The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
77
|
structure length |
77
|
Chain Sequence |
EKEEKDFRKKFKYDGEIRVLYSTKVTTSITSKKWGTRDLQVKPGESLEVIQTTDDTKVLCRNEEGKYGYVLRSYLAD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of a Helically Extended SH3 Domain of the T Cell Adapter Protein ADAP.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
FYN-binding protein
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
8
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-11-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1I1J A; 1G2B A; 2X3X D; 2KYB A; 3VS0 A; 2ROL A; 2QDL A; 1UFF A; 5IXF A; 1H8K A; 2J6O A; 2KRN A; 2BZX A; 3UAT A; 1ZUK A; 2P4R A; 2RQV A; 4F16 A; 5HCK A; 4AFS C; 2K3B A; 3VRY A; 1X2K A; 2GQI A; 3QWY A; 1TG0 A; 2O88 A; 4J9E A; 2A28 A; 5IHI A; 2BTT A; 1UHF A; 2V1R A; 1E6G A; 2LZ6 B; 5IH2 A; 1PRM C; 4X1V A; 1UHC A; 4JZ4 A; 1AEY A; 4F14 A; 3SHW A; 2GGR A; 4FSS A; 2RN8 A; 2JMC A; 4HVU A; 1OOT A; 1PKT A; 3KFV A; 1NLO C; 1QLY A; 4AFU C; 3H0F A; 2EYW A; 2HCK A; 1OEB A; 3R6N A; 1WA7 A; 1S1N A; 4F17 A; 2YSQ A; 2EYY A; 2H8H A; 1E6H A; 1QKX A; 1ZUY A; 3FJ5 A; 2L0A A; 2PTK A; 2JXB A; 2O31 A; 2SEM A; 2CUD A; 3REB B; 3TSW A; 2HDA A; 4J9D A; 1K1Z A; 1UE9 A; 2FPF A; 5FWC A; 2J06 A; 2KRM A; 2JM8 A; 3EHQ A; 4OMO A; 1PWT A; 2DL8 A; 1WFW A; 1WXU A; 1WYX A; 4JJB A; 1CKB A; 4K11 A; 3I5R A; 4E6R A; 5FWB A; 1CSK A; 4OMQ A; 2DBK A; 3I35 A; 1K76 A; 2GBQ A; 2AZS A; 1QWE A; 4R0K A; 3CQT A; 2CT3 A; 3IQL A; 1ZBJ A; 1A0N B; 4Z8A A; 1ZLM A; 2JM9 A; 1JQQ A; 1OPK A; 1K0S A; 4RTY A; 1WI7 A; 2I0N A; 4J9I A; 3GBQ A; 2MIO A; 1X6G A; 2DL3 A; 2LQW A; 2RQU A; 4JPB W; 1UJY A; 2A37 A; 2EGA A; 4HXJ A; 1SSH A; 4AFZ C; 1V1C A; 1X69 A; 4J9F A; 4JZ3 A; 2K2M A; 1NLP C; 2VWF A; 1NM7 A; 2FO0 A; 4LUE A; 2K7A A; 2KYM A; 1BK2 A; 2KNB B; 4QT7 A; 1WXT A; 2KT8 A; 2JTE A; 1W70 A; 2J7I A; 4ZNX A; 4J9B A; 1B3Q A; 1GBQ A; 2YUP A; 2OI3 A; 1UUE A; 2DVJ A; 1T0H A; 4RTZ A; 2CUB A; 2DF6 A; 2ENM A; 4DEY A; 2L3Q A; 5IHK A; 