The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVGDRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Thermodynamic and Structural Characterization of Asn and Ala Residues in the Disallowed II' Region of the Ramachandran Plot
pubmed rcsb |
| molecule tags |
Cytoskeleton
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| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
ALPHA II SPECTRIN
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| total genus |
12
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-08-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4HVW A; 1J3T A; 1WX6 A; 1W70 A; 2CT3 A; 2DF6 A; 2J7I A; 2YUO A; 2EYX A; 2K3B A; 4J9E A; 1X6B A; 1TG0 A; 2CSI A; 1OOT A; 2A37 A; 2MIO A; 2EBP A; 3M0P A; 2O31 A; 4J9I A; 1U5S A; 1W6X A; 2JMA A; 4AG2 C; 3PE0 A; 3H0F A; 2IIM A; 2CDT A; 4DEY A; 1K0S A; 2RQV A; 1MV3 A; 3QWX X; 1SRL A; 2RMO A; 1HSQ A; 4IIM A; 1S1N A; 3H41 A; 1X6G A; 2EKH A; 4HVU A; 3EG1 A; 3REA B; 3M0T A; 1M8M A; 3O5Z A; 2J6F A; 2KYB A; 4OMM A; 1NYG A; 1H92 A; 2K9G A; 2D1X A; 2KE9 A; 3EG3 A; 1KJW A; 3H0H A; 1OPK A; 1RLP C; 2DRM A; 3VRY A; 2HSP A; 1WLP B; 2M0Y A; 5IXF A; 4QT7 A; 2V1Q A; 1PWT A; 2DL4 A; 1PRL C; 2KXD A; 2BZ8 A; 4JJB A; 5IHN A; 3RBB B; 3UF4 A; 5IHK A; 4Z8A A; 1UJ0 A; 2LJ3 A; 4WCI A; 1M27 C; 2DL5 A; 3R6N A; 1YNZ A; 2SEM A; 2HDA A; 1WA7 A; 2DBM A; 3UAT A; 1AZG B; 1PRM C; 1UHF A; 2KEA A; 2DL3 A; 4AFQ C; 1HD3 A; 3I35 A; 1K0X A; 1GL5 A; 4AFU C; 1UG1 A; 2JS0 A; 1AEY A; 1QLY A; 4F14 A; 1Y57 A; 2ESW A; 2FPD A; 2DYB A; 4OMO A; 3EG2 A; 2LNH B; 1UHC A; 2O88 A; 1MUZ A; 1Y0M A; 3M0U A; 4OML A; 2CUD A; 1CSK A; 4OMP A; 2AZV A; 1G83 A; 4CC4 B; 5IH2 A; 1G2B A; 2EYW A; 2DE0 X; 4LUD A; 1AD5 A; 2A36 A; 2YUN A; 2XMF A; 1JXO A; 1U06 A; 1E6H A; 2GTO A; 3NMZ C; 1JO8 A; 4GLM A; 2W10 A; 4OMN A; 3NGP A; 2YUP A; 