 1UDL A; 2PTK A; 2V1Q A; 2CSI A; 4GBQ A; 3M0Q A; 2DRK A; 2RNA A; 2KEA A; 2LNH B; 1OV3 A; 5HCK A; 1AVZ C; 1AOJ A; 1UUE A; 2KGT A; 3VRZ A; 4OMP A; 4OMQ A; 5FW9 A; 2FRW A; 2KRN A; 1E7O A; 2K79 A; 2RQV A; 1NLP C; 2SEM A; 2RQT A; 2LJ3 A; 1K0S A; 2JMA A; 1WA7 A; 1GRI A; 2DMO A; 3EG0 A; 1YNZ A; 2L0A A; 1TUC A; 4ESR A; 2C0O A; 2BZ8 A; 2AZV A; 2LX7 A; 2DF6 A; 3RBB B; 2JW4 A; 1MV3 A; 3TVT A; 1XOV A; 2VVK A; 2LJ0 A; 1KSW A; 2O2O A; 2D0N A; 2FEI A; 4ORZ A; 2A08 A; 3UF4 A; 1JXO A; 2C0T A; 3NHN A; 2L2P A; 2M51 A; 1YWO A; 2L3S A; 4F16 A; 2JMC A; 4E6R A; 2DL4 A; 4AFQ C; 1X2K A; 2DM1 A; 3CQT A; 2CUD A; 1OPK A; 2EBP A; 4DEX A; 2J6F A; 1V1C A; 1PWT A; 1SRL A; 1JQQ A; 2ED0 A; 1RI9 A; 2W0Z A; 5GJW B; 1MV0 B; 2BZX A; 1NG2 A; 1QKX A; 4F17 A; 1FMK A; 2A28 A; 2G6F X; 2W10 A; 4IIO A; 2KR3 A; 2DYB A; 1UJY A; 1QWE A; 1OOT A; 2GTJ A; 1BK2 A; 2L3P A; 2KXD A; 3VS1 A; 4AFZ C; 1FYN A; 1UFF A; 2LQN A; 2DX1 A; 1UJ0 A; 4CC3 A; 1HJD A; 4D8K A; 2CH4 W; 3H0H A; 1NM7 A; 4JJC A; 3H0F A; 2CSQ A; 2E5K A; 3VS5 A; 2YT6 A; 1GBQ A; 2CT4 A; 2K9G A; 1SPK A; 2LZ6 B; 2DL7 A; 1GBR A; 2LJ1 A; 4D8D A; 3NMZ C; 3EHQ A; 3M0U A; 2DVJ A; 2EPD A; 4Z8A A; 3ZL7 C; 1UTI A; 3VS6 A; 2K2M A; 3ULR B; 1QCF A; 2LP5 A; 2O88 A; 5IXB A; 3EHR A; 4HVW A; 3TSW A; 2F2V A; 4FSS A; 1K4U S; 1WFW A; 2AKL A; 2CDT A; 4AFS C; 1YN8 A; 1RUW A; 1T0J A; 4LE9 A; 3VS3 A; 1AWW A; 2JTE A; 2P4R A; 1OEB A; 1K0X A; 2KRS A; 2NUZ A; 2ROL A; 3RNJ A; 3VS0 A; 1I07 A; 2K7A A; 3SEM A; 5ECA A; 5IHN A; 1AEY A; 2DIL A; 5IHK A; 1BU1 A; 2HCK A; 2OAW A; 3EGU A; 4CC2 A; 1WDX A; 4LUD A; 1ZX6 A; 1WIE A; 1CSK A; 2KBT A; 3THK A; 1KIK A; 2HDA A; 1KJW A; 2L3Q A; 1W1F A; 1VYU A; 2RN8 A; 2VWF A; 2JT4 A; 4JZ3 A; 4LNP A; 2FG0 A; 1ABQ A; 2EW3 A; 4J9H A; 1M8M A; 1HSQ A; 5IH2 A; 2XMF A; 4OMM A; 1M3C A; 1WXT A; 2J06 A; 3C0C A; 4M4Z A; 2LMJ A; 3PVQ A; 1NYG A; 2CH4 A; 2I0N A; 1MUZ A; 4GLM A; 1ZSG A; 3VRY A; 2D8J A; 2DJQ A; 4K11 A; 1GL5 A; 1W70 A; 2GNC A; 2X3W D; 5IXF A; 4J9D A; 1UG1 A; 2FPF A; 3TSZ A; 2YUO A; 4AG2 C; 4R0K A; 3REB B; 3NPF A; 1UE9 A; 3U23 A; 3UA6 A; 1I0C A; 1ABO A; 2NWM A; 1TG0 A; 2KYB A; 1H8K A; 2GGR A; 2HSP A; 3O5Z A; 2PNI A; 2DLP A; 1JU5 C; 1T3S A; 2ABL A; 2GBQ A; 1E6H A; 2X3X D; 1YP5 A; 1UEC A; 2PZ1 A; 1Y57 A; 3A98 A; 4Y92 A; 2J05 A; 2OJ2 A; 2DRM A; 1YCS B; 2SRC A; 3I5R A; 4HVU A; 2HEQ A; 1EFN A; 2RMO A; 1A0N B; 1X27 A; 2F2X A; 2RF0 A; 1AZE A; 2HBW A; 1X6G A; 3EG3 A; 5FWB A; 1M27 C; 4Z89 A; 2QDL A; 3QWY A; 4HVV A; 3REA B; 1U06 A; 1NEB A; 2O9V A; 2VKN A; 2DBK A; 4J9B A; 1M3B A; 1QLY A; 1PNJ A; 1X2Q A; 3IQL A; 2IIM A; 2KYM A; 4ZNX A; 1K9A A; 1SRM A; 2ESW A; 2FPD A; 2OI3 A; 1WXB A; 4LN2 A; 4RTZ A; 1B07 A; 4F14 A; 5I11 A; 4RTU A; 1LCK A; 1NEG A; 2EGC A; 1S1N A; 2AK5 A; 2DL5 A; 1SSH A; 1K1Z A; 1GCQ A; 2DNU A; 4OML A; 5FWC A; 1QWF A; 1H92 A; 1M3A A; 4RTY A; 2B86 A; 3JV3 A; 4JZ4 A; 1M30 A; 2D8H A; 4LUE A; 1HD3 A; 4AG1 C; 3KFV A; 2FPE A; 5L23 A; 2YUP A; 2JS2 A; 1UGV A; 4JPB W; 4RTV A; 2ROT A; 4J9G A; 2DE0 X; 2KRO A; 2JXB A; 4RTW A; 2JM8 A; 2GQI A; 2RQR A; 2MIO A; 3NGP A; 2J6K A; 2K6D A; 3M0R A; 2EVR A; 3UA7 A; 1SHG A; 3I5S A; 3VS4 A; 1UHF A; 2YSQ A; 1NYF A; 1T3L A; 1YWP A; 3PE0 A; 4A63 B; 2K3B A; 2O9S A; 1B3Q A; 1VA7 A; 4EIK A; 4WCI A; 3I35 A; 4RTT A; 1RLQ C; 2MOX A; 2GTO A; 1BB9 A; 3H0I A; 1GFD A; 3VS7 A; 1QKW A; 2KXC A; 4QT7 A; 1AWJ A; 1N5Z A; 3M0P A; 3I9Q A; 4J9I A; 1VYT A; 1PRM C; 2EYX A; 1Z9Z A; 3FJ5 A; 1ZBJ A; 2ECZ A; 4JJD A; 4KRT A; 2MCN A; 3SHW A; 2EYW A; 1AZG B; 1JXM A; 1UHC A; 2V1R A; 2EKH A; 2J7I A; 1GCQ C; 1G2B A; 1WX6 A; 1W6X A; 1JEG A; 1SHF A; 2YDL A; 1WLP B; 4JJB A; 4OMO A; 2EGA A; 4J9F A; 1KFZ A; 1U3O A; 4AFU C; 1VYV A; 2EGE A; 1X43 A; 2J6O A; 3H41 