The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
STLFEALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEVRSLTTGETGYIPSPYLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
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| source organism |
Gallus gallus
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| publication title |
Structure of an intermediate state in protein folding and aggregation.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Tyrosine-protein kinase Fyn
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| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 2010-08-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4Y92 A; 3JV3 A; 1WDX A; 2ENM A; 2JT4 A; 3ZL7 C; 2BZY A; 3UAT A; 1QKW A; 2YUP A; 2RN8 A; 1AWO A; 3FJ5 A; 2D8J A; 4F17 A; 2RQW A; 2K3B A; 2EYZ A; 1X43 A; 4E6R A; 5IXF A; 2DE0 X; 2JXB A; 2LJ0 A; 2O2O A; 2O31 A; 2IIM A; 2M0Y A; 2GTJ A; 2AZV A; 1ABO A; 1M3A A; 2LQN A; 2FPE A; 3SHW A; 1RLP C; 1UG1 A; 2K7A A; 2DF6 A; 1SSH A; 1YNZ A; 4DEY A; 1KJW A; 2CDT A; 2EYY A; 2K9G A; 1Y57 A; 2CT3 A; 1K0S A; 1U5S A; 2GBQ A; 2AZS A; 2HCK A; 2KXC A; 1UEC A; 1W70 A; 2D0N A; 3I9Q A; 3IQL A; 1QWF A; 1U06 A; 2LNH B; 1AVZ C; 2KYM A; 1X69 A; 2KNB B; 4ESR A; 2AKL A; 2A28 A; 2ROT A; 1WYX A; 1WI7 A; 2MOX A; 1A0N B; 4OMQ A; 4J9H A; 2HEQ A; 1VYU A; 1WA7 A; 2NWM A; 1GCQ A; 2DJQ A; 3REB B; 1AD5 A; 3A98 A; 2GNC A; 2M51 A; 4DEX A; 2A36 A; 2FO0 A; 4Z88 A; 2FRY A; 2KRO A; 4RTY A; 1ZUK A; 3H0I A; 4RTZ A; 4AFS C; 1SHF A; 1PKS A; 3EG1 A; 2W10 A; 1JEG A; 1I07 A; 2CSI A; 2EVR A; 1BBZ A; 3LH5 A; 1K4U S; 2JS0 A; 1VYV A; 1GFD A; 2D8H A; 2DNU A; 2J6O A; 1U3O A; 4OMN A; 1NEB A; 2K79 A; 1SPK A; 4WCI A; 4LUE A; 2DL5 A; 1NG2 A; 1UHC A; 3VRY A; 1OV3 A; 2HDA A; 5I22 A; 2CUD A; 1UUE A; 3QWX X; 1K0X A; 4Z8A A; 1MUZ A; 3VRZ A; 3M0R A; 2P4R A; 2X3W D; 1SRL A; 1KFZ A; 2O88 A; 2OI3 A; 1ZUU A; 2JM8 A; 4JZ4 A; 1QKX A; 4HCK A; 1QCF A; 1K9A A; 2DM1 A; 3UF4 A; 2DYB A; 1JU5 C; 1ZUY A; 4J9F A; 3RNJ A; 2A37 A; 1X6B A; 