The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
EGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the PI3K SH3 domain and analysis of the SH3 family.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN
|
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
76
|
| sequence length |
76
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.1.137: Phosphatidylinositol 3-kinase. |
| pdb deposition date | 1994-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UEC A; 1JEG A; 1U5S A; 4RTU A; 2DRM A; 3EG1 A; 2DRK A; 1ZUU A; 2RN8 A; 2D8H A; 2LJ3 A; 4J9C A; 1T0J A; 3LH5 A; 1HD3 A; 1SRM A; 1K76 A; 4OML A; 1SSH A; 2EVR A; 4HVU A; 2CT3 A; 2DL8 A; 5GJV B; 2I0N A; 5IXF A; 1T3L A; 2BZY A; 1G2B A; 1K0S A; 1A0N B; 2CSI A; 1BB9 A; 2BZ8 A; 3UF4 A; 1GCP A; 1X69 A; 1S1N A; 2KRN A; 2KRM A; 3VS3 A; 4DEX A; 3VS0 A; 2D0N A; 1AWX A; 2OI3 A; 4WCI A; 1MV0 B; 2JTE A; 2H8H A; 2EPD A; 1K1Z A; 1QKX A; 4J9G A; 2KR3 A; 4IIM A; 4RTY A; 1QWE A; 2B86 A; 3VRZ A; 1KJW A; 1I1J A; 1NG2 A; 2EQI A; 2RPN A; 1B3Q A; 1NLO C; 3H0F A; 1MV3 A; 4F17 A; 1WXU A; 1NYG A; 5FW9 A; 2CH4 W; 5HCK A; 3SEM A; 1AZG B; 2CUB A; 2CT4 A; 4F16 A; 2AKK A; 4EIK A; 1VYT A; 2L3S A; 2LJ0 A; 2RQW A; 2RQR A; 2RMO A; 1EFN A; 4RTW A; 2KT8 A; 1GBQ A; 3PVQ A; 1KSW A; 3VS7 A; 1QCF A; 1M3B A; 1ZX6 A; 3VS4 A; 2M51 A; 4DEY A; 1CKB A; 1PRL C; 1X2Q A; 2JW4 A; 1WDX A; 1UUE A; 1X6B A; 1I07 A; 2EBP A; 4IIO A; 2VWF A; 4AFZ C; 1BK2 A; 1RUW A; 4E6R A; 1GCQ C; 1X6G A; 1YWO A; 2EGC A; 2GGR A; 3M0U A; 1UJ0 A; 3VRY A; 2FPF A; 1E7O A; 1ABQ A; 1WLP B; 3O5Z A; 4HXJ A; 4AG1 C; 2F2X A; 2DX1 A; 2JMC A; 2OAW A; 1ZUK A; 4M4Z A; 2L0A A; 2P4R A; 4Z88 A; 1LCK A; 1AZE A; 4OMO A; 3M0Q A; 1UJY A; 2OJ2 A; 1M8M A; 1KIK A; 1WFW A; 3NHN A; 2KYB A; 2LNH B; 2CRE A; 2LMJ A; 3RNJ A; 5I11 A; 1YP5 A; 3NPF A; 2L2P A; 4Z89 A; 2FG0 A; 1JU5 C; 5IHK A; 4CC2 A; 2K2M A; 2CUD A; 1H92 A; 4OMM A; 4RTZ A; 2ED0 A; 1BBZ A; 2J6F A; 2DL7 A; 2KRS A; 3U23 A; 3ULR B; 2FO0 A; 1GFC A; 2ABL