The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
23
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sequence length |
96
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structure length |
96
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Chain Sequence |
RREAERQAQAQLEKAKTKPVAFAVRTNVRYSAAQEDDVPVPGMAISFEAKDFLHVKEKFNNDWWIGRLVKEGCEIGFIPSPVKLENMRLQHEQRAK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of a complex between a voltage-gated calcium channel beta-subunit and an alpha-subunit domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Rattus norvegicus
|
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
voltage-gated calcium channel subunit beta2a
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| total genus |
23
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| structure length |
96
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| sequence length |
96
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-04-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF12052 | VGCC_beta4Aa_N | Voltage gated calcium channel subunit beta domain 4Aa N terminal |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1S1N A; 4J9C A; 1E7O A; 2EYX A; 1A0N B; 2BZY A; 1YWP A; 1I07 A; 4LNP A; 1BB9 A; 2ED0 A; 2AKK A; 1PNJ A; 3EHQ A; 2RMO A; 1VYU A; 2FRW A; 2I0N A; 4JZ3 A; 1IO6 A; 2L0A A; 2J6O A; 1WLP B; 3TSZ A; 2A08 A; 2DL5 A; 1WXU A; 3I35 A; 1HSQ A; 3VS5 A; 1X2K A; 2HCK A; 2EVR A; 4LE9 A; 4AG1 C; 2MOX A; 1UHF A; 2EGE A; 4F16 A; 2DL4 A; 1ABO A; 3VS3 A; 2W10 A; 2CH4 A; 1SPK A; 1TG0 A; 2DRM A; 1QCF A; 2HDA A; 2RQT A; 2DBK A; 1PRM C; 4Z8A A; 2FG0 A; 1X69 A; 1ZUY A; 4J9H A; 2K9G A; 1U5S A; 4OMQ A; 1T3S A; 1HD3 A; 2DVJ A; 1ARK A; 1AZE A; 4JPB W; 1YWO A; 4J9B A; 4CC4 B; 1M3C A; 2RPN A; 4HCK A; 3C0C A; 4OML A; 3UA7 A; 3UAT A; 3QWY A; 4RTU A; 2O9S A; 3EG3 A; 1JQQ A; 3PVL A; 1H8K A; 2DYB A; 1ZUK A; 2YUO A; 3U23 