The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
EKEEKDFRKKFKYDGEIRVLYSTKVTTSITSKKWGTRDLQVKPGESLEVIQTTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRSYLAD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
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| publication title |
Structure of a Helically Extended SH3 Domain of the T Cell Adapter Protein ADAP.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
FYN-binding protein
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| total genus |
8
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| structure length |
77
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| sequence length |
77
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-11-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2CSQ A; 2CH4 W; 4X1V A; 1WDX A; 2DL8 A; 1GFC A; 4LUE A; 1H8K A; 2D1X A; 4HXJ A; 2E5K A; 4Z8A A; 1LCK A; 1K1Z A; 2KR3 A; 1PRL C; 2IIM A; 2YSQ A; 2OJ2 A; 3QWY A; 1Y0M A; 4Y92 A; 1PKT A; 2O9S A; 3VS3 A; 1RLQ C; 1YN8 A; 2GNC A; 2A28 A; 4ZNX A; 2FPD A; 4M4Z A; 4JZ4 A; 4AFS C; 1RLP C; 2LJ0 A; 1U06 A; 2EQI A; 4F14 A; 1BB9 A; 4CC3 A; 1G2B A; 1H92 A; 2KRO A; 2HSP A; 2G6F X; 2GBQ A; 4AG2 C; 1SHG A; 2LJ3 A; 1UHC A; 2AKL A; 2M0Y A; 1G83 A; 4AFZ C; 1UUE A; 4LN2 A; 1WI7 A; 4J9C A; 2GQI A; 1WA7 A; 5GJV B; 1BBZ A; 2VVK A; 2AK5 A; 1AOJ A; 1K76 A; 2L2P A; 4R0K A; 5I11 A; 2W0Z A; 2K3B A; 2D0N A; 2H8H A; 2D8H A; 1X2K A; 3M0U A; 4ESR A; 2EPD A; 3REA B; 4RTX A; 1AD5 A; 2DNU A; 1QKX A; 1U3O A; 4DEX A; 1K4U S; 1QWE A; 1JU5 C; 5IXB A; 1NEB A; 1Z9Z A; 3H41 A; 1HJD A; 1WX6 A; 3VS6 A; 3UF4 A; 1AWO A; 5IHN A; 3I35 A; 2DL4 A; 4JJD A; 2DIL A; 1X6B A; 1N5Z A; 1SPK A; 2GTO A; 2ED1 A; 2HCK A; 2KYB A; 5FW9 A; 1YWO A; 2HDA A; 1BK2 A; 2JM8 A; 2LZ6 B; 2DF6 A; 2MCN A; 3A98 A; 4E6R A; 1M3B A; 4GBQ A; 3UAT A; 2LP5 A; 3FJ5 A; 2YUQ A; 1MUZ A; 2DRM A; 2KT8 A; 2RQU A; 2PNI A; 2BZX A; 1WXB A; 2DE0 X; 4J9E A; 4OMM A; 2V1Q A; 5I22 A; 3TVT A; 2KXD A; 1M30 A; 1HD3 A; 1W1F A; 2FPE A; 2B86 A; 4J9B A; 2XMF A; 3IQL