The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
65
|
structure length |
65
|
Chain Sequence |
EPEVPFKVVAQFPYKSDYEDDLNFEKDQEIIVTSVEDAEWYFGEYQDSNGDVIEGIFPKSFVAVQ
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule keywords |
Myosin tail region-interacting protein MTI1
|
| molecule tags |
Contractile protein
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| total genus |
14
|
| structure length |
65
|
| sequence length |
65
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1AEY A; 2ROT A; 3LH5 A; 2KT8 A; 4OMQ A; 4R0K A; 3VS2 A; 4OMN A; 2OAW A; 2RQR A; 1H8K A; 2LCS A; 1QLY A; 1EFN A; 2DL3 A; 2JW4 A; 2DYB A; 2K9G A; 3C0C A; 1YP5 A; 2RMO A; 1HD3 A; 1G83 A; 1UUE A; 3FJ5 A; 4DEY A; 1W6X A; 2EKH A; 1UTI A; 2W0Z A; 2FPE A; 2DF6 A; 2PZ1 A; 2YUN A; 1FYN A; 1M3C A; 2DBM A; 4CC3 A; 1A0N B; 2CT3 A; 1G2B A; 1AVZ C; 2FEI A; 2RQV A; 2BZY A; 4EIK A; 4QT7 A; 4RTU A; 1RLQ C; 3VS1 A; 1SPK A; 2DLP A; 3H0F A; 3TVT A; 2C0I A; 2HCK A; 4RTX A; 2A28 A; 4F14 A; 2K7A A; 2K3B A; 1CSK A; 2HSP A; 4J9E A; 4HVU A; 2OI3 A; 3PVL A; 1PHT A; 3ULR B; 1M27 C; 2GQI A; 1I0C A; 1SEM A; 2J06 A; 2DVJ A; 1AD5 A; 1GFC A; 1AOJ A; 2J6K A; 2L3P A; 1UEC A; 1T0H A; 2GNC A; 2JS2 A; 1ZLM A; 5ECA A; 2J7I A; 2LNH B; 2F2V A; 3VRY A; 2QDL A; 1K0X A; 1JXM A; 3R6N A; 2AZV A; 2LJ3 A; 1SRL A; 4KRT A; 2LJ1 A; 3KFV A; 3VS6 A; 1BU1 A; 2YT6 A; 4JZ4 A; 2XMF A; 2DRM A; 3QWY A; 3NGP A; 2A36 A; 1QKX A; 1KSW A; 2MIO A; 2YUP A; 1RUW A; 3NHN A; 4ZNX A; 4OMM A; 1ZUU A; 1JXO A; 1VYV A; 1YWP A; 2A08 A; 1WXT A; 2D0N A; 1MUZ A; 2KRO A; 1GBQ A; 1NEB A; 2EYX A; 4J9C A; 1E6H A; 5FWB A; 4CC4 B; 2LP5 A; 4AFZ C; 1QCF A; 1Z9Z A; 1I07 A; 2DE0 X; 5IXB A; 2M51 A; 1K76 A; 1QWE A; 2LQW A; 1GCQ A; 3VS3 A; 3I9Q A; 2DNU A; 3JV3 A; 2VKN A; 2VVK A; 2KXC A; 2ED0 A; 2HDA A; 2RPN A; 1MV0 B; 4AFU C; 4Z88 A; 1JEG A; 4Z8A A; 2DL8 A; 2FPF A; 1X6G A; 1GCP A; 2ECZ A; 4Z89 A; 4RTT A; 4HCK A; 1UGV A; 1SSH A; 4AG2 C; 3REB B; 2AKK A; 2PNI A; 2C0O A; 2O9V A; 1B07 A; 5EC7 A; 2FO0 A; 3SHW A; 4DEX A; 3IQL A; 3VRZ A; 3U23 A; 1V1C A; 3VS4 A; 1AWW A; 2CSI A; 3TSZ A; 1T0J A; 2V1R A; 4J9D A; 2JM8 A; 2A37 A; 1WXU A; 2ESW A; 3M0Q A; 1WLP B; 4K11 A; 2EQI A; 4E6R A; 1X6B A; 2EGE A; 1HSQ A; 3EG2 A; 1N5Z A; 1K1Z A; 3RBB B; 1NLO C; 2CSQ A; 2EVR A; 2OJ2 A; 1K9A A; 1PRM C; 3H0I A; 2GTO A; 4HXJ A; 3TSW A; 3UA6 A; 3NMZ C; 4FSS A; 1NYG A; 2ED1 A; 1ZX6 A; 1AWO A; 2L3S A; 4F17 A; 4AFS C; 2L2P A; 2RNA A; 3NPF A; 1UG1 A; 2RQU A; 3EG1 A; 4OMO A; 1AZG B; 3CQT A; 1ZBJ A; 3PVQ A; 2DMO A; 4RTW A; 4D8D A; 1YWO A; 4JPB W; 5IHK A; 1PWT A; 2LMJ A; 3I5S A; 2RN8 A; 1I1J A; 2L3Q A; 1UE9 A; 1WYX A; 4J9G A; 1NYF A; 4AG1 C; 4Y92 A; 2E5K A; 2D8J A; 2KEA A; 2KYM A; 3M0U A; 1ARK A; 4JJB A; 4X1V A; 2KNB B; 2DRK A; 2GTJ A; 1AZE A; 3SEM A; 2IIM A; 2JXB A; 1U3O A; 2FRY A; 2NUZ A; 4JJD A; 4CC2 A; 2CDT A; 2CRE A; 2VWF A; 2MOX A; 1Y0M A; 2X3X D; 4LNP A; 2BZ8 A; 2BTT A; 2EYY A; 1YNZ A; 1UHC A; 1ZSG A; 2JMA A; 1UJY A; 1K4U S; 4LUD A; 1X27 A; 2RF0 A; 3EHQ A; 2J6F A; 1M3B A; 4WCI A; 2FG0 A; 5HCK A; 3RNJ A; 4ESR A; 2O2O A; 2DIL A; 1Y57 A; 1AWX A; 4J9F A; 2KBT A; 1OV3 A; 3VS7 A; 1PKS A; 1LCK A; 2ENM A; 1OOT A; 1GRI A; 1TUC A; 2GBQ A; 2LJ0 A; 4RTY A; 1SHF A; 2EYW A; 2F2X A; 4ORZ A; 4J9B A; 4RTZ A; 1U06 A; 2LQN A; 1K0S A; 1UFF A; 2D8H A; 2FPD A; 1H3H A; 1X43 A; 2K2M A; 1X2K A; 1BB9 A; 2KXD A; 3EG0 A; 2M0Y A; 1NG2 A; 2GGR A; 2V1Q A; 3M0T A; 1ABO A; 3M0S A; 4AFQ C; 1VYU A; 2KRS A; 1PNJ A; 4IIM A; 3EG3 A; 2JMC A; 1T3L A; 1WDX A; 2K79 A; 2FRW A; 4RTV A; 2DJQ A; 3UAT A; 1QKW A; 2YDL A; 2CH4 W; 1FMK A; 4M4Z A; 3GBQ A; 3VS0 A; 1WXB A; 3THK A; 2NWM A; 2JT4 A; 2O9S A; 2G6F X; 1B3Q A; 