A; 2JMA A; 2M0Y A; 2KT1 A; 1WYX A; 2VKN A; 2KRO A; 1YN8 A; 1AWJ A; 2EW3 A; 1ZBJ A; 2DNU A; 4J9E A; 4A63 B; 1WA7 A; 2GQI A; 4LE9 A; 1K4U S; 2DF6 A; 2FRY A; 1E6G A; 2RQU A; 3PE0 A; 2VVK A; 2DYB A; 3EG2 A; 3REB B; 1UE9 A; 3I9Q A; 1U3O A; 4QT7 A; 1JO8 A; 1W70 A; 1AVZ C; 2ED1 A; 1GL5 A; 3ZL7 C; 2X3X D; 1T3S A; 2PNI A; 2NUZ A; 3H41 A; 2K6D A; 1ZSG A; 1OOT A; 4LN2 A; 2E5K A; 2HBW A; 4AG2 C; 2LX7 A; 1OV3 A; 2J06 A; 1TUC A; 1UG1 A; 2MCN A; 1H3H A; 1TG0 A; 2D8J A; 4R0K A; 1JXO A; 1AOJ A; 2DVJ A; 4LUD A; 1GCQ A; 4X1V A; 1VYV A; 2X3W D; 2AZV A; 2ENM A; 2PZ1 A; 1T0H A; 1BU1 A; 2JS2 A; 2KXD A; 1M27 C; 5ECA A; 2DBM A; 1RLP C; 3H0I A; 1TUD A; 3EG3 A; 2F2V A; 1WI7 A; 4HVV A; 2O9V A; 1M3C A; 1UGV A; 2EYW A; 2DL4 A; 3I5R A; 5EC7 A; 3NMZ C; 1HSQ A; 2CH4 A; 2K3B A; 1IO6 A; 2RQT A; 2GNC A; 1KFZ A; 3JV3 A; 2DMO A; 2EGE A; 1NLP C; 3R6N A; 2DIL A; 4CC3 A; 1UHF A; 2LJ1 A; 2YT6 A; 2ECZ A; 3VS6 A; 4Y92 A; 2FPE A; 3IQL A; 1W6X A; 3REA B; 2LZ6 B; 2HEQ A; 2YSQ A; 1XOV A; 2DBK A; 1J3T A; 2L3Q A; 1GBR A; 1X27 A; 2K9G A; 3M0R A; 4JPB W; 2EKH A; 4J9D A; 2GTJ A; 2MOX A; 1WIE A; 1YWP A; 2EGA A; 1ARK A; 2C0O A; 3THK A; 4CC7 A; 2O9S A; 2W0Z A; 4CC4 B; 1VYU A; 1H8K A; 2SRC A; 5IHN A; 2V1R A; 4F14 A; 2DM1 A; 2JT4 A; 1I0C A; 3VS2 A; 2KNB B; 3M0T A; 1NYF A; 2FRW A; 2EYY A; 1SEM A; 4LUE A; 2DL3 A; 2SEM A; 2RNA A; 4D8D A; 4GBQ A; 4OMP A; 3SHW A; 4Z8A A; 1FYN A; 2J6O A; 2IIM A; 2YUN A; 3QWX X; 4RTX A; 2AZS A; 3VS5 A; 1UHC A; 1OEB A; 2L3P A; 2O2O A; 2A08 A; 3CQT A; 3EGU A; 1AWW A; 3EHQ A; 4JJD A; 4D8K A; 2DJQ A; 1NEB A; 3QWY A; 2CSQ A; 2KYM A; 2F2W A; 3TSZ A; 1PHT A; 4ESR A; 1PKS A; 1RI9 A; 2BTT A; 2XMF A; 2G6F X; 1SPK A; 3M0S A; 2CDT A; 1QWF A; 1X43 A; 3TVT A; 3NGP A; 1SHG A; 4GLM A; 2GBQ A; 2V1Q A; 1Y57 A; 4ORZ A; 2AKL A; 4JZ3 A; 1FMK A; 2J6K A; 4AFQ C; 1G83 A; 2RQV A; 2AK5 A; 1Z9Q A; 2HSP A; 2LQN A; 1WX6 A; 1SHF A; 1ZLM A; 5FWB A; 1GFD A; 1K0X A; 1MUZ A; 2YUP A; 5IH2 A; 1W1F A; 2YDL A; 3VS1 A; 2K79 A; 1UTI A; 4LNP A; 