A; 2RPN A; 2EYY A; 2RQU A; 3QWX X; 4CC4 B; 2C0I A; 1CKB A; 3GBQ A; 2CUB A; 1ZUU A; 2A36 A; 3M0T A; 2KT1 A; 2D1X A; 1J3T A; 1TUD A; 4HXJ A; 4X1V A; 4CC7 A; 1RLP C; 2AZS A; 2DL8 A; 2ED1 A; 2EQI A; 1ARK A; 1H3H A; 1Z9Q A; 2AKK A; 2RQW A; 2BZY A; 4RTX A; 2A37 A; 3LH5 A; 4OMN A; 2DL3 A; 1K76 A; 2KRM A; 2ENM A; 2CT3 A; 1ZLM A; 1AWO A; 1BBZ A; 5I22 A; 2KNB B; 5GJV B; 3M0S A; 3R6N A; 2JM9 A; 2LQW A; 2FRY A; 3EG2 A; 2KT8 A; 4IIM A; 2FO0 A; 1NLO C; 3PVL A; 4J9E A; 5IHI A; 1G83 A; 1SEM A; 1X69 A; 2BTT A; 1WI7 A; 1X6B A; 2O31 A; 2YUQ A; 1GFC A; 1AD5 A; 1IO6 A; 2JS0 A; 1PRL C; 1U5S A; 1CKA A; 2M0Y A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1KC8 R; 3UAT A; 4HCK A; 1I5L A; 1PKT A; 3HRU A; 3FLG A; 4XTZ A; 3RDV A; 3CME Q; 1PG5 B; 3OSV A; 4DA4 A; 2L3R A; 1YIT A; 2H8H A; 3CCJ A; 1JO8 A; 2VXF A; 3CCS A; 4OB3 B; 2E3H A; 1WXU A; 3OW2 S; 1D09 B; 4DEY A; 1UDL A; 2PTK A; 1YJ9 T; 2MWO A; 2DRK A; 1O9S A; 1IGU A; 1YI2 T; 2IG0 A; 4C5I A; 3QJ6 A; 1OV3 A; 2HAX A; 2FYK A; 3EAE A; 1AOJ A; 3EH1 A; 1YIJ T; 1D0X A; 3JCM c; 1KK7 A; 1SKU B; 4JRQ A; 2MK5 A; 1FWZ A; 4OMQ A; 1VQ6 A; 3UPU A; 2H3E B; 1KG1 A; 1E7O A; 3M57 A; 4PJO B; 1YJN T; 2RQV A; 5I21 A; 1VQ9 T; 1NLP C; 1FX7 A; 2SEM A; 1K0S A; 2QTV A; 1YJW T; 1WA7 A; 1GRI A; 2DMO A; 2KQW A; 3MHX A; 3EG0 A; 3JCM b; 1Q81 U; 5I2M A; 2XK0 A; 1O75 A; 1MV3 A; 4C92 E; 2LJ0 A; 5GAM h; 1UEB A; 2D0N A; 2FEI A; 2WSE E; 4BD3 A; 3TEE A; 2C0T A; 1HK9 A; 3CC4 Q; 2F5T X; 1M2V B; 4C0Z A; 2M51 A; 1JB0 E; 1VQ4 T; 3O8V A; 2JMC A; 2QK0 A; 3S6W A; 1ZA2 B; 2DL4 A; 1X2K A; 2CUD A; 2EBP A; 3MEA A; 1YIT Q; 1V1C A; 2QI2 A; 3CCJ Q; 1Q82 R; 4LDV A; 3CCS Q; 1MMA A; 4XTV A; 2RHI A; 3SDZ A; 3EG9 A; 2OTL A; 1RI9 A; 3VUB A; 2VC8 A; 2V8I A; 2GF7 A; 1RAD B; 2VUB A; 4C92 F; 2A28 A; 2G6F X; 4M75 F; 1M5Q 1; 2KR3 A; 1UJY A; 3CCM T; 4BE0 A; 2GTJ A; 3WXM B; 2BE9 B; 1UJ0 A; 3QDR B; 1HJD A; 3H0H A; 1QW1 A; 5GAN 2; 1LOJ A; 1MMG A; 2E5K A; 4J5Y A; 1TUG B; 3GF5 A; 2PUO B; 2WSF E; 4IUQ A; 1SPK A; 1VIE A; 2DL7 A; 2LJ1 A; 5GAN h; 1VQ7 T; 3VS6 A; 1OYX A; 3ULR B; 2O88 A; 4EMG A; 1PM3 A; 2PQW A; 2DD5 A; 3QG1 A; 3HSB A; 4C92 G; 1YN8 A; 5LJ3 h; 1T0J A; 3JB9 D; 2ZPF B; 4LE9 A; 2HL5 C; 2DXC A; 4J7I A; 2PUK B; 3RKY A; 2P4R A; 1OEB A; 1K0X A; 2NUZ A; 2WSC E; 1QVP A; 1I07 A; 1Q7Y C; 3SEM A; 2X4W A; 5ECA A; 5GAN 7; 5IHN A; 3G71 T; 1AEY A; 1D3B B; 3GNG A; 3MO8 A; 5IHK A; 1BU1 A; 2OAW A; 4M78 E; 2XID A; 2OTL Q; 4LUD A; 5GMK j; 3C95 A; 4PFP A; 1KIK A; 4O5V A; 2HDA A; 1KQS A; 2E70 A; 4ZN1 A; 3HHT B; 1W2B A; 3CCQ A; 4LNP A; 2FG0 A; 2EW3 A; 2QTX A; 4BDZ A; 4KGX B; 1WPY A; 2CS7 A; 1P92 A; 2LMJ A; 4E7Z A; 4LDY A; 2CH4 A; 4MZT A; 2DK3 A; 2D8J A; 5LJ5 d; 2DJQ A; 2GNC A; 4JDS A; 3OYL A; 5IT9 E; 1MHN A; 4M78 F; 4FYY B; 3V8J A; 2GFU A; 3GNF B; 4EMH A; 1QVG A; 1UE9 A; 3U23 A; 2QQA A; 3OYC A; 3HTR A; 1VQM A; 2NWM A; 1TG0 A; 2DKG A; 2HSP A; 2DJZ A; 3QO3 A; 1PSF A; 4E47 A; 5DLO A; 3EFR A; 3JCM g; 1WHK A; 1WNL A; 3TRE A; 3G4S A; 1D1B A; 2HQH A; 1KC8 U; 1UEC A; 2MI6 A; 2OAU A; 4Y92 A; 1N6A A; 3EGD A; 5CKB A; 4XK8 E; 1VOM A; 4HVU A; 3L1A A; 2RM4 A; 3CC2 A; 2QAZ A; 1UGP B; 2P84 A; 2F2X A; 3RIR A; 1AZE A; 4FW1 A; 2FHD A; 5FWB A; 3JCM e; 3REA B; 2M16 A; 3RER A; 4M78 G; 3X26 B; 2O9V A; 2VKN A; 3G7Z A; 2EAY A; 3SFM A; 3CCR A; 1PSE A; 4EMK C; 4J9B A; 1RAC B; 3CCQ Q; 1M1F A; 1M3B A; 1D1C A; 1QLY A; 4LD6 A; 2KYM A; 1K9A A; 3JCM f; 2QQS A; 4YTL A; 3RKX A; 4R56 A; 4RTZ A; 4UC4 A; 3OW2 A; 4JRI A; 5I11 A; 4RTU A; 1LCK A; 3I56 A; 1NEG A; 6AT1 B; 4DBH A; 1K1Z A; 1GCQ A; 4OML A; 3J7A F; 4PJN A; 4C92 B; 2BE7 D; 4M75 B; 1VQP T; 1M3A A; 4RTY A; 2HKQ B; 1VQL T; 1VQM Q; 4AG1 C; 3MP1 A; 3V8K A; 2FVU A; 2FPE A; 3DLL A; 1TU0 B; 2YUP