A; 1GBR A; 3I9Q A; 2D8J A; 2KBT A; 2DYB A; 4DEY A; 3THK A; 1JEG A; 2F2V A; 2DJQ A; 1E6H A; 2OI3 A; 4D8K A; 3H0I A; 3M0S A; 1YWP A; 3GBQ A; 2FO0 A; 1WIE A; 2F2X A; 3I5R A; 1M3A A; 1W6X A; 2LQW A; 3PVQ A; 1GCQ A; 1TUC A; 1QCF A; 2LQN A; 3SHW A; 1ZLM A; 4KRT A; 3REB B; 1K0X A; 3M0Q A; 1PHT A; 1UHF A; 2DBM A; 2LCS A; 2F2W A; 2VWF A; 4RTV A; 3EG0 A; 4LUD A; 1NEG A; 2DVJ A; 2K7A A; 5IXF A; 1VYU A; 2DX1 A; 1SRL A; 2DMO A; 4J9D A; 3M0R A; 2W10 A; 3R6N A; 2EYZ A; 3C0C A; 3UA7 A; 1T0H A; 3NMZ C; 4OML A; 1ZX6 A; 1AWW A; 1GL5 A; 1YCS B; 2YUP A; 1T3L A; 1NM7 A; 1GRI A; 4JPB W; 2SRC A; 1BU1 A; 2ROT A; 2KGT A; 3RNJ A; 4J9I A; 2JMA A; 1FMK A; 3EHR A; 1M3C A; 5HCK A; 2A08 A; 2HBW A; 4OMQ A; 1HSQ A; 2ENM A; 1GCP A; 2LJ1 A; 3VS1 A; 2GTJ A; 4K11 A; 1ZUK A; 1S1N A; 2BTT A; 4RTY A; 1E7O A; 1NG2 A; 2FRW A; 4LNP A; 2O31 A; 4ORZ A; 1QWF A; 2O88 A; 3H0F A; 2L3S A; 2JTE A; 3VRZ A; 4RUG A; 2RMO A; 4LE9 A; 4OMP A; 3VS2 A; 1KFZ A; 2JS2 A; 3LH5 A; 2RQR A; 4J9G A; 4HCK A; 1B07 A; 1PRM C; 1T0J A; 2FRY A; 2AZS A; 2C0I A; 4IIO A; 4RTW A; 3TSW A; 3NGP A; 3PVL A; 2ROL A; 2KNB B; 5EC7 A; 2JXB A; 3UA6 A; 2J6K A; 4AFU C; 2C0O A; 2CT4 A; 3JV3 A; 2L0A A; 2KXC A; 1OPK A; 1UE9 A; 1A0N B; 2OAW A; 4RTT A; 4F16 A; 1V1C A; 2X3W D; 2KRM A; 1SHF A; 3RBB B; 1UGV A; 1UJ0 A; 1ZUU A; 5GJW B; 2JM9 A; 2CUB A; 1X2Q A; 2KRN A; 4CC4 B; 1YP5 A; 3QWX X; 1KIK A; 2J05 A; 2K9G A; 1Y57 A; 1CKB A; 1GCQ C; 1I07 A; 1OV3 A; 1QLY A; 1K0S A; 2DRK A; 1NLO C; 2L3Q A; 3VS5 A; 1PWT A; 1M8M A; 5IHK A; 2O2O A; 5FWB A; 2PTK A; 2RF0 A; 2A36 A; 4WCI A; 1CSK A; 2KT1 A; 1ZBJ A; 2YDL A; 2QDL A; 3EGU A; 2EBP A; 1GFD A; 2EGC A; 2FPF A; 4HVU A; 4OMN A; 4OMO A; 1KJW A; 2LX7 A; 2DL5 A; 4RTU A; 3U23 A; 2EYX A; 3PE0 A; 2EVR A; 2AZV A; 1ZUY A; 3VRY A; 2ABL A; 4Z88 A; 1AZE A; 2AKK A; 3O5Z A; 1PNJ A; 1AZG B; 1AEY A; 2K2M A; 3ULR B; 2DBK A; 1IO6 A; 2DL3 A; 3VS7 A; 4IIM A; 2EW3 A; 2M51 A; 1Z9Q A; 1JXO A; 2DLP A; 1ABQ A; 2KE9 A; 2RPN A; 3M0T A; 2SEM A; 2RQW A; 4CC2 A; 1U5S A; 1VYT A; 2EGA A; 1OEB A; 2JS0 A; 2RNA A; 2V1R A; 2KRS