The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
EKEEKDFRKKFKYDGEIRVLYSTKVTTSITSKKWGTRDLQVKPGESLEVIQTTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRSYLAD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
FYN-binding protein
|
| publication title |
Structure of a Helically Extended SH3 Domain of the T Cell Adapter Protein ADAP.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| total genus |
8
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-11-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1G83 A; 2F2W A; 2ESW A; 1JO8 A; 1W70 A; 4HXJ A; 5FW9 A; 2L3P A; 2FEI A; 2ROT A; 2EVR A; 1ZLM A; 1PNJ A; 5HCK A; 4J9F A; 1ABQ A; 3M0S A; 1TUC A; 2NWM A; 1BU1 A; 2M0Y A; 5L23 A; 2EW3 A; 1M27 C; 3VS4 A; 2JS0 A; 2DM1 A; 2M51 A; 1M3B A; 1M3C A; 2GTO A; 4DEX A; 2A36 A; 2DNU A; 1AWJ A; 1WA7 A; 1QLY A; 4Z88 A; 1UJY A; 1PRL C; 2KGT A; 2DRK A; 4OMM A; 4WCI A; 4J9I A; 3RBB B; 3ZL7 C; 2V1Q A; 4AFS C; 1JQQ A; 3QWX X; 2IIM A; 1T3S A; 2KE9 A; 4ZNX A; 1M30 A; 2PZ1 A; 2D0N A; 2FRY A; 2CH4 A; 2HCK A; 1NYF A; 1GBQ A; 4JJC A; 2RN8 A; 1X2K A; 2DL7 A; 4JPB W; 4AFQ C; 2AK5 A; 1RUW A; 1XOV A; 1JU5 C; 3VS3 A; 2F2X A; 1I07 A; 2J6F A; 5I11 A; 2RNA A; 3KFV A; 2A28 A; 2YUN A; 1E6G A; 3REB B; 2RMO A; 3QWY A; 2JMC A; 4M4Z A; 3UF4 A; 2DF6 A; 3M0R A; 3PVQ A; 1YN8 A; 1X2Q A; 3ULR B; 1ABO A; 1KJW A; 1VYV A; 2YUO A; 4D8D A; 2B86 A; 3EG0 A; 2DIL A; 1UGV A; 2LMJ A; 2CUD A; 4AFU C; 1WFW A; 1MV3 A; 2XMF A; 4RTV A; 1H3H A; 3UA6 A; 2V1R A; 1GCQ A; 4J9D A; 2GNC A; 2DX1 A; 2KBT A; 1UTI A; 2CT4 A; 2PTK A; 2FPD A; 1QKX A; 2K2M A; 4CC4 B; 5IHN A; 2KXC A; 2MCN A; 2RF0 A; 4QT7 A; 4J9B A; 1QWF A; 1NG2 A; 4OMN A; 3NHN A; 4F14 A; 1GL5 A; 1SHG A; 5I22 A; 1AOJ A; 2DJQ A; 1VYT A; 3EHQ A; 1N5Z A; 1WYX A; 1UE9 A; 1WI7 A; 4JZ3 A; 5IHI A; 4CC3 A; 1AZE A; 1OEB A; 1UDL A; 1SEM A; 2L3S A; 4RTZ A; 1NYG A; 1WXU A; 1WDX A; 1LCK A; 1GFC A; 1CSK A; 1Y57 A; 2D8H A; 3EG3 A; 1SPK A; 1AWO A; 5FWC A; 2DL3 A; 1RLP C; 1GCP A; 2DBM A; 1AZG