A; 1ABQ A; 1MV0 B; 3I5S A; 3NMZ C; 2KR3 A; 3M0Q A; 1I0C A; 2FPD A; 3REA B; 3M0S A; 3VS2 A; 2GTJ A; 2VVK A; 1UG1 A; 4GLM A; 1K9A A; 2A37 A; 4AFQ C; 1GCQ C; 2CT3 A; 1XOV A; 2OAW A; 2PNI A; 5EC7 A; 3PVQ A; 3NPF A; 4OMM A; 1GBR A; 2AK5 A; 1SEM A; 4JZ4 A; 1QWE A; 1ZSG A; 4ORZ A; 4J9D A; 1GCQ A; 2BZX A; 5I11 A; 2EKH A; 2KNB B; 2GTO A; 2F2V A; 3TVT A; 1SRL A; 1KJW A; 2HBW A; 2DLP A; 2DNU A; 2EGA A; 1ZLM A; 2EYY A; 2J6F A; 1AWX A; 1V1C A; 4D8D A; 2SEM A; 4ZNX A; 1M30 A; 3H0F A; 2LQW A; 5FW9 A; 1EFN A; 2YSQ A; 2JM8 A; 2D1X A; 2JT4 A; 4D8K A; 3CQT A; 4RTW A; 4LN2 A; 2IIM A; 2LJ3 A; 2DMO A; 2KXC A; 5FWB A; 1KFZ A; 1E6H A; 3EG2 A; 5GJW B; 2LJ1 A; 2JMA A; 1UE9 A; 2KRO A; 1UUE A; 1Z9Z A; 1K0S A; 4A63 B; 1G2B A; 1PWT A; 2KE9 A; 2RQU A; 3H0H A; 3M0R A; 1WIE A; 1VYV A; 2LP5 A; 3VS7 A; 1MV3 A; 2O88 A; 3M0P A; 4RTY A; 5IHI A; 2A36 A; 1M3B A; 1RLQ C; 1GL5 A; 2G6F X; 2K7A A; 2HEQ A; 1TUD A; 1WFW A; 1UDL A; 2B86 A; 1W1F A; 2RQV A; 4R0K A; 2JS2 A; 2CSI A; 1SRM A; 1RI9 A; 2DRK A; 2QDL A; 2MIO A; 1VA7 A; 2L2P A; 2X3X D; 1SSH A; 1KSW A; 1UGV A; 3TSW A; 2EQI A; 3I9Q A; 1B07 A; 2J6K A; 4HXJ A; 3UF4 A; 2LJ0 A; 1X6G A; 3SEM A; 1M3A A; 4K11 A; 1PHT A; 2J05 A; 1BBZ A; 1X2Q A; 1Z9Q A; 3VS4 A; 1WXB A; 5IXF A; 2RNA A; 1WXT A; 4X1V A; 4DEX A; 2FEI A; 1YCS B; 4OMN A; 2YUP A; 4KRT A; 1PRL C; 3M0T A; 4HVW A; 3VS6 A; 4CC2 A; 2RN8 A; 2O31 A; 1NEB A; 2DA9 A; 2DL7 A; 4GBQ A; 4AFU C; 5IXB A; 1TUC A; 2FPE A; 4E6R A; 1KIK A; 2VKN A; 4J9F A; 4HVU A; 4F17 A; 4M4Z A; 4RTX A; 3GBQ A; 2DJQ A; 3A98 A; 1CKA A; 1JU5 C; 4LUD A; 1WYX A; 2YUN A; 1K4U S; 3VS1 A; 3ZL7 C; 4CC7 A; 1ZBJ A; 2L3P A; 1BU1 A; 4DEY A; 2KRM A; 2ENM A; 1YNZ A; 2FPF A; 2KT8 A; 1X43 A; 2VWF A; 2OJ2 A; 1HJD A; 4J9E A; 3O5Z A; 2ESW A; 2KT1 A; 1AWW A; 1NYG A; 4RTV A; 1PKT A; 1FYN A; 1GRI A; 2CUD A; 1GFD A; 2MCN A; 5FWC A; 1UJ0 A; 2DF6 A; 4FSS A; 2KRS A; 1T3L A; 1ZUU A; 1T0H A; 3FJ5 A; 1CKB A; 2GQI A; 2DBM A; 1OV3 A; 