2O9V A; 1T3S A; 1WLP B; 1M27 C; 2JMA A; 2RQT A; 1SEM A; 4RTT A; 1PWT A; 1AWW A; 1JXO A; 2I0N A; 2EYX A; 1RI9 A; 2RQV A; 2LJ3 A; 2DRK A; 1AWX A; 2EGC A; 4R0K A; 1AZG B; 2YUQ A; 4J9C A; 2KT1 A; 4JJB A; 2J6F A; 2EPD A; 1NEG A; 4LN2 A; 3I35 A; 1BK2 A; 2F2W A; 3EHR A; 1CKB A; 2LP5 A; 4OMM A; 4X1V A; 1V1C A; 3VS1 A; 2CUB A; 3PVQ A; 1BB9 A; 1AEY A; 4GLM A; 2CSQ A; 2DA9 A; 2RPN A; 2EGA A; 2KBT A; 1B07 A; 4OMP A; 1JQQ A; 1H92 A; 1WXU A; 4AG2 C; 1PHT A; 2L3P A; 2KEA A; 3H0F A; 1M8M A; 1GBQ A; 4FSS A; 2LX7 A; 1GCQ C; 1JXM A; 2LZ6 B; 2VKN A; 4OMO A; 4RTW A; 1HJD A; 1I0C A; 2GQI A; 4HXJ A; 4GBQ A; 2QDL A; 1ZX6 A; 1Z9Z A; 1VYT A; 2G6F X; 3H41 A; 2RNA A; 1YP5 A; 4JZ3 A; 3KFV A; 2K6D A; 4IIO A; 3VS5 A; 1TUD A; 1M30 A; 1B3Q A; 3SEM A; 4D8K A; 3M0T A; 2DRM A; 2AKK A; 3EHQ A; 4HVU A; 1KSW A; 2SRC A; 1PRM C; 5FW9 A; 2VWF A; 4RTX A; 2E5K A; 2YT6 A; 1CKA A; 1NYF A; 3GBQ A; 1IO6 A; 3M0P A; 2RQU A; 1X27 A; 2XMF A; 3H0H A; 4JPB W; 2W0Z A; 4CC4 B; 2DMO A; 2JTE A; 1AWJ A; 2KYB A; 1J3T A; 1G2B A; 2DL4 A; 3EGU A; 2DX1 A; 3THK A; 5FWB A; 1T3L A; 1UJ0 A; 1HD3 A; 5ECA A; 4J9E A; 1WIE A; 2JMC A; 2V1R A; 1OPL A; 2CH4 W; 4KRT A; 1X2Q A; 1UFF A; 3ULR B; 1K1Z A; 1NLP C; 1CSK A; 1UHF A; 3VS0 A; 4CC7 A; 1N5Z A; 1WXT A; 3I5R A; 1E6H A; 2KRN A; 4A63 B; 4M4Z A; 2J7I A; 1YN8 A; 2LCS A; 2ECZ A; 2RF0 A; 1M3B A; 2HBW A; 3TSZ A; 3TVT A; 1S1N A; 1WX6 A; 1X2K A; 1AZE A; 3REA B; 4AFZ C; 2PNI A; 4J9I A; 3NGP A; 3TSW A; 2VVK A; 4CC2 A; 4ZNX A; 1GBR A; 2EQI A; 5IXB A; 2PZ1 A; 3O5Z A; 1GL5 A; 2CH4 A; 2YUN A; 4J9D A; 4CC3 A; 3I5S A; 1KIK A; 1WXB A; 2EBP A; 2AK5 A; 2L0A A; 5IH2 A; 1OOT A; 2JW4 A; 1H3H A; 2YSQ A; 1ABQ A; 5IHN A; 1UDL A; 4F14 A; 5EC7 A; 2CRE A; 1UE9 A; 2FEI A; 3C0C A; 1SHG A; 2BZX A; 2J06 A; 2V1Q A; 2EKH A; 2FG0 A; 4AG1 C; 2GGR A; 2K2M A; 4IIM A; 2RQR A; 1BU1 A; 1T0H A; 2B86 A; 1YWP A; 2ROL A; 2YDL A; 3VS4 A; 2KE9 A; 2D1X A; 2FPD A; 2ED1 A; 1PNJ A; 3UA7 A; 3PE0 A; 5HCK A; 3NPF A; 3R6N A; 1E6G A; 2C0I A; 4RTU A; 3VS3 A; 2FPF A; 1M3C A; 3PVL A; 2RMO A; 