B; 3NGP A; 1HSQ A; 1HD3 A; 4X1V A; 2MIO A; 2KRS A; 4JJB A; 1Y0M A; 1ZX6 A; 2J05 A; 1SSH A; 2HSP A; 2VVK A; 1J3T A; 1SRM A; 3SEM A; 2EYX A; 1I1J A; 1EFN A; 2K6D A; 2O88 A; 2RQU A; 3I35 A; 3JV3 A; 1YP5 A; 4IIM A; 4HCK A; 1B07 A; 4RTT A; 1X69 A; 2EQI A; 1I0C A; 2QDL A; 1FYN A; 1FMK A; 1PHT A; 1W6X A; 2FG0 A; 1GRI A; 1KIK A; 1JEG A; 2CUB A; 2DBK A; 5GJW B; 1NLO C; 2D8J A; 1U06 A; 1X27 A; 2KXD A; 3VRZ A; 2JM9 A; 1U3O A; 2GGR A; 2RQW A; 2RQV A; 1YCS B; 2LJ1 A; 3UA7 A; 4OMO A; 1KFZ A; 1X6B A; 2L0A A; 4RTU A; 2YUQ A; 2X3W D; 2MOX A; 1PWT A; 2JXB A; 1CKB A; 4LUD A; 4JZ4 A; 4LE9 A; 2KT1 A; 4LUE A; 2EGA A; 1X6G A; 1H8K A; 2KRN A; 1ZUU A; 2KRO A; 2RPN A; 1YNZ A; 2BZY A; 2F2V A; 1Z9Q A; 1AWX A; 3EGU A; 2DLP A; 3THK A; 2K9G A; 1YWO A; 4LN2 A; 2G6F X; 2GBQ A; 2KNB B; 1V1C A; 1WIE A; 4FSS A; 3H0F A; 1H92 A; 1UUE A; 4ESR A; 4AG1 C; 2DL8 A; 1WXT A; 2JM8 A; 2FRW A; 2LQW A; 1AD5 A; 2C0I A; 2LX7 A; 2KR3 A; 2X3X D; 1M8M A; 3EG1 A; 2OI3 A; 4DEY A; 4ORZ A; 1GFD A; 2W10 A; 2SEM A; 4GLM A; 3H0I A; 4HVU A; 3LH5 A; 2J7I A; 2PNI A; 3A98 A; 3TSW A; 2LP5 A; 1UG1 A; 2EGC A; 1M3A A; 2KEA A; 4E6R A; 1OPK A; 1UEC A; 1QWE A; 3PE0 A; 2JT4 A; 1GCQ C; 2J06 A; 2KT8 A; 2ENM A; 4Z89 A; 3M0T A; 2LZ6 B; 5IH2 A; 3EG2 A; 2E5K A; 4EIK A; 1ZBJ A; 2EPD A; 4D8K A; 1AEY A; 2CRE A; 2EBP A; 1K0S A; 3VS6 A; 2O9V A; 2DE0 X; 3H0H A; 1PKT A; 1Z9Z A; 1K0X A; 4OMP A; 3VS2 A; 2P4R A; 3UAT A; 2YSQ A; 2ECZ A; 4LNP A; 2YDL A; 2CH4 W; 2CSI A; 3FJ5 A; 1QCF A; 1OPL A; 2A37 A; 2A08 A; 2AKL A; 5ECA A; 4RTY A; 1GBR A; 3VS1 A; 2FO0 A; 1NEG A; 2LJ3 A; 4Y92 A; 3SHW A; 1ZSG A; 4GBQ A; 1IO6 A; 1A0N B; 1UFF A; 4J9G A; 2K79 A; 2ROL A; 2RQT A; 4RTW A; 1JXM A; 2KYM A; 3I9Q A; 2J6O A; 4CC2 A; 5IXF A; 2FPF A; 1AWW A; 3PVL A; 1VA7 A; 1E6H A; 1QKW A; 3TSZ A; 3U23 A; 4RUG A; 3O5Z A; 2JW4 A; 2GTJ A; 3NPF A; 2AKK A; 2W0Z A; 5IXB A; 1NM7 A; 4JJD A; 2O31 A; 1S1N A; 1PRM C; 1U5S A; 2ABL A; 1ARK A; 2HEQ A; 2AZS A; 2H8H A; 1W1F A; 1VYU A; 2EYZ A; 1CKA A; 2LQN A; 1ZUY A; 