5FWC A; 2YUO A; 4RTV A; 5GJW B; 1OPK A; 1ZUY A; 3C0C A; 2A28 A; 2KGT A; 1CSK A; 1UFF A; 4RUG A; 2JM9 A; 2JXB A; 2C0T A; 2JS0 A; 2FPD A; 1Z9Z A; 2D1X A; 3I5S A; 4HCK A; 1N5Z A; 2O31 A; 1Y0M A; 2PTK A; 1SRL A; 3FJ5 A; 3A98 A; 2QDL A; 5IXB A; 1M30 A; 3TSW A; 1M3A A; 1V1C A; 2DL5 A; 2ESW A; 2ROL A; 4AFU C; 2KEA A; 2YUQ A; 1WXT A; 2C0I A; 4J9I A; 2W10 A; 1OPL A; 4FSS A; 2EYZ A; 3I35 A; 1PWT A; 2EYX A; 2ROT A; 1YCS B; 1E6H A; 1WXB A; 4J9H A; 2KBT A; 4KRT A; 5IHI A; 2RF0 A; 4J9B A; 3UA7 A; 2NWM A; 1PKT A; 2J05 A; 1PNJ A; 3RBB B; 1PRM C; 5I22 A; 1VA7 A; 3KFV A; 1ABO A; 3EG0 A; 2GTO A; 4OMQ A; 2BZX A; 4OMN A; 2A36 A; 1HJD A; 2HDA A; 2LP5 A; 2KXC A; 1NEG A; 1X2K A; 3H0H A; 2O88 A; 1AWO A; 4HVW A; 2LCS A; 3PVL A; 4AFS C; 1B07 A; 1K9A A; 4K11 A; 3UAT A; 4ZNX A; 4RTT A; 1U06 A; 2HCK A; 2DA9 A; 2LQW A; 1UDL A; 1JQQ A; 1RLQ C; 4J9F A; 2FEI A; 1CKA A; 4JJC A; 2DE0 X; 1YNZ A; 4JZ4 A; 5L23 A; 1JXM A; 1AD5 A; 1NM7 A; 2DLP A; 4JJB A; 2K7A A; 3M0P A; 3UA6 A; 1QLY A; 3GBQ A; 3EHR A; 2J7I A; 1QKW A; 2KE9 A; 2JM8 A; 1GRI A; 2A37 A; 2MIO A; 1AEY A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QII A; 1U5S A; 4BDZ A; 1VQ4 A; 4F7U E; 2E6Z A; 2DRK A; 4PJO F; 2CP6 A; 3G6E Q; 3I56 A; 2D8H A; 2DTI A; 2XU8 A; 4J9C A; 1QVP A; 2YRD A; 4XTW A; 4M7A E; 2JVV A; 4BI8 B; 1SRM A; 4OML A; 2EVR A; 1D0Y A; 5KE3 A; 2DL8 A; 3JRZ A; 4PJL A; 3C95 A; 1Q7Y C; 1K0S A; 1KC8 R; 2CSI A; 3UF4 A; 1N27 A; 4AT1 B; 2CZ1 B; 1GCP A; 1X69 A; 3V7R A; 3FB9 A; 4PJJ A; 2KRM A; 3OS5 A; 5DY9 A; 4DEX A; 2K3X A; 1VQP Q; 3FLG A; 3FJP A; 1NPR A; 5GAO n; 5DM7 R; 1Q81 R; 2H8H A; 2EPD A; 1N6A A; 3GOX A; 4PJM A; 4XU0 A; 2GFU A; 4RMO A; 1QWE A; 4C92 A; 5GMK l; 1NG2 A; 4KUL A; 1B3Q A; 2K5I A; 3H0F A; 1U1T A; 4ZN3 A; 3TQ7 P; 3OY9 A; 1WXU A; 2P4T A; 4IUU A; 2HKQ B; 1U1S A; 3CCL A; 1OZ3 A; 2QEX T; 1M2V A; 1NBE B; 3CCU A; 2CUB A; 2AKK A; 4EIK A; 2L3S A; 1YHQ A; 5LJ3 d; 2DVE A; 1SG5 A; 5FRO A; 1X75 C; 3OA6 A; 1VQ4 T; 3PVQ A; 2RHI A; 4M7D D; 1QCF