4LUD A; 2DVJ A; 4HVW A; 1I1J A; 4QT7 A; 4K11 A; 2LJ1 A; 2KXD A; 2DLP A; 1FYN A; 1T0J A; 1H8K A; 3VS7 A; 4D8D A; 1UJY A; 3VS2 A; 3VS6 A; 2CT4 A; 2O9S A; 4EIK A; 3RBB B; 2J05 A; 1OEB A; 1QLY A; 1EFN A; 2EGE A; 5IHK A; 4AFQ C; 1HSQ A; 1X6G A; 1UGV A; 4AFU C; 2X3X D; 2F2X A; 1ZBJ A; 2L3Q A; 2ED0 A; 2KRS A; 2DL3 A; 2JS2 A; 2DL7 A; 2L2P A; 1ZLM A; 3M0U A; 1TUC A; 1Y0M A; 5GJV B; 3M0S A; 1FMK A; 2EW3 A; 2EYW A; 1XOV A; 1QWE A; 2JM9 A; 4RUG A; 2KGT A; 1YCS B; 1G83 A; 2OJ2 A; 3CQT A; 1PRL C; 2KR3 A; 3UA6 A; 2MCN A; 2DBM A; 1VA7 A; 3EG2 A; 2BZ8 A; 2KRM A; 2L3S A; 1PKT A; 1WFW A; 2SEM A; 4RTV A; 1AOJ A; 2YUO A; 4J9G A; 3NHN A; 2FRW A; 1ARK A; 2C0T A; 3M0Q A; 1RUW A; 2DIL A; 2DBK A; 2ABL A; 1YWO A; 4J9B A; 4ORZ A; 2MIO A; 1NLO C; 2KT8 A; 3QWY A; 1MV3 A; 2J6K A; 3EG0 A; 4JJC A; 3NMZ C; 1LCK A; 2F2V A; 4OML A; 2C0O A; 4Z89 A; 1OPK A; 2LMJ A; 3U23 A; 1RLQ C; 2ESW A; 1GCP A; 4LE9 A; 4LNP A; 2GTO A; 1Z9Q A; 1ZSG A; 2OAW A; 3EG3 A; 5L23 A; 4HVV A; 1GFC A; 1W1F A; 2PTK A; 5I11 A; 1SRM A; 5FWC A; 1TG0 A; 1NM7 A; 1JO8 A; 5GJW B; 1NYG A; 1E7O A; 1K76 A; 1MV0 B; 1W6X A; 1UTI A; 2NUZ A; 2H8H A; 2LQW A; 2HSP A; 4JJD A; 1GRI A; 4F16 A; 2DL8 A; 2BTT A; 5IHI A; 2A08 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RER A; 4Y28 E; 3M58 A; 3E2U A; 1WDX A; 2R5M A; 3L2U A; 3ZL7 C; 2XIC A; 5LJ3 g; 2EIF A; 4FYV B; 2XDP A; 4XQ3 A; 4XTZ A; 3JB9 G; 1G3T A; 3VYH B; 4E6R A; 4C0F A; 1XTD A; 5IXF A; 3DLL A; 3LWH A; 4QQG A; 2CZ6 B; 5HK0 A; 3DKM A; 3SHW A; 3CCS A; 1G5V A; 2M0O A; 2DF6 A; 3N5B B; 1UEB A; 1YNZ A; 3CCS T; 4DEY A; 1Q95 G; 3H8Z A; 1JBM A; 3CEY A; 2CDT A; 4C8Q E; 1Q82 C; 1Y57 A; 1KG1 A; 1KQ1 A; 1K0S A; 3I55 T; 1W2B A; 2KXC A; 1C0M A; 1W70 A; 4J6Y A; 4BY6 B; 3FEO A; 4B6M A; 2LNH B; 1AVZ C; 5IN1 A; 4XTU A; 2A28 A; 1WYX A; 1A0N B; 2RHI A; 2RHY A; 2HEQ A; 1WA7 A; 4X34 A; 5CQX A; 2NWM A; 5GMK h; 4OMF B; 1D09 B; 1D1B A; 2A7Y A; 4FIB A; 5FRM A; 3P8H A; 2F69 A; 4IUT A; 3G6E A; 4Z88 A; 5KH6 A; 3LGF A; 3ASK A; 2IG0 A; 3JB9 J; 1BKB A; 2X51 A; 1ZSZ A; 