2KR3 A; 1I07 A; 3NHN A; 1ABO A; 3M0U A; 1XOV A; 2RQT A; 2ED0 A; 2ESW A; 4Z89 A; 3VS2 A; 3PVQ A; 2CH4 A; 5GJW B; 2RQR A; 2KBT A; 1YN8 A; 3O5Z A; 1N5Z A; 1SEM A; 1UG1 A; 1UTI A; 2EPD A; 1PNJ A; 3REA B; 2DMO A; 2LJ1 A; 2EKH A; 1NYG A; 2KGT A; 4LNP A; 2EBP A; 1RI9 A; 1X43 A; 2J6K A; 1KSW A; 1U3O A; 2CSQ A; 2CH4 W; 2K9G A; 1KIK A; 1MV3 A; 1YWP A; 1U06 A; 5L23 A; 4RTT A; 1H3H A; 2ROT A; 2HBW A; 3PE0 A; 4WCI A; 1KFZ A; 1AOJ A; 1M27 C; 4LE9 A; 2EQI A; 2NUZ A; 2MOX A; 4AG1 C; 1PHT A; 1X2Q A; 3NPF A; 2DM1 A; 2LNH B; 1NYF A; 4HVW A; 2A36 A; 1SRM A; 3EG0 A; 4D8K A; 2V1Q A; 1AZG B; 1KJW A; 4IIM A; 1M3A A; 3VS5 A; 1GFD A; 4J9G A; 1BBZ A; 2FPD A; 3M0R A; 2KXC A; 2F2W A; 2NWM A; 1NG2 A; 2CT4 A; 2FRW A; 3EGU A; 1ZSG A; 2JS0 A; 2OAW A; 1T0J A; 2PZ1 A; 2C0O A; 2MCN A; 2DX1 A; 3U23 A; 1AWJ A; 1T3L A; 2DA9 A; 2O9S A; 2OJ2 A; 2DRK A; 1M3C A; 3LH5 A; 4LUD A; 2DL4 A; 2RF0 A; 3VS7 A; 2LMJ A; 1PRL C; 1B07 A; 1U5S A; 2AK5 A; 2PNI A; 2YDL A; 1IO6 A; 4AFQ C; 3VS3 A; 1QKW A; 2RQW A; 4OMP A; 2C0T A; 5ECA A; 2KEA A; 2BZY A; 2GTJ A; 2KRO A; 3JV3 A; 3H0I A; 2D8H A; 4A63 B; 4RTU A; 2DE0 X; 2LX7 A; 3EG2 A; 1GCP A; 1ZX6 A; 2AKL A; 1UEC A; 2HEQ A; 5EC7 A; 1J3T A; 1RUW A; 4JJD A; 3TSZ A; 3A98 A; 5IHN A; 2JT4 A; 1JO8 A; 3M0S A; 1VYV A; 2G6F X; 2KXD A; 2LCS A; 2CDT A; 2DYB A; 3I5S A; 2ABL A; 1SPK A; 2YUQ A; 4EIK A; 4CC7 A; 1AWO A; 2L3S A; 1CKA A; 2K79 A; 1I0C A; 2CSI A; 3THK A; 2DJQ A; 2LP5 A; 1E7O A; 1G83 A; 1Y0M A; 2EGC A; 2D1X A; 4RTX A; 2B86 A; 5FW9 A; 2X3W D; 4GLM A; 1UJ0 A; 1AWX A; 2BZ8 A; 2RNA A; 2DLP A; 4OML A; 1WDX A; 2YUO A; 2RMO A; 3EG3 A; 2M0Y A; 1K9A A; 2D8J A; 2EW3 A; 3H41 A; 3QWX X; 4CC3 A; 1TUD A; 1Z9Z A; 3ZL7 C; 1K4U S; 1ZUU A; 2RPN A; 1M30 A; 3EHR A; 3VS1 A; 1RLP C; 3SEM A; 2YUN A; 2JMA A; 4RUG A; 1GBR A; 2DL5 A; 5I11 A; 2KE9 A; 1QWF A; 1JU5 C; 2C0I A; 3H0H A; 3M0Q A; 2O9V A; 4M4Z A; 2LJ0 A; 2HSP A; 2ED1 A; 3UF4 A; 2L2P A; 3EG1 A; 1VYT A; 1Z9Q A; 2CRE A; 5GJV B; 1JXM A; 3NGP A; 2AKK A; 2DBM A; 2GTO A; 2W10 A; 