A; 1ABO A; 1I1J A; 3TSZ A; 1SSH A; 4EIK A; 3H0H A; 1NYF A; 2A37 A; 5FWC A; 2VKN A; 1TG0 A; 2J06 A; 1X69 A; 2DM1 A; 2J6F A; 2JT4 A; 1NLP C; 1E6G A; 1ZSG A; 3VS0 A; 2K79 A; 1PKS A; 2J6O A; 1XOV A; 1SRM A; 1AWJ A; 3M0P A; 2LNH B; 2PZ1 A; 2ESW A; 2EKH A; 3NHN A; 2I0N A; 2KYM A; 1W70 A; 4RTZ A; 4CC7 A; 1WLP B; 1X6G A; 2J7I A; 1K9A A; 2FG0 A; 3EG1 A; 3NPF A; 4JJC A; 1B3Q A; 2CSI A; 1GBQ A; 4FSS A; 2GGR A; 4J9F A; 2DA9 A; 2NWM A; 2JW4 A; 3I5S A; 1UJY A; 1UG1 A; 4JJB A; 1AVZ C; 1JXM A; 2RN8 A; 2NUZ A; 5IH2 A; 2ECZ A; 3VS4 A; 1JO8 A; 4D8D A; 1MV3 A; 1VYV A; 1ARK A; 1NYG A; 1JQQ A; 1UFF A; 3EG2 A; 1WXT A; 4Z89 A; 2EYY A; 3KFV A; 2RQV A; 4AFQ C; 1AWX A; 2YUO A; 2FEI A; 4J9H A; 1I0C A; 2DL7 A; 2CUD A; 4HVW A; 1UEC A; 1KSW A; 1RI9 A; 4AG1 C; 2YT6 A; 1OPL A; 4F17 A; 2YUN A; 2X3X D; 2P4R A; 2CDT A; 2RQT A; 1EFN A; 2JMC A; 4JZ3 A; 2C0T A; 1T3S A; 2KEA A; 1UTI A; 3ZL7 C; 1FYN A; 1SEM A; 2L3P A; 1CKA A; 4GLM A; 4QT7 A; 1M27 C; 2HEQ A; 1WYX A; 1WFW A; 1TUD A; 1MV0 B; 5IHI A; 1QKW A; 2ED0 A; 5ECA A; 3EHQ A; 1OOT A; 5L23 A; 2O9V A; 2EYW A; 2CRE A; 1VA7 A; 2EGE A; 3SEM A; 3CQT A; 1J3T A; 2BZY A; 2K6D A; 2MIO A; 1UDL A; 1X27 A; 1YNZ A; 2BZ8 A; 1X43 A; 2CT3 A; 2LMJ A; 3EG3 A; 1WXU A; 2MOX A; 4HVV A; 1RUW A; 4A63 B; 1H3H A; 2CH4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3C94 A; 1IRX A; 3I56 A; 2CYZ B; 2DKG A; 3HRT A; 2R5A A; 1TOV A; 1GFC A; 1H8K A; 3CCL T; 1YJN T; 5LJ3 e; 3OS5 A; 4XTY A; 3JB9 J; 4M75 C; 3L2Z A; 3QWY A; 1Y0M A; 2O9S A; 4E2F B; 1UGS B; 2A28 A; 4J7I A; 2E1H A; 2CP3 A; 4A4E A; 3CCM Q; 2LX9 A; 1U06 A; 4XTZ A; 4FYX B; 5KH6 A; 2EQI A; 3NFC A; 4F14 A; 1XNI A; 4CC3 A; 1H92 A; 2CP7 A; 3HSB A; 3BE3 A; 1VQ7 T; 2GBQ A; 1SHG A; 3J81 E; 2LJ3 A; 3M56 A; 3WVE B; 2M0O A; 1ZQ1 A; 4AFZ C; 4C0Z A; 1KQ2 A; 4J9C A; 4FW1 A; 2GQI A; 4VUB A; 5HY6 A; 1K76 A; 3M4G A; 1QVF S; 1Q7Y R; 2H8H A; 3JAM E; 1ZSZ C; 1Q86 C; 2YHT A; 1VQ6 Q; 3OS1 A; 4ATO A; 1JB0 E; 3GLX A; 3MEU A; 4XU3 A; 4KGX B; 2CZ1 B; 1NEB A; 2CP0 A; 1D1B A; 1QMC A; 3VS6 A; 3I35 A; 4OB3 B; 2DL4 A; 2IVW