1ZX6 A; 2XMF A; 4RTT A; 1FMK A; 2YDL A; 4J9G A; 1M27 C; 4OMO A; 1JXO A; 1W6X A; 1AWO A; 2CSQ A; 2DM1 A; 2DIL A; 3ULR B; 1E6G A; 2CRE A; 3EGU A; 2O2O A; 1AZG B; 2EBP A; 3PE0 A; 1CSK A; 4OMP A; 4QT7 A; 1NG2 A; 2A28 A; 1QLY A; 4HVV A; 1UTI A; 3RBB B; 1AWJ A; 5ECA A; 4JJC A; 2JS0 A; 1WI7 A; 3IQL A; 1WDX A; 1J3T A; 1G83 A; 2DX1 A; 1QWF A; 2KYB A; 4J9I A; 1GCP A; 3H0I A; 2AZS A; 2LMJ A; 1AD5 A; 2PZ1 A; 2W0Z A; 2NUZ A; 3UA6 A; 2LCS A; 2CT4 A; 2J7I A; 1OPK A; 1NLO C; 1W70 A; 4WCI A; 2M51 A; 2AZV A; 2GNC A; 4JJD A; 3QWX X; 1I1J A; 2ABL A; 3SHW A; 4RTZ A; 2JMC A; 2K6D A; 3EG0 A; 2C0O A; 1RUW A; 2JXB A; 2RF0 A; 1AVZ C; 2FO0 A; 4AFZ C; 2JTE A; 3KFV A; 1Y0M A; 2ECZ A; 2PTK A; 1WX6 A; 4Z89 A; 2DL3 A; 2LQN A; 2BZ8 A; 2KEA A; 3VS0 A; 1UJY A; 1AOJ A; 1WA7 A; 2YT6 A; 1LCK A; 2EGC A; 2ED1 A; 3EHR A; 5I22 A; 2ROT A; 1JXM A; 3I5R A; 2GBQ A; 2D0N A; 5IHN A; 2J06 A; 1T0J A; 4IIO A; 2H8H A; 1K0X A; 1Y57 A; 2KBT A; 1M8M A; 1GFC A; 2RQR A; 4JJB A; 1K1Z A; 2DE0 X; 1QKX A; 2V1R A; 2SRC A; 2F2W A; 2KGT A; 3M0U A; 2E5K A; 2RQW A; 2EYW A; 2P4R A; 1H3H A; 1X27 A; 2O9V A; 2JM9 A; 4IIM A; 1U06 A; 1NEG A; 4AFS C; 3NHN A; 4EIK A; 2BTT A; 1OEB A; 2KXD A; 1MUZ A; 2K2M A; 2LZ6 B; 5IH2 A; 2EPD A; 4Y92 A; 2LNH B; 1H92 A; 3R6N A; 1X6B A; 3VRY A; 1JO8 A; 2L3Q A; 2X3W D; 1OPL A; 2DL8 A; 1UHC A; 2YUQ A; 4ESR A; 2AKL A; 2NWM A; 2HSP A; 5HCK A; 1UEC A; 2C0I A; 2K3B A; 1U3O A; 2K79 A; 3NGP A; 1QKW A; 3REB B; 3LH5 A; 5L23 A; 2C0T A; 1BK2 A; 1NLP C; 2F2X A; 1UFF A; 1NYF A; 1SHG A; 3JV3 A; 4LUE A; 1YN8 A; 1YP5 A; 2LX7 A; 1SHF A; 4F14 A; 4Z88 A; 4CC3 A; 2EW3 A; 3EG1 A; 1GBQ A; 1N5Z A; 1NM7 A; 2CUB A; 2KYM A; 1OOT A; 2ROL A; 2CDT A; 1B3Q A; 2KRN A; 1K76 A; 2L3S A; 1PKS A; 1RLP C; 1VYT A; 5IHK A; 3THK A; 2EYZ A; 4RUG A; 1AEY A; 2JW4 A; 1JEG A; 2FRY A; 2GGR A; 2M0Y A; 3RNJ A; 4AG2 C; 2CH4 W; 2V1Q A; 3H41 A; 2OI3 A; 2D8H A; 2D8J A; 5GJV B; 3VRZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5DM7 