3VS6 A; 1BB9 A; 4ORZ A; 1YCS B; 1VYU A; 1SRL A; 2DL7 A; 2VKN A; 4OMN A; 2J05 A; 1EFN A; 4HCK A; 1QCF A; 4J9H A; 1FMK A; 1T3S A; 2DRM A; 2JW4 A; 2YT6 A; 1RLQ C; 2EYX A; 2F2X A; 2M51 A; 2GNC A; 5IXB A; 4JJC A; 1JXO A; 3NMZ C; 4RTV A; 1WX6 A; 3UA7 A; 1YP5 A; 2LQN A; 3RBB B; 2DIL A; 1HSQ A; 1AD5 A; 1ARK A; 2AZV A; 1WXB A; 2L3P A; 4IIO A; 2KT1 A; 4J9C A; 3M0P A; 2EYZ A; 4ESR A; 5I22 A; 2EVR A; 3C0C A; 1X27 A; 2E5K A; 2ECZ A; 1MUZ A; 4HVV A; 3RNJ A; 1WLP B; 2VVK A; 2FG0 A; 1AWW A; 1SHG A; 1UGV A; 3VRZ A; 1Y57 A; 1PKS A; 2KRS A; 1X6B A; 4Z88 A; 4DEX A; 1SHF A; 1GFC A; 1JEG A; 1TUC A; 1MV0 B; 1VA7 A; 2LJ3 A; 2XMF A; 4D8D A; 1UDL A; 3PVL A; 2F2V A; 4LN2 A; 1M3B A; 1HD3 A; 1GCQ C; 1AZE A; 3VS4 A; 1W1F A; 2FRY A; 1OV3 A; 2J6F A; 2O2O A; 1ABQ A; 2K6D A; 2FEI A; 3M0T A; 1NEB A; 2EGE A; 4CC4 B; 2D0N A; 4KRT A; 3TVT A; 2SRC A; 1H92 A; 1K0X A; 1BU1 A; 2W0Z A; 1LCK A; 1NEG A; 4GBQ A; 2JS2 A; 1YNZ A; 2FPE A; 4Y92 A; 1HJD A; 1OPL A; 4OMM A; 1W6X A; 4AG2 C; 1GCQ A; 1M8M A; 1WIE A; 2DNU A; 1AVZ C; 4RTW A; 3UA6 A; 3ULR B; 1YWO A; 1FYN A; 2IIM A; 4CC2 A; 1GRI A; 1GL5 A; 2A08 A; 3I9Q A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2X3X D; 5C6S A; 5M9O A; 4M78 F; 2QA4 A; 2QDL A; 5IXF A; 4C0F A; 1H8K A; 2KRN A; 3L42 A; 3OYK A; 4A4F A; 3EGD B; 4PLL A; 1QVP A; 2K3B A; 2E65 A; 4BY6 C; 1X2K A; 2A28 A; 3CMA T; 1K8A U; 3CCR A; 3OB9 A; 4HT8 A; 1WJR A; 2RN8 A; 2JMC A; 1WJS A; 1NPR A; 1N27 A; 4AFU C; 3H0F A; 5CKD A; 3G7Z A; 1OEB A; 4ZTF A; 2YSQ A; 1E6H A; 4LDX A; 2MWO A; 2LT4 A; 1Y07 A; 2JXB A; 2RK1 A; 3M57 A; 3REB B; 1Q81 C; 3EG9 B; 4XTV A; 5FWC A; 1Q81 R; 4PJO G; 1FX7 A; 4BE1 A; 1WJQ A; 3CBM A; 2BIV A; 1WXU A; 3L2Z A; 4JJB A; 4R56 A; 3I5R A; 4E6R A; 3OS1 A; 5FWB A; 1U1T A; 3PMT A; 3R6O A; 4OMQ A; 1G5V A; 4FU6 A; 1K76 A; 2GBQ A; 2AZS A; 2QAZ A; 3CCV Q; 1QWE A; 4X34 A; 1ZBJ A; 1R8O B; 4M77 G; 1ZLM A; 3MP6 A; 2EJF A; 3ER0 A; 1K0S A; 3S3N A; 4J9I A; 2Y90 A; 4HA8 A; 1X6G A; 1NPP A; 3H8Z A; 2LQW A; 2E4H A; 1RAD B; 2RQU