A; 4JJD A; 3CCQ A; 3F70 A; 2GTO A; 3CC4 A; 2DK3 A; 1YWO A; 2HDA A; 3ZFJ A; 1YI2 T; 4J5Y A; 5HKC A; 2R57 A; 4GBQ A; 3LWH A; 3FJ5 A; 2YUQ A; 1VQO T; 2DRM A; 1U1S A; 2KT8 A; 4HCZ A; 3BY7 A; 2JTM A; 3A1P A; 3RES A; 2K57 A; 4C8Q B; 4J9E A; 4LDY A; 5FU7 C; 2KXD A; 1ZHI A; 5LJ3 g; 4CRI A; 1HD3 A; 2HZY A; 1W1F A; 1H3Z A; 4LDW A; 5I21 A; 3X25 B; 3M58 A; 1WHL A; 1GBR A; 3I9Q A; 3A5Z B; 3JCM V; 4MDX A; 1SSF A; 2F2V A; 3FDR A; 2WSF E; 3H0I A; 2E3H A; 3PVQ A; 4ZN1 A; 1QCF A; 4M75 G; 4X9C A; 3SHW A; 1RAH B; 4KRT A; 5J26 A; 4IUR A; 2EJF A; 3O8V A; 2CP6 A; 2DBM A; 2LCS A; 3G71 A; 4OB0 B; 3MPU B; 4RTV A; 4LUD A; 2K7A A; 3EFS A; 5LJ5 f; 3M0R A; 1W2B A; 2KVQ G; 2EYZ A; 3C0C A; 3ME9 A; 4RCC A; 4ZGE B; 3DB3 A; 2VAS A; 5GAO m; 1JRI A; 1YCS B; 1GRI A; 2QEX Q; 3CPF A; 1BU1 A; 3V8K A; 2RD1 A; 2A0F B; 4DBH A; 2XDB A; 2M02 A; 5HCK A; 4OB1 B; 1IHW A; 2HBW A; 2YRC A; 4JDS A; 2ENM A; 3P8D A; 4FU6 A; 1BKB A; 1M2V A; 1EZZ B; 1ZUK A; 2BTT A; 4RTY A; 2OTJ T; 2O31 A; 4M75 A; 1WJR A; 3H0F A; 3OMG A; 3CCS T; 1NPP A; 2X4X A; 4RUG A; 1WQW A; 2RMO A; 3VS2 A; 2QDY B; 1B07 A; 3E9G A; 2PU9 B; 4HT8 A; 3TSW A; 4XQ3 A; 3NGP A; 3LX7 A; 5EC7 A; 4BY6 C; 4E7J A; 3I55 A; 3UA6 A; 1VQL A; 2PUK B; 1QP2 A; 3OQ5 A; 4IKF A; 2CT4 A; 1K73 C; 5CK9 A; 1SF9 A; 1VQ5 A; 2X3W D; 3QKJ A; 1R77 A; 1ZUU A; 2YRV A; 2LT1 A; 2VYT A; 1N9S A; 4PJO D; 5LJ5 d; 4FSX A; 2J05 A; 1YJ9 A; 4OMF B; 2CS7 A; 1Y57 A; 4A4F A; 2QQA A; 2QYZ A; 2DRK A; 3C12 A; 1PD0 A; 2L3Q A; 3VS5 A; 3EGD A; 3FEO A; 2A7Y A; 2RF0 A; 2VGN A; 2QI2 A; 1CSK A; 1I81 A; 1NPR A; 3CCV Q; 2KT1 A; 1FWZ A; 4FL6 A; 3EAE A; 1GXI E; 3VJP A; 2EBP A; 1GFD A; 4FT2 A; 2JN0 A; 2EYX A; 3PE0 A; 4E7K A; 1NBE B; 2DEQ A; 5GAO n; 2ABL A; 5CR2 A; 2RJE A; 4TVR A; 2XG8 D; 1OQK A; 1PNJ A; 1X01 A; 4R56 A; 3V7S A; 4YTL A; 3JB9 H; 2K2M A; 4FYW B; 1QVG P; 1OZ2 A; 1IO6 A; 2DL3 A; 3CMA Q; 1MND A; 4ANJ A; 3QZ5 B; 4E7Z A; 5C0M A; 2KE9 A; 2RJC A; 2DEU A; 3H6Z A; 1D1A A; 1MMN A; 2YLB A; 2RNA A; 5DM7 R; 1ABO A; 1G8X A; 1B34 A; 3CC4 T; 3E19 A; 4EDU A; 5LJ3 f; 1PC0 A; 3VKI A; 2WAC