3EGU A; 2W10 A; 5FWC A; 5IH2 A; 2CT4 A; 2CUD A; 2DL5 A; 4JJC A; 1Z9Q A; 1CKA A; 4J9H A; 2EBP A; 2DBK A; 2LX7 A; 1AWJ A; 2EPD A; 2AKL A; 1NM7 A; 1WI7 A; 1M30 A; 2JTE A; 1WFW A; 2DA9 A; 2C0T A; 4HVV A; 1E6G A; 1GBR A; 2F2W A; 1VA7 A; 4RUG A; 4GLM A; 3I35 A; 1JQQ A; 1TUD A; 4F16 A; 1MV3 A; 2D1X A; 2HBW A; 3M0P A; 4A63 B; 2SRC A; 1XOV A; 4J9I A; 3ZL7 C; 2ABL A; 1RI9 A; 2AZS A; 1GFD A; 3H41 A; 4IIO A; 1GCQ C; 1WIE A; 2L0A A; 2RQW A; 2PTK A; 4LUE A; 2DL7 A; 1GL5 A; 2B86 A; 5IXF A; 1YCS B; 2EGA A; 2BZX A; 2KE9 A; 2YUQ A; 1SHG A; 1VYT A; 2DX1 A; 2KYB A; 2KGT A; 5GJV B; 1M3A A; 2KT1 A; 1T3S A; 3VS5 A; 1OPL A; 3I5R A; 5I11 A; 1UJ0 A; 3UF4 A; 2I0N A; 2EW3 A; 3O5Z A; 1HJD A; 3QWX X; 1E7O A; 2MCN A; 1RLP C; 1PKT A; 2DL4 A; 2ROL A; 1YN8 A; 2P4R A; 4OMP A; 1TG0 A; 2LZ6 B; 3M0R A; 1H92 A; 2O88 A; 1WX6 A; 1KFZ A; 1S1N A; 4CC7 A; 2KRN A; 2YSQ A; 2J6O A; 1ZUK A; 2RQT A; 3A98 A; 1BK2 A; 2DM1 A; 2JS0 A; 1J3T A; 1UDL A; 4LN2 A; 1X69 A; 1SRM A; 1X2Q A; 4OML A; 5IHI A; 3H0H A; 2CUB A; 2H8H A; 2HEQ A; 2SEM A; 3PE0 A; 3REA B; 2X3W D; 2YUO A; 1QWF A; 1KJW A; 4JZ3 A; 5GJW B; 1IO6 A; 3EHR A; 2K6D A; 2AK5 A; 1U5S A; 2EGC A; 4HVW A; 1W70 A; 1OPK A; 1UHF A; 1ABQ A; 4LE9 A; 5L23 A; 1OEB A; 2KR3 A; 5FW9 A; 1JO8 A; 1NEG A; 1W1F A; 1KIK A; 2O31 A; 2J05 A; 1CKB A; 4GBQ A; 1JU5 C; 1NLP C; 1ZUY A; 2KRM A; 2EYZ A; 5I22 A; 1M8M A; 2CH4 A; 2JM9 A; 3UA7 A; 1PRL C; 1WA7 A; 1BBZ A; 5IHN A; 4D8K A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3FRN A; 1TTH B; 1QVF A; 2IG0 A; 3M9Q A; 3CCL T; 2DFU A; 4OMQ A; 3CCJ Q; 1HYO A; 1D0X A; 4FU6 A; 5GAN 3; 1EX4 A; 5LJ3 h; 1OZ3 A; 1KQS A; 1QLY A; 1YFN A; 2DL3 A; 2JW4 A; 3HPW A; 3E9G A; 3C0C A; 1Q82 C; 1X6O A; 1TWB A; 2WSF E; 2OTJ A; 5LJ3 d; 2EKH A; 2W0Z A; 2FPE A; 3MEU A; 2DF6 A; 1M3C A; 5CQX A; 4CC3 A; 4MMK A; 4IUP A; 1X01 