A; 4B9W A; 4KH1 B; 1UJY A; 2EGA A; 4HXJ A; 1JRI A; 1V1C A; 4PKC C; 4J9F A; 1OQK A; 5FLX E; 1ZQ1 A; 2K2M A; 3KXT A; 2IVW A; 4OP0 A; 2E6Z A; 2KYM A; 2KNB B; 4QT7 A; 1IB8 A; 4M7D F; 4DBQ A; 2J7I A; 4BY6 B; 4ZNX A; 1B34 A; 2VB6 A; 4J9B A; 2YUP A; 4RG2 A; 1O75 A; 1WNL A; 2MAM A; 2OI3 A; 1UUE A; 2DVJ A; 1QVG P; 5CAI A; 2CUB A; 1KQS A; 1YHQ Q; 2D0Q B; 2I2L A; 4M78 D; 5LJ5 e; 4DEY A; 2EQJ A; 1XOV A; 3FEO A; 2RQT A; 4CI0 C; 1S72 Q; 1NJI U; 2ESW A; 5D6X A; 2LNV A; 1FMW A; 1VQN T; 4GLK A; 3UWN A; 5GMK j; 1KQS P; 3CD6 A; 3UPU A; 1Q7Y U; 3O5Z A; 2KSS A; 1KG1 A; 1PNJ A; 3CC2 Q; 2V8I A; 3QBY A; 1MMD A; 1KD1 C; 2DXB A; 2LJ1 A; 4QVC A; 2RI5 A; 3FRN A; 1KD1 R; 1QVF A; 1RI9 A; 1X43 A; 2J6K A; 5GAM e; 4OVA A; 2JVV A; 5I2M A; 1YIT T; 1IHV A; 5IAY A; 4RTT A; 2ROT A; 2XU8 A; 2HBW A; 1M1K U; 1QVF P; 4J7I A; 1AOJ A; 4BDY A; 2RHY A; 3CCJ A; 1M27 C; 2NYS A; 4LE9 A; 1UGP B; 1WQ7 A; 1OYX A; 2MOX A; 1ZSZ C; 1X2Q A; 5GMK i; 1NYF A; 3GF5 A; 4LDU A; 1SRM A; 3EG0 A; 3MEA A; 1JJ2 S; 1XTD A; 2WSE E; 4XTW A; 2RJC A; 5CR2 A; 1M3A A; 4LD9 K; 1BBZ A; 3QDR B; 2KVQ G; 5GAO q; 2KXC A; 2F2W A; 1IGQ A; 2E5Q A; 1VQM Q; 1N8R U; 1VQ8 T; 3JB9 D; 1T0J A; 3GPL A; 4F7U E; 2DX1 A; 1AWJ A; 2DO3 A; 3OYG A; 2O9S A; 2EKO A; 2QQR A; 3BFM A; 2FZG B; 1RI0 A; 3NTK A; 2DL4 A; 2LRQ A; 1BI1 A; 2RF0 A; 4M7D D; 1WHJ A; 1U5S A; 3FB9 A; 2YDL A; 3VS3 A; 1QKW A; 2RI2 A; 2RQW A; 3RER A; 4OMP A; 2HBP A; 4ANJ A; 5GMK l; 1Q86 C; 4RTU A; 2AHJ B; 4IUQ A; 3EG2 A; 1GCP A; 1VQ4 T; 4FSX A; 2AKL A; 2HEQ A; 5EC7 A; 1J3T A; 2EWN A; 1RUW A; 3SFM A; 3A98 A; 4ZGE B; 5IHN A; 1YI2 Q; 2GFA A; 4X9C A; 2LCS A; 2DYB A; 2CS7 A; 2ZPF B; 1K9M U; 4EIK A; 1BIA A; 3X24 B; 2M9U A; 1VQ6 T; 3I55 T; 2ZAE A; 2LP5 A; 1E7O A; 1ZSZ B; 2EGC A; 3OS0 A; 3CCQ Q; 2H3E B; 4JRI A; 3JCM f; 2X3W D; 1YJ9 A; 4GLM A; 1UJ0 A; 1AWX A; 2CGH A; 3MEU A; 5HK0 A; 1YIJ Q; 2YLC A; 3CCM A; 2BZ8 A; 3RMS A; 2RNA A; 1VQ9 A; 5LJ3 e; 3EG3 A; 5I21 A; 1X6O A; 1D3B A; 1K9A A; 3QWX X; 4CC3 A; 3OYH A; 2E64 A; 5KYY A; 2RJE