3EGU A; 2ROT A; 1JXM A; 2DL7 A; 1NEG A; 1WI7 A; 1XOV A; 1X69 A; 3NPF A; 2G6F X; 1ZSG A; 2GQI A; 1RUW A; 4E6R A; 1AZE A; 1UTI A; 2P4R A; 4Y92 A; 2CH4 W; 3VS2 A; 1CKB A; 2EGC A; 1WFW A; 2FPE A; 1SRM A; 2DNU A; 3SHW A; 3VS3 A; 3VS6 A; 1BBZ A; 4M4Z A; 1YWO A; 2LZ6 B; 2BZX A; 3VS7 A; 2DRK A; 2HCK A; 2KRN A; 3THK A; 1T0J A; 1E6G A; 2RQR A; 1KSW A; 3I5S A; 1Z9Q A; 3PVQ A; 3QWY A; 4HVV A; 4RTU A; 1ZX6 A; 2W0Z A; 3TSW A; 1QWF A; 2J6O A; 2DJQ A; 1W1F A; 3KFV A; 1SEM A; 3M0R A; 1ARK A; 2V1R A; 1V1C A; 2GGR A; 2KRM A; 2KRS A; 5I11 A; 1UDL A; 1GFC A; 1WDX A; 2L3Q A; 3VS1 A; 1SSH A; 1Z9Z A; 3UA7 A; 2KT1 A; 2JW4 A; 2CH4 A; 1GBQ A; 2F2W A; 2YSQ A; 1PHT A; 1WXB A; 2J6K A; 2EGA A; 2YDL A; 1BU1 A; 4AG1 C; 1YCS B; 2LX7 A; 2ECZ A; 1M30 A; 4J9F A; 1UFF A; 2E5K A; 2LJ1 A; 2KXC A; 2EGE A; 2EYY A; 4OMQ A; 1IO6 A; 4Z89 A; 2AK5 A; 4RTX A; 4A63 B; 2LP5 A; 2JT4 A; 1I07 A; 2BZY A; 3GBQ A; 2DIL A; 3PVL A; 4FSS A; 2C0I A; 1NM7 A; 2YT6 A; 2KGT A; 1SHG A; 2YUQ A; 2DX1 A; 2L0A A; 5FWB A; 2K2M A; 1GFD A; 4ESR A; 2RQW A; 3VS4 A; 1RI9 A; 2LQW A; 1SHF A; 1AVZ C; 2L3S A; 2GTJ A; 1WIE A; 1OV3 A; 2OI3 A; 3SEM A; 2EQI A; 5I22 A; 1H3H A; 1BB9 A; 5EC7 A; 1OPL A; 1ABO A; 3M0Q A; 2RPN A; 2J06 A; 2D0N A; 3ZL7 C; 4K11 A; 4HCK A; 2H8H A; 2ROL A; 2CT4 A; 4DEX A; 4LNP A; 3CQT A; 1ZUY A; 2DM1 A; 2FO0 A; 1WXU A; 2RN8 A; 2EPD A; 2DMO A; 3UA6 A; 1AWJ A; 1CKA A; 4CC3 A; 1UUE A; 1ZUK A; 1LCK A; 2ABL A; 2KT8 A; 3VS5 A; 5FWC A; 4RTY A; 1K1Z A; 4IIO A; 1GCQ C; 1I1J A; 4GBQ A; 3REB B; 4ORZ A; 1X2Q A; 1WXT A; 2PNI A; 2DL8 A; 3IQL A; 3M0S A; 1AWW A; 2AKL A; 2JXB A; 1UJY A; 1A0N B; 2JM9 A; 3VS0 A; 3A98 A; 1I0C A; 1UEC A; 2QDL A; 4JZ3 A; 3C0C A; 2RNA A; 1FMK A; 1K4U S; 4F17 A; 3ULR B; 4CC7 A; 5GJW B; 1GRI A; 4JJD A; 5FW9 A; 2CRE A; 2FPF A; 4JPB W; 1UE9 A; 2LMJ A; 2O9S A; 1M3C A; 4CC2 A; 1JU5 C; 1FYN