A; 1MHN A; 2JJ9 A; 2RQV A; 4C92 G; 1RLQ C; 1S72 T; 3VS1 A; 3VU3 C; 3A1P A; 4BAC A; 3H0F A; 2C0I A; 2AIR B; 4RTX A; 4PFZ A; 5EG2 A; 4F14 A; 4DQ2 A; 3MET A; 1BI3 A; 5LJ5 g; 1I4K 1; 3PVL A; 1PHT A; 2COW A; 1KD1 U; 4DOW A; 3OB9 A; 3OYN A; 7AT1 B; 5GAO l; 1NPP A; 2JUF A; 1SEM A; 2FHD A; 4PJN A; 1AOJ A; 4C8Q D; 2GNC A; 3CC2 A; 1VQL A; 3GNF B; 1K0X A; 1JXM A; 5FRN A; 2DD5 A; 5GAM h; 3V8K A; 4BE1 A; 1OU9 A; 2LC4 A; 3WVD B; 1AHJ B; 4KUI A; 1I5L A; 1VQ6 T; 5GAM d; 2XI9 A; 1YI2 T; 1M1K U; 2MWP A; 2DRM A; 3QSU A; 2LQ8 A; 1QKX A; 4OP0 A; 2MIO A; 3SB2 A; 5GAN 2; 1RUW A; 3WXM B; 5DM7 R; 3WVE B; 5FLX E; 2FVU A; 4FIB A; 1JB0 E; 3UWN A; 3CCE T; 4J9C A; 2QYZ A; 2EQJ A; 2EFI A; 3JCM X; 3A8L B; 2LT4 A; 1PSF A; 3MO8 A; 4PJJ A; 2RHZ A; 4C8Q B; 1QVP A; 1QCF A; 1PM3 A; 1BI2 A; 5KYY B; 4QKU A; 1YIT A; 4OVA A; 1K76 A; 2LQW A; 3VS3 A; 3LW5 E; 3JV3 A; 2VVK A; 3CXC A; 1YJW A; 3CEY A; 3ME9 A; 4MZM A; 5CKH A; 4JRQ A; 4C92 E; 3VUZ A; 2DZC A; 2K4Y A; 2FPF A; 5LJ5 d; 1GCP A; 2A0F B; 1XTD A; 2YRC A; 1TH7 A; 4EMK A; 4XTX A; 2AKK A; 2RD1 A; 2RI2 A; 2NUT A; 2ZPF B; 1VQK T; 4DEX A; 3VRZ A; 3JAM E; 3A8H B; 4XTV A; 1AWW A; 4DOV A; 4J9D A; 2QA4 A; 1QVF S; 3ZEH A; 1LJO A; 1PC0 A; 1WLP B; 2GFA A; 1PSE A; 2COZ A; 2EGE A; 3CCM A; 3A8M B; 1KQS S; 3RBB B; 2QAS A; 2EVR A; 2OJ2 A; 1K9A A; 2GTO A; 3QZ9 B; 4PFP A; 4LDV A; 3DLM A; 3UA6 A; 2QGF B; 5GAO m; 1Q81 U; 2ED1 A; 1AWO A; 2L3S A; 3OYD A; 4O6J A; 3DLL A; 4AFS C; 3MP1 A; 2RNA A; 5KH6 A; 2K5I A; 4KUD K; 4C92 F; 2RQU A; 3EG1 A; 5L8R E; 1ZBJ A; 4OGE A; 4JPB W; 2L5Q A; 5IHK A; 2EQK A; 2VYT A; 3CCL A; 1QQJ A; 3CCR T; 2F69 A; 2HNI A; 3ER0 A; 3PFS A; 1K73 U; 1WYX A; 4ZN3 A; 4LDU A; 5FU6 B; 2D8J A; 3PT9 A; 4C8Q C; 3EG9 A; 3GOX A; 4XTU A; 3S6W A; 2R57 A; 3V7C A; 2QQB A; 4CC2 A; 2CRE A; 5CO7 A; 2JTF A; 3L2R A; 1SF9 A; 3INZ A; 