A; 1M3B A; 2C06 A; 4OGE A; 2DIQ A; 1JJ2 S; 3OYJ A; 4PLL A; 3I56 T; 2BIV A; 2LRQ A; 1OU9 A; 4DEY A; 1CKB A; 3CC4 A; 1I8F A; 1X2Q A; 2JW4 A; 1UUE A; 3P8D A; 2EBP A; 2VWF A; 1RUW A; 3GP8 A; 2QGF B; 1VQ6 Q; 2EGC A; 2GGR A; 1H3Z A; 3M0U A; 1UGQ B; 2NUT B; 4HXJ A; 4N4I A; 4AG1 C; 2F2X A; 2L3R A; 2DX1 A; 3I55 A; 4PJO C; 5GAN d; 3OYB A; 3OMC A; 2V8K A; 4IUT A; 3M0Q A; 4JS4 A; 2QTV A; 1UJY A; 3OYC A; 2OJ2 A; 3JCM e; 1R0B G; 1WFW A; 1KQ2 A; 2XHC A; 1KC8 C; 3QJY A; 5I11 A; 3CCV Q; 2RHX A; 4RKU E; 4DA4 A; 2FG0 A; 4OF1 A; 1JU5 C; 1Q86 R; 2K2M A; 3JB9 I; 4OMM A; 2DL7 A; 5KYX A; 1QVF S; 3CCM Q; 2ZPF B; 4FT4 A; 4JRP A; 1Q81 C; 1EX4 A; 2KRO A; 3QUI A; 3S3M A; 1XJW B; 1AWJ A; 5GAM g; 1WA7 A; 4LE9 A; 1K4U S; 4A4K A; 1QW1 A; 2LX9 A; 2VVK A; 2R58 A; 3I9Q A; 4EPC A; 1BIA A; 1YHQ T; 4M77 G; 4M75 D; 1AVZ C; 3QYG B; 3ZL7 C; 1T3S A; 4Y28 E; 1VQ9 Q; 4F04 B; 1JB0 E; 4AG2 C; 3CC2 T; 3CC4 T; 1YBY A; 1TUC A; 2XIC A; 3TCJ A; 1TU0 B; 4J6W A; 1WZO A; 4N4G A; 2HKN A; 4LUD A; 3HPW A; 2X51 A; 3I55 T; 3NTH A; 4PJO A; 2PZ1 A; 2CYZ B; 1T0H A; 1BU1 A; 1LJO A; 2KXD A; 1M27 C; 2M16 A; 5LJ5 e; 3H0I A; 1TUD A; 3MP8 A; 1WI7 A; 2JZ2 A; 1M3C A; 1UGV A; 2DZ9 A; 2EYW A; 3I5R A; 4BI3 A; 5EC7 A; 5GAN 4; 3L2W A; 2DK3 A; 1SSF A; 3M57 A; 1HSQ A; 2PUK B; 5FU6 C; 4FCY A; 4V2S A; 3EGD A; 1GXI E; 1YJW T; 3KUF A; 1IB8 A; 3M5A A; 3QHS A; 1KQS S; 3R6N A; 4CC3 A; 2YT6 A; 1OX8 A; 2ECZ A; 2FPE A; 4F7U G; 2GF7 A; 4N0A C; 1VQL Q; 4C5E A; 2HEQ A; 2YSQ A; 3EGX A; 1XOV A; 1W2B P; 4J6X A; 1J3T A; 2F5K A; 4XU3 A; 4C8Q F; 3E19 A; 4M7A G; 2EKH A; 4J9D A; 1FMV A; 3ER0 A; 5KCH A; 4FIB A; 2RK2 A; 1WIE A; 1ZA1 B; 1VOM A; 1ARK A; 2C0O A; 2DEQ A; 5GAO m; 2OTJ Q; 2W0Z A; 1VYU A; 1H8K A; 1IHV A; 4FYV B; 1M1G A; 4E7H A; 2MWP A; 2SRC A; 1C1A A; 2CP3 A; 1TSF A; 5IT9 E; 4F14 A; 1VQO T; 3VS2 A; 3M0T A; 3EG9 A; 4LDX A; 2IVW A; 2HBP A; 4KT0 E; 2ZPG B; 4OMP A; 4BI4 A; 3L2V A; 1WJS A; 4Z8A A; 2LCL A; 2EJG A; 3QWX X; 7AT1 B; 3EFS A; 1O9S A; 3V7C A; 1G3Y A; 3UWN A; 