1VQM A; 1MMA A; 4M75 E; 1KD1 R; 3HP9 A; 1NPR A; 3RKW A; 3LH5 A; 4Z02 A; 2D8H A; 2DNU A; 1VQ5 A; 5CKB A; 2MK5 A; 4J7F A; 1VQ5 T; 4C92 F; 2HQH A; 5GAM f; 2CUD A; 4Z8A A; 4M75 G; 2XDB A; 3JB9 H; 3VV0 A; 5LJ5 f; 1KC8 R; 1SRL A; 3CCJ T; 1KFZ A; 4BD3 A; 2P84 A; 3PMI A; 1QKX A; 1I8F A; 1K9A A; 2DM1 A; 4C92 A; 1QVP A; 4JRK A; 5KYX A; 1JU5 C; 4J9F A; 2DXB A; 2HQX A; 1IHV A; 2QI2 A; 1SEM A; 4RTT A; 3JCM b; 3G71 A; 5GAN 7; 3G4S T; 2QYZ A; 1AWX A; 3G71 T; 3AHU A; 4LDW A; 4M7A G; 2KT1 A; 2J6F A; 3M9Q A; 1NEG A; 3VU3 C; 1M1G A; 5GAO n; 2F2W A; 4RMO A; 2FB7 A; 2QK0 A; 2LP5 A; 4OMM A; 4QKU A; 4X1V A; 3A8L B; 3PVQ A; 3OS1 A; 4M7D F; 3M53 A; 4GLM A; 5I2S A; 3QKJ A; 2DA9 A; 2EGA A; 4DBF A; 1K8A R; 2DEU A; 2K5L A; 1B07 A; 2E10 A; 1VQ4 Q; 2GF7 A; 1FXX A; 2VUB A; 3CC7 Q; 3H0F A; 2XU8 A; 3FRN A; 2CKK A; 1GBQ A; 5GAM h; 2MF2 A; 4XU0 A; 1GCQ C; 1WGS A; 2VKN A; 4OMO A; 4HXJ A; 4FSX A; 4M7D A; 3H41 A; 5LJ5 h; 1M90 U; 1KD1 U; 3HTR A; 4XK8 E; 1YP5 A; 2GCX A; 2K6D A; 3OSS C; 2JZ2 A; 5GAO m; 4C5H A; 1VUB A; 3SEM A; 2JVV A; 4D8K A; 3M0T A; 2AKK A; 4HVU A; 1RAA B; 2SRC A; 4HT8 A; 2JOY A; 3SDZ A; 2VWF A; 2HNI A; 2E5K A; 2VYT A; 4NL3 A; 5GAN f; 3CC4 A; 2IPO B; 4DQ2 A; 5LL6 S; 3QJ6 A; 1TWB A; 1KC8 U; 1RAD B; 4N0A A; 3H0H A; 4O6J A; 1NBE B; 2W0Z A; 4CC4 B; 2DMO A; 2D6F A; 2JTE A; 3TCJ A; 5DY9 A; 1M8V A; 4AT1 B; 1BI3 A; 1G2B A; 3CMA Q; 4XTV A; 1I5O B; 3RMQ A; 1T3L A; 2E6Z A; 2M16 A; 2HZY A; 3RKX A; 1WIE A; 2RK1 A; 5GMK i; 2V8K A; 1X2Q A; 3CCR A; 2PUO B; 2NLU A; 3A1P A; 1NLP C; 1N9S A; 2RHX A; 1VQK Q; 3CCR T; 2K4Y A; 2X4J A; 4ZN3 A; 1E6H A; 2CYZ B; 3GPL A; 4J6W A; 3KBG A; 4M4Z A; 5DLO A; 3CBO A; 2OX7 A; 1X2K A; 1RI0 A; 1N8R C; 4M78 F; 2ZPH B; 1GBR A; 2EQI A; 5IXB A; 4DOW A; 4J9D A; 1YJ9 Q; 4L5G A; 5IH2 A; 1JJ2 A; 1ABQ A; 4MML A; 5IHN A; 4F14 A; 1VQ9 Q; 2LCC A; 4OB1 B; 5EC7 A; 2JUF A; 2BZX A; 2NUP A; 4MDX A; 4M78 A; 4ATO A; 2LRQ A; 1X75 C; 4FW1 A; 3CCJ Q; 3CCL A; 2KAF A; 4B9W A; 2K2M A; 5GAN h; 4IIM A; 2RQR A; 1VQP T; 2K5I A; 2B86 A; 1YI2 T; 2ROL A; 