5I2M A; 2FB7 A; 2YLB A; 5LJ3 j; 2BZ8 A; 1K8A U; 2BTT A; 3JCM b; 3TU4 K; 1YNZ A; 3SD4 A; 3HHT B; 2L8D A; 4ZTF A; 1ZSG A; 2JMA A; 3JB9 D; 2D0Q B; 1K4U S; 4M7D G; 2KSS A; 4GY5 A; 2J6F A; 4UC4 A; 3C94 A; 5CKE A; 5HCK A; 4ESR A; 2DK3 A; 1AWX A; 5IT9 E; 2COY A; 1VQ4 A; 1R8O B; 1LCK A; 1ZQ1 A; 3FC3 A; 1Q86 R; 4M75 G; 1JJ2 P; 2HSE B; 2EYW A; 2FZC B; 3H9N A; 1U06 A; 1X43 A; 2K2M A; 1BIA A; 3DKM A; 2KXD A; 1NG2 A; 2GGR A; 3CCS Q; 2V1Q A; 4HCZ A; 4AFQ C; 3M0S A; 3QZ5 B; 1RAE B; 4C92 A; 1VQ6 A; 4BI4 A; 1YI2 A; 4GLK A; 5GAN g; 1QW1 A; 1KD1 R; 4RG8 A; 3UAT A; 3CXC S; 1YIJ A; 5GAM j; 3MPU B; 4DA4 A; 2NWM A; 2JT4 A; 2G6F X; 3M54 A; 3RIR A; 4ZGJ B; 3EGU A; 3CCE A; 5FWC A; 2DER A; 4J9H A; 2EBP A; 3SFM A; 5KE2 A; 4DBF A; 1KHI A; 2JTE A; 5FU6 C; 1WJQ A; 1RAC B; 1VQ9 T; 1M1K R; 3CCU T; 2V8I A; 5GAN 7; 4F7U B; 1RAF B; 4C5G A; 4M7A B; 4GLM A; 2A7Y A; 4ZTJ A; 2BE9 B; 1MV3 A; 2EJ9 A; 2HBW A; 3M0P A; 3M53 A; 4A63 B; 1XOV A; 3RKX A; 3ZL7 C; 2AZS A; 1M4Z A; 2DIQ A; 4IIO A; 1QVG S; 4M7D E; 1WIE A; 2PTK A; 5LJ5 j; 4LUE A; 2JNG A; 1QVG P; 4CI0 C; 4PLL A; 2PUO B; 2EAY A; 5IXF A; 3PMT A; 2RJE A; 2BZX A; 2KE9 A; 4M77 G; 3AHU A; 1G3W A; 1K9M U; 4M75 E; 1WHM A; 1V29 B; 4ATO A; 1VIF A; 4PLI A; 1JRI A; 3JCM f; 1OI1 A; 1T3S A; 3A8G B; 1OZ2 A; 2VC8 A; 1ZSZ A; 2X9H A; 2ZPI B; 2EW3 A; 3QWX X; 5CQY A; 1PKT A; 3URG A; 3CME Q; 2DL4 A; 5CKB A; 1NBE B; 2XD0 A; 2P0P A; 4NL3 A; 3PGG A; 5GAO q; 1D1B A; 4M78 D; 4QVD A; 4BDZ A; 4BE0 A; 1G3S A; 2VAS A; 4CC7 A; 5HK0 A; 3MJX A; 5GAN 8; 4RCB A; 4JLG A; 1BK2 A; 4M7D F; 2DXB A; 2LTO A; 2EYQ A; 5IN1 A; 3CCR A; 4KUL A; 2HAX A; 2LVM A; 1VQ7 Q; 2E64 A; 2CUB A; 1O9S A; 3CCV Q; 2DEQ A; 2HEQ A; 4M75 F; 5GMK i; 2GFU A; 4JZ3 A; 1KJW A; 5GJW B; 3D7S B; 1EZZ B; 2DXU A; 3EHR A; 1Q81 R; 2K2V A; 2PVO B; 3UPU A; 4J6Y A; 2MAM A; 5C0M A; 1UGP B; 