A; 1Q82 C; 3OYM A; 3SEM A; 1Q82 R; 4ZN1 A; 1JBM A; 3CCU A; 5GAN h; 1NBE B; 2XHC A; 1QW1 A; 3M0Q A; 2MWP A; 3X28 B; 4NS5 A; 4M4Z A; 3S3O A; 4F7U A; 3UF4 A; 3C12 A; 2DXU A; 2YRD A; 5J26 A; 1SG5 A; 2RB6 A; 1G8X A; 3QJ6 A; 3OS5 A; 2RI3 A; 4DA4 A; 2GTO A; 2W10 A; 4LXC A; 1VQ5 Q; 2NUP B; 2VKN A; 4OMN A; 2NUT A; 3CPW S; 4HCK A; 4J9H A; 1T3S A; 2DRM A; 3I56 T; 2FL7 A; 4UC4 A; 5A0L A; 2BKD N; 2KMT A; 2F2X A; 2GNC A; 1Y96 B; 4KGV B; 2FVU A; 1YP5 A; 2DIL A; 3L2Q A; 1M8V A; 1M2O A; 2AZV A; 1W2B S; 1WXB A; 3M53 A; 1VQP A; 3CMA A; 1ZA1 B; 3V7S A; 4HCC A; 4J9C A; 3M0P A; 2EYZ A; 3DKM A; 2O01 E; 4PFZ A; 2F1L A; 2E3I A; 3NTH A; 2P84 A; 4FW1 A; 4FW2 A; 2BE9 B; 2ATC B; 2VVK A; 4PL6 A; 1WZO A; 1YJW T; 2VXE A; 4Z88 A; 4DEX A; 2QQA A; 1JEG A; 1TUC A; 1G3W A; 2XMF A; 2LJ3 A; 2F2V A; 4LN2 A; 1LVK A; 4DBH A; 2EYQ A; 3CD6 T; 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4M7D E; 4M78 A; 2CZ7 B; 2DL8 A; 4K11 A; 3VUZ A; 4N4G A; 4E7L A; 3AHU A; 2CT3 A; 3IQL A; 3EAE A; 2KAF A; 2JM9 A; 2E10 A; 4M75 F; 1KQS S; 1X75 C; 5LJ5 h; 1VQ8 A; 4XQ3 A; 3QYH B; 2PUO B; 1U8R A; 4C5G A; 2DL3 A; 1W2B P; 3CC2 T; 3CXC A; 3L2W A; 3JB9 I; 1PSE A; 1SSH A; 1OUL A; 1X69 A; 4JZ3 A; 3EFR A; 2QAS A; 2RA2 A; 4N4I A; 2CP2 A; 4KH0 B; 2JTE A; 4L5G A; 1W70 A; 4XU1 A; 1B3Q A; 1GBQ A; 3JCM e; 3RES A; 3EGD A; 4KGZ B; 4M7A E; 4M7D C; 2K5L A; 3ZFJ A; 2ENM A; 1TOV A; 1PD0 A; 2WAC A; 2VC8 A; 1QVF S; 1FMV A; 5GAM h; 4Z02 A; 3MP8 A; 4R55 A; 2WSF E; 1I8F A; 3PVQ A; 2OTL Q; 2CH4 A; 1BCM A; 1N5Z A; 1SEM A; 3OY9 A; 1UG1 A; 2EPD A; 5I2S A; 3G6E T; 3REA B; 3OYN A; 4C92 G; 1VQ6 A; 4IUR A; 3I55 A; 2EKH A; 4BB7 A; 1VUB A; 3EG9 A; 3JCM V; 2KGT A; 1KQ2 A; 3G4S A; 4XK8 E; 1U3O A; 2CSQ A; 5CKB A; 4M7D A; 2CH4 W; 1QP3 A; 2K2V A; 2RH2 A; 1VQP T; 2K9G A; 4C8Q D; 4PJO F; 1QQJ A; 1LNX A; 3PTA A; 2E6N A; 4HCB A; 5KCO A; 2QTX A; 3C95 A; 1QCN A; 3RUX A; 3NPF A; 5CCA A; 4Y91 A; 2F69 A; 4HVW A; 1M2V B; 4II1 A; 2V1Q A; 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