R; 4XU3 A; 3RMS A; 2YLB A; 1A0N B; 4CRI A; 4DOW A; 1VYU A; 5CAI A; 4NL3 A; 1YHQ A; 4JZ3 A; 2X35 A; 2A3L A; 5CKH A; 1U1T A; 2L0A A; 2RK2 A; 2DER A; 3KBG A; 1WLP B; 1Q81 R; 1VQN Q; 3ER0 A; 2AHJ B; 1YI2 T; 4M78 G; 4NOY A; 4PFO A; 4C8Q C; 1NPP A; 2X4Y A; 1WXU A; 2YLC A; 3VS5 A; 4TVR A; 4OGE A; 6AT1 B; 4XK8 E; 1VQ5 A; 2EGE A; 2DL4 A; 1ABO A; 4B9W A; 1U1S A; 2CH4 A; 1TS9 A; 1H3Z A; 1TG0 A; 2ATC B; 2DRM A; 2HDA A; 1JRI A; 2RO0 A; 1M90 R; 1G3W A; 4EDU A; 4PJO F; 2DVE A; 2K9G A; 1U5S A; 3L2Q A; 1IXD A; 1HD3 A; 2DVJ A; 3BY7 A; 4C0D B; 1AZE A; 4J9B A; 4CC4 B; 4C8Q E; 3MEA A; 1LNX A; 3UA7 A; 5GAO r; 3UAT A; 1YIT T; 2O9S A; 3HFO A; 1JQQ A; 4M7D C; 2CGH A; 3JB9 G; 3HP9 A; 2DYB A; 1ZUK A; 2YUO A; 3NMZ C; 3M0Q A; 4RMO A; 4C5G A; 3CC7 A; 2ZPB B; 2CYZ B; 2QQB A; 1NJI R; 5GAN e; 1YI2 Q; 5CQX A; 2A37 A; 1WHG A; 3C12 A; 1XOV A; 5EC7 A; 1B34 A; 4JLI A; 3MET A; 2GFA A; 1IGQ A; 1QVF A; 4ORZ A; 5GAN d; 4R56 A; 1QVG P; 5I11 A; 2KNB B; 1B7T A; 5KE3 A; 3I56 Q; 4UC4 A; 2NYS A; 2EYY A; 1ZLM A; 1I4K 1; 4MZP A; 1Q7Y C; 3H0F A; 4Q5W A; 2YSQ A; 2IVW A; 2F1L A; 4RTW A; 2K5F A; 3OBW A; 3E19 A; 5FWB A; 4BE1 A; 5CIU A; 1FXX A; 5GMK l; 1WHL A; 3ME9 A; 2KRO A; 5GAN 3; 3R6O A; 4A4G A; 1QVG S; 5GAO n; 5CCA A; 1G2B A; 3M55 A; 4HT8 A; 5KCO A; 4Z02 A; 3L2V A; 1LOJ A; 3I55 A; 1ZSZ C; 3VS7 A; 3G6E A; 1RAE B; 1MNE A; 1MV3 A; 3WVD B; 2RB6 A; 5GMK h; 3S3O A; 3M0P A; 3S3N A; 5IHI A; 3EGD A; 2Y4Y A; 2HKQ B; 2K57 A; 3OQ5 A; 4DA4 A; 3JB9 H; 3PGG A; 3JCM h; 4FYW B; 2DEQ A; 1TOV A; 3OS0 A; 1WZO A; 2P84 A; 1RI9 A; 2DRK A; 5GAN 4; 4IKF A; 3G71 A; 1PCX A; 3GLX A; 4V2S A; 4M78 B; 1M8V A; 1W2B A; 2HSE B; 3PIO A; 1Q82 U; 3TCJ A; 3CCJ Q; 1Q81 C; 1VQP T; 3GPL A; 3RER A; 5KYW A; 1M3A A; 3PT9 A; 3CC4 Q; 3QYH B; 5J39 A; 5IXF A; 3M5A A; 1HK9 A; 2EKO A; 2JNG A; 3OYM A; 1V76 A; 3WXM B; 2HKN A; 1ZHI A; 4KRT A; 1PRL C; 2D6F A; 5CO7 A; 2O31 A; 1NEB A; 2XU8 A; 4HT9 A; 3JB9 J; 1JB0 E; 