3LYI A; 1WJR A; 3QO3 A; 4M7A C; 1UHF A; 4M78 B; 3L2V A; 5FW9 A; 1IB8 A; 4J7F A; 2J05 A; 1CKB A; 2A3L A; 1K73 R; 2F5K A; 1NJI U; 1KQ2 A; 4GBQ A; 4II1 A; 1FWZ A; 3RMS A; 3M4Y A; 1M8M A; 2CH4 A; 2DJZ A; 3LX7 A; 4FT4 A; 2ZGW A; 3RKW A; 4M77 E; 4X34 A; 4D8K A; 4PJM A; 2ROT A; 3LH5 A; 1K9M C; 1YCY A; 4OMN A; 2OAW A; 4BY6 B; 2VUB A; 1YJ9 T; 1VQN T; 3G71 Q; 2LCS A; 3FIF A; 2K9G A; 1K8A R; 1FMW A; 1YP5 A; 2RMO A; 5A2Q E; 3QJY A; 2NYS A; 1W6X A; 1UTI A; 2PZ1 A; 1FYN A; 3G6E Q; 1D3B A; 1NE8 A; 1G2B A; 1AVZ C; 4E47 A; 3NTI A; 4M7D A; 4OGC A; 2DLP A; 1RAB B; 3VYH B; 2NUP B; 1MND A; 3CCJ T; 3OBY A; 4PJO A; 4M77 F; 3FB9 A; 2KDS A; 1M27 C; 2GQI A; 1Q82 U; 2J06 A; 3G1J A; 2CKK A; 1VQ8 Q; 1VQ9 A; 5KYU A; 2JS2 A; 2J7I A; 3OYL A; 3CCU A; 2Y4Y A; 2K5L A; 3RMQ A; 5IAY A; 4V2S A; 1BCM A; 2X4W A; 2P0K A; 2QXF A; 4L59 A; 4KRT A; 3E9F A; 5LJ3 g; 1M8V A; 4N4G A; 1R0C B; 3KFV A; 4FYW B; 3CMA T; 4P5N A; 4M78 C; 2YT6 A; 2OTJ Q; 1BKB A; 2CYZ B; 2LRQ A; 3E2U A; 3NGP A; 4N0A A; 5AYF A; 3NHN A; 3GNG A; 1H3Z A; 1ZUU A; 1YWP A; 2XDP A; 1M90 R; 1WXT A; 3M58 A; 1YJN Q; 1IHV A; 3M59 A; 2OX7 A; 1NEB A; 2HZY A; 4XTZ A; 1E6H A; 2RJD A; 3SWN A; 4BY6 C; 2AT1 B; 1QMC A; 4LDW A; 4HT9 A; 4AMC A; 1KC8 U; 1N8R R; 2M51 A; 1WQ7 A; 1C0M A; 3CC2 Q; 1VQL Q; 2HDA A; 4FW2 A; 1SKU B; 4JLI A; 5CAI A; 5GAM g; 2VGN A; 3O8V A; 1M5Q 1; 2ECZ A; 4RTT A; 3GF5 A; 2E70 A; 2GF7 A; 1VQ5 A; 1SSH A; 3MEW A; 4M77 A; 3REB B; 2C0O A; 2FO0 A; 2DKG A; 3SHW A; 4OB3 B; 3P8H A; 1YHQ A; 3BW1 A; 2QAZ A; 4PKC C; 3VS4 A; 3I56 T; 2CSI A; 3TSZ A; 1T0J A; 5KCH A; 2JM8 A; 5I21 A; 2A37 A; 2OAU A; 3OYJ A; 3M0Q A; 4E6R A; 3P8D A; 2WSE E; 2XID A; 3CPW S; 1W2B A; 5D6X A; 1ZHI A; 2DZ9 A; 8AT1 B; 3J81 E; 3CPW P; 4PL6 A; 4FSS A; 1NYG A; 4F17 A; 3OS2 A; 1YIT Q; 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