2AZV A; 3M0U A; 5FWB A; 4CC7 A; 2BZ8 A; 2J6K A; 1BK2 A; 1UHC A; 2OAW A; 2DMO A; 4Z8A A; 2NUZ A; 4IIO A; 2DYB A; 2DL5 A; 3M0P A; 1UHF A; 3VS5 A; 2KRM A; 1K9A A; 1T0H A; 1G2B A; 2SRC A; 4AG2 C; 3I5R A; 2DVJ A; 2VKN A; 3REA B; 2HDA A; 2ED0 A; 1TG0 A; 1K76 A; 2YT6 A; 1SHF A; 1T3L A; 2EKH A; 2LCS A; 3R6N A; 4F16 A; 4HVV A; 2BTT A; 2D1X A; 2KYB A; 1RLQ C; 3H41 A; 4R0K A; 2L3Q A; 2C0O A; 4AFZ C; 2EGE A; 1HJD A; 5EC7 A; 4J9C A; 2JS2 A; 4J9H A; 1B3Q A; 2BZX A; 2I0N A; 2VWF A; 3NMZ C; 5GJV B; 4OMQ A; 1T0J A; 1MV0 B; 1OOT A; 1TUD A; 4OML A; 3VS7 A; 1AVZ C; 1BBZ A; 1YWP A; 3I5S A; 1NEB A; 1KSW A; 2CDT A; 2DA9 A; 2RQR A; 2O9S A; 2L2P A; 2ED1 A; 3TVT A; 4A63 B; 1WLP B; 2K3B A; 2JMA A; 1SRL A; 2O2O A; 2GQI A; 2DL4 A; 3IQL A; 4RTX A; 3GBQ A; 2EYW A; 1X43 A; 3EHR A; 4KRT A; 2K7A A; 1UJ0 A; 3CQT A; 2EYY A; 1WX6 A; 1BB9 A; 1RI9 A; 4J9E A; 2C0T A; 4HVW A; 2FPE A; 1PKS A; 2JTE A; 1K4U S; 1JXO A; 2YUP A; 2HBW A; 1ZUK A; 1NLP C; 3VS0 A; 1WXB A; 1OV3 A; 3VRY A; 1K1Z A; 5IHK A; 4K11 A; 1MUZ A; 2DRM A; 2OJ2 A; 2CSQ A; 3M0Q A; 4F17 A; 2LJ0 A; 2CT3 A; 1E7O A; 3RNJ A; 3C0C A; 2LNH B; #chains in the Genus database with same CATH topology 5GAN 5; 1VQK Q; 1JO8 A; 1VQP Q; 1BIB A; 2CP6 A; 5EG2 A; 4ZGJ B; 1M1F A; 5D7U A; 2YWW A; 4IUV A; 1WZO A; 4J9F A; 3L2U A; 4R56 A; 3OSS C; 1FMV A; 1WHG A; 2NWM A; 1I5L A; 4MMK A; 3LH0 A; 2DM1 A; 2M51 A; 1M3B A; 1U1S A; 3MP1 A; 4DBQ A; 4M7D G; 2A36 A; 1YIT A; 1AWJ A; 4M75 C; 3FRN A; 5FRM A; 1VQL T; 1BIA A; 1YJW T; 3VUZ A; 5CAI A; 4KGV B; 3EG9 B; 3RBB B; 2KSS A; 4FU6 A; 3UWN A; 2IIM A; 1FMW A; 1T3S A; 4LXC A; 2PZ1 A; 3MP8 A; 4E2F B; 1NYF A; 3SWN C; 1X2K A; 1LNX A; 2DL7 A; 1YJ9 Q; 2RO0 A; 2VGN A; 1G8X A; 3HFN A; 2HQX A; 2IPO B; 3OYD A; 1NJI U; 1R8O B; 4YTL A; 1MND A; 2NUT A; 4PLI A; 3CMA A; 1AHJ B; 1D0X A; 2F2X A; 5GAN 3; 1I07 A; 3LX7 A; 5LL6 S; 2DO3 A; 4QVC A; 3UF4 A; 1M90 C; 1H3Z A; 3RES A; 3CXC A; 3FB9 A; 1YN8 A; 1ZA2 B; 4QQG A; 3JB9 I; 2K5L A; 4HT9 A; 1X2Q A; 2PVD B; 2DXB A; 4AMC A; 