1WPY A; 4KGZ B; 5A0G A; 2CP5 A; 4E6R A; 1XQH A; 3HRU A; 4HVU A; 3CCR Q; 5D7U A; 2DJQ A; 1JU5 C; 4LUD A; 4M75 G; 1WYX A; 4LDY A; 2A7Y A; 1MMD A; 2LQ8 A; 4E7S A; 2RA2 A; 2L3P A; 1BU1 A; 4PLL A; 4DEY A; 2ENM A; 4BB7 A; 3JCM d; 3E9G A; 1YJ9 A; 2QQA A; 3CD6 Q; 3NFC A; 2OJ2 A; 4J9E A; 3I55 Q; 1TUG B; 2KT1 A; 4E7L A; 1NYG A; 1GRI A; 2CUD A; 1VQP Q; 3PNW C; 1UJ0 A; 2VGN A; 4IUT A; 3EFO B; 5GAM d; 3QYG B; 3CC4 T; 1ZUU A; 1M1K U; 1M4Z A; 1T0H A; 2PVO B; 2DBM A; 3HRS A; 2QTX A; 1M27 C; 2LT4 A; 2RJD A; 2QA4 A; 1QQJ A; 1JXO A; 4ATO A; 2DIL A; 5KYW B; 3VYG A; 3X24 B; 2GQV A; 2E6Z A; 3EGU A; 3L2R A; 1M90 C; 3CBM A; 1G3S A; 4OMP A; 4QT7 A; 2MF2 A; 1QLY A; 1TTH B; 1UTI A; 4HVV A; 1AWJ A; 5ECA A; 3CCR T; 4M77 A; 3OB9 A; 4ZN1 A; 2MYS A; 2VB6 A; 1QWF A; 4J9I A; 2PU9 B; 3CBO A; 4M77 C; 3JB9 F; 1YJN T; 2W0Z A; 2LCS A; 1Q7Y U; 1EX4 A; 2J7I A; 1ACM B; 4BI4 A; 2PUO B; 1QVF S; 2IPO B; 2GFU A; 4WCI A; 2M51 A; 3BDU A; 1BI1 A; 3SWN C; 2GNC A; 1SG5 A; 4KT0 E; 2JMC A; 3HHT B; 4QVC A; 2FO0 A; 4AFZ C; 4LD6 A; 2CKK A; 2JTE A; 5FLX E; 4EMK C; 3OYG A; 3MCA B; 5FRO A; 2LCL A; 2B8A A; 1NJI U; 1PSE A; 2KEA A; 5HK0 A; 1FX7 A; 3HFN A; 4F7U F; 2K5I A; 2XI9 A; 1KC8 C; 3EHR A; 1DJ7 B; 1X6O A; 2R58 A; 2K5L A; 1VIF A; 4BAC A; 1M5Q 1; 2F69 A; 5KYX B; 2J06 A; 1Q82 R; 1Y57 A; 4C8Q A; 2DXU A; 4IUU A; 2DE0 X; 1VQ6 A; 3CCQ A; 3FLG A; 3M0U A; 2KGT A; 1X27 A; 3MP1 A; 2O9V A; 2JM9 A; 1FMV A; 5LJ3 h; 2LX9 A; 2E3I A; 1MUZ A; 1Q7Y R; 1Q82 C; 4PJO A; 3OSS C; 2LZ6 B; 4Y92 A; 5L8R E; 5DLO A; 1H92 A; 2L3Q A; 1OPL A; 2DL8 A; 4KGX B; 1UHC A; 3TRE A; 2QEX A; 4ESR A; 4HCC A; 2RI3 A; 4PJO C; 1VQ7 Q; 1UEC A; 2K3B A; 2WSE E; 3EFR A; 1QKW A; 2Y90 A; 4M77 F; 1IZ6 A; 3E9F A; 3QHS A; 8ATC B; 4WF2 A; 4PKC C; 5L23 A; 4XTV A; 1UFF A; 3TU4 K; 1SHG A; 3CCU Q; 2CZ0 B; 3GF5 A; 2ZZD A; 4F14 A; 3CCE Q; 2FZK B; 2EW3 A; 3EG1 A; 1GBQ A; 3VKI A; 4PL6 A; 2CUB A; 1NM7 A; 4FCY A; 1K73 C; 1QVG A; 2ROL A; 2KRN A; 3OYN A; 