A; 2WAC A; 2JS2 A; 5J26 A; 2P4T A; 2KRO A; 2JXB A; 3G4S Q; 3HFN A; 1NJI R; 2DTH A; 2RQR A; 2MIO A; 2EQK A; 3M0R A; 4A53 A; 1SHG A; 3BFM A; 1UHF A; 2YSQ A; 1YWP A; 3PE0 A; 3JAM E; 3CC2 Q; 1Q82 U; 3V7C A; 1B3Q A; 5KYN A; 4WCI A; 2RA2 A; 4WF2 A; 4B6M A; 3E9F A; 2MOX A; 2QXF A; 1BB9 A; 2YLB A; 3CCR Q; 1N5Z A; 1VYT A; 2RJE A; 2EYX A; 3H8Z A; 2HSE B; 5DM7 R; 4D6W A; 4E7L A; 1Z9Z A; 1ZBJ A; 4CI0 C; 4KRT A; 3CCE T; 2V26 A; 3I56 Q; 1C0M A; 4OVA A; 5FU7 B; 3OW2 P; 5KE3 A; 1W6X A; 4M75 A; 2YDL A; 4N0A A; 4WTO B; 3LWH A; 1QCO A; 1YJ9 A; 3OS2 A; 2MWP A; 3H6Z A; 2J6O A; 1Y71 A; 1JJ2 S; 1BCM A; 3GBQ A; 3J80 E; 8ATC B; 4E2F B; 1YIJ A; 3SWN A; 4NL2 A; 4M78 B; 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5GMK e; 2O2O A; 2DXU A; 4ORZ A; 5GAO m; 2CP5 A; 2R58 A; 3G71 A; 2L2P A; 1FMV A; 1YWO A; 3FDR A; 4F7U F; 3WVE B; 4IUT A; 2J6F A; 2LT1 A; 2PVG B; 5GAN g; 1PWT A; 4KT0 E; 2QA4 Q; 2ED0 A; 4N4G A; 2W0Z A; 1NG2 A; 3JCM V; 1K73 C; 2K5F A; 4AT1 B; 1NJI U; 3TQ7 P; 1FMK A; 5GAO r; 2RK2 A; 1OZ2 A; 2D9T A; 2QQB A; 5LJ3 g; 2DYB A; 1OOT A; 1BK2 A; 2KI7 A; 2KXD A; 2QG9 B; 1BI3 A; 3OS5 A; 3FC3 A; 1FYN A; 1UFF A; 5GAN e; 2DX1 A; 1RI0 A; 5HK3 A; 1IXD A; 3MKD A; 3EFO B; 2KDS A; 3M59 A; 5IAY A; 3FB9 A; 3VS5 A; 2YT6 A; 2YWW A; 3BE3 A; 1GBR A; 4D8D A; 2I2L A; 3EHQ A; 5GAN f; 3M0U A; 2EPD A; 3M56 A; 1UTI A; 2COW A; 2K2M A; 2QGG A; 4JJN K; 1Q86 R; 1D1A A; 4KGV B; 1QCF A; 5CVI A; 2IVW A; 2LP5 A; 2RJF A; 4HVW A; 2F2V A; 1C6V X; 4C8Q G; 2HKN A; 2RI2 A; 2V8J A; 5KYX A; 2DEQ A; 2CDT A; 5LJ3 f; 4M77 B; 2RI5 A; 2DO3 A; 2K2V A; 3A8M B; 3OS1 A; 2NUP A; 2KRS A; 3RNJ A; 4C0G A; 5FRN A; 1VQO T; 5LJ5 j; 2K7A A; 4DBQ A; 1K8A U; 3GP8 A; 4IUP A; 2HCK A; 3M5A A; 2YRD A; 1EZZ B; 1ZX6 A; 1PCX A; 4FYV B; 2CZ1 B; 3THK A; 4ELZ C; 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