2NUP B; 1PSF A; 1JJ2 A; 2DIL A; 1UGV A; 4FT2 A; 4J6W A; 2CUD A; 2ZPG B; 4XTU A; 4AFU C; 1WFW A; 2R5M A; 1K73 U; 1H3H A; 2YRV A; 4XTZ A; 2F5K A; 3ER0 A; 4MZP A; 2DX1 A; 3OW2 P; 1QVP A; 3QJY A; 2RF0 A; 3G4S A; 3ASK A; 2CP2 A; 1QWF A; 4XTV A; 4EMK C; 1N6A A; 3EGD B; 2FL7 A; 4C5G A; 1K8A C; 5I22 A; 1QCO A; 3JCM W; 1AOJ A; 2DTI A; 1B7T A; 1Q7Y U; 5GAN f; 2DJQ A; 5GMK i; 3EHQ A; 1N5Z A; 3T9N A; 3H8Z A; 1Y96 B; 4E7Z A; 1WI7 A; 2FZG B; 4CC3 A; 1AZE A; 3NTH A; 1SEM A; 2COY A; 1WXU A; 3JCM Q; 1GFC A; 1Y57 A; 2PUK B; 1O9S A; 4IUR A; 3CCL A; 3I55 Q; 2DL3 A; 1RLP C; 3FJP A; 4RKU E; 1D0Z A; 1EIF A; 5GAN 8; 4X1V A; 1MMD A; 1Y0M A; 2ZPF B; 2J05 A; 1SSH A; 4FT4 A; 1YJN A; 2QQB A; 3OA6 A; 3PIP A; 1SRM A; 4O6J A; 2EYX A; 4C0D B; 2LQ8 A; 3INZ A; 2HQE A; 3CCM A; 3A1P A; 5J26 A; 1I0C A; 2QAS A; 2CGH A; 2XIC A; 4RMO A; 2FG0 A; 4J7I A; 2HL5 C; 5LJ3 e; 1U06 A; 1X27 A; 3CCS A; 1KQS A; 3VRZ A; 4MDX A; 1TUG B; 2RQV A; 1WGS A; 2LJ1 A; 2YUQ A; 1VQO A; 2E6N A; 5GMK l; 2FZK B; 4II1 A; 4C8Q A; 2JXB A; 2R57 A; 4JZ4 A; 4LE9 A; 1W2B S; 1VQK A; 3CC7 Q; 2EGA A; 2DTO A; 1X6G A; 5GMK m; 1I81 A; 2F2V A; 1PC0 A; 2XU8 A; 2OX7 A; 2M16 A; 2GBQ A; 2JZ2 A; 4PK4 A; 1Q81 C; 2XDD A; 1H92 A; 1VQ4 Q; 4ESR A; 4AG1 C; 2PU9 B; 3HP9 A; 5LJ5 g; 2HBP A; 2ZPE B; 2JM8 A; 3MHX A; 1PSE A; 2C0I A; 4M78 D; 3VV0 A; 2DAQ A; 4PFP A; 1YFN A; 2BIV A; 4A54 A; 1KHC A; 4E7K A; 1GFD A; 5GAO r; 2W10 A; 1B34 B; 2SEM A; 1JRI A; 1KQS S; 2J7I A; 4ZN1 A; 1KQ1 A; 3JB9 H; 3SB2 A; 1UG1 A; 4C8Q F; 2WSE E; 1YJ9 A; 1N9S A; 3ZEH A; 5D6X A; 4PJO D; 4N4I A; 2ENM A; 2CP3 A; 2LZ6 B; 3EFO A; 4EIK A; 4D8K A; 3TRE A; 1QQJ A; 2CRE A; 1ZSZ B; 1K0S A; 3VS6 A; 2RHU A; 3BDU A; 1VQ9 T; 3MEV A; 1S72 T; 4OMP A; 3VS2 A; 2YSQ A; 3OYA A; 4LNP A; 5C0M A; 3OYM A; 2DER A; 4EPC A; 3FJ5 A; 4LDV A; 1QCF A; 5GAN h; 5ECA A; 3JRZ A; 2O4X A; 1M1K C; 2FO0 A; 1NEG A; 3UT1 A; 1NJI R; 1VQ5 T; 1IO6 A; 4DBH A; 3PFS A; 1M4Z A; 2QEX Q; 4M77 D; 2ZAE A; 2K79 A; 3J81 E; 2K5I A; 3A8L B; 4LDX A; 4CRI A; 4CC2 