1K76 A; 1VYT A; 1VQ9 T; 1YIT A; 5J3B A; 4RUG A; 1U8R A; 4M7A F; 2FRY A; 2GGR A; 2M0Y A; 3RNJ A; 4AG2 C; 2CH4 W; 2RHZ A; 3OYC A; 4MDW A; 2YRD A; 1NBE B; 1N27 A; 3G4S T; 1IHW A; 3VYH B; 1YWP A; 1LVK A; 2KVQ G; 1I5O B; 2ED0 A; 2QK0 A; 3EHQ A; 2D0Q B; 4FYX B; 4PJM A; 4QW2 A; 3M4G A; 1IRX A; 1VQL Q; 4BY6 B; 4M78 A; 2DIG A; 3TSZ A; 1ZQ1 A; 2EWN A; 3G6E T; 2A08 A; 3M9Q A; 1NZ9 A; 3CCV Q; 4LDX A; 3I35 A; 3JCM X; 1HSQ A; 3GNG A; 2KDS A; 1X2K A; 3OYD A; 2HCK A; 1OUL A; 2QTV A; 2QA4 T; 1UHF A; 4B6M A; 3OYE A; 1B34 B; 1RAH B; 3VS3 A; 2E4H A; 2ZCF B; 3V8J A; 5GAO m; 2W10 A; 2DJZ A; 3CPF A; 3CCS A; 1Q95 G; 2DBK A; 4J6Y A; 1PRM C; 1M90 U; 3GOX A; 2E65 A; 1YJN A; 5GAN 5; 4XU0 A; 1JJ2 P; 1R0C B; 1YWO A; 2E3H A; 1RAC B; 4OML A; 5GAO q; 3LWI A; 1HXD A; 4FM4 B; 5LJ5 d; 4PJO B; 3X28 B; 1AT1 B; 2CZ7 B; 3JCM f; 1KQ2 A; 3ZBD A; 1YHQ T; 2COW A; 2EQU A; 2RI5 A; 1KHI A; 3HSB A; 3REA B; 2HMA A; 3M0S A; 1Q86 U; 1NPR A; 1BI2 A; 2GTJ A; 1UG1 A; 1K9A A; 3PMI A; 2CT3 A; 2PNI A; 4FT4 A; 3PVQ A; 3QZ5 B; 3NPF A; 4ME7 A; 4OMM A; 2AK5 A; 1SEM A; 1O75 A; 2M1H A; 2EKH A; 3TVT A; 4PJO E; 1D0Z A; 4M7D G; 3QDR B; 2HBW A; 3M54 A; 2JOY A; 2EQM A; 2EGA A; 3HPW A; 1BIB A; 4Y91 A; 1PSF A; 3JCM W; 2DAQ A; 1EFN A; 4M7A C; 2YHT A; 5GMK i; 2IIM A; 3PFS A; 2DMO A; 4ELZ C; 2VAS A; 3RR6 A; 5FRM A; 1KFZ A; 4M7A A; 1UEB A; 3OYK A; 4J8O A; 3CME Q; 2YXY A; 1F1B B; 4EPC A; 2GCX A; 1VQK A; 1PWT A; 4L59 A; 1XJW B; 3CCS Q; 2RQU A; 3BDL A; 1WIE A; 4JDS A; 2KAF A; 3FDR A; 2KY9 A; 5KH6 A; 5CVI A; 4RG2 A; 3A8O B; 2A36 A; 1M3B A; 1RLQ C; 4M75 D; 2HEQ A; 2OAU A; 1TUD A; 3GNF B; 1UDL A; 1KD1 U; 1VQK T; 2HAX A; 4C8Q F; 2CS7 A; 5D6Y A; 2BIV A; 1IB8 A; 2CSI A; 2DTH A; 1SRM A; 5KE2 A; 2L2P A; 2KSS A; 3JCM g; 3V8K A; 3CXC P; 4PJO G; 1SSH A; 1K73 U; 4RKU E; 1B07 A; 2J6K A; 2DFU A; 3UF4 A; 2LJ0 A; 4DBH A; 2OTL Q; 3H6Z A; 3A8G B; 3SEM A; 3JCM c; 2BKD N; 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