A; 4DQ2 A; 2A37 A; 1RAC B; 4PJO C; 2DM1 A; 2KMT A; 5A0L A; 4Y91 A; 1E6G A; 1ZSG A; 1PKS A; 2HKQ B; 3L2V A; 1VQP Q; 3T9N A; 1RAG B; 2EKH A; 2MPX C; 3NHN A; 3CCM A; 4N4G A; 1W70 A; 2FB7 A; 1M2V B; 1WLP B; 4P5N A; 3VV0 A; 2O01 E; 4M75 B; 2CSI A; 4ELY C; 4M7D G; 1FXX A; 1KQS S; 2DA9 A; 2NWM A; 2RO0 A; 4JRP A; 2JW4 A; 1UJY A; 3UPU A; 1UG1 A; 2EQU A; 1VIE A; 2VC8 A; 2FHD A; 2B8A A; 4JRK A; 2LTO A; 2PVG B; 1O9S A; 1YJN A; 2QQ9 A; 5AYF A; 3QZ9 B; 1JO8 A; 4D8D A; 1MV3 A; 2HSE B; 3JCM e; 3G71 T; 2O4X A; 4M7A F; 1VQ6 A; 2DVE A; 5D6Y A; 4UC4 A; 4Z89 A; 4ZGJ B; 2Y90 A; 3FJP A; 2RHI A; 4ELZ C; 1D09 B; 1KSW A; 4WTO B; 2QA4 T; 1OPL A; 2AT1 B; 3M59 A; 3PMT A; 2CDT A; 1EFN A; 1V29 B; 5D6X A; 1VQK Q; 2C0T A; 4MDW A; 2KEA A; 2P0Q A; 3UT1 A; 1VQ4 Q; 1SEM A; 3QO3 A; 3MEV A; 1VOM A; 4FYY B; 3CXC S; 1WHJ A; 4GLM A; 1SKU B; 5GAN 6; 5M9O A; 4M7D A; 1W2B S; 3SDZ A; 1M90 R; 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2HCK A; 4A4G A; 2KAF A; 5FW9 A; 4C5E A; 3MP8 A; 1EX4 A; 2QGF B; 5A0D A; 2DF6 A; 2ZGW A; 3A98 A; 1K9M R; 1D0Y A; 2L8D A; 4C8Q A; 3P8B B; 5CQX A; 4C92 A; 3KXT A; 2LP5 A; 2DFU A; 1Q82 R; 1EIF A; 1MUZ A; 4N4I A; 2PNI A; 2OTJ A; 4E7L A; 2BZX A; 5LL6 S; 1RI0 A; 1WXB A; 2DE0 X; 3HTR A; 4QQG A; 3LLR A; 3CCS A; 3TVT A; 4LDX A; 2RH2 A; 1M30 A; 4XU1 A; 2B86 A; 3OYM A; 4M7D B; 2K5L A; 4BDZ A; 3JB9 F; 2D8J A; 2KBT A; 1XTD A; 2DYB A; 2QAS A; 2KK4 A; 3CCM T; 3THK A; 4KGV B; 5KYU B; 5GAM g; 4D8K A; 3TRE A; 1YWP A; 2FO0 A; 1YJW Q; 3LWI A; 2NUT B; 1GCQ A; 2XDD A; 1TUC A; 5L8R E; 4II1 A; 1QVG A; 2F1L A; 3EFO B; 3REB B; 1WJS A; 3WVD B; 2OTL Q; 4R55 A; 3RR6 A; 2LCC A; 4CI0 C; 2F2W A; 4M7D E; 1Q7Y U; 5IXF A; 1PD1 A; 2QQB A; 3OW2 S; 2DX1 A; 1SRL A; 2DMO A; 4EMG A; 3OYB A; 3JB9 I; 1VQ6 T; 1ZX6 A; 1GL5 A; 2EJG A; 2YUP A; 1NM7 A; 2JJ9 A; 2DXT A; 1HYO A; 2FYK A; 2ZPI B; 3DLL A; 4JS5 A; 2KGT A; 2JMA A; 2IG0 A; 1M3C A; 2H3J A; 5CKE A; 2A08 A; 1HSQ A; 5GAN g; 1WPY A; 4E7H A; 1D3B A; 3QPH A; 4FW2 A; 1GCP A; 4QW2 A; 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