3EGU A; 4NS5 A; 4D8K A; 1VQK A; 4FYW B; 4KH1 B; 3EFO B; 4HCZ A; 1YIJ Q; 2F2W A; 5D6X A; 4C0G A; 2CZ6 B; 2XMF A; 2V8J A; 2G6F X; 1SPK A; 2A7Y A; 4MDX A; 4II1 A; 1YJN Q; 3L1A A; 4N0A A; 2FHD A; 3NGP A; 3OYD A; 1SHG A; 4ORZ A; 2XD0 A; 1FMK A; 2ZCF B; 2AK5 A; 3SWN B; 3MCA B; 1N9R A; 3WXM B; 3X26 B; 4D6W A; 1ZLM A; 5FWB A; 1MUZ A; 3M53 A; 3VV0 A; 3VS1 A; 5CIU A; 1UTI A; 3JCM h; 5FWC A; 2YUO A; 4HA8 A; 3BY7 A; 1OPK A; 1YI2 Q; 2KY9 A; 3V8J A; 1IZ6 A; 4C8Q C; 1CSK A; 3VJP A; 1TOV A; 1K9M R; 3CCQ Q; 2F1L A; 2JXB A; 3BFM A; 4TVR A; 4HT9 A; 2X4X A; 1N5Z A; 1M1K U; 2PTK A; 1SRL A; 3FJ5 A; 4EMK B; 4KGZ B; 3LGF A; 1M3A A; 5CR2 A; 5CVI A; 1BI0 A; 2EYZ A; 1PWT A; 4E7L A; 3CD6 Q; 2CGH A; 4QQG A; 2EYX A; 1N9S A; 1YCS B; 4XTX A; 5GAN 7; 2QQB A; 1ACM B; 4BY6 B; 3LH0 A; 1VQK T; 1QMC A; 2EJF A; 2J05 A; 1YJN A; 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1SF9 A; 4IUQ A; 1Q7Y R; 1N8R U; 1WHG A; 1VQ4 Q; 2O4X A; 5LJ3 g; 1K8A C; 1ZBX A; 4M78 F; 4C5I A; 3I56 Q; 1M90 R; 2RQW A; 2RQR A; 1PG5 B; 2HQE A; 1RAB B; 2VYT A; 1EFN A; 2DJZ A; 3L2R A; 4F7U F; 2KT8 A; 1KSW A; 1I5L A; 3VS7 A; 3CPW S; 5CKH A; 1O75 A; 3SWN C; 3BDL A; 4M7A F; 2EQJ A; 1V76 A; 1VQ5 A; 4DBH A; 3CME A; 4IIO A; 3M4G A; 1X6G A; 2YLC A; 5DLQ E; 2LQ8 A; 2DFU A; 4PNO A; 5GAN g; 1WLP B; 3O5Z A; 1FX7 A; 1F1B B; 4IUR A; 2V8I A; 3JCM f; 2R5A A; 1ZUK A; 1WHL A; 4M4Z A; 2LNV A; 2L0A A; 2P4R A; 1LCK A; 4OMO A; 4M77 C; 1M8M A; 2CZ7 B; 3NHN A; 3O8V A; 2QEX A; 2NUP A; 4B6M A; 2CRE A; 2LMJ A; 3RNJ A; 3LW5 E; 1YP5 A; 3NPF A; 1MNE A; 2K3Y A; 2LC4 A; 4ATO A; 3OBW A; 2OTL T; 1H92 A; 2ED0 A; 1BBZ A; 3CBM A; 2VGM A; 3CCL Q; 1D3B A; 4BE1 A; 3ULR B; 2FO0 A; 3A8H B; 2K57 A; 2VKN A; 3M55 A; 1BCO A; 1YHQ Q; 3FIF A; 1Q82 R; 2VB6 A; 2COY A; 1YN8 A; 2DNU A; 2DF6 A; 2FRY A; 1E6G A; 1IRE B; 4R56 A; 3JCM J; 2DYB A; 1UE9 A; 2D0Q B; 2DAQ A; 1ZSZ C; 3CC4 Q; 4L5G A; 5C6S A; 5CQY A; 1B7T A; 2KMT A; 2QGG A; 3PNW C; 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