A; 1AWO A; 2D8J A; 1QWE A; 1U3O A; 1SPK A; 2LQN A; 2O9V A; 2O2O A; 1M3A A; 1RLQ C; 1YN8 A; 3RNJ A; 1B07 A; 1KIK A; 1K9A A; 2C0T A; 1TUD A; 2KYM A; 2ENM A; 5IHI A; 2MOX A; 1HJD A; 3VRZ A; 2AZS A; 1YP5 A; 5IXB A; 2ED0 A; 1GBR A; 2OJ2 A; 4RUG A; 1MV0 B; 3EHQ A; 2GNC A; 4J9G A; 2MCN A; 1H8K A; 4JZ4 A; 3LH5 A; 2NWM A; 2KBT A; 1GCP A; 1VYV A; 2CSQ A; 2C0O A; 1M3B A; 1N5Z A; 2KRO A; 1ZBJ A; 2ED1 A; 4KRT A; 2FRW A; 1GCQ A; 2DLP A; 2VWF A; 4RTZ A; 1X43 A; 1X2K A; 1PKS A; 2F2X A; 1VA7 A; 1ZLM A; 2DBK A; 1PKT A; 4D8K A; 4F16 A; 3U23 A; 2L3P A; 2PZ1 A; 1T3L A; 2FEI A; 2RF0 A; 1AOJ A; 2A08 A; 1VYU A; 2JS2 A; 3JV3 A; 1NYF A; 1KFZ A; 2EVR A; 2FRY A; 4RTT A; 2JM8 A; 1VYT A; 3FJ5 A; 1PNJ A; 1T3S A; 2K7A A; 4HXJ A; 4JJC A; 2HBW A; 4X1V A; 4J9H A; 1UGV A; 1ZUU A; 2M51 A; 5ECA A; 1AWX A; 5HCK A; 1NLO C; 1QKX A; 1NEB A; 2F2V A; 1E7O A; 2EYZ A; 4R0K A; 3EHR A; 2AKK A; 2KNB B; 4J9C A; 4LUE A; 4RTV A; 1JEG A; 1NG2 A; 4J9B A; 1NLP C; 3H0I A; 1X27 A; 2JMC A; 3I9Q A; 2J05 A; 4RTW A; 4D8D A; 2K79 A; 2DVJ A; 2DA9 A; 2FG0 A; 2D8H A; 2LJ0 A; 4LE9 A; 4EIK A; 2NUZ A; 4AFZ C; 1K76 A; 2BTT A; 2L2P A; 4J9D A; 1ABQ A; 1TUC A; 1WYX A; 1YWP A; 2PTK A; 4Z88 A; 4LN2 A; 1B3Q A; 2HEQ A; 1QKW A; 2X3W D; 2RQU A; 5GJV B; 4AFS C; 3TVT A; 2CUB A; 1EFN A; 1OEB A; 2SRC A; 2LCS A; 2OAW A; 2RQT A; 5L23 A; 2I0N A; 2B86 A; 1T0H A; 2VKN A; 2VVK A; 3TSZ A; 1BK2 A; 1JQQ A; 2X3X D; 1QCF A; 2K6D A; 4ZNX A; 3I5R A; 3NHN A; 2EW3 A; 2GBQ A; 2KR3 A; 2A28 A; 3EG0 A; 2JTE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3HPW A; 4HVW A; 2DYI A; 3P8B B; 4A4E A; 5FLX E; 2P84 A; 5DY9 A; 2DEQ A; 2EYX A; 3JCM g; 4J9E A; 1X6B A; 3A1P A; 2OTJ Q; 2HQE A; 4BDZ A; 2KQW A; 2O31 A; 1YJ9 T; 1U5S A; 2JMA A; 4AG2 C; 1K8A C; 5FRO A; 3H0F A; 4HT9 A; 2IIM A; 2CDT A; 4DEY A; 2RQV A; 1MV3 A; 5LJ5 j; 8AT1 B; 2QEX T; 1NJI U; 3QWX X; 2QDY B; 3URG A; 1S1N A; 3QII A; 5EG2 A; 3CCS A; 4M7D B; 1X6G A; 2Y4X A; 3REA B; 1M8M A; 2H3J A; 3CCQ Q; 2DKG A; 4OVA A; 3X26 B; 3MEU A; 3KUF A; 3G4S A; 2K9G A; 1KJW A; 2LCL A; 4M77 F; 4L6V 5; 5LJ5 h; 4DBH A; 5IN1 A; 2XDD A; 3GLX A; 3GNG A; 5GAO q; 4M7A C; 1VQ5 Q; 1WLP B; 5IXF A; 3G71 Q; 1ZSZ B; 4FU6 A; 2OTJ T; 1U1S A; 3EG9 B; 3CCM A; 4DBQ A; 3L2U A; 2HL5 C; 2QQ9 A; 5IHN A; 2FVU A; 3UF4 A; 4Z8A A; 2A7Y A; 2FZC B; 3OS2 A; 2A0F B; 2LJ3 A; 2DK3 A; 1R8O B; 4ZGE B; 3R6N A; 5FU7 B; 3S3O A; 2SEM A; 2IVW A; 1WA7 A; 1C0M A; 1PRM C; 3CPW A; 3OYL A; 3EH2 A; 2RB6 A; 1YIT T; 1HD3 A; 3L2V A; 3CCQ T; 4M7A E; 1UG1 A; 2CYZ B; 2JS0 A; 1K73 C; 1QLY A; 4F14 A; 1VQ4 A; 3EG2 A; 3OA6 A; 2QK0 A; 4PFO A; 2DEU A; 2O88 A; 2XU8 A; 2QYZ A; 1D09 B; 1OZ2 A; 2CUD A; 1H64 1; 4KBM B; 4X34 A; 1IRX A; 2DE0 X; 2QG9 B; 4RG8 A; 3M4Y A; 3L1A A; 1AD5 A; 3L2Q A; 2YUN A; 2E65 A; 2GTO A; 3NMZ C; 1D1B A; 3MEW A; 5CKE A; 3QKJ A; 2LNV A; 4FT2 A; 2HD0 A; 3NGP A; 2FZK B; 2ROT A; 1BCO A; 1VIE A; 3EAE A; 3JCM Q; 2DL7 A; 1X69 A; 3VUZ A; 1QMC A; 5CVI A; 4KUL A; 2LRQ A; 2RJE A; 2CH4 W; 3VS2 A; 4HT8 A; 3EGX B; 1BKB A; 2DNU A; 3JB9 G; 4QQG A; 4FL6 A; 1BBZ A; 4M4Z A; 5J39 A; 4JRQ A; 2IG0 A; 4XTY A; 1Q82 C; 5GAO l; 2HCK A; 3CCS Q; 3RUX A; 1E6G A; 4HVV A; 4RTU A; 2E4H A; 1ZX6 A; 2E70 A; 2W0Z A; 2YRC A; 1G3Y A; 3PGG A; 1B34 B; 3G7Z A; 4M7D G; 3KFV A; 1AT1 B; 2DJZ A; 2CP0 A; 2KRS A; 4M77 D; 3VU3 C; 1GFC A; 1KQS P; 3QBY A; 1WJR A; 2F2W A; 4EMK A; 3CCJ Q; 1PHT A; 2RK1 A; 5GAM f; 3DLL A; 2YDL A; 3JRZ A; 4AG1 C; 1V29 B; 1YCS B; 3JCM d; 3TQ7 P; 2RK2 A; 4FSX A; 2DAQ A; 3MPU B; 3CEY A; 2EGE A; 3OYI A; 2PVG B; 5C6S A; 2M9U A; 4M75 F; 4RTX A; 2FZG B; 2K5F A; 3CME Q; 3CCS T; 1TUG B; 2BZY A; 3GBQ A; 1VQ9 A; 4F04 B; 4FSS A; 1B7T A; 4N0A A; 2X4J A; 1D0Z A; 4C8Q E; 2KGT A; 2YUQ A; 1O75 A; 1VQ4 