A; 5IXF A; 4C8Q E; 2CZ0 B; 3TSZ A; 1M5Q 1; 1KG1 A; 3OBW A; 3CD6 T; 2HZY A; 4R55 A; 4IKF A; 3O5Z A; 2JW4 A; 4RG2 A; 3RKX A; 1WJQ A; 2D9T A; 3NPF A; 2AKK A; 3FLG A; 3HL8 A; 1PD0 A; 1NM7 A; 2O31 A; 1Q86 C; 2QQ9 A; 2H8H A; 2MPX C; 1W1F A; 2EWN A; 1K73 R; 4M7D D; 4PNO A; 3OQ5 A; 5FU6 B; 3SDZ A; 4BDY A; 2AZV A; 3JCM h; 3I55 A; 5FWB A; 4DOV A; 3QYG B; 4OMF B; 2BZ8 A; 4EMH A; 1UHC A; 1K9M U; 3NFC A; 4Z8A A; 2ZGW A; 4NL2 A; 4C8Q C; 4IIO A; 3CC4 T; 3AT1 B; 2DYB A; 5KCO A; 4Q5W A; 3JB9 F; 3VS5 A; 4PLL A; 1G3Y A; 1G2B A; 4AG2 C; 3P8B B; 2VKN A; 3QJ6 A; 1TG0 A; 1Q7Y R; 2RI3 A; 1P92 A; 1T3L A; 2X9H A; 4F16 A; 3OYH A; 4HVV A; 4C92 G; 3H9N A; 3MKD A; 2DXU A; 4JLG A; 4R0K A; 2L3Q A; 2EGE A; 2WSC E; 3RKY A; 3S3N A; 2ZPI B; 4J9H A; 5L8R E; 2BZX A; 4FYW B; 3KBG A; 3NMZ C; 3L1A A; 3OYY A; 4J7F A; 1OOT A; 2CS7 A; 1AVZ C; 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3PVQ A; 4LD9 K; 1JJ2 P; 5M9O A; 3OB9 A; 5FU7 B; 2YUO A; 4X9C A; 3OYE A; 2B86 A; 3EG0 A; 5LJ3 j; 5CCA A; 3CMA T; 2BUD A; 1YI2 T; 1K8A U; 1OU9 A; 3UA6 A; 2V1R A; 1GCQ A; 3JCM g; 2DYI A; 2GNC A; 4MDW A; 2PUO B; 5A0L A; 3DB4 A; 2DTH A; 3CEY A; 4M7D B; 2HNI A; 2KXC A; 2MCN A; 1BKB A; 3M5A A; 3OMG A; 5GAO n; 1VQL Q; 2VUB A; 3HFO A; 3NHN A; 4QVZ A; 1SHG A; 1YJW Q; 3MO8 A; 3SFM A; 1IRX A; 2M0O A; 1SSF A; 1W2B P; 3J7A F; 3LGL A; 3RER A; 3EGD A; 1UDL A; 3PT9 A; 1QVG A; 1NYG A; 2F5T X; 1K9M R; 1SPK A; 4NL3 A; 1AWO A; 1Y96 A; 1OX8 A; 1YCY A; 1RAA B; 1VQM A; 3CCE A; 2DBM A; 1AZG B; 2DIG A; 1HD3 A; 3OS0 A; 2KRS A; 3OBY A; 1FWZ A; 1IGU A; 1I1J A; 2K6D A; 3I35 A; 1B07 A; 1KQS P; 1FYN A; 1FMK A; 3CBP A; 3A5Z B; 4KT0 E; 1W6X A; 1KIK A; 2D0Q B; 3PMT A; 3CCQ A; 2KXD A; 1BI3 A; 2X35 A; 2JM9 A; 1TU0 B; 1YCS B; 4XTX A; 2JTM A; 1YHQ A; 1Q81 U; 2RHI A; 4OMO A; 1KFZ A; 1X6B A; 2L0A A; 4RTU A; 1SF9 A; 5GAO p; 3CCM T; 3HHT B; 2E64 A; 2ATC B; 4ELY C; 3CCV A; 3X25 B; 5CKH A; 2RPN A; 1YNZ A; 2BZY A; 3C4S A; 3E19 A; 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