1TXQ A; 2ED1 A; 4D6W A; 2XDD A; 4CI0 C; 3R6N A; 4X9C A; 2C0I A; 3X20 B; 4FCY A; 2PVD B; 5GAN 3; 1RAB B; 3VS3 A; 5GAN 6; 2FPF A; 1M3C A; 4JDS A; 3G4S Q; 4IUQ A; 5GAN 2; 1I1J A; 4EMK B; 1FMW A; 1K73 C; 2KXD A; 5J26 A; 3JCM V; 1N6A A; 4ZGE B; 4JS5 A; 5FRO A; 1LOJ A; 3SWN A; 1UJY A; 3VS2 A; 3VS6 A; 1Q7Y R; 2J05 A; 2DER A; 4NOY A; 4B9X A; 1EFN A; 3JCM X; 2P0Q A; 3CCM A; 3GOX A; 4M77 C; 1X6G A; 4AFU C; 3MPU B; 1ZBJ A; 1Y71 A; 2DL3 A; 2KRS A; 2DL7 A; 2M02 A; 2DXC A; 5HKC A; 1DJ7 B; 1VQL A; 1UGQ B; 4HCC A; 1VQ6 Q; 1KK7 A; 2DIG A; 3EFR A; 3A8M B; 3OYN A; 1YIT T; 4FT2 A; 1YJN A; 2JM9 A; 4HA8 A; 4M75 B; 1U8R A; 5GMK m; 4N4H A; 3F70 A; 3CXC P; 2YHT A; 1YJN T; 1PRL C; 3C95 A; 2L89 A; 2XKO C; 1BI0 A; 1B34 B; 2DBM A; 3TQ7 P; 4ANJ A; 1M4Z A; 3EG2 A; 1X01 A; 2OTJ A; 2YUO A; 3JCM d; 5M9O A; 4MZT A; 4J9G A; 3CCE A; 4JLI A; 1VQO A; 4FW2 A; 3M0Q A; 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1M1K U; 1MGQ A; 2YLB A; 3E1S A; 4ZGD B; 1GCQ A; 3REB B; 1F1B B; 4EMG A; 4DBR A; 1R0C B; 3A98 A; 1PSF A; 4BE2 A; 1YCY A; 2FO0 A; 2HL5 C; 1NPP A; 2RD1 A; 3RKY A; 4RTY A; 1ZUK A; 1EZZ B; 4RTZ A; 4AFS C; 4DA4 A; 2MMP A; 5FU7 B; 3I56 Q; 1X6O A; 1PKS A; 2W10 A; 1JEG A; 4PKC C; 2DTI A; 4KH0 B; 3EH2 A; 1BBZ A; 5GMK j; 2JS0 A; 1GFD A; 4AMC A; 3OBY A; 2RI2 A; 3KXT A; 4RCC A; 2PUK B; 4KGZ B; 2K79 A; 1SPK A; 4LUE A; 1NG2 A; 2AT1 B; 1JB0 E; 2M1H A; 1O9S A; 5I22 A; 1UUE A; 1ZQ1 A; 5CAI A; 3VRZ A; 1OYX A; 4C5E A; 5KCO A; 4PJM A; 1AHJ B; 2JM8 A; 4JZ4 A; 2LC4 A; 4M75 D; 1YIJ Q; 1C6V X; 4HCK A; 1QCO A; 2DO3 A; 4KUI A; 2DYB A; 3PNW C; 3RNJ A; 2FL7 A; 5A0D A; 3CPW P; 2O9V A; 2CP2 A; 2XHC A; 1T3S A; 4JRI A; 3OYL A; 1WLP B; 5C6S A; 1BIB A; 4OB0 B; 1M27 C; 1MMD A; 2JMA A; 2RQT A; 1QVF A; 2ZPE B; 1OI1 A; 1PWT A; 1LJO A; 4PFZ A; 1WHJ A; 1RI9 A; 2EYX A; 2RQV A; 2H3E B; 1QCN A; 1WJS A; 2YUQ A; 4J9C A; 4OVA A; 2EPD A; 4VUB A; 5A0L A; 3V8K A; 3I35 A; 1ZSZ B; 3EHR A; 3EH1 A; 4M7A D; 2CUB A; 5KYU A; 1Q82 R; 3OYH A; 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