Q; 3G4S T; 1ACM B; 1I5O B; 1OUL A; 4R56 A; 2EQJ A; 2LQW A; 3ER0 A; 1RAG B; 1M1K R; 1TWB A; 5CO7 A; 2NLU A; 3OS0 A; 1VQL A; 1WIE A; 2QAS A; 2OI3 A; 4YTL A; 4LDX A; 1BIB A; 3CCM T; 2L8D A; 2RHI A; 2DTO A; 4XTW A; 2M16 A; 4KUI A; 2D0N A; 6AT1 B; 2E64 A; 4HCK A; 1UB4 A; 1ZUY A; 1MMD A; 2RN8 A; 1QP3 A; 4MDX A; 3CME T; 2DMO A; 1M1F A; 5FU7 C; 3UA6 A; 1AWJ A; 4J5Y A; 2EJG A; 2EFI A; 1EZZ B; 3QSU A; 4CC3 A; 2O01 E; 1Q81 C; 2H3E B; 1LCK A; 3JB9 I; 4RTY A; 4BY6 B; 1K1Z A; 3M58 A; 1VQ4 T; 4IIO A; 1BYM A; 1GCQ C; 2IPO B; 1I1J A; 4GBQ A; 3CCE A; 5GAO m; 2DER A; 3REB B; 3QO3 A; 3NTH A; 4ORZ A; 2JZ2 A; 1UGP B; 3PIO A; 2XG8 D; 4KH1 B; 3ASK A; 4C0D B; 2K5I A; 3MP1 A; 5GMK e; 1I0C A; 1R0B G; 4M7A F; 5CKD A; 4E7L A; 5KCO A; 3F70 A; 2YRD A; 3AHU A; 4JJD A; 5FW9 A; 4FIB A; 2HMA A; 4IKF A; 3CCV A; 2FPF A; 3P8D A; 1UE9 A; 2KVQ G; 2XK0 A; 2O9S A; 3LGL A; 1JU5 C; 5GAM j; 1K8A U; 1KD1 C; 2D8J A; 2RM4 A; 5A0L A; 1RAB B; 2O2O A; 3UDC A; 4Q5W A; 1YJW Q; 2VYT A; 1K9A A; 2QQS A; 3A8H B; 4GY5 A; 1OU8 A; 2KK4 A; 2P0K A; 2ENM A; 5D6Y A; 1YP5 A; 3UWN A; 2ZPE B; 2WAC A; 1GBR A; 4RUG A; 4J9G A; 3I56 Q; 4JZ4 A; 4A4K A; 3LH5 A; 4EMK B; 5GAM h; 2KBT A; 1GCP A; 2CSQ A; 5CKB A; 1LPL A; 2C0O A; 1M3B A; 2RA2 A; 2JVV A; 2DXT A; 2DLP A; 4PJO B; 1X2K A; 2NYS A; 1Q86 R; 2CS7 A; 5LJ5 e; 2DBK A; 1NE8 A; 1X75 C; 4D8K A; 4F16 A; 3U23 A; 2PZ1 A; 3VV0 A; 2RF0 A; 5LJ3 f; 3EFS A; 1VYU A; 1QVG S; 1YCY A; 1NYF A; 4JUV A; 3RDV A; 1KFZ A; 2EVR A; 2KI7 A; 1HYO A; 3M54 A; 2FL7 A; 1JBM A; 1W4S A; 1VQ9 T; 2HBW A; 2B8A A; 4J9H A; 4XU1 A; 5ECA A; 3Q1J A; 1NLO C; 2F2V A; 1E7O A; 2EYZ A; 3OQ5 A; 5AT1 B; 4LUE A; 2OTL Q; 3QYG B; 1NG2 A; 1NLP C; 3I9Q A; 3CCE Q; 4RTW A; 4EIK A; 2K79 A; 2FG0 A; 2D8H A; 5KYX A; 2ZPF B; 4PJL A; 1KQ2 A; 3T9N A; 2EQK A; 3RKW A; 4J6W A; 1ABQ A; 2COY A; 3JCM f; 2X4X A; 3CMA A; 3BY7 A; 1RAI B; 3VYG A; 1FMW A; 2DTI A; 2HEQ A; 1I4K 1; 1OI1 A; 4AFS C; 1EFN A; 1OEB A; 2DVE A; 4C8Q F; 2B86 A; 4ZGD B; 4RCB A; 2QTV A; 4PJM A; 5I21 A; 2X3X D; 1QCF A; 3E1S A; 3VJP A; 1AHJ B; 3I5R A; 5HK0 A; 4C8Q A; 5IAY A; 2EW3 A; 4FW2 A; 2VXE A; 5CIU A; 2KR3 A; 5HCK A; 2JTE A; 3FRN A; 4O5V A; 3RKY A; 3CCV Q; 2R57 A; 2CT3 A; 3QZ5 B; 2DF6 A; 2HQX A; 2YUO A; 2K3B A; 2ATC B; 3QJ6 A; 2EQU A; 2EKO A; 4C92 A; 2OTL T; 4BUG A; 1OOT A; 3CCE T; 3HFN A; 4BY6 C; 4J9I A; 2F5K A; 4OGC A; 1QCO A; 1JJ2 S; 2G3R A; 3UT1 A; 4ZN3 A; 1K0S A; 4BE1 A; 1HSQ A; 4KGX B; 3QDR B; 2CZ6 B; 3QPH A; 4C0D C; 1YI2 Q; 4XQ3 A; 3O5Z A; 2J6F A; 2NUP A; 1D0Y A; 3KBG A; 4LD9 K; 3J7A F; 3V7C A; 2K2V A; 3CCV T; 1G3S A; 2GFA A; 3LGF A; 1RLP C; 4BI8 B; 3VRY A; 5KE2 A; 4JRK A; 4PJO G; 4DQ2 A; 2M0Y A; 1BI3 A; 3ME9 A; 4QT7 A; 3V7R A; 2V1Q A; 4M78 C; 4L5G A; 1FX7 A; 3L2Z A; 1PRL C; 2KXD A; 4ZGJ B; 5LJ3 j; 1IGU A; 2ZPG B; 4Y28 E; 1M27 C; 1VQ7 Q; 1VQP Q; 4FYW B; 2MWP A; 2DBM A; 3UAT A; 1W2B S; 2DL3 A; 4FW1 A; 3JB9 J; 3NTK A; 3CPW P; 4LXC A; 4AFU C; 2XDP A; 2PVD B; 2XKO C; 2FPD A; 1BCM A; 4M78 E; 4JS5 A; 5LJ3 h; 5GAO r; 1MUZ A; 5HKC A; 4OMP A; 4PJO C; 4F7U A; 4CC4 B; 2YRV A; 3E9F A; 4LUD A; 1K9M C; 3JB9 D; 2RHU A; 2RI2 A; 1JXO A; 1U06 A; 2DXC A; 1E6H A; 3SDZ A; 4HCB A; 2YWW A; 3L2R A; 2LVM A; 4OMN A; 4BB7 A; 5D7U A; 1IRE B; 4N4G A; 1D3B A; 1VQP T; 1F1B B; 1WGS A; 1NEG A; 5KYX B; 1XOV A; 3NPF A; 4IUR A; 4KGZ B; 3C94 A; 2G6F X; 4M7D D; 3RES A; 3TCJ A; 2GQI A; 1RUW A; 1Q86 U; 2KMT A; 3OMG A; 4LDW A; 1OX9 A; 1MMA A; 1N8R C; 2ZAE A; 3CMA T; 3VS3 A; 4C0F A; 5CKF A; 2BZX A; 2DRK A; 3THK A; 3PVQ A; 4BI4 A; 2M02 A; 5KYY A; 2MWO A; 4UC4 A; 2P0Q A; 4JLI A; 2J6O A; 1OU9 A; 3M0R A; 3C12 A; 2K4Y A; 2V1R A; 5I11 A; 